17	80011813	.	C	A	669.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;DP=68;Dels=0.00;FS=7.508;HRun=1;HaplotypeScore=3.1930;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.430;VQSLOD=3.0750;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,28:68:99:699,0,1212
14	72055745	.	A	G	1451.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.293;DP=90;Dels=0.00;FS=0.791;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.556;VQSLOD=4.5142;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,50:90:99:1482,0,1103
7	150389678	.	T	C	636.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.580;DP=54;Dels=0.00;FS=1.065;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.745;VQSLOD=4.6863;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:54:99:666,0,840
6	38821025	.	C	T	1051.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=60;Dels=0.00;FS=10.003;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.381;VQSLOD=2.2250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,41:60:99:1081,0,494
12	53200999	.	T	A	1321.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.176;DP=98;Dels=0.00;FS=0.789;HRun=0;HaplotypeScore=1.9367;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.508;VQSLOD=5.0908;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:98:99:1351,0,1464
17	74300534	.	C	T	621.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=12.18;ReadPosRankSum=2.355;VQSLOD=4.9484;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,23:51:99:651,0,686
15	91454691	.	C	A	1894.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=147;DS;Dels=0.00;FS=5.606;HRun=0;HaplotypeScore=1.5717;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.777;VQSLOD=4.0284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,71:147:99:1925,0,1873
1	40562894	.	C	A	517.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;DP=47;Dels=0.00;FS=3.006;HRun=1;HaplotypeScore=3.0588;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.398;VQSLOD=3.3370;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,20:47:99:548,0,833
6	29142317	.	C	T	1721.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.152;DP=121;Dels=0.00;FS=1.586;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.554;VQSLOD=6.0136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,70:121:99:1751,0,1181
14	78399644	.	C	A	1943.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.5410;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.809;VQSLOD=3.2699;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,71:152:99:1973,0,2161
6	29408600	.	G	T	2962.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=2.968;HRun=1;HaplotypeScore=8.1440;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.563;VQSLOD=3.1467;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,113:245:99:2992,0,3829
21	43161252	.	G	A	2443.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=168;Dels=0.00;FS=5.694;HRun=0;HaplotypeScore=5.5961;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.431;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.602;VQSLOD=3.3254;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,94:168:99:2474,0,1914
13	46543092	.	C	T	3161.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.193;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=7.424;HRun=0;HaplotypeScore=3.4090;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.628;VQSLOD=3.0805;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,114:225:99:3192,0,2833
20	1298963	.	C	T	1020.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.193;DP=103;Dels=0.00;FS=0.766;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.443;VQSLOD=4.5082;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,44:103:99:1050,0,1572
21	11029596	.	AC	A	520.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.255;DP=76;FS=2.547;HRun=2;HaplotypeScore=350.9240;MQ=50.71;MQ0=1;MQRankSum=2.881;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.395;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,21:76:99:560,0,2242
9	117853237	.	C	T	1218.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.591;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.1673;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.202;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.543;VQSLOD=3.9401;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,45:102:99:1249,0,1418
11	111637064	.	C	G	634.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.857;VQSLOD=4.2263;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,28:61:99:664,0,793
6	56497826	.	T	C	938.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.042;DP=88;Dels=0.00;FS=2.837;HRun=0;HaplotypeScore=2.7321;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.737;VQSLOD=4.7001;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,38:88:99:968,0,1333
20	19654276	.	C	G	1892.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=146;Dels=0.00;FS=3.979;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.583;VQSLOD=4.7781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,73:146:99:1922,0,1770
1	94517254	.	C	G	1168.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.769;DP=93;Dels=0.00;FS=2.910;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=5.1981;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,46:93:99:1198,0,1193
10	1405261	.	G	A	473.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=24;Dels=0.00;FS=4.548;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.900;VQSLOD=2.5738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:503,0,173
9	138710347	.	C	T	425.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.766;DP=31;Dels=0.00;FS=3.407;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.171;VQSLOD=4.6043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,17:31:99:455,0,368
4	123207867	.	T	G	1853.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.955;DP=130;Dels=0.00;FS=0.701;HRun=2;HaplotypeScore=1.9861;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.623;VQSLOD=5.5426;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,73:130:99:1883,0,1504
18	61654247	.	G	T	928.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.678;DP=89;Dels=0.00;FS=0.817;HRun=0;HaplotypeScore=2.8602;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.193;VQSLOD=4.8800;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,39:89:99:959,0,1482
X	48920046	.	C	T	668.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.68;MQ0=0;QD=33.44;VQSLOD=7.3066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:57.17:702,57,0
20	36842049	.	G	A	470.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.215;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=10.5945;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:500,0,329
14	21972019	.	G	A	1391.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.657;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8564;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.299;VQSLOD=4.5774;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,48:95:99:1421,0,1327
1	32674927	.	T	C	1594.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=134;Dels=0.00;FS=0.665;HRun=0;HaplotypeScore=4.7569;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.694;VQSLOD=3.9707;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,66:134:99:1624,0,1598
11	6023762	.	C	T	1183.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.108;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2645;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.669;VQSLOD=5.8891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,43:83:99:1213,0,1053
5	118835033	.	C	T	755.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;DP=67;Dels=0.00;FS=5.207;HRun=1;HaplotypeScore=2.7802;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.161;VQSLOD=3.1750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,34:67:99:785,0,909
16	320583	.	C	T	52.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=8.8690;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:82.04:82,0,169
3	127337927	.	A	G	395.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;DP=30;Dels=0.00;FS=3.873;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.995;VQSLOD=3.9069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:426,0,459
17	33679559	.	G	A	1990.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.961;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=4.688;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.531;VQSLOD=3.9422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,81:190:99:2020,0,3044
2	109414936	.	G	T	877.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=65;Dels=0.00;FS=8.863;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.080;VQSLOD=3.0899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,37:65:99:908,0,781
10	50901917	.	C	A	1481.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;DP=148;Dels=0.00;FS=7.708;HRun=2;HaplotypeScore=2.7258;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.956;VQSLOD=2.6905;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,58:148:99:1512,0,2447
11	1018088	.	TG	T	544.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.574;DP=180;DS;FS=49.327;HRun=3;HaplotypeScore=1626.3210;MQ=40.53;MQ0=6;MQRankSum=-6.293;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.842;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,59:180:99:584,0,5823
2	48809609	.	C	G	1346	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.768;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1405;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.018;VQSLOD=2.4267;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,53:118:99:1376,0,1688
3	37670679	.	G	A	2009.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.847;DP=180;Dels=0.00;FS=0.559;HRun=0;HaplotypeScore=5.6070;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.813;VQSLOD=4.1754;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,80:180:99:2040,0,2622
15	30025358	.	G	C	656.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.661;VQSLOD=5.1244;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,27:82:99:687,0,1422
3	42679486	.	A	G	814.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.947;DP=88;Dels=0.00;FS=7.186;HRun=3;HaplotypeScore=1.9973;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.958;VQSLOD=2.8338;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,32:88:99:845,0,1588
1	231398511	.	A	T	1299.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8151;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.471;VQSLOD=3.7860;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,50:116:99:1329,0,1816
10	18828486	.	C	G	1648.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=121;Dels=0.00;FS=0.705;HRun=2;HaplotypeScore=2.7554;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.412;VQSLOD=5.4675;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,66:121:99:1678,0,1390
4	2200366	.	G	A	2060.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=145;Dels=0.00;FS=0.676;HRun=0;HaplotypeScore=5.1357;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.076;VQSLOD=3.6954;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,78:145:99:2091,0,1668
10	97916272	.	C	T	341.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.402;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.083;VQSLOD=4.1804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,15:43:99:371,0,818
14	21859687	.	G	A	1166.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.834;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.708;VQSLOD=5.7518;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,43:76:99:1196,0,837
7	72745738	.	C	T	2364.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.023;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.0324;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=2.7982;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,86:162:99:2395,0,1837
3	169099171	.	T	G	1033.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.529;VQSLOD=4.3479;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,45:85:99:1064,0,1047
11	60636698	.	G	A	1248	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;DP=98;Dels=0.00;FS=0.805;HRun=1;HaplotypeScore=4.1940;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.210;VQSLOD=3.7378;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,47:98:99:1278,0,1340
1	151337690	.	G	C	624.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.474;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.551;VQSLOD=4.8045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,26:50:99:655,0,540
1	54272121	.	T	C	1252.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.276;DP=91;Dels=0.00;FS=4.109;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.095;VQSLOD=3.7113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,54:91:99:1283,0,887
11	78433746	.	G	A	2560.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;DP=203;Dels=0.00;FS=2.585;HRun=0;HaplotypeScore=4.3999;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.290;VQSLOD=3.5726;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,97:203:99:2591,0,2766
13	42875089	.	C	T	1478.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=121;Dels=0.00;FS=7.084;HRun=1;HaplotypeScore=2.5677;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.316;VQSLOD=4.8183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,55:121:99:1509,0,1677
11	8414090	.	G	GAACCA	2554.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=161;FS=4.617;HRun=0;HaplotypeScore=872.7179;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=-7.299;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.103;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,20:161:99:2593,0,7022
20	33872215	.	C	A	3180.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.011;HRun=1;HaplotypeScore=9.0385;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=4.3459;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,122:250:99:3210,0,3647
4	57796639	.	T	C	760.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.900;DP=48;Dels=0.00;FS=4.200;HRun=1;HaplotypeScore=3.9618;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=2.6156;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,29:48:99:790,0,528
1	978762	.	G	A	224.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=20;Dels=0.00;FS=2.392;HRun=0;HaplotypeScore=7.6397;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.288;VQSLOD=2.8342;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:20:99:255,0,244
7	151800292	.	A	G	1566.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;DP=138;Dels=0.00;FS=5.113;HRun=0;HaplotypeScore=1.8313;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=5.0056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,63:138:99:1596,0,1991
9	119413896	.	T	C	2104.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=159;Dels=0.00;FS=2.105;HRun=0;HaplotypeScore=6.1434;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.128;VQSLOD=3.4926;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,81:159:99:2134,0,1993
3	52821210	.	C	T	1064.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.162;DP=117;Dels=0.00;FS=4.770;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.557;VQSLOD=3.9827;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,43:117:99:1094,0,1875
X	19379640	.	G	C	3354.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5581;MQ=58.71;MQ0=0;QD=29.17;VQSLOD=7.5285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:115:99:3354,250,0
7	1049749	.	C	A	636.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.077;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.858;VQSLOD=5.7167;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:666,0,629
2	118578824	.	A	G	1493.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.814;DP=80;Dels=0.00;FS=0.897;HRun=0;HaplotypeScore=1.7873;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=4.9199;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,51:80:99:1523,0,697
5	82554375	.	A	G	1320.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.544;DP=94;Dels=0.00;FS=0.779;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.038;VQSLOD=4.7029;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,52:94:99:1351,0,1022
1	57395228	.	G	A	1062.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;DP=85;Dels=0.00;FS=4.328;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.730;VQSLOD=4.8496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1092,0,996
19	501738	.	C	A	147.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=18;Dels=0.00;FS=1.913;HRun=0;HaplotypeScore=2.7317;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.826;VQSLOD=3.2790;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:177,0,293
15	50189566	.	A	G	1685.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.009;DP=205;Dels=0.00;FS=1.138;HRun=0;HaplotypeScore=8.5349;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=1.551;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.426;VQSLOD=2.9246;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,78:205:99:1715,0,3178
3	132218621	.	G	A	2997.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;DP=208;DS;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=0;HaplotypeScore=8.1012;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.303;VQSLOD=3.5781;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,108:208:99:3027,0,2527
1	16260606	.	G	A	2893.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.310;DP=190;Dels=0.00;FS=0.541;HRun=0;HaplotypeScore=4.9852;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.425;VQSLOD=3.5290;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,106:190:99:2924,0,1998
12	101761753	.	A	G	2827.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.758;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=3.097;HRun=2;HaplotypeScore=1.5616;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.194;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.412;VQSLOD=4.6186;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,105:231:99:2858,0,3578
X	106016268	.	A	T	2558.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=94;Dels=0.00;FS=3.664;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.437;VQSLOD=3.1283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,93:94:99:2592,175,0
1	16464653	.	G	C	916.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;DP=60;Dels=0.00;FS=3.607;HRun=0;HaplotypeScore=4.8923;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.443;VQSLOD=2.7532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,33:60:99:946,0,688
7	1608812	.	C	G	1580.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.7438;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.961;VQSLOD=3.1051;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,63:148:99:1610,0,2176
18	29412105	.	A	C	1079.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1512;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=3.8673;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,51:104:99:1110,0,1192
16	2133726	.	C	T	393.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=25;Dels=0.00;FS=1.685;HRun=0;HaplotypeScore=2.9810;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.028;VQSLOD=4.0917;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:423,0,255
5	177546780	.	A	G	2545.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=216;Dels=0.00;FS=0.527;HRun=1;HaplotypeScore=4.0285;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.158;VQSLOD=4.1807;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,107:216:99:2576,0,3104
1	17297252	.	A	C	87.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5606;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=2.6560;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:118,0,367
15	63889941	.	A	G	638.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=62;Dels=0.00;FS=1.057;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.316;VQSLOD=4.4888;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,25:62:99:668,0,963
13	52542680	.	A	G	1352.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.159;DP=109;Dels=0.00;FS=1.559;HRun=1;HaplotypeScore=6.4142;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.006;VQSLOD=3.2632;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,49:109:99:1382,0,1519
17	33430313	.	T	C	308.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=11.0557;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:338,0,476
17	59534904	.	G	C	1685.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.778;DP=147;Dels=0.01;FS=2.169;HRun=1;HaplotypeScore=7.3320;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.268;VQSLOD=3.1300;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,63:147:99:1715,0,2022
7	44578740	.	C	G	1729.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.965;DP=132;Dels=0.00;FS=8.840;HRun=1;HaplotypeScore=2.5160;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.804;VQSLOD=2.3775;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,70:132:99:1759,0,1739
7	82764393	.	C	T	2635.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.069;DP=196;DS;Dels=0.00;FS=0.537;HRun=0;HaplotypeScore=4.4810;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.204;VQSLOD=5.1365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,99:196:99:2665,0,2793
10	105891927	.	G	C	727.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=74;Dels=0.00;FS=2.022;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.197;VQSLOD=5.7297;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,31:74:99:758,0,1202
9	95237024	.	CTCA	C	848.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.409;DP=72;FS=1.264;HRun=0;HaplotypeScore=337.9932;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.241;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,26:72:99:887,0,443
1	45795084	.	G	A	2642.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=211;Dels=0.00;FS=3.986;HRun=1;HaplotypeScore=5.1087;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.150;VQSLOD=3.4845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,98:211:99:2673,0,2823
8	17611809	.	G	C	2554.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.504;DP=227;Dels=0.00;FS=4.549;HRun=0;HaplotypeScore=6.3772;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.770;VQSLOD=2.8872;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,101:227:99:2584,0,3688
2	86088333	.	T	C	1726.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.570;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9943;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.362;VQSLOD=4.0850;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,65:128:99:1756,0,1614
2	75879359	.	G	A	791.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.551;DP=74;Dels=0.00;FS=0.934;HRun=4;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.998;VQSLOD=5.6640;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,32:74:99:821,0,1180
3	196807928	.	A	C	741.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.707;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.163;VQSLOD=5.7736;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,31:55:99:771,0,554
1	65099841	.	A	G	1321.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.924;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.603;VQSLOD=3.6255;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,47:101:99:1351,0,1492
8	99148791	.	A	G	2401.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.470;DP=226;Dels=0.00;FS=0.491;HRun=0;HaplotypeScore=8.4417;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.013;VQSLOD=2.6786;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,96:226:99:2431,0,3053
3	436384	.	A	T	272.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=43;Dels=0.00;FS=5.159;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.626;VQSLOD=2.6294;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,13:43:99:303,0,761
11	60886423	.	C	T	812.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=60;Dels=0.00;FS=1.007;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.030;VQSLOD=4.8342;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,33:60:99:842,0,575
8	17722223	.	C	T	386.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.741;DP=36;Dels=0.00;FS=3.410;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.621;VQSLOD=4.9110;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,16:36:99:417,0,466
3	131100956	.	C	G	974.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.737;DP=97;Dels=0.00;FS=2.800;HRun=0;HaplotypeScore=2.3609;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.518;VQSLOD=4.7853;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,43:97:99:1005,0,1411
9	2718712	.	C	A	1644.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=131;Dels=0.00;FS=4.523;HRun=0;HaplotypeScore=3.8287;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.123;VQSLOD=3.5735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,64:131:99:1675,0,1965
4	83785582	.	T	C	1090.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.147;DP=75;Dels=0.00;FS=4.674;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.089;VQSLOD=4.3406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,40:75:99:1121,0,866
1	27332521	.	C	T	952.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.761;DP=71;Dels=0.00;FS=5.836;HRun=0;HaplotypeScore=4.6523;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.489;VQSLOD=3.0529;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,42:71:99:982,0,740
15	92690379	.	A	G	1703.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.264;DP=185;Dels=0.00;FS=8.961;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=2.1952;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,73:185:99:1733,0,3175
17	76447713	.	C	A	3116.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.301;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.212;HRun=2;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.231;VQSLOD=4.6139;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,122:248:99:3147,0,3495
16	57201066	.	T	A	1540.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.000;DP=128;Dels=0.00;FS=0.728;HRun=1;HaplotypeScore=5.6032;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.285;VQSLOD=2.8477;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:128:99:1570,0,1953
10	116046066	.	C	T	1490.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.926;DP=120;Dels=0.00;FS=5.652;HRun=0;HaplotypeScore=3.3072;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=12.42;ReadPosRankSum=-2.175;VQSLOD=2.5045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,56:120:99:1520,0,1802
X	153174934	.	T	G	801.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.49;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=7.0300;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.19:835,72,0
18	20573556	.	G	A	630.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=52;Dels=0.00;FS=2.388;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.833;VQSLOD=5.7752;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:660,0,736
8	144620660	.	G	A	2278.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.280;DP=171;Dels=0.00;FS=1.996;HRun=0;HaplotypeScore=7.6919;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.134;VQSLOD=3.1990;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,84:171:99:2309,0,2210
6	41303993	.	C	T	1024.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.722;DP=70;Dels=0.00;FS=3.254;HRun=0;HaplotypeScore=4.3000;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.182;VQSLOD=4.7869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,36:70:99:1055,0,965
6	109768568	.	G	T	670.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;DP=67;Dels=0.00;FS=1.005;HRun=2;HaplotypeScore=2.6921;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.933;VQSLOD=5.9126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,26:67:99:701,0,1108
19	2422191	.	G	A	2163.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;DP=173;Dels=0.00;FS=2.656;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.625;VQSLOD=5.4358;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,82:173:99:2193,0,2286
9	131696121	.	G	A	2239.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.252;DP=178;Dels=0.00;FS=1.181;HRun=0;HaplotypeScore=1.8893;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=12.58;ReadPosRankSum=3.165;VQSLOD=2.8443;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,89:178:99:2270,0,2210
10	97917556	.	G	C	1371.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.842;DP=118;Dels=0.00;FS=3.404;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.019;VQSLOD=5.8699;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,54:118:99:1401,0,1777
7	69064806	.	A	G	387.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.376;VQSLOD=4.9960;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:418,0,267
X	129150143	.	T	C	132.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.093;VQSLOD=4.0111;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:162,0,135
1	14109319	.	G	A	718.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=4.7500;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:749,0,506
16	72993159	.	A	G	2104.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.754;DP=176;Dels=0.00;FS=4.916;HRun=1;HaplotypeScore=4.6192;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.757;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=3.2675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,76:176:99:2135,0,2688
6	31749884	.	G	A	946.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;DP=70;Dels=0.00;FS=0.918;HRun=0;HaplotypeScore=2.6202;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.565;VQSLOD=4.8954;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,37:70:99:977,0,917
14	64687258	.	A	T	1046.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;DP=87;Dels=0.00;FS=1.819;HRun=0;HaplotypeScore=3.8814;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=12.03;ReadPosRankSum=-2.568;VQSLOD=3.3177;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,43:87:99:1077,0,1188
19	36674413	.	G	A	3957.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.578;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.472;HRun=0;HaplotypeScore=3.6945;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.409;VQSLOD=2.4747;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3288,0,3444
17	9729503	.	G	C	473.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.705;DP=33;Dels=0.00;FS=3.166;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.754;VQSLOD=5.2527;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:503,0,424
1	155206037	.	G	A	447.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.385;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.866;VQSLOD=6.1293;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:477,0,514
X	1471062	.	G	C	1311.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;DP=74;Dels=0.00;FS=5.300;HRun=1;HaplotypeScore=1.5774;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.941;VQSLOD=3.1431;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,45:74:99:1342,0,794
3	156413682	.	A	C	724.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.811;DP=60;Dels=0.00;FS=1.028;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.104;VQSLOD=3.2027;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,29:60:99:755,0,799
10	25273744	.	T	C	1203.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.800;DP=99;Dels=0.00;FS=5.079;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=4.7064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,46:99:99:1233,0,1395
19	54973653	.	C	T	856.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.332;DP=76;Dels=0.00;FS=10.734;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.845;VQSLOD=3.9380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,37:76:99:887,0,1068
1	32158076	.	T	C	820.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.215;VQSLOD=5.9749;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,32:60:99:851,0,753
2	204001482	.	A	G	2228.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=201;Dels=0.00;FS=2.460;HRun=1;HaplotypeScore=2.8729;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.767;VQSLOD=4.7912;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,94:201:99:2258,0,2707
19	38056830	.	GA	G	1237.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=63;FS=2.122;HRun=1;HaplotypeScore=155.1217;MQ=60.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.685;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,35:63:99:1276,0,1153
12	52579259	.	C	T	1494.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.009;DP=112;Dels=0.00;FS=3.842;HRun=0;HaplotypeScore=2.4029;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.103;VQSLOD=4.3991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,53:112:99:1525,0,1480
17	3916824	.	C	T	1366.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2131;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.003;VQSLOD=3.9898;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,58:119:99:1397,0,1715
12	53586536	.	C	T	1549.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.618;DP=139;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=0;HaplotypeScore=2.8926;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.699;VQSLOD=5.4099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,61:139:99:1580,0,2107
1	23418803	.	G	C	4616.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.835;HRun=0;HaplotypeScore=3.5919;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.879;VQSLOD=4.3852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,135:250:99:3969,0,3125
4	8583046	.	C	T	306.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.251;DP=17;Dels=0.00;FS=2.187;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=4.2540;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:337,0,120
11	6816872	.	G	T	1871.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=148;Dels=0.00;FS=6.081;HRun=1;HaplotypeScore=5.8704;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.405;VQSLOD=2.8954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,71:148:99:1901,0,2151
16	24815534	.	A	G	894.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;DP=68;Dels=0.00;FS=4.662;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.924;VQSLOD=4.3499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,37:68:99:925,0,831
16	48174765	.	C	A	1610.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.774;DP=157;Dels=0.00;FS=0.613;HRun=2;HaplotypeScore=2.9792;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.657;VQSLOD=4.4362;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,62:157:99:1640,0,2640
17	29161517	.	G	A	2878.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.678;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4122;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.415;VQSLOD=2.6976;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,112:249:99:2909,0,3276
4	89625388	.	A	T	2140.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.379;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4984;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=13.21;ReadPosRankSum=2.586;VQSLOD=4.3608;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,77:162:99:2171,0,2276
7	1028376	.	C	T	452.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.482;DP=34;Dels=0.00;FS=3.211;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=4.4350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:482,0,357
12	15776164	.	A	C	774.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.856;DP=89;Dels=0.00;FS=1.847;HRun=1;HaplotypeScore=4.7184;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.724;VQSLOD=5.3505;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,33:89:99:804,0,1450
4	187205402	.	A	G	523.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.491;DP=48;Dels=0.00;FS=4.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.843;VQSLOD=4.1639;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,19:48:99:553,0,823
9	32550896	.	G	C	710.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9947;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=13.66;ReadPosRankSum=-2.260;VQSLOD=4.9973;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:740,0,612
12	57569339	.	G	A	1514.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=127;Dels=0.00;FS=5.446;HRun=0;HaplotypeScore=2.5494;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.078;VQSLOD=4.6216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,55:127:99:1544,0,1952
9	116053252	.	C	T	2265.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=149;Dels=0.00;FS=4.373;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.039;VQSLOD=4.0911;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,85:149:99:2295,0,1677
6	132891675	.	C	T	2000.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6312;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.024;VQSLOD=4.3831;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,85:205:99:2030,0,3547
18	76873346	.	G	A	942.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.919;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9794;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.628;VQSLOD=3.5375;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,41:88:99:973,0,1121
19	12088237	.	G	A	1016.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.517;VQSLOD=4.9259;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,44:82:99:1046,0,945
X	2836184	.	C	T	139.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.936;VQSLOD=3.0502;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:170,0,170
10	99968670	.	A	G	1789.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HRun=0;HaplotypeScore=3.5350;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.269;VQSLOD=5.6537;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,63:125:99:1820,0,1553
19	44739712	.	G	C	1150.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=88;Dels=0.00;FS=4.132;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.918;VQSLOD=4.3240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,43:88:99:1181,0,1227
5	16681986	.	C	T	1291.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;DP=125;Dels=0.00;FS=10.170;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.221;VQSLOD=2.6394;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,48:125:99:1322,0,2138
3	140409837	.	G	A	1393.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.968;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.019;VQSLOD=5.6392;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,52:95:99:1423,0,994
15	43712823	.	C	T	1425.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=120;Dels=0.00;FS=1.478;HRun=2;HaplotypeScore=6.6496;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.911;VQSLOD=4.5800;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,53:120:99:1455,0,1653
12	4737404	.	C	T	1674.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;DP=157;Dels=0.00;FS=8.798;HRun=1;HaplotypeScore=3.9114;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.982;VQSLOD=3.2011;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,67:157:99:1704,0,2472
17	34862932	.	C	T	462.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;DP=56;Dels=0.00;FS=2.377;HRun=0;HaplotypeScore=3.3153;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.642;VQSLOD=3.5381;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,21:56:99:493,0,941
16	3432993	.	G	C	1416.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=75;Dels=0.00;FS=3.494;HRun=0;HaplotypeScore=4.8786;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.606;VQSLOD=2.3981;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,47:75:99:1447,0,765
10	22019855	.	G	A	1901.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=143;Dels=0.00;FS=3.407;HRun=0;HaplotypeScore=1.9623;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=4.7451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,74:143:99:1931,0,1763
19	501743	.	T	C	191.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.468;DP=16;Dels=0.00;FS=5.021;HRun=1;HaplotypeScore=2.7317;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.523;VQSLOD=3.6028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:222,0,180
6	29408571	.	G	T	3157.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.376;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.487;HRun=0;HaplotypeScore=1.9936;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.259;VQSLOD=4.5209;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3187,0,3702
12	6630988	.	A	G	802.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;DP=80;Dels=0.00;FS=6.130;HRun=1;HaplotypeScore=1.5518;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.356;VQSLOD=5.1681;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,31:80:99:833,0,1316
3	54925426	.	C	T	749.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.463;DP=77;Dels=0.00;FS=3.017;HRun=0;HaplotypeScore=2.8291;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.373;VQSLOD=5.1838;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,33:77:99:780,0,1062
12	21624546	.	C	G	933.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;DP=68;Dels=0.00;FS=1.004;HRun=0;HaplotypeScore=3.4279;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.637;VQSLOD=2.7062;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,34:68:99:963,0,877
7	133932357	.	T	C	1190.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;DP=115;Dels=0.00;FS=2.368;HRun=0;HaplotypeScore=2.5310;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.014;VQSLOD=5.8899;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1220,0,1356
1	155264120	.	C	G	760.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9966;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.723;VQSLOD=3.8562;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:791,0,832
1	158985673	.	G	A	1752.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=168;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=1;HaplotypeScore=5.2745;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.513;VQSLOD=4.1303;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,73:168:99:1782,0,2403
12	96371731	.	C	T	1510.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.621;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4962;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.526;VQSLOD=5.2536;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,57:140:99:1541,0,2247
15	48623812	.	G	A	164.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.741;VQSLOD=11.5347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:194,0,120
14	20666175	.	C	CA	4546.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=273.0452;MQ=60.55;MQ0=0;QD=34.19;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,121:133:99:4547,370,0
20	62378405	.	C	T	506.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.822;DP=62;Dels=0.00;FS=1.053;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.816;VQSLOD=4.1789;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,23:62:99:537,0,1016
22	50885800	.	G	A	2025.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.879;DP=172;Dels=0.00;FS=2.729;HRun=0;HaplotypeScore=8.1830;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.612;VQSLOD=2.6444;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,78:172:99:2055,0,2147
15	22853786	.	C	T	162.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.130;DP=40;Dels=0.00;FS=3.223;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.648;VQSLOD=2.4292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,9:40:99:193,0,882
11	78433753	.	T	C	2285.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.766;DP=176;Dels=0.00;FS=2.081;HRun=2;HaplotypeScore=2.4303;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.846;VQSLOD=4.6023;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,86:176:99:2315,0,2300
1	22160001	.	C	T	933.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.471;DP=72;Dels=0.00;FS=6.518;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=4.7444;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,33:72:99:964,0,896
12	110034320	.	G	A	1128.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.901;DP=86;Dels=0.00;FS=9.762;HRun=0;HaplotypeScore=3.9855;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.343;VQSLOD=3.6239;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,49:86:99:1159,0,816
19	19741292	.	C	G	1472.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.144;DP=142;Dels=0.00;FS=0.622;HRun=0;HaplotypeScore=1.9461;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.308;VQSLOD=4.6845;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,67:142:99:1503,0,1865
2	27461368	.	T	C	1569.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=148;Dels=0.00;FS=1.336;HRun=0;HaplotypeScore=3.4391;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.030;VQSLOD=4.4950;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,60:148:99:1600,0,2339
12	48538908	.	G	A	1453.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.521;DP=116;Dels=0.00;FS=1.510;HRun=0;HaplotypeScore=3.5996;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.217;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.216;VQSLOD=4.5959;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,52:116:99:1484,0,1667
13	20797025	.	A	T	1381.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=100;Dels=0.00;FS=0.761;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.386;VQSLOD=5.8476;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,55:100:99:1412,0,1142
8	2037874	.	C	T	1169.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.376;DP=85;Dels=0.00;FS=0.838;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=13.76;ReadPosRankSum=-2.317;VQSLOD=4.9267;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,44:85:99:1199,0,1116
2	179400130	.	G	A	1594.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=121;Dels=0.00;FS=7.243;HRun=0;HaplotypeScore=1.9980;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.901;VQSLOD=3.9213;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,57:121:99:1624,0,1789
7	128494922	.	G	A	1751.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.989;DP=134;Dels=0.00;FS=2.189;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.971;VQSLOD=4.0434;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,67:134:99:1782,0,1687
5	150947891	.	C	G	2565.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;DP=176;Dels=0.00;FS=1.978;HRun=0;HaplotypeScore=1.9990;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.856;VQSLOD=5.5966;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,93:176:99:2595,0,2424
11	1082353	.	C	T	218.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.247;DP=26;Dels=0.00;FS=1.685;HRun=1;HaplotypeScore=1.9975;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.471;VQSLOD=4.1260;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:248,0,382
12	8278195	.	G	A	1158.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.547;DP=82;Dels=0.00;FS=0.872;HRun=0;HaplotypeScore=4.7687;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.643;VQSLOD=4.9174;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,45:82:99:1188,0,885
17	1383868	.	C	T	1818.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.082;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.050;VQSLOD=5.5838;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,75:195:99:1848,0,2995
5	70307189	.	G	A	735.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;DP=68;Dels=0.00;FS=4.951;HRun=0;HaplotypeScore=3.6379;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.273;VQSLOD=3.6790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,29:68:99:766,0,958
11	68566802	.	G	A	887.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;DP=71;Dels=0.00;FS=0.889;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.524;VQSLOD=3.1110;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,37:71:99:917,0,871
20	18297336	.	G	A	1709.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=143;Dels=0.00;FS=8.064;HRun=0;HaplotypeScore=8.9460;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.777;VQSLOD=2.3877;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,71:143:99:1739,0,1760
2	220161785	.	G	C	738.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4824;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.781;VQSLOD=3.5054;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,35:68:99:768,0,953
15	55652187	.	T	C	3777	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.895;DP=206;Dels=0.00;FS=6.006;HRun=1;HaplotypeScore=2.9930;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.902;VQSLOD=2.5891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,121:206:99:3301,0,1990
1	226055624	.	C	T	1221.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=119;Dels=0.00;FS=0.698;HRun=0;HaplotypeScore=2.8448;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.397;VQSLOD=5.4037;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,52:119:99:1252,0,1905
3	48682480	.	C	A	796.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;DP=62;Dels=0.00;FS=4.985;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.092;VQSLOD=3.9208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:62:99:827,0,796
17	72367973	.	T	C	946.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;DP=65;Dels=0.00;FS=3.468;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.099;VQSLOD=4.9132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,35:65:99:976,0,720
16	24372717	.	G	A	2008.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=185;Dels=0.00;FS=12.899;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.641;VQSLOD=2.5366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,89:185:99:2039,0,2343
X	2835863	.	G	T	743.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.564;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.285;VQSLOD=4.0749;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,31:63:99:774,0,921
4	99325652	.	G	C	702.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.405;DP=51;Dels=0.00;FS=2.422;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.498;VQSLOD=4.6337;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,25:51:99:733,0,687
11	108175544	.	C	CG	183.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.548;DP=76;FS=98.848;HRun=1;HaplotypeScore=418.9612;MQ=60.52;MQ0=0;MQRankSum=3.225;QD=2.42;ReadPosRankSum=-4.933;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,31:76:99:223,0,1153
1	155260382	.	C	T	1117.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=77;Dels=0.00;FS=8.752;HRun=0;HaplotypeScore=2.7476;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.508;VQSLOD=4.0527;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,43:77:99:1148,0,972
16	30456729	.	C	T	195.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;DP=19;Dels=0.00;FS=3.274;HRun=0;HaplotypeScore=2.2859;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.177;VQSLOD=4.7707;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:225,0,286
2	44513202	.	T	C	2247.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.160;DP=174;Dels=0.00;FS=4.587;HRun=0;HaplotypeScore=2.7470;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.407;VQSLOD=3.3963;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,88:174:99:2278,0,2307
1	32207720	.	G	A	654.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.686;DP=56;Dels=0.00;FS=1.451;HRun=0;HaplotypeScore=2.9141;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.304;VQSLOD=3.3082;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,28:56:99:684,0,651
19	10106260	.	G	A	1054.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;DP=87;Dels=0.00;FS=4.075;HRun=0;HaplotypeScore=5.2211;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.430;VQSLOD=2.6930;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,45:87:99:1085,0,1094
1	46032307	.	G	A	2067.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=189;Dels=0.00;FS=3.365;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.126;VQSLOD=5.2333;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,82:189:99:2097,0,2749
6	146351069	.	G	A	1226.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=97;Dels=0.00;FS=0.771;HRun=0;HaplotypeScore=3.4698;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.514;VQSLOD=4.7869;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,45:97:99:1256,0,1409
11	1018093	.	G	GT	647.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.268;DP=186;DS;FS=52.174;HRun=1;HaplotypeScore=1680.1075;MQ=41.69;MQ0=4;MQRankSum=-6.998;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.880;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,58:186:99:686,0,5175
19	38896204	.	T	G	1243.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;DP=127;Dels=0.00;FS=3.560;HRun=1;HaplotypeScore=5.5898;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.003;VQSLOD=3.9207;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,52:127:99:1273,0,1890
8	100994274	.	A	G	2356.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.601;DP=153;DS;Dels=0.00;FS=3.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.196;VQSLOD=4.5416;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,81:153:99:2386,0,1942
15	40018945	.	C	A	280.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=43;Dels=0.00;FS=1.406;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.501;VQSLOD=3.6071;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,12:43:99:310,0,825
20	17956347	.	C	T	1283.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.516;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.059;VQSLOD=3.8322;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,52:92:99:1314,0,1036
11	111707001	.	T	C	1102.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;DP=95;Dels=0.00;FS=4.004;HRun=0;HaplotypeScore=2.7348;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.361;VQSLOD=3.7031;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,46:95:99:1133,0,1250
1	33236255	.	G	A	401.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.724;DP=39;Dels=0.00;FS=1.293;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=10.30;ReadPosRankSum=2.144;VQSLOD=4.5379;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,16:39:99:432,0,630
19	3179884	.	G	T	2245.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.016;DP=174;Dels=0.00;FS=5.565;HRun=0;HaplotypeScore=4.6904;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.267;VQSLOD=4.6791;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,86:174:99:2275,0,2091
3	33156020	.	C	G	143.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.339;DP=14;Dels=0.00;FS=5.434;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.524;VQSLOD=3.6556;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:174,0,230
16	320629	.	C	T	211.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=16;Dels=0.00;FS=2.081;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.788;VQSLOD=5.6054;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:241,0,188
16	3019781	.	T	TC	184.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=28;FS=26.946;HRun=1;HaplotypeScore=161.8037;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.637;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:224,0,120
16	28550174	.	C	T	548.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=49;Dels=0.00;FS=2.940;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.270;VQSLOD=4.7567;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,23:49:99:578,0,718
14	37736325	.	A	G	1315.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;DP=90;Dels=0.00;FS=1.760;HRun=1;HaplotypeScore=3.8225;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=4.2096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,55:90:99:1346,0,930
16	69377470	.	A	G	2119.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=196;Dels=0.00;FS=2.476;HRun=0;HaplotypeScore=10.3971;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.187;VQSLOD=3.0851;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,91:196:99:2149,0,2532
1	228109247	.	C	T	1262.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.051;DP=95;Dels=0.00;FS=3.836;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.197;VQSLOD=4.8474;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,48:95:99:1292,0,1225
9	95179071	.	G	A	932.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=87;Dels=0.00;FS=1.765;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.399;VQSLOD=5.7871;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:963,0,1437
18	21057228	.	C	T	2413.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=166;DS;Dels=0.00;FS=3.339;HRun=1;HaplotypeScore=1.9860;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.176;VQSLOD=4.9759;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,88:166:99:2444,0,1835
12	48137441	.	C	T	831.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.317;DP=63;Dels=0.00;FS=3.665;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.148;VQSLOD=4.5670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:63:99:861,0,747
19	57985702	.	C	A	1312.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.135;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8288;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.458;VQSLOD=2.8725;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,49:84:99:1343,0,835
6	116574452	.	C	T	161.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.245;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7519;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.147;VQSLOD=2.7293;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:191,0,619
16	89776278	.	C	T	2397.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.415;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6898;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=4.5871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,100:176:99:2428,0,2003
2	188348943	.	G	A	253.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.186;VQSLOD=4.2681;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:284,0,526
3	125877290	.	G	A	535.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.516;DP=41;Dels=0.00;FS=2.304;HRun=0;HaplotypeScore=3.4114;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.216;VQSLOD=4.1976;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:566,0,618
1	207200875	.	G	GT	2597.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;DP=129;FS=0.667;HRun=1;HaplotypeScore=302.8926;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=20.13;ReadPosRankSum=-1.004;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,67:129:99:2636,0,1845
17	61417560	.	G	T	2278.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.025;DP=150;Dels=0.00;FS=3.953;HRun=0;HaplotypeScore=2.3293;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=4.0971;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,86:150:99:2308,0,1716
15	34649336	.	G	A	1083.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.817;DP=82;Dels=0.00;FS=1.923;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.517;VQSLOD=3.3659;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,42:82:99:1114,0,1120
12	116457069	.	C	T	1594.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=126;Dels=0.00;FS=2.676;HRun=0;HaplotypeScore=6.8552;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.238;VQSLOD=3.2592;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,64:126:99:1625,0,1603
4	57839405	.	T	C	3202.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.239;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.885;HRun=0;HaplotypeScore=4.5348;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.578;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.360;VQSLOD=3.0816;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,122:239:99:3232,0,2985
11	78449583	.	G	A	1019.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.510;VQSLOD=4.7779;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,40:93:99:1050,0,1359
5	24511490	.	C	T	2495.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.548;DP=204;DS;Dels=0.00;FS=12.043;HRun=0;HaplotypeScore=5.7544;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=2.3118;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,96:204:99:2525,0,3031
21	45217936	.	C	T	962.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.903;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.606;VQSLOD=5.2037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,33:57:99:993,0,573
6	35762937	.	G	A	961.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.073;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3459;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.696;VQSLOD=3.9406;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,44:191:99:992,0,4049
9	35675799	.	C	A	538.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.360;DP=51;Dels=0.00;FS=2.471;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.162;VQSLOD=5.7932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,22:51:99:569,0,725
15	80855492	.	T	A	3963.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.622;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=3.236;HRun=0;HaplotypeScore=5.1080;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.225;VQSLOD=3.0957;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,115:224:99:3340,0,3006
17	7849130	.	G	A	1451.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=173;Dels=0.00;FS=3.018;HRun=0;HaplotypeScore=5.3597;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.092;VQSLOD=3.1154;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,60:173:99:1482,0,2960
17	59761411	.	CTCTT	C	1754.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.940;DP=76;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=349.1594;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.955;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,38:76:99:1794,0,2237
5	179321458	.	C	T	771.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;DP=58;Dels=0.00;FS=4.798;HRun=0;HaplotypeScore=1.9874;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.497;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.101;VQSLOD=3.4038;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,28:58:99:802,0,893
14	94088266	.	G	A	2176.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.554;DP=157;Dels=0.00;FS=5.878;HRun=1;HaplotypeScore=6.9601;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.874;VQSLOD=3.9750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,78:157:99:2206,0,2040
19	35435059	.	G	A	1356.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.271;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.152;VQSLOD=4.9312;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,49:103:99:1387,0,1493
16	31391381	.	G	A	1053.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.602;DP=94;Dels=0.00;FS=1.750;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.167;VQSLOD=3.7410;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,41:94:99:1084,0,1352
18	29101156	.	T	G	1855.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.219;DP=135;Dels=0.00;FS=0.677;HRun=1;HaplotypeScore=3.4433;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.378;VQSLOD=4.5429;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,74:135:99:1886,0,1540
3	58191244	.	G	A	3161.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.733;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.138;HRun=1;HaplotypeScore=5.7389;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.674;VQSLOD=3.5741;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,124:248:99:3192,0,3258
11	76506691	.	G	A	1083.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.338;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2367;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=15.04;ReadPosRankSum=-1.108;VQSLOD=2.9239;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,40:72:99:1113,0,788
2	86317012	.	C	G	793.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=76;Dels=0.00;FS=4.208;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.165;VQSLOD=4.3866;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,30:76:99:824,0,1206
3	100074068	.	C	T	775.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.260;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8284;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.290;VQSLOD=3.9856;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,35:84:99:806,0,1279
6	90661242	.	C	T	2379.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;DP=164;Dels=0.00;FS=7.155;HRun=0;HaplotypeScore=6.6748;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.302;VQSLOD=2.7907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,90:164:99:2409,0,1808
19	58948579	.	T	C	997.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.121;DP=80;Dels=0.00;FS=1.992;HRun=0;HaplotypeScore=2.8278;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.656;VQSLOD=3.8073;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,39:80:99:1028,0,1047
6	39859415	.	A	G	451.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.844;VQSLOD=4.6778;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,17:44:99:482,0,667
15	90168171	.	C	T	2224.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.667;DP=196;Dels=0.00;FS=1.798;HRun=0;HaplotypeScore=1.9025;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.945;VQSLOD=4.8412;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,91:196:99:2254,0,2799
17	19474875	.	C	T	1039.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.809;DP=84;Dels=0.00;FS=0.886;HRun=0;HaplotypeScore=2.6503;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.979;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.434;VQSLOD=4.7869;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,45:84:99:1069,0,976
4	55131118	.	C	T	2250.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;DP=178;Dels=0.00;FS=1.217;HRun=2;HaplotypeScore=2.7932;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.841;VQSLOD=4.7823;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,89:178:99:2280,0,2298
10	127737958	.	T	C	2560.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.775;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=5.134;HRun=0;HaplotypeScore=5.4402;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.850;VQSLOD=3.8173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,87:162:99:2591,0,2053
10	31810679	.	A	G	1072.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=87;Dels=0.00;FS=7.124;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.425;VQSLOD=3.4421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:1102,0,1407
10	49447720	.	G	A	675.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.271;DP=80;Dels=0.00;FS=0.893;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.317;VQSLOD=5.4926;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,30:80:99:706,0,1212
7	95216415	.	C	CA	294.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=66;FS=67.469;HRun=2;HaplotypeScore=391.7316;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=2.547;QD=4.40;ReadPosRankSum=-4.235;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,32:66:99:334,0,674
4	139093119	.	A	T	912.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.114;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.943;VQSLOD=4.2820;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:94:99:942,0,1180
9	136277979	.	G	A	1823.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=117;Dels=0.00;FS=2.440;HRun=0;HaplotypeScore=5.3801;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.981;VQSLOD=3.2030;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,70:117:99:1854,0,1227
19	18701700	.	G	A	350.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;DP=28;Dels=0.00;FS=1.510;HRun=0;HaplotypeScore=2.4551;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.130;VQSLOD=5.4931;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:28:99:381,0,290
10	79616564	.	G	A	613.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3210;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.722;VQSLOD=2.5413;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,28:59:99:644,0,765
22	20043504	.	G	A	749.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=90;Dels=0.00;FS=0.821;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=4.6492;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,33:90:99:780,0,1517
4	106604164	.	C	A	2433.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=218;Dels=0.00;FS=1.061;HRun=0;HaplotypeScore=3.5356;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.478;VQSLOD=4.7051;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,95:218:99:2464,0,3258
8	23004486	.	G	A	1783.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9962;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.349;VQSLOD=4.8313;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,67:131:99:1814,0,1591
20	40045902	.	C	T	2307.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=145;Dels=0.00;FS=1.384;HRun=1;HaplotypeScore=2.3696;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.399;VQSLOD=4.1349;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,89:145:99:2338,0,1403
15	66735693	.	G	T	608.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.035;DP=52;Dels=0.00;FS=7.260;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.368;VQSLOD=3.4847;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,23:52:99:638,0,766
8	21996199	.	G	A	1121.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.040;DP=72;Dels=0.00;FS=7.017;HRun=0;HaplotypeScore=1.7880;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=15.57;ReadPosRankSum=2.596;VQSLOD=3.2652;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,45:72:99:1151,0,619
2	20974586	.	C	T	2476.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.678;DP=225;Dels=0.00;FS=5.551;HRun=1;HaplotypeScore=7.2651;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.258;VQSLOD=4.1284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,99:225:99:2507,0,3125
14	24656694	.	GTC	G	1573.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.692;DP=109;FS=0.741;HRun=0;HaplotypeScore=341.1591;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.068;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,45:109:99:1612,0,2989
17	26696680	.	T	A	969.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=57;Dels=0.00;FS=1.053;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=17.01;ReadPosRankSum=-1.472;VQSLOD=5.1315;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,34:57:99:1000,0,644
17	19813277	.	G	T	920.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=84;Dels=0.00;FS=0.827;HRun=2;HaplotypeScore=2.4370;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.139;VQSLOD=3.5126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,40:84:99:950,0,1127
2	65541063	.	C	G	1814.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.757;DP=150;Dels=0.00;FS=7.257;HRun=0;HaplotypeScore=7.2492;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.656;VQSLOD=2.7231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,74:150:99:1844,0,2224
17	69519	.	T	C	1607.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=157;Dels=0.00;FS=1.326;HRun=1;HaplotypeScore=4.0054;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=3.9419;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,69:157:99:1637,0,2379
19	53959715	.	C	T	2547.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.939;DP=201;Dels=0.00;FS=1.736;HRun=0;HaplotypeScore=4.2775;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.989;VQSLOD=3.6329;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,97:201:99:2578,0,2938
17	66872692	.	A	G	2052.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;DP=205;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7824;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.613;VQSLOD=4.4093;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,81:205:99:2083,0,3215
1	40535490	.	C	CG	838.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.346;DP=131;DS;FS=125.979;HRun=1;HaplotypeScore=683.9167;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=6.40;ReadPosRankSum=-4.512;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,74:131:99:877,0,1276
2	219561254	.	G	A	1392.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.097;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.843;VQSLOD=6.4023;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,53:127:99:1422,0,1802
16	22149688	.	T	C	279.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=10.5565;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:310,0,149
8	143816828	.	G	A	446.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=12.7290;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.11:479,39,0
1	228506768	.	C	T	321.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.110;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.425;VQSLOD=4.7049;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:351,0,466
4	79353667	.	G	A	364.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=10.3368;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:395,0,543
12	53702252	.	TCAGA	T	5469.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.918;DP=245;DS;FS=2.232;HRun=0;HaplotypeScore=1143.7843;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=22.32;ReadPosRankSum=1.289;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,111:245:99:5469,0,9080
15	42278168	.	C	T	349.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.300;DP=25;Dels=0.00;FS=6.402;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.804;VQSLOD=4.6280;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:380,0,246
17	73753098	.	G	A	993.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.002;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=10.5342;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,36:65:99:1023,0,743
15	22864369	.	G	A	799.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.505;VQSLOD=4.9096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,33:89:99:830,0,1519
20	23375624	.	T	C	1242.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.607;DP=112;Dels=0.00;FS=2.700;HRun=0;HaplotypeScore=3.3212;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.191;VQSLOD=5.3786;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,48:112:99:1273,0,1706
4	120422407	.	T	G	789.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.215;DP=67;Dels=0.00;FS=3.576;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.263;VQSLOD=3.9934;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,32:67:99:820,0,856
17	56386383	.	C	CT	730.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;DP=137;FS=171.598;HRun=2;HaplotypeScore=494.7743;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=4.418;QD=5.33;ReadPosRankSum=-4.329;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,48:137:99:770,0,1671
21	41455898	.	T	C	1019.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.626;DP=102;Dels=0.00;FS=2.669;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.277;VQSLOD=4.4078;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,44:102:99:1049,0,1328
7	158672405	.	C	G	248.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.064;DP=36;Dels=0.00;FS=7.847;HRun=0;HaplotypeScore=3.4485;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.487;VQSLOD=2.6556;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,12:36:99:278,0,671
19	39876646	.	A	G	990.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=97;Dels=0.00;FS=4.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.001;VQSLOD=4.2278;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,38:97:99:1020,0,1453
15	78466037	.	C	G	1263.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.405;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.138;VQSLOD=4.7066;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,49:119:99:1293,0,1806
3	138023785	.	C	T	3017.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.472;HRun=0;HaplotypeScore=9.4978;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.694;VQSLOD=2.2166;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,110:250:99:3048,0,3668
20	43723573	.	C	T	2523.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.832;DP=195;Dels=0.00;FS=7.356;HRun=0;HaplotypeScore=7.4651;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.290;VQSLOD=2.8688;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,95:195:99:2554,0,2633
12	39726179	.	T	C	3906.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.042;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=7.305;HRun=0;HaplotypeScore=4.0815;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.536;VQSLOD=3.0418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,123:249:99:3316,0,3181
3	72971366	.	G	A	3026.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.989;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.553;HRun=0;HaplotypeScore=2.9912;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.111;VQSLOD=4.9660;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,120:245:99:3057,0,3450
14	24030824	.	A	AT	1101.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=93;FS=5.748;HRun=6;HaplotypeScore=231.5748;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.068;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,37:93:99:1141,0,1195
17	61497577	.	G	A	310.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.759;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=5.5283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:340,0,113
12	49430947	.	T	C	1131.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=117;Dels=0.00;FS=0.698;HRun=0;HaplotypeScore=3.4442;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.097;VQSLOD=5.0249;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,48:117:99:1162,0,1847
19	11097098	.	C	T	99.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.718;VQSLOD=4.1687;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:129,0,171
10	53458646	.	A	C	437.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.102;DP=30;Dels=0.00;FS=6.429;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.725;VQSLOD=3.4017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:468,0,416
11	8414089	.	C	CA	462.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.332;DP=158;FS=3.851;HRun=0;HaplotypeScore=618.4830;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-6.826;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.051;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,20:158:99:502,0,4235
1	202731846	.	G	T	2248.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9800;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.984;VQSLOD=2.7026;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,93:214:99:2279,0,3120
14	72054708	.	G	A	2455.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=1.666;HRun=0;HaplotypeScore=9.4106;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=3.3561;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,96:223:99:2485,0,3336
13	41814531	.	C	T	1378.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.984;DP=100;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=0;HaplotypeScore=1.9736;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.107;VQSLOD=5.0603;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,52:100:99:1408,0,1241
14	64954410	.	G	A	4626.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.195;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.866;HRun=1;HaplotypeScore=4.6490;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.578;VQSLOD=3.0731;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,137:250:99:3949,0,3204
18	21119949	.	T	A	1470.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;DP=134;Dels=0.00;FS=1.531;HRun=2;HaplotypeScore=4.5098;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.228;VQSLOD=4.0276;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,60:134:99:1500,0,1932
11	60183132	.	G	C	549.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.450;DP=51;Dels=0.00;FS=3.896;HRun=0;HaplotypeScore=4.9112;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.718;VQSLOD=2.7443;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,21:51:99:580,0,758
8	33318891	.	T	C	2051.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.326;DP=180;Dels=0.00;FS=0.616;HRun=2;HaplotypeScore=1.9774;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.174;VQSLOD=4.5126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,78:180:99:2081,0,2736
9	112687354	.	C	T	1371.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.240;DP=117;Dels=0.00;FS=4.487;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.278;VQSLOD=3.6009;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,55:117:99:1402,0,1493
14	45711988	.	C	A	1579.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.690;DP=140;Dels=0.00;FS=2.269;HRun=0;HaplotypeScore=4.5980;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.204;VQSLOD=4.1176;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,69:140:99:1609,0,1806
7	157931003	.	C	T	791.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;DP=70;Dels=0.00;FS=2.482;HRun=0;HaplotypeScore=2.3913;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=11.31;ReadPosRankSum=-2.007;VQSLOD=5.2367;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:821,0,1066
10	116057112	.	C	T	532.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.517;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.978;VQSLOD=4.6030;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:57:99:562,0,952
19	3179427	.	G	A	2794.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=1.894;HRun=0;HaplotypeScore=8.8479;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.730;VQSLOD=2.5443;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,108:218:99:2825,0,2997
8	8235578	.	C	T	543.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.199;DP=62;Dels=0.00;FS=6.601;HRun=1;HaplotypeScore=1.4450;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.066;VQSLOD=2.8036;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,22:62:99:573,0,1140
16	15729650	.	C	T	1236.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.236;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.058;VQSLOD=4.7372;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,46:109:99:1267,0,1683
2	203820453	.	T	C	487.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.102;DP=56;Dels=0.00;FS=5.429;HRun=0;HaplotypeScore=3.4885;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.310;VQSLOD=3.1909;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:56:99:518,0,876
12	111353547	.	G	T	2640.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.903;HRun=2;HaplotypeScore=7.1121;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.790;VQSLOD=2.4905;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,108:239:99:2671,0,3311
14	94088734	.	G	A	1712.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=177;Dels=0.00;FS=1.213;HRun=2;HaplotypeScore=9.8165;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=2.2986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,70:177:99:1743,0,2858
12	55886507	.	A	G	1369.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;DP=129;Dels=0.00;FS=0.657;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.682;VQSLOD=4.6653;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,56:129:99:1399,0,1952
2	189861933	.	C	A	1669	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.440;DP=147;Dels=0.00;FS=7.331;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.255;VQSLOD=4.2132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,70:147:99:1699,0,2042
8	86049708	.	T	C	1297.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.163;DP=100;Dels=0.00;FS=2.888;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.266;VQSLOD=5.0723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,54:100:99:1327,0,1200
10	12595329	.	A	G	1806.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.059;DP=129;Dels=0.00;FS=0.802;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.643;VQSLOD=6.3109;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,64:129:99:1836,0,1847
2	187702100	.	G	T	815.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;DP=83;Dels=0.00;FS=0.843;HRun=1;HaplotypeScore=3.3826;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=3.6109;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,35:83:99:846,0,1325
16	74425569	.	C	T	7739.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7635;MQ=56.84;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=4.5549;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7738,611,0
5	140773812	.	G	A	736.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.786;DP=59;Dels=0.00;FS=8.433;HRun=1;HaplotypeScore=1.9153;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.592;VQSLOD=3.1677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,27:59:99:767,0,820
6	87970650	.	G	A	249.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=6.4601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:280,0,192
17	72916365	.	C	T	684.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.900;DP=54;Dels=0.00;FS=2.577;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.140;VQSLOD=4.8171;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,24:54:99:714,0,786
11	12316146	.	C	A	1316.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=114;Dels=0.00;FS=4.595;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.828;VQSLOD=5.4473;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,52:114:99:1346,0,1887
7	81588616	.	T	G	942.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.888;DP=67;Dels=0.00;FS=2.117;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.680;VQSLOD=5.9864;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,39:67:99:972,0,668
20	3128854	.	A	G	1452.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=144;Dels=0.00;FS=1.325;HRun=0;HaplotypeScore=3.9635;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.371;VQSLOD=4.3521;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,60:144:99:1483,0,1988
