1	881918	.	G	A	861.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.048;DP=83;Dels=0.00;FS=1.848;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.749;VQSLOD=5.7609;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,33:83:99:891,0,1300
1	888659	.	T	C	1257.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.53;MQ0=0;QD=32.24;VQSLOD=8.1358;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1290,105,0
1	909238	.	G	C	1019.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=66;Dels=0.00;FS=0.949;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=6.1256;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,38:66:99:1049,0,717
1	978762	.	G	A	224.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=20;Dels=0.00;FS=2.392;HRun=0;HaplotypeScore=7.6397;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.288;VQSLOD=2.8342;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:20:99:255,0,244
1	1269554	.	T	C	912.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=35.11;VQSLOD=9.2646;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78.23:946,78,0
1	1430985	.	C	T	993.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.170;DP=87;Dels=0.00;FS=0.998;HRun=0;HaplotypeScore=3.9004;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.004;VQSLOD=4.5955;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,40:87:99:1024,0,1117
1	1551927	.	T	C	899.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.71;VQSLOD=5.6157;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:69.22:933,69,0
1	1558792	.	T	C	357.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.34;VQSLOD=13.1025;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:33.08:390,33,0
1	1686040	.	G	T	5146.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.2100;MQ=59.88;MQ0=0;QD=33.64;VQSLOD=8.4095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:5146,397,0
1	2444414	.	G	A	2224.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.842;DP=160;Dels=0.00;FS=4.777;HRun=0;HaplotypeScore=5.4332;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.720;VQSLOD=4.5545;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,83:160:99:2255,0,1884
1	2488153	.	A	G	146.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.271;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=9.16;ReadPosRankSum=-2.115;VQSLOD=10.0782;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:177,0,265
1	2526746	.	A	G	779.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.317;DP=62;Dels=0.00;FS=1.044;HRun=0;HaplotypeScore=1.8934;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.768;VQSLOD=6.7565;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:62:99:809,0,840
1	3328358	.	T	C	6598.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.4079;MQ=59.64;MQ0=0;QD=31.13;VQSLOD=7.4685;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6598,512,0
1	3389727	.	C	T	3696.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.9388;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=5.2251;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:126:99:3695,310,0
1	3428608	.	G	A	1665.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.690;DP=109;Dels=0.00;FS=3.943;HRun=0;HaplotypeScore=2.5922;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.449;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.948;VQSLOD=5.0504;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,65:109:99:1696,0,1053
1	3496479	.	T	C	473.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=20;Dels=0.00;FS=5.006;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=23.68;ReadPosRankSum=1.561;VQSLOD=3.2560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:14.70:506,15,0
1	3511934	.	A	G	587.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;DP=62;Dels=0.00;FS=4.349;HRun=0;HaplotypeScore=2.7658;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.955;VQSLOD=5.2348;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,27:62:99:618,0,768
1	3745924	.	G	A	590.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.974;DP=61;Dels=0.00;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=4.6547;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.787;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.007;VQSLOD=5.1125;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,28:61:99:620,0,866
1	3753136	.	A	T	2012.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=178;Dels=0.00;FS=2.004;HRun=0;HaplotypeScore=1.9722;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.254;VQSLOD=5.9230;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,83:178:99:2042,0,2380
1	3807593	.	G	C	6394.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.6109;MQ=59.02;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=6.9033;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6394,488,0
1	4772717	.	G	A	2517.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.649;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.1268;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.865;VQSLOD=4.3708;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,100:197:99:2547,0,2435
1	6046264	.	G	A	720.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.710;DP=52;Dels=0.00;FS=4.076;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.278;VQSLOD=5.8022;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,29:52:99:750,0,613
1	6184092	.	A	G	1107.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=9.3692;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:93.27:1140,93,0
1	6313938	.	C	T	1192.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.36;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=9.0164;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1226,102,0
1	6614535	.	G	A	410.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.84;MQ0=0;QD=20.54;VQSLOD=6.1364;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:20:39.09:444,39,0
1	6635231	.	A	G	1878.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;QD=33.54;VQSLOD=9.6260;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1911,150,0
1	6693097	.	A	G	317.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.091;DP=28;Dels=0.00;FS=7.402;HRun=3;HaplotypeScore=2.4432;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.370;VQSLOD=2.9647;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:347,0,415
1	7880683	.	T	G	867.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.890;DP=82;Dels=0.00;FS=1.960;HRun=1;HaplotypeScore=3.1233;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.109;VQSLOD=6.2401;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,37:82:99:898,0,1140
1	7887493	.	T	C	4646.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.4496;MQ=59.23;MQ0=0;QD=33.67;VQSLOD=7.9222;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:138:99:4646,379,0
1	7890117	.	T	C	4023.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=246;Dels=0.00;FS=5.194;HRun=0;HaplotypeScore=9.9578;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.501;VQSLOD=2.2427;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,134:246:99:3409,0,2955
1	7897133	.	A	G	1030.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;DP=79;Dels=0.00;FS=1.874;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.260;VQSLOD=6.6268;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,41:79:99:1061,0,983
1	7913430	.	G	A	1040.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.387;DP=89;Dels=0.00;FS=1.870;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.426;VQSLOD=5.6363;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,39:89:99:1070,0,1283
1	9009406	.	C	T	684.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=62;Dels=0.00;FS=5.329;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.951;VQSLOD=4.9975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,27:62:99:715,0,994
1	9009444	.	A	C	879.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.741;DP=73;Dels=0.00;FS=0.951;HRun=0;HaplotypeScore=4.3123;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=6.1297;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,33:73:99:909,0,1101
1	11090916	.	C	A	2919	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.266;DP=104;Dels=0.00;FS=3.054;HRun=1;HaplotypeScore=4.5539;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=28.07;ReadPosRankSum=-0.666;VQSLOD=3.8605;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,103:104:99:2952,199,0
1	11106666	.	T	C	843.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.011;DP=81;Dels=0.00;FS=0.861;HRun=1;HaplotypeScore=1.6439;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.532;VQSLOD=5.9209;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,33:81:99:873,0,1204
1	11561593	.	G	A	290.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;DP=28;Dels=0.00;FS=3.674;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.391;VQSLOD=4.9796;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:321,0,455
1	11856378	.	G	A	2598.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.571;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.975;HRun=0;HaplotypeScore=7.9562;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.229;VQSLOD=4.5684;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,101:239:99:2629,0,3877
1	11884555	.	A	G	3851.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.4734;MQ=58.46;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=7.8971;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3851,295,0
1	12082926	.	A	G	800.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.096;DP=44;Dels=0.00;FS=1.306;HRun=0;HaplotypeScore=3.8277;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.391;VQSLOD=5.3199;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,30:44:99:831,0,345
1	12175729	.	C	T	5170.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8725;MQ=59.55;MQ0=0;QD=33.80;VQSLOD=8.2705;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:5170,418,0
1	12252955	.	T	G	804.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.089;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.9779;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.307;VQSLOD=6.3332;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,31:67:99:835,0,984
1	12776344	.	A	T	1576.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.579;DP=145;Dels=0.00;FS=3.052;HRun=1;HaplotypeScore=8.4126;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.194;VQSLOD=3.7045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,62:145:99:1606,0,2030
1	12779560	.	T	C	5433.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.8606;MQ=59.62;MQ0=0;QD=33.96;VQSLOD=9.9990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:5433,427,0
1	12779618	.	T	C	4399.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=34.37;VQSLOD=9.4852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4399,343,0
1	12785494	.	G	T	5416.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=6.4303;MQ=59.37;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=7.1851;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5416,433,0
1	12820870	.	T	C	3577.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4394;MQ=59.58;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=8.8097;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3577,280,0
1	12835868	.	T	C	5298.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.29;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=9.1062;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,171:171:99:5298,433,0
1	12854530	.	C	G	7697.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8892;MQ=51.08;MQ0=10;QD=31.42;VQSLOD=3.1488;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:7695,653,0
1	13940864	.	C	G	1837.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=192;Dels=0.00;FS=0.548;HRun=1;HaplotypeScore=8.5136;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.805;VQSLOD=3.0545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,79:192:99:1868,0,2770
1	14109319	.	G	A	718.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=4.7500;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:749,0,506
1	14143003	.	A	G	3124.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6628;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=8.3682;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:104:99:3157,259,0
1	15438990	.	G	A	283.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;QD=28.36;VQSLOD=8.3438;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:27.06:317,27,0
1	15812432	.	A	G	8020.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4440;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=9.2452;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8019,671,0
1	16096934	.	C	T	1781.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.439;DP=149;Dels=0.00;FS=2.145;HRun=1;HaplotypeScore=2.2859;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=2.490;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.693;VQSLOD=5.0239;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,72:149:99:1812,0,1899
1	16256007	.	T	C	634.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.041;DP=58;Dels=0.00;FS=2.243;HRun=1;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.155;VQSLOD=6.8665;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,24:58:99:664,0,899
1	16259813	.	A	G	1229.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=110;Dels=0.00;FS=9.439;HRun=0;HaplotypeScore=2.9912;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.641;VQSLOD=4.3830;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,47:110:99:1259,0,1766
1	16260606	.	G	A	2893.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.310;DP=190;Dels=0.00;FS=0.541;HRun=0;HaplotypeScore=4.9852;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.425;VQSLOD=3.5290;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,106:190:99:2924,0,1998
1	16351275	.	A	G	1422.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=109;Dels=0.00;FS=2.660;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.725;VQSLOD=4.8723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,57:109:99:1452,0,1447
1	16356501	.	G	A	736.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=103;Dels=0.00;FS=1.785;HRun=0;HaplotypeScore=3.4265;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.400;VQSLOD=5.3143;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,33:103:99:766,0,1707
1	16371067	.	G	T	232.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.25;VQSLOD=11.9894;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:21.05:265,21,0
1	16380196	.	T	C	4340.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.707;DP=158;Dels=0.00;FS=3.163;HRun=0;HaplotypeScore=2.4703;MQ=51.79;MQ0=6;MQRankSum=0.091;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.684;VQSLOD=3.0190;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,157:158:99:4307,331,0
1	16464653	.	G	C	916.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;DP=60;Dels=0.00;FS=3.607;HRun=0;HaplotypeScore=4.8923;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.443;VQSLOD=2.7532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,33:60:99:946,0,688
1	16532498	.	G	A	396.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.432;DP=35;Dels=0.00;FS=1.281;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=11.33;ReadPosRankSum=-2.053;VQSLOD=4.9272;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:427,0,450
1	16534646	.	C	G	1174.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.781;DP=81;Dels=0.00;FS=0.850;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.262;VQSLOD=6.6528;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,46:81:99:1204,0,890
1	16577908	.	G	C	731.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.596;DP=69;Dels=0.00;FS=2.191;HRun=0;HaplotypeScore=5.5690;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.727;VQSLOD=4.2012;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,27:69:99:762,0,1168
1	16730308	.	G	T	1959.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=162;Dels=0.00;FS=4.933;HRun=2;HaplotypeScore=8.8221;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.068;VQSLOD=3.9562;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,75:162:99:1989,0,2197
1	16892272	.	C	CT	697.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.528;DP=42;DS;FS=88.834;HRun=1;HaplotypeScore=407.5146;MQ=13.50;MQ0=153;MQRankSum=-5.049;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.171;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,23:42:99:737,0,647
1	16892276	.	TG	T	670.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.459;DP=42;DS;FS=95.161;HRun=1;HaplotypeScore=398.5461;MQ=13.46;MQ0=154;MQRankSum=-5.006;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.101;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,23:42:99:710,0,796
1	17087541	.	GGTGCT	G	1171.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=152;DS;FS=35.118;HRun=0;HaplotypeScore=853.6694;MQ=40.47;MQ0=6;MQRankSum=-4.137;QD=5.48;ReadPosRankSum=-3.075;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,72:152:99:1211,0,10568
1	17265560	.	C	T	109.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=12;Dels=0.00;FS=6.264;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.663;VQSLOD=3.2823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:140,0,125
1	17266536	.	G	C	252.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.832;DP=42;Dels=0.00;FS=1.574;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.030;VQSLOD=3.3778;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,11:42:99:282,0,903
1	17297252	.	A	C	87.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5606;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=2.6560;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:118,0,367
1	17657534	.	G	A	1231.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.871;DP=100;Dels=0.00;FS=2.683;HRun=0;HaplotypeScore=5.9130;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.162;VQSLOD=4.9922;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,45:100:99:1262,0,1357
1	17657616	.	T	C	721.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;DP=75;Dels=0.00;FS=0.904;HRun=0;HaplotypeScore=5.4511;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.173;VQSLOD=4.8413;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,30:75:99:751,0,1183
1	17660499	.	G	C	1367.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.510;DP=119;Dels=0.00;FS=0.700;HRun=0;HaplotypeScore=2.6287;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.481;VQSLOD=6.1207;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,60:119:99:1398,0,1624
1	17991052	.	T	C	987.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.15;MQ0=0;QD=29.94;VQSLOD=7.8664;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:81.24:1021,81,0
1	18023690	.	A	G	1223.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=31.36;VQSLOD=9.5518;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1256,111,0
1	18149510	.	G	T	740.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9977;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.043;VQSLOD=6.4687;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,27:69:99:770,0,1307
1	18807897	.	C	G	1814.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=8.9509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1847,159,0
1	18807953	.	C	A	2830.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9962;MQ=58.65;MQ0=0;QD=32.17;VQSLOD=8.8923;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2864,226,0
1	18808292	.	C	A	5402.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7591;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.8115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:169:99:5402,436,0
1	18808526	.	A	C	1150.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.88;VQSLOD=9.1507;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:93.29:1184,93,0
1	19175846	.	T	C	967.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.344;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5757;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.401;VQSLOD=6.2664;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,37:66:99:997,0,748
1	19186129	.	G	C	3656.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4787;MQ=58.95;MQ0=0;QD=33.24;VQSLOD=8.6540;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3656,280,0
1	19413261	.	T	A	669.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;DP=61;Dels=0.00;FS=0.982;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.141;VQSLOD=5.0809;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:699,0,898
1	19499560	.	T	C	1344.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=91;Dels=0.00;FS=0.783;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.266;VQSLOD=6.0240;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,48:91:99:1375,0,1103
1	19595137	.	C	T	1475.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=121;Dels=0.00;FS=4.550;HRun=0;HaplotypeScore=3.9944;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.550;VQSLOD=4.2551;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,64:121:99:1505,0,1419
1	19611241	.	T	C	2039.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.651;DP=166;Dels=0.00;FS=0.573;HRun=1;HaplotypeScore=5.8570;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=5.0563;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,84:166:99:2070,0,2097
1	20020994	.	C	T	2665.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.251;DP=220;Dels=0.00;FS=1.811;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.563;VQSLOD=6.2414;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,110:220:99:2696,0,2808
1	20246876	.	C	T	1021.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;DP=74;Dels=0.00;FS=3.412;HRun=0;HaplotypeScore=4.3302;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.746;VQSLOD=4.8233;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,40:74:99:1051,0,827
1	20442054	.	T	C	1241.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=123;Dels=0.00;FS=0.677;HRun=1;HaplotypeScore=3.8074;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.368;VQSLOD=5.4583;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,56:123:99:1272,0,1743
1	20490518	.	T	C	994.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.86;MQ0=0;QD=30.13;VQSLOD=9.2598;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:81.25:1027,81,0
1	20915701	.	A	C	757.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.119;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.622;VQSLOD=6.7718;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,31:82:99:788,0,1360
1	20972111	.	G	A	1262.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.307;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8874;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.628;VQSLOD=4.0622;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,46:86:99:1292,0,977
1	20977000	.	A	C	1003.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.770;DP=83;Dels=0.00;FS=4.981;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.263;VQSLOD=5.9103;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,35:83:99:1033,0,1347
1	20987873	.	G	C	715.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08;VQSLOD=12.9095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:57.19:749,57,0
1	21024901	.	C	T	2345.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9940;MQ=58.78;MQ0=0;QD=30.07;VQSLOD=9.0026;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2378,187,0
1	21042033	.	T	C	1921.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;DP=137;Dels=0.00;FS=0.640;HRun=1;HaplotypeScore=3.8587;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.694;VQSLOD=5.3310;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,71:137:99:1951,0,1846
1	21573855	.	G	A	1358.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.695;DP=116;Dels=0.00;FS=3.674;HRun=0;HaplotypeScore=5.8423;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.533;VQSLOD=5.0288;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,57:116:99:1389,0,1487
1	21795388	.	A	G	4891.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.84;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=9.8031;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4892,373,0
1	21940555	.	C	T	1445	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.84;VQSLOD=9.0979;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1478,117,0
1	22160001	.	C	T	933.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.471;DP=72;Dels=0.00;FS=6.518;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=4.7444;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,33:72:99:964,0,896
1	22160043	.	C	T	1120.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.074;DP=76;Dels=0.00;FS=0.918;HRun=1;HaplotypeScore=1.7675;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.801;VQSLOD=5.8881;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,39:76:99:1151,0,882
1	22167605	.	C	T	347.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.092;DP=27;Dels=0.00;FS=9.864;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.237;VQSLOD=3.6353;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:378,0,360
1	22168801	.	T	C	822.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.303;DP=69;Dels=0.00;FS=3.363;HRun=1;HaplotypeScore=1.7219;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.150;VQSLOD=6.0626;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,32:69:99:853,0,935
1	22168845	.	A	T	604.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;DP=50;Dels=0.00;FS=12.025;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.058;VQSLOD=3.7155;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:635,0,774
1	22179244	.	C	T	2949.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.195;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=0.714;HRun=0;HaplotypeScore=2.6493;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.825;VQSLOD=5.2732;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,106:195:99:2980,0,2208
1	22181895	.	C	T	289.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.097;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.122;VQSLOD=6.0116;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:320,0,570
1	22191454	.	G	A	103.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9330;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.286;VQSLOD=2.7454;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:16:99:134,0,291
1	22206649	.	T	C	2604.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.357;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9789;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=31.38;ReadPosRankSum=1.315;VQSLOD=7.8585;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,82:83:99:2638,181,0
1	22207235	.	T	C	454.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=13.9582;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.12:488,39,0
1	22307538	.	C	T	3947.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=56.30;MQ0=0;QD=32.90;VQSLOD=8.0145;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3948,304,0
1	22336277	.	C	G	2806.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7792;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.142;VQSLOD=5.0463;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,88:89:99:2840,199,0
1	22835677	.	A	G	5609.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5313;MQ=59.04;MQ0=0;QD=33.00;VQSLOD=7.9411;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:170:99:5609,433,0
1	22846709	.	G	A	5531.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8127;MQ=59.25;MQ0=0;QD=34.15;VQSLOD=8.4821;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5531,454,0
1	22852880	.	G	C	1769.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.925;DP=167;Dels=0.00;FS=0.624;HRun=0;HaplotypeScore=4.1049;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.477;VQSLOD=5.4406;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,76:167:99:1799,0,2540
1	23418153	.	C	T	5300.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.3403;MQ=59.18;MQ0=0;QD=30.29;VQSLOD=7.7097;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5300,421,0
1	23418803	.	G	C	4616.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.835;HRun=0;HaplotypeScore=3.5919;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.879;VQSLOD=4.3852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,135:250:99:3969,0,3125
1	23419374	.	G	T	7874.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5345;MQ=58.81;MQ0=0;QD=34.69;VQSLOD=9.4876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:7874,629,0
1	23419383	.	C	T	8297.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8215;MQ=58.88;MQ0=0;QD=34.43;VQSLOD=8.5651;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,240:241:99:8297,659,0
1	23847464	.	C	A	1088.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.180;DP=100;Dels=0.00;FS=2.749;HRun=0;HaplotypeScore=4.2716;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.285;VQSLOD=5.5941;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,43:100:99:1119,0,1589
1	23885498	.	T	C	357.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.040;VQSLOD=6.6794;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:388,0,665
1	23965704	.	A	C	281.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.666;DP=32;Dels=0.00;FS=1.440;HRun=0;HaplotypeScore=3.8547;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=5.8618;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:311,0,556
1	24201920	.	T	C	4132.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3187;MQ=58.48;MQ0=0;QD=32.80;VQSLOD=6.2836;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:4132,349,0
1	24393563	.	C	T	80.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.577;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.774;VQSLOD=4.5083;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:110,0,341
1	24394811	.	A	G	3059.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.609;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.025;HRun=1;HaplotypeScore=5.9263;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.199;VQSLOD=5.1068;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:3089,0,3856
1	24406535	.	G	A	1706.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;DP=118;Dels=0.00;FS=3.455;HRun=0;HaplotypeScore=8.0844;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.297;VQSLOD=4.2855;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,64:118:99:1736,0,1440
1	24416059	.	T	C	329.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94;VQSLOD=9.5604;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30.08:362,30,0
1	24417415	.	T	C	1281.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.169;DP=124;Dels=0.00;FS=5.856;HRun=0;HaplotypeScore=6.2808;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.145;VQSLOD=4.4049;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,57:124:99:1312,0,1847
1	24447468	.	G	C	848.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.250;DP=73;Dels=0.00;FS=2.003;HRun=1;HaplotypeScore=1.9989;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.239;VQSLOD=6.3268;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,30:73:99:878,0,1115
1	24861704	.	G	A	763.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.808;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.253;VQSLOD=6.3753;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,27:50:99:794,0,542
1	25291010	.	A	T	533.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.061;DP=32;Dels=0.00;FS=6.205;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.996;VQSLOD=4.0617;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,22:32:99:564,0,247
1	25570081	.	T	C	1509.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.755;DP=120;Dels=0.00;FS=1.494;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.658;VQSLOD=6.7439;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,65:120:99:1540,0,1243
1	25572984	.	T	G	2503.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.768;DP=232;DS;Dels=0.00;FS=2.291;HRun=0;HaplotypeScore=3.8192;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.348;VQSLOD=5.6684;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,97:232:99:2533,0,3534
1	25889632	.	T	C	1409.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=1.8646;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=9.5429;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1443,114,0
1	26131654	.	G	A	3932.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3714;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.832;VQSLOD=5.6727;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,127:128:99:3932,340,0
1	26136282	.	C	T	2406.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=188;Dels=0.00;FS=8.496;HRun=0;HaplotypeScore=6.5302;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.323;VQSLOD=2.8976;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,91:188:99:2437,0,2277
1	26138262	.	T	C	517.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;QD=28.77;VQSLOD=8.3958;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:42.13:551,42,0
1	26140573	.	C	A	3451.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.4833;MQ=58.45;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=7.9826;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:111:99:3451,280,0
1	26357656	.	C	A	1553.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=136;Dels=0.00;FS=0.647;HRun=1;HaplotypeScore=3.6155;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.390;VQSLOD=6.4296;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,64:136:99:1583,0,1867
1	26487940	.	A	G	45.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.422;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.422;VQSLOD=4.3872;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:75.74:76,0,148
1	26520292	.	G	T	2261.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=157;Dels=0.00;FS=2.063;HRun=2;HaplotypeScore=1.8519;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.641;VQSLOD=6.2685;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,90:157:99:2291,0,1882
1	26527951	.	G	A	3930.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.470;HRun=1;HaplotypeScore=6.3014;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.287;VQSLOD=4.1927;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,137:250:99:3345,0,2837
1	26582091	.	G	A	2183.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.662;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.746;VQSLOD=6.6861;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,92:222:99:2214,0,3520
1	26610891	.	A	C	2102.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=8.5990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2135,177,0
1	26646726	.	A	G	3528.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=110;Dels=0.00;FS=3.100;HRun=0;HaplotypeScore=1.9963;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=32.08;ReadPosRankSum=-0.839;VQSLOD=4.5735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,108:110:99:3457,202,0
1	26646730	.	A	G	3811.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.998;DP=118;Dels=0.00;FS=5.367;HRun=0;HaplotypeScore=2.8284;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.116;VQSLOD=4.2992;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,117:118:99:3775,259,0
1	26673076	.	G	A	164.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.134;VQSLOD=5.8604;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:13:99:194,0,119
1	26691174	.	C	A	2150.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.664;DP=155;Dels=0.00;FS=13.805;HRun=1;HaplotypeScore=7.4784;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.009;VQSLOD=2.7802;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,72:155:99:2181,0,2117
1	26694245	.	T	C	168.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.150;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.428;VQSLOD=6.4286;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:199,0,156
1	26786627	.	G	A	3115.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14;VQSLOD=13.9609;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3149,253,0
1	27210721	.	T	C	1029.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7740;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.182;VQSLOD=5.6933;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,40:73:99:1060,0,921
1	27332521	.	C	T	952.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.761;DP=71;Dels=0.00;FS=5.836;HRun=0;HaplotypeScore=4.6523;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.489;VQSLOD=3.0529;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,42:71:99:982,0,740
1	27677409	.	G	A	974.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;DP=94;Dels=0.00;FS=4.099;HRun=0;HaplotypeScore=2.6448;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.606;VQSLOD=5.3047;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,43:94:99:1004,0,1374
1	27679797	.	A	G	653.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72;VQSLOD=13.2972;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:57.17:687,57,0
1	27687466	.	G	T	175.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;DP=25;Dels=0.00;FS=3.960;HRun=2;HaplotypeScore=0.9997;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.786;VQSLOD=5.2759;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:205,0,489
1	27688633	.	G	A	563.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7381;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.070;VQSLOD=6.0684;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,23:51:99:593,0,747
1	27875824	.	C	T	3170.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5989;MQ=59.57;MQ0=0;QD=29.63;VQSLOD=7.7819;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3203,259,0
1	28209366	.	A	G	5769.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.0534;MQ=58.79;MQ0=0;QD=32.23;VQSLOD=8.6835;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5769,454,0
1	28282292	.	T	C	3514.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=33.15;ReadPosRankSum=0.233;VQSLOD=9.5333;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,105:106:99:3514,277,0
1	28800380	.	C	A	1852.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.592;DP=123;Dels=0.00;FS=11.275;HRun=0;HaplotypeScore=2.0756;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.885;VQSLOD=4.1570;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,66:123:99:1882,0,1606
1	29475648	.	T	G	6045.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.4721;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.961;QD=33.03;ReadPosRankSum=2.656;VQSLOD=3.0252;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,179:183:99:5977,427,0
1	29542637	.	A	G	5969.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6254;MQ=59.90;MQ0=0;QD=32.44;VQSLOD=9.3347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:184:99:5969,469,0
1	29631909	.	A	G	2093.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.188;DP=192;Dels=0.00;FS=5.183;HRun=0;HaplotypeScore=3.8083;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.395;VQSLOD=4.8807;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,82:192:99:2124,0,2845
1	31349647	.	C	T	527.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.090;DP=38;Dels=0.00;FS=14.520;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.931;VQSLOD=3.5113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,22:38:99:558,0,372
1	32092525	.	A	G	7137.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.963;HRun=0;HaplotypeScore=6.3487;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.906;VQSLOD=3.8911;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,237:239:99:7064,521,0
1	32158076	.	T	C	820.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.215;VQSLOD=5.9749;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,32:60:99:851,0,753
1	32165495	.	G	T	3377.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.15;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=8.2309;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3377,259,0
1	32207720	.	G	A	654.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.686;DP=56;Dels=0.00;FS=1.451;HRun=0;HaplotypeScore=2.9141;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.304;VQSLOD=3.3082;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,28:56:99:684,0,651
1	32279629	.	G	A	1587.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.019;DP=110;Dels=0.00;FS=13.993;HRun=0;HaplotypeScore=2.8857;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.294;VQSLOD=3.6773;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,54:110:99:1617,0,1456
1	32280610	.	T	C	1811.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.650;DP=115;Dels=0.00;FS=8.052;HRun=0;HaplotypeScore=2.7520;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.607;VQSLOD=4.4521;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,59:115:99:1841,0,1417
1	32672908	.	T	G	1204.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=96;Dels=0.00;FS=1.799;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.996;VQSLOD=6.2838;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,44:96:99:1235,0,1315
1	32674927	.	T	C	1594.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=134;Dels=0.00;FS=0.665;HRun=0;HaplotypeScore=4.7569;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.694;VQSLOD=3.9707;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,66:134:99:1624,0,1598
1	32842319	.	T	C	470.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6775;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.229;VQSLOD=5.4969;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,22:66:99:500,0,1192
1	33065947	.	G	C	3488.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8184;MQ=59.43;MQ0=0;QD=32.01;VQSLOD=7.7755;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3488,262,0
1	33236255	.	G	A	401.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.724;DP=39;Dels=0.00;FS=1.293;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=10.30;ReadPosRankSum=2.144;VQSLOD=4.5379;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,16:39:99:432,0,630
1	33957152	.	T	G	3117.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.8255;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52;VQSLOD=8.9893;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:3151,247,0
1	34038214	.	T	C	2002.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=188;Dels=0.00;FS=1.165;HRun=0;HaplotypeScore=7.5173;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.651;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=2.7660;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,85:188:99:2032,0,2728
1	34663208	.	C	G	1486.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;DP=100;Dels=0.00;FS=4.984;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=14.86;ReadPosRankSum=-1.102;VQSLOD=4.0953;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,55:100:99:1516,0,1368
1	34663411	.	C	G	1411.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;DP=127;Dels=0.00;FS=0.675;HRun=0;HaplotypeScore=6.7259;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.174;VQSLOD=3.8699;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,52:127:99:1442,0,2122
1	35227007	.	TTGTC	T	1761.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.737;DP=77;FS=7.782;HRun=0;HaplotypeScore=376.5769;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.316;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,36:77:99:1800,0,3017
1	35250457	.	C	T	1561.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.104;DP=119;Dels=0.00;FS=3.378;HRun=0;HaplotypeScore=5.1552;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.790;VQSLOD=4.5312;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,57:119:99:1592,0,1572
1	35260769	.	C	T	1257.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=113;Dels=0.00;FS=2.527;HRun=0;HaplotypeScore=2.7348;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.328;VQSLOD=5.4381;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,54:113:99:1287,0,1478
1	35562965	.	G	A	4775.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6014;MQ=59.25;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=8.8230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:4775,367,0
1	36202585	.	G	A	1875.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.536;DP=132;Dels=0.00;FS=1.381;HRun=2;HaplotypeScore=3.8745;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.809;VQSLOD=5.6276;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,70:132:99:1905,0,1637
1	36225948	.	T	C	1013.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=6.8613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,37:75:99:1043,0,981
1	36752433	.	C	T	2267.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.701;DP=145;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0021;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.156;VQSLOD=5.6256;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,83:145:99:2297,0,1778
1	36807481	.	C	T	803.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.925;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.808;VQSLOD=6.7424;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,32:70:99:833,0,1000
1	36887813	.	C	A	1312.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.128;DP=110;Dels=0.00;FS=2.905;HRun=1;HaplotypeScore=5.8699;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.854;VQSLOD=5.0867;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,49:110:99:1343,0,1428
1	38023316	.	C	T	2641.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.446;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=3.032;HRun=0;HaplotypeScore=9.2660;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=10.65;ReadPosRankSum=-2.748;VQSLOD=3.2466;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,107:248:99:2671,0,4284
1	38148765	.	A	G	2475.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0979;MQ=58.04;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=8.6867;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2508,196,0
1	38185723	.	C	T	725.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.302;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9774;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.562;VQSLOD=5.7857;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,27:63:99:755,0,860
1	38188740	.	C	T	1459.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.091;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7985;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.378;VQSLOD=6.2013;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,55:118:99:1489,0,1605
1	38188787	.	A	G	1298.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.831;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.6006;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.486;VQSLOD=5.4280;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,51:108:99:1329,0,1523
1	38227086	.	A	T	1669.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.307;DP=116;DS;Dels=0.00;FS=4.615;HRun=0;HaplotypeScore=3.2726;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.128;VQSLOD=4.7241;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,61:116:99:1699,0,1510
1	38338795	.	A	G	5717.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9090;MQ=59.09;MQ0=0;QD=28.73;VQSLOD=8.3976;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,199:199:99:5716,451,0
1	39340282	.	C	T	1777.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.213;DP=155;Dels=0.00;FS=4.883;HRun=0;HaplotypeScore=4.9333;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.690;VQSLOD=4.6689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,71:155:99:1807,0,1936
1	39352271	.	G	T	2681.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.972;DP=236;Dels=0.00;FS=4.611;HRun=0;HaplotypeScore=5.6101;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.653;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.324;VQSLOD=4.1483;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,104:236:99:2712,0,3805
1	39957913	.	A	G	328.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.21;MQ0=0;QD=23.47;VQSLOD=6.8130;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:30.08:362,30,0
1	40098328	.	T	C	7565.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.2090;MQ=59.58;MQ0=0;QD=30.88;VQSLOD=5.6540;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,244:245:99:7564,611,0
1	40363054	.	G	C	5269.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2337;MQ=59.57;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=8.7628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5268,400,0
1	40533266	.	T	G	1881.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.3990;MQ=52.31;MQ0=0;QD=31.36;VQSLOD=4.3219;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1915,156,0
1	40533287	.	T	G	1190.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9916;MQ=46.85;MQ0=0;QD=29.77;VQSLOD=2.9904;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1224,105,0
1	40533326	.	T	G	1336.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=39.97;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=2.3179;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1369,123,0
1	40533347	.	T	G	1496.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=45.14;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=3.6114;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1529,132,0
1	40535490	.	C	CG	838.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.346;DP=131;DS;FS=125.979;HRun=1;HaplotypeScore=683.9167;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=6.40;ReadPosRankSum=-4.512;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,74:131:99:877,0,1276
1	40562894	.	C	A	517.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;DP=47;Dels=0.00;FS=3.006;HRun=1;HaplotypeScore=3.0588;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.398;VQSLOD=3.3370;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,20:47:99:548,0,833
1	40703244	.	G	A	1464.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.401;DP=122;Dels=0.00;FS=1.472;HRun=0;HaplotypeScore=2.9285;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.618;VQSLOD=5.9720;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,58:122:99:1495,0,1694
1	40773123	.	G	C	379.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;DP=34;Dels=0.00;FS=8.008;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.811;VQSLOD=3.9616;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:410,0,447
1	40773149	.	T	C	333.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=35;Dels=0.00;FS=10.352;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.383;VQSLOD=4.2910;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:363,0,618
1	41485902	.	C	G	1570.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.512;DP=140;Dels=0.00;FS=0.641;HRun=0;HaplotypeScore=4.7715;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.254;VQSLOD=5.3542;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,62:140:99:1600,0,2051
1	41976328	.	T	C	289.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.65;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=7.4298;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:27.08:322,27,0
1	41978825	.	C	G	3089.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.21;MQ0=0;QD=34.33;VQSLOD=8.4385;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:3122,250,0
1	42048745	.	T	C	2483.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7866;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.2178;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2516,217,0
1	42050366	.	C	T	3100.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.991;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.503;HRun=0;HaplotypeScore=7.9224;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.761;VQSLOD=3.8029;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,121:248:99:3131,0,3294
1	42693597	.	A	G	4464.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.645;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3095;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.346;VQSLOD=6.1818;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,159:160:99:4439,324,0
1	42898843	.	A	G	7137.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1526;MQ=59.14;MQ0=0;QD=32.15;VQSLOD=9.4866;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:7137,545,0
1	43119661	.	C	A	494.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.000;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4923;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.333;VQSLOD=6.2082;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,21:49:99:525,0,809
1	43201614	.	C	T	182.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.386;VQSLOD=12.2915;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:45.39:213,0,45
1	43212926	.	G	A	1651.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;DP=120;Dels=0.00;FS=6.984;HRun=0;HaplotypeScore=5.2998;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.896;VQSLOD=3.8705;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,62:120:99:1681,0,1568
1	43223489	.	C	T	3104.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.181;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.600;HRun=0;HaplotypeScore=2.5598;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.011;VQSLOD=6.2099;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,114:245:99:3134,0,3674
1	43232504	.	C	A	777.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7006;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.613;VQSLOD=4.7903;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:57:99:808,0,712
1	43296195	.	C	T	1540.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.565;DP=141;Dels=0.00;FS=0.677;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.865;VQSLOD=5.9588;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,66:141:99:1570,0,2115
1	43632536	.	C	T	2118.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.762;DP=159;Dels=0.00;FS=2.070;HRun=0;HaplotypeScore=9.6164;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.087;VQSLOD=4.2575;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,87:159:99:2148,0,1673
1	43649508	.	A	G	2394.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=4.802;HRun=0;HaplotypeScore=7.8911;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.024;VQSLOD=3.4667;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,98:238:99:2425,0,4038
1	43886494	.	C	T	6891.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.090;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9402;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.66;ReadPosRankSum=1.338;VQSLOD=9.0168;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,210:211:99:6854,530,0
1	44137257	.	C	A	2844.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=9.0788;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2877,226,0
1	44401384	.	A	G	1432.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.52;MQ0=0;QD=29.85;VQSLOD=8.3578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1466,114,0
1	44595113	.	G	C	1462.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;DP=127;Dels=0.00;FS=1.461;HRun=1;HaplotypeScore=3.3659;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.905;VQSLOD=5.2122;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,56:127:99:1493,0,2026
1	44595410	.	A	G	739.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;DP=52;Dels=0.00;FS=7.963;HRun=0;HaplotypeScore=3.1253;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.971;VQSLOD=4.8004;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,25:52:99:769,0,834
1	45795084	.	G	A	2642.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=211;Dels=0.00;FS=3.986;HRun=1;HaplotypeScore=5.1087;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.150;VQSLOD=3.4845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,98:211:99:2673,0,2823
1	45797505	.	C	G	382.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80;VQSLOD=12.4592;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33.10:416,33,0
1	46032307	.	G	A	2067.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=189;Dels=0.00;FS=3.365;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.126;VQSLOD=5.2333;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,82:189:99:2097,0,2749
1	46086077	.	C	T	97.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;DP=21;Dels=0.00;FS=2.046;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.454;VQSLOD=4.3307;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:128,0,491
1	46195375	.	T	C	1250.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.872;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8305;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.120;VQSLOD=6.5380;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,50:108:99:1281,0,1449
1	46476587	.	T	G	813	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=62;Dels=0.00;FS=0.990;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.535;VQSLOD=4.1529;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,36:62:99:843,0,563
1	46521559	.	A	T	1360.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.941;DP=122;Dels=0.00;FS=3.455;HRun=2;HaplotypeScore=3.4429;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.384;VQSLOD=5.7766;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,54:122:99:1391,0,1794
1	46655158	.	T	C	1101.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46;VQSLOD=13.9330;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:90.28:1134,90,0
1	46810530	.	A	G	3057.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.942;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.581;HRun=1;HaplotypeScore=5.4935;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=12.48;ReadPosRankSum=-2.008;VQSLOD=4.3213;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,119:245:99:3087,0,3258
1	46827456	.	A	G	2224.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=147;Dels=0.00;FS=1.994;HRun=0;HaplotypeScore=2.4304;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.157;VQSLOD=6.0105;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,78:147:99:2254,0,1854
1	47080679	.	G	A	852.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.473;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.034;VQSLOD=6.7872;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,35:72:99:883,0,867
1	47279175	.	C	T	1557.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.475;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4324;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.767;VQSLOD=5.6269;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,59:107:99:1587,0,1232
1	47607281	.	C	T	1344.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;DP=129;Dels=0.00;FS=6.665;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.071;VQSLOD=2.9410;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,59:129:99:1374,0,1768
1	47609489	.	T	C	2415.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.333;DP=183;Dels=0.00;FS=4.626;HRun=1;HaplotypeScore=6.5651;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.658;VQSLOD=4.7473;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,95:183:99:2446,0,2566
1	47767914	.	G	A	661.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.071;DP=60;Dels=0.00;FS=2.250;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.669;VQSLOD=5.5498;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,27:60:99:692,0,856
1	47834209	.	G	T	1333.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;DP=115;Dels=0.00;FS=2.383;HRun=1;HaplotypeScore=1.9717;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.752;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.676;VQSLOD=3.8324;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,53:115:99:1364,0,1747
1	48695081	.	G	A	2738.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.438;DP=174;Dels=0.00;FS=0.582;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.543;VQSLOD=6.4818;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,101:174:99:2768,0,1951
1	48697733	.	T	G	4220.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7873;MQ=59.82;MQ0=0;QD=33.23;VQSLOD=9.7833;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:4220,328,0
1	48708228	.	G	T	1054.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.493;DP=85;Dels=0.00;FS=0.968;HRun=0;HaplotypeScore=3.5571;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.588;VQSLOD=6.4195;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,43:85:99:1085,0,1050
1	48764419	.	C	T	3211.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.613;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.5203;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.054;VQSLOD=4.4406;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,127:250:99:3242,0,3365
1	50666515	.	C	T	6484.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.10;MQ0=0;QD=30.73;VQSLOD=8.7282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6484,512,0
1	51826921	.	T	C	4398.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.13;VQSLOD=8.8186;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:146:99:4398,334,0
1	52838992	.	A	G	1496.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;DP=111;Dels=0.00;FS=5.196;HRun=0;HaplotypeScore=3.8409;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.492;VQSLOD=5.1360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,56:111:99:1526,0,1500
1	53535478	.	G	A	164.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.365;VQSLOD=5.5387;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:195,0,153
1	53544597	.	T	C	955.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85;VQSLOD=8.5212;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90.21:989,90,0
1	53553754	.	T	C	2705.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;QD=28.78;VQSLOD=7.9184;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2738,217,0
1	53676448	.	G	A	1174.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.674;DP=85;Dels=0.00;FS=1.784;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.850;VQSLOD=6.5904;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1204,0,1104
1	53712727	.	C	T	753.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.312;DP=56;Dels=0.00;FS=1.097;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.344;VQSLOD=6.8414;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,29:56:99:784,0,669
1	53792651	.	A	C	3133.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6546;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.530;VQSLOD=7.9377;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,99:102:99:3166,187,0
1	54060016	.	G	C	462.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=35;Dels=0.00;FS=4.856;HRun=2;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.414;VQSLOD=5.4439;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:493,0,545
1	54060248	.	T	C	690.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.087;DP=57;Dels=0.00;FS=7.380;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.69;MQ0=1;MQRankSum=0.544;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.829;VQSLOD=3.6359;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,25:57:99:720,0,746
1	54272121	.	T	C	1252.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.276;DP=91;Dels=0.00;FS=4.109;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.095;VQSLOD=3.7113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,54:91:99:1283,0,887
1	54605319	.	G	GC	3111.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=149.7287;MQ=61.47;MQ0=0;QD=41.48;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:3153,226,0
1	54606804	.	C	T	1173.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.134;DP=97;Dels=0.00;FS=8.447;HRun=0;HaplotypeScore=1.9198;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.109;VQSLOD=4.8601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,45:97:99:1204,0,1238
1	54681920	.	G	C	1416.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.240;DP=118;Dels=0.00;FS=0.747;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.584;VQSLOD=5.8953;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,49:118:99:1446,0,2099
1	55064970	.	C	T	2634.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.368;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7861;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.184;VQSLOD=4.2595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,94:166:99:2664,0,1948
1	55075452	.	G	A	461.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.962;DP=54;Dels=0.00;FS=5.765;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.472;VQSLOD=5.3859;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:54:99:491,0,844
1	55119534	.	C	T	4089.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=3.608;HRun=1;HaplotypeScore=8.5904;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.635;VQSLOD=4.2202;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,127:247:99:3460,0,3248
1	55119546	.	A	G	8205.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6165;MQ=59.11;MQ0=0;QD=33.22;VQSLOD=7.2363;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:247:99:8179,638,0
1	55134585	.	A	G	2271.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;DP=159;Dels=0.00;FS=2.171;HRun=1;HaplotypeScore=8.6346;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.182;VQSLOD=4.2528;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,88:159:99:2301,0,1956
1	55139741	.	A	G	2205.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;DP=186;Dels=0.00;FS=1.862;HRun=0;HaplotypeScore=1.8455;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.779;VQSLOD=6.0180;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,91:186:99:2236,0,2405
1	55167773	.	T	A	702.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.764;DP=64;Dels=0.00;FS=0.971;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.181;VQSLOD=5.4086;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,30:64:99:733,0,840
1	55266797	.	G	C	440.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=51;Dels=0.00;FS=1.144;HRun=0;HaplotypeScore=2.8127;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.259;VQSLOD=5.2392;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,20:51:99:471,0,900
1	55277599	.	T	C	3438.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6722;MQ=58.64;MQ0=0;QD=32.14;VQSLOD=8.4442;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3438,271,0
1	55524237	.	G	A	2609.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3888;MQ=58.89;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=8.9310;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2642,223,0
1	55529187	.	G	A	2378.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7249;MQ=58.58;MQ0=0;QD=30.50;VQSLOD=8.7871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2412,193,0
1	55541174	.	A	G	466.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.74;MQ0=0;QD=24.54;VQSLOD=7.6237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:36.12:499,36,0
1	55638075	.	G	A	853.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=14.1445;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:69.22:886,69,0
1	57340727	.	C	A	869.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.922;DP=75;Dels=0.00;FS=0.883;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.838;VQSLOD=4.8421;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,33:75:99:899,0,1158
1	57395228	.	G	A	1062.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;DP=85;Dels=0.00;FS=4.328;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.730;VQSLOD=4.8496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1092,0,996
1	57422484	.	C	T	8583.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5488;MQ=59.35;MQ0=0;QD=34.33;VQSLOD=8.9905;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8583,680,0
1	59002282	.	A	C	1190.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.454;DP=74;Dels=0.00;FS=3.195;HRun=0;HaplotypeScore=1.6918;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.109;VQSLOD=5.5972;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,46:74:99:1220,0,701
1	59004617	.	G	A	1776.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.196;DP=141;Dels=0.00;FS=4.272;HRun=1;HaplotypeScore=5.2096;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.404;VQSLOD=4.4970;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,65:141:99:1807,0,2076
1	59042181	.	G	T	180.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.118;VQSLOD=10.4384;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:211,0,506
1	59147926	.	T	C	1584.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.887;DP=146;Dels=0.00;FS=10.240;HRun=0;HaplotypeScore=5.5652;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.093;VQSLOD=3.9358;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,62:146:99:1614,0,2189
1	59787350	.	T	G	413.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6289;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=12.93;ReadPosRankSum=-2.266;VQSLOD=4.1806;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:444,0,412
1	60466814	.	T	C	225.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=18;Dels=0.00;FS=4.598;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.489;VQSLOD=4.3327;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:256,0,188
1	62257036	.	A	C	952.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4826;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.434;VQSLOD=5.6279;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,40:94:99:982,0,1310
1	62330080	.	T	G	2514.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=32.24;VQSLOD=9.3702;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2548,196,0
1	62713224	.	C	G	6082.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3102;MQ=59.59;MQ0=0;QD=34.17;VQSLOD=8.6670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:6082,478,0
1	62728784	.	A	G	1005.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;QD=29.56;VQSLOD=8.9476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:90.24:1038,90,0
1	62728838	.	T	C	1566.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=31.96;VQSLOD=9.3997;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1599,132,0
1	62732421	.	T	C	1125.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=112;Dels=0.00;FS=3.527;HRun=0;HaplotypeScore=1.4725;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.337;VQSLOD=6.4721;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,50:112:99:1155,0,1551
1	63881552	.	C	T	526.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.8634;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.196;VQSLOD=4.7885;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,21:51:99:556,0,786
1	63999826	.	C	T	1235.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=99;Dels=0.00;FS=2.771;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.081;VQSLOD=6.8230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:99:99:1266,0,1265
1	63999868	.	T	C	633.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6640;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.141;VQSLOD=5.2518;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,28:60:99:664,0,789
1	64021096	.	G	A	1010.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.116;DP=109;Dels=0.00;FS=1.658;HRun=1;HaplotypeScore=4.4468;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.682;VQSLOD=5.3230;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,40:109:99:1041,0,1812
1	64095111	.	A	G	2288.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=186;Dels=0.00;FS=2.558;HRun=0;HaplotypeScore=5.2136;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.525;VQSLOD=5.4433;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,90:186:99:2318,0,2344
1	64643277	.	C	T	7826.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8307;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=9.3908;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:242:99:7826,623,0
1	65099841	.	A	G	1321.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.924;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.603;VQSLOD=3.6255;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,47:101:99:1351,0,1492
1	65113568	.	T	C	2867.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9772;MQ=59.75;MQ0=0;QD=30.51;VQSLOD=9.3073;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2901,244,0
1	67109335	.	A	G	2372.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.219;DP=180;Dels=0.00;FS=7.139;HRun=1;HaplotypeScore=5.8463;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.640;VQSLOD=4.1909;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,88:180:99:2403,0,2582
1	67266756	.	T	A	3956.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0918;MQ=58.02;MQ0=0;QD=29.75;VQSLOD=5.8005;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:3956,295,0
1	67288045	.	C	T	2420.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.12;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=9.0691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2453,187,0
1	67390416	.	G	C	4636.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2156;MQ=59.31;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=5.9440;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4635,388,0
1	67390468	.	C	G	6707.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6433;MQ=58.70;MQ0=0;QD=30.49;VQSLOD=8.3366;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,220:220:99:6706,509,0
1	67450431	.	A	G	1260.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=104;Dels=0.00;FS=1.621;HRun=1;HaplotypeScore=6.7777;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.450;VQSLOD=4.3072;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,47:104:99:1291,0,1675
1	67560956	.	C	T	2610.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;QD=28.38;VQSLOD=8.0024;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2644,202,0
1	67633812	.	G	T	4539.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.19;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=9.3352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4539,355,0
1	67685387	.	T	C	4124.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.1363;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.44;VQSLOD=7.6581;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4123,331,0
1	67833527	.	G	C	3102.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.817;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.992;HRun=0;HaplotypeScore=4.7446;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.860;VQSLOD=4.9554;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,122:250:99:3132,0,3536
1	74575182	.	C	T	825.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=27.53;VQSLOD=8.3828;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:69.19:859,69,0
1	75036812	.	C	T	7889.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2736;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=7.2232;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7889,623,0
1	75097426	.	G	C	2924.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.75;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=8.5766;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2958,226,0
1	76397972	.	C	T	1720.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;QD=29.67;VQSLOD=8.6711;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1754,138,0
1	79392756	.	C	A	1219.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.13;MQ0=0;QD=28.35;VQSLOD=8.4675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:93.30:1252,93,0
1	85009894	.	A	G	148.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.096;DP=19;Dels=0.00;FS=2.077;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.395;VQSLOD=5.9180;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:179,0,284
1	85029077	.	C	T	422.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.038;VQSLOD=5.9861;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:43:99:452,0,597
1	85594466	.	G	A	952.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;DP=125;Dels=0.00;FS=2.495;HRun=0;HaplotypeScore=4.2355;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.659;VQSLOD=4.9086;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,43:125:99:982,0,1801
1	85624549	.	C	T	957.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;QD=28.18;VQSLOD=8.6517;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:75.24:991,75,0
1	85648620	.	C	T	5164.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.2820;MQ=58.77;MQ0=0;QD=30.38;VQSLOD=7.9478;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:170:99:5164,403,0
1	86173943	.	C	T	2021.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.188;DP=145;Dels=0.00;FS=7.519;HRun=2;HaplotypeScore=2.5141;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.164;VQSLOD=4.8205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,78:145:99:2051,0,1995
1	86557967	.	G	A	388.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;DP=39;Dels=0.00;FS=4.977;HRun=0;HaplotypeScore=1.9512;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.411;VQSLOD=5.0253;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:418,0,545
1	86591837	.	G	A	921.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7012;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.412;VQSLOD=6.3796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,40:72:99:952,0,804
1	86900372	.	C	G	3046.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;DP=224;Dels=0.00;FS=3.169;HRun=0;HaplotypeScore=7.6424;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.497;VQSLOD=4.8692;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,114:224:99:3076,0,2815
1	86939130	.	C	T	2762.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.42;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=8.9178;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2796,226,0
1	86952324	.	A	G	2114.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.284;DP=166;Dels=0.00;FS=1.255;HRun=0;HaplotypeScore=3.2906;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.993;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.351;VQSLOD=6.0664;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,76:166:99:2144,0,2386
1	86959173	.	T	C	1438.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;DP=104;Dels=0.00;FS=1.572;HRun=0;HaplotypeScore=2.9230;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.764;VQSLOD=6.5865;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,57:104:99:1469,0,1272
1	89474818	.	A	G	2488.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.11;MQ0=0;QD=32.32;VQSLOD=8.8035;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2522,202,0
1	89475135	.	C	T	4910.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8192;MQ=53.05;MQ0=0;QD=27.59;VQSLOD=3.8730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:4909,379,0
1	89522646	.	G	C	5354.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9810;MQ=58.67;MQ0=0;QD=33.89;VQSLOD=8.9360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:5354,418,0
1	89847372	.	G	T	1075.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.783;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6264;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.349;VQSLOD=5.8619;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,41:96:99:1106,0,1512
1	89847411	.	C	T	1407.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=103;Dels=0.00;FS=3.654;HRun=1;HaplotypeScore=3.5220;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.577;VQSLOD=5.3409;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,52:103:99:1437,0,1448
1	89847444	.	A	G	1478.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;DP=123;Dels=0.00;FS=8.952;HRun=0;HaplotypeScore=4.8889;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.501;VQSLOD=4.3530;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,59:123:99:1509,0,1712
1	89849742	.	A	T	2669.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.37;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=9.1653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2702,211,0
1	90178743	.	A	G	2915.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.42;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=8.8220;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2949,226,0
1	91404256	.	C	A	792.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;DP=66;Dels=0.00;FS=0.954;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.853;VQSLOD=6.2202;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,32:66:99:823,0,839
1	91782031	.	T	C	1515.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.966;DP=117;Dels=0.00;FS=1.662;HRun=0;HaplotypeScore=3.3691;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.713;VQSLOD=5.6770;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,62:117:99:1546,0,1302
1	91859795	.	T	C	2702.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=32.56;VQSLOD=9.9187;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2736,208,0
1	91859801	.	A	G	708.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.415;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.240;VQSLOD=5.6894;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,31:83:99:738,0,1413
1	92327045	.	G	A	1242.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.334;DP=105;Dels=0.00;FS=0.775;HRun=1;HaplotypeScore=1.7883;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.062;VQSLOD=6.5996;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,50:105:99:1272,0,1505
1	92428495	.	C	A	3703.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9117;MQ=58.91;MQ0=0;QD=29.63;VQSLOD=8.6791;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3703,280,0
1	92445257	.	C	G	1384.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5256;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=3.5387;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,53:118:99:1415,0,1591
1	92457843	.	C	T	1260.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.18;MQ0=0;QD=28.00;VQSLOD=7.8211;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:96.30:1293,96,0
1	93160902	.	T	C	4414.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7281;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.66;VQSLOD=8.7780;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4414,334,0
1	93580581	.	G	C	2162.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.04;MQ0=0;QD=30.03;VQSLOD=7.5584;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2195,166,0
1	93620393	.	G	A	2034.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.206;DP=204;Dels=0.00;FS=0.529;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.942;VQSLOD=5.5366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,89:204:99:2064,0,2714
1	93672723	.	A	C	496.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.834;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.314;VQSLOD=5.6902;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,23:42:99:526,0,477
1	94342564	.	C	A	280.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.572;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9861;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.180;VQSLOD=5.3210;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,11:37:99:311,0,685
1	94517254	.	C	G	1168.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.769;DP=93;Dels=0.00;FS=2.910;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=5.1981;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,46:93:99:1198,0,1193
1	94639447	.	C	T	6604.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1357;MQ=59.66;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=7.1211;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6604,533,0
1	95330372	.	G	A	7809.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8907;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.14;VQSLOD=9.5358;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:243:99:7808,620,0
1	95709821	.	T	C	3415.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.18;MQ0=0;QD=31.05;VQSLOD=9.7070;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3415,274,0
1	95709939	.	T	G	3972.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.80;MQ0=0;QD=34.25;VQSLOD=9.7692;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3972,313,0
1	97981395	.	T	C	1035.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.411;DP=60;Dels=0.00;FS=1.095;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.121;VQSLOD=5.1390;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,40:60:99:1065,0,424
1	98348885	.	G	A	3393.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.76;VQSLOD=8.2031;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3393,265,0
1	100575933	.	G	A	808.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;DP=46;Dels=0.00;FS=2.755;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=17.58;ReadPosRankSum=-1.914;VQSLOD=2.7183;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,31:46:99:839,0,382
1	100598866	.	G	A	1702.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=8.4052;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1736,138,0
1	100598867	.	C	T	1675.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=9.4010;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1708,135,0
1	100672060	.	T	C	8490.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.1396;MQ=59.47;MQ0=0;QD=34.10;VQSLOD=9.3821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8490,659,0
1	103354138	.	A	G	634.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=39;Dels=0.00;FS=2.920;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=16.26;ReadPosRankSum=-2.328;VQSLOD=2.5415;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,25:39:99:664,0,303
1	103379918	.	G	A	667.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;DP=57;Dels=0.00;FS=2.182;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.574;VQSLOD=5.6216;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,30:57:99:698,0,631
1	108185301	.	C	G	2199.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3691;MQ=58.94;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=8.5879;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2232,172,0
1	108185309	.	G	A	907.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.192;DP=72;Dels=0.00;FS=0.923;HRun=0;HaplotypeScore=3.3417;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.110;VQSLOD=5.5679;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,35:72:99:938,0,965
1	108307727	.	T	A	2907.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.451;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.482;VQSLOD=6.3501;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,110:112:99:2940,200,0
1	109268441	.	G	A	3233.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;DP=208;Dels=0.00;FS=2.763;HRun=1;HaplotypeScore=11.9534;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.674;VQSLOD=3.3741;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,121:208:99:3262,0,2187
1	109268573	.	T	C	7106.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.463;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4262;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=34.50;ReadPosRankSum=-0.404;VQSLOD=8.3924;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,205:206:99:7072,523,0
1	109369915	.	G	T	5816.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.33;MQ0=0;QD=32.31;VQSLOD=9.2183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:180:99:5816,454,0
1	109377070	.	C	A	114.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;DP=19;Dels=0.00;FS=2.017;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.307;VQSLOD=4.4859;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:144,0,377
1	109395105	.	C	T	2123.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.886;DP=164;Dels=0.00;FS=0.590;HRun=1;HaplotypeScore=6.9197;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.610;VQSLOD=4.9906;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,81:164:99:2153,0,2103
1	109440215	.	G	A	952.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.844;DP=80;Dels=0.00;FS=1.843;HRun=1;HaplotypeScore=3.5441;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=5.5147;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,40:80:99:983,0,1000
1	109479978	.	G	T	1091.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=82;Dels=0.00;FS=9.882;HRun=0;HaplotypeScore=3.5151;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.547;VQSLOD=4.7503;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,45:82:99:1122,0,898
1	109704618	.	A	G	2815.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9661;MQ=59.73;MQ0=0;QD=33.51;VQSLOD=9.8089;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2848,232,0
1	109735416	.	A	C	7651.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=5.4181;MQ=60.37;MQ0=0;QD=33.27;VQSLOD=6.8496;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:7651,602,0
1	109745618	.	T	C	5133.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=9.6282;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=3.5578;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:5133,391,0
1	109838918	.	C	T	4258.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.57;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=8.7441;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4258,325,0
1	110019439	.	A	G	1061.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.343;DP=85;Dels=0.00;FS=4.378;HRun=1;HaplotypeScore=2.2329;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.784;VQSLOD=5.8358;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,38:85:99:1091,0,1264
1	110300441	.	G	A	4340.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.13;VQSLOD=8.7277;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4340,346,0
1	110301260	.	C	T	3410.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5275;MQ=59.05;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=9.0382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3410,268,0
1	110466709	.	T	C	3848.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89;VQSLOD=9.3094;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3848,298,0
1	110950439	.	C	T	907.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.073;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4858;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.264;VQSLOD=6.0253;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:937,0,1101
1	110998854	.	G	A	4273.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.3876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4273,346,0
1	111854889	.	A	G	2086.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.619;DP=202;Dels=0.00;FS=5.033;HRun=0;HaplotypeScore=7.0443;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.042;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.094;VQSLOD=3.5292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,87:202:99:2116,0,3148
1	111854895	.	G	A	2352.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=205;Dels=0.00;FS=3.228;HRun=1;HaplotypeScore=5.8384;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.715;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.500;VQSLOD=3.3570;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,90:205:99:2382,0,2824
1	111854938	.	G	T	2723.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.430;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.203;HRun=0;HaplotypeScore=5.7799;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.089;VQSLOD=4.4064;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,106:249:99:2754,0,3774
1	111861841	.	A	G	3925.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.23;MQ0=0;QD=29.07;VQSLOD=8.6079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:3924,319,0
1	111861974	.	T	C	2925.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8923;MQ=59.75;MQ0=0;QD=31.12;VQSLOD=8.6765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2958,229,0
1	111862952	.	T	G	3015.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.29;MQ0=0;QD=34.27;VQSLOD=9.3142;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:88:99:3049,241,0
1	111891192	.	C	A	2714.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.678;HRun=5;HaplotypeScore=4.4703;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.089;VQSLOD=5.9795;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,102:250:99:2744,0,4293
1	112042787	.	T	G	1786.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.099;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.182;VQSLOD=5.7809;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,66:108:99:1816,0,991
1	112308953	.	T	C	948.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;DP=28;Dels=0.00;FS=3.522;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.495;VQSLOD=4.8777;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:49:981,49,0
1	113255389	.	C	T	7102.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3917;MQ=59.48;MQ0=0;QD=31.43;VQSLOD=6.5375;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,226:226:99:7101,560,0
1	114377568	.	A	G	6732.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4950;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.14;VQSLOD=7.7273;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:6731,521,0
1	114394689	.	C	T	599.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.902;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9913;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.049;VQSLOD=5.7898;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,26:72:99:629,0,1059
1	114424601	.	C	T	1694.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.5004;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.619;VQSLOD=4.6485;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,55:56:99:1727,141,0
1	114438951	.	A	G	6860.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2408;MQ=59.57;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=8.7594;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:6859,578,0
1	114948281	.	A	G	4629.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9945;MQ=59.87;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=9.3536;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4629,364,0
1	115168097	.	T	C	1837.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.92;MQ0=0;QD=32.81;VQSLOD=9.7032;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1870,144,0
1	115417175	.	A	G	2234.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.688;DP=174;Dels=0.00;FS=2.720;HRun=0;HaplotypeScore=2.7591;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.184;VQSLOD=5.3885;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,89:174:99:2265,0,2010
1	115576023	.	A	G	3280	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.32;MQ0=0;QD=34.53;VQSLOD=9.9057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3280,250,0
1	115829313	.	G	A	3472.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=14.0771;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3472,289,0
1	116310967	.	T	C	3885.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.003;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.103;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.941;VQSLOD=5.8132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,128:250:99:3298,0,3039
1	117487711	.	T	A	1942.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.16;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=8.4627;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1975,168,0
1	117554421	.	A	G	2148.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.73;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=9.1219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2181,169,0
1	117559726	.	A	G	4946.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.10;VQSLOD=8.9255;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:170:99:4946,409,0
1	117617705	.	A	G	1577.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.019;DP=126;Dels=0.00;FS=2.279;HRun=1;HaplotypeScore=2.4328;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.784;VQSLOD=6.4078;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,57:126:99:1607,0,1814
1	117635413	.	A	G	2848.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;DP=211;DS;Dels=0.00;FS=1.072;HRun=1;HaplotypeScore=4.6143;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.094;VQSLOD=5.3495;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,110:211:99:2878,0,2913
1	117656088	.	A	G	2763.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.05;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=9.4976;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2796,229,0
1	117660754	.	C	T	5320.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.4646;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=30.06;ReadPosRankSum=1.497;VQSLOD=5.7228;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,176:177:99:5319,427,0
1	118482149	.	C	T	1751.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.510;DP=150;Dels=0.00;FS=3.003;HRun=0;HaplotypeScore=9.3991;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.591;VQSLOD=3.6119;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,76:150:99:1782,0,1715
1	120057246	.	C	A	1476.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8924;MQ=48.85;MQ0=3;QD=28.95;VQSLOD=3.0073;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,48:51:99:1509,132,0
1	120612002	.	CGG	C	135.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.363;HRun=4;HaplotypeScore=111.2955;MQ=40.77;MQ0=1;MQRankSum=-1.041;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.674;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:15:99:175,0,363
1	144865850	.	G	T	2765.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.316;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.472;HRun=2;HaplotypeScore=6.7434;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.273;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.073;VQSLOD=2.5012;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,100:250:99:2795,0,4662
1	144866643	.	G	A	3041.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.878;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.505;HRun=0;HaplotypeScore=1.8930;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=2.374;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.577;VQSLOD=4.9514;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,107:241:99:3072,0,3528
1	144868170	.	C	T	1598.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2866;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.254;VQSLOD=4.8313;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,64:119:99:1629,0,1558
1	144871738	.	C	A	2624.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.518;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9096;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=10.54;ReadPosRankSum=-2.530;VQSLOD=4.0743;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,107:249:99:2654,0,4016
1	144871755	.	A	T	2288.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.639;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4750;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.838;VQSLOD=5.5218;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,89:236:99:2318,0,4059
1	144871782	.	A	G	2552.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.964;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=1.099;HRun=2;HaplotypeScore=5.6287;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.512;VQSLOD=4.6346;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,95:223:99:2582,0,3657
1	144874815	.	T	C	2031.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.270;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=2.756;HRun=0;HaplotypeScore=6.1456;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.070;VQSLOD=3.4582;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,86:233:99:2061,0,4500
1	144879090	.	T	C	1272.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.582;DP=217;DS;Dels=0.00;FS=1.372;HRun=0;HaplotypeScore=2.7220;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.344;VQSLOD=4.4363;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,56:217:99:1303,0,5068
1	144879264	.	A	G	5569.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=5.2636;MQ=58.88;MQ0=0;QD=30.11;VQSLOD=6.4967;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:185:99:5568,454,0
1	144879375	.	T	C	4049.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.486;HRun=0;HaplotypeScore=5.2355;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.625;VQSLOD=3.9524;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,122:250:99:3369,0,3642
1	144882823	.	C	T	3225.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.006;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=4.276;HRun=2;HaplotypeScore=7.4280;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.395;VQSLOD=3.7191;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,116:249:99:3255,0,4064
1	144886197	.	A	T	4089.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3850;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.623;VQSLOD=4.2501;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,129:249:99:3456,0,3124
1	144912153	.	A	G	3731.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.2510;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.44;VQSLOD=3.6788;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:134:99:3731,298,0
1	144912233	.	C	T	1374.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=103;Dels=0.00;FS=1.721;HRun=0;HaplotypeScore=1.6647;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.327;VQSLOD=3.7808;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,55:103:99:1404,0,1159
1	144915623	.	AG	A	1674.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=220;DS;FS=4.632;HRun=1;HaplotypeScore=773.8255;MQ=48.87;MQ0=5;MQRankSum=-4.148;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.153;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,62:220:99:1713,0,5529
1	144916748	.	C	G	2852.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=1.341;HRun=0;HaplotypeScore=8.4428;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=3.9623;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,107:224:99:2882,0,3480
1	144918957	.	T	A	3014.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.002;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=4.949;HRun=0;HaplotypeScore=4.8350;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.123;VQSLOD=3.8019;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,116:249:99:3044,0,3705
1	144922583	.	G	A	4051.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.184;HRun=1;HaplotypeScore=5.4162;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.273;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.755;VQSLOD=3.1244;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,115:250:99:3358,0,3529
1	144923728	.	GT	G	1025.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.318;DP=228;DS;FS=0.620;HRun=2;HaplotypeScore=512.8734;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.094;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,48:228:99:1065,0,7134
1	144930940	.	T	C	4474.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.473;HRun=1;HaplotypeScore=4.8546;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.215;VQSLOD=4.3651;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,142:246:99:3863,0,2740
1	144931087	.	T	C	994.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.561;DP=153;Dels=0.00;FS=4.566;HRun=0;HaplotypeScore=4.9073;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.319;VQSLOD=3.0228;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,43:153:99:1024,0,3180
1	144931330	.	C	T	3112.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.408;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.938;HRun=0;HaplotypeScore=6.2612;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.077;VQSLOD=3.9739;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,115:250:99:3142,0,3881
1	144931392	.	G	A	3025.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.574;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.983;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.133;VQSLOD=6.1051;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,112:249:99:3055,0,3697
1	144994658	.	C	A	2721.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.949;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=2.437;HRun=0;HaplotypeScore=3.0908;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.938;VQSLOD=5.6185;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,101:212:99:2752,0,2875
1	145075683	.	C	T	903.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;DP=117;Dels=0.00;FS=6.431;HRun=0;HaplotypeScore=2.8905;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.571;VQSLOD=3.6847;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,40:117:99:933,0,2000
1	145103947	.	T	C	473.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.571;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.698;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.282;VQSLOD=4.9495;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,23:55:99:503,0,812
1	145109583	.	C	A	4103.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.881;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.420;HRun=1;HaplotypeScore=10.3636;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.743;VQSLOD=2.6885;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,119:249:99:3389,0,3646
1	145109661	.	G	A	1083.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.587;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3452;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.363;VQSLOD=3.6835;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,53:249:99:1114,0,5654
1	145112485	.	C	T	909.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.555;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9273;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.337;VQSLOD=3.1768;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,51:225:99:940,0,4490
1	145561594	.	C	T	1461.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=84;Dels=0.00;FS=12.286;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=2.373;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.881;VQSLOD=2.5615;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,53:84:99:1491,0,741
1	145583938	.	C	G	4266.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.464;HRun=0;HaplotypeScore=1.8646;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.136;VQSLOD=5.4036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,128:248:99:3631,0,3307
1	146740502	.	C	G	509.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=41;Dels=0.00;FS=1.204;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.813;VQSLOD=2.9116;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:540,0,528
1	146767149	.	G	T	2850.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=28.79;VQSLOD=8.0769;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2883,229,0
1	147091972	.	C	T	923.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.180;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5983;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.445;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.502;VQSLOD=5.4120;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,39:80:99:954,0,1115
1	147121977	.	C	T	4104.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.70;MQ0=0;QD=29.96;VQSLOD=9.2062;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4104,319,0
1	149906413	.	T	C	1206.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7295;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.492;VQSLOD=6.1346;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,51:122:99:1236,0,1923
1	150199123	.	G	T	725.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.765;VQSLOD=6.5156;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,29:63:99:756,0,844
1	150526044	.	G	C	2260.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=158;Dels=0.00;FS=2.045;HRun=1;HaplotypeScore=1.9325;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.381;VQSLOD=6.4420;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,82:158:99:2291,0,1969
1	150970577	.	G	T	6138.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.54;MQ0=0;QD=34.68;VQSLOD=9.5402;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:6138,472,0
1	151011325	.	C	T	1070.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0285;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.930;VQSLOD=4.6052;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,42:88:99:1100,0,1278
1	151108137	.	T	G	3227.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.81;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=9.8010;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3260,253,0
1	151315287	.	G	C	2653.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.520;HRun=0;HaplotypeScore=7.6247;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.417;VQSLOD=4.1788;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,112:242:99:2684,0,3646
1	151337690	.	G	C	624.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.474;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.551;VQSLOD=4.8045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,26:50:99:655,0,540
1	151740666	.	T	C	1710.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8311;MQ=59.60;MQ0=0;QD=36.40;VQSLOD=8.8733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1744,138,0
1	151820298	.	G	C	3166.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.16;VQSLOD=8.9141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3200,247,0
1	151820324	.	T	C	2869.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=9.7653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2902,226,0
1	152085505	.	A	C	1798.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=29.01;VQSLOD=8.4978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1832,156,0
1	152191709	.	C	G	2437.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5036;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.113;VQSLOD=5.0623;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,88:171:99:2468,0,2352
1	152192555	.	T	C	4411.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.362;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.368;HRun=0;HaplotypeScore=5.3818;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.298;VQSLOD=2.8804;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3704,0,3435
1	152192631	.	C	T	4688.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.763;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.920;HRun=0;HaplotypeScore=7.9810;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.124;VQSLOD=2.6034;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,132:250:99:3974,0,3103
1	152192687	.	T	C	9064.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=36.26;VQSLOD=9.1164;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:9064,719,0
1	152192825	.	C	T	2860.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.533;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=5.689;HRun=0;HaplotypeScore=4.3230;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.652;VQSLOD=4.2352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,107:222:99:2891,0,3407
1	152192978	.	T	C	8001.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.19;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=9.4751;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7999,677,0
1	152193286	.	G	T	4097.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.845;HRun=1;HaplotypeScore=7.8084;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.047;VQSLOD=3.7051;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,117:249:99:3387,0,4082
1	152193851	.	C	T	1701.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.870;DP=110;Dels=0.00;FS=2.476;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.199;VQSLOD=6.4481;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,63:110:99:1732,0,1280
1	152195728	.	AT	A	1025.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;DP=63;FS=0.000;HRun=11;HaplotypeScore=175.9091;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.072;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:13,47:63:99:1067,109,0
1	152281007	.	A	G	2479.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.847;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.317;HRun=0;HaplotypeScore=8.8450;MQ=57.02;MQ0=1;MQRankSum=1.280;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.824;VQSLOD=2.3650;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,92:250:99:2509,0,4728
1	152281039	.	G	A	2591.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.922;HRun=0;HaplotypeScore=5.2382;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.441;VQSLOD=3.7913;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,99:250:99:2622,0,4399
1	152281948	.	G	A	2974	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=4.436;HRun=0;HaplotypeScore=3.5832;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.085;VQSLOD=4.2712;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,113:248:99:3004,0,3916
1	152282267	.	G	A	4352.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.871;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4919;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.754;VQSLOD=3.9221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,128:250:99:3641,0,3129
1	152282917	.	G	T	2933.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.490;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.993;VQSLOD=5.8298;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,112:250:99:2963,0,4009
1	152283568	.	T	C	4175.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.546;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.382;HRun=0;HaplotypeScore=5.3071;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.345;VQSLOD=3.7797;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,124:250:99:3479,0,3420
1	152285076	.	CACTG	C	5043.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.668;DP=243;DS;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1540.1528;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.509;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.849;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,113:243:99:5043,0,9485
1	152285930	.	G	A	4038.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.144;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=12.970;HRun=0;HaplotypeScore=2.9288;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.714;VQSLOD=3.3452;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,122:250:99:3339,0,3732
1	152286002	.	T	C	4548.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=7.129;HRun=0;HaplotypeScore=7.7081;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.218;VQSLOD=3.0629;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,140:250:99:3843,0,3069
1	152286032	.	C	T	4812.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.303;HRun=0;HaplotypeScore=5.3525;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.617;VQSLOD=3.6324;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,135:250:99:4087,0,3444
1	152286367	.	C	A	2793.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.986;DP=235;DS;Dels=0.00;FS=7.758;HRun=0;HaplotypeScore=7.4945;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.186;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.205;VQSLOD=3.1986;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,107:235:99:2824,0,3784
1	152323132	.	G	T	2295.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;DP=160;Dels=0.00;FS=0.617;HRun=1;HaplotypeScore=4.9600;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.009;VQSLOD=5.2699;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,85:160:99:2325,0,2111
1	152329435	.	C	T	4565.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.6784;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.874;VQSLOD=3.5440;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,136:243:99:3917,0,2535
1	152331240	.	G	A	2538.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.511;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.2603;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.106;VQSLOD=5.6958;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,98:206:99:2568,0,3015
1	152382120	.	C	T	1833.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.518;DP=140;Dels=0.00;FS=7.638;HRun=1;HaplotypeScore=4.8622;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.292;VQSLOD=4.9763;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,65:140:99:1864,0,2188
1	152636843	.	A	T	1961.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;DP=128;Dels=0.00;FS=2.332;HRun=0;HaplotypeScore=3.6951;MQ=57.67;MQ0=1;MQRankSum=0.666;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.050;VQSLOD=3.8713;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,76:128:99:1991,0,1271
1	152732106	.	A	T	2564.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;DP=207;Dels=0.00;FS=1.237;HRun=0;HaplotypeScore=1.6385;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=-1.323;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.178;VQSLOD=5.5756;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,97:207:99:2594,0,3071
1	152733301	.	T	A	2215.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.355;DP=155;Dels=0.00;FS=2.906;HRun=1;HaplotypeScore=4.4179;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.691;VQSLOD=4.9986;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,76:155:99:2245,0,2096
1	152749091	.	C	T	1129.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.642;DP=78;Dels=0.00;FS=4.930;HRun=0;HaplotypeScore=3.4375;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=4.7975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,41:78:99:1159,0,895
1	152975941	.	C	G	2758.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=9.3696;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2792,220,0
1	153277423	.	C	T	1293.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;DP=98;Dels=0.00;FS=2.859;HRun=1;HaplotypeScore=2.6547;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=13.20;ReadPosRankSum=2.168;VQSLOD=5.5839;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,46:98:99:1324,0,1551
1	153314153	.	C	A	7219.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6071;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.446;VQSLOD=8.2209;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,228:230:99:7218,587,0
1	153320372	.	T	G	1856.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.04;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=8.5390;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1889,141,0
1	153410822	.	C	A	1233.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.566;DP=101;Dels=0.00;FS=4.151;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=5.6722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,54:101:99:1263,0,1279
1	153431406	.	C	G	6992.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.6201;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.753;VQSLOD=3.3617;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,232:238:99:6935,572,0
1	154426970	.	A	C	735.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.518;DP=49;Dels=0.00;FS=1.342;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.831;VQSLOD=6.6243;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,26:49:99:765,0,571
1	154516477	.	G	A	2231.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.688;DP=210;DS;Dels=0.00;FS=0.539;HRun=1;HaplotypeScore=7.3324;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=4.7925;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,87:210:99:2262,0,3273
1	154573967	.	T	C	8380.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5519;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=34.07;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=8.8283;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,245:246:99:8380,656,0
1	154574820	.	T	C	2590.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.26;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=8.8539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2624,217,0
1	154904840	.	T	C	753.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.770;VQSLOD=6.0020;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,34:84:99:784,0,1336
1	154919080	.	C	T	2709.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.10;VQSLOD=8.7924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2742,226,0
1	154938662	.	T	C	484.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.340;DP=49;Dels=0.00;FS=1.303;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.159;VQSLOD=6.4497;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,19:49:99:514,0,804
1	155019710	.	A	C	1991.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.057;DP=150;Dels=0.00;FS=7.238;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=13.28;ReadPosRankSum=-1.335;VQSLOD=4.5424;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,70:150:99:2022,0,2077
1	155026942	.	A	C	3349.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7035;MQ=58.83;MQ0=0;QD=28.87;VQSLOD=8.5085;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3348,283,0
1	155106227	.	A	T	1797.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;DP=215;Dels=0.00;FS=1.120;HRun=0;HaplotypeScore=4.4567;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.739;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.153;VQSLOD=4.6863;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,80:215:99:1828,0,3392
1	155178782	.	A	T	96.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.119;VQSLOD=4.3640;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:127,0,255
1	155206037	.	G	A	447.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.385;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.866;VQSLOD=6.1293;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:477,0,514
1	155260382	.	C	T	1117.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=77;Dels=0.00;FS=8.752;HRun=0;HaplotypeScore=2.7476;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.508;VQSLOD=4.0527;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,43:77:99:1148,0,972
1	155264120	.	C	G	760.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9966;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.723;VQSLOD=3.8562;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:791,0,832
1	155408635	.	T	C	4079.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=8.9660;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4079,349,0
1	155837865	.	G	C	4144.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9126;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.70;VQSLOD=7.7382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:4144,325,0
1	155912486	.	T	C	2492.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7356;MQ=59.37;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=9.0839;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2525,229,0
1	156011444	.	T	C	468.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.57;MQ0=0;QD=36.00;VQSLOD=9.1336;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.13:501,39,0
1	156202173	.	A	G	3065.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.212;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=5.190;HRun=0;HaplotypeScore=8.9873;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=3.086;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=3.2482;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,113:226:99:3095,0,3218
1	156206121	.	G	A	4717.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=59.11;MQ0=0;QD=31.88;VQSLOD=9.8060;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4717,373,0
1	156213921	.	C	T	1158.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.107;VQSLOD=6.6494;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,45:97:99:1188,0,1512
1	156347131	.	G	A	3141.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.580;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5514;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.288;VQSLOD=5.8928;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3171,0,3539
1	156351699	.	G	A	1055.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8267;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.201;VQSLOD=6.0660;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,40:80:99:1086,0,1052
1	156354367	.	A	G	2450.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.524;DP=212;Dels=0.00;FS=1.094;HRun=0;HaplotypeScore=4.1670;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.997;VQSLOD=5.7796;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,97:212:99:2480,0,2642
1	156526387	.	C	G	2972.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=34.56;VQSLOD=9.7412;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:3005,241,0
1	156526444	.	T	C	2810.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9789;MQ=57.41;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=7.2546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2843,217,0
1	156561651	.	G	C	1268.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.65;MQ0=0;QD=28.19;VQSLOD=7.4861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1301,99,0
1	156565049	.	A	AAC	13118.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;DS;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=593.3311;MQ=60.62;MQ0=0;QD=53.98;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:8,230:243:99:13118,704,0
1	156622252	.	G	A	197.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.3302;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.807;VQSLOD=5.8848;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:227,0,436
1	156640156	.	G	A	2753.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=187;Dels=0.00;FS=4.226;HRun=0;HaplotypeScore=4.5480;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.001;VQSLOD=5.2430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,107:187:99:2784,0,2121
1	156640678	.	G	A	270.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.971;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.693;VQSLOD=5.8765;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:300,0,437
1	156641537	.	C	T	1113.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7279;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.66;ReadPosRankSum=1.564;VQSLOD=5.9626;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,41:88:99:1144,0,1205
1	156646668	.	A	G	530.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9947;MQ=56.66;MQ0=0;QD=25.26;VQSLOD=2.8296;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:42.13:563,42,0
1	156705593	.	G	C	4031.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5990;MQ=59.80;MQ0=0;QD=34.76;VQSLOD=7.4755;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:4031,316,0
1	156784982	.	T	C	41.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.185;VQSLOD=8.7808;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:71.20:71,0,258
1	156848918	.	C	T	560.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;DP=53;Dels=0.00;FS=1.072;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.700;VQSLOD=5.6920;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,24:53:99:591,0,721
1	156848946	.	G	T	559.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;DP=52;Dels=0.00;FS=4.244;HRun=1;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.898;VQSLOD=5.4427;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,22:52:99:589,0,729
1	156877457	.	T	C	8170.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.0063;MQ=59.10;MQ0=0;QD=32.81;VQSLOD=4.6477;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8170,650,0
1	156883546	.	A	G	1230.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.531;DP=83;Dels=0.00;FS=0.935;HRun=0;HaplotypeScore=1.7256;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.549;VQSLOD=6.3247;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,50:83:99:1261,0,866
1	157062739	.	C	G	439.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=44;Dels=0.00;FS=2.648;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.577;VQSLOD=3.4664;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,20:44:99:469,0,678
1	157508882	.	C	T	3047.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=9.5889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3081,253,0
1	157509025	.	C	T	4222.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6728;MQ=59.82;MQ0=0;QD=32.73;VQSLOD=8.4670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4222,346,0
1	157514091	.	C	T	2743	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.029;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=2.200;HRun=0;HaplotypeScore=3.7658;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.618;VQSLOD=5.6981;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,108:242:99:2773,0,3693
1	157514097	.	A	G	8286.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0319;MQ=59.73;MQ0=0;QD=34.38;VQSLOD=8.5380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,241:241:99:8286,650,0
1	157668390	.	T	C	1316.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.723;DP=108;Dels=0.00;FS=0.803;HRun=0;HaplotypeScore=4.1363;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.051;VQSLOD=6.1359;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,52:108:99:1347,0,1416
1	158450314	.	A	G	2161.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.690;DP=202;Dels=0.00;FS=1.140;HRun=1;HaplotypeScore=6.3671;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.320;VQSLOD=4.8549;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,86:202:99:2192,0,3040
1	158450382	.	C	T	1194.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;DP=107;Dels=0.00;FS=3.645;HRun=1;HaplotypeScore=1.8661;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.657;VQSLOD=6.2855;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,44:107:99:1224,0,1793
1	158517142	.	C	T	2448.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.936;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=0.557;HRun=0;HaplotypeScore=4.7205;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.061;VQSLOD=5.4189;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,92:182:99:2479,0,2377
1	158549492	.	C	T	1553.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;DP=121;Dels=0.00;FS=3.266;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.349;VQSLOD=6.5058;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,59:121:99:1583,0,1716
1	158549511	.	A	G	2034.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=132;Dels=0.00;FS=2.245;HRun=1;HaplotypeScore=3.3269;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=6.1686;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,75:132:99:2065,0,1476
1	158577109	.	A	C	4038.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.192;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=5.969;HRun=0;HaplotypeScore=4.4702;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.202;VQSLOD=4.4502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,116:243:99:3384,0,3502
1	158607935	.	T	G	1079.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.036;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7876;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=13.33;ReadPosRankSum=1.264;VQSLOD=6.5498;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,37:81:99:1110,0,1242
1	158612236	.	A	G	2063.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=1.060;HRun=0;HaplotypeScore=2.7719;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.334;VQSLOD=6.3387;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,88:219:99:2094,0,3377
1	158619728	.	A	C	947.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72;VQSLOD=13.1617;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:72.24:981,72,0
1	158687163	.	G	A	1577.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.789;DP=115;Dels=0.00;FS=12.561;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.809;VQSLOD=3.7289;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1607,0,1691
1	158687224	.	G	A	1765.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.577;DP=125;Dels=0.00;FS=3.325;HRun=2;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.413;VQSLOD=6.2600;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,67:125:99:1796,0,1712
1	158735595	.	C	T	7804.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.6795;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=5.1855;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7803,638,0
1	158735691	.	T	C	7812.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2171;MQ=59.74;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=6.7983;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:246:99:7811,653,0
1	158735740	.	A	G	8389.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=3.835;HRun=1;HaplotypeScore=7.2016;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=34.81;ReadPosRankSum=1.603;VQSLOD=4.2890;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,240:241:99:8355,626,0
1	158735892	.	A	G	8106.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4613;MQ=59.42;MQ0=0;QD=32.69;VQSLOD=8.1037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:248:99:8081,623,0
1	158736445	.	C	T	764.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;DP=64;Dels=0.00;FS=2.392;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.994;VQSLOD=6.4856;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,31:64:99:795,0,890
1	158985673	.	G	A	1752.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=168;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=1;HaplotypeScore=5.2745;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.513;VQSLOD=4.1303;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,73:168:99:1782,0,2403
1	158986477	.	G	C	2004.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;DP=154;Dels=0.00;FS=2.909;HRun=0;HaplotypeScore=4.1590;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.658;VQSLOD=5.8186;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,85:154:99:2035,0,1748
1	159002377	.	C	A	2503.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=56.19;MQ0=1;QD=30.91;VQSLOD=7.1470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2537,205,0
1	159002389	.	T	A	2846.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=55.90;MQ0=1;QD=30.60;VQSLOD=4.3349;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2879,229,0
1	159175354	.	G	A	1694.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.276;DP=133;Dels=0.00;FS=2.293;HRun=0;HaplotypeScore=7.5647;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.128;VQSLOD=4.9834;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,63:133:99:1725,0,1923
1	159409734	.	G	T	6701.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9815;MQ=59.68;MQ0=0;QD=33.51;VQSLOD=9.8703;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:6701,527,0
1	159409857	.	A	G	2266.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=138;Dels=0.00;FS=17.896;HRun=0;HaplotypeScore=1.9983;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.551;VQSLOD=3.2064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,74:138:99:2297,0,1784
1	159410340	.	T	A	3035.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.679;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.023;HRun=0;HaplotypeScore=2.3204;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.808;VQSLOD=5.7919;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,112:250:99:3066,0,3645
1	159505101	.	G	A	1427.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.043;DP=106;Dels=0.00;FS=3.847;HRun=0;HaplotypeScore=4.4631;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.352;VQSLOD=4.7394;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,48:106:99:1457,0,1517
1	159799910	.	G	A	1247.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.739;DP=114;Dels=0.00;FS=8.931;HRun=0;HaplotypeScore=5.2242;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.067;VQSLOD=4.0049;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,45:114:99:1277,0,1953
1	159923111	.	T	G	1736.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.750;DP=128;Dels=0.00;FS=1.588;HRun=0;HaplotypeScore=3.1401;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.444;VQSLOD=5.3038;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,65:128:99:1767,0,1658
1	160124875	.	G	A	2701.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.155;DP=213;DS;Dels=0.00;FS=14.494;HRun=0;HaplotypeScore=7.4474;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.699;VQSLOD=3.2904;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,107:213:99:2731,0,2735
1	160793560	.	A	G	2455.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.810;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=1.411;HRun=0;HaplotypeScore=7.1298;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.552;VQSLOD=5.0039;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,89:183:99:2486,0,2655
1	160851826	.	A	T	5824.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=54.80;MQ0=0;QD=32.36;VQSLOD=7.7955;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5824,490,0
1	160920966	.	C	T	5537.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.367;DP=172;Dels=0.00;FS=4.692;HRun=0;HaplotypeScore=7.5180;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.570;VQSLOD=2.4790;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,171:172:99:5507,431,0
1	161019040	.	G	C	6699.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5567;MQ=59.91;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=8.8207;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6698,568,0
1	161068836	.	A	C	263.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;DP=36;Dels=0.00;FS=1.421;HRun=4;HaplotypeScore=1.9992;MQ=57.03;MQ0=1;MQRankSum=1.095;QD=7.32;ReadPosRankSum=-2.311;VQSLOD=2.9822;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,12:36:99:294,0,574
1	161130701	.	C	T	766.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5946;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.400;VQSLOD=6.6266;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,33:65:99:796,0,987
1	161132821	.	C	A	1374.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;DP=133;Dels=0.00;FS=3.360;HRun=0;HaplotypeScore=7.8344;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.424;VQSLOD=4.3874;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,58:133:99:1405,0,1910
1	161163037	.	T	C	1245.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=13.9731;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1279,102,0
1	161479745	.	A	G	891.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.802;VQSLOD=6.6085;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,37:86:99:921,0,1473
1	161683136	.	G	A	3155.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=103;Dels=0.00;FS=4.771;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.087;VQSLOD=4.0887;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,102:103:99:3188,213,0
1	161696782	.	G	C	532.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;VQSLOD=12.6072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:48.13:565,48,0
1	161751741	.	A	G	582.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.838;DP=48;Dels=0.00;FS=1.097;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=6.1213;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,22:48:99:613,0,527
1	161967681	.	A	G	3194.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.199;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.543;HRun=0;HaplotypeScore=8.9779;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.368;VQSLOD=4.3393;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,121:243:99:3224,0,3067
1	162345091	.	G	A	6447.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1526;MQ=59.11;MQ0=0;QD=30.13;VQSLOD=8.8818;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,214:214:99:6446,508,0
1	162367103	.	G	T	1591.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HRun=2;HaplotypeScore=3.6924;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.069;VQSLOD=5.2025;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,63:130:99:1621,0,1834
1	167095163	.	G	C	1278.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=107;Dels=0.00;FS=0.727;HRun=0;HaplotypeScore=1.8640;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.242;VQSLOD=5.5272;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,56:107:99:1309,0,1384
1	167097070	.	G	A	1013.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.539;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8824;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.121;VQSLOD=5.8203;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,39:82:99:1043,0,1021
1	167097567	.	G	A	646.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=53;Dels=0.00;FS=1.054;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.845;VQSLOD=6.4695;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,27:53:99:676,0,747
1	167097739	.	C	A	323.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;DP=40;Dels=0.00;FS=3.009;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.063;VQSLOD=5.7405;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,14:40:99:354,0,745
1	167865871	.	G	A	1880.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;DP=184;DS;Dels=0.00;FS=0.591;HRun=0;HaplotypeScore=1.8808;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.566;VQSLOD=6.6516;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,75:184:99:1910,0,2882
1	169498975	.	T	C	1837.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=152;Dels=0.00;FS=6.030;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.059;VQSLOD=5.5622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,73:152:99:1867,0,1944
1	169511555	.	T	C	1586.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.237;DP=122;Dels=0.00;FS=1.485;HRun=2;HaplotypeScore=7.2124;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=4.1871;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,57:122:99:1617,0,1750
1	169511734	.	T	C	3178.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=3.526;HRun=0;HaplotypeScore=10.4928;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.580;VQSLOD=3.4914;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,127:249:99:3209,0,3126
1	169511755	.	T	C	3175.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.042;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=3.604;HRun=0;HaplotypeScore=6.8807;MQ=58.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.937;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.183;VQSLOD=4.4130;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,118:238:99:3206,0,3182
1	169519049	.	T	C	1860.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=30.50;VQSLOD=9.2514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1894,150,0
1	169762807	.	T	G	1307.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.247;DP=100;Dels=0.00;FS=1.624;HRun=0;HaplotypeScore=4.1086;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.760;VQSLOD=5.3055;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,53:100:99:1338,0,1343
1	169823718	.	T	C	1786.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=162;Dels=0.00;FS=0.593;HRun=0;HaplotypeScore=4.8604;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=11.03;ReadPosRankSum=-3.270;VQSLOD=3.3404;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,72:162:99:1817,0,2416
1	170521376	.	G	A	746.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.725;VQSLOD=6.6157;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,30:67:99:777,0,992
1	171076966	.	G	A	2769.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;DP=217;Dels=0.00;FS=1.682;HRun=4;HaplotypeScore=8.4435;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.696;VQSLOD=4.4470;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,109:217:99:2799,0,2646
1	171162551	.	T	TGAC	2814.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.524;DP=108;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=417.8132;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.576;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,42:108:99:2853,0,2142
1	171162583	.	T	C	726.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.957;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7510;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.469;VQSLOD=5.1840;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,31:68:99:757,0,1044
1	171165802	.	TG	T	1285.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.987;DP=72;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=170.6508;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.529;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,39:72:99:1325,0,1259
1	171168584	.	C	T	5807.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5518;MQ=59.27;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=9.1033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:184:99:5807,448,0
1	171168585	.	A	G	6025.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.5518;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.39;VQSLOD=8.6253;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:6025,457,0
1	171176912	.	T	G	2261.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.986;DP=142;Dels=0.00;FS=4.218;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.241;VQSLOD=6.2575;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,85:142:99:2292,0,1376
1	171227216	.	T	C	993.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=70;Dels=0.00;FS=2.038;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.165;VQSLOD=5.9621;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,37:70:99:1023,0,884
1	171509327	.	G	A	2601.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7900;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=8.7038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2635,220,0
1	171514731	.	C	G	1268.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.39;VQSLOD=9.0153;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1302,99,0
1	171753039	.	A	G	2411.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=201;Dels=0.00;FS=9.327;HRun=0;HaplotypeScore=2.8919;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.269;VQSLOD=4.9419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,94:201:99:2441,0,2913
1	171755182	.	G	A	805.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.687;VQSLOD=6.6422;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,33:61:99:836,0,700
1	172410967	.	G	A	1295.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;DP=122;Dels=0.00;FS=1.553;HRun=1;HaplotypeScore=2.7977;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.108;VQSLOD=6.4693;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,50:122:99:1326,0,2040
1	172437592	.	G	A	2738.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.552;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=4.764;HRun=3;HaplotypeScore=5.7705;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.262;VQSLOD=4.3605;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,110:248:99:2769,0,3853
1	172501643	.	T	C	308.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.989;DP=29;Dels=0.00;FS=4.410;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.292;VQSLOD=6.1633;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:339,0,460
1	175046789	.	A	G	2141.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.72;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.7132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2175,178,0
1	175087729	.	T	C	5371.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8835;MQ=59.25;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=7.9168;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:184:99:5370,433,0
1	175092674	.	C	T	4903.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6393;MQ=59.04;MQ0=0;QD=31.64;VQSLOD=8.5611;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4903,376,0
1	175092707	.	C	T	4095.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6457;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.75;VQSLOD=8.2836;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4095,325,0
1	175348723	.	C	T	1180.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.824;DP=83;Dels=0.00;FS=9.267;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.135;VQSLOD=4.7748;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,47:83:99:1210,0,990
1	175375469	.	C	A	2723.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.839;DP=217;Dels=0.00;FS=8.884;HRun=1;HaplotypeScore=8.2926;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.482;VQSLOD=4.1072;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,104:217:99:2754,0,3263
1	175375802	.	T	C	3112.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.369;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=3.648;HRun=0;HaplotypeScore=4.4738;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.471;VQSLOD=5.5346;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:249:99:3143,0,3498
1	176833497	.	G	C	2693.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;DP=195;Dels=0.00;FS=1.123;HRun=3;HaplotypeScore=1.7675;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.243;VQSLOD=6.0680;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,104:195:99:2724,0,2218
1	176863836	.	G	C	2535.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.837;DP=165;Dels=0.00;FS=5.232;HRun=0;HaplotypeScore=3.7366;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.637;VQSLOD=4.1621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,93:165:99:2565,0,2036
1	176863867	.	T	C	2910.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.573;DP=207;Dels=0.00;FS=6.038;HRun=0;HaplotypeScore=7.7754;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.778;VQSLOD=4.5735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,106:207:99:2940,0,2590
1	177247854	.	C	G	2657.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.422;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=0.570;HRun=0;HaplotypeScore=4.6293;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.230;VQSLOD=5.9108;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,102:220:99:2687,0,3468
1	177902387	.	C	A	423.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;DP=32;Dels=0.00;FS=6.903;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.728;VQSLOD=4.9716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:32:99:454,0,283
1	177902725	.	C	T	594.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=83;Dels=0.00;FS=0.906;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.821;VQSLOD=5.7414;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,27:83:99:625,0,1504
1	177902753	.	G	C	753.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.203;DP=96;Dels=0.00;FS=1.765;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.913;VQSLOD=5.1836;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,32:96:99:783,0,1652
1	177905469	.	C	A	246.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.969;DP=25;Dels=0.00;FS=3.619;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.411;VQSLOD=3.6394;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:276,0,412
1	177929987	.	T	C	924.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.135;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.006;VQSLOD=6.1732;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,34:68:99:954,0,887
1	178489978	.	T	G	823.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=80;Dels=0.00;FS=2.217;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.204;VQSLOD=6.4442;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,33:80:99:854,0,1365
1	179414105	.	A	C	1439.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.750;DP=53;Dels=0.00;FS=5.315;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.210;VQSLOD=3.7661;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,51:53:80.38:1472,80,0
1	179631242	.	G	A	3858.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3609;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=8.3999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:3858,304,0
1	179852074	.	T	C	519.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=35;Dels=0.00;FS=1.619;HRun=0;HaplotypeScore=2.5407;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.427;VQSLOD=6.5361;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,22:35:99:550,0,369
1	179876988	.	C	G	1108.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=101;Dels=0.00;FS=1.612;HRun=0;HaplotypeScore=1.9982;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.650;VQSLOD=3.1068;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,47:101:99:1139,0,1358
1	180243524	.	A	G	3114.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.864;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=6.732;HRun=0;HaplotypeScore=6.9677;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.198;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.156;VQSLOD=3.5977;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,110:250:99:3144,0,3814
1	180885430	.	T	C	1543.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=9.0204;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1576,126,0
1	180905263	.	C	T	943.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.743;DP=63;Dels=0.00;FS=0.954;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.859;VQSLOD=6.0390;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,31:63:99:973,0,897
1	180905448	.	G	T	1008.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;DP=115;Dels=0.00;FS=1.756;HRun=2;HaplotypeScore=1.7319;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.201;VQSLOD=5.9327;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,41:115:99:1039,0,2023
1	180913597	.	A	G	2364.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=6.1397;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.50;VQSLOD=5.6008;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:86:99:2398,193,0
1	182026813	.	G	C	1083.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.012;DP=104;Dels=0.00;FS=0.739;HRun=1;HaplotypeScore=1.7297;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.660;VQSLOD=5.9754;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,42:104:99:1114,0,1624
1	182027022	.	C	T	2073	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;DP=173;Dels=0.00;FS=1.212;HRun=1;HaplotypeScore=4.6687;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.541;VQSLOD=5.7390;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,84:173:99:2103,0,2338
1	182369233	.	A	G	8258.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4821;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=33.17;ReadPosRankSum=0.782;VQSLOD=7.9585;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:249:99:8258,635,0
1	182569626	.	T	C	4570.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;QD=29.49;VQSLOD=8.7615;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4569,388,0
1	183532580	.	G	T	4096.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=1.604;HRun=1;HaplotypeScore=3.5984;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=3.305;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.382;VQSLOD=3.5579;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,125:243:99:3461,0,3286
1	183542387	.	T	C	7634.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.8811;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=33.34;ReadPosRankSum=0.945;VQSLOD=5.9727;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,228:229:99:7633,590,0
1	183616926	.	T	C	7457.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5089;MQ=59.37;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=9.1292;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,241:241:99:7456,623,0
1	183617105	.	A	G	4550.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6567;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.397;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.501;VQSLOD=8.5667;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,138:140:99:4494,314,0
1	184663537	.	A	C	220.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.732;DP=23;Dels=0.00;FS=1.824;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.346;VQSLOD=6.4102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:250,0,401
1	186273994	.	C	T	872	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.104;DP=69;Dels=0.00;FS=2.118;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=6.7129;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,36:69:99:902,0,922
1	186321242	.	C	T	766.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.538;DP=69;Dels=0.00;FS=3.075;HRun=0;HaplotypeScore=3.5581;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.338;VQSLOD=3.9030;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,30:69:99:797,0,1161
1	186946912	.	G	A	3756.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9399;MQ=58.57;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=9.6053;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3756,286,0
1	196659237	.	C	T	1225.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;DP=81;Dels=0.00;FS=0.944;HRun=1;HaplotypeScore=2.9906;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.640;VQSLOD=3.7839;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,46:81:99:1256,0,915
1	197031021	.	C	T	1143.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.564;DP=72;Dels=0.00;FS=1.980;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.965;VQSLOD=6.1165;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,42:72:99:1174,0,718
1	197070901	.	A	G	2015.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.57;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=8.7997;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2049,156,0
1	200522566	.	G	C	4734.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.920;DP=163;Dels=0.00;FS=4.122;HRun=0;HaplotypeScore=6.9557;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=29.05;ReadPosRankSum=1.283;VQSLOD=3.3733;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,161:163:99:4702,366,0
1	201009182	.	A	G	1605.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.984;DP=137;Dels=0.00;FS=1.727;HRun=0;HaplotypeScore=6.4870;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.191;VQSLOD=4.4679;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,62:137:99:1636,0,2272
1	201052310	.	A	T	1367.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5491;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.025;VQSLOD=4.9757;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,52:97:99:1398,0,1293
1	201182609	.	G	A	1479.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.021;DP=107;Dels=0.00;FS=2.687;HRun=0;HaplotypeScore=3.8153;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.586;VQSLOD=5.1338;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,53:107:99:1509,0,1355
1	201195119	.	C	T	1928.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.96;MQ0=0;QD=32.14;VQSLOD=9.7416;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1961,159,0
1	201351421	.	T	A	2852.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=5.481;HRun=0;HaplotypeScore=4.4399;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.596;VQSLOD=4.5539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,125:242:99:2883,0,2852
1	201355522	.	T	C	279.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=34;Dels=0.00;FS=1.917;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.282;VQSLOD=4.4628;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:309,0,651
1	201358304	.	C	A	1900.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.325;DP=159;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.6630;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=11.95;ReadPosRankSum=3.429;VQSLOD=3.2030;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,73:159:99:1930,0,2466
1	201869257	.	G	A	1819.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8109;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.456;VQSLOD=6.1173;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,56:58:99:1853,153,0
1	202092332	.	C	G	921.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;DP=68;Dels=0.00;FS=1.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.8484;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.086;VQSLOD=4.1377;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,35:68:99:951,0,903
1	202092360	.	G	A	1025.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.539;DP=83;Dels=0.00;FS=3.244;HRun=0;HaplotypeScore=2.8120;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.673;VQSLOD=5.2558;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,40:83:99:1055,0,1061
1	202287206	.	T	C	3861.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=127;Dels=0.00;FS=9.469;HRun=5;HaplotypeScore=6.2167;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.537;VQSLOD=2.6793;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,125:127:99:3793,260,0
1	202731846	.	G	T	2248.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9800;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.984;VQSLOD=2.7026;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,93:214:99:2279,0,3120
1	203028371	.	G	T	113.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.177;VQSLOD=5.3240;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:143,0,245
1	203152801	.	T	C	1134.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=137;Dels=0.00;FS=2.385;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.456;VQSLOD=6.0117;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,47:137:99:1164,0,2635
1	203194186	.	C	T	2066.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=9.0767;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2099,162,0
1	203455902	.	A	C	1367.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.649;DP=106;Dels=0.00;FS=1.649;HRun=0;HaplotypeScore=3.6917;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.174;VQSLOD=5.5039;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,56:106:99:1397,0,1375
1	204159611	.	CT	C	491.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.194;DP=19;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=57.6798;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.87;ReadPosRankSum=-0.787;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:531,0,183
1	204237416	.	C	T	499.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.871;DP=58;Dels=0.00;FS=6.277;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.597;VQSLOD=5.0574;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,20:58:99:530,0,898
1	204379452	.	T	C	1595.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9918;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.011;VQSLOD=6.5008;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,57:118:99:1625,0,1629
1	204379617	.	T	C	8408.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.475;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=4.081;HRun=0;HaplotypeScore=9.6072;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=33.90;ReadPosRankSum=-0.056;VQSLOD=3.1040;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,247:248:99:8371,628,0
1	205027737	.	G	A	783.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.959;DP=67;Dels=0.00;FS=3.399;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.366;VQSLOD=5.7837;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,35:67:99:814,0,876
1	205031116	.	C	T	573.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;DP=46;Dels=0.00;FS=2.329;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.309;VQSLOD=6.0888;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:603,0,803
1	205053219	.	C	T	4896.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8907;MQ=59.84;MQ0=0;QD=34.72;VQSLOD=8.8416;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4896,382,0
1	205130413	.	A	G	5782.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6882;MQ=59.27;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=9.1394;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,188:188:99:5782,463,0
1	205801872	.	A	G	1730.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.169;DP=125;Dels=0.00;FS=3.436;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.316;VQSLOD=6.0145;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1761,0,1543
1	205814485	.	G	A	6161.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.56;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=9.6553;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:195:99:6161,481,0
1	205814497	.	T	C	5707.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=58.38;MQ0=0;QD=28.97;VQSLOD=8.5145;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:5706,469,0
1	206603535	.	G	A	2583.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.670;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.550;HRun=0;HaplotypeScore=5.6061;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.661;VQSLOD=5.1585;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,106:250:99:2614,0,3900
1	206626607	.	G	A	224.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;DP=26;Dels=0.00;FS=1.760;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.237;VQSLOD=6.4254;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:254,0,466
1	206634429	.	A	G	818.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.122;DP=100;Dels=0.00;FS=2.829;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.460;VQSLOD=5.5115;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,35:100:99:848,0,1697
1	207074905	.	T	C	1169.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.445;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9905;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.398;VQSLOD=6.0865;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,46:111:99:1199,0,1741
1	207109116	.	C	T	540.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.491;VQSLOD=6.5141;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,22:52:99:570,0,779
1	207195779	.	A	G	2549.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.20;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=10.0174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2583,202,0
1	207200875	.	G	GT	2597.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;DP=129;FS=0.667;HRun=1;HaplotypeScore=302.8926;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=20.13;ReadPosRankSum=-1.004;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,67:129:99:2636,0,1845
1	207304900	.	T	C	2074.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.27;MQ0=0;QD=32.93;VQSLOD=10.0376;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2108,168,0
1	207646462	.	G	A	3813.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.77;MQ0=0;QD=29.56;VQSLOD=8.1915;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:3813,295,0
1	207646898	.	T	C	4422.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8625;MQ=58.77;MQ0=1;QD=33.00;VQSLOD=9.4971;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4422,346,0
1	207646923	.	G	A	5196.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8865;MQ=58.84;MQ0=1;QD=32.08;VQSLOD=8.9873;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5196,415,0
1	207653395	.	C	A	3344.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=9.2864;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3344,268,0
1	207782916	.	A	T	1092.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.53;VQSLOD=8.1166;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:90.25:1126,90,0
1	207795320	.	A	G	809.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97;VQSLOD=12.7038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:63.20:842,63,0
1	207851611	.	A	G	4851.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.73;VQSLOD=7.8714;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:4851,370,0
1	207857254	.	A	G	3182.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.74;MQ0=1;QD=28.17;VQSLOD=8.7036;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3216,253,0
1	207890866	.	T	C	4692.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=1.7046;MQ=52.61;MQ0=0;QD=31.50;VQSLOD=3.6736;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4692,364,0
1	208391254	.	C	T	780.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.450;DP=61;Dels=0.00;FS=3.086;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.469;VQSLOD=6.1888;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,28:61:99:811,0,854
1	209785206	.	G	A	2720.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.609;DP=191;DS;Dels=0.00;FS=1.167;HRun=0;HaplotypeScore=6.1851;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.649;VQSLOD=4.4321;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,103:191:99:2750,0,2032
1	209950760	.	C	G	1109.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.114;VQSLOD=6.3495;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,40:83:99:1140,0,1167
1	210004199	.	C	G	1586.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=134;Dels=0.00;FS=0.717;HRun=0;HaplotypeScore=2.9402;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.664;VQSLOD=4.8119;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,58:134:99:1617,0,2044
1	212273639	.	C	T	2722	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5741;MQ=59.26;MQ0=0;QD=28.65;VQSLOD=6.4753;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:95:99:2755,229,0
1	212274413	.	A	C	2000.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.84;MQ0=0;QD=33.35;VQSLOD=9.9711;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2034,156,0
1	212798977	.	A	G	3224.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.647;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=1.583;HRun=0;HaplotypeScore=3.3245;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.302;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.264;VQSLOD=6.0432;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,119:240:99:3254,0,3163
1	212799870	.	A	G	4203.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.698;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.028;VQSLOD=9.6927;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,124:125:99:4167,301,0
1	212799949	.	C	T	4906.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.748;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3776;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.962;VQSLOD=7.6554;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,161:162:99:4872,360,0
1	212911836	.	T	C	3994.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=9.8221;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:3994,322,0
1	213009469	.	A	G	2870.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.75;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=8.9796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2903,223,0
1	213068595	.	C	T	2799.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=9.0380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2833,220,0
1	214492286	.	G	A	4676.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.3732;MQ=59.44;MQ0=0;QD=31.17;VQSLOD=8.1129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:4676,373,0
1	214820099	.	A	G	421.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;DP=35;Dels=0.00;FS=3.067;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.073;VQSLOD=6.0148;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:451,0,466
1	214826196	.	G	A	1479.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.044;DP=120;Dels=0.00;FS=3.512;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.076;VQSLOD=6.0863;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,58:120:99:1509,0,1393
1	214830617	.	A	G	1348.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.744;DP=109;Dels=0.00;FS=4.886;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.772;VQSLOD=5.8767;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,48:109:99:1379,0,1733
1	214837110	.	C	G	544.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.102;DP=46;Dels=0.00;FS=4.119;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.919;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.221;VQSLOD=5.1001;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:574,0,619
1	215914826	.	T	C	1650.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.854;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8537;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.171;VQSLOD=5.1511;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,67:164:99:1680,0,2415
1	215916563	.	G	A	2230.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.0110;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.848;VQSLOD=6.3330;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,90:181:99:2260,0,2384
1	215960167	.	T	G	2317.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.63;MQ0=0;QD=33.11;VQSLOD=8.5068;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2351,190,0
1	216172380	.	A	G	868.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.825;DP=72;Dels=0.00;FS=1.992;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.478;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.259;VQSLOD=5.8255;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,33:72:99:899,0,947
1	216219781	.	A	G	1166.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.926;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.698;VQSLOD=6.3948;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,46:72:99:1196,0,617
1	216348764	.	C	T	1759.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.777;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9325;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.34;ReadPosRankSum=1.015;VQSLOD=9.2173;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:1793,107,0
1	216595306	.	C	T	2323.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=0;QD=29.79;VQSLOD=8.5434;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2357,196,0
1	219383905	.	A	G	1751.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.49;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=8.2264;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1784,141,0
1	220193423	.	T	C	2008.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.592;DP=166;Dels=0.00;FS=3.611;HRun=0;HaplotypeScore=2.9808;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.928;VQSLOD=4.7346;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,75:166:99:2038,0,2412
1	220197625	.	G	T	696.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;DP=70;Dels=0.00;FS=2.331;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.109;VQSLOD=6.5520;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,27:70:99:726,0,1185
1	220331205	.	C	G	526.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=38;Dels=0.00;FS=2.826;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.629;VQSLOD=5.1612;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:556,0,498
1	220970028	.	A	G	1914.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.75;VQSLOD=7.3806;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1948,162,0
1	221053545	.	T	C	508.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.226;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7218;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.409;VQSLOD=5.5036;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,21:42:99:539,0,566
1	221057646	.	C	T	406.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.995;DP=36;Dels=0.00;FS=3.012;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.385;VQSLOD=6.4782;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:436,0,557
1	222713501	.	C	A	1919.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.788;DP=132;Dels=0.00;FS=1.456;HRun=0;HaplotypeScore=3.6019;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.065;VQSLOD=5.6632;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,75:132:99:1949,0,1373
1	222713621	.	C	T	1621.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.320;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6593;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=4.5579;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,67:146:99:1651,0,2029
1	222802006	.	A	G	7887.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6900;MQ=59.82;MQ0=0;QD=34.00;VQSLOD=8.5114;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,232:232:99:7887,608,0
1	222919895	.	T	G	576.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.725;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.441;VQSLOD=5.6534;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,23:61:99:606,0,1001
1	222923351	.	A	G	2567.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4905;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.21;VQSLOD=7.5684;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:91:99:2600,217,0
1	223178478	.	G	A	2878.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.804;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.499;HRun=0;HaplotypeScore=5.1176;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.563;VQSLOD=4.3549;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,109:249:99:2908,0,3612
1	223283910	.	A	G	2315.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8606;MQ=58.89;MQ0=0;QD=34.56;VQSLOD=8.7499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2349,187,0
1	223567401	.	T	C	1620.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=171;Dels=0.00;FS=4.779;HRun=0;HaplotypeScore=2.9900;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.414;VQSLOD=5.1598;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,65:171:99:1650,0,2709
1	223900408	.	C	G	484.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.2434;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49;VQSLOD=6.8392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:39.13:517,39,0
1	223954080	.	A	C	1266.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.850;DP=102;Dels=0.00;FS=0.751;HRun=1;HaplotypeScore=1.9937;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.787;VQSLOD=6.7423;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,52:102:99:1296,0,1350
1	224482084	.	C	T	1118.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=81;Dels=0.00;FS=4.481;HRun=0;HaplotypeScore=1.9780;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.241;VQSLOD=5.0770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,42:81:99:1148,0,1021
1	225607144	.	C	T	1866.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=8.5626;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1899,147,0
1	226026406	.	A	G	2925.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=246;Dels=0.00;FS=5.186;HRun=0;HaplotypeScore=13.8106;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.310;VQSLOD=2.7835;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,123:246:99:2955,0,3094
1	226055624	.	C	T	1221.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=119;Dels=0.00;FS=0.698;HRun=0;HaplotypeScore=2.8448;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.397;VQSLOD=5.4037;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,52:119:99:1252,0,1905
1	226125385	.	G	A	531.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.600;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6103;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.894;VQSLOD=4.1930;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,21:41:99:562,0,479
1	226352498	.	T	G	1256.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=120;Dels=0.00;FS=1.484;HRun=0;HaplotypeScore=3.8197;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.559;VQSLOD=6.1503;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,52:120:99:1287,0,1767
1	226923505	.	G	T	2034.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.62;MQ0=0;QD=33.35;VQSLOD=9.7905;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2067,163,0
1	226923938	.	A	C	1628.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23;VQSLOD=13.6073;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1661,129,0
1	226924642	.	C	T	2018.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;DP=146;Dels=0.00;FS=11.768;HRun=0;HaplotypeScore=2.9711;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.796;VQSLOD=4.0341;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,79:146:99:2048,0,1830
1	227182033	.	G	A	410.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.77;MQ0=0;QD=24.16;VQSLOD=7.8088;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:36.09:444,36,0
1	227216775	.	C	T	917.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6454;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.486;VQSLOD=5.9825;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,35:59:99:947,0,661
1	227923081	.	G	A	494.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05;VQSLOD=13.2633;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:42.13:528,42,0
1	228033197	.	A	G	569.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.528;DP=48;Dels=0.00;FS=1.490;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.757;VQSLOD=5.9269;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,22:48:99:599,0,682
1	228109247	.	C	T	1262.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.051;DP=95;Dels=0.00;FS=3.836;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.197;VQSLOD=4.8474;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,48:95:99:1292,0,1225
1	228402121	.	A	G	3895.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2185;MQ=58.47;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=6.8286;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:122:99:3895,319,0
1	228444565	.	T	A	2212.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.65;VQSLOD=7.0306;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:80:99:2245,207,0
1	228506768	.	C	T	321.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.110;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.425;VQSLOD=4.7049;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:351,0,466
1	229772693	.	T	G	4448.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;QD=34.75;VQSLOD=10.1094;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4448,346,0
1	230895340	.	C	A	542.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.370;VQSLOD=6.5441;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,22:53:99:573,0,850
1	230914729	.	A	C	860.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.753;DP=60;Dels=0.00;FS=1.025;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.052;VQSLOD=6.0831;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,34:60:99:890,0,665
1	231398511	.	A	T	1299.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8151;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.471;VQSLOD=3.7860;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,50:116:99:1329,0,1816
1	231488524	.	C	T	1733.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.37;VQSLOD=14.2873;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1766,138,0
1	231830295	.	G	A	2717.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9652;MQ=58.42;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=9.0051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2750,217,0
1	232568041	.	G	A	817.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.922;DP=61;Dels=0.00;FS=6.141;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.190;VQSLOD=5.2362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,31:61:99:847,0,704
1	232940953	.	T	C	2721.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.258;DP=163;DS;Dels=0.00;FS=2.166;HRun=1;HaplotypeScore=2.9385;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.582;VQSLOD=6.1350;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,96:163:99:2752,0,1781
1	232941677	.	G	T	175.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.211;VQSLOD=6.0673;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:206,0,359
1	233122127	.	C	T	240.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.184;DP=15;Dels=0.00;FS=2.515;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.531;VQSLOD=2.9692;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:271,0,142
1	234582651	.	T	C	2293.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.570;DP=173;Dels=0.00;FS=1.189;HRun=1;HaplotypeScore=6.4328;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.693;VQSLOD=4.6688;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,90:173:99:2324,0,2343
1	234603322	.	A	T	600.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.400;DP=44;Dels=0.00;FS=2.788;HRun=0;HaplotypeScore=1.9907;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.037;VQSLOD=4.6166;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:44:99:630,0,530
1	236413230	.	T	A	2323.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.41;VQSLOD=7.2865;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2357,175,0
1	236557771	.	G	A	4755.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=1;QD=29.72;VQSLOD=8.9978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:159:99:4755,364,0
1	236700807	.	T	A	2018.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.68;MQ0=0;QD=28.43;VQSLOD=7.9008;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2052,162,0
1	236700857	.	C	T	2611.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=8.0228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2645,205,0
1	236702210	.	A	G	2128.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5812;MQ=57.34;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=5.7243;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2161,174,0
1	236706862	.	G	C	2833.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8129;MQ=58.56;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=7.0594;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:92:99:2867,226,0
1	236717926	.	T	C	2869.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=30.52;VQSLOD=8.9965;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2902,223,0
1	236718620	.	T	C	6648.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.0769;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=32.75;ReadPosRankSum=-1.115;VQSLOD=7.0365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,202:203:99:6616,495,0
1	236719193	.	A	G	5926.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9420;MQ=58.84;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=8.1336;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:5926,484,0
1	236721660	.	T	C	4403.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.83;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=9.0048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:139:99:4403,328,0
1	236749649	.	T	C	2412.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=31.75;VQSLOD=8.8003;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2446,187,0
1	236758887	.	T	C	2734.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=58.62;MQ0=0;QD=29.40;VQSLOD=8.4449;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2768,214,0
1	237048500	.	A	G	904.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.546;DP=68;Dels=0.00;FS=0.933;HRun=2;HaplotypeScore=1.9632;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.153;VQSLOD=6.0487;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,33:68:99:934,0,870
1	240492734	.	G	A	2628.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.722;DP=191;Dels=0.00;FS=5.064;HRun=0;HaplotypeScore=8.9371;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.808;VQSLOD=4.2666;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,98:191:99:2659,0,2427
1	241755348	.	C	T	1882.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.595;DP=177;DS;Dels=0.00;FS=3.850;HRun=0;HaplotypeScore=3.8473;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.172;VQSLOD=5.7025;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,71:177:99:1913,0,2601
1	241929542	.	G	A	1652.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=125;Dels=0.00;FS=1.488;HRun=1;HaplotypeScore=3.9549;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.032;VQSLOD=6.0704;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,67:125:99:1683,0,1324
1	241951329	.	C	T	407.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.577;DP=45;Dels=0.00;FS=5.039;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.391;VQSLOD=5.6961;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,16:45:99:438,0,808
1	242030151	.	A	G	4406.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6764;MQ=59.13;MQ0=0;QD=28.06;VQSLOD=7.4928;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:4405,358,0
1	242035382	.	C	T	1184.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.024;VQSLOD=7.7971;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,38:40:60.58:1217,61,0
1	242042301	.	G	A	4795.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.09;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.8135;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4795,376,0
1	242045275	.	C	T	2321.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.24;VQSLOD=6.5714;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2355,172,0
1	245704130	.	G	C	1516.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.705;DP=139;Dels=0.00;FS=0.657;HRun=2;HaplotypeScore=1.8932;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.438;VQSLOD=5.2634;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,63:139:99:1547,0,1762
1	246755124	.	T	C	1523.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75;VQSLOD=8.1310;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1557,126,0
1	247006051	.	G	C	7808.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4926;MQ=57.91;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=6.9891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7770,593,0
1	247048834	.	T	C	2063.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=45.01;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=4.8890;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2096,163,0
1	247151557	.	A	G	408.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.251;VQSLOD=6.0988;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:438,0,622
1	247162658	.	C	T	2734.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;QD=30.39;VQSLOD=9.0841;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2768,214,0
1	247267269	.	C	T	168.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=13;Dels=0.00;FS=2.616;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.289;VQSLOD=6.3169;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:91.35:199,0,91
1	247267274	.	C	A	52.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;DP=13;Dels=0.00;FS=2.616;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=3.6815;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:82.65:83,0,208
1	247419509	.	T	C	6780.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6486;MQ=59.49;MQ0=0;QD=31.10;VQSLOD=8.8539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:218:99:6780,518,0
1	247419664	.	C	T	6911.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=59.38;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=9.3505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:218:99:6911,551,0
1	247614386	.	T	C	2976.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.985;HRun=1;HaplotypeScore=1.9318;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.618;VQSLOD=6.2599;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:3006,0,3867
1	247614407	.	G	A	3051.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.058;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.686;HRun=0;HaplotypeScore=2.8385;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.564;VQSLOD=6.1434;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,112:250:99:3082,0,4101
1	247614693	.	C	T	2560.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;QD=33.26;VQSLOD=9.9863;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2594,220,0
1	247614896	.	A	C	1819.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=146;Dels=0.00;FS=9.305;HRun=0;HaplotypeScore=4.0511;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=12.46;ReadPosRankSum=-2.165;VQSLOD=3.2944;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,66:146:99:1850,0,2172
1	247695612	.	G	A	4594.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6075;MQ=58.88;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=9.2184;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,149:150:99:4594,376,0
1	247695756	.	T	C	3493.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7074;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.804;VQSLOD=9.0788;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,111:112:99:3471,288,0
1	247752019	.	G	C	4236.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.266;HRun=0;HaplotypeScore=6.9711;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.128;VQSLOD=4.4763;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:250:99:3565,0,3564
1	247752161	.	T	C	7966.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=6.2176;MQ=59.14;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=7.4302;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7965,671,0
1	247752367	.	A	G	2030.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.041;DP=166;Dels=0.00;FS=15.539;HRun=2;HaplotypeScore=1.3990;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.188;VQSLOD=3.7500;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,77:166:99:2060,0,2534
1	247769752	.	A	G	920.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;DP=94;Dels=0.00;FS=0.777;HRun=0;HaplotypeScore=3.8427;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.749;VQSLOD=4.9705;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:94:99:951,0,1345
1	247835950	.	T	C	3523.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;QD=34.55;VQSLOD=9.9857;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3523,277,0
1	247875415	.	A	G	2405.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;DP=204;Dels=0.00;FS=2.438;HRun=2;HaplotypeScore=4.5506;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.662;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.183;VQSLOD=4.7777;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,88:204:99:2435,0,3271
1	247978319	.	A	G	1834.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.55;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=9.2653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1868,144,0
1	248004687	.	C	G	3012.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.922;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=9.352;HRun=1;HaplotypeScore=3.7428;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.618;VQSLOD=4.0931;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,102:206:99:3043,0,2866
1	248004775	.	C	T	1480.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=147;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=3.402;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.286;VQSLOD=3.8556;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,58:147:99:1510,0,2724
1	248004848	.	G	C	1314.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.875;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7318;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.481;VQSLOD=3.8760;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,43:79:99:1344,0,1052
1	248004877	.	C	T	1103.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.921;DP=77;Dels=0.00;FS=4.383;HRun=0;HaplotypeScore=3.8770;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=14.33;ReadPosRankSum=-1.676;VQSLOD=4.4292;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,38:77:99:1133,0,1041
1	248039451	.	C	T	4297.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6609;MQ=58.78;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.0235;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4297,343,0
1	248059423	.	C	T	2585.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;DP=181;Dels=0.00;FS=1.217;HRun=0;HaplotypeScore=3.7499;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.348;VQSLOD=4.0379;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,94:181:99:2615,0,2290
1	248059456	.	G	A	3108.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=203;Dels=0.00;FS=3.257;HRun=0;HaplotypeScore=2.9962;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.968;VQSLOD=4.4185;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,110:203:99:3139,0,2441
1	248059476	.	A	C	7011.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6021;MQ=57.77;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=6.3398;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:7010,587,0
1	248059703	.	T	A	2043.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.990;DP=143;Dels=0.00;FS=3.610;HRun=1;HaplotypeScore=5.1740;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.331;VQSLOD=4.2486;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,75:143:99:2074,0,1804
1	248059712	.	T	C	1639.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.128;DP=134;Dels=0.00;FS=2.582;HRun=0;HaplotypeScore=8.0514;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.674;VQSLOD=4.6605;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,69:134:99:1670,0,1709
1	248059779	.	G	GA	1747.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.591;DP=92;FS=11.134;HRun=2;HaplotypeScore=275.0093;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.096;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,48:92:99:1787,0,1186
1	248112809	.	A	G	5220.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7602;MQ=44.54;MQ0=2;QD=30.35;VQSLOD=2.5962;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5220,427,0
1	248112836	.	A	G	5932.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.931;DP=202;Dels=0.00;FS=3.563;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=49.07;MQ0=2;MQRankSum=1.192;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.096;VQSLOD=3.0442;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,201:202:99:5898,478,0
1	248128929	.	G	A	2852.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.316;DP=209;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=1;HaplotypeScore=8.4748;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.724;VQSLOD=4.6676;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,101:209:99:2883,0,3149
1	248129240	.	G	A	1370.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;DP=83;Dels=0.00;FS=0.911;HRun=0;HaplotypeScore=3.3307;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.752;VQSLOD=6.1009;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,48:83:99:1401,0,873
1	248457979	.	C	A	7956.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=58.24;MQ0=0;QD=34.59;VQSLOD=7.8520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:7955,626,0
1	248457993	.	C	G	7965.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6343;MQ=58.33;MQ0=0;QD=32.78;VQSLOD=9.2017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,243:243:99:7965,653,0
1	248458875	.	CT	C	3638.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=233.4709;MQ=41.03;MQ0=8;QD=34.32;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,104:89:99:3638,262,0
1	248487638	.	A	G	8662.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6918;MQ=58.44;MQ0=0;QD=34.65;VQSLOD=9.1714;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8662,683,0
1	248487768	.	A	G	8601.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.11;MQ0=0;QD=34.54;VQSLOD=8.6936;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:249:99:8600,671,0
1	248512498	.	A	G	5125.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8410;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.7637;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:169:99:5124,427,0
1	248525328	.	C	CTA	11052.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1662.7607;MQ=35.14;MQ0=1;QD=47.03;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:8,223:195:99:11052,575,0
1	248525780	.	C	T	6539.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8730;MQ=53.06;MQ0=0;QD=30.70;VQSLOD=3.4471;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:213:99:6539,527,0
1	248550970	.	A	G	3347.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9074;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.437;VQSLOD=8.0446;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,114:115:99:3310,240,0
1	248550976	.	T	G	3491.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9074;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=32.03;ReadPosRankSum=0.064;VQSLOD=9.2863;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,107:109:99:3424,231,0
1	248551636	.	T	G	6209.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.16;MQ0=0;QD=33.93;VQSLOD=9.2542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:6209,476,0
1	248789504	.	T	C	5233.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.72;MQ0=0;QD=31.72;VQSLOD=8.5325;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:165:99:5233,406,0
1	248790075	.	A	G	3947.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2451;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=8.5960;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3947,328,0
1	248814080	.	A	C	4377.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=44.78;MQ0=2;QD=33.42;VQSLOD=4.0295;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:4377,346,0
1	248845097	.	C	T	2755.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=34.02;VQSLOD=9.6045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2789,226,0
1	248845458	.	C	T	4825.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.69;MQ0=0;QD=31.96;VQSLOD=8.3844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,151:151:99:4825,373,0
1	248845499	.	A	G	3940.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=8.6345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:3940,316,0
2	1271230	.	A	G	408.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.625;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.415;VQSLOD=5.9899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:438,0,409
2	1460004	.	G	T	2896.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.15;MQ0=0;QD=29.26;VQSLOD=8.5243;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,98:99:99:2930,238,0
2	1499927	.	A	C	1102.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.566;DP=101;Dels=0.00;FS=0.785;HRun=1;HaplotypeScore=4.8497;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=10.91;ReadPosRankSum=-2.407;VQSLOD=4.5593;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,41:101:99:1132,0,1509
2	1520676	.	T	C	985.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;DP=114;Dels=0.00;FS=2.565;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.415;VQSLOD=6.2735;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,44:114:99:1016,0,1714
2	3392295	.	A	G	574.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.754;DP=60;Dels=0.00;FS=1.016;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.625;VQSLOD=5.7439;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,25:60:99:604,0,862
2	7137067	.	A	G	2824.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4905;MQ=59.44;MQ0=0;QD=34.44;VQSLOD=9.4283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2857,223,0
2	10045024	.	G	A	2022.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=9.2977;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2056,163,0
2	10050960	.	A	G	1422.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.622;DP=106;Dels=0.00;FS=2.521;HRun=0;HaplotypeScore=3.4591;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.107;VQSLOD=6.0635;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,55:106:99:1452,0,1390
2	10059770	.	G	T	982.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;DP=90;Dels=0.00;FS=5.269;HRun=1;HaplotypeScore=2.6722;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.303;VQSLOD=4.4514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,40:90:99:1013,0,1288
2	10101468	.	A	G	4192.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=9.240;HRun=0;HaplotypeScore=5.6305;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.090;VQSLOD=4.0381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,129:248:99:3560,0,3268
2	10126330	.	G	A	3160.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.289;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.506;HRun=2;HaplotypeScore=9.8815;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.620;VQSLOD=4.2485;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,119:250:99:3191,0,3622
2	10262920	.	T	G	545.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.91;MQ0=0;QD=27.26;VQSLOD=7.5382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.14:578,48,0
2	10350599	.	G	C	858.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.625;DP=83;Dels=0.00;FS=1.986;HRun=0;HaplotypeScore=1.5661;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.949;VQSLOD=6.3245;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,34:83:99:888,0,1390
2	10717806	.	C	T	219.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.841;DP=37;Dels=0.00;FS=1.378;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.013;VQSLOD=2.3109;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,11:37:99:249,0,592
2	10908893	.	A	G	1592.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.7559;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.368;VQSLOD=4.6145;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,67:126:99:1622,0,1460
2	11359120	.	G	T	759.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;DP=89;Dels=0.00;FS=0.802;HRun=3;HaplotypeScore=0.9979;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.706;VQSLOD=5.7927;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,36:89:99:789,0,1364
2	11702661	.	A	C	6609.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.7241;MQ=59.52;MQ0=0;QD=32.56;VQSLOD=9.5283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:203:99:6609,518,0
2	11774324	.	G	A	6244.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7107;MQ=59.81;MQ0=0;QD=32.19;VQSLOD=9.2388;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:194:99:6243,494,0
2	15607842	.	T	C	941.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.349;VQSLOD=6.5654;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,33:55:99:971,0,557
2	15674686	.	T	C	2558.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.356;DP=244;Dels=0.00;FS=3.009;HRun=0;HaplotypeScore=8.4674;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.021;VQSLOD=4.4657;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,109:244:99:2588,0,3477
2	17696573	.	C	T	892.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.944;DP=87;Dels=0.00;FS=4.249;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.935;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.952;VQSLOD=4.7082;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,38:87:99:923,0,1326
2	17884495	.	C	T	468.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.618;DP=62;Dels=0.00;FS=1.099;HRun=0;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.394;VQSLOD=6.1694;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,23:62:99:499,0,1006
2	17942775	.	T	A	1540.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;DP=98;Dels=0.00;FS=3.837;HRun=0;HaplotypeScore=1.9402;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.007;VQSLOD=6.0666;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,57:98:99:1570,0,1029
2	17946243	.	A	G	2393.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.510;DP=170;Dels=0.00;FS=3.558;HRun=0;HaplotypeScore=6.6191;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.808;VQSLOD=4.1034;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,87:170:99:2424,0,2184
2	17954027	.	G	A	1385.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.05;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=8.5366;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1418,114,0
2	17962518	.	C	T	971.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.161;DP=86;Dels=0.00;FS=12.930;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.187;VQSLOD=4.4197;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,38:86:99:1001,0,1347
2	17998025	.	A	T	891.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7214;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.412;VQSLOD=5.9803;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,33:71:99:921,0,1235
2	17998095	.	C	T	903.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.872;DP=60;Dels=0.00;FS=2.286;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.291;VQSLOD=6.0247;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,34:60:99:933,0,724
2	18113623	.	A	G	1937.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4596;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.540;VQSLOD=5.9149;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,75:168:99:1967,0,2414
2	20133221	.	C	T	1432.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.583;DP=102;Dels=0.00;FS=5.004;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.133;VQSLOD=4.7923;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,61:102:99:1462,0,1093
2	20403794	.	A	T	3716.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4160;MQ=58.76;MQ0=0;QD=32.89;VQSLOD=5.8642;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3716,292,0
2	20818764	.	C	T	823.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;DP=77;Dels=0.00;FS=10.718;HRun=0;HaplotypeScore=2.9821;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.887;VQSLOD=3.6678;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,38:77:99:853,0,853
2	20824498	.	C	T	1201.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.063;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.459;VQSLOD=6.8796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,50:90:99:1231,0,988
2	20974586	.	C	T	2476.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.678;DP=225;Dels=0.00;FS=5.551;HRun=1;HaplotypeScore=7.2651;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.258;VQSLOD=4.1284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,99:225:99:2507,0,3125
2	21225281	.	C	T	1101.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=33.37;VQSLOD=9.3761;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:90.28:1134,90,0
2	21225753	.	C	T	841.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;DP=76;Dels=0.00;FS=0.943;HRun=2;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.275;VQSLOD=6.4612;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,31:76:99:872,0,1277
2	21232803	.	T	C	2978.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8317;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.03;VQSLOD=9.0978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:3011,244,0
2	21235475	.	T	C	2570.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;QD=30.97;VQSLOD=9.0435;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:83:99:2604,199,0
2	21249716	.	C	T	1321.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.939;DP=118;Dels=0.00;FS=0.693;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.477;VQSLOD=5.8008;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,54:118:99:1352,0,1704
2	21250914	.	G	A	5117.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.13;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=9.0297;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:173:99:5117,406,0
2	24108652	.	T	C	842.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=28.10;VQSLOD=7.9318;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:69.20:876,69,0
2	25022598	.	A	G	1174.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=97;Dels=0.00;FS=3.862;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=12.11;ReadPosRankSum=-2.952;VQSLOD=4.4017;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,45:97:99:1205,0,1529
2	25141538	.	A	G	2178.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.448;DP=154;Dels=0.00;FS=2.924;HRun=3;HaplotypeScore=2.7702;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.626;VQSLOD=6.0080;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,86:154:99:2208,0,1760
2	26203678	.	T	C	4649.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.73;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=9.7537;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4648,379,0
2	26534801	.	G	A	2495.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.1790;MQ=59.31;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=9.2161;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2529,211,0
2	26536694	.	C	T	2751.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.80;MQ0=0;QD=30.24;VQSLOD=9.0300;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2784,238,0
2	26607992	.	T	C	623.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=9.2526;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:51.16:656,51,0
2	26667615	.	T	C	2186.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=29.55;VQSLOD=7.6663;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2220,175,0
2	26741961	.	G	A	1505.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=13.4584;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1538,120,0
2	26800422	.	G	A	4694.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.695;DP=155;Dels=0.00;FS=9.556;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.877;VQSLOD=3.3534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,152:155:99:4584,253,0
2	27260469	.	G	A	2751.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6456;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.414;VQSLOD=6.2512;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,104:208:99:2781,0,2651
2	27303755	.	A	G	801.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.11;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=8.4417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:72.17:835,72,0
2	27315252	.	G	A	855.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;DP=71;Dels=0.00;FS=2.332;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.024;VQSLOD=6.8308;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,34:71:99:886,0,1051
2	27351948	.	T	G	4553.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.84;MQ0=0;QD=32.52;VQSLOD=9.5913;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4552,358,0
2	27424636	.	G	A	952.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.249;DP=70;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.746;VQSLOD=6.7605;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:982,0,1117
2	27461368	.	T	C	1569.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=148;Dels=0.00;FS=1.336;HRun=0;HaplotypeScore=3.4391;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.030;VQSLOD=4.4950;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,60:148:99:1600,0,2339
2	27730940	.	T	C	1900.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5494;MQ=59.61;MQ0=0;QD=32.21;VQSLOD=9.0435;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1933,156,0
2	27799773	.	A	C	624.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.410;DP=50;Dels=0.00;FS=2.463;HRun=0;HaplotypeScore=2.6766;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.690;VQSLOD=5.3286;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,26:50:99:655,0,676
2	27801403	.	C	G	878.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.088;DP=80;Dels=0.00;FS=0.831;HRun=0;HaplotypeScore=2.8607;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.533;VQSLOD=5.9369;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,36:80:99:909,0,1226
2	27801418	.	C	A	900.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.518;DP=74;Dels=0.00;FS=1.931;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.146;VQSLOD=6.9197;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,34:74:99:931,0,1122
2	27887034	.	C	A	2855.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=30.37;VQSLOD=9.0597;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2888,235,0
2	29226512	.	A	G	567.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80;VQSLOD=12.9581;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:45.14:601,45,0
2	29246044	.	T	C	78.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.055;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.791;VQSLOD=3.6204;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:108,0,320
2	29416366	.	G	C	2977.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=14.506;HRun=0;HaplotypeScore=3.4264;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.799;VQSLOD=3.2784;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,108:250:99:3008,0,4255
2	29416572	.	T	C	5264.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.78;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=8.9232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:169:99:5264,409,0
2	30975961	.	G	T	8079.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.651;HRun=3;HaplotypeScore=8.4535;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.316;VQSLOD=2.5862;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,236:239:99:7997,593,0
2	31805880	.	A	AG	1980.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=108.1491;MQ=60.94;MQ0=0;QD=40.42;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,47:49:99:2023,141,0
2	32667182	.	G	C	2898.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.98;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=8.3650;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2931,223,0
2	33585796	.	T	C	3491.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8835;MQ=59.40;MQ0=0;QD=30.36;VQSLOD=8.6096;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3491,292,0
2	33764176	.	A	G	254.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.384;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9976;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.325;VQSLOD=5.5791;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:284,0,182
2	37456032	.	C	T	1567.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=0;QD=30.73;VQSLOD=9.3936;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1600,126,0
2	38179134	.	G	A	2312.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.18;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=8.0283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2346,187,0
2	38298139	.	T	C	1469.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.464;DP=111;Dels=0.00;FS=3.536;HRun=0;HaplotypeScore=2.7877;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.072;VQSLOD=5.8687;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,55:111:99:1500,0,1461
2	38298203	.	C	G	1322.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;DP=104;Dels=0.00;FS=4.915;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.351;VQSLOD=5.4985;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,51:104:99:1353,0,1488
2	38537579	.	T	C	678.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.018;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.158;VQSLOD=6.0102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,26:69:99:709,0,1074
2	38604351	.	A	G	148.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=19;Dels=0.00;FS=5.161;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.127;VQSLOD=3.9766;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:178,0,321
2	39082344	.	T	C	2865.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=1.280;HRun=0;HaplotypeScore=2.6594;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.621;VQSLOD=6.1158;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,99:218:99:2896,0,3183
2	42510018	.	A	G	6973.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6102;MQ=58.85;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=9.1290;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:6973,533,0
2	42515388	.	A	G	3671.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.32;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=8.1294;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:3671,271,0
2	42990101	.	G	C	3815.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7718;MQ=59.14;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=7.6497;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3815,295,0
2	43015704	.	T	A	4767.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9818;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.37;VQSLOD=8.2925;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:157:99:4767,370,0
2	43015719	.	T	C	4545.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2665;MQ=58.91;MQ0=0;QD=28.95;VQSLOD=8.6083;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:4544,376,0
2	43452618	.	C	T	385.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.080;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7331;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.577;VQSLOD=6.0193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:416,0,177
2	44004010	.	T	C	1494.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.635;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.513;VQSLOD=6.4138;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,56:108:99:1524,0,1241
2	44028013	.	A	T	572.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.126;DP=45;Dels=0.00;FS=1.161;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.217;VQSLOD=5.1513;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,25:45:99:603,0,457
2	44071743	.	A	G	1261.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.884;DP=92;Dels=0.00;FS=2.902;HRun=0;HaplotypeScore=4.7384;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.034;VQSLOD=4.8857;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,46:92:99:1291,0,996
2	44104925	.	T	C	3782.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.68;MQ0=0;QD=32.33;VQSLOD=9.6865;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3782,292,0
2	44513202	.	T	C	2247.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.160;DP=174;Dels=0.00;FS=4.587;HRun=0;HaplotypeScore=2.7470;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.407;VQSLOD=3.3963;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,88:174:99:2278,0,2307
2	44547574	.	G	A	794.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.941;DP=80;Dels=0.00;FS=16.935;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.009;VQSLOD=3.5518;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,31:80:99:824,0,1446
2	47382342	.	G	T	674.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.008;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4368;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=11.44;ReadPosRankSum=-2.008;VQSLOD=4.7807;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,26:59:99:705,0,977
2	47601106	.	T	C	1567.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;DP=116;Dels=0.00;FS=2.407;HRun=0;HaplotypeScore=1.8874;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.434;VQSLOD=6.4345;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,62:116:99:1598,0,1369
2	48807796	.	A	C	1472.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=153;Dels=0.00;FS=3.867;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.003;VQSLOD=4.2167;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,63:153:99:1502,0,2242
2	48808152	.	G	C	1485.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.363;DP=105;Dels=0.00;FS=13.486;HRun=0;HaplotypeScore=3.7800;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.375;VQSLOD=3.5595;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,55:105:99:1516,0,1222
2	48809593	.	G	T	1594.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.463;DP=131;Dels=0.00;FS=1.410;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.173;VQSLOD=6.8122;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,66:131:99:1625,0,1841
2	48809609	.	C	G	1346	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.768;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1405;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.018;VQSLOD=2.4267;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,53:118:99:1376,0,1688
2	48921375	.	T	C	695.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.83;VQSLOD=8.4892;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:54.18:729,54,0
2	49189921	.	C	T	2076.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.258;DP=168;Dels=0.00;FS=4.503;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.273;VQSLOD=5.4174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,85:168:99:2107,0,2207
2	49191041	.	C	T	2988.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.503;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=6.187;HRun=0;HaplotypeScore=6.9618;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.054;VQSLOD=4.6205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,118:249:99:3019,0,3578
2	54587596	.	C	T	453.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=32.42;VQSLOD=9.4397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.12:487,39,0
2	55407754	.	C	T	4640.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3302;MQ=59.53;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=9.4796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4640,373,0
2	55436934	.	G	A	2028.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.65;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=9.3096;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2061,166,0
2	55490819	.	G	T	1291.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=91;Dels=0.00;FS=2.826;HRun=1;HaplotypeScore=1.9811;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.607;VQSLOD=6.1803;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,46:91:99:1321,0,1286
2	55771161	.	A	G	2904.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.97;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=9.3880;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2937,226,0
2	55912120	.	T	C	827.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.694;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.006;VQSLOD=5.6545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,34:73:99:857,0,941
2	58316814	.	A	G	4267.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.70;VQSLOD=8.8304;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4267,319,0
2	61483548	.	A	T	1862.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=29.56;ReadPosRankSum=1.347;VQSLOD=7.7157;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,62:63:99:1895,147,0
2	61575308	.	A	G	2409.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=31.71;VQSLOD=9.6315;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2443,199,0
2	63176139	.	A	C	460.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=30;Dels=0.00;FS=5.469;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.672;VQSLOD=4.6454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:490,0,352
2	63660902	.	C	T	500.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8789;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.433;VQSLOD=4.3606;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,21:61:99:531,0,1111
2	65245365	.	G	A	1992.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.435;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7356;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.427;VQSLOD=6.5537;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,81:144:99:2022,0,1720
2	65541063	.	C	G	1814.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.757;DP=150;Dels=0.00;FS=7.257;HRun=0;HaplotypeScore=7.2492;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.656;VQSLOD=2.7231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,74:150:99:1844,0,2224
2	67630980	.	G	A	1491.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;DP=110;Dels=0.00;FS=1.527;HRun=1;HaplotypeScore=2.6939;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.171;VQSLOD=6.3982;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,60:110:99:1521,0,1299
2	67631831	.	G	A	1224.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=108;Dels=0.00;FS=0.871;HRun=2;HaplotypeScore=4.4021;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.109;VQSLOD=5.4971;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,47:108:99:1255,0,1629
2	67632125	.	C	T	570.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;DP=42;Dels=0.00;FS=2.636;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.233;VQSLOD=6.0708;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,21:42:99:601,0,543
2	68364478	.	T	C	869.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;DP=98;Dels=0.00;FS=0.786;HRun=0;HaplotypeScore=1.6648;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.059;VQSLOD=5.8041;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,37:98:99:899,0,1563
2	68385097	.	A	G	1287.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60;VQSLOD=13.3494;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1320,105,0
2	68607947	.	G	T	2626.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.463;DP=204;DS;Dels=0.00;FS=1.085;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=6.6210;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,101:204:99:2656,0,2961
2	68622914	.	G	A	1506.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.563;VQSLOD=5.9921;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,51:86:99:1537,0,984
2	68753240	.	T	A	915.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.646;VQSLOD=6.1789;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,37:83:99:946,0,1217
2	68765205	.	C	T	1235.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.813;DP=83;Dels=0.00;FS=2.988;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.244;VQSLOD=6.2691;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,48:83:99:1265,0,1050
2	69049941	.	T	C	1568.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;DP=161;Dels=0.00;FS=0.589;HRun=0;HaplotypeScore=2.4063;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.308;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.254;VQSLOD=4.5929;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,68:161:99:1599,0,2491
2	69650730	.	G	A	477.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.614;DP=49;Dels=0.00;FS=4.201;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.088;VQSLOD=4.2625;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:49:99:508,0,711
2	69659126	.	A	T	575.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.900;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.808;VQSLOD=6.0521;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,24:45:99:605,0,513
2	69736561	.	A	G	394.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.947;DP=38;Dels=0.00;FS=1.672;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.197;VQSLOD=5.5370;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,16:38:99:425,0,562
2	69741854	.	T	G	1026.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.52;VQSLOD=7.6868;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:78.25:1060,78,0
2	70188676	.	T	C	998.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.734;DP=76;Dels=0.00;FS=0.968;HRun=0;HaplotypeScore=3.2261;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.504;VQSLOD=6.5280;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,36:76:99:1029,0,988
2	71043461	.	C	T	1528.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.783;DP=115;Dels=0.00;FS=4.834;HRun=0;HaplotypeScore=4.8438;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.089;VQSLOD=4.9893;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,55:115:99:1558,0,1473
2	71044211	.	C	T	1004.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.540;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.824;VQSLOD=6.4305;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,36:67:99:1034,0,763
2	71058835	.	A	G	1717.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;DP=127;Dels=0.00;FS=5.169;HRun=0;HaplotypeScore=1.6644;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.888;VQSLOD=5.7274;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,68:127:99:1748,0,1615
2	71060111	.	G	A	1331.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;DP=78;Dels=0.00;FS=3.263;HRun=2;HaplotypeScore=1.9930;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.578;VQSLOD=5.9922;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,50:78:99:1361,0,748
2	71163173	.	C	T	1858.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.274;DP=132;Dels=0.00;FS=3.306;HRun=0;HaplotypeScore=2.6432;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.835;VQSLOD=4.7048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,75:132:99:1888,0,1320
2	71351487	.	G	A	1507.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=116;Dels=0.00;FS=7.298;HRun=0;HaplotypeScore=1.6671;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=5.2674;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,58:116:99:1537,0,1508
2	73226090	.	G	A	816.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.402;DP=53;Dels=0.00;FS=1.108;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.399;VQSLOD=6.3048;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,34:53:99:847,0,475
2	73651967	.	C	T	1152.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.689;DP=87;Dels=0.00;FS=3.039;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.123;VQSLOD=6.4585;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,46:87:99:1182,0,986
2	73675669	.	T	G	3810.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9251;MQ=59.37;MQ0=0;QD=34.64;VQSLOD=8.0904;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3810,304,0
2	73677898	.	G	C	2515.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.400;DP=170;Dels=0.00;FS=6.614;HRun=0;HaplotypeScore=4.2084;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.551;VQSLOD=4.6796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,91:170:99:2546,0,2095
2	73679280	.	A	G	749.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.489;DP=51;Dels=0.00;FS=2.482;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.066;VQSLOD=5.7324;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,28:51:99:780,0,607
2	73679866	.	T	C	878.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.492;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.793;VQSLOD=5.9548;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,31:58:99:909,0,665
2	73679990	.	T	A	283.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.779;DP=37;Dels=0.00;FS=1.334;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.366;VQSLOD=4.4923;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,13:37:99:313,0,641
2	73680508	.	G	C	784.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.688;DP=56;Dels=0.00;FS=2.250;HRun=3;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.518;VQSLOD=6.1196;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,26:56:99:815,0,726
2	73717567	.	G	T	581	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=42;Dels=0.00;FS=1.218;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.733;VQSLOD=6.3938;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,23:42:99:611,0,596
2	73717656	.	A	G	1576.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.624;DP=120;Dels=0.00;FS=0.753;HRun=0;HaplotypeScore=1.9928;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.512;VQSLOD=5.6300;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,58:120:99:1607,0,1718
2	73828538	.	G	A	738.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;DP=58;Dels=0.00;FS=1.840;HRun=1;HaplotypeScore=1.8650;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.998;VQSLOD=5.9574;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,27:58:99:768,0,973
2	73868328	.	A	G	2250.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.882;DP=169;Dels=0.00;FS=2.031;HRun=0;HaplotypeScore=2.6141;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.063;VQSLOD=4.1076;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,87:169:99:2280,0,2260
2	73927931	.	A	G	1677.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.361;DP=110;Dels=0.00;FS=4.868;HRun=1;HaplotypeScore=4.1595;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=4.6484;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,57:110:99:1708,0,1490
2	73928098	.	C	G	2941.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=184;Dels=0.00;FS=4.336;HRun=0;HaplotypeScore=4.6575;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.750;VQSLOD=3.7764;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,97:184:99:2972,0,2382
2	73928366	.	G	C	2183.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=6.6310;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.926;VQSLOD=3.9572;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,97:210:99:2213,0,2979
2	74274329	.	C	T	1764.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6838;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=14.01;ReadPosRankSum=-1.053;VQSLOD=4.3596;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,70:126:99:1795,0,1422
2	74489318	.	G	A	875.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.473;DP=64;Dels=0.00;FS=2.076;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=13.69;ReadPosRankSum=-2.037;VQSLOD=4.2671;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,36:64:99:906,0,802
2	75720372	.	C	T	2122.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.195;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=1.284;HRun=0;HaplotypeScore=3.8449;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.228;VQSLOD=6.3173;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,80:169:99:2153,0,2137
2	75879359	.	G	A	791.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.551;DP=74;Dels=0.00;FS=0.934;HRun=4;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.998;VQSLOD=5.6640;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,32:74:99:821,0,1180
2	75923413	.	T	C	2338.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.02;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.4418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2372,181,0
2	80529956	.	T	C	882	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=63;Dels=0.00;FS=8.922;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.076;VQSLOD=4.9417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,32:63:99:912,0,809
2	85549868	.	A	G	632.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.169;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=5.3838;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.859;VQSLOD=4.5648;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,26:48:99:662,0,559
2	85554080	.	G	A	1780.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.775;DP=137;Dels=0.00;FS=0.721;HRun=0;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.202;VQSLOD=6.6407;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,65:137:99:1810,0,1770
2	85622059	.	T	C	1404.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=29.26;VQSLOD=8.9234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1437,117,0
2	85780536	.	C	T	3314.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.4105;MQ=58.58;MQ0=0;QD=33.48;VQSLOD=8.6879;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3314,262,0
2	85843431	.	C	T	149.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=19;Dels=0.00;FS=4.359;HRun=1;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.940;VQSLOD=4.1574;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:179,0,324
2	85893741	.	G	A	3920.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=9.8225;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3920,313,0
2	85924729	.	C	T	2009.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.67;MQ0=0;QD=29.13;VQSLOD=8.6738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2043,165,0
2	86088333	.	T	C	1726.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.570;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9943;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.362;VQSLOD=4.0850;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,65:128:99:1756,0,1614
2	86317012	.	C	G	793.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=76;Dels=0.00;FS=4.208;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.165;VQSLOD=4.3866;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,30:76:99:824,0,1206
2	86317037	.	G	C	1848.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5352;MQ=58.60;MQ0=0;QD=34.88;VQSLOD=7.2158;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1881,147,0
2	86433240	.	C	T	5227.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8737;MQ=56.80;MQ0=0;QD=29.04;VQSLOD=5.2587;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:180:99:5227,421,0
2	86683642	.	A	G	1024.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.276;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.140;VQSLOD=5.6577;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,41:87:99:1055,0,1092
2	86693826	.	T	C	2634.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.554;DP=231;Dels=0.00;FS=8.745;HRun=1;HaplotypeScore=4.8579;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.202;VQSLOD=4.6100;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,96:231:99:2664,0,3280
2	88424066	.	T	C	5926.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7356;MQ=59.66;MQ0=0;QD=30.39;VQSLOD=8.9066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:5926,442,0
2	88472791	.	G	A	3634.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.62;MQ0=0;QD=29.79;VQSLOD=8.9141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3634,280,0
2	88825965	.	G	A	1637.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.581;DP=136;Dels=0.00;FS=2.231;HRun=1;HaplotypeScore=1.6483;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.621;VQSLOD=6.1892;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,61:136:99:1668,0,1635
2	88874891	.	C	A	5100.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6780;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=34.23;ReadPosRankSum=-0.257;VQSLOD=6.1238;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,147:149:99:5100,397,0
2	88895123	.	T	C	1930.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.53;MQ0=0;QD=28.82;VQSLOD=7.7957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1964,159,0
2	95947085	.	A	G	5154.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.31;MQ0=0;QD=33.47;VQSLOD=9.6368;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:5153,406,0
2	96795608	.	T	G	2677.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7305;MQ=58.27;MQ0=0;QD=31.50;VQSLOD=8.6602;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2711,211,0
2	96795857	.	T	C	4233.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.85;VQSLOD=7.9733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,152:152:99:4233,340,0
2	96798305	.	C	T	1142.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.246;VQSLOD=6.1312;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,42:82:99:1173,0,1071
2	96993757	.	C	T	2607.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.279;DP=196;Dels=0.00;FS=4.389;HRun=0;HaplotypeScore=9.7253;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.019;VQSLOD=4.2769;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,96:196:99:2637,0,2425
2	97030247	.	T	C	1254.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.315;DP=113;Dels=0.00;FS=1.587;HRun=0;HaplotypeScore=5.7826;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.672;VQSLOD=5.1697;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,51:113:99:1284,0,1460
2	98164184	.	C	G	367.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=49.95;MQ0=0;QD=24.52;VQSLOD=4.1972;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:30.08:401,30,0
2	98409046	.	G	A	304.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.091;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=14.51;ReadPosRankSum=2.452;VQSLOD=5.1520;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:335,0,234
2	98809432	.	T	C	2400.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.481;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.849;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.794;VQSLOD=4.9200;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,87:194:99:2430,0,2731
2	98844674	.	C	G	1631.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;DP=150;Dels=0.00;FS=2.976;HRun=0;HaplotypeScore=6.2195;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.213;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.176;VQSLOD=3.2127;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,66:150:99:1661,0,2241
2	98853173	.	G	A	3919.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.451;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=2.859;HRun=0;HaplotypeScore=5.6218;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.217;VQSLOD=4.8304;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,122:241:99:3310,0,3038
2	98928494	.	G	A	192.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;DP=14;Dels=0.00;FS=2.027;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.225;VQSLOD=5.9472;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:222,0,163
2	99226173	.	T	A	4189.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.706;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.264;VQSLOD=5.8746;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,129:250:99:3541,0,3354
2	99812070	.	G	A	7955.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8606;MQ=53.89;MQ0=0;QD=31.82;VQSLOD=3.4626;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7954,668,0
2	100343557	.	C	T	2669.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6103;MQ=59.80;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=8.3766;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2702,208,0
2	101086966	.	C	T	6621	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.5534;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.349;VQSLOD=3.9257;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,227:228:99:6581,466,0
2	101591304	.	A	G	1143.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.170;VQSLOD=6.7148;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,47:99:99:1174,0,1397
2	101624471	.	T	C	835.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.243;VQSLOD=6.7659;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,32:65:99:865,0,884
2	101656726	.	T	C	1561.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.587;DP=144;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9756;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.459;VQSLOD=5.1450;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,66:144:99:1591,0,2294
2	101898412	.	G	C	6471.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.44;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=9.5094;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:6471,506,0
2	102968007	.	G	A	1345.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.883;DP=88;Dels=0.00;FS=3.157;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.253;VQSLOD=6.5564;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,54:88:99:1375,0,940
2	102968211	.	C	A	1085.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;DP=71;Dels=0.00;FS=7.323;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.132;VQSLOD=5.1372;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,36:71:99:1115,0,1009
2	102968212	.	A	G	1009.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.458;DP=70;Dels=0.00;FS=5.451;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.117;VQSLOD=6.0250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,35:70:99:1040,0,1025
2	102968356	.	C	T	1180.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.886;DP=88;Dels=0.00;FS=1.819;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.014;VQSLOD=6.4312;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,44:88:99:1211,0,1214
2	102968362	.	T	C	1134.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;DP=92;Dels=0.00;FS=4.059;HRun=0;HaplotypeScore=3.8577;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.131;VQSLOD=5.5555;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,43:92:99:1164,0,1303
2	103149100	.	G	A	979.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=79;Dels=0.00;FS=9.728;HRun=0;HaplotypeScore=2.4947;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.933;VQSLOD=4.6822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,35:79:99:1009,0,1188
2	103431404	.	T	C	1265.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7825;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.37;VQSLOD=7.1964;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1299,105,0
2	105885961	.	T	C	486.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;DP=33;Dels=0.00;FS=3.412;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.092;VQSLOD=6.4707;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:517,0,362
2	107459974	.	C	T	4065.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.806;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=9.191;HRun=0;HaplotypeScore=6.5516;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.160;VQSLOD=4.0480;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,123:241:99:3463,0,2927
2	108875198	.	G	A	978.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.735;DP=98;Dels=0.00;FS=2.722;HRun=0;HaplotypeScore=1.8947;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.705;VQSLOD=5.2931;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,41:98:99:1009,0,1421
2	108875244	.	T	C	882.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.341;DP=87;Dels=0.00;FS=1.941;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.192;VQSLOD=5.6422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:912,0,1358
2	109099572	.	C	G	1478.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;QD=29.56;VQSLOD=8.0189;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1511,114,0
2	109414936	.	G	T	877.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=65;Dels=0.00;FS=8.863;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.080;VQSLOD=3.0899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,37:65:99:908,0,781
2	111562875	.	C	T	2455.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=197;Dels=0.00;FS=3.332;HRun=2;HaplotypeScore=1.6640;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.822;VQSLOD=5.6539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,89:197:99:2486,0,2750
2	112686988	.	G	A	1633.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.206;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5518;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.470;VQSLOD=6.3637;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,62:143:99:1663,0,2195
2	112751928	.	G	A	7661.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.1757;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=32.06;ReadPosRankSum=1.020;VQSLOD=6.8235;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,236:239:99:7625,572,0
2	112755001	.	A	G	5020.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.1815;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39;VQSLOD=7.1157;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:5020,400,0
2	113309473	.	C	T	1946.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.773;DP=167;Dels=0.00;FS=1.962;HRun=2;HaplotypeScore=5.4836;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.464;VQSLOD=5.4518;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,74:167:99:1976,0,2307
2	113498566	.	A	G	5512.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1907;MQ=59.16;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=8.0648;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,176:177:99:5512,421,0
2	113513825	.	T	C	6034.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9721;MQ=59.49;MQ0=0;QD=31.43;VQSLOD=8.9271;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,192:192:99:6033,499,0
2	113674709	.	C	G	1434.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.793;DP=101;Dels=0.00;FS=6.428;HRun=0;HaplotypeScore=2.4203;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.047;VQSLOD=4.6744;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,55:101:99:1464,0,1163
2	113674721	.	A	G	1655.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.338;DP=107;Dels=0.00;FS=7.660;HRun=0;HaplotypeScore=5.8888;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.531;VQSLOD=4.1388;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,59:107:99:1686,0,1160
2	113675269	.	C	T	3182.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.986;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=2.727;HRun=0;HaplotypeScore=5.9069;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.985;VQSLOD=4.8711;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,108:236:99:3212,0,3226
2	113676219	.	T	C	519.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;DP=61;Dels=0.00;FS=3.594;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=5.8982;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,24:61:99:550,0,1034
2	113676381	.	G	A	1008.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.621;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.849;VQSLOD=6.9457;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,44:96:99:1039,0,1287
2	113763575	.	A	G	1976.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.216;DP=196;Dels=0.00;FS=0.543;HRun=4;HaplotypeScore=5.2071;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.015;VQSLOD=5.4399;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,81:196:99:2006,0,3068
2	113832312	.	T	C	2717.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.771;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=7.429;HRun=0;HaplotypeScore=9.0354;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.389;VQSLOD=3.3429;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,101:201:99:2747,0,2645
2	113832333	.	C	A	2218.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=181;DS;Dels=0.00;FS=10.301;HRun=0;HaplotypeScore=9.0120;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.299;VQSLOD=3.4484;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,85:181:99:2248,0,2494
2	113940839	.	G	C	1653.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.137;DP=125;Dels=0.00;FS=5.648;HRun=0;HaplotypeScore=2.9835;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.571;VQSLOD=5.3678;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,66:125:99:1684,0,1621
2	116510817	.	G	C	2551.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12;VQSLOD=8.8759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2584,199,0
2	116525960	.	G	A	1766.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.60;VQSLOD=7.6030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1800,135,0
2	118578824	.	A	G	1493.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.814;DP=80;Dels=0.00;FS=0.897;HRun=0;HaplotypeScore=1.7873;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=4.9199;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,51:80:99:1523,0,697
2	120060082	.	T	C	1382.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;QD=27.65;VQSLOD=8.5050;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1416,102,0
2	120078778	.	T	C	1581.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=28.24;VQSLOD=7.9420;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1614,120,0
2	120129841	.	A	G	2194.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;DP=190;Dels=0.00;FS=1.789;HRun=0;HaplotypeScore=3.9954;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.694;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.971;VQSLOD=5.7569;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,89:190:99:2224,0,2524
2	120388412	.	G	A	7943.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5486;MQ=59.23;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=9.2154;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7942,623,0
2	120438523	.	A	G	6293.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9714;MQ=58.73;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=8.0626;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:6292,490,0
2	120439230	.	C	G	4353.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.49;MQ0=0;QD=34.55;VQSLOD=9.7422;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:4353,343,0
2	120885310	.	G	A	2245.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.728;DP=195;Dels=0.00;FS=3.296;HRun=2;HaplotypeScore=4.9505;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.465;VQSLOD=5.0005;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,92:195:99:2275,0,2768
2	121746956	.	G	T	2032.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.47;MQ0=0;QD=28.62;VQSLOD=8.6745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2065,162,0
2	121747406	.	G	A	1862.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.78;MQ0=0;QD=32.67;VQSLOD=9.8139;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1895,150,0
2	128321770	.	G	A	259.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.529;DP=17;Dels=0.00;FS=4.598;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.203;VQSLOD=5.6316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:290,0,195
2	131487673	.	A	C	4480.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2932;MQ=59.50;MQ0=0;QD=34.73;VQSLOD=8.6426;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4480,355,0
2	131520663	.	T	C	2665.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=32.12;VQSLOD=9.3967;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2699,214,0
2	132241704	.	C	T	1384.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.544;DP=154;Dels=0.00;FS=0.623;HRun=0;HaplotypeScore=3.9400;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-1.063;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.239;VQSLOD=4.7483;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,58:154:99:1415,0,2440
2	132241731	.	T	C	1689.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;DP=152;Dels=0.00;FS=9.977;HRun=0;HaplotypeScore=5.9504;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.545;VQSLOD=2.4856;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,68:152:99:1719,0,2264
2	133541107	.	T	A	3157.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.965;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.039;HRun=0;HaplotypeScore=7.2754;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.374;VQSLOD=3.5827;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,120:249:99:3188,0,3658
2	133541454	.	A	G	688.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.539;VQSLOD=6.5483;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,25:43:99:718,0,423
2	133542574	.	C	T	995.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;DP=75;Dels=0.00;FS=1.070;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.460;VQSLOD=5.6747;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,35:75:99:1025,0,1070
2	135745129	.	G	A	1721.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;DP=144;Dels=0.00;FS=1.330;HRun=1;HaplotypeScore=2.6566;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.474;VQSLOD=6.5426;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,68:144:99:1751,0,2146
2	135893372	.	A	G	1287.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.533;DP=100;Dels=0.00;FS=8.606;HRun=0;HaplotypeScore=2.7966;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.594;VQSLOD=4.8320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,45:100:99:1318,0,1476
2	136393658	.	A	G	1667.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.039;DP=141;Dels=0.00;FS=5.859;HRun=1;HaplotypeScore=2.8573;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.467;VQSLOD=4.8158;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,67:141:99:1698,0,1906
2	136555659	.	T	C	2571.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.625;DP=206;Dels=0.00;FS=2.408;HRun=0;HaplotypeScore=3.1062;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.345;VQSLOD=6.0653;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,102:206:99:2602,0,2702
2	136575534	.	T	C	6371.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.68;VQSLOD=9.8693;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6371,497,0
2	136590746	.	C	T	1771.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.752;DP=175;DS;Dels=0.00;FS=3.566;HRun=0;HaplotypeScore=4.3124;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.469;VQSLOD=5.1408;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,78:175:99:1802,0,2575
2	137917922	.	T	A	2996.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.76;MQ0=0;QD=30.89;VQSLOD=8.8102;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3029,250,0
2	138420996	.	A	G	144.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=5.8742;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:174,0,169
2	138759649	.	C	T	624.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.199;DP=73;Dels=0.00;FS=0.919;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.693;VQSLOD=6.0836;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,29:73:99:655,0,1222
2	143798189	.	A	G	225.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.861;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.032;VQSLOD=4.5737;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:255,0,546
2	144899559	.	C	A	1272.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=9.0944;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1306,102,0
2	152311570	.	G	A	2161.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.528;DP=171;Dels=0.00;FS=0.579;HRun=0;HaplotypeScore=2.8132;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.720;VQSLOD=6.0348;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,85:171:99:2192,0,2035
2	152320118	.	G	A	941.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;DP=66;Dels=0.00;FS=1.998;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=14.26;ReadPosRankSum=2.094;VQSLOD=4.4484;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,35:66:99:971,0,849
2	152322095	.	A	T	533.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.265;DP=48;Dels=0.00;FS=6.227;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.265;VQSLOD=4.3752;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,20:48:99:563,0,725
2	152331418	.	C	G	476.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=33;Dels=0.00;FS=8.742;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.271;VQSLOD=4.4694;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:507,0,437
2	152346979	.	T	C	271.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=23;Dels=0.00;FS=1.648;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.523;VQSLOD=6.0946;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:301,0,311
2	152352843	.	C	G	337.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.3302;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.249;VQSLOD=5.2961;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:368,0,500
2	152422076	.	C	G	509.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.308;DP=29;Dels=0.00;FS=6.262;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.950;VQSLOD=3.8010;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:540,0,252
2	152476028	.	C	G	2806.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.389;DP=222;Dels=0.00;FS=1.657;HRun=0;HaplotypeScore=5.6285;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.706;VQSLOD=4.6954;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,103:222:99:2836,0,3274
2	152527572	.	C	T	4371.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4725;MQ=58.78;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=8.8454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4370,346,0
2	152531077	.	A	G	2686.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.23;VQSLOD=9.2766;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2719,205,0
2	152536498	.	T	A	1860.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=9.0413;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1893,150,0
2	157406249	.	G	A	1050.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=80;Dels=0.00;FS=1.468;HRun=0;HaplotypeScore=3.3240;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=13.13;ReadPosRankSum=2.842;VQSLOD=3.1811;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,38:80:99:1081,0,1206
2	159166069	.	T	C	3657.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.54;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=9.3001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3657,283,0
2	159663599	.	T	C	1467.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.341;DP=116;Dels=0.00;FS=0.721;HRun=1;HaplotypeScore=1.6545;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.456;VQSLOD=6.3614;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,60:116:99:1498,0,1384
2	159663616	.	G	A	1193.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=116;Dels=0.00;FS=3.521;HRun=0;HaplotypeScore=2.3974;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=5.8294;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,54:116:99:1224,0,1393
2	160019863	.	A	G	3961.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3657;MQ=58.91;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=7.7475;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:129:99:3961,304,0
2	160112881	.	G	T	1883.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.71;VQSLOD=7.9392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:1917,150,0
2	160136337	.	G	A	2180.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.95;VQSLOD=8.3622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2213,163,0
2	160599717	.	C	G	1669.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=128;Dels=0.00;FS=3.351;HRun=0;HaplotypeScore=6.0773;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.319;VQSLOD=3.4439;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,61:128:99:1699,0,1802
2	160673519	.	G	A	484.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.752;DP=41;Dels=0.00;FS=5.573;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=11.82;ReadPosRankSum=-2.699;VQSLOD=3.5169;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:515,0,620
2	160673526	.	A	G	602.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.755;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.609;VQSLOD=6.3157;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:633,0,446
2	160676427	.	C	A	1150.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.84;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=8.1516;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:93.29:1183,93,0
2	160808075	.	C	T	2619.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=31.18;VQSLOD=9.1858;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2652,208,0
2	160879259	.	C	T	1568.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.658;DP=131;Dels=0.00;FS=2.285;HRun=0;HaplotypeScore=4.7431;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.382;VQSLOD=4.6648;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,59:131:99:1598,0,1819
2	160885418	.	G	C	2443.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=8.5123;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2477,190,0
2	160885442	.	T	C	2306.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.0323;MQ=59.38;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=8.8039;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2340,178,0
2	163124051	.	C	T	1349.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.205;DP=119;Dels=0.00;FS=5.638;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.495;VQSLOD=5.7842;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,53:119:99:1379,0,1641
2	163128824	.	T	C	564.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=45;Dels=0.00;FS=4.491;HRun=0;HaplotypeScore=2.9632;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=6.0012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,21:45:99:595,0,667
2	165381542	.	C	A	142.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;DP=25;Dels=0.00;FS=2.044;HRun=1;HaplotypeScore=2.7245;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.524;VQSLOD=3.9903;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:172,0,454
2	165476253	.	A	T	4251.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.53;VQSLOD=8.1637;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:149:99:4251,319,0
2	165551404	.	G	A	900.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=81;Dels=0.00;FS=0.947;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.450;VQSLOD=6.0484;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,37:81:99:930,0,1311
2	166535883	.	G	C	1170.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;DP=80;Dels=0.00;FS=2.087;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.699;VQSLOD=5.4852;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,42:80:99:1200,0,1131
2	166788336	.	T	C	1526.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;QD=28.26;VQSLOD=8.6464;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1559,114,0
2	166797646	.	C	T	754.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7329;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.705;VQSLOD=6.4759;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,32:77:99:784,0,1191
2	166892788	.	C	T	938.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=83;Dels=0.00;FS=0.886;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.779;VQSLOD=5.7526;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,35:83:99:969,0,1315
2	167334085	.	G	T	145.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=6.990;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.377;VQSLOD=4.9511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:90.79:175,0,91
2	169721377	.	G	A	2572.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6701;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.192;VQSLOD=8.2382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,80:81:99:2606,197,0
2	169764176	.	G	C	2055.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.095;DP=180;DS;Dels=0.00;FS=5.802;HRun=0;HaplotypeScore=1.9494;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.699;VQSLOD=5.3179;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,73:180:99:2085,0,3083
2	169830328	.	A	G	1290.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.761;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4726;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.098;VQSLOD=4.8399;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,46:87:99:1321,0,1027
2	170003432	.	T	G	1380.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=9.3841;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1414,108,0
2	170010985	.	T	C	1771.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=9.1590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1805,144,0
2	170053505	.	C	T	988.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.474;DP=104;Dels=0.00;FS=1.016;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.212;VQSLOD=6.0039;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,39:104:99:1018,0,1710
2	170175334	.	T	C	1529.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.995;DP=147;Dels=0.00;FS=8.681;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=4.8391;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,62:147:99:1560,0,2236
2	170367099	.	G	A	1432.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4052;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.357;VQSLOD=6.1719;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,57:123:99:1463,0,1557
2	170403030	.	T	C	1974.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7005;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.594;VQSLOD=6.5425;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,71:129:99:2004,0,1586
2	170493103	.	T	A	457.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.263;DP=28;Dels=0.00;FS=3.799;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.673;VQSLOD=4.4283;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:488,0,229
2	171225841	.	A	G	1006.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;DP=91;Dels=0.00;FS=1.728;HRun=0;HaplotypeScore=3.9041;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.881;VQSLOD=6.0367;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,41:91:99:1036,0,1283
2	171260787	.	G	A	6194.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2231;MQ=58.52;MQ0=0;QD=29.50;VQSLOD=8.4901;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,210:210:99:6193,502,0
2	171356274	.	G	A	3417.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.31;MQ0=0;QD=30.51;VQSLOD=9.0401;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3417,262,0
2	171572940	.	G	A	556.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.138;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.320;VQSLOD=6.5162;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:587,0,319
2	172411273	.	G	A	1038.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;DP=91;Dels=0.00;FS=1.690;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.220;VQSLOD=6.6018;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,43:91:99:1068,0,1309
2	173339808	.	G	A	2072.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.74;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=7.5848;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2105,169,0
2	174128513	.	C	T	1447.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.128;DP=133;Dels=0.00;FS=0.825;HRun=2;HaplotypeScore=3.7168;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.296;VQSLOD=6.3608;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,53:133:99:1478,0,2259
2	174820750	.	T	C	2439.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.596;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=1.906;HRun=0;HaplotypeScore=4.7146;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.129;VQSLOD=4.4015;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,89:182:99:2470,0,2364
2	175289259	.	G	T	786.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=65;Dels=0.00;FS=3.487;HRun=2;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.403;VQSLOD=6.1935;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,29:65:99:816,0,985
2	175436940	.	G	A	3199.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=9.5056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3232,250,0
2	177016728	.	T	C	566.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=56;Dels=0.00;FS=2.668;HRun=3;HaplotypeScore=2.4533;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.701;VQSLOD=6.1854;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,28:56:99:596,0,780
2	177054769	.	G	A	3179.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-11.234;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=1.721;HRun=0;HaplotypeScore=6.5013;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.564;VQSLOD=4.6877;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,127:238:99:3209,0,3226
2	178417142	.	C	T	3085.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.032;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=3.203;HRun=0;HaplotypeScore=10.0483;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.770;VQSLOD=3.3450;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,104:201:99:3115,0,2264
2	178936614	.	C	T	6722.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.5340;MQ=59.40;MQ0=0;QD=33.61;VQSLOD=5.8839;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:6722,524,0
2	179400130	.	G	A	1594.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=121;Dels=0.00;FS=7.243;HRun=0;HaplotypeScore=1.9980;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.901;VQSLOD=3.9213;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,57:121:99:1624,0,1789
2	179444768	.	C	G	5042.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=58.44;MQ0=0;QD=32.32;VQSLOD=9.1559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:5042,388,0
2	179558366	.	T	C	164.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.916;VQSLOD=5.2722;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:194,0,379
2	179615887	.	T	C	1623.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8824;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=30.63;ReadPosRankSum=-0.537;VQSLOD=8.5671;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,51:53:70.96:1656,71,0
2	179615931	.	C	G	1575.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.03;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=9.3492;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1609,126,0
2	179620951	.	C	T	5419.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3001;MQ=59.10;MQ0=0;QD=30.97;VQSLOD=9.3959;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5419,430,0
2	179621477	.	C	T	1941	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.4218;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1974,156,0
2	179623758	.	C	T	4009.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.48;VQSLOD=8.8249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4009,307,0
2	179629461	.	C	T	5817.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.67;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=9.0406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:185:99:5816,463,0
2	179644035	.	G	A	1976.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=9.8003;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2010,159,0
2	179644855	.	T	C	3072.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8975;MQ=59.02;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=8.9150;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3105,238,0
2	179650408	.	G	A	3390.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.66;MQ0=0;QD=32.29;VQSLOD=9.0795;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3390,280,0
2	180810264	.	A	T	6755.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7706;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=8.3975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:223:99:6755,530,0
2	182395345	.	G	A	7397.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5156;MQ=59.42;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=6.7249;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,235:235:99:7396,566,0
2	182543455	.	T	C	1819.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.53;MQ0=0;QD=37.14;VQSLOD=9.6750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1853,147,0
2	185800905	.	A	T	2990.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8628;MQ=58.39;MQ0=0;QD=28.75;VQSLOD=7.8321;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3023,235,0
2	185801747	.	G	A	1321.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.06;MQ0=0;QD=29.37;VQSLOD=8.0906;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1354,105,0
2	185802243	.	C	A	2691.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;DP=83;Dels=0.00;FS=2.855;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=2.064;QD=32.43;ReadPosRankSum=2.212;VQSLOD=3.4299;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,81:83:99:2725,165,0
2	185802363	.	A	G	3515.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.95;MQ0=0;QD=30.05;VQSLOD=8.3449;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3515,286,0
2	186670104	.	A	C	1074.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;QD=29.86;VQSLOD=8.7706;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:84.27:1108,84,0
2	186670979	.	T	C	1024.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=34;Dels=0.00;FS=3.424;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.631;VQSLOD=4.0474;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,33:34:56.84:1057,57,0
2	186697876	.	A	G	1466.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.5826;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1499,114,0
2	187532417	.	G	A	3384.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2031;MQ=59.68;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=7.9405;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3384,265,0
2	187702100	.	G	T	815.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;DP=83;Dels=0.00;FS=0.843;HRun=1;HaplotypeScore=3.3826;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=3.6109;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,35:83:99:846,0,1325
2	188250301	.	T	A	1824.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9937;MQ=57.28;MQ0=0;QD=26.83;VQSLOD=4.3339;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:1857,144,0
2	188348943	.	G	A	253.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.186;VQSLOD=4.2681;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:284,0,526
2	189861933	.	C	A	1669	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.440;DP=147;Dels=0.00;FS=7.331;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.255;VQSLOD=4.2132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,70:147:99:1699,0,2042
2	189864080	.	G	A	453.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6195;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40;VQSLOD=8.2509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42.12:487,42,0
2	189875421	.	T	G	3684.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9134;MQ=59.21;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=9.6600;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3684,283,0
2	189940142	.	T	G	1363.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.258;DP=108;Dels=0.00;FS=7.445;HRun=0;HaplotypeScore=2.7627;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=12.63;ReadPosRankSum=2.651;VQSLOD=3.3219;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,54:108:99:1394,0,1169
2	190531426	.	G	A	2392.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7820;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19;VQSLOD=9.2580;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2426,193,0
2	190595258	.	G	T	2325.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.9957;MQ=58.97;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=8.8427;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2359,181,0
2	191064753	.	C	T	8151.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8255;MQ=58.34;MQ0=0;QD=32.61;VQSLOD=9.2188;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8150,668,0
2	192701407	.	G	C	365.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.307;VQSLOD=5.5503;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:396,0,564
2	196673533	.	A	G	2385.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=14.1612;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2418,190,0
2	196825238	.	C	A	1386.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9925;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.106;VQSLOD=6.0816;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,51:123:99:1417,0,2181
2	196851911	.	G	A	733	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.43;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=8.6606;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:60.19:766,60,0
2	198950240	.	G	A	701.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.646;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.952;VQSLOD=11.6351;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,30:67:99:732,0,1085
2	200813126	.	T	C	1411.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=6.2886;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,55:120:99:1441,0,1606
2	201253956	.	A	G	498.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70;VQSLOD=14.0421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:45.12:532,45,0
2	201355106	.	G	A	1437.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;DP=93;Dels=0.00;FS=20.875;HRun=0;HaplotypeScore=3.2165;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.262;VQSLOD=2.2938;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,53:93:99:1468,0,1040
2	202122995	.	A	G	1928.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.447;DP=167;DS;Dels=0.00;FS=0.592;HRun=0;HaplotypeScore=2.6653;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.105;VQSLOD=6.6120;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,73:167:99:1959,0,2629
2	202215492	.	C	G	655.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;DP=55;Dels=0.00;FS=1.038;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.513;VQSLOD=4.2567;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:686,0,732
2	202252539	.	G	A	1498.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=147;Dels=0.00;FS=5.282;HRun=0;HaplotypeScore=4.0969;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.335;VQSLOD=4.8826;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,63:147:99:1528,0,2469
2	202264156	.	C	T	952.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.424;DP=75;Dels=0.00;FS=0.886;HRun=0;HaplotypeScore=2.9903;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.624;VQSLOD=5.5942;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,42:75:99:983,0,854
2	202410300	.	A	T	982.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.519;DP=92;Dels=0.00;FS=3.991;HRun=1;HaplotypeScore=1.9780;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.332;VQSLOD=4.4110;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,46:92:99:1012,0,1057
2	202557702	.	C	T	1157.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=57.36;MQ0=1;QD=30.46;VQSLOD=7.4318;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:90.29:1191,90,0
2	202625615	.	C	T	1830.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.874;DP=130;Dels=0.00;FS=0.947;HRun=1;HaplotypeScore=3.1473;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.491;VQSLOD=5.7588;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,67:130:99:1861,0,1673
2	203820453	.	T	C	487.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.102;DP=56;Dels=0.00;FS=5.429;HRun=0;HaplotypeScore=3.4885;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.310;VQSLOD=3.1909;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:56:99:518,0,876
2	204001482	.	A	G	2228.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=201;Dels=0.00;FS=2.460;HRun=1;HaplotypeScore=2.8729;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.767;VQSLOD=4.7912;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,94:201:99:2258,0,2707
2	204062061	.	A	G	2395.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.85;VQSLOD=8.0571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2428,193,0
2	204116690	.	C	T	2669.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=14.2267;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2702,220,0
2	204154552	.	C	T	1984.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.12;VQSLOD=8.0427;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2018,147,0
2	204732714	.	A	G	3691.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4303;MQ=59.00;MQ0=0;QD=29.29;VQSLOD=8.2632;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3691,277,0
2	206581033	.	G	A	6885.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.1994;MQ=59.21;MQ0=0;QD=33.59;VQSLOD=6.3698;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6885,536,0
2	207169731	.	G	A	221.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.347;VQSLOD=6.6446;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:252,0,312
2	207820276	.	G	A	2920.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=9.7372;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2953,241,0
2	207824384	.	T	G	2950.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.15;VQSLOD=9.9216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2984,229,0
2	208477852	.	G	A	7017.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9312;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=8.3919;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:7017,545,0
2	209007559	.	T	G	3051.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.847;HRun=0;HaplotypeScore=6.4588;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.171;VQSLOD=4.7807;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,107:248:99:3082,0,3602
2	209036712	.	T	C	8332.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7569;MQ=59.09;MQ0=0;QD=33.33;VQSLOD=9.3145;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8332,650,0
2	209036778	.	A	G	7071.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4826;MQ=59.54;MQ0=0;QD=33.04;VQSLOD=8.5863;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,214:214:99:7071,560,0
2	209108317	.	C	T	681.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.249;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.667;VQSLOD=6.0103;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,31:72:99:712,0,1042
2	209179939	.	A	G	1195.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.255;DP=116;Dels=0.00;FS=5.610;HRun=1;HaplotypeScore=4.7199;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.647;VQSLOD=4.8883;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,48:116:99:1226,0,1796
2	209184980	.	G	A	2274.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=34.46;VQSLOD=9.3331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2307,181,0
2	209190330	.	T	C	4018.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9814;MQ=59.46;MQ0=0;QD=32.41;VQSLOD=9.4845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:4018,325,0
2	209190519	.	A	T	2530.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=8.7787;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2564,202,0
2	209190528	.	C	G	2207.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;QD=34.49;VQSLOD=8.9688;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2240,178,0
2	209190632	.	T	G	2660.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.57;MQ0=0;QD=30.23;VQSLOD=9.2146;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2693,220,0
2	209191082	.	C	A	4108.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7552;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.43;VQSLOD=8.5977;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:135:99:4108,313,0
2	211060050	.	T	G	1327.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.241;DP=106;Dels=0.00;FS=1.581;HRun=0;HaplotypeScore=1.6624;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.721;VQSLOD=6.3833;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,51:106:99:1358,0,1362
2	211456637	.	A	G	574.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=52;Dels=0.00;FS=1.182;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.214;VQSLOD=4.4578;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,23:52:99:604,0,625
2	214727221	.	A	C	5639.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=5.6585;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=7.1718;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:5639,439,0
2	215632255	.	C	T	1216.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.852;DP=108;Dels=0.00;FS=1.549;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.257;VQSLOD=4.1876;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,52:108:99:1247,0,1356
2	215674224	.	G	A	227.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;DP=19;Dels=0.00;FS=6.767;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.367;VQSLOD=4.5272;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:258,0,259
2	215876166	.	A	T	1072.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.23;VQSLOD=7.3983;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:38:93.23:1106,93,0
2	216235089	.	C	T	2631.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.82;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=9.1978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:87:99:2665,208,0
2	216272900	.	T	G	4908.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8743;MQ=59.41;MQ0=0;QD=33.16;VQSLOD=8.5501;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4908,385,0
2	216300482	.	T	A	935.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65;VQSLOD=13.5678;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:78.23:969,78,0
2	218674697	.	C	T	2953.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.42;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=8.2193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2986,232,0
2	218683154	.	A	G	3194.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5463;MQ=59.57;MQ0=0;QD=29.57;VQSLOD=7.8744;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3227,268,0
2	218713282	.	G	A	1566.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=125;Dels=0.00;FS=6.064;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.467;VQSLOD=5.6697;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,62:125:99:1597,0,1706
2	218758200	.	T	G	1460.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.969;DP=111;Dels=0.00;FS=2.802;HRun=1;HaplotypeScore=3.8151;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.938;VQSLOD=4.9404;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,57:111:99:1491,0,1466
2	219146803	.	G	A	186.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.106;VQSLOD=11.8936;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:53.19:216,0,53
2	219319657	.	A	G	4918.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9560;MQ=59.04;MQ0=0;QD=28.11;VQSLOD=7.9012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:4918,397,0
2	219508372	.	A	T	4076.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.462;HRun=0;HaplotypeScore=6.5799;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=0.649;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.569;VQSLOD=3.7733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,131:250:99:3443,0,3261
2	219508988	.	T	C	2140.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.912;DP=169;Dels=0.00;FS=4.557;HRun=1;HaplotypeScore=5.0593;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=12.66;ReadPosRankSum=-2.114;VQSLOD=4.4517;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,78:169:99:2170,0,2439
2	219509618	.	C	A	1430.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=113;Dels=0.00;FS=0.961;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.371;VQSLOD=6.5425;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,54:113:99:1460,0,1851
2	219555262	.	G	A	1061.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.764;DP=78;Dels=0.00;FS=2.240;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.015;VQSLOD=6.6705;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,38:78:99:1091,0,993
2	219561254	.	G	A	1392.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.097;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.843;VQSLOD=6.4023;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,53:127:99:1422,0,1802
2	219562675	.	G	A	2914.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.297;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=4.782;HRun=0;HaplotypeScore=1.8268;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.366;VQSLOD=5.8326;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,111:242:99:2944,0,3719
2	219602499	.	G	C	1842.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;DP=131;Dels=0.00;FS=1.405;HRun=0;HaplotypeScore=3.3554;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.389;VQSLOD=5.6952;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,68:131:99:1873,0,1778
2	219903258	.	T	G	2500.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;QD=32.90;VQSLOD=9.9457;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2533,196,0
2	220037393	.	A	G	6301.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5220;MQ=59.62;MQ0=0;QD=34.62;VQSLOD=9.0939;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:6301,494,0
2	220046975	.	C	A	4664.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=6.418;HRun=1;HaplotypeScore=4.7185;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.023;VQSLOD=3.5110;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,138:247:99:3995,0,3145
2	220161785	.	G	C	738.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4824;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.781;VQSLOD=3.5054;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,35:68:99:768,0,953
2	220250147	.	A	G	2166.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.68;MQ0=0;QD=29.67;VQSLOD=8.6954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2199,184,0
2	220402671	.	G	T	98.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.524;DP=13;Dels=0.00;FS=2.480;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.978;VQSLOD=4.3627;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:128,0,221
2	220402680	.	T	C	114.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.933;DP=14;Dels=0.00;FS=5.219;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.200;VQSLOD=4.3796;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:145,0,227
2	220405321	.	T	C	622.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12;VQSLOD=13.3649;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:57.15:655,57,0
2	220417266	.	C	T	117.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.141;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.134;VQSLOD=5.6945;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:147,0,181
2	220419339	.	T	C	1218.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.09;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=8.4974;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1252,105,0
2	220421417	.	C	G	939.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=53;Dels=0.00;FS=1.534;HRun=1;HaplotypeScore=3.2325;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.548;VQSLOD=5.3718;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,31:53:99:970,0,606
2	220430203	.	C	T	1547.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=102;Dels=0.00;FS=3.106;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=15.17;ReadPosRankSum=-1.059;VQSLOD=4.1338;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,56:102:99:1577,0,1212
2	220473355	.	G	A	610.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.656;DP=45;Dels=0.00;FS=4.300;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.377;VQSLOD=5.2679;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,25:45:99:640,0,507
2	220476443	.	C	T	3866.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5616;MQ=59.37;MQ0=0;QD=35.15;VQSLOD=9.7989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3866,316,0
2	220494118	.	A	C	783.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.63;VQSLOD=14.2744;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:63.20:817,63,0
2	220502367	.	A	C	741.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=43;Dels=0.00;FS=3.179;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.584;VQSLOD=5.7882;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,26:43:99:772,0,420
2	223436607	.	C	T	1317.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03;VQSLOD=13.3528;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1351,105,0
2	223559089	.	T	C	1691.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8937;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.577;VQSLOD=7.4587;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,56:57:99:1725,100,0
2	223917983	.	T	G	2136.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.89;VQSLOD=9.8392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2170,169,0
2	224462310	.	G	A	1228.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.054;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9654;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.272;VQSLOD=5.8166;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,44:86:99:1259,0,1033
2	226491770	.	A	C	118.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.584;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.578;VQSLOD=4.0698;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,7:26:99:148,0,479
2	227886773	.	A	G	2879.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.100;DP=208;Dels=0.00;FS=0.560;HRun=4;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.709;VQSLOD=6.4120;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,102:208:99:2910,0,2721
2	227892720	.	C	T	189.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;DP=29;Dels=0.00;FS=3.799;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.262;VQSLOD=3.2243;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:220,0,521
2	227915832	.	G	A	1956.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.534;DP=141;Dels=0.00;FS=2.184;HRun=0;HaplotypeScore=2.5975;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.559;VQSLOD=6.5641;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,74:141:99:1987,0,1558
2	227954599	.	G	A	610.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.570;DP=58;Dels=0.00;FS=1.065;HRun=0;HaplotypeScore=3.8891;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.889;VQSLOD=5.8076;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,27:58:99:640,0,828
2	228111435	.	T	C	1287.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=13.7220;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1320,102,0
2	228113175	.	A	G	1936.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=14.0386;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1970,150,0
2	228135631	.	C	T	2076.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.62;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=9.5574;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2109,163,0
2	228194480	.	A	T	1520.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.142;DP=140;Dels=0.00;FS=3.070;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.401;VQSLOD=5.7733;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,65:140:99:1550,0,1988
2	228194481	.	G	T	1517.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;DP=141;Dels=0.00;FS=2.153;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.271;VQSLOD=6.6608;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,65:141:99:1547,0,2027
2	228476140	.	C	T	7320.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.02;VQSLOD=9.4878;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,236:236:99:7320,575,0
2	228476253	.	C	G	4806.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4718;MQ=59.58;MQ0=0;QD=33.38;VQSLOD=8.8005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4806,379,0
2	228758554	.	A	T	1015.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.541;DP=85;Dels=0.00;FS=0.888;HRun=0;HaplotypeScore=3.3626;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.079;VQSLOD=5.4073;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,43:85:99:1046,0,1043
2	228855866	.	G	C	741.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.892;DP=64;Dels=0.00;FS=3.540;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=5.8141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,26:64:99:771,0,1098
2	231036860	.	C	T	2343.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.608;DP=188;DS;Dels=0.00;FS=2.962;HRun=2;HaplotypeScore=4.9439;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.005;VQSLOD=5.4045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,89:188:99:2374,0,2843
2	231042276	.	A	G	2634.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.642;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.481;HRun=0;HaplotypeScore=11.0684;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.124;VQSLOD=3.4947;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,109:238:99:2664,0,3584
2	231050715	.	A	G	7295.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.07;MQ0=0;QD=29.18;VQSLOD=8.9606;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7294,593,0
2	231072709	.	C	T	470.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.94;MQ0=0;QD=29.39;VQSLOD=8.4713;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:39.12:503,39,0
2	231077110	.	C	T	1173.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=117;Dels=0.00;FS=1.476;HRun=2;HaplotypeScore=2.6766;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.848;VQSLOD=6.2047;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,49:117:99:1203,0,1822
2	231077676	.	G	A	1249.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1119;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.497;VQSLOD=6.4706;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,53:126:99:1279,0,2047
2	231077725	.	A	G	3502.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=118;Dels=0.00;FS=4.234;HRun=0;HaplotypeScore=7.2666;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=3.7168;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,115:118:99:3468,252,0
2	231149108	.	G	A	529.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=57;Dels=0.00;FS=3.715;HRun=4;HaplotypeScore=1.8663;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.617;VQSLOD=5.7099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,25:57:99:559,0,704
2	231333763	.	A	G	1537.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.740;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5257;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.907;VQSLOD=5.8123;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,62:130:99:1568,0,1648
2	231406680	.	T	C	2513.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.958;DP=86;Dels=0.00;FS=3.170;HRun=0;HaplotypeScore=7.6667;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.917;VQSLOD=3.4510;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,85:86:99:2546,185,0
2	231738168	.	G	A	687.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;DP=61;Dels=0.00;FS=3.940;HRun=0;HaplotypeScore=1.7781;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=2.811;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.361;VQSLOD=3.7116;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,25:61:99:718,0,901
2	232087474	.	A	G	1523.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9931;MQ=57.36;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=6.2520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1557,120,0
2	232087475	.	T	A	1507.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9973;MQ=57.36;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=6.6716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1541,120,0
2	232263127	.	G	A	2281.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;DP=181;DS;Dels=0.00;FS=8.426;HRun=0;HaplotypeScore=3.7854;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.731;VQSLOD=4.9513;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,90:181:99:2311,0,2499
2	232458443	.	T	C	6872.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=10.4552;MQ=59.09;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=2.3946;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:204:99:6871,536,0
2	233349588	.	G	A	5029.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3822;MQ=59.75;MQ0=0;QD=30.67;VQSLOD=7.9467;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:164:99:5028,427,0
2	233834975	.	A	G	2349.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;DP=171;Dels=0.00;FS=1.938;HRun=0;HaplotypeScore=1.8947;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.782;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.585;VQSLOD=5.4761;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,100:171:99:2380,0,1723
2	234229320	.	A	G	381.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;DP=36;Dels=0.00;FS=3.009;HRun=0;HaplotypeScore=1.8410;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.172;VQSLOD=6.2796;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:412,0,426
2	234255548	.	T	C	485.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.481;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.427;VQSLOD=7.0222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:516,0,247
2	234394487	.	G	A	168.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.879;DP=29;Dels=0.00;FS=3.890;HRun=1;HaplotypeScore=2.7431;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.122;VQSLOD=4.0844;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:199,0,477
2	234601669	.	T	G	520.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.026;DP=54;Dels=0.00;FS=1.103;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.732;VQSLOD=4.7020;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:54:99:550,0,905
2	234602191	.	A	G	3208.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.324;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.978;HRun=0;HaplotypeScore=4.8261;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.530;VQSLOD=5.4292;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,123:250:99:3239,0,3201
2	234602202	.	A	C	2968.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7536;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=5.8969;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,111:230:99:2998,0,3170
2	234750542	.	G	C	2342.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.897;DP=142;Dels=0.00;FS=6.407;HRun=0;HaplotypeScore=4.1532;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.604;VQSLOD=4.1624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,79:142:99:2372,0,1837
2	234750831	.	T	C	922.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.091;DP=103;Dels=0.00;FS=9.305;HRun=1;HaplotypeScore=5.9205;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.633;VQSLOD=4.0118;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,43:103:99:952,0,1834
2	234761225	.	C	T	877	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.216;DP=64;Dels=0.00;FS=0.952;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.033;VQSLOD=6.6666;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,37:64:99:907,0,618
2	235949877	.	T	C	2093.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=154;Dels=0.00;FS=1.403;HRun=0;HaplotypeScore=1.7870;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.602;VQSLOD=6.8407;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,74:154:99:2123,0,2098
2	235950002	.	G	A	2057.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.311;DP=196;Dels=0.00;FS=1.128;HRun=0;HaplotypeScore=4.4235;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.391;VQSLOD=5.4798;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,80:196:99:2088,0,3160
2	236957822	.	G	A	2580.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=193;DS;Dels=0.00;FS=2.587;HRun=1;HaplotypeScore=4.6533;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.338;VQSLOD=5.6921;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,93:193:99:2611,0,2755
2	237103697	.	G	T	384.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;DP=31;Dels=0.00;FS=2.222;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.245;VQSLOD=4.2811;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:415,0,497
2	238243292	.	G	A	1978.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98;VQSLOD=14.0871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2012,165,0
2	238243464	.	C	G	5991.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8237;MQ=59.76;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=9.3028;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,188:189:99:5969,463,0
2	238244963	.	A	G	5305.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5146;MQ=58.67;MQ0=0;QD=30.67;VQSLOD=7.0949;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:5304,463,0
2	238990388	.	G	A	1150.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.735;VQSLOD=6.6162;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1181,0,1183
2	239039183	.	G	A	234.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=19;Dels=0.00;FS=4.359;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.289;VQSLOD=5.4632;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:264,0,161
2	239040218	.	G	A	656.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.432;DP=57;Dels=0.00;FS=1.300;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.285;VQSLOD=5.7554;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:57:99:686,0,921
2	239155053	.	C	T	357.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.851;DP=34;Dels=0.00;FS=6.007;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.921;VQSLOD=5.2077;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:387,0,589
2	239237953	.	G	T	967.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.524;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.377;VQSLOD=6.0944;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,44:107:99:997,0,1681
2	241405528	.	A	G	520.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.427;DP=57;Dels=0.00;FS=1.082;HRun=1;HaplotypeScore=2.6766;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.400;VQSLOD=5.8693;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,23:57:99:550,0,1046
2	241468875	.	C	T	599.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.193;VQSLOD=6.5455;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,25:53:99:630,0,647
2	241536126	.	A	G	345.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4671;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.483;VQSLOD=5.9079;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,14:42:99:375,0,687
2	241569692	.	C	T	1798.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70;VQSLOD=9.2020;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1831,147,0
2	241621799	.	GC	G	449.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.807;DP=33;FS=7.949;HRun=1;HaplotypeScore=76.7649;MQ=20.60;MQ0=68;MQRankSum=-1.330;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.184;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,32:33:99:488,0,790
2	241808314	.	C	T	578.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.322;VQSLOD=11.1962;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,22:42:99:608,0,548
2	241817516	.	A	G	1165.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.457;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7785;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=6.2932;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,41:87:99:1196,0,1141
2	241828034	.	A	G	481.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.77;VQSLOD=7.8705;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:39.13:515,39,0
2	242149010	.	C	T	564.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.077;DP=37;Dels=0.00;FS=1.421;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.199;VQSLOD=5.7046;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:594,0,394
2	242157241	.	G	A	353.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;DP=38;Dels=0.00;FS=3.012;HRun=0;HaplotypeScore=3.5629;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.602;VQSLOD=4.9947;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:38:99:384,0,504
2	242203916	.	A	C	7759.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9150;MQ=59.27;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=8.8190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:7723,599,0
2	242371101	.	C	T	1609.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.697;DP=138;Dels=0.00;FS=6.463;HRun=0;HaplotypeScore=2.6538;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.701;VQSLOD=4.9446;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,66:138:99:1639,0,1955
2	242407588	.	G	A	4062.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.873;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=2.366;HRun=0;HaplotypeScore=4.0482;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.442;VQSLOD=5.5232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,125:230:99:3444,0,2947
2	242573211	.	T	C	5203.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5102;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.316;VQSLOD=8.3053;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,158:159:99:5165,383,0
2	242610773	.	T	A	291.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.337;VQSLOD=5.1036;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:30:99:322,0,571
2	242757820	.	G	A	654.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.23;VQSLOD=6.1990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:51.16:687,51,0
3	361508	.	C	T	363	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9857;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.349;VQSLOD=2.8751;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:393,0,116
3	391100	.	A	G	2757.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.09;MQ0=0;QD=32.06;VQSLOD=8.8602;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2790,217,0
3	436384	.	A	T	272.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=43;Dels=0.00;FS=5.159;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.626;VQSLOD=2.6294;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,13:43:99:303,0,761
3	439963	.	A	G	2092.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=58.19;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=8.4779;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2126,160,0
3	3170792	.	C	T	6155.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5416;MQ=59.04;MQ0=0;QD=34.39;VQSLOD=9.0264;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:6155,485,0
3	8955389	.	C	T	2060.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;QD=28.23;VQSLOD=8.1527;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2094,160,0
3	9426224	.	G	A	4008.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.626;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.752;HRun=1;HaplotypeScore=1.9970;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.491;VQSLOD=6.0001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3333,0,3368
3	9871030	.	T	G	6907.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5167;MQ=59.75;MQ0=0;QD=30.98;VQSLOD=7.9722;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:223:99:6907,536,0
3	9876919	.	G	A	1301.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=98;Dels=0.00;FS=4.144;HRun=0;HaplotypeScore=3.2422;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.114;VQSLOD=5.9809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,49:98:99:1332,0,1371
3	9934753	.	A	G	859.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;DP=78;Dels=0.00;FS=0.887;HRun=0;HaplotypeScore=1.8606;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.597;VQSLOD=6.0587;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,34:78:99:890,0,1272
3	9956279	.	G	A	5934.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8513;MQ=59.16;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=9.2206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,188:189:99:5908,457,0
3	9960070	.	C	T	697.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21;VQSLOD=13.8620;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:57.18:730,57,0
3	9970031	.	A	G	3146.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.46;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=8.4770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,102:103:99:3179,262,0
3	9976159	.	A	G	3457.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4588;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=7.3227;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:113:99:3457,268,0
3	9991388	.	G	C	4966.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.72;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=9.0339;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4966,391,0
3	10264480	.	C	G	5868.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6939;MQ=59.64;MQ0=0;QD=32.61;VQSLOD=8.1043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:180:99:5868,460,0
3	10276163	.	T	A	2336.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9243;MQ=58.77;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=7.6900;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2370,181,0
3	10302172	.	G	A	546.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=55;Dels=0.00;FS=2.357;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=9.93;ReadPosRankSum=-2.218;VQSLOD=5.4907;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,22:55:99:576,0,971
3	10353626	.	C	T	618.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.531;DP=63;Dels=0.00;FS=1.108;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.517;VQSLOD=6.4405;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,26:63:99:649,0,923
3	11643465	.	T	C	2703.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8308;MQ=59.09;MQ0=0;QD=35.58;VQSLOD=8.8496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2737,214,0
3	11871215	.	T	C	2526.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.475;DP=186;DS;Dels=0.00;FS=2.645;HRun=0;HaplotypeScore=2.5762;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.548;VQSLOD=5.8044;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,99:186:99:2557,0,2325
3	12046076	.	T	C	335.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.20;MQ0=0;QD=25.84;VQSLOD=6.5748;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:13:30.07:369,30,0
3	12232074	.	A	G	6040.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7486;MQ=59.76;MQ0=0;QD=34.52;VQSLOD=6.7441;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:6040,484,0
3	12393125	.	C	G	1054.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.817;DP=78;Dels=0.00;FS=0.897;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.033;VQSLOD=6.1454;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,46:78:99:1085,0,867
3	12856856	.	A	G	1187.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;DP=88;Dels=0.00;FS=0.904;HRun=1;HaplotypeScore=5.5269;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.023;VQSLOD=3.9631;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,46:88:99:1217,0,1226
3	12857493	.	C	T	1583.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.696;DP=115;Dels=0.00;FS=2.838;HRun=1;HaplotypeScore=2.5586;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.016;VQSLOD=6.4592;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,59:115:99:1613,0,1702
3	12858028	.	T	C	1508.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.690;DP=104;Dels=0.00;FS=5.260;HRun=1;HaplotypeScore=2.0508;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.433;VQSLOD=5.4473;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,54:104:99:1539,0,1378
3	12859004	.	A	C	833.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.933;DP=80;Dels=0.00;FS=9.714;HRun=2;HaplotypeScore=2.7318;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=3.7832;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,32:80:99:864,0,1307
3	12861608	.	G	A	1772.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.391;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3411;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.168;VQSLOD=5.3903;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,74:168:99:1803,0,2200
3	12875443	.	G	A	1308.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.006;DP=143;Dels=0.00;FS=2.236;HRun=0;HaplotypeScore=1.8824;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.720;VQSLOD=6.3136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,58:143:99:1338,0,2136
3	12962074	.	G	A	2142.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.113;DP=143;Dels=0.00;FS=1.485;HRun=0;HaplotypeScore=2.5650;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.151;VQSLOD=6.0270;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,74:143:99:2172,0,1931
3	13361287	.	C	T	706.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3604;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.138;VQSLOD=5.5221;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,29:48:99:737,0,478
3	13361391	.	A	G	1211.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;DP=98;Dels=0.00;FS=6.799;HRun=0;HaplotypeScore=4.0970;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.388;VQSLOD=3.5759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,44:98:99:1241,0,1271
3	13395579	.	C	A	96.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.717;VQSLOD=5.8700;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:126,0,146
3	13399786	.	G	A	1189.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.875;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6611;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.473;VQSLOD=4.4879;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,46:95:99:1220,0,1291
3	13407556	.	T	C	532.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=54;Dels=0.00;FS=3.989;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.238;VQSLOD=5.8831;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:562,0,734
3	13421150	.	C	T	1306.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.7851;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.604;VQSLOD=4.6953;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,45:83:99:1337,0,1077
3	13670536	.	A	G	610.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.199;DP=42;Dels=0.00;FS=1.222;HRun=3;HaplotypeScore=1.6640;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.061;VQSLOD=6.2997;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,23:42:99:641,0,479
3	14174427	.	A	T	1493.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.285;DP=129;Dels=0.00;FS=0.696;HRun=0;HaplotypeScore=1.9152;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.565;VQSLOD=6.0960;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,60:129:99:1524,0,1781
3	14175262	.	T	C	2951.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.281;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=9.177;HRun=0;HaplotypeScore=6.1910;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.371;VQSLOD=3.7224;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,122:241:99:2981,0,3049
3	14187449	.	G	T	684.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.320;DP=70;Dels=0.00;FS=0.960;HRun=1;HaplotypeScore=3.1005;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.055;VQSLOD=6.3382;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,28:70:99:715,0,1110
3	14551444	.	A	G	98.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.186;DP=11;Dels=0.00;FS=2.808;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.408;VQSLOD=4.0588;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:128,0,131
3	14555216	.	T	C	377.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8920;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.686;VQSLOD=5.4430;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:31:99:407,0,370
3	14561627	.	A	AG	362.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=21.5565;MQ=62.13;MQ0=0;QD=36.26;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30.09:405,30,0
3	14563258	.	A	G	314.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;DP=22;Dels=0.00;FS=1.740;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.099;VQSLOD=5.8473;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:345,0,272
3	14724345	.	G	A	2202.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.890;DP=185;Dels=0.00;FS=7.430;HRun=0;HaplotypeScore=5.4958;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.396;VQSLOD=4.0261;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,91:185:99:2233,0,2544
3	14724413	.	G	A	4965.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.28;VQSLOD=8.9368;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:164:99:4965,382,0
3	16254172	.	G	A	1515.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.494;DP=123;Dels=0.00;FS=3.363;HRun=0;HaplotypeScore=2.3046;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.741;VQSLOD=6.1424;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,60:123:99:1545,0,1798
3	16327855	.	T	G	4501.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6857;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=30.01;ReadPosRankSum=0.632;VQSLOD=7.7158;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,148:150:99:4501,343,0
3	17208267	.	T	C	1084.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=108;Dels=0.00;FS=1.576;HRun=0;HaplotypeScore=3.3746;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.151;VQSLOD=6.2862;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,48:108:99:1114,0,1609
3	19575232	.	C	T	2836.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;DP=207;Dels=0.00;FS=1.131;HRun=1;HaplotypeScore=5.9788;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.233;VQSLOD=4.4396;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,107:207:99:2866,0,2729
3	19924058	.	G	A	464.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.357;VQSLOD=5.3473;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:495,0,669
3	19930130	.	A	T	149.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.669;DP=18;Dels=0.00;FS=2.112;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.358;VQSLOD=5.2663;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:180,0,304
3	19959756	.	G	A	4349.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.447;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1806;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.637;VQSLOD=4.9506;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,140:250:99:3690,0,3072
3	19961330	.	C	T	1198.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.239;DP=110;Dels=0.00;FS=2.594;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.851;VQSLOD=6.0644;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,51:110:99:1228,0,1415
3	23848835	.	A	C	1653.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.846;DP=137;Dels=0.00;FS=1.400;HRun=0;HaplotypeScore=6.2803;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.858;VQSLOD=3.5286;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,68:137:99:1684,0,1694
3	24006477	.	T	A	4432.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8284;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.16;VQSLOD=7.5993;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4432,334,0
3	27472936	.	C	T	2454.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.566;HRun=2;HaplotypeScore=6.1219;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.578;VQSLOD=4.7727;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,90:206:99:2485,0,3311
3	28520417	.	T	A	948.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.593;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.516;VQSLOD=6.4027;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,40:80:99:978,0,1034
3	28533658	.	G	A	545.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=1.8824;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.438;VQSLOD=4.9300;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,24:54:99:575,0,721
3	31789582	.	T	C	644.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8930;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.717;VQSLOD=5.8304;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,23:38:99:674,0,350
3	33055721	.	A	G	2199.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.29;MQ0=0;QD=33.84;VQSLOD=9.4909;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2233,184,0
3	33138549	.	G	A	805.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.255;DP=56;Dels=0.00;FS=3.757;HRun=1;HaplotypeScore=3.8182;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.715;VQSLOD=4.5272;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:56:99:835,0,609
3	33156020	.	C	G	143.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.339;DP=14;Dels=0.00;FS=5.434;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.524;VQSLOD=3.6556;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:174,0,230
3	33194990	.	C	A	1197.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.777;DP=98;Dels=0.00;FS=1.660;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.226;VQSLOD=6.5340;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:98:99:1227,0,1450
3	33195309	.	A	G	763.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.117;DP=88;Dels=0.00;FS=5.831;HRun=0;HaplotypeScore=4.0057;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.447;VQSLOD=4.0184;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,35:88:99:794,0,1453
3	33255592	.	A	G	2051.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19;VQSLOD=14.5177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2084,163,0
3	33879770	.	G	A	4665.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3503;MQ=55.67;MQ0=0;QD=27.44;VQSLOD=3.5295;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:170:99:4664,364,0
3	37053568	.	A	G	1690.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;DP=127;Dels=0.00;FS=1.423;HRun=0;HaplotypeScore=2.4095;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.127;VQSLOD=5.9737;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,66:127:99:1721,0,1481
3	37366459	.	C	A	955.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.213;DP=70;Dels=0.00;FS=0.961;HRun=3;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.558;VQSLOD=5.6007;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:986,0,957
3	37368755	.	T	A	1354.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.038;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8782;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=6.1695;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,56:114:99:1384,0,1466
3	37574951	.	G	A	3683.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.25;MQ0=0;QD=32.31;VQSLOD=9.4861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3683,292,0
3	37670679	.	G	A	2009.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.847;DP=180;Dels=0.00;FS=0.559;HRun=0;HaplotypeScore=5.6070;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.813;VQSLOD=4.1754;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,80:180:99:2040,0,2622
3	38080952	.	T	G	1049.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.391;DP=109;Dels=0.00;FS=1.613;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.231;VQSLOD=6.7580;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,45:109:99:1080,0,1954
3	38170810	.	C	G	2437.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.520;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8119;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.158;VQSLOD=4.8570;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,95:188:99:2468,0,2408
3	38349146	.	ATTTG	A	4899.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.320;DP=245;FS=6.414;HRun=0;HaplotypeScore=1154.2887;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.726;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.408;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,100:245:99:4899,0,10228
3	38350519	.	G	A	6279.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4913;MQ=59.59;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=7.8259;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:190:99:6278,515,0
3	38350543	.	A	G	6074.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.6086;MQ=59.20;MQ0=0;QD=32.66;VQSLOD=7.2417;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:6073,496,0
3	38357961	.	C	G	1206.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=95;Dels=0.00;FS=2.754;HRun=2;HaplotypeScore=3.8636;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.450;VQSLOD=5.7691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,48:95:99:1237,0,1257
3	38404472	.	C	A	2192.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.227;DP=158;Dels=0.00;FS=0.618;HRun=1;HaplotypeScore=5.8077;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.760;VQSLOD=5.2626;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,86:158:99:2223,0,1955
3	38739574	.	T	C	6941.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.55;MQ0=0;QD=29.54;VQSLOD=9.0348;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,235:235:99:6940,563,0
3	38766675	.	A	G	2384.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.9117;MQ=59.42;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=8.7998;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:80:99:2417,187,0
3	38768300	.	T	C	1659.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=113;Dels=0.00;FS=3.478;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.089;VQSLOD=5.5919;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,62:113:99:1689,0,1402
3	39180263	.	G	A	1892.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=14.0627;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1926,150,0
3	39184959	.	C	T	2939.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9739;MQ=59.49;MQ0=0;QD=32.30;VQSLOD=9.4661;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2972,244,0
3	39226127	.	C	T	4130.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.024;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.466;HRun=0;HaplotypeScore=6.7347;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=2.652;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.622;VQSLOD=2.9914;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,121:250:99:3465,0,3438
3	39228043	.	T	G	1270.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=109;Dels=0.00;FS=3.651;HRun=3;HaplotypeScore=1.6609;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.422;VQSLOD=5.4665;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,47:109:99:1301,0,1592
3	39229900	.	T	C	5808.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6482;MQ=59.01;MQ0=0;QD=30.10;VQSLOD=8.5036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:193:99:5807,487,0
3	39323163	.	A	C	485.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.664;DP=24;Dels=0.00;FS=1.893;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.378;VQSLOD=4.3356;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:515,0,150
3	39373902	.	C	G	2044.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.750;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.002;VQSLOD=6.1548;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,77:171:99:2074,0,2367
3	40468896	.	C	T	2026.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=168;Dels=0.00;FS=5.599;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.812;VQSLOD=4.9470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,76:168:99:2057,0,2473
3	41756965	.	C	T	1370.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.799;DP=137;Dels=0.00;FS=3.157;HRun=0;HaplotypeScore=3.2355;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.047;VQSLOD=4.7084;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,55:137:99:1400,0,2273
3	41756986	.	A	T	1355.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;DP=130;Dels=0.00;FS=2.311;HRun=0;HaplotypeScore=6.2812;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.232;VQSLOD=4.4184;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,53:130:99:1385,0,1976
3	41831203	.	C	T	1744.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.151;DP=161;Dels=0.00;FS=2.028;HRun=0;HaplotypeScore=1.8533;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.528;VQSLOD=5.8102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,72:161:99:1774,0,2154
3	41841716	.	A	C	6748.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2973;MQ=57.74;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=6.1033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,219:221:99:6712,509,0
3	41877414	.	T	C	2134.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.645;DP=152;DS;Dels=0.00;FS=15.301;HRun=0;HaplotypeScore=3.6671;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.514;VQSLOD=3.0737;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,74:152:99:2164,0,2187
3	41925398	.	C	T	1374.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HRun=1;HaplotypeScore=1.6281;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.312;VQSLOD=5.1720;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,57:114:99:1405,0,1454
3	41952852	.	T	C	1463.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=106;Dels=0.00;FS=0.725;HRun=1;HaplotypeScore=3.6906;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.041;VQSLOD=5.4323;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,56:106:99:1494,0,1207
3	41960006	.	T	C	1727.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=136;Dels=0.00;FS=2.205;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.587;VQSLOD=5.2580;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,70:136:99:1757,0,1457
3	41996136	.	T	C	2931.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.999;DP=215;Dels=0.00;FS=0.502;HRun=0;HaplotypeScore=8.7157;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=13.64;ReadPosRankSum=-1.080;VQSLOD=4.4627;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,109:215:99:2962,0,2701
3	42679486	.	A	G	814.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.947;DP=88;Dels=0.00;FS=7.186;HRun=3;HaplotypeScore=1.9973;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.958;VQSLOD=2.8338;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,32:88:99:845,0,1588
3	42728144	.	A	G	1918.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.599;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.741;VQSLOD=5.8505;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,72:192:99:1948,0,3284
3	42733468	.	T	C	2377.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=28.99;VQSLOD=8.7203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2410,208,0
3	42735150	.	T	C	1825.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45;VQSLOD=13.2906;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1859,141,0
3	42772038	.	A	T	398.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6647;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.313;VQSLOD=6.5154;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,18:41:99:428,0,578
3	42907112	.	A	C	4220.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.7280;MQ=59.40;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=7.7867;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4220,322,0
3	42917047	.	A	G	4003.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8801;MQ=59.62;MQ0=0;QD=33.08;VQSLOD=9.2841;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:4003,316,0
3	44489880	.	T	C	1607.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=119;Dels=0.00;FS=2.379;HRun=0;HaplotypeScore=3.2400;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.508;VQSLOD=6.2154;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,58:119:99:1637,0,1681
3	44607013	.	T	C	2662.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=196;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4360;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=13.58;ReadPosRankSum=-2.299;VQSLOD=4.5624;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,100:196:99:2692,0,2387
3	44611896	.	A	G	466.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.942;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=48.17;MQ0=1;MQRankSum=-1.188;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.682;VQSLOD=3.5166;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:496,0,623
3	44612050	.	C	T	5423.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7769;MQ=58.58;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=8.5034;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5423,433,0
3	44692564	.	C	G	1061.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.533;DP=66;Dels=0.00;FS=2.161;HRun=0;HaplotypeScore=1.9940;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.185;VQSLOD=4.1844;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,41:66:99:1091,0,632
3	44775962	.	A	G	1281.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;DP=110;Dels=0.00;FS=6.170;HRun=0;HaplotypeScore=1.9150;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.786;VQSLOD=5.3341;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,56:110:99:1311,0,1343
3	44871505	.	A	T	1417.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;DP=199;Dels=0.00;FS=2.650;HRun=0;HaplotypeScore=5.5220;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.000;VQSLOD=3.6867;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,68:199:99:1448,0,3154
3	44884647	.	C	A	728.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=62;Dels=0.00;FS=3.461;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.514;VQSLOD=6.2403;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,30:62:99:759,0,858
3	44929287	.	G	C	2305.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.54;MQ0=0;QD=28.11;VQSLOD=7.9507;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2338,196,0
3	44943389	.	G	A	4374.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.60;MQ0=0;QD=31.47;VQSLOD=9.3745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4374,337,0
3	44948479	.	C	T	4000.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3639;MQ=59.41;MQ0=0;QD=34.19;VQSLOD=8.9720;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:117:99:3961,310,0
3	44948590	.	G	A	7939.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9516;MQ=59.48;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=7.6925;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7939,626,0
3	44974433	.	A	C	1431.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=141;Dels=0.00;FS=3.204;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.357;VQSLOD=5.8019;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,59:141:99:1461,0,1979
3	45017782	.	A	G	422.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.803;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=5.7598;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,18:27:99:452,0,179
3	45052775	.	G	C	2261.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8824;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76;VQSLOD=7.4340;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2295,172,0
3	45077123	.	G	A	1352.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;DP=100;Dels=0.00;FS=4.983;HRun=0;HaplotypeScore=2.6432;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.504;VQSLOD=5.2222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,53:100:99:1383,0,1352
3	45127515	.	T	C	5426.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=34.34;VQSLOD=9.6724;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:5426,424,0
3	45134822	.	T	C	1997.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.465;DP=160;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=0;HaplotypeScore=10.1267;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.654;VQSLOD=3.9209;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,80:160:99:2028,0,2196
3	45779136	.	A	T	999.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.775;DP=88;Dels=0.00;FS=0.843;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.529;VQSLOD=6.0267;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,40:88:99:1030,0,1171
3	46007823	.	G	T	1382.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.336;DP=105;Dels=0.00;FS=0.733;HRun=2;HaplotypeScore=1.8835;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=13.16;ReadPosRankSum=-2.477;VQSLOD=5.0547;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,53:105:99:1412,0,1397
3	46007825	.	T	C	1186.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.171;DP=103;Dels=0.00;FS=4.900;HRun=0;HaplotypeScore=2.8624;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.088;VQSLOD=4.7974;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,50:103:99:1217,0,1406
3	46009487	.	G	A	4493.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.824;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.600;HRun=0;HaplotypeScore=5.4608;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.712;VQSLOD=3.4447;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,129:250:99:3788,0,3116
3	46009864	.	C	G	1315.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=132;Dels=0.00;FS=13.530;HRun=2;HaplotypeScore=4.2030;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.324;VQSLOD=3.3394;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,51:132:99:1345,0,2404
3	46010077	.	C	T	3015.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4888;MQ=59.33;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=8.8012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3048,235,0
3	46399208	.	G	A	3004.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=228;Dels=0.00;FS=5.667;HRun=0;HaplotypeScore=8.9838;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.304;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.747;VQSLOD=3.6123;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,109:228:99:3034,0,2936
3	46450070	.	T	A	1700.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=141;Dels=0.00;FS=1.329;HRun=0;HaplotypeScore=4.7697;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.170;VQSLOD=4.8728;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,67:141:99:1731,0,1975
3	46501213	.	T	C	906.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.841;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5324;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.014;VQSLOD=4.9503;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,33:81:99:937,0,1351
3	46501268	.	C	T	657.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.524;DP=48;Dels=0.00;FS=2.700;HRun=0;HaplotypeScore=1.6483;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.016;VQSLOD=3.6365;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,26:48:99:687,0,579
3	46580591	.	G	T	1217.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.721;DP=132;Dels=0.00;FS=2.328;HRun=0;HaplotypeScore=1.9961;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.867;VQSLOD=5.0988;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,49:132:99:1248,0,2078
3	46620614	.	T	C	2182.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.742;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6208;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.363;VQSLOD=5.1490;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,87:210:99:2213,0,3033
3	46759010	.	T	G	976.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5624;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.314;VQSLOD=5.4305;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,41:92:99:1007,0,1470
3	46783959	.	T	C	2145.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;DP=180;Dels=0.00;FS=8.866;HRun=0;HaplotypeScore=5.1849;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.357;VQSLOD=4.3980;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,86:180:99:2176,0,2490
3	46784467	.	G	A	1068.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=69;Dels=0.00;FS=3.770;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.265;VQSLOD=5.4420;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,41:69:99:1098,0,814
3	47036756	.	C	G	245.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=22;Dels=0.00;FS=11.974;HRun=1;HaplotypeScore=1.7172;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.131;VQSLOD=3.8491;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:275,0,284
3	47125385	.	G	A	1913.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=159;Dels=0.00;FS=2.072;HRun=0;HaplotypeScore=4.6235;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.905;VQSLOD=5.4528;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,70:159:99:1943,0,2638
3	47282303	.	G	A	1297.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.908;DP=106;Dels=0.00;FS=4.087;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.328;VQSLOD=5.8265;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,51:106:99:1327,0,1379
3	47452118	.	G	A	762.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=65;Dels=0.00;FS=5.384;HRun=0;HaplotypeScore=4.3892;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=5.0112;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,34:65:99:792,0,701
3	47459679	.	C	T	110.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.689;VQSLOD=5.6829;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:140,0,180
3	47618953	.	C	A	938.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.001;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.509;VQSLOD=6.5938;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,37:78:99:969,0,1026
3	47956424	.	C	T	2037.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.327;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9092;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.806;VQSLOD=6.2697;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,79:185:99:2067,0,2701
3	47958037	.	G	T	2151.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.143;DP=189;Dels=0.00;FS=3.350;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.619;VQSLOD=5.9333;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,85:189:99:2182,0,2832
3	48309828	.	C	G	1768.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=127;Dels=0.00;FS=2.616;HRun=1;HaplotypeScore=5.3442;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.962;VQSLOD=4.7432;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,64:127:99:1799,0,1721
3	48360992	.	T	G	914.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.522;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.209;VQSLOD=5.9901;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,30:66:99:945,0,940
3	48419897	.	C	T	1221.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.790;DP=86;Dels=0.00;FS=10.547;HRun=1;HaplotypeScore=2.4703;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.285;VQSLOD=4.3274;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,45:86:99:1252,0,1023
3	48422235	.	T	A	1024.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9524;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.482;VQSLOD=6.3640;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,46:115:99:1055,0,1823
3	48628014	.	G	A	1197.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.911;DP=105;Dels=0.00;FS=1.586;HRun=0;HaplotypeScore=2.2100;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.198;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.515;VQSLOD=6.0914;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,45:105:99:1227,0,1617
3	48682480	.	C	A	796.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;DP=62;Dels=0.00;FS=4.985;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.092;VQSLOD=3.9208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:62:99:827,0,796
3	49054692	.	T	C	5797.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;QD=32.39;VQSLOD=9.8804;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5797,463,0
3	49138810	.	T	C	1308.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.601;DP=127;Dels=0.00;FS=1.437;HRun=0;HaplotypeScore=5.9115;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.012;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.895;VQSLOD=4.3548;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,54:127:99:1339,0,1828
3	49548008	.	C	G	5966.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.7764;MQ=59.36;MQ0=0;QD=34.69;VQSLOD=8.7367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5966,460,0
3	49701298	.	G	A	1044.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.907;VQSLOD=5.8800;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,39:75:99:1075,0,955
3	49721532	.	G	A	1459	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.554;DP=96;Dels=0.00;FS=3.028;HRun=0;HaplotypeScore=5.9154;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.749;VQSLOD=4.3852;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,51:96:99:1489,0,1141
3	49737954	.	G	A	2753.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.622;DP=179;Dels=0.00;FS=4.398;HRun=0;HaplotypeScore=2.5769;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.439;VQSLOD=5.2225;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,99:179:99:2783,0,1976
3	49760039	.	T	C	2442.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2905;MQ=58.70;MQ0=0;QD=29.08;VQSLOD=8.5131;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2476,199,0
3	49924940	.	T	C	1615.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;DP=111;Dels=0.00;FS=4.792;HRun=1;HaplotypeScore=1.9402;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.465;VQSLOD=4.9183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,60:111:99:1645,0,1518
3	49928691	.	T	C	3973.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4587;MQ=58.50;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=8.4839;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:3973,328,0
3	49936102	.	T	C	811.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=74;Dels=0.00;FS=10.895;HRun=0;HaplotypeScore=10.2005;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.014;VQSLOD=2.5504;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,34:74:99:841,0,1163
3	50222926	.	T	A	1475.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;QD=33.54;VQSLOD=9.0955;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1509,123,0
3	50332697	.	G	A	1712.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;DP=135;Dels=0.00;FS=12.664;HRun=0;HaplotypeScore=2.7227;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=12.68;ReadPosRankSum=-2.424;VQSLOD=2.7738;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,63:135:99:1742,0,1976
3	50357869	.	A	C	505.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.296;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9717;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.377;VQSLOD=5.4328;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,20:29:99:535,0,209
3	50597092	.	G	A	456.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.56;MQ0=0;QD=25.34;VQSLOD=7.4034;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:36.12:489,36,0
3	51895693	.	G	A	800.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.473;DP=77;Dels=0.00;FS=5.884;HRun=1;HaplotypeScore=2.9895;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.036;VQSLOD=5.0072;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:77:99:830,0,1038
3	51978220	.	A	G	8430.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7214;MQ=59.30;MQ0=0;QD=34.00;VQSLOD=8.6722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8430,674,0
3	51990315	.	A	G	421.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.33;VQSLOD=6.9640;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:39.09:454,39,0
3	52430698	.	A	G	5655.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.7355;MQ=58.72;MQ0=0;QD=29.76;VQSLOD=6.9094;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:5654,475,0
3	52510592	.	G	A	3015.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;QD=28.72;VQSLOD=8.6572;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3049,238,0
3	52544470	.	A	G	2562.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4476;MQ=59.45;MQ0=0;QD=32.44;VQSLOD=9.5351;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2596,217,0
3	52554304	.	G	C	6002.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.33;MQ0=0;QD=33.72;VQSLOD=9.1942;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:6002,475,0
3	52556890	.	A	G	2161.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=174;Dels=0.00;FS=0.591;HRun=0;HaplotypeScore=4.2905;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.018;VQSLOD=5.1535;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,84:174:99:2191,0,2472
3	52558008	.	T	C	917.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=5.6183;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,34:71:99:947,0,937
3	52721305	.	G	A	1024.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.377;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.712;VQSLOD=6.7196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:73:99:1054,0,968
3	52727257	.	G	A	1410.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.510;DP=120;Dels=0.00;FS=1.575;HRun=0;HaplotypeScore=2.3249;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.281;VQSLOD=6.3632;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,54:120:99:1440,0,1971
3	52797634	.	G	C	1438.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.560;DP=148;Dels=0.00;FS=1.969;HRun=0;HaplotypeScore=5.3711;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.402;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.030;VQSLOD=3.0357;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,56:148:99:1468,0,2589
3	52821210	.	C	T	1064.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.162;DP=117;Dels=0.00;FS=4.770;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.557;VQSLOD=3.9827;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,43:117:99:1094,0,1875
3	52852538	.	G	T	470.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.574;VQSLOD=12.4126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:501,0,208
3	52861211	.	A	T	2213.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.305;DP=171;Dels=0.00;FS=9.510;HRun=1;HaplotypeScore=5.7736;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.549;VQSLOD=3.7183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,82:171:99:2244,0,2116
3	52867715	.	G	C	460.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=8.0092;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.12:493,39,0
3	54925426	.	C	T	749.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.463;DP=77;Dels=0.00;FS=3.017;HRun=0;HaplotypeScore=2.8291;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.373;VQSLOD=5.1838;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,33:77:99:780,0,1062
3	56627598	.	A	G	3230.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.29;MQ0=0;QD=29.10;VQSLOD=8.1546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3264,265,0
3	56650012	.	G	C	3169.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.27;MQ0=0;QD=33.72;VQSLOD=7.8338;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3202,259,0
3	56658871	.	T	C	1988.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.82;VQSLOD=8.6781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2021,159,0
3	56667682	.	G	C	4675.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=32.24;ReadPosRankSum=1.230;VQSLOD=8.8031;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,144:145:99:4653,342,0
3	57138419	.	G	A	362.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88;VQSLOD=13.6621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:30.10:395,30,0
3	57303684	.	A	G	4697.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9283;MQ=57.59;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=7.7817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4697,370,0
3	57528503	.	A	G	1235.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.824;DP=122;Dels=0.00;FS=4.478;HRun=0;HaplotypeScore=2.9932;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.080;VQSLOD=4.8394;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,50:122:99:1265,0,2040
3	57542173	.	C	T	866.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9279;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.296;VQSLOD=5.4255;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,31:62:99:897,0,903
3	58109162	.	G	A	1894.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4909;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.689;VQSLOD=6.2726;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,73:154:99:1925,0,1996
3	58118555	.	G	A	1356.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.834;DP=115;Dels=0.00;FS=1.508;HRun=0;HaplotypeScore=3.4530;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.994;VQSLOD=6.3412;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1386,0,1477
3	58191244	.	G	A	3161.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.733;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.138;HRun=1;HaplotypeScore=5.7389;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.674;VQSLOD=3.5741;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,124:248:99:3192,0,3258
3	58552329	.	C	G	2849.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5717;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=30.32;ReadPosRankSum=1.285;VQSLOD=8.6564;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,93:94:99:2883,198,0
3	63968083	.	A	G	382.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.868;DP=22;Dels=0.00;FS=2.643;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.534;VQSLOD=5.7499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:412,0,268
3	63982082	.	G	A	2831.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.986;DP=227;Dels=0.00;FS=0.491;HRun=0;HaplotypeScore=4.5297;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.724;VQSLOD=5.7678;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,121:227:99:2862,0,2584
3	66419956	.	C	T	240.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.804;DP=25;Dels=0.00;FS=1.623;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.250;VQSLOD=6.2852;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:271,0,389
3	69082708	.	C	G	885.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=79;Dels=0.00;FS=0.858;HRun=0;HaplotypeScore=3.3471;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.246;VQSLOD=5.0624;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,35:79:99:916,0,1041
3	69230061	.	G	A	5502.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5313;MQ=59.22;MQ0=0;QD=30.23;VQSLOD=9.2352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5502,421,0
3	69245454	.	T	C	7091.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.27;MQ0=0;QD=33.77;VQSLOD=9.4653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,210:210:99:7091,548,0
3	72971366	.	G	A	3026.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.989;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.553;HRun=0;HaplotypeScore=2.9912;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.111;VQSLOD=4.9660;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,120:245:99:3057,0,3450
3	73433369	.	G	A	777.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;DP=76;Dels=0.00;FS=3.263;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.277;VQSLOD=6.0641;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,34:76:99:808,0,1073
3	81643167	.	T	C	327.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79;VQSLOD=13.2540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:27.09:361,27,0
3	88188420	.	G	A	644.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;QD=32.21;VQSLOD=9.1687;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:54.17:677,54,0
3	88189341	.	T	C	5192.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4914;MQ=58.68;MQ0=0;QD=28.69;VQSLOD=7.0976;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:5192,385,0
3	93768268	.	C	G	649.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5584;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.454;VQSLOD=4.5402;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,24:48:99:679,0,583
3	93779860	.	C	T	1777.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.439;DP=165;Dels=0.00;FS=4.605;HRun=0;HaplotypeScore=2.5922;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.688;VQSLOD=5.1647;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,73:165:99:1807,0,2360
3	97660106	.	A	C	817.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=71;Dels=0.00;FS=8.183;HRun=0;HaplotypeScore=4.3139;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.933;VQSLOD=4.7981;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,31:71:99:848,0,941
3	97664725	.	C	T	547.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;DP=41;Dels=0.00;FS=6.287;HRun=2;HaplotypeScore=1.5317;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.484;VQSLOD=3.4583;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,22:41:99:578,0,500
3	97806616	.	G	A	883.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6487;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.738;VQSLOD=5.7502;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,32:59:99:913,0,791
3	97806944	.	T	C	376.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.763;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=9.91;ReadPosRankSum=2.150;VQSLOD=4.4256;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:406,0,603
3	97983391	.	C	T	6754.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4718;MQ=51.83;MQ0=1;QD=30.70;VQSLOD=3.4247;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,220:220:99:6754,551,0
3	97983561	.	G	C	4318.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.4972;MQ=48.04;MQ0=1;QD=28.79;VQSLOD=2.9005;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:4318,352,0
3	97983711	.	T	C	1873.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.81;MQ0=0;QD=29.27;VQSLOD=7.3174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1906,156,0
3	97983942	.	A	G	1390.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=55.06;MQ0=0;QD=28.98;VQSLOD=6.7149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1424,117,0
3	97983981	.	G	A	1965.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.21;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=8.2320;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1999,162,0
3	98073591	.	TA	T	2960.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=301.9575;MQ=60.06;MQ0=0;QD=24.07;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:22,101:123:99:3003,298,0
3	98110406	.	G	GA	1398.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=86.3922;MQ=60.49;MQ0=0;QD=31.78;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,40:44:99:1440,120,0
3	100074068	.	C	T	775.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.260;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8284;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.290;VQSLOD=3.9856;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,35:84:99:806,0,1279
3	100354524	.	A	G	1538.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.463;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.458;VQSLOD=6.5551;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,57:107:99:1569,0,1291
3	101283792	.	C	G	4001.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.64;VQSLOD=7.9624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4000,331,0
3	102157365	.	A	T	1631.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;QD=31.99;VQSLOD=9.3427;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1664,132,0
3	102157417	.	A	G	1461.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=9.3064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1494,114,0
3	102181131	.	A	G	2149.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.88;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=8.6553;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2183,169,0
3	108072298	.	T	C	764.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58;VQSLOD=14.1104;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:60.20:798,60,0
3	108147728	.	T	C	1364.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=96;Dels=0.00;FS=2.010;HRun=1;HaplotypeScore=1.8824;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=6.3936;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,49:96:99:1395,0,1200
3	108188993	.	G	A	2105.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8304;MQ=58.97;MQ0=0;QD=30.08;VQSLOD=7.5822;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:69:99:2138,178,0
3	108189627	.	C	T	1264.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.304;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7719;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.390;VQSLOD=4.3729;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,47:76:99:1295,0,708
3	108475993	.	G	GGGGGATTA	1559.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.523;DP=54;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=323.0535;MQ=53.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.572;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.042;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,12:54:99:1599,0,2278
3	108639423	.	C	T	358.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.255;DP=35;Dels=0.00;FS=4.212;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.540;VQSLOD=4.4492;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:388,0,575
3	108690221	.	G	A	1242.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.217;DP=115;Dels=0.00;FS=4.780;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.134;VQSLOD=5.8524;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,52:115:99:1272,0,1681
3	108754238	.	A	T	3026.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7046;MQ=58.46;MQ0=0;QD=28.28;VQSLOD=7.5857;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3059,241,0
3	109052732	.	T	C	1751.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.597;DP=148;Dels=0.00;FS=1.291;HRun=0;HaplotypeScore=4.9943;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.056;VQSLOD=5.1798;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,68:148:99:1782,0,1913
3	111799845	.	A	T	2757.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=216;Dels=0.00;FS=1.657;HRun=0;HaplotypeScore=10.1124;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.514;VQSLOD=4.0942;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,105:216:99:2787,0,2936
3	111828423	.	G	A	1078.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.30;VQSLOD=6.9865;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:81.27:1111,81,0
3	111918215	.	C	T	398.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;DP=63;Dels=0.00;FS=1.051;HRun=0;HaplotypeScore=1.9968;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=6.32;ReadPosRankSum=2.315;VQSLOD=2.3364;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,17:63:99:428,0,1212
3	111921116	.	C	A	629.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;DP=60;Dels=0.00;FS=5.468;HRun=2;HaplotypeScore=3.9880;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.267;VQSLOD=4.9080;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,27:60:99:659,0,891
3	111921225	.	G	T	976.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=78;Dels=0.00;FS=1.868;HRun=3;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.089;VQSLOD=6.5936;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,39:78:99:1006,0,1125
3	111923123	.	G	A	341.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=47;Dels=0.00;FS=1.226;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.011;VQSLOD=5.6009;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,16:47:99:371,0,941
3	111962851	.	T	C	1144.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.383;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.946;VQSLOD=6.0162;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,50:106:99:1175,0,1306
3	111981878	.	T	C	1097.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.274;DP=107;Dels=0.00;FS=3.605;HRun=2;HaplotypeScore=1.9575;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.239;VQSLOD=5.3553;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,50:107:99:1127,0,1459
3	111981924	.	T	C	870.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.971;DP=80;Dels=0.00;FS=4.603;HRun=0;HaplotypeScore=1.9325;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.893;VQSLOD=4.8328;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,34:80:99:901,0,1153
3	111985107	.	T	C	1129.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.403;DP=101;Dels=0.00;FS=1.620;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.996;VQSLOD=6.0304;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,48:101:99:1159,0,1256
3	111996554	.	T	C	841.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.539;VQSLOD=6.0505;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,40:98:99:871,0,1411
3	112059768	.	C	G	3100.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.48;MQ0=0;QD=28.18;VQSLOD=7.5042;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3133,238,0
3	112185025	.	G	A	6163.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=33.68;VQSLOD=10.0609;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:6163,473,0
3	112190137	.	G	T	2694.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.77;MQ0=0;QD=32.86;VQSLOD=9.4886;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:82:99:2728,214,0
3	112546306	.	C	A	1399.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.624;DP=133;Dels=0.00;FS=5.547;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.553;VQSLOD=3.7696;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,51:133:99:1430,0,2150
3	112642568	.	C	G	676.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;DP=91;Dels=0.00;FS=0.850;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.038;VQSLOD=4.7204;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,31:91:99:706,0,1622
3	112647783	.	T	C	1096.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.972;DP=97;Dels=0.00;FS=3.964;HRun=2;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.236;VQSLOD=5.3113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,43:97:99:1126,0,1378
3	112647832	.	A	C	1382.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.578;DP=92;Dels=0.00;FS=0.808;HRun=0;HaplotypeScore=2.6274;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.117;VQSLOD=5.5041;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,50:92:99:1412,0,1004
3	112648127	.	T	G	1893.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.898;DP=152;Dels=0.00;FS=2.092;HRun=2;HaplotypeScore=1.9827;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.454;VQSLOD=4.3335;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,68:152:99:1923,0,2051
3	112727184	.	A	T	2096.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.379;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6203;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=30.39;ReadPosRankSum=0.769;VQSLOD=7.6100;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,67:69:99:2130,175,0
3	113115543	.	C	G	526.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.382;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.200;VQSLOD=5.7951;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,22:44:99:556,0,545
3	113373930	.	A	G	3505.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9874;MQ=59.24;MQ0=0;QD=31.02;VQSLOD=8.7758;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3505,280,0
3	113379865	.	G	C	417.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;DP=48;Dels=0.00;FS=11.114;HRun=1;HaplotypeScore=3.3052;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.043;VQSLOD=4.0850;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,17:48:99:448,0,910
3	113673125	.	A	G	1226.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=98;Dels=0.00;FS=3.044;HRun=1;HaplotypeScore=4.2844;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.010;VQSLOD=5.6581;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,47:98:99:1257,0,1448
3	113729786	.	CG	C	4317.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.892;DP=249;FS=2.252;HRun=2;HaplotypeScore=616.5618;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.923;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,131:249:99:4317,0,4123
3	113737568	.	G	A	3050.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.666;DP=222;Dels=0.00;FS=1.804;HRun=0;HaplotypeScore=3.7866;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.705;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.375;VQSLOD=4.2703;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,117:222:99:3081,0,2629
3	113890815	.	C	T	610.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15;VQSLOD=14.3724;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:54.16:644,54,0
3	113955164	.	T	G	1022.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.524;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9937;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.184;VQSLOD=6.0340;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,40:81:99:1053,0,999
3	113955320	.	C	T	1872.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;DP=177;Dels=0.00;FS=1.213;HRun=0;HaplotypeScore=14.5113;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.553;VQSLOD=2.5595;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,74:177:99:1902,0,2785
3	118649060	.	G	T	5397	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3365;MQ=58.94;MQ0=0;QD=29.98;VQSLOD=8.9665;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:180:99:5396,436,0
3	118866376	.	C	T	2935.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.71;MQ0=0;QD=32.62;VQSLOD=8.7978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2968,247,0
3	118909159	.	A	G	5134.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.10;MQ0=0;QD=28.37;VQSLOD=7.8883;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:5134,394,0
3	119133183	.	G	A	4378.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;QD=32.19;VQSLOD=9.7684;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4378,337,0
3	119150836	.	C	T	336.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;DP=24;Dels=0.00;FS=2.114;HRun=0;HaplotypeScore=2.5968;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=3.2190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:366,0,251
3	119256056	.	T	C	2296.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.961;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=5.020;HRun=0;HaplotypeScore=3.8322;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.086;VQSLOD=4.6193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,85:200:99:2327,0,3078
3	119379186	.	C	T	1386.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.544;DP=94;Dels=0.00;FS=0.807;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.898;VQSLOD=5.8991;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,53:94:99:1417,0,1085
3	119434527	.	G	C	5435.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;QD=34.19;VQSLOD=9.3407;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:5435,430,0
3	119886776	.	T	A	2957.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.807;DP=244;Dels=0.00;FS=2.178;HRun=0;HaplotypeScore=6.7398;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.061;VQSLOD=5.0481;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,116:244:99:2987,0,3634
3	120389316	.	T	A	5205.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=58.93;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=8.4185;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:5205,400,0
3	120500093	.	C	T	2313.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;DP=184;Dels=0.00;FS=3.466;HRun=1;HaplotypeScore=4.7708;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.526;VQSLOD=5.3565;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,91:184:99:2344,0,2467
3	120976051	.	C	G	1152.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.626;DP=118;Dels=0.00;FS=3.547;HRun=0;HaplotypeScore=3.4017;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.792;VQSLOD=4.8144;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,50:118:99:1183,0,1802
3	121154974	.	T	C	4659.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.04;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=9.2578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:4659,355,0
3	121208833	.	G	C	1224.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=33.11;VQSLOD=9.1240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1258,99,0
3	121263720	.	C	A	2251.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4417;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.62;VQSLOD=8.8329;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2284,178,0
3	121350966	.	C	G	4618.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5452;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=8.9131;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4618,367,0
3	121353254	.	T	C	4456.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8392;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.30;VQSLOD=9.6645;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4456,346,0
3	121414061	.	C	T	2038.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.984;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=2.895;HRun=0;HaplotypeScore=1.7206;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.531;VQSLOD=6.6572;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,81:190:99:2068,0,3177
3	121415610	.	G	A	1052.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=84;Dels=0.00;FS=3.233;HRun=0;HaplotypeScore=2.4088;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.929;VQSLOD=4.3986;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,40:84:99:1082,0,1313
3	121415720	.	T	C	4131.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.039;DP=240;Dels=0.00;FS=0.471;HRun=0;HaplotypeScore=4.1402;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.991;VQSLOD=5.1559;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,132:240:99:3559,0,2737
3	121416623	.	G	C	1384.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7463;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.545;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.167;VQSLOD=4.6402;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,57:114:99:1415,0,1555
3	121825197	.	G	A	2043.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.315;DP=172;Dels=0.00;FS=2.124;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.705;VQSLOD=5.9439;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,84:172:99:2074,0,2488
3	122003769	.	A	G	956	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;DP=87;Dels=0.00;FS=2.833;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.245;VQSLOD=5.5304;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,36:87:99:986,0,1535
3	122003832	.	G	C	2121.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6604;MQ=58.45;MQ0=0;QD=35.35;VQSLOD=8.4117;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2154,169,0
3	122186188	.	C	T	2294.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=28.33;VQSLOD=8.1509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2328,181,0
3	122259606	.	T	C	6878.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.9916;MQ=57.65;MQ0=0;QD=32.14;VQSLOD=4.1745;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,214:214:99:6878,533,0
3	122288210	.	G	A	5844.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.428;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2330;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=32.11;ReadPosRankSum=1.428;VQSLOD=7.1510;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,181:182:99:5811,453,0
3	122354792	.	G	A	1272.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;DP=130;Dels=0.00;FS=9.764;HRun=0;HaplotypeScore=1.7287;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.080;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.227;VQSLOD=3.1833;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,53:130:99:1303,0,2087
3	122630346	.	T	C	136.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.573;VQSLOD=6.2367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:59.82:167,0,60
3	123451773	.	G	C	3330.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=8.9098;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3331,259,0
3	123457893	.	G	A	2561.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.77;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=9.4502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2595,205,0
3	123665902	.	T	G	7259.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.8188;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=30.37;ReadPosRankSum=0.884;VQSLOD=7.2198;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,238:239:99:7220,518,0
3	124646594	.	A	G	4425.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=5.303;HRun=0;HaplotypeScore=8.6667;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.305;VQSLOD=2.2211;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,129:247:99:3762,0,2998
3	124728626	.	A	G	1162.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.68;VQSLOD=8.3546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:93.29:1196,93,0
3	124731485	.	C	G	1627.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91;VQSLOD=13.4917;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1661,132,0
3	124732618	.	A	G	2410.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=77;Dels=0.00;FS=3.493;HRun=0;HaplotypeScore=1.9924;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=31.31;ReadPosRankSum=1.372;VQSLOD=4.4596;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,76:77:99:2444,165,0
3	124746049	.	A	G	1164.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.62;MQ0=0;QD=28.39;VQSLOD=8.3362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:96.28:1197,96,0
3	124802888	.	C	T	382.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.790;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.949;VQSLOD=5.9464;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,17:40:99:413,0,549
3	124837684	.	T	C	1885	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.72;MQ0=0;QD=28.13;VQSLOD=8.7052;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1918,153,0
3	124839470	.	G	A	1520.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=9.7279;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1553,123,0
3	125648356	.	T	C	2930.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=55.25;MQ0=0;QD=32.56;VQSLOD=6.5407;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2964,229,0
3	125725268	.	TAACA	T	865.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=72;FS=3.905;HRun=0;HaplotypeScore=323.2479;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.461;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,21:72:99:905,0,3495
3	125786879	.	T	C	7351.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2601;MQ=58.91;MQ0=0;QD=29.41;VQSLOD=8.1770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7350,590,0
3	125826059	.	T	C	2670.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.733;DP=184;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3881;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.738;VQSLOD=5.5978;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,102:184:99:2701,0,2172
3	125877290	.	G	A	535.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.516;DP=41;Dels=0.00;FS=2.304;HRun=0;HaplotypeScore=3.4114;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.216;VQSLOD=4.1976;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:566,0,618
3	127337927	.	A	G	395.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;DP=30;Dels=0.00;FS=3.873;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.995;VQSLOD=3.9069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:426,0,459
3	127641968	.	C	A	964.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=62;Dels=0.00;FS=2.216;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.033;VQSLOD=6.2958;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,37:62:99:995,0,618
3	127642814	.	G	C	1092.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;DP=90;Dels=0.00;FS=0.795;HRun=0;HaplotypeScore=4.1434;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.703;VQSLOD=5.2273;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,37:90:99:1122,0,1426
3	128204951	.	C	T	433.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.952;DP=28;Dels=0.00;FS=2.049;HRun=1;HaplotypeScore=1.8245;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.973;VQSLOD=3.9535;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:463,0,306
3	129155670	.	C	T	1948.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.961;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7877;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.690;VQSLOD=5.9850;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,81:216:99:1978,0,3627
3	129281980	.	C	T	1422.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8301;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.151;VQSLOD=8.1945;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,45:46:99:1455,117,0
3	129284818	.	A	C	965.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=85;Dels=0.00;FS=1.803;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.084;VQSLOD=6.9170;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,38:85:99:995,0,1248
3	129293183	.	T	C	545.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.63;MQ0=0;QD=32.10;VQSLOD=8.5184;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:48.14:579,48,0
3	129293256	.	T	C	470.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;DP=30;Dels=0.00;FS=1.477;HRun=0;HaplotypeScore=2.7523;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.122;VQSLOD=5.8163;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:500,0,343
3	130162395	.	A	G	2177.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.17;MQ0=0;QD=29.83;VQSLOD=8.8845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2210,175,0
3	130174334	.	G	A	456.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.95;MQ0=0;QD=24.02;VQSLOD=8.0357;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:36.12:489,36,0
3	130284284	.	G	A	5830	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9374;MQ=59.87;MQ0=0;QD=32.21;VQSLOD=8.9637;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:181:99:5829,496,0
3	130947435	.	A	T	2000.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.812;DP=153;Dels=0.00;FS=2.164;HRun=0;HaplotypeScore=2.4304;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.647;VQSLOD=6.0812;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,78:153:99:2031,0,2029
3	130992385	.	T	C	2064.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9528;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.584;VQSLOD=6.5219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,80:159:99:2094,0,1887
3	131068497	.	C	T	1487.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.276;DP=118;Dels=0.00;FS=1.502;HRun=0;HaplotypeScore=8.8110;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.713;VQSLOD=4.3563;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,56:118:99:1517,0,1577
3	131068509	.	A	G	1620.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.314;DP=116;Dels=0.00;FS=1.484;HRun=0;HaplotypeScore=4.0608;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.806;VQSLOD=6.0836;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,57:116:99:1650,0,1686
3	131100956	.	C	G	974.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.737;DP=97;Dels=0.00;FS=2.800;HRun=0;HaplotypeScore=2.3609;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.518;VQSLOD=4.7853;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,43:97:99:1005,0,1411
3	132218621	.	G	A	2997.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;DP=208;DS;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=0;HaplotypeScore=8.1012;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.303;VQSLOD=3.5781;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,108:208:99:3027,0,2527
3	132218623	.	G	T	2550.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.202;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.1012;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.687;VQSLOD=4.2357;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,99:206:99:2580,0,3079
3	132360883	.	C	T	5081.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;QD=31.18;VQSLOD=9.7703;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5081,403,0
3	133356790	.	G	A	4102.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.637;DP=242;Dels=0.00;FS=9.177;HRun=1;HaplotypeScore=8.5190;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.461;VQSLOD=3.3629;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,122:242:99:3439,0,3046
3	133368362	.	T	G	2732.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.834;HRun=0;HaplotypeScore=4.6706;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.223;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.866;VQSLOD=4.9043;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,107:249:99:2762,0,3593
3	133475812	.	G	A	2272.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.017;DP=180;Dels=0.00;FS=4.443;HRun=0;HaplotypeScore=3.4485;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.185;VQSLOD=5.8102;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,84:180:99:2302,0,2520
3	133485133	.	A	G	8136.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0477;MQ=59.81;MQ0=0;QD=33.08;VQSLOD=9.2053;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:246:99:8136,626,0
3	133524717	.	G	C	1241.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.202;DP=102;Dels=0.00;FS=2.742;HRun=0;HaplotypeScore=3.4624;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.329;VQSLOD=4.3356;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,47:102:99:1271,0,1454
3	134077470	.	C	G	1748.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.32;VQSLOD=6.5558;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:64:99:1782,153,0
3	134278270	.	C	T	831.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.911;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.059;VQSLOD=6.1145;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,34:75:99:861,0,1040
3	135720851	.	G	T	322.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.021;DP=59;Dels=0.00;FS=4.534;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.169;VQSLOD=4.1898;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,16:59:99:353,0,1042
3	136574501	.	A	G	1658.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.279;DP=131;Dels=0.00;FS=2.301;HRun=1;HaplotypeScore=2.6953;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.565;VQSLOD=4.6082;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,61:131:99:1688,0,1908
3	137786442	.	T	C	1059.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5566;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.473;VQSLOD=4.3713;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,48:109:99:1089,0,1650
3	137787047	.	C	T	1434.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.804;VQSLOD=6.3891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,56:60:99:1467,129,0
3	137787192	.	T	C	2048.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.444;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=28.45;ReadPosRankSum=1.684;VQSLOD=6.4662;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,71:72:99:2082,151,0
3	137807259	.	G	A	674.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.519;DP=60;Dels=0.00;FS=2.652;HRun=0;HaplotypeScore=1.9150;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.030;VQSLOD=6.6399;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,28:60:99:705,0,797
3	137843476	.	G	T	1165.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.759;DP=117;Dels=0.00;FS=3.421;HRun=0;HaplotypeScore=4.0749;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.970;VQSLOD=4.5968;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,49:117:99:1196,0,1923
3	138023785	.	C	T	3017.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.472;HRun=0;HaplotypeScore=9.4978;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.694;VQSLOD=2.2166;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,110:250:99:3048,0,3668
3	138191232	.	G	A	1763.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.483;DP=188;Dels=0.00;FS=7.566;HRun=0;HaplotypeScore=5.8094;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.608;VQSLOD=4.4671;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,75:188:99:1794,0,3159
3	138289221	.	C	T	2814.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.75;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=8.8042;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2848,229,0
3	138668457	.	CGGCATTCGAA	C	1793.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.383;DP=106;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=867.4403;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-6.445;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.204;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,23:106:99:1833,0,10900
3	140178485	.	G	A	1171.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=92;Dels=0.00;FS=2.817;HRun=3;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.211;VQSLOD=6.5447;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,47:92:99:1201,0,1307
3	140401693	.	A	G	7454.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2268;MQ=59.47;MQ0=0;QD=34.19;VQSLOD=7.5010;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:218:99:7454,587,0
3	140406947	.	G	A	3308.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8936;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=9.4599;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3308,256,0
3	140409837	.	G	A	1393.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.968;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.019;VQSLOD=5.6392;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,52:95:99:1423,0,994
3	141535558	.	A	G	840.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.993;DP=69;Dels=0.00;FS=2.744;HRun=1;HaplotypeScore=2.8585;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.490;VQSLOD=6.1046;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,30:69:99:870,0,1062
3	141535608	.	C	A	1299.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.162;DP=128;Dels=0.00;FS=4.454;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.245;VQSLOD=5.4900;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,55:128:99:1330,0,2036
3	142178144	.	C	T	892.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.486;DP=55;Dels=0.00;FS=1.040;HRun=1;HaplotypeScore=1.8410;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.178;VQSLOD=6.1227;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,31:55:99:922,0,586
3	142281612	.	A	G	1420.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;QD=29.60;VQSLOD=8.2706;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1454,123,0
3	145917761	.	T	C	776.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.648;VQSLOD=6.8823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,36:72:99:807,0,882
3	145938619	.	T	C	610.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.946;DP=44;Dels=0.00;FS=6.617;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.880;VQSLOD=5.4216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,22:44:99:640,0,482
3	148562310	.	G	A	1128.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=79;Dels=0.00;FS=1.854;HRun=1;HaplotypeScore=1.4450;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=14.28;ReadPosRankSum=-1.406;VQSLOD=6.0418;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,44:79:99:1158,0,792
3	148597612	.	C	T	3365.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.49;MQ0=0;QD=29.52;VQSLOD=8.8098;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3365,259,0
3	149468530	.	T	G	2346.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.627;DP=235;Dels=0.00;FS=4.518;HRun=0;HaplotypeScore=5.9081;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.005;VQSLOD=4.8293;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,99:235:99:2377,0,3371
3	150280445	.	C	G	454.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7329;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.027;VQSLOD=5.4583;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:485,0,549
3	151046308	.	G	A	2545.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7784;MQ=58.69;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=8.9544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2578,202,0
3	151090424	.	G	A	1697.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.191;DP=144;Dels=0.00;FS=3.045;HRun=1;HaplotypeScore=2.9453;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.230;VQSLOD=5.4619;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,66:144:99:1728,0,1879
3	151171439	.	A	C	3462.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=59.58;MQ0=0;QD=31.47;VQSLOD=9.7622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3462,268,0
3	151463421	.	G	T	1879.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.40;VQSLOD=9.7358;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1912,153,0
3	151545601	.	G	A	1295.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;QD=28.78;VQSLOD=8.6428;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1328,102,0
3	153839866	.	G	C	618.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7645;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.77;VQSLOD=5.5528;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:24:54.14:651,54,0
3	153839960	.	T	C	271.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;QD=27.12;VQSLOD=6.9446;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:24.08:304,24,0
3	154018887	.	G	C	3087.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=29.98;VQSLOD=7.7920;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3121,232,0
3	155485302	.	C	T	508.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=13.5408;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:42.13:542,42,0
3	156413682	.	A	C	724.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.811;DP=60;Dels=0.00;FS=1.028;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.104;VQSLOD=3.2027;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,29:60:99:755,0,799
3	157155314	.	C	A	1187.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27;VQSLOD=12.7043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:96.30:1220,96,0
3	158366900	.	G	A	4034.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=59.58;MQ0=0;QD=28.02;VQSLOD=7.9431;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4034,307,0
3	158388780	.	T	C	2544.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=88;Dels=0.00;FS=3.612;HRun=0;HaplotypeScore=1.9874;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.630;VQSLOD=3.8723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,87:88:99:2578,180,0
3	158537443	.	A	G	1543.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=48.28;MQ0=0;QD=32.15;VQSLOD=7.7915;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1576,135,0
3	160131347	.	A	G	405.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.807;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.227;VQSLOD=4.6234;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,19:46:99:435,0,830
3	161221705	.	A	C	358.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.808;DP=41;Dels=0.00;FS=3.491;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.628;VQSLOD=6.0807;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:388,0,665
3	164714532	.	C	T	284.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=25.84;ReadPosRankSum=-0.158;VQSLOD=6.1057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:27.08:317,27,0
3	164783165	.	T	C	1739.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=9.0927;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1772,132,0
3	167000256	.	G	C	1622.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;DP=114;Dels=0.00;FS=1.647;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.170;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.498;VQSLOD=5.7069;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,62:114:99:1652,0,1404
3	167184878	.	T	C	1386.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.05;MQ0=0;QD=30.82;VQSLOD=8.3765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1420,111,0
3	167217964	.	A	G	3534.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.36;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=7.7272;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3533,292,0
3	167506937	.	C	G	1363.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.484;DP=107;Dels=0.00;FS=7.776;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.088;VQSLOD=4.2419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,52:107:99:1394,0,1436
3	169098992	.	G	A	874.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.804;DP=73;Dels=0.00;FS=0.939;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.370;VQSLOD=5.9320;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,38:73:99:904,0,1005
3	169099171	.	T	G	1033.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.529;VQSLOD=4.3479;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,45:85:99:1064,0,1047
3	170078232	.	C	T	3358.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8379;MQ=58.16;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=8.6394;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3358,277,0
3	171969077	.	C	G	1123.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.251;DP=127;Dels=0.00;FS=0.703;HRun=0;HaplotypeScore=6.9079;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=4.1788;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,49:127:99:1154,0,1954
3	172428782	.	T	C	2703.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.97;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=8.5577;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2736,229,0
3	172835392	.	A	T	2930.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.541;HRun=0;HaplotypeScore=4.8982;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.069;VQSLOD=3.2442;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,118:245:99:2960,0,3351
3	174814738	.	G	A	475.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.537;DP=44;Dels=0.00;FS=2.713;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=10.80;ReadPosRankSum=-2.733;VQSLOD=3.4995;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:505,0,662
3	174814920	.	A	G	1106.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.968;DP=89;Dels=0.00;FS=1.829;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.473;VQSLOD=6.5844;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,41:89:99:1136,0,1182
3	174951756	.	T	C	1233.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34;VQSLOD=13.5852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1266,99,0
3	175165079	.	C	T	768.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45;VQSLOD=14.2470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:66.19:801,66,0
3	175473047	.	T	C	2272.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9914;MQ=57.74;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=7.9066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2305,175,0
3	178968634	.	C	T	1133.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.586;DP=133;Dels=0.00;FS=0.699;HRun=0;HaplotypeScore=9.7140;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.087;VQSLOD=3.6716;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,52:133:99:1164,0,2067
3	179096508	.	C	G	2106.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=29.67;VQSLOD=8.6070;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2139,178,0
3	179306775	.	C	T	377.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=5.5415;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,18:63:99:408,0,1162
3	182755209	.	T	G	2254.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8658;MQ=58.14;MQ0=0;QD=32.67;VQSLOD=8.8494;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2287,178,0
3	182853670	.	T	C	7286.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8308;MQ=59.80;MQ0=0;QD=34.37;VQSLOD=9.7281;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:212:99:7286,569,0
3	182925404	.	T	C	1744.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.691;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.4639;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.284;VQSLOD=4.4891;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,64:118:99:1775,0,1311
3	183476685	.	G	A	2097.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9525;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.939;VQSLOD=5.8720;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,90:180:99:2128,0,2201
3	183755822	.	G	A	3001.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.91;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=8.8746;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3034,244,0
3	183756702	.	G	A	7383.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=51.59;MQ0=4;QD=29.65;VQSLOD=3.1275;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:7382,593,0
3	183861243	.	A	G	1751.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.709;VQSLOD=6.6509;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,72:129:99:1781,0,1444
3	183896641	.	T	C	1229.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.743;DP=89;Dels=0.00;FS=0.850;HRun=3;HaplotypeScore=2.2829;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=0.285;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.412;VQSLOD=6.8055;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,45:89:99:1260,0,1169
3	183908982	.	C	T	4095.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.011;HRun=0;HaplotypeScore=3.8287;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.451;VQSLOD=5.2653;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3426,0,3602
3	183975365	.	C	T	3857.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.367;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9665;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.300;VQSLOD=8.2855;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,117:119:99:3857,322,0
3	183976103	.	C	T	3222.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.480;HRun=0;HaplotypeScore=5.6030;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.283;VQSLOD=5.1254;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,115:242:99:3253,0,3313
3	183994447	.	C	T	51.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.185;VQSLOD=3.7223;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:81.66:82,0,248
3	184020542	.	G	T	2594.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.008;DP=215;Dels=0.00;FS=7.754;HRun=1;HaplotypeScore=8.5180;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.634;VQSLOD=3.8895;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,100:215:99:2624,0,3174
3	184037533	.	A	G	622.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05;VQSLOD=13.1287;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:54.15:655,54,0
3	184039666	.	A	G	4166.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.628;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=7.377;HRun=0;HaplotypeScore=11.3134;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.730;VQSLOD=2.3448;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,126:243:99:3512,0,2959
3	184071063	.	G	C	6811.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2974;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=6.9639;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,216:216:99:6811,527,0
3	184428903	.	T	G	1124.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=98;Dels=0.00;FS=2.032;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.797;VQSLOD=5.4240;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,40:98:99:1155,0,1731
3	184429414	.	C	A	2051.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4499;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.265;VQSLOD=5.6037;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,79:154:99:2081,0,2052
3	184766301	.	T	C	1527.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.866;DP=114;Dels=0.00;FS=1.520;HRun=2;HaplotypeScore=3.5726;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.698;VQSLOD=6.1264;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,57:114:99:1558,0,1269
3	184801094	.	G	A	1519.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=95;Dels=0.00;FS=2.743;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.127;VQSLOD=5.9802;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,55:95:99:1550,0,1057
3	185990096	.	C	T	4620.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6949;MQ=58.79;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=9.3834;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4620,355,0
3	186006618	.	G	C	2526.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.851;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=0.496;HRun=0;HaplotypeScore=13.2332;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.446;VQSLOD=2.2118;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,106:236:99:2556,0,3307
3	186337713	.	T	C	1077.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.619;DP=94;Dels=0.00;FS=3.917;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=6.4082;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,45:94:99:1108,0,1181
3	186370350	.	A	G	1637.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.459;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.331;VQSLOD=6.0859;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,59:90:99:1668,0,804
3	186390627	.	C	T	746.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.005;DP=80;Dels=0.00;FS=0.900;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.658;VQSLOD=6.0792;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,34:80:99:776,0,1257
3	186395572	.	A	T	1532.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;DP=142;Dels=0.00;FS=0.634;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.357;VQSLOD=5.5512;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,63:142:99:1563,0,2060
3	186443018	.	T	C	1442.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=119;Dels=0.00;FS=1.471;HRun=0;HaplotypeScore=2.9539;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.816;VQSLOD=6.5117;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,58:119:99:1472,0,1436
3	186459927	.	T	C	2793.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.654;DP=222;Dels=0.00;FS=2.311;HRun=0;HaplotypeScore=6.5324;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.721;VQSLOD=5.0434;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,104:222:99:2824,0,2955
3	186917751	.	C	G	4300.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6336;MQ=58.98;MQ0=0;QD=29.87;VQSLOD=8.4874;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4300,361,0
3	187088812	.	C	T	685.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=66;Dels=0.00;FS=3.466;HRun=0;HaplotypeScore=3.8772;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.185;VQSLOD=4.9581;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,26:66:99:716,0,1057
3	187088926	.	G	A	980.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.350;DP=97;Dels=0.00;FS=8.600;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.148;VQSLOD=4.4089;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,40:97:99:1010,0,1701
3	187089031	.	C	A	1531.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.435;DP=133;Dels=0.00;FS=2.236;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.232;VQSLOD=6.3956;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,62:133:99:1562,0,1955
3	187446211	.	C	T	111.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.132;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.307;VQSLOD=5.7917;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:142,0,355
3	191179193	.	A	G	7359.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4189;MQ=59.30;MQ0=0;QD=29.44;VQSLOD=8.3426;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7358,593,0
3	192994543	.	A	G	556.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=56;Dels=0.00;FS=1.075;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.110;VQSLOD=6.4692;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,25:56:99:587,0,750
3	193031926	.	C	T	1891.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;DP=179;Dels=0.00;FS=1.911;HRun=1;HaplotypeScore=6.4862;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.765;VQSLOD=4.3241;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,75:179:99:1921,0,2973
3	193080414	.	C	G	6719.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4775;MQ=59.42;MQ0=0;QD=30.00;VQSLOD=8.0066;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,224:224:99:6718,503,0
3	193171979	.	T	A	1037.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;DP=96;Dels=0.00;FS=1.712;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.734;VQSLOD=5.5130;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,45:96:99:1067,0,1293
3	193334991	.	G	A	420.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.704;VQSLOD=4.7555;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,18:59:99:451,0,1018
3	194061826	.	C	T	539.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=42;Dels=0.00;FS=2.928;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.013;VQSLOD=5.9221;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,22:42:99:570,0,490
3	194061906	.	T	C	1918.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08;VQSLOD=8.7757;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1952,153,0
3	194061907	.	G	A	672.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.614;DP=58;Dels=0.00;FS=3.858;HRun=1;HaplotypeScore=1.9957;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.493;VQSLOD=4.4995;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:58:99:703,0,855
3	194062519	.	C	T	1189.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0962;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=13.36;ReadPosRankSum=2.072;VQSLOD=5.5418;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,45:89:99:1219,0,1106
3	194080916	.	G	A	1731.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.200;DP=89;Dels=0.00;FS=4.347;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=19.45;ReadPosRankSum=2.877;VQSLOD=3.2222;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,59:89:99:1761,0,730
3	194080983	.	C	T	1215.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;DP=95;Dels=0.00;FS=3.883;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.529;VQSLOD=4.9900;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,46:95:99:1246,0,1308
3	194373832	.	T	C	1884.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.774;DP=166;Dels=0.00;FS=1.225;HRun=0;HaplotypeScore=4.9745;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.015;VQSLOD=5.2903;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,74:166:99:1915,0,2372
3	195477786	.	C	T	4926.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=54.96;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=6.1519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4926,382,0
3	195497174	.	C	G	1934.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=33.35;ReadPosRankSum=0.299;VQSLOD=8.9361;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:1967,153,0
3	195501149	.	C	T	2206.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=9.1889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2240,184,0
3	195505664	.	G	A	547.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.03;MQ0=0;QD=24.91;VQSLOD=8.1860;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:48.13:581,48,0
3	195515594	.	C	G	1690.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.17;MQ0=0;QD=33.15;VQSLOD=8.3345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1724,138,0
3	195515617	.	G	C	1721.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.69;MQ0=0;QD=30.21;VQSLOD=7.9596;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1755,138,0
3	195516878	.	T	C	2612.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=6.8104;MQ=58.49;MQ0=0;QD=35.31;VQSLOD=6.0667;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2646,211,0
3	195517258	.	G	A	5493.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=58.95;MQ0=0;QD=32.70;VQSLOD=9.8613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:5493,457,0
3	195517321	.	G	A	7714.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.2003;MQ=58.93;MQ0=0;QD=30.86;VQSLOD=4.8937;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7714,617,0
3	195517553	.	A	C	4114.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.92;MQ0=0;QD=35.17;VQSLOD=10.0838;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:4114,325,0
3	195518330	.	C	G	6484.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5119;MQ=58.42;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=8.4948;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,214:214:99:6483,512,0
3	196050834	.	C	T	676.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.928;DP=58;Dels=0.00;FS=1.238;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=5.6838;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,27:58:99:706,0,719
3	196054439	.	T	G	3291.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5049;MQ=58.47;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=8.5284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:99:99:3291,262,0
3	196199204	.	G	T	6844.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7219;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=8.8747;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:6844,527,0
3	196435534	.	T	C	688.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.000;DP=46;Dels=0.00;FS=1.232;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.170;VQSLOD=6.3976;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,28:46:99:718,0,498
3	196674749	.	C	T	2844.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.76;MQ0=0;QD=35.12;VQSLOD=9.2045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:81:99:2877,226,0
3	196674972	.	C	T	2897.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;QD=32.55;VQSLOD=8.7565;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2930,250,0
3	196807928	.	A	C	741.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.707;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.163;VQSLOD=5.7736;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,31:55:99:771,0,554
3	197495334	.	G	A	4157.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;QD=29.70;VQSLOD=9.2791;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4157,322,0
3	197579466	.	C	T	2397.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=0.508;HRun=0;HaplotypeScore=10.5444;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.715;VQSLOD=3.7875;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,98:219:99:2427,0,3051
3	197701913	.	G	T	1125.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=126;Dels=0.00;FS=0.680;HRun=2;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.502;VQSLOD=5.6550;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,51:126:99:1156,0,1855
4	85995	.	C	CA	1168.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=313.2998;MQ=41.25;MQ0=0;QD=36.50;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,29:30:84.28:1210,84,0
4	86016	.	G	GC	627.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=315.8932;MQ=31.16;MQ0=0;QD=36.92;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,15:16:45.15:670,45,0
4	86031	.	CA	C	384.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=422.8753;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.60;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,12:17:36.10:426,36,0
4	86034	.	TC	T	384.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=321.9773;MQ=29.00;MQ0=0;QD=32.02;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.10:426,36,0
4	86101	.	G	GC	3567.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=331.2051;MQ=54.13;MQ0=0;QD=41.98;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,82:85:99:3568,244,0
4	86738	.	A	G	1854.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.657;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.4261;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.538;VQSLOD=6.2409;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:1888,117,0
4	87277	.	G	C	3530.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.92;MQ0=0;QD=30.97;VQSLOD=8.9012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:114:99:3530,268,0
4	87313	.	G	GA	3168.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=329.8838;MQ=59.93;MQ0=0;QD=41.69;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,74:76:99:3211,220,0
4	648643	.	G	A	5563.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.7616;MQ=58.67;MQ0=0;QD=29.91;VQSLOD=5.8622;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5563,436,0
4	663908	.	A	G	2885.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.388;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=0.677;HRun=0;HaplotypeScore=4.0768;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.616;VQSLOD=4.7613;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,107:216:99:2916,0,2988
4	843508	.	C	T	584.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;DP=48;Dels=0.00;FS=2.488;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.206;VQSLOD=6.6816;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,25:48:99:614,0,544
4	1164277	.	C	G	3666.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6205;MQ=59.50;MQ0=0;QD=35.94;VQSLOD=8.0316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3666,295,0
4	1165130	.	G	T	722.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.29;MQ0=0;QD=27.81;VQSLOD=8.4841;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:63.18:756,63,0
4	1165741	.	A	G	1998.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.97;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=9.0521;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2032,162,0
4	1330759	.	T	C	4595.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4082;MQ=58.59;MQ0=0;QD=28.19;VQSLOD=7.4932;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:163:99:4594,370,0
4	1374774	.	C	T	1624.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=34.57;VQSLOD=9.1248;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1658,135,0
4	1388375	.	T	TCA	979.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.100;DP=228;DS;FS=31.531;HRun=0;HaplotypeScore=2131.2808;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.056;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,29:228:99:1018,0,7096
4	1388503	.	ACG	A	775.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.924;DP=235;DS;FS=30.303;HRun=0;HaplotypeScore=1133.5510;MQ=51.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.799;QD=3.10;ReadPosRankSum=4.205;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,39:235:99:814,0,10213
4	1388622	.	T	TCA	4816.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=134;DS;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1157.3005;MQ=33.29;MQ0=14;MQRankSum=1.482;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.118;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:95,84:134:99:4817,218,0
4	1729556	.	G	A	2768.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.113;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.8888;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=14.57;ReadPosRankSum=-1.129;VQSLOD=3.2880;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,95:190:99:2799,0,2733
4	1843324	.	C	T	1550.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9479;MQ=58.06;MQ0=1;MQRankSum=1.126;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.245;VQSLOD=4.7486;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,62:132:99:1580,0,1819
4	2200366	.	G	A	2060.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=145;Dels=0.00;FS=0.676;HRun=0;HaplotypeScore=5.1357;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.076;VQSLOD=3.6954;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,78:145:99:2091,0,1668
4	2306053	.	A	G	2636.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.47;MQ0=0;QD=33.37;VQSLOD=9.8919;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2669,211,0
4	2306259	.	C	T	674.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;DP=50;Dels=0.00;FS=10.991;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.379;VQSLOD=4.0675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:704,0,754
4	2744087	.	G	A	1472.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44;VQSLOD=8.2222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1505,126,0
4	2906707	.	G	T	1400.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=89;Dels=0.00;FS=7.137;HRun=0;HaplotypeScore=2.7834;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=4.0899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,51:89:99:1430,0,1103
4	2916762	.	C	G	561.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.108;VQSLOD=6.6652;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,21:41:99:591,0,566
4	2951804	.	A	G	3124.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.739;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=2.854;HRun=0;HaplotypeScore=8.3016;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.381;VQSLOD=4.7759;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,122:246:99:3154,0,3662
4	2990499	.	G	T	1298.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.363;DP=105;Dels=0.00;FS=1.606;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.516;VQSLOD=5.9974;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,51:105:99:1329,0,1323
4	3006043	.	C	T	1678.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.115;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9920;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.539;VQSLOD=6.0921;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,65:140:99:1708,0,2062
4	3015553	.	G	A	1420.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.354;DP=112;Dels=0.00;FS=7.348;HRun=0;HaplotypeScore=3.9919;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.923;VQSLOD=4.5937;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1450,0,1322
4	3215835	.	T	C	1976.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=34.08;VQSLOD=10.2222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2010,159,0
4	3234980	.	G	A	8224.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4988;MQ=59.83;MQ0=0;QD=32.90;VQSLOD=7.4036;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8224,662,0
4	3495095	.	G	A	255.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=17;Dels=0.00;FS=2.062;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.025;VQSLOD=5.6696;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:285,0,178
4	4199634	.	A	T	6729.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4779;MQ=59.37;MQ0=0;QD=32.67;VQSLOD=8.5776;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,206:206:99:6729,524,0
4	4276132	.	T	C	8132.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4912;MQ=59.29;MQ0=0;QD=32.66;VQSLOD=5.6493;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8131,692,0
4	4304522	.	A	C	3020.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.58;MQ0=0;QD=33.94;VQSLOD=9.5777;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:3054,238,0
4	5624670	.	T	C	1941.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=155;Dels=0.00;FS=2.354;HRun=0;HaplotypeScore=4.7722;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.541;VQSLOD=5.6903;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,74:155:99:1971,0,2135
4	5743512	.	T	C	1938.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.65;MQ0=0;QD=29.37;VQSLOD=9.0199;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:1971,147,0
4	5755542	.	C	A	6436.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4710;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=31.70;ReadPosRankSum=1.071;VQSLOD=8.0073;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,201:203:99:6391,452,0
4	5785442	.	G	A	968.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.232;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7059;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.125;VQSLOD=6.1606;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,31:68:99:999,0,1095
4	6302519	.	G	A	8010.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6485;MQ=59.33;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=9.2653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8010,635,0
4	6303354	.	G	A	8565.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2792;MQ=59.39;MQ0=0;QD=34.26;VQSLOD=8.0316;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8564,698,0
4	6596360	.	G	A	2944.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9140;MQ=58.78;MQ0=0;QD=31.00;VQSLOD=8.7869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2978,244,0
4	7716932	.	T	C	5693.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6399;MQ=58.66;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=8.2425;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:183:99:5693,436,0
4	7780582	.	C	T	871.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.768;DP=91;Dels=0.00;FS=0.978;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.993;VQSLOD=4.5139;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,36:91:99:901,0,1355
4	8228731	.	T	C	1508.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.16;MQ0=0;QD=30.16;VQSLOD=9.3707;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1541,120,0
4	8229774	.	C	T	1857.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=8.3841;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1890,162,0
4	8583046	.	C	T	306.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.251;DP=17;Dels=0.00;FS=2.187;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=4.2540;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:337,0,120
4	8583312	.	A	C	261.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.355;DP=18;Dels=0.00;FS=2.392;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.088;VQSLOD=6.0646;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:292,0,242
4	8589023	.	G	A	1361.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;DP=134;Dels=0.00;FS=0.691;HRun=0;HaplotypeScore=2.2772;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.258;VQSLOD=6.1073;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,62:134:99:1391,0,1764
4	8603117	.	A	T	428.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;DP=21;Dels=0.00;FS=2.602;HRun=0;HaplotypeScore=1.9783;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.187;VQSLOD=4.3171;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:458,0,131
4	8616179	.	T	C	2986.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=9.1295;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:3019,235,0
4	9909923	.	G	A	2083.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.266;DP=190;Dels=0.00;FS=6.950;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.654;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.357;VQSLOD=4.2347;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,79:190:99:2114,0,2898
4	9922167	.	C	T	2056.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.841;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7939;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.580;VQSLOD=5.9934;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,80:159:99:2086,0,1865
4	10022981	.	C	T	2346.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.949;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4640;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=16.07;ReadPosRankSum=-1.423;VQSLOD=4.3444;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,84:146:99:2377,0,1539
4	10446385	.	C	T	3382.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.38;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=9.0209;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3382,265,0
4	10447640	.	A	G	1288.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.089;DP=111;Dels=0.00;FS=4.775;HRun=2;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.570;VQSLOD=5.6894;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,49:111:99:1318,0,1795
4	13604182	.	T	C	1331.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=94;Dels=0.00;FS=4.126;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.513;VQSLOD=5.7491;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,52:94:99:1362,0,978
4	13604418	.	G	C	2343.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.378;VQSLOD=5.9637;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,86:149:99:2374,0,1663
4	13606576	.	A	T	3596.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.8245;MQ=59.39;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=9.1624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:114:99:3596,286,0
4	13615174	.	G	A	1767.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.302;DP=162;Dels=0.00;FS=4.711;HRun=0;HaplotypeScore=3.8776;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.329;VQSLOD=5.2502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,73:162:99:1797,0,2201
4	15964485	.	G	A	1409.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.548;DP=105;Dels=0.00;FS=2.536;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.682;VQSLOD=6.3008;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,57:105:99:1440,0,1358
4	15964670	.	C	T	1456.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.266;VQSLOD=5.4185;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,57:125:99:1487,0,1860
4	17829990	.	G	C	1436.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;DP=135;Dels=0.00;FS=0.683;HRun=0;HaplotypeScore=3.7672;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.845;VQSLOD=5.8820;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,57:135:99:1466,0,1996
4	22820504	.	A	T	555.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.689;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.104;VQSLOD=6.7446;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,24:51:99:585,0,703
4	23814707	.	G	A	2968.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.859;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=5.279;HRun=0;HaplotypeScore=6.5077;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.044;VQSLOD=4.9219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,112:240:99:2998,0,3169
4	23815662	.	C	T	2824.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.273;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3582;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.036;VQSLOD=5.7597;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,99:176:99:2855,0,1971
4	24801315	.	G	A	64.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.061;VQSLOD=9.3156;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:94.19:94,0,281
4	25125703	.	C	G	1091.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=92;Dels=0.00;FS=3.993;HRun=0;HaplotypeScore=2.5564;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.601;VQSLOD=5.6538;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,44:92:99:1121,0,1191
4	25363901	.	T	A	3083.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9323;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.81;VQSLOD=7.1622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3116,238,0
4	36081878	.	C	T	2526.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.35;MQ0=0;QD=28.70;VQSLOD=8.3728;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2559,193,0
4	37903756	.	T	C	7096.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5785;MQ=59.40;MQ0=0;QD=31.82;VQSLOD=8.5096;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:223:99:7095,551,0
4	37962186	.	G	C	1495.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.045;DP=96;Dels=0.00;FS=2.729;HRun=1;HaplotypeScore=2.8413;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.175;VQSLOD=5.3987;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,51:96:99:1526,0,1170
4	38016395	.	T	G	102.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.095;VQSLOD=5.0418;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:133,0,569
4	38830350	.	A	G	537.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=36;Dels=0.00;FS=1.258;HRun=1;HaplotypeScore=2.9874;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.016;VQSLOD=4.6433;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:568,0,429
4	38879949	.	G	A	1828.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.076;DP=154;Dels=0.00;FS=2.996;HRun=0;HaplotypeScore=6.1896;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.754;VQSLOD=4.6071;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,71:154:99:1858,0,2243
4	38880046	.	T	C	1563.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=123;Dels=0.00;FS=1.625;HRun=1;HaplotypeScore=4.4037;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.673;VQSLOD=6.0019;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,68:123:99:1594,0,1435
4	38933859	.	G	A	996.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.011;DP=75;Dels=0.00;FS=1.972;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.492;VQSLOD=5.8625;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,40:75:99:1027,0,852
4	38987965	.	C	T	715.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;DP=56;Dels=0.00;FS=2.258;HRun=0;HaplotypeScore=3.5213;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.025;VQSLOD=5.5760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,32:56:99:745,0,680
4	39000305	.	A	G	335.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.664;DP=43;Dels=0.00;FS=5.089;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.112;VQSLOD=4.8829;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,17:43:99:365,0,702
4	39064162	.	A	C	2107.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.388;DP=156;Dels=0.00;FS=6.659;HRun=0;HaplotypeScore=2.9895;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.656;VQSLOD=5.1426;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,79:156:99:2138,0,1871
4	39450229	.	C	A	1368.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=112;Dels=0.00;FS=4.793;HRun=1;HaplotypeScore=1.7845;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.083;VQSLOD=5.9568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1398,0,1611
4	40121562	.	G	A	2782.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=29.29;VQSLOD=8.9888;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2815,214,0
4	40356422	.	A	G	4107.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.50;MQ0=0;QD=34.52;VQSLOD=9.7231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:4107,322,0
4	40428010	.	T	C	1684.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;DP=143;Dels=0.00;FS=7.775;HRun=0;HaplotypeScore=3.4529;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.955;VQSLOD=4.7606;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,73:143:99:1715,0,1735
4	40778162	.	T	G	1276.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=131;Dels=0.00;FS=0.661;HRun=0;HaplotypeScore=7.1586;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.996;VQSLOD=4.5469;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,55:131:99:1307,0,2057
4	41015899	.	C	T	7567.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2161;MQ=59.68;MQ0=0;QD=34.56;VQSLOD=8.3200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,219:219:99:7567,611,0
4	41673604	.	T	C	2637.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2408;MQ=59.29;MQ0=0;QD=28.67;VQSLOD=8.5871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2671,214,0
4	42003671	.	A	G	846.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.662;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.415;VQSLOD=5.6721;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,34:77:99:877,0,1127
4	42020142	.	A	G	2276.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.48;MQ0=0;QD=28.46;VQSLOD=8.5022;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2309,178,0
4	44682465	.	T	C	307.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;DP=30;Dels=0.00;FS=1.744;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.672;VQSLOD=5.3352;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:338,0,551
4	46995366	.	G	T	3188.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.002;DP=206;Dels=0.00;FS=6.008;HRun=0;HaplotypeScore=3.8204;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.692;VQSLOD=3.7616;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,122:206:99:3219,0,2047
4	47584046	.	G	A	2093.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.231;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=2.389;HRun=0;HaplotypeScore=4.2573;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.372;VQSLOD=5.4770;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,87:216:99:2124,0,3315
4	47667064	.	T	C	2019.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=9.3472;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2052,165,0
4	47839929	.	C	T	6039.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8134;MQ=58.61;MQ0=0;QD=30.97;VQSLOD=8.6740;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6038,499,0
4	47901476	.	G	A	1014.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.513;DP=90;Dels=0.00;FS=0.816;HRun=0;HaplotypeScore=5.2818;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.149;VQSLOD=3.9884;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,40:90:99:1045,0,1255
4	48115264	.	C	T	2152.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.372;DP=173;Dels=0.00;FS=1.893;HRun=0;HaplotypeScore=8.8812;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.190;VQSLOD=4.6287;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,94:173:99:2183,0,1913
4	48492769	.	A	T	210.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.159;VQSLOD=10.9112;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:17.51:241,0,18
4	49063872	.	C	A	694.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.04;MQ0=0;QD=25.71;VQSLOD=7.4504;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:54.17:727,54,0
4	52938243	.	T	C	2201.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.244;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.4053;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.950;VQSLOD=5.5598;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,82:168:99:2232,0,2018
4	55131118	.	C	T	2250.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;DP=178;Dels=0.00;FS=1.217;HRun=2;HaplotypeScore=2.7932;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.841;VQSLOD=4.7823;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,89:178:99:2280,0,2298
4	55139771	.	T	C	2449.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.179;DP=157;Dels=0.00;FS=3.994;HRun=3;HaplotypeScore=4.0810;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.247;VQSLOD=4.1271;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,96:157:99:2480,0,1511
4	56820412	.	G	A	748.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.972;DP=76;Dels=0.00;FS=4.661;HRun=0;HaplotypeScore=6.9657;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.132;VQSLOD=4.0804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,32:76:99:778,0,1102
4	56874517	.	A	C	3217.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74;VQSLOD=13.7064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3251,238,0
4	57181629	.	C	T	664.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.033;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4764;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=14.78;ReadPosRankSum=-1.328;VQSLOD=5.6159;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,23:45:99:695,0,583
4	57181632	.	G	C	1490.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=3.4764;MQ=58.97;MQ0=0;QD=33.12;VQSLOD=8.2130;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1523,120,0
4	57181995	.	C	T	2142.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;QD=33.48;VQSLOD=9.2988;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2176,178,0
4	57796639	.	T	C	760.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.900;DP=48;Dels=0.00;FS=4.200;HRun=1;HaplotypeScore=3.9618;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=2.6156;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,29:48:99:790,0,528
4	57839405	.	T	C	3202.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.239;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.885;HRun=0;HaplotypeScore=4.5348;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.578;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.360;VQSLOD=3.0816;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,122:239:99:3232,0,2985
4	57843114	.	C	G	635.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.6573;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=4.8676;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:665,0,592
4	62758491	.	G	A	2243.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.875;DP=155;Dels=0.00;FS=0.657;HRun=0;HaplotypeScore=4.8748;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.243;VQSLOD=4.0100;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,79:155:99:2274,0,1981
4	68380070	.	C	T	354.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.759;VQSLOD=5.6881;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:384,0,405
4	68380215	.	G	A	370.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=29;Dels=0.00;FS=1.637;HRun=2;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.938;VQSLOD=6.2662;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:400,0,395
4	68784774	.	T	C	1893.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.159;DP=151;DS;Dels=0.00;FS=0.626;HRun=1;HaplotypeScore=3.6985;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.222;VQSLOD=6.0225;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,74:151:99:1923,0,2112
4	68810346	.	T	C	413.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=20;Dels=0.00;FS=5.684;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=20.69;ReadPosRankSum=-1.506;VQSLOD=2.6128;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:444,0,149
4	68995529	.	C	T	2919.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;QD=29.49;VQSLOD=8.6582;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2953,235,0
4	69094507	.	T	A	1612.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.990;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HRun=1;HaplotypeScore=2.8052;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.378;VQSLOD=4.3363;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,66:124:99:1642,0,1372
4	69094575	.	T	G	2543.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=9.1822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2577,199,0
4	69095197	.	T	C	1100.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=88;Dels=0.00;FS=2.905;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=12.50;ReadPosRankSum=-2.671;VQSLOD=5.5131;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,45:88:99:1130,0,1159
4	69337325	.	C	G	1795.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;DP=125;Dels=0.00;FS=0.745;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.267;VQSLOD=5.7489;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1826,0,1606
4	69512847	.	T	G	7232.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.608;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.9629;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=32.29;ReadPosRankSum=-0.093;VQSLOD=4.9114;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,223:224:99:7200,518,0
4	69795626	.	C	T	1522.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7593;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.968;VQSLOD=4.6912;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,60:134:99:1552,0,1680
4	69964338	.	T	C	2755.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=188;Dels=0.00;FS=12.248;HRun=0;HaplotypeScore=2.6786;MQ=58.00;MQ0=1;MQRankSum=-0.510;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.132;VQSLOD=2.8499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,104:188:99:2785,0,2059
4	70160277	.	T	G	1606.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=43.12;MQ0=1;QD=27.24;VQSLOD=3.7408;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1640,135,0
4	70160309	.	C	G	2377.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=45.09;MQ0=1;QD=29.72;VQSLOD=3.3558;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2410,196,0
4	70460328	.	C	T	1351.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;DP=124;Dels=0.00;FS=0.769;HRun=1;HaplotypeScore=7.3992;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.191;VQSLOD=4.0729;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,50:124:99:1382,0,2110
4	70513139	.	C	T	1665.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.09;MQ0=0;QD=30.85;VQSLOD=9.0550;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1699,129,0
4	71201388	.	C	T	1382.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=8.8445;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1415,111,0
4	71232388	.	G	A	968.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.203;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.283;VQSLOD=4.7620;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,42:107:99:999,0,1852
4	71232430	.	T	C	4819.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1838;MQ=57.67;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=6.0531;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:4819,391,0
4	71232701	.	C	T	852.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;DP=74;Dels=0.00;FS=2.267;HRun=1;HaplotypeScore=3.3601;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.675;VQSLOD=5.1091;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,33:74:99:882,0,1146
4	71346701	.	C	G	984.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.168;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7128;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.453;VQSLOD=5.4021;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,39:88:99:1014,0,1365
4	72618296	.	T	C	2911.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.29;MQ0=0;QD=29.71;VQSLOD=8.3718;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:2945,244,0
4	72618323	.	G	T	1234.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.300;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9971;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.036;VQSLOD=6.7364;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,52:117:99:1265,0,1677
4	72618334	.	A	C	1692.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.695;DP=119;Dels=0.00;FS=1.515;HRun=1;HaplotypeScore=1.6643;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.413;VQSLOD=6.4472;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,64:119:99:1722,0,1333
4	75675841	.	A	T	2417.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.410;DP=220;Dels=0.00;FS=8.541;HRun=0;HaplotypeScore=5.4559;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.996;VQSLOD=3.7272;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,89:220:99:2448,0,3558
4	76720885	.	T	C	3626	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.26;MQ0=0;QD=29.24;VQSLOD=7.9541;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3625,304,0
4	76722353	.	G	A	1451.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.602;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=27.38;ReadPosRankSum=-1.405;VQSLOD=6.2385;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,52:53:99:1484,111,0
4	76794345	.	T	G	4605.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=34.11;VQSLOD=9.8021;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4605,355,0
4	76836137	.	A	G	1233.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;DP=99;Dels=0.00;FS=4.243;HRun=1;HaplotypeScore=4.4565;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.224;VQSLOD=4.7777;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,46:99:99:1264,0,1450
4	76878716	.	G	C	1845.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=151;Dels=0.00;FS=1.272;HRun=0;HaplotypeScore=6.9724;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.121;VQSLOD=3.9382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,71:151:99:1876,0,2154
4	76881233	.	G	T	541.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;DP=65;Dels=0.00;FS=3.563;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.221;VQSLOD=4.6504;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,26:65:99:572,0,1082
4	76955914	.	T	C	210.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.047;VQSLOD=6.4456;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:240,0,417
4	77053834	.	T	C	939.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.326;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5880;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.230;VQSLOD=5.3802;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,33:66:99:970,0,942
4	77660162	.	G	C	1281.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;DP=95;Dels=0.00;FS=2.740;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.560;VQSLOD=5.6320;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,45:95:99:1311,0,1478
4	77660299	.	T	G	1726.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8647;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.146;VQSLOD=4.8773;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,69:132:99:1756,0,1711
4	77660731	.	C	G	2729.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.839;DP=203;Dels=0.00;FS=0.571;HRun=0;HaplotypeScore=10.0259;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.718;VQSLOD=4.2666;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,105:203:99:2760,0,2740
4	77675505	.	C	T	3945.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.670;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.206;HRun=0;HaplotypeScore=6.8799;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.532;VQSLOD=4.6786;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,114:248:99:3282,0,3365
4	78987157	.	A	G	657.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38;VQSLOD=12.8202;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:51.16:690,51,0
4	79353667	.	G	A	364.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=10.3368;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:395,0,543
4	79387464	.	A	G	4908.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.811;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.2434;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=32.08;ReadPosRankSum=-0.185;VQSLOD=9.1779;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,151:153:99:4863,340,0
4	79443850	.	G	A	584.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22;VQSLOD=13.9060;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.15:617,48,0
4	80905990	.	C	G	283.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.81;MQ0=0;QD=25.74;VQSLOD=7.2265;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:24.08:316,24,0
4	81884722	.	G	A	590.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.812;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.600;VQSLOD=6.8106;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,28:59:99:620,0,724
4	81967188	.	C	T	8287.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.7297;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.15;VQSLOD=5.7256;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8287,662,0
4	83582064	.	G	T	3080.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.907;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=12.178;HRun=0;HaplotypeScore=6.3278;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.412;VQSLOD=3.5586;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,114:250:99:3111,0,3743
4	83582211	.	C	G	2693.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0336;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=4.8842;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,97:200:99:2723,0,2979
4	83785582	.	T	C	1090.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.147;DP=75;Dels=0.00;FS=4.674;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.089;VQSLOD=4.3406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,40:75:99:1121,0,866
4	83838217	.	G	A	3914.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.1267;MQ=58.41;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=5.9487;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:128:99:3914,331,0
4	83838262	.	G	T	1629.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.271;DP=161;Dels=0.00;FS=11.115;HRun=3;HaplotypeScore=3.5435;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.486;VQSLOD=3.4273;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,68:161:99:1660,0,2514
4	83839799	.	A	G	2595.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.80;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=8.6933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2628,199,0
4	84230619	.	T	C	686.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.652;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.9965;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.725;VQSLOD=5.2915;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,28:52:99:716,0,558
4	84374480	.	C	T	1801.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=143;Dels=0.00;FS=4.163;HRun=1;HaplotypeScore=5.6390;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.028;VQSLOD=4.7658;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,71:143:99:1831,0,1949
4	84376743	.	A	T	6747.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0237;MQ=59.59;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=6.9451;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,214:214:99:6746,545,0
4	84383810	.	C	T	2638.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.442;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=3.729;HRun=3;HaplotypeScore=6.9503;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.090;VQSLOD=4.2593;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,101:240:99:2668,0,3967
4	87690998	.	A	G	1070.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.684;DP=80;Dels=0.00;FS=2.389;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.303;VQSLOD=6.3643;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,37:80:99:1101,0,1128
4	87706506	.	T	G	134.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=19;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.409;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.465;VQSLOD=4.7946;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:164,0,281
4	87809387	.	G	T	3380.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7697;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.05;VQSLOD=7.5949;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3380,259,0
4	88258483	.	T	C	4813.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.82;VQSLOD=7.4935;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:4812,379,0
4	88412806	.	T	C	2204.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=196;Dels=0.00;FS=2.476;HRun=0;HaplotypeScore=4.6513;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.045;VQSLOD=5.3812;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,91:196:99:2235,0,2569
4	88415636	.	G	C	3752.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.84;MQ0=0;QD=32.92;VQSLOD=8.9352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3752,295,0
4	88416188	.	G	T	5554.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.4686;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.511;VQSLOD=4.8043;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,203:204:99:5521,401,0
4	88583135	.	A	T	1781.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;DP=125;Dels=0.00;FS=0.664;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.166;VQSLOD=5.9170;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,67:125:99:1812,0,1368
4	88732692	.	G	A	1210.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.926;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.744;VQSLOD=6.3549;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,48:86:99:1240,0,973
4	88732746	.	A	G	2458.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.85;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=9.3797;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2492,196,0
4	88732763	.	A	G	601.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=72;Dels=0.00;FS=2.036;HRun=2;HaplotypeScore=1.9957;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.674;VQSLOD=6.3536;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,26:72:99:632,0,1322
4	88732911	.	C	T	1015.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=86;Dels=0.00;FS=4.337;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.697;VQSLOD=5.9131;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,40:86:99:1045,0,1312
4	88732918	.	A	T	1224.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;DP=90;Dels=0.00;FS=4.225;HRun=1;HaplotypeScore=2.6565;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.183;VQSLOD=5.6731;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,46:90:99:1255,0,1185
4	89311962	.	T	C	632.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;DP=54;Dels=0.00;FS=1.067;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.121;VQSLOD=5.2028;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,27:54:99:663,0,726
4	89625388	.	A	T	2140.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.379;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4984;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=13.21;ReadPosRankSum=2.586;VQSLOD=4.3608;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,77:162:99:2171,0,2276
4	90169925	.	A	G	1384.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.014;DP=111;Dels=0.00;FS=3.635;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.082;VQSLOD=6.4811;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,56:111:99:1414,0,1563
4	95170839	.	G	A	1189.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7776;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.649;VQSLOD=6.4287;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,54:121:99:1220,0,1607
4	95173779	.	T	C	266.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.071;DP=33;Dels=0.00;FS=3.142;HRun=0;HaplotypeScore=2.5873;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.092;VQSLOD=5.5545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,13:33:99:296,0,524
4	95496882	.	C	T	2835.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=13.123;HRun=2;HaplotypeScore=5.0804;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.647;VQSLOD=4.0542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,109:250:99:2865,0,4101
4	95539267	.	G	A	2127.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.39;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=9.2886;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2160,178,0
4	95578588	.	G	A	5053.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.2434;MQ=59.03;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=9.3445;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:164:99:5053,385,0
4	96106322	.	A	G	2040.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;DP=160;Dels=0.00;FS=2.817;HRun=0;HaplotypeScore=6.5837;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.667;VQSLOD=4.9624;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,84:160:99:2071,0,1959
4	99325652	.	G	C	702.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.405;DP=51;Dels=0.00;FS=2.422;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.498;VQSLOD=4.6337;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,25:51:99:733,0,687
4	100045616	.	C	T	356.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.247;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.708;VQSLOD=6.4257;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:387,0,589
4	100048414	.	T	C	862.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.222;DP=82;Dels=0.00;FS=1.869;HRun=0;HaplotypeScore=4.8899;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.658;VQSLOD=5.5699;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,38:82:99:892,0,1040
4	100140306	.	A	T	1912	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8237;MQ=59.27;MQ0=0;QD=28.97;VQSLOD=8.6334;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:1945,150,0
4	100239319	.	T	C	5987.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5162;MQ=58.33;MQ0=0;QD=29.49;VQSLOD=7.2659;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:203:99:5986,511,0
4	100263965	.	C	T	7966.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8061;MQ=49.76;MQ0=8;QD=31.87;VQSLOD=3.4070;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,246:250:99:7966,635,0
4	100266112	.	C	T	5356.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6497;MQ=58.46;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=6.8656;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:169:99:5356,433,0
4	100266371	.	A	G	460.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.922;DP=43;Dels=0.00;FS=2.692;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.382;VQSLOD=5.3469;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:490,0,537
4	100268190	.	A	C	8150.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5406;MQ=43.50;MQ0=7;QD=32.60;VQSLOD=3.4332;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8150,662,0
4	100443720	.	G	A	1435.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.223;DP=143;Dels=0.00;FS=3.044;HRun=1;HaplotypeScore=3.7265;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.770;VQSLOD=4.7813;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,58:143:99:1465,0,2159
4	100443782	.	T	C	1247.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.084;DP=110;Dels=0.00;FS=0.711;HRun=4;HaplotypeScore=1.6281;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.272;VQSLOD=4.5847;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,48:110:99:1277,0,1725
4	100443800	.	G	A	1122.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;DP=114;Dels=0.00;FS=1.545;HRun=1;HaplotypeScore=2.6794;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.533;VQSLOD=5.0511;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,45:114:99:1153,0,1849
4	100516022	.	C	G	1235.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;DP=85;Dels=0.00;FS=3.390;HRun=0;HaplotypeScore=3.4791;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.541;VQSLOD=4.8351;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1266,0,1102
4	102816467	.	C	G	318.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=35;Dels=0.00;FS=4.202;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.09;ReadPosRankSum=2.068;VQSLOD=4.6745;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,12:35:99:348,0,582
4	102965043	.	T	C	3188.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7308;MQ=57.69;MQ0=0;QD=27.25;VQSLOD=6.0632;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3221,250,0
4	103188709	.	C	T	1540.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=121;Dels=0.00;FS=4.960;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.660;VQSLOD=5.1455;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,64:121:99:1570,0,1556
4	103611845	.	C	T	2453.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.562;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=6.288;HRun=0;HaplotypeScore=2.7541;MQ=58.66;MQ0=2;MQRankSum=1.664;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.518;VQSLOD=4.9087;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,97:222:99:2483,0,3184
4	103911069	.	C	A	1359.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;QD=28.32;VQSLOD=7.8628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1392,108,0
4	103964529	.	A	C	1023.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.078;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5657;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=6.3616;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,39:78:99:1053,0,980
4	104013796	.	T	C	315.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.142;DP=31;Dels=0.00;FS=3.151;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.061;VQSLOD=5.5141;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:345,0,489
4	104061993	.	C	G	750.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.906;DP=73;Dels=0.00;FS=3.562;HRun=2;HaplotypeScore=2.8926;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.210;VQSLOD=5.6025;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,31:73:99:780,0,1078
4	106317429	.	C	G	2788.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6634;MQ=53.63;MQ0=0;QD=28.75;VQSLOD=4.0131;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:2821,220,0
4	106604164	.	C	A	2433.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=218;Dels=0.00;FS=1.061;HRun=0;HaplotypeScore=3.5356;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.478;VQSLOD=4.7051;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,95:218:99:2464,0,3258
4	106859549	.	G	C	1162.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.477;DP=107;Dels=0.00;FS=2.634;HRun=1;HaplotypeScore=2.8211;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.229;VQSLOD=5.5436;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,47:107:99:1193,0,1652
4	106861730	.	A	G	7086.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6093;MQ=59.24;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=7.3587;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:237:99:7085,593,0
4	107168431	.	G	C	1398.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.99;MQ0=0;QD=29.76;VQSLOD=7.8129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1432,108,0
4	108931039	.	T	C	2596.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;DP=87;Dels=0.00;FS=5.416;HRun=2;HaplotypeScore=6.9753;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.737;VQSLOD=3.7376;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,86:87:99:2629,165,0
4	109674116	.	A	G	1298.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.142;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.073;VQSLOD=6.4736;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,50:106:99:1329,0,1585
4	110790911	.	A	T	1952.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=174;Dels=0.00;FS=1.327;HRun=1;HaplotypeScore=5.3491;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.510;VQSLOD=4.6008;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,74:174:99:1982,0,2849
4	110901198	.	G	A	2473.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.367;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7467;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.087;VQSLOD=6.4810;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,93:181:99:2504,0,2419
4	110914427	.	A	T	6043.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6457;MQ=59.59;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.3409;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:202:99:6042,490,0
4	111398208	.	A	G	3199.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2625;MQ=59.09;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=8.9095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3232,259,0
4	113345147	.	A	G	807.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;DP=68;Dels=0.00;FS=3.466;HRun=0;HaplotypeScore=1.9155;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.490;VQSLOD=6.0092;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,34:68:99:838,0,833
4	113352397	.	G	A	4971.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8637;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=30.50;ReadPosRankSum=1.668;VQSLOD=8.5444;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,162:163:99:4971,397,0
4	113352628	.	A	G	4190.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7172;MQ=59.44;MQ0=0;QD=29.72;VQSLOD=9.0183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4189,343,0
4	113352899	.	G	A	3757.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=9.4311;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3757,292,0
4	113353285	.	T	C	4410.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.83;MQ0=0;QD=32.91;VQSLOD=9.3617;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4410,358,0
4	115589302	.	A	G	4713.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6588;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=9.5111;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4713,355,0
4	119951647	.	A	G	6680.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.31;MQ0=0;QD=33.07;VQSLOD=9.8557;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:202:99:6679,518,0
4	120214030	.	T	G	1313.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.329;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.634;VQSLOD=6.0920;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,44:83:99:1343,0,995
4	120241902	.	T	C	548.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=57;Dels=0.00;FS=1.039;HRun=0;HaplotypeScore=3.8840;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.664;VQSLOD=5.5626;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,22:57:99:578,0,892
4	120422407	.	T	G	789.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.215;DP=67;Dels=0.00;FS=3.576;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.263;VQSLOD=3.9934;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,32:67:99:820,0,856
4	120528327	.	G	A	3869.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8675;MQ=58.91;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=9.5567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,123:124:99:3869,322,0
4	122683007	.	G	A	2810.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;QD=28.39;VQSLOD=8.8362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2843,223,0
4	122742217	.	T	C	6226.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4572;MQ=58.23;MQ0=1;QD=29.37;VQSLOD=7.2202;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6226,463,0
4	123150286	.	T	C	2986.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.519;DP=194;Dels=0.00;FS=5.309;HRun=0;HaplotypeScore=1.9445;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.853;VQSLOD=4.6755;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,115:194:99:3016,0,1950
4	123171659	.	T	A	992.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.439;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.1515;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.814;VQSLOD=5.8017;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,41:84:99:1022,0,1053
4	123207867	.	T	G	1853.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.955;DP=130;Dels=0.00;FS=0.701;HRun=2;HaplotypeScore=1.9861;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.623;VQSLOD=5.5426;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,73:130:99:1883,0,1504
4	123838758	.	A	G	4513.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.23;MQ0=0;QD=32.71;VQSLOD=9.9950;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4513,364,0
4	126238924	.	A	T	2301.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.28;MQ0=0;QD=32.41;VQSLOD=8.8055;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2334,187,0
4	126239986	.	C	T	6580.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.9924;MQ=59.14;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=3.8768;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:215:99:6546,536,0
4	126372742	.	G	A	2171.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=169;Dels=0.00;FS=4.513;HRun=0;HaplotypeScore=5.0679;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.366;VQSLOD=4.7505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,83:169:99:2201,0,2349
4	126373789	.	G	A	1705.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.11;MQ0=0;QD=32.79;VQSLOD=9.7406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1738,141,0
4	126412891	.	C	T	616.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.740;VQSLOD=6.0590;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,27:52:99:646,0,648
4	128723042	.	T	C	2205.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6427;MQ=57.42;MQ0=0;QD=27.92;VQSLOD=4.7116;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2239,181,0
4	128807219	.	T	A	7277.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.5522;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.376;VQSLOD=7.1917;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,234:235:99:7276,575,0
4	128814964	.	G	T	5872.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.65;VQSLOD=8.2594;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:5872,460,0
4	129043204	.	C	G	2326.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.945;DP=171;Dels=0.00;FS=3.563;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.531;VQSLOD=2.5962;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,90:171:99:2357,0,2168
4	129100643	.	G	A	1477.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.429;DP=132;Dels=0.00;FS=0.671;HRun=0;HaplotypeScore=6.0650;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.501;VQSLOD=5.1221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,57:132:99:1507,0,1827
4	129867280	.	T	A	707.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;DP=49;Dels=0.00;FS=4.322;HRun=0;HaplotypeScore=4.4029;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=4.7296;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:737,0,512
4	130030652	.	A	G	2553.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.2434;MQ=58.57;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=7.4726;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:85:99:2586,199,0
4	139093119	.	A	T	912.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.114;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.943;VQSLOD=4.2820;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:94:99:942,0,1180
4	144801662	.	C	T	2749.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.76;MQ0=4;QD=21.83;VQSLOD=5.8255;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:126:99:2783,229,0
4	144918712	.	C	G	1144.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.216;DP=96;Dels=0.00;FS=3.945;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.568;VQSLOD=5.4976;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,46:96:99:1174,0,1311
4	147824864	.	G	A	706.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.73;MQ0=0;QD=28.28;VQSLOD=7.7785;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:57.18:740,57,0
4	148560193	.	C	T	888.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.167;DP=86;Dels=0.00;FS=8.836;HRun=0;HaplotypeScore=2.9423;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.323;VQSLOD=4.1117;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,37:86:99:918,0,1318
4	149357475	.	C	T	6384.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0998;MQ=59.05;MQ0=0;QD=29.42;VQSLOD=7.6164;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,215:217:99:6360,494,0
4	151199080	.	G	A	2572.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.596;DP=170;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2439;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.622;VQSLOD=5.5396;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,91:170:99:2602,0,1943
4	151207127	.	C	T	259.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=23;Dels=0.00;FS=3.976;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=11.30;ReadPosRankSum=2.739;VQSLOD=3.6330;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:290,0,304
4	152201018	.	G	GCAGGT	6975.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.313;DP=237;FS=24.184;HRun=0;HaplotypeScore=1109.1055;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-9.291;QD=29.31;ReadPosRankSum=-1.300;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,69:237:99:6976,0,6354
4	152212603	.	T	G	1151.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=34.89;VQSLOD=9.8266;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1184,99,0
4	153690842	.	T	C	930.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.872;DP=71;Dels=0.00;FS=0.966;HRun=0;HaplotypeScore=1.9092;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.869;VQSLOD=5.1872;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,37:71:99:960,0,864
4	153896358	.	C	T	1106.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.261;DP=83;Dels=0.00;FS=2.996;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.241;VQSLOD=6.1975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,41:83:99:1137,0,1147
4	154513627	.	A	G	1821.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8835;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.38;VQSLOD=8.4814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1855,144,0
4	154514965	.	T	C	1762.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.75;MQ0=0;QD=27.97;VQSLOD=6.9628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1795,144,0
4	154631587	.	C	G	123.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.421;VQSLOD=5.2822;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:153,0,335
4	154644537	.	T	C	456.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;DP=45;Dels=0.00;FS=12.588;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.379;VQSLOD=3.8366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,18:45:99:486,0,716
4	155219318	.	C	T	1466.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.585;DP=102;Dels=0.00;FS=0.749;HRun=1;HaplotypeScore=3.5296;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.693;VQSLOD=5.5943;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,51:102:99:1496,0,1260
4	155219662	.	G	C	2282.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.239;DP=186;Dels=0.00;FS=2.563;HRun=0;HaplotypeScore=6.2055;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.493;VQSLOD=4.2648;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,83:186:99:2313,0,2816
4	155241572	.	G	A	2381.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=185;Dels=0.00;FS=2.662;HRun=1;HaplotypeScore=3.2545;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=6.3653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,93:185:99:2412,0,2400
4	155243604	.	T	C	2670.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=57.86;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=7.5644;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,84:85:99:2703,208,0
4	155256205	.	G	A	4159.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=3.2854;MQ=58.55;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=9.1848;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4159,322,0
4	155287535	.	T	C	1204.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.616;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8143;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.690;VQSLOD=4.5546;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,56:116:99:1234,0,1585
4	155295076	.	A	G	830.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.249;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.914;VQSLOD=5.8725;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,38:88:99:861,0,1149
4	155491759	.	G	A	3645.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=34.07;VQSLOD=10.1368;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3645,280,0
4	156273768	.	T	C	1586.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=31.73;VQSLOD=9.3563;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1619,126,0
4	156274377	.	T	C	859.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;DP=69;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.134;VQSLOD=5.9462;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,34:69:99:890,0,970
4	156289917	.	G	A	1626.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.295;DP=179;Dels=0.00;FS=3.783;HRun=1;HaplotypeScore=5.6357;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.921;VQSLOD=4.5092;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,68:179:99:1656,0,2799
4	159601676	.	C	T	1513.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.922;DP=125;Dels=0.00;FS=2.447;HRun=0;HaplotypeScore=4.8907;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.397;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.161;VQSLOD=4.9363;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,57:125:99:1543,0,1865
4	159631991	.	G	T	1185.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;DP=123;Dels=0.00;FS=13.141;HRun=2;HaplotypeScore=2.7648;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.901;VQSLOD=3.9176;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,45:123:99:1215,0,1895
4	159894250	.	C	T	475.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.17;MQ0=0;QD=27.96;VQSLOD=8.2533;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:39.12:508,39,0
4	159894277	.	T	C	304.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=26;Dels=0.00;FS=1.580;HRun=0;HaplotypeScore=1.9924;MQ=54.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.190;VQSLOD=2.5882;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:334,0,295
4	159894305	.	T	C	666.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.66;VQSLOD=8.2698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:25:54.17:699,54,0
4	159894391	.	G	A	675.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.826;DP=41;Dels=0.00;FS=4.815;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.474;VQSLOD=4.2534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,26:41:99:706,0,345
4	162307312	.	C	A	1676.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.594;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.7187;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=0.347;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.534;VQSLOD=5.6597;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,65:124:99:1707,0,1582
4	164085425	.	T	C	690.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=65;Dels=0.00;FS=0.966;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.912;VQSLOD=6.5673;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,32:65:99:721,0,883
4	164393117	.	T	A	2127.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;DP=151;Dels=0.00;FS=0.597;HRun=0;HaplotypeScore=3.4232;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.564;VQSLOD=6.0794;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,77:151:99:2157,0,1922
4	164435265	.	A	C	1908.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=139;Dels=0.00;FS=3.033;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.027;VQSLOD=5.9892;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,75:139:99:1938,0,1568
4	164440581	.	T	C	772.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.040;DP=50;Dels=0.00;FS=11.048;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=15.45;ReadPosRankSum=1.594;VQSLOD=3.5041;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,30:50:99:802,0,533
4	169083694	.	A	C	764.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.662;DP=65;Dels=0.00;FS=3.060;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.112;VQSLOD=6.1888;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,29:65:99:794,0,981
4	169282355	.	T	C	350.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.99;VQSLOD=6.6319;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:30.09:384,30,0
4	169315760	.	C	A	2082.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.92;MQ0=0;QD=28.52;VQSLOD=8.0877;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2115,166,0
4	169336662	.	T	C	2011.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=33.52;VQSLOD=10.2021;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2044,157,0
4	169341435	.	A	G	913.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.95;MQ0=0;QD=28.54;VQSLOD=8.0082;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:81.22:946,81,0
4	169433326	.	T	C	1654.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.513;DP=169;Dels=0.00;FS=0.594;HRun=0;HaplotypeScore=1.7753;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.120;VQSLOD=4.1170;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,67:169:99:1685,0,2867
4	169433327	.	G	A	1610.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.489;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7753;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.222;VQSLOD=3.4602;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,65:165:99:1641,0,2941
4	170477125	.	G	A	765.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.120;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5777;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.062;VQSLOD=5.1508;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,33:72:99:796,0,1019
4	170663235	.	C	T	1533.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;QD=31.29;VQSLOD=9.7097;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1566,120,0
4	175225452	.	G	A	1340.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;DP=111;Dels=0.00;FS=0.723;HRun=0;HaplotypeScore=2.7374;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.959;VQSLOD=6.0125;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,54:111:99:1370,0,1404
4	177073026	.	G	A	3446.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.37;MQ0=1;QD=27.14;VQSLOD=7.4776;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:3446,268,0
4	177082069	.	G	C	779.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7653;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.663;VQSLOD=5.7591;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:810,0,984
4	177100644	.	G	A	1605.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=149;Dels=0.00;FS=3.881;HRun=0;HaplotypeScore=3.5587;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.450;VQSLOD=5.2827;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,71:149:99:1635,0,1904
4	178262784	.	A	G	981.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;DP=63;Dels=0.00;FS=3.696;HRun=0;HaplotypeScore=2.6971;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.021;VQSLOD=5.4821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,35:63:99:1012,0,694
4	178274750	.	C	T	2404.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=59.70;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=9.3030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2438,190,0
4	178274835	.	A	C	3007.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5572;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=28.64;ReadPosRankSum=-0.148;VQSLOD=4.2871;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,104:105:99:3040,229,0
4	178281754	.	G	A	3778.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7005;MQ=59.36;MQ0=0;QD=32.57;VQSLOD=8.9660;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3778,292,0
4	178359960	.	G	C	1237.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.90;VQSLOD=7.8516;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:93.30:1270,93,0
4	184203886	.	G	C	159.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.581;VQSLOD=12.0688;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:190,0,211
4	184615117	.	A	C	2154.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.955;DP=171;Dels=0.00;FS=10.806;HRun=1;HaplotypeScore=1.5983;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.990;VQSLOD=3.8210;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,80:171:99:2184,0,2321
4	184618936	.	G	C	1855.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.091;VQSLOD=6.1604;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,66:121:99:1885,0,1499
4	185587165	.	A	G	1863.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.06;MQ0=0;QD=28.66;VQSLOD=8.0195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1896,150,0
4	185615764	.	C	A	839.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=93;Dels=0.00;FS=5.394;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.716;QD=9.03;ReadPosRankSum=-2.240;VQSLOD=2.6643;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,35:93:99:870,0,1577
4	185634144	.	T	C	800.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=81;Dels=0.00;FS=3.259;HRun=0;HaplotypeScore=6.8871;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.768;VQSLOD=4.5086;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,32:81:99:830,0,1179
4	185637699	.	A	G	995.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.135;DP=68;Dels=0.00;FS=0.937;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.234;VQSLOD=6.2280;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,37:68:99:1026,0,809
4	186111639	.	T	C	731.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.201;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7356;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.253;VQSLOD=5.5352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,27:60:99:761,0,869
4	186379899	.	G	C	2714.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.73;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=8.5542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2748,205,0
4	186380243	.	A	C	1157.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.86;MQ0=0;QD=35.08;VQSLOD=9.7367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:93.30:1191,93,0
4	186380515	.	G	A	4163.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.18;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=9.2392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:4163,322,0
4	186380846	.	A	T	3996.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5348;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.51;VQSLOD=6.9863;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:3996,313,0
4	186381115	.	G	T	1329.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.77;MQ0=0;QD=33.24;VQSLOD=8.9463;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1363,111,0
4	187004074	.	C	T	833.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.637;DP=74;Dels=0.00;FS=1.943;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=11.27;ReadPosRankSum=-3.531;VQSLOD=3.2473;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,34:74:99:864,0,1126
4	187074833	.	A	G	7036.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.4542;MQ=59.38;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=4.2612;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:226:99:6990,590,0
4	187077206	.	A	G	3342.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5213;MQ=59.47;MQ0=0;QD=29.32;VQSLOD=8.7163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3342,280,0
4	187078785	.	A	G	3565.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6202;MQ=59.57;MQ0=1;QD=28.99;VQSLOD=7.2668;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:123:99:3565,301,0
4	187113041	.	C	G	89.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.336;VQSLOD=5.3340;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:120,0,104
4	187120211	.	C	A	978.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.030;DP=82;Dels=0.00;FS=0.925;HRun=1;HaplotypeScore=5.8979;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.758;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.501;VQSLOD=4.0409;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,39:82:99:1009,0,1168
4	187158034	.	G	A	1050.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.862;DP=96;Dels=0.00;FS=0.776;HRun=1;HaplotypeScore=2.7627;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=5.4580;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,44:96:99:1081,0,1326
4	187179210	.	T	C	4182.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.98;MQ0=0;QD=30.09;VQSLOD=8.8016;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4182,328,0
4	187205402	.	A	G	523.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.491;DP=48;Dels=0.00;FS=4.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.843;VQSLOD=4.1639;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,19:48:99:553,0,823
4	187519206	.	C	G	3752.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5439;MQ=59.28;MQ0=1;QD=29.78;VQSLOD=8.3807;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:126:99:3752,289,0
4	187525020	.	A	C	1029.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.064;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.463;VQSLOD=6.9226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,40:76:99:1060,0,958
4	187538942	.	T	G	2497.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.420;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=6.7348;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.240;VQSLOD=2.9783;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,99:238:99:2528,0,3822
4	187627792	.	T	C	7395.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9049;MQ=59.44;MQ0=0;QD=29.94;VQSLOD=8.6125;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:247:99:7394,581,0
4	187628398	.	C	G	4663.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.83;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=9.6614;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4663,367,0
4	187629140	.	G	C	3095.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.75;MQ0=0;QD=33.29;VQSLOD=8.9697;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:93:99:3129,241,0
4	187629538	.	C	T	4086.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.298;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=1.615;HRun=0;HaplotypeScore=5.8667;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.264;VQSLOD=4.7769;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,125:247:99:3418,0,3574
4	187629770	.	A	C	2603.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.289;DP=211;Dels=0.00;FS=1.097;HRun=1;HaplotypeScore=5.3865;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.288;VQSLOD=5.3989;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,101:211:99:2633,0,2787
4	187630590	.	G	A	2495.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.288;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=2.365;HRun=0;HaplotypeScore=4.8395;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.681;VQSLOD=5.5898;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,101:220:99:2525,0,2925
5	163260	.	A	C	925.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.614;VQSLOD=8.3649;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,28:29:78.23:959,78,0
5	174106	.	G	A	927.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;QD=34.33;VQSLOD=9.7618;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:75.24:960,75,0
5	181730	.	C	G	6977.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.8135;MQ=59.47;MQ0=0;QD=30.74;VQSLOD=8.5400;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:6976,572,0
5	223646	.	A	T	1135.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.545;DP=134;Dels=0.00;FS=1.436;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.623;VQSLOD=2.9270;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,51:134:99:1166,0,2005
5	422955	.	C	G	558.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.563;VQSLOD=10.9401;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,24:60:99:589,0,1019
5	434722	.	G	C	57.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.024;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.979;VQSLOD=4.5361;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:87.29:87,0,306
5	475104	.	A	G	632.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.48;VQSLOD=8.2726;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.16:665,57,0
5	639231	.	C	A	1476.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.286;DP=113;Dels=0.00;FS=2.469;HRun=1;HaplotypeScore=8.6969;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.495;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.864;VQSLOD=3.5201;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,56:113:99:1506,0,1650
5	767033	.	A	C	1337.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.672;DP=80;Dels=0.00;FS=1.241;HRun=2;HaplotypeScore=4.7849;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.599;VQSLOD=4.0077;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,46:80:99:1368,0,887
5	1065514	.	A	G	1344.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;DP=96;Dels=0.00;FS=0.771;HRun=0;HaplotypeScore=3.8640;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.114;VQSLOD=3.5289;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,52:96:99:1374,0,1073
5	1081767	.	C	T	1540.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.347;VQSLOD=6.8227;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,61:132:99:1571,0,1830
5	1213668	.	G	A	664.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.545;DP=54;Dels=0.00;FS=4.029;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.978;VQSLOD=5.9744;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:694,0,673
5	1225626	.	T	A	705.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=63;Dels=0.00;FS=1.329;HRun=0;HaplotypeScore=2.9951;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=3.5479;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,28:63:99:736,0,980
5	1225687	.	C	T	4336.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.2047;MQ=57.40;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=4.8138;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:139:99:4335,352,0
5	1467004	.	A	G	1148.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;DP=145;Dels=0.00;FS=3.378;HRun=0;HaplotypeScore=3.8091;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.468;VQSLOD=4.4651;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,50:145:99:1178,0,2712
5	5146335	.	C	G	6204.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=9.5619;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:6204,482,0
5	5146377	.	T	C	2422.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.512;DP=196;Dels=0.00;FS=0.565;HRun=2;HaplotypeScore=5.3823;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.912;VQSLOD=4.4755;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,88:196:99:2453,0,3192
5	5146395	.	A	G	4132.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.745;DP=225;Dels=0.00;FS=0.518;HRun=0;HaplotypeScore=5.9929;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=18.37;ReadPosRankSum=-1.300;VQSLOD=3.9693;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,128:225:99:3499,0,2758
5	5303424	.	G	A	153.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5326;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.030;VQSLOD=4.6922;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:183,0,265
5	5460619	.	G	C	826.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=14.0078;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:66.21:859,66,0
5	5462148	.	G	A	5953.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5661;MQ=59.88;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=8.6151;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:5952,472,0
5	6633779	.	C	G	164.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.093;VQSLOD=4.2542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:194,0,203
5	7520881	.	G	T	1943.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.930;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.8466;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=4.1221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,83:167:99:1973,0,2389
5	7835555	.	C	G	2201.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;DP=171;Dels=0.00;FS=0.607;HRun=0;HaplotypeScore=5.3860;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.915;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.357;VQSLOD=3.0266;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,86:171:99:2232,0,2350
5	7868030	.	T	C	4177.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7300;MQ=59.71;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=8.8038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4177,328,0
5	7870973	.	A	G	4241.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.64;MQ0=0;QD=33.14;VQSLOD=9.4305;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4241,325,0
5	9629529	.	G	A	715.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.204;DP=57;Dels=0.00;FS=3.740;HRun=0;HaplotypeScore=1.9978;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.312;VQSLOD=6.1414;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,27:57:99:746,0,792
5	13701536	.	T	C	3426.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6126;MQ=58.02;MQ0=0;QD=28.79;VQSLOD=7.6140;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3426,253,0
5	13719089	.	G	A	1564.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=125;Dels=0.00;FS=1.403;HRun=1;HaplotypeScore=1.7336;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.649;VQSLOD=6.7304;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,63:125:99:1594,0,1722
5	13737444	.	G	A	2503.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.725;DP=184;Dels=0.00;FS=2.609;HRun=0;HaplotypeScore=3.7801;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.294;VQSLOD=5.1389;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,98:184:99:2533,0,2344
5	13788886	.	C	A	884.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=95;Dels=0.00;FS=4.104;HRun=2;HaplotypeScore=4.7973;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.234;VQSLOD=3.7476;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,36:95:99:914,0,1552
5	13811775	.	T	C	1539.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;DP=125;Dels=0.00;FS=0.718;HRun=0;HaplotypeScore=1.9951;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.186;VQSLOD=6.6511;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,57:125:99:1569,0,1821
5	13902220	.	T	C	1269.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=28.20;VQSLOD=8.6592;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:96.31:1302,96,0
5	13944512	.	A	C	3825.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.93;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=9.1235;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:3825,289,0
5	16673975	.	C	G	3977.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=8.8345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:3977,307,0
5	16681986	.	C	T	1291.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;DP=125;Dels=0.00;FS=10.170;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.221;VQSLOD=2.6394;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,48:125:99:1322,0,2138
5	16769273	.	G	A	746.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;DP=42;Dels=0.00;FS=3.067;HRun=2;HaplotypeScore=1.9402;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.358;VQSLOD=5.3439;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,29:42:99:777,0,281
5	22078584	.	C	T	1602.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;DP=112;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=0;HaplotypeScore=1.8279;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.582;VQSLOD=4.3683;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,62:112:99:1632,0,1251
5	24511490	.	C	T	2495.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.548;DP=204;DS;Dels=0.00;FS=12.043;HRun=0;HaplotypeScore=5.7544;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=2.3118;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,96:204:99:2525,0,3031
5	26988328	.	G	A	741.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.196;DP=67;Dels=0.00;FS=6.967;HRun=0;HaplotypeScore=3.7905;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.925;VQSLOD=3.7043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,29:67:99:772,0,963
5	26988424	.	T	C	1288.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.611;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9977;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.150;VQSLOD=6.6722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,50:99:99:1318,0,1183
5	32403346	.	C	T	7205.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5743;MQ=59.24;MQ0=0;QD=31.88;VQSLOD=9.2876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,226:226:99:7205,569,0
5	33535060	.	G	A	1190.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;DP=101;Dels=0.00;FS=2.655;HRun=1;HaplotypeScore=3.6599;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=6.1539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,49:101:99:1221,0,1393
5	33881252	.	G	A	1416.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=104;Dels=0.00;FS=2.602;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.344;VQSLOD=6.0162;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,58:104:99:1447,0,1235
5	33951693	.	C	G	6430.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0539;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.98;VQSLOD=6.3892;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6430,509,0
5	33954511	.	T	C	2670.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7801;MQ=59.21;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=8.6892;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:88:99:2704,223,0
5	33989518	.	C	T	3798.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.79;MQ0=0;QD=34.22;VQSLOD=9.7371;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:111:99:3798,304,0
5	33998883	.	A	G	3099.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.68;VQSLOD=8.2173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3133,241,0
5	34004707	.	C	T	6207.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.715;DP=204;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9833;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.306;VQSLOD=8.0674;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,203:204:99:6206,506,0
5	34008100	.	C	T	966.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.83;VQSLOD=7.3863;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:75.24:999,75,0
5	34824555	.	G	T	425.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;DP=48;Dels=0.00;FS=10.403;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.940;VQSLOD=3.7216;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,19:48:99:455,0,743
5	34840841	.	A	G	6383.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;DP=198;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6514;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.308;VQSLOD=8.2888;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,197:198:99:6345,484,0
5	34998877	.	C	A	2835.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.33;MQ0=0;QD=29.23;VQSLOD=7.9520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:2869,220,0
5	35033605	.	G	A	3982.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7098;MQ=59.17;MQ0=0;QD=28.24;VQSLOD=7.4884;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:141:99:3981,316,0
5	35039486	.	C	T	4792.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.4023;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=8.0915;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:4792,376,0
5	35709095	.	C	T	2699.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.3437;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.615;VQSLOD=7.2069;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,93:94:99:2733,220,0
5	35709184	.	G	C	5252.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6717;MQ=58.44;MQ0=0;QD=28.39;VQSLOD=6.3335;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,184:185:99:5252,397,0
5	35861068	.	T	C	4086.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8689;MQ=58.71;MQ0=0;QD=30.27;VQSLOD=8.6676;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4086,316,0
5	35871190	.	G	A	2934.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6493;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.64;VQSLOD=9.1223;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2967,232,0
5	35874575	.	C	T	1875.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.871;DP=159;Dels=0.00;FS=1.990;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.917;VQSLOD=6.0063;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,75:159:99:1905,0,2081
5	35910529	.	C	T	863.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=69;Dels=0.00;FS=0.908;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.487;VQSLOD=6.8282;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,33:69:99:894,0,979
5	35965970	.	A	C	898.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.391;DP=82;Dels=0.00;FS=1.902;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.309;VQSLOD=5.6547;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,35:82:99:928,0,1087
5	36269551	.	G	C	4214.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5652;MQ=59.10;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=8.0739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:137:99:4214,322,0
5	38370537	.	T	C	612.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.309;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9713;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.264;VQSLOD=4.4256;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,26:45:99:643,0,469
5	38486065	.	C	T	829.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.8886;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.817;VQSLOD=6.4478;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,36:79:99:859,0,1121
5	40955561	.	G	C	2110.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.126;DP=181;Dels=0.00;FS=4.349;HRun=0;HaplotypeScore=6.9293;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.080;VQSLOD=4.9413;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,83:181:99:2140,0,2582
5	41008780	.	A	G	801.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.740;DP=89;Dels=0.00;FS=3.125;HRun=1;HaplotypeScore=3.1324;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=5.7954;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,30:89:99:831,0,1752
5	41042204	.	T	A	63.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.769;VQSLOD=4.4308;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:93.17:93,0,145
5	41049397	.	C	T	721.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.768;DP=70;Dels=0.00;FS=3.635;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.719;VQSLOD=4.8284;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,27:70:99:751,0,1072
5	41061716	.	A	G	2743.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.964;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5368;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.473;VQSLOD=5.9350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,107:201:99:2774,0,2458
5	41199959	.	G	T	843.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.147;VQSLOD=6.0061;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,33:76:99:873,0,1128
5	42719239	.	A	C	1007.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.763;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.071;VQSLOD=5.6028;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,37:78:99:1038,0,1011
5	42801268	.	C	T	1562.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.391;DP=124;Dels=0.00;FS=11.376;HRun=0;HaplotypeScore=6.2591;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.654;VQSLOD=3.9719;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,67:124:99:1593,0,1474
5	43039793	.	T	C	1975.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;DP=165;Dels=0.00;FS=7.035;HRun=1;HaplotypeScore=5.8751;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=4.7458;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,77:165:99:2005,0,2573
5	43509348	.	T	A	3339.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=59.64;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=8.3722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3339,265,0
5	44809162	.	G	C	247.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;DP=25;Dels=0.00;FS=5.409;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.575;VQSLOD=4.4969;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:278,0,453
5	52096889	.	C	A	3860.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.80;MQ0=0;QD=33.28;VQSLOD=9.6687;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3860,313,0
5	52201722	.	C	T	1814.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=167;DS;Dels=0.00;FS=0.654;HRun=0;HaplotypeScore=3.4232;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.458;VQSLOD=6.2540;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,74:167:99:1845,0,2233
5	52214581	.	G	A	524.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;DP=49;Dels=0.00;FS=1.202;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.095;VQSLOD=5.7267;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,22:49:99:554,0,789
5	52229745	.	T	G	531.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.464;DP=38;Dels=0.00;FS=1.310;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.147;VQSLOD=4.4055;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:38:99:562,0,371
5	53815495	.	A	C	1754.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=123;Dels=0.00;FS=3.258;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.965;VQSLOD=6.2510;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,65:123:99:1785,0,1554
5	54403957	.	T	C	1483.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;QD=28.00;VQSLOD=7.6776;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1517,114,0
5	54410120	.	A	C	5623.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.4035;MQ=59.22;MQ0=0;QD=33.67;VQSLOD=7.6125;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:167:99:5589,433,0
5	54439466	.	G	A	1461.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;QD=32.48;VQSLOD=9.2086;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1495,120,0
5	54459961	.	A	G	1044.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=70;Dels=0.00;FS=0.918;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.445;VQSLOD=6.3778;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,40:70:99:1075,0,864
5	55081694	.	A	G	1058.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.911;DP=93;Dels=0.00;FS=1.775;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.803;VQSLOD=6.2642;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,42:93:99:1088,0,1264
5	55178976	.	G	A	969.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;DP=73;Dels=0.01;FS=3.165;HRun=1;HaplotypeScore=2.9448;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.668;VQSLOD=6.3318;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:73:99:999,0,990
5	55206444	.	G	A	2416.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.086;DP=175;Dels=0.00;FS=3.859;HRun=1;HaplotypeScore=4.3121;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.798;VQSLOD=4.9002;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,88:175:99:2447,0,2519
5	55407542	.	C	T	4491.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.928;HRun=0;HaplotypeScore=4.4009;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.847;VQSLOD=4.4780;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,142:250:99:3849,0,2732
5	56177443	.	G	A	3721.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.18;MQ0=0;QD=29.77;VQSLOD=9.0278;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3721,292,0
5	56177743	.	G	A	2665.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=9.7485;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2698,214,0
5	56207123	.	T	A	1426.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=13.2877;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:48:99:1460,123,0
5	56209735	.	A	G	980.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.638;DP=94;Dels=0.00;FS=5.439;HRun=0;HaplotypeScore=1.9658;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.926;VQSLOD=5.4406;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,43:94:99:1010,0,1301
5	60982841	.	G	A	2125.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;DP=185;Dels=0.01;FS=3.421;HRun=0;HaplotypeScore=6.8855;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.522;VQSLOD=4.8266;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,85:185:99:2155,0,2490
5	60999768	.	C	T	482.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.857;DP=59;Dels=0.00;FS=3.822;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.649;VQSLOD=5.8324;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,23:59:99:513,0,956
5	63905068	.	A	G	1535.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.84;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=8.4715;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1569,126,0
5	64097145	.	C	G	469.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.91;MQ0=0;QD=23.49;VQSLOD=7.1492;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:36.12:503,36,0
5	65321311	.	C	T	2149.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.878;DP=180;Dels=0.00;FS=0.563;HRun=2;HaplotypeScore=3.9840;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.249;VQSLOD=5.6723;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,86:180:99:2179,0,2269
5	66459878	.	G	C	458.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=13.7648;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.11:492,42,0
5	66460390	.	G	A	2343.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.429;DP=163;Dels=0.00;FS=2.790;HRun=0;HaplotypeScore=4.9232;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.341;VQSLOD=5.1954;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,86:163:99:2374,0,2016
5	66480004	.	T	C	2282.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=8.7072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2315,178,0
5	68531253	.	C	T	1046.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=120;Dels=0.00;FS=8.819;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.065;VQSLOD=3.5731;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,47:120:99:1076,0,1840
5	68616331	.	C	T	1823.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.008;DP=147;Dels=0.00;FS=5.247;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.757;VQSLOD=5.8568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,74:147:99:1853,0,1726
5	68695940	.	T	G	652.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;DP=86;Dels=0.00;FS=1.828;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=7.58;ReadPosRankSum=-1.285;VQSLOD=3.5300;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,33:86:99:682,0,1270
5	68715310	.	C	T	947.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9881;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.230;VQSLOD=6.3221;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,37:82:99:978,0,1214
5	70307189	.	G	A	735.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;DP=68;Dels=0.00;FS=4.951;HRun=0;HaplotypeScore=3.6379;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.273;VQSLOD=3.6790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,29:68:99:766,0,958
5	70751818	.	T	G	996	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13;VQSLOD=13.8999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:81.25:1029,81,0
5	70800538	.	G	A	1616.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.31;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=8.6645;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1649,132,0
5	70806649	.	T	A	3893.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.97;MQ0=0;QD=30.90;VQSLOD=9.0527;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3893,313,0
5	70806711	.	C	G	4414.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=30.23;VQSLOD=8.5661;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:146:99:4414,334,0
5	70806958	.	G	A	3580.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.40;MQ0=0;QD=28.65;VQSLOD=7.9765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3580,274,0
5	70809169	.	A	G	5989.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.1095;MQ=58.24;MQ0=0;QD=28.52;VQSLOD=4.9924;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,209:210:99:5988,490,0
5	70837295	.	A	C	5082.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.389;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5738;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=31.18;ReadPosRankSum=0.933;VQSLOD=6.8678;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,161:163:99:5082,403,0
5	71739602	.	G	C	1227.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.74;MQ0=0;QD=27.90;VQSLOD=8.1628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:93.30:1261,93,0
5	71756896	.	T	C	2837.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.514;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.691;HRun=2;HaplotypeScore=7.0729;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.079;VQSLOD=2.9750;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:2868,0,3571
5	72348272	.	A	G	151.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.733;VQSLOD=5.0546;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:181,0,313
5	72419267	.	T	C	1728.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;DP=152;Dels=0.00;FS=2.926;HRun=1;HaplotypeScore=4.5391;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=11.37;ReadPosRankSum=-2.545;VQSLOD=4.5146;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,67:152:99:1758,0,2426
5	72419617	.	C	A	2229.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;DP=182;Dels=0.00;FS=1.163;HRun=2;HaplotypeScore=9.3048;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.760;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.888;VQSLOD=3.6512;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,82:182:99:2259,0,2683
5	72427404	.	C	G	1306.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=96;Dels=0.00;FS=1.662;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.783;VQSLOD=6.1696;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,52:96:99:1337,0,1210
5	73072354	.	T	C	3564.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3002;MQ=59.79;MQ0=0;QD=33.01;VQSLOD=9.4421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3564,289,0
5	73207372	.	T	A	303.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.830;DP=28;Dels=0.00;FS=1.792;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.255;VQSLOD=6.0999;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:333,0,423
5	73981270	.	T	C	1131.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=9.1561;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:96.28:1164,96,0
5	75923294	.	T	G	7760.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.0818;MQ=58.12;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=4.0542;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:247:99:7760,599,0
5	75923307	.	A	G	7318	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6995;MQ=58.29;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=8.3579;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,244:244:99:7316,593,0
5	75932965	.	G	C	922	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=90;Dels=0.00;FS=6.995;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.334;VQSLOD=4.2492;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,36:90:99:952,0,1595
5	75996909	.	G	A	848.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.458;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.740;VQSLOD=6.4053;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:62:99:878,0,741
5	76128521	.	G	A	4300.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=9.2084;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4300,337,0
5	76171252	.	A	C	1967.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.380;DP=126;Dels=0.00;FS=8.473;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.860;VQSLOD=4.1134;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,67:126:99:1997,0,1533
5	76734084	.	C	T	2963.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.590;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=0.486;HRun=0;HaplotypeScore=1.9459;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.718;VQSLOD=6.2560;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,115:239:99:2994,0,3066
5	77425028	.	A	T	1607.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.05;MQ0=0;QD=32.81;VQSLOD=9.7331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1641,129,0
5	77745853	.	C	CA	4474.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=227.2648;MQ=60.31;MQ0=0;QD=41.43;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,105:108:99:4474,307,0
5	78324352	.	A	G	2549.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.123;DP=183;Dels=0.00;FS=1.914;HRun=2;HaplotypeScore=3.3715;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.570;VQSLOD=5.6180;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,94:183:99:2579,0,2350
5	78326750	.	G	C	1118.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.868;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.5394;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.503;VQSLOD=3.6488;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,44:102:99:1149,0,1560
5	78340286	.	A	G	1216.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.366;DP=112;Dels=0.00;FS=5.162;HRun=1;HaplotypeScore=3.2090;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.199;VQSLOD=5.4787;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,48:112:99:1246,0,1699
5	78421959	.	G	A	1108.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=91;Dels=0.01;FS=15.843;HRun=1;HaplotypeScore=4.5425;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.602;VQSLOD=3.4033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,43:91:99:1139,0,1199
5	78573790	.	A	T	1307.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.477;VQSLOD=5.9718;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,53:155:99:1337,0,2677
5	79361265	.	G	C	1858.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.9198;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.567;VQSLOD=4.3414;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,84:192:99:1889,0,2783
5	79616083	.	G	C	8044.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.7286;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.57;VQSLOD=8.8520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:247:99:8044,629,0
5	79733079	.	T	C	651.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.666;DP=68;Dels=0.00;FS=3.637;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.057;VQSLOD=5.8448;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,26:68:99:681,0,1114
5	79734297	.	T	C	1039.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=74;Dels=0.00;FS=8.264;HRun=0;HaplotypeScore=1.9945;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.671;VQSLOD=4.5169;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,38:74:99:1070,0,902
5	79735858	.	A	G	1564.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.291;DP=98;Dels=0.00;FS=9.348;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.675;VQSLOD=4.1114;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,55:98:99:1595,0,1083
5	79745469	.	A	G	2032.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.257;DP=198;Dels=0.00;FS=8.343;HRun=1;HaplotypeScore=5.8415;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.516;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.010;VQSLOD=3.4737;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,83:198:99:2063,0,2893
5	79815658	.	T	C	4483.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.73;MQ0=0;QD=29.30;VQSLOD=8.2760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:4483,334,0
5	79855372	.	A	G	3121.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.962;DP=209;Dels=0.00;FS=7.853;HRun=0;HaplotypeScore=5.4482;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.631;VQSLOD=4.5477;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,114:209:99:3151,0,2638
5	80149981	.	A	G	2054.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.08;MQ0=0;QD=28.14;VQSLOD=7.9000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2087,171,0
5	80168937	.	G	A	3337.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9402;MQ=58.70;MQ0=0;QD=29.02;VQSLOD=8.6698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3337,262,0
5	80409526	.	T	C	2028.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=137;Dels=0.00;FS=1.368;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.919;VQSLOD=5.8645;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,70:137:99:2059,0,1800
5	81354389	.	T	C	2465.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.372;DP=213;Dels=0.00;FS=3.192;HRun=1;HaplotypeScore=6.1276;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.579;VQSLOD=5.0036;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,97:213:99:2495,0,2702
5	81549216	.	C	T	2051.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.699;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8917;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.627;VQSLOD=4.7390;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,83:162:99:2082,0,1923
5	81549240	.	C	A	1448.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=115;Dels=0.00;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=2.6566;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.300;VQSLOD=6.0181;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1478,0,1627
5	82554375	.	A	G	1320.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.544;DP=94;Dels=0.00;FS=0.779;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.038;VQSLOD=4.7029;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,52:94:99:1351,0,1022
5	82833369	.	A	G	3050.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.26;MQ0=0;QD=31.45;VQSLOD=8.8779;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3084,238,0
5	82834299	.	G	A	4813.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9679;MQ=59.35;MQ0=0;QD=32.97;VQSLOD=6.8360;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:146:99:4776,382,0
5	82835724	.	T	A	3356.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7653;MQ=58.16;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=7.6951;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3356,271,0
5	82837631	.	G	T	3819.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.85;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=9.5567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3820,292,0
5	89703641	.	C	G	771.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;DP=68;Dels=0.00;FS=0.899;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.920;VQSLOD=4.5613;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,33:68:99:802,0,834
5	89769728	.	T	C	429.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;VQSLOD=13.6640;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:36.10:462,36,0
5	90024735	.	G	A	495.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.528;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.287;VQSLOD=6.2056;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,22:52:99:526,0,764
5	90107108	.	A	G	1544.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.8218;MQ=58.66;MQ0=0;QD=30.89;VQSLOD=8.9685;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1578,120,0
5	90119324	.	G	A	5142.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.57;VQSLOD=8.4390;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:180:99:5142,400,0
5	94772540	.	C	T	2192.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06;VQSLOD=13.8638;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2225,166,0
5	94826655	.	C	A	1020.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;DP=79;Dels=0.00;FS=6.130;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.143;VQSLOD=5.3228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,41:79:99:1051,0,1054
5	94861118	.	G	C	1681.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;DP=145;Dels=0.00;FS=0.619;HRun=0;HaplotypeScore=7.9333;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.967;VQSLOD=4.7644;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,71:145:99:1711,0,1732
5	94939193	.	A	G	558.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;DP=49;Dels=0.00;FS=1.171;HRun=1;HaplotypeScore=2.9978;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.714;VQSLOD=5.2348;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,23:49:99:588,0,687
5	95728898	.	C	G	1649.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;DP=107;Dels=0.00;FS=0.785;HRun=0;HaplotypeScore=4.7262;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.557;VQSLOD=3.9921;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,64:107:99:1679,0,1180
5	95728974	.	G	C	925.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.265;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8229;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.111;VQSLOD=4.9675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,38:76:99:955,0,1011
5	96118852	.	G	C	4070.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.553;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3697;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.134;VQSLOD=3.6414;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,126:249:99:3432,0,3383
5	96124330	.	T	C	1298.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.387;DP=81;Dels=0.00;FS=15.312;HRun=3;HaplotypeScore=2.9979;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=16.03;ReadPosRankSum=-1.329;VQSLOD=3.5669;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,46:81:99:1329,0,991
5	96139250	.	C	G	2516.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.41;MQ0=0;QD=35.45;VQSLOD=9.3113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2550,205,0
5	96139464	.	C	T	1918.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.110;DP=142;Dels=0.00;FS=11.072;HRun=1;HaplotypeScore=4.8600;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.008;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.029;VQSLOD=3.3707;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,73:142:99:1948,0,2065
5	96139595	.	G	A	1356.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.189;DP=127;Dels=0.00;FS=4.430;HRun=0;HaplotypeScore=2.7472;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.609;VQSLOD=5.0881;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,56:127:99:1386,0,1911
5	96231000	.	G	T	1309.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.138;DP=108;Dels=0.00;FS=0.717;HRun=0;HaplotypeScore=4.2329;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.997;VQSLOD=5.1339;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,55:108:99:1339,0,1393
5	96503523	.	C	T	3006.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.969;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.563;HRun=0;HaplotypeScore=5.0877;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.293;VQSLOD=5.3228;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,112:250:99:3037,0,3446
5	96513471	.	G	C	1475.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;DP=118;Dels=0.00;FS=8.460;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.258;VQSLOD=3.9133;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,59:118:99:1505,0,1556
5	101631761	.	T	C	2244.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.482;DP=132;Dels=0.00;FS=1.454;HRun=0;HaplotypeScore=3.8697;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.622;VQSLOD=5.5420;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,81:132:99:2274,0,1293
5	101724448	.	G	C	820.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;DP=68;Dels=0.00;FS=2.058;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.610;VQSLOD=6.0258;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,36:68:99:850,0,755
5	102433409	.	G	A	1725.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.144;DP=138;Dels=0.00;FS=1.399;HRun=0;HaplotypeScore=1.9125;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.013;VQSLOD=6.7314;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,72:138:99:1755,0,1646
5	108281909	.	C	G	1556.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.186;DP=130;Dels=0.00;FS=4.249;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.205;VQSLOD=3.6846;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,64:130:99:1586,0,1691
5	108672946	.	C	T	1103.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.231;DP=147;Dels=0.00;FS=2.245;HRun=0;HaplotypeScore=3.6560;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.806;VQSLOD=4.9250;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,54:147:99:1133,0,2283
5	108714298	.	T	C	1934.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=154;Dels=0.00;FS=3.142;HRun=0;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.502;VQSLOD=6.6234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,79:154:99:1964,0,2044
5	112176756	.	T	A	540.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.820;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.090;VQSLOD=6.8932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:570,0,310
5	112312676	.	T	C	5518.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1099;MQ=58.91;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=8.1739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:5518,436,0
5	112439941	.	T	C	8526.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8920;MQ=59.48;MQ0=0;QD=34.38;VQSLOD=9.4366;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,247:248:99:8525,668,0
5	112929013	.	T	A	1627.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.98;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=8.9109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1661,129,0
5	114462355	.	C	T	990.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;DP=79;Dels=0.00;FS=1.865;HRun=1;HaplotypeScore=1.9972;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=6.1833;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,39:79:99:1021,0,1175
5	115298475	.	T	C	633.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=71;Dels=0.00;FS=3.744;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.302;VQSLOD=6.1787;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,27:71:99:663,0,1206
5	115341638	.	G	C	2878.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=9.2024;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2912,217,0
5	115813726	.	A	G	7614.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4048;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=7.9589;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:7614,581,0
5	118513876	.	G	A	959.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7334;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.049;VQSLOD=5.0723;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,37:60:99:990,0,587
5	118811533	.	G	A	463	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.926;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.471;VQSLOD=5.6986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,22:75:99:493,0,1332
5	118835033	.	C	T	755.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;DP=67;Dels=0.00;FS=5.207;HRun=1;HaplotypeScore=2.7802;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.161;VQSLOD=3.1750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,34:67:99:785,0,909
5	118861713	.	A	G	826.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=65;Dels=0.00;FS=6.343;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.046;VQSLOD=4.8369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,32:65:99:857,0,935
5	118969960	.	C	T	2485.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6567;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.586;VQSLOD=6.4903;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,94:190:99:2516,0,2665
5	121488506	.	C	G	1378.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.431;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=6.2369;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,53:95:99:1408,0,1180
5	122718736	.	G	C	155.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.902;VQSLOD=4.7123;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:186,0,291
5	123983915	.	G	T	1117.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=80;Dels=0.00;FS=8.818;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.847;VQSLOD=4.5638;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,41:80:99:1147,0,1090
5	125887715	.	T	G	377.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.251;DP=42;Dels=0.00;FS=2.755;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.437;VQSLOD=5.7980;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,17:42:99:407,0,662
5	126993263	.	A	T	4196.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.35;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=9.0101;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4196,352,0
5	127685135	.	C	T	858.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=81;Dels=0.00;FS=1.867;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.495;VQSLOD=5.6530;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,33:81:99:888,0,1164
5	128301885	.	T	G	1170.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.882;DP=117;Dels=0.00;FS=3.150;HRun=0;HaplotypeScore=2.5257;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.279;VQSLOD=6.0786;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,51:117:99:1200,0,1967
5	128863471	.	A	G	2285.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.4972;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.89;VQSLOD=6.9401;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2319,169,0
5	129040056	.	A	T	2348.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.755;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7232;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.651;VQSLOD=4.2919;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,89:182:99:2378,0,2442
5	129521126	.	A	G	1760.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.594;DP=130;Dels=0.00;FS=11.159;HRun=1;HaplotypeScore=3.7304;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=4.2015;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,67:130:99:1790,0,1593
5	130766662	.	T	C	6795.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2517;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.34;VQSLOD=8.6210;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,224:224:99:6794,551,0
5	131008194	.	T	C	6524.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9920;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=8.9989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6524,533,0
5	131066725	.	C	A	2675.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;QD=31.85;VQSLOD=9.0590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2709,211,0
5	131663062	.	T	C	1821.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9970;MQ=58.26;MQ0=0;QD=28.45;VQSLOD=8.2874;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1854,141,0
5	131676320	.	C	T	7726.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.1966;MQ=58.97;MQ0=0;QD=32.60;VQSLOD=9.5844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:237:99:7726,608,0
5	131995964	.	A	G	2421.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.9469;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2454,196,0
5	132150948	.	T	G	1693.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=59.31;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=9.6651;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1726,132,0
5	132535046	.	G	A	1024.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.878;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7883;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.103;VQSLOD=6.3877;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,40:79:99:1054,0,956
5	132652281	.	C	T	1368.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.596;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9469;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.261;VQSLOD=5.1937;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,50:105:99:1399,0,1344
5	134364518	.	C	G	440.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.443;DP=31;Dels=0.00;FS=7.732;HRun=2;HaplotypeScore=1.8914;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.731;VQSLOD=4.4270;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:470,0,424
5	134782450	.	T	A	4125.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.911;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=1.071;HRun=0;HaplotypeScore=2.5564;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.388;VQSLOD=5.8476;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,122:236:99:3499,0,3273
5	134782510	.	T	C	1739.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.637;DP=135;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7279;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.622;VQSLOD=3.8946;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,73:135:99:1769,0,1704
5	134782576	.	T	G	679.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.299;DP=48;Dels=0.00;FS=6.149;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.258;VQSLOD=5.0975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,24:48:99:709,0,633
5	135276201	.	AGTT	A	435.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.984;DP=25;FS=4.678;HRun=0;HaplotypeScore=105.8224;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.849;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:475,0,840
5	135276314	.	C	T	658.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.024;DP=62;Dels=0.00;FS=5.351;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.290;VQSLOD=5.1154;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,28:62:99:689,0,908
5	135276814	.	G	A	2068.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;DP=133;Dels=0.00;FS=0.658;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.609;VQSLOD=5.6503;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,74:133:99:2099,0,1495
5	135276847	.	T	C	1534.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;DP=130;Dels=0.00;FS=1.419;HRun=0;HaplotypeScore=1.9874;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.887;VQSLOD=6.3450;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,64:130:99:1565,0,1698
5	135287029	.	T	C	2131.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;DP=158;Dels=0.00;FS=1.253;HRun=0;HaplotypeScore=4.5206;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.187;VQSLOD=5.6728;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,86:158:99:2161,0,1793
5	135288632	.	A	G	3071.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.558;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=0.570;HRun=0;HaplotypeScore=5.2219;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.321;VQSLOD=4.7828;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,108:214:99:3102,0,2655
5	135513085	.	T	TC	2139.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=103.1643;MQ=59.77;MQ0=0;QD=46.52;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2182,138,0
5	137206560	.	A	C	4875.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.4304;MQ=58.82;MQ0=0;QD=34.34;VQSLOD=9.0800;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4875,379,0
5	137244517	.	G	A	897.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.729;DP=75;Dels=0.00;FS=12.268;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.218;VQSLOD=4.3462;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,35:75:99:928,0,1118
5	137259179	.	T	C	3215.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.31;MQ0=0;QD=27.96;VQSLOD=8.4444;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3249,238,0
5	137476416	.	T	C	8310.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8224;MQ=58.73;MQ0=0;QD=33.38;VQSLOD=7.4543;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:249:99:8309,665,0
5	137500665	.	G	A	3988.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.723;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.154;HRun=0;HaplotypeScore=4.8563;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.815;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.474;VQSLOD=4.2344;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,126:249:99:3376,0,3022
5	137522945	.	C	T	583.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9894;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.026;VQSLOD=5.8911;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,26:81:99:613,0,1613
5	137717265	.	G	A	2998.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.05;MQ0=0;QD=29.11;VQSLOD=8.4489;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3031,247,0
5	138713959	.	A	C	425.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62;VQSLOD=13.3512;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:36.11:459,36,0
5	138857919	.	T	C	4912.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5845;MQ=59.70;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=8.7352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4911,409,0
5	139931628	.	A	AGT	1000.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.756;DP=82;FS=4.851;HRun=0;HaplotypeScore=334.8073;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.398;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,20:82:99:1039,0,2160
5	139931629	.	C	CG	733.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=80;FS=4.958;HRun=0;HaplotypeScore=311.3443;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.143;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,20:80:99:772,0,1807
5	139936760	.	G	T	1284.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.048;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2156;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.662;VQSLOD=4.4096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,52:113:99:1315,0,1509
5	139941228	.	A	G	6770.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.9133;MQ=59.35;MQ0=0;QD=33.68;VQSLOD=6.0990;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:6769,557,0
5	140048267	.	T	C	4848.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4994;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=8.1730;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:4848,394,0
5	140168070	.	A	G	4887.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4440;MQ=59.71;MQ0=0;QD=34.42;VQSLOD=8.1445;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4887,388,0
5	140168151	.	G	T	3473.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5655;MQ=59.10;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=8.1461;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3473,289,0
5	140174622	.	G	A	3105.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.1345;MQ=53.81;MQ0=1;QD=30.44;VQSLOD=3.4226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,100:102:99:3138,271,0
5	140174865	.	G	C	8685.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5145;MQ=56.70;MQ0=1;MQRankSum=1.155;QD=35.17;ReadPosRankSum=0.113;VQSLOD=3.8492;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,246:247:99:8685,686,0
5	140181734	.	A	G	6818.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.40;MQ0=0;QD=33.10;VQSLOD=8.8328;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,206:206:99:6818,530,0
5	140182101	.	G	T	7988.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6439;MQ=58.10;MQ0=0;QD=31.95;VQSLOD=6.4062;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7987,674,0
5	140183058	.	G	A	6609.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5786;MQ=59.31;MQ0=0;QD=30.46;VQSLOD=7.8028;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:217:99:6608,548,0
5	140187322	.	C	T	1942.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.96;MQ0=0;QD=29.89;VQSLOD=8.8135;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1976,159,0
5	140203432	.	C	T	5928.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6565;MQ=59.32;MQ0=0;QD=29.06;VQSLOD=7.8887;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:204:99:5927,496,0
5	140216042	.	G	A	3196.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.880;HRun=1;HaplotypeScore=6.2215;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.909;VQSLOD=4.6556;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3227,0,3384
5	140222641	.	A	G	6510.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4310;MQ=58.82;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=7.7597;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,208:208:99:6509,560,0
5	140230370	.	A	C	2945.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.490;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=6.265;HRun=0;HaplotypeScore=7.4318;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.410;VQSLOD=4.2317;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,109:245:99:2976,0,3438
5	140230371	.	A	C	2788.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=7.145;HRun=0;HaplotypeScore=7.4318;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.003;VQSLOD=4.0116;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,113:246:99:2819,0,3610
5	140474756	.	G	A	647.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.166;DP=38;Dels=0.00;FS=3.003;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.530;VQSLOD=5.5638;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,24:38:99:678,0,373
5	140480355	.	A	G	867.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.604;DP=66;Dels=0.00;FS=10.444;HRun=3;HaplotypeScore=1.9465;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.274;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.156;VQSLOD=3.9515;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,31:66:99:898,0,946
5	140517174	.	T	C	7352.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.7787;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.562;VQSLOD=6.0095;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,229:230:99:7351,596,0
5	140530718	.	G	T	1401.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.903;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HRun=0;HaplotypeScore=3.0110;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=10.46;ReadPosRankSum=-2.220;VQSLOD=4.5340;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,54:134:99:1431,0,2039
5	140553581	.	G	C	1491.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;DP=107;Dels=0.00;FS=4.806;HRun=0;HaplotypeScore=8.1237;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.174;VQSLOD=3.7271;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,54:107:99:1522,0,1468
5	140567608	.	C	T	912.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.211;DP=73;Dels=0.00;FS=0.996;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.441;VQSLOD=4.5082;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,38:73:99:943,0,1089
5	140568034	.	C	CA	3044.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=153.7842;MQ=60.18;MQ0=0;QD=40.60;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,69:75:99:3087,208,0
5	140572763	.	C	G	2620.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.189;DP=197;DS;Dels=0.00;FS=1.374;HRun=0;HaplotypeScore=5.2255;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.180;VQSLOD=4.6565;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,94:197:99:2651,0,2994
5	140589738	.	C	T	2881.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=198;Dels=0.00;FS=5.855;HRun=0;HaplotypeScore=6.8657;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.753;VQSLOD=3.4842;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,109:198:99:2912,0,2459
5	140590766	.	A	G	2132.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.541;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5905;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.261;VQSLOD=5.5347;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,82:163:99:2163,0,2145
5	140710705	.	G	A	7855.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6538;MQ=59.82;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=9.1830;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:7854,620,0
5	140750044	.	T	C	1996.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6385;MQ=59.65;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=9.4230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2030,156,0
5	140773812	.	G	A	736.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.786;DP=59;Dels=0.00;FS=8.433;HRun=1;HaplotypeScore=1.9153;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.592;VQSLOD=3.1677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,27:59:99:767,0,820
5	141244356	.	C	T	2279.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=202;Dels=0.00;FS=4.473;HRun=0;HaplotypeScore=3.8410;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.530;VQSLOD=5.0454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,92:202:99:2310,0,2914
5	141307833	.	T	C	1748.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=136;Dels=0.00;FS=5.375;HRun=1;HaplotypeScore=3.1576;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.602;VQSLOD=5.0419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,67:136:99:1778,0,1844
5	141336264	.	G	T	5411.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5661;MQ=59.62;MQ0=0;QD=34.03;VQSLOD=9.8093;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:5411,430,0
5	143200053	.	C	T	2930.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-11.302;DP=242;Dels=0.00;FS=1.811;HRun=0;HaplotypeScore=2.7603;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.142;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.345;VQSLOD=5.8585;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,117:242:99:2960,0,3353
5	145246085	.	T	G	5372.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=5.2740;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.101;VQSLOD=7.9598;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,171:172:99:5346,390,0
5	145393364	.	C	T	3961.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6899;MQ=59.13;MQ0=0;QD=32.20;VQSLOD=7.7088;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:3961,307,0
5	145439647	.	T	C	2802.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.44;MQ0=0;QD=31.13;VQSLOD=8.6711;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:90:99:2835,232,0
5	145442203	.	G	C	3061.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5221;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.57;VQSLOD=8.5738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3094,241,0
5	145894896	.	G	C	1283.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;DP=111;Dels=0.00;FS=5.908;HRun=0;HaplotypeScore=2.8553;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.797;VQSLOD=4.8670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,50:111:99:1313,0,1760
5	147286054	.	G	A	2599.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9950;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.265;VQSLOD=7.4697;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,88:89:99:2632,174,0
5	147475386	.	A	G	370.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;DP=46;Dels=0.00;FS=1.197;HRun=1;HaplotypeScore=1.9992;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.281;VQSLOD=4.7944;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,18:46:99:401,0,697
5	147477551	.	C	T	549.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=53;Dels=0.00;FS=9.496;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.547;VQSLOD=2.3438;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,23:53:99:579,0,781
5	147480955	.	A	G	1576.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.532;DP=125;Dels=0.00;FS=6.737;HRun=0;HaplotypeScore=2.7067;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.694;VQSLOD=4.9822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1606,0,1486
5	147498019	.	G	A	1911	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.537;DP=146;Dels=0.00;FS=2.993;HRun=0;HaplotypeScore=3.7515;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.393;VQSLOD=5.8367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,72:146:99:1941,0,1825
5	147593497	.	C	A	5933.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3503;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=27.73;ReadPosRankSum=-1.258;VQSLOD=6.8693;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,211:213:99:5933,454,0
5	148206440	.	G	A	3891	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.5245;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.97;VQSLOD=5.1939;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3890,319,0
5	148206473	.	G	C	4720.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=33.72;ReadPosRankSum=0.520;VQSLOD=9.7168;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,139:140:99:4720,361,0
5	149001551	.	A	C	1420.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5731;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.51;VQSLOD=8.9167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1453,117,0
5	149003627	.	C	T	1724.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.109;DP=127;Dels=0.00;FS=0.680;HRun=0;HaplotypeScore=5.2914;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=13.57;ReadPosRankSum=-2.703;VQSLOD=3.7839;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,69:127:99:1754,0,1714
5	149006726	.	A	C	2785.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.465;HRun=1;HaplotypeScore=4.3614;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.180;VQSLOD=5.6535;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,114:250:99:2815,0,3997
5	149008521	.	A	G	936.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;DP=79;Dels=0.00;FS=6.983;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.634;VQSLOD=5.1257;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,37:79:99:966,0,1058
5	149219653	.	G	A	579.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;DP=65;Dels=0.00;FS=1.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.977;VQSLOD=4.0860;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,26:65:99:610,0,919
5	149360877	.	T	C	2740.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.98;MQ0=0;QD=32.62;VQSLOD=9.9976;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2773,217,0
5	149374879	.	CT	C	6304.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=680.1418;MQ=60.81;MQ0=0;QD=37.98;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,165:166:99:6304,491,0
5	149374932	.	T	C	6375.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.8647;MQ=59.62;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=7.4220;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:6375,521,0
5	149585025	.	A	C	3177.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.81;MQ0=0;QD=29.98;VQSLOD=8.9949;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3211,244,0
5	149772280	.	C	G	467.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.369;DP=39;Dels=0.00;FS=1.243;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.436;VQSLOD=5.8823;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:498,0,512
5	149776232	.	C	T	171.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;DP=19;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.939;VQSLOD=4.8974;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:202,0,252
5	150051958	.	T	C	686.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.47;VQSLOD=7.4472;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:60.15:720,60,0
5	150436503	.	G	C	573.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=45;Dels=0.00;FS=1.306;HRun=1;HaplotypeScore=1.6642;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.261;VQSLOD=5.6175;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,23:45:99:604,0,654
5	150639409	.	A	G	2233.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8835;MQ=57.12;MQ0=0;QD=28.27;VQSLOD=5.6326;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2266,186,0
5	150639439	.	A	G	1998.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.756;VQSLOD=7.8299;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,70:71:99:2031,165,0
5	150886882	.	G	A	3880.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.27;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=9.7127;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3880,301,0
5	150901261	.	C	T	2096.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.43;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=9.5325;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2130,175,0
5	150901613	.	A	G	2874.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3965;MQ=58.71;MQ0=0;QD=32.66;VQSLOD=8.6272;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2907,238,0
5	150923405	.	A	G	2464.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=35.21;VQSLOD=9.1288;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2498,199,0
5	150942919	.	A	G	3484.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5657;MQ=59.58;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.3295;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3484,265,0
5	150942969	.	G	A	4702.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=9.5950;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4702,370,0
5	150945483	.	C	T	1929.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.38;MQ0=0;QD=32.16;VQSLOD=9.9356;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1962,156,0
5	150946436	.	A	G	6542.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7866;MQ=58.88;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.6745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:6542,503,0
5	150946773	.	G	A	5305.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.85;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=9.0231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:5305,415,0
5	150947891	.	C	G	2565.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;DP=176;Dels=0.00;FS=1.978;HRun=0;HaplotypeScore=1.9990;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.856;VQSLOD=5.5966;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,93:176:99:2595,0,2424
5	151771817	.	C	T	4614.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9142;MQ=58.92;MQ0=0;QD=30.16;VQSLOD=9.1404;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:4613,370,0
5	151771838	.	T	C	1152.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;DP=147;Dels=0.00;FS=2.232;HRun=0;HaplotypeScore=1.9258;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.054;VQSLOD=5.8679;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,51:147:99:1183,0,2695
5	151771852	.	G	A	1188.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;DP=146;Dels=0.00;FS=4.245;HRun=0;HaplotypeScore=5.4609;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.069;VQSLOD=4.3280;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,48:146:99:1218,0,2865
5	151772055	.	G	T	1256.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.115;DP=111;Dels=0.00;FS=3.038;HRun=0;HaplotypeScore=4.5438;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.215;VQSLOD=5.0990;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,47:111:99:1287,0,1713
5	151775064	.	C	G	2286.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;DP=156;Dels=0.00;FS=3.725;HRun=0;HaplotypeScore=9.4813;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=3.6763;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,84:156:99:2316,0,1839
5	153413390	.	C	T	687.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.861;DP=65;Dels=0.00;FS=0.962;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.599;VQSLOD=3.9933;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,33:65:99:718,0,754
5	154203121	.	C	T	1407.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.521;DP=112;Dels=0.00;FS=6.461;HRun=0;HaplotypeScore=4.1192;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=12.57;ReadPosRankSum=2.109;VQSLOD=4.2554;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,55:112:99:1437,0,1322
5	154291409	.	C	T	2724.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.07;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=9.5226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2757,214,0
5	154395158	.	G	T	1622.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=112;Dels=0.00;FS=7.963;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.003;VQSLOD=4.9700;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,58:112:99:1653,0,1332
5	156376703	.	A	G	1022.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.526;DP=97;Dels=0.00;FS=3.959;HRun=0;HaplotypeScore=2.4167;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.081;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.230;VQSLOD=5.4126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,42:97:99:1052,0,1490
5	156721863	.	T	TC	2281.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=117.3606;MQ=60.35;MQ0=0;QD=39.33;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,56:58:99:2323,169,0
5	156936364	.	T	C	2089.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.73;MQ0=0;QD=30.73;VQSLOD=9.3098;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2123,174,0
5	157164962	.	T	C	1183.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.969;DP=102;Dels=0.00;FS=0.750;HRun=1;HaplotypeScore=3.5318;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.411;VQSLOD=5.5804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,52:102:99:1213,0,1228
5	159659273	.	C	T	1226.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=58.84;MQ0=0;QD=30.66;VQSLOD=9.1436;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1260,99,0
5	159835658	.	A	G	1795.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=56.73;MQ0=0;QD=26.80;VQSLOD=5.6320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1829,141,0
5	160042903	.	G	T	2261.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.388;DP=178;Dels=0.00;FS=3.815;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.104;VQSLOD=5.8992;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,92:178:99:2291,0,2341
5	160047759	.	C	T	2177.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;DP=158;Dels=0.00;FS=0.603;HRun=0;HaplotypeScore=4.7331;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.185;VQSLOD=5.1621;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,75:158:99:2208,0,2315
5	160097496	.	A	G	7473.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8598;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.38;VQSLOD=8.9223;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:246:99:7472,620,0
5	162911075	.	C	A	802.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=67;Dels=0.00;FS=2.117;HRun=0;HaplotypeScore=4.8751;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.064;VQSLOD=4.6031;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,35:67:99:832,0,778
5	168212951	.	A	G	6306.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.88;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=9.5687;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:6306,479,0
5	169028481	.	T	C	907.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.445;DP=71;Dels=0.00;FS=2.002;HRun=0;HaplotypeScore=4.8579;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.178;VQSLOD=5.6417;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,35:71:99:938,0,866
5	169031150	.	T	C	981.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4957;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.127;VQSLOD=5.8312;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,38:76:99:1011,0,1034
5	169661994	.	G	C	141.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=12;Dels=0.00;FS=2.632;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.000;VQSLOD=6.3449;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:171,0,106
5	174156168	.	T	C	3485.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8024;MQ=58.94;MQ0=0;QD=33.19;VQSLOD=8.8241;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:105:99:3485,277,0
5	175995711	.	C	A	1948.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=147;Dels=0.00;FS=1.390;HRun=1;HaplotypeScore=1.9931;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.858;VQSLOD=5.8076;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,74:147:99:1978,0,2158
5	176004476	.	T	C	420.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07;VQSLOD=13.6791;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.11:454,36,0
5	176017639	.	C	A	2968.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.541;DP=229;Dels=0.00;FS=3.018;HRun=0;HaplotypeScore=7.5758;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.699;VQSLOD=4.6641;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,117:229:99:2999,0,3225
5	176025938	.	T	C	6428.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2766;MQ=59.44;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=8.6764;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6427,514,0
5	176517797	.	C	T	2238.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5940;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.056;VQSLOD=6.2594;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,85:147:99:2269,0,1576
5	176831826	.	C	G	358.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;DP=22;Dels=0.00;FS=8.280;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.184;VQSLOD=3.7153;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,16:22:99:388,0,175
5	176885178	.	A	G	2159.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9933;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79;VQSLOD=7.1560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:75:99:2192,172,0
5	176885499	.	T	C	5124.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.2175;MQ=58.75;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=7.8525;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:157:99:5101,397,0
5	176936819	.	C	G	278.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.844;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.142;VQSLOD=6.3242;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:309,0,390
5	176951276	.	A	G	711.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.156;VQSLOD=7.1599;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:34.55:745,35,0
5	177422876	.	T	C	3023.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7781;MQ=58.12;MQ0=0;QD=28.53;VQSLOD=6.8404;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:106:99:3057,250,0
5	177546780	.	A	G	2545.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=216;Dels=0.00;FS=0.527;HRun=1;HaplotypeScore=4.0285;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.158;VQSLOD=4.1807;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,107:216:99:2576,0,3104
5	177683377	.	T	C	159.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9584;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.049;VQSLOD=3.3481;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:18:99:190,0,212
5	178294060	.	G	A	6319.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5650;MQ=57.50;MQ0=1;QD=28.60;VQSLOD=6.0586;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:221:99:6319,488,0
5	178391902	.	A	C	3368.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7782;MQ=58.65;MQ0=0;QD=29.81;VQSLOD=8.7713;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3368,259,0
5	178409927	.	G	A	1444.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=158;Dels=0.00;FS=0.622;HRun=0;HaplotypeScore=2.8452;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.846;VQSLOD=5.1887;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,66:158:99:1474,0,2553
5	178507069	.	T	C	2328.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46;VQSLOD=9.3156;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2361,181,0
5	178507090	.	G	A	1789.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34;VQSLOD=13.2218;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1823,141,0
5	178540975	.	G	A	2437.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=177;Dels=0.00;FS=3.550;HRun=0;HaplotypeScore=11.0682;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.970;VQSLOD=3.9982;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,97:177:99:2467,0,2115
5	178634672	.	C	T	3140.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.380;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=4.966;HRun=0;HaplotypeScore=8.1556;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.013;VQSLOD=4.1753;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,113:216:99:3171,0,2546
5	179201847	.	G	A	2268.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.221;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8991;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.434;VQSLOD=5.3381;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,92:219:99:2299,0,3408
5	179229032	.	G	A	2096.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=157;Dels=0.00;FS=0.592;HRun=1;HaplotypeScore=3.3992;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.161;VQSLOD=5.8902;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,81:157:99:2127,0,1909
5	179267949	.	T	C	264.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.585;VQSLOD=6.8668;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:295,0,249
5	179321458	.	C	T	771.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;DP=58;Dels=0.00;FS=4.798;HRun=0;HaplotypeScore=1.9874;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.497;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.101;VQSLOD=3.4038;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,28:58:99:802,0,893
5	180166461	.	C	G	7025.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5452;MQ=59.20;MQ0=0;QD=33.61;VQSLOD=7.8344;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:7024,557,0
5	180218668	.	A	G	846	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.264;VQSLOD=6.7925;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:876,0,903
5	180338368	.	A	G	4240.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.262;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.468;HRun=0;HaplotypeScore=3.7724;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=16.96;ReadPosRankSum=2.291;VQSLOD=4.6677;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:250:99:3553,0,3379
5	180377470	.	G	A	3968.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.27;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=8.9110;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:3968,334,0
5	180486785	.	G	C	884.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63;VQSLOD=12.6137;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:81.20:917,81,0
5	180582604	.	A	G	2874.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.591;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.017;HRun=0;HaplotypeScore=3.5301;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.387;VQSLOD=6.1496;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,111:245:99:2905,0,3583
6	656143	.	C	A	1706.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=128;Dels=0.00;FS=0.752;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.528;VQSLOD=6.8035;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,68:128:99:1736,0,1574
6	656343	.	T	C	2706.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2023;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.223;VQSLOD=5.4539;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,104:212:99:2737,0,2952
6	2749381	.	C	T	1236.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9448;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.771;VQSLOD=6.4103;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,50:118:99:1267,0,1819
6	2955802	.	T	C	1695.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.722;DP=126;Dels=0.00;FS=1.421;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.666;VQSLOD=6.0659;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,62:126:99:1725,0,1655
6	3010390	.	C	T	2475.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=9.3567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2508,196,0
6	3012778	.	G	A	1652.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=121;Dels=0.00;FS=3.335;HRun=0;HaplotypeScore=2.5803;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.200;VQSLOD=5.9238;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,62:121:99:1682,0,1544
6	3727811	.	C	G	3410.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=9.3079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3410,262,0
6	4069166	.	C	T	1554.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.339;DP=131;Dels=0.00;FS=0.661;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.340;VQSLOD=6.3421;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,61:131:99:1584,0,1797
6	4087949	.	A	T	4210.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.742;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=1.188;HRun=0;HaplotypeScore=3.5918;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.217;VQSLOD=5.1462;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,132:239:99:3586,0,2721
6	4996543	.	C	T	1022.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=75;Dels=0.00;FS=3.132;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.563;VQSLOD=4.7450;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,37:75:99:1052,0,1184
6	6152137	.	C	G	3428.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.812;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6452;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.125;VQSLOD=8.0076;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,107:109:99:3384,223,0
6	6152140	.	C	T	1574.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;DP=108;Dels=0.00;FS=6.339;HRun=1;HaplotypeScore=3.6452;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.994;VQSLOD=4.5372;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,59:108:99:1605,0,1262
6	7211818	.	G	A	3669.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=58.33;MQ0=0;QD=29.36;VQSLOD=8.4891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3669,280,0
6	7247248	.	T	C	677.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.66;VQSLOD=14.1539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57.17:711,57,0
6	7247344	.	C	A	1992.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3162;MQ=59.68;MQ0=0;QD=28.06;VQSLOD=6.5861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,70:71:99:2025,162,0
6	7310259	.	A	G	3785.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4385;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=32.08;ReadPosRankSum=1.288;VQSLOD=8.7073;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,116:118:99:3785,295,0
6	7374207	.	T	G	911.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.300;DP=71;Dels=0.00;FS=17.088;HRun=0;HaplotypeScore=2.9872;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.296;VQSLOD=3.6341;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,36:71:99:941,0,855
6	10587038	.	C	G	5589.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3658;MQ=58.91;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=8.3715;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5589,430,0
6	10955408	.	C	T	6918.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7152;MQ=59.05;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=8.2746;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:237:99:6918,545,0
6	12120588	.	C	T	4893.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3800;MQ=59.18;MQ0=0;QD=33.29;VQSLOD=8.2964;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4893,388,0
6	12122174	.	A	G	3074.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7641;MQ=59.32;MQ0=0;QD=32.03;VQSLOD=8.7814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3108,259,0
6	12122645	.	A	G	6455.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6701;MQ=59.11;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=8.2090;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6455,532,0
6	12124855	.	G	A	5685.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=9.8144;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5685,466,0
6	12296255	.	G	T	2606.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.315;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=3.012;HRun=0;HaplotypeScore=6.3678;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.420;VQSLOD=5.0678;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,111:228:99:2636,0,2927
6	16145325	.	A	G	3175.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=0.518;HRun=0;HaplotypeScore=8.9950;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.326;VQSLOD=4.2548;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,114:207:99:3205,0,2457
6	16290761	.	T	A	4307.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=0.505;HRun=0;HaplotypeScore=1.9965;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.456;VQSLOD=5.2198;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,136:240:99:3635,0,2857
6	18122506	.	G	A	392.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=35;Dels=0.00;FS=2.026;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.488;VQSLOD=5.9603;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:422,0,565
6	24291203	.	T	C	1715.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.77;VQSLOD=9.4236;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1749,141,0
6	24437445	.	G	A	7663.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4418;MQ=59.06;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=7.3765;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:242:99:7662,635,0
6	24437458	.	T	C	2534.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;DP=242;Dels=0.00;FS=0.480;HRun=0;HaplotypeScore=7.7941;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.837;VQSLOD=3.8984;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,99:242:99:2564,0,3932
6	24489652	.	C	T	1517.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;DP=121;Dels=0.00;FS=0.818;HRun=0;HaplotypeScore=2.3294;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.127;VQSLOD=6.3355;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,58:121:99:1548,0,1681
6	24503590	.	C	T	1012.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.122;DP=93;Dels=0.00;FS=2.890;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.412;VQSLOD=6.6630;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,37:93:99:1042,0,1482
6	24551664	.	T	C	1613.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=116;Dels=0.00;FS=1.549;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.373;VQSLOD=5.6493;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,60:116:99:1644,0,1400
6	24551729	.	T	C	1391.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.397;DP=109;Dels=0.00;FS=0.732;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.119;VQSLOD=4.8230;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,56:109:99:1422,0,1353
6	24596478	.	T	G	4620.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.5519;MQ=59.85;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=8.4778;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:4620,355,0
6	25426768	.	G	A	1063.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.029;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.604;VQSLOD=6.7733;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,46:98:99:1093,0,1208
6	25605091	.	G	A	93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=13;Dels=0.00;FS=2.276;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.092;VQSLOD=2.9219;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:123,0,236
6	25776949	.	G	A	1914.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.081;DP=146;Dels=0.00;FS=2.983;HRun=0;HaplotypeScore=5.6795;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.133;VQSLOD=4.5678;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,75:146:99:1945,0,2087
6	25813150	.	G	A	844.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;DP=70;Dels=0.00;FS=2.102;HRun=1;HaplotypeScore=2.3683;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.788;VQSLOD=5.7777;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:874,0,983
6	26107790	.	G	T	2598.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.480;DP=195;Dels=0.00;FS=2.540;HRun=2;HaplotypeScore=3.2838;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.794;VQSLOD=6.0811;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,102:195:99:2628,0,2452
6	26108282	.	C	G	3401.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1713;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=9.1025;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:107:99:3401,274,0
6	26184102	.	G	A	4008.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.506;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.358;HRun=0;HaplotypeScore=3.9795;MQ=57.88;MQ0=1;MQRankSum=0.616;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.070;VQSLOD=3.8396;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,120:248:99:3336,0,3358
6	26505362	.	G	A	3810.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.17;MQ0=0;QD=30.98;VQSLOD=9.1573;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:3810,313,0
6	26509330	.	C	G	5626.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6268;MQ=59.24;MQ0=0;QD=30.58;VQSLOD=7.9026;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:184:99:5626,436,0
6	27425185	.	C	A	2045.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.11;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=8.6809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2078,165,0
6	28228342	.	A	G	1613.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=9.3557;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1647,126,0
6	28254862	.	G	C	1062.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;DP=78;Dels=0.00;FS=0.991;HRun=0;HaplotypeScore=1.9931;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.789;VQSLOD=5.4162;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,39:78:99:1093,0,1033
6	28294550	.	T	C	1416.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.415;DP=96;Dels=0.00;FS=12.146;HRun=0;HaplotypeScore=2.6191;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.040;VQSLOD=4.4027;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,52:96:99:1447,0,1225
6	28327371	.	G	C	1414.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.591;DP=123;Dels=0.00;FS=9.186;HRun=0;HaplotypeScore=6.6306;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.663;VQSLOD=4.3108;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,52:123:99:1444,0,1784
6	28478555	.	A	T	2218.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.338;DP=181;Dels=0.00;FS=7.482;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.450;VQSLOD=4.2308;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,89:181:99:2248,0,2361
6	28483482	.	A	C	4729.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.85;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=8.1580;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:4729,352,0
6	28499567	.	T	C	3158.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.172;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.542;HRun=2;HaplotypeScore=6.2576;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.167;VQSLOD=4.2682;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,113:250:99:3188,0,3978
6	28543089	.	G	T	987.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.250;DP=75;Dels=0.00;FS=0.896;HRun=1;HaplotypeScore=1.8932;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.798;VQSLOD=5.9455;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,39:75:99:1017,0,981
6	28963248	.	T	G	1467.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.735;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8919;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.407;VQSLOD=6.3186;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,55:110:99:1498,0,1500
6	29080349	.	A	G	5298.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9849;MQ=58.37;MQ0=0;QD=33.11;VQSLOD=9.2562;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:5298,415,0
6	29080450	.	G	A	5108.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1534;MQ=58.96;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=7.6592;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:168:99:5085,403,0
6	29141632	.	T	C	2814.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.243;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=1.665;HRun=1;HaplotypeScore=4.1879;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.162;VQSLOD=5.1203;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,99:221:99:2844,0,3307
6	29141743	.	A	G	7752.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6632;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=31.01;ReadPosRankSum=-0.014;VQSLOD=6.5660;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:7728,651,0
6	29141849	.	T	C	4564.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.555;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=1.661;HRun=0;HaplotypeScore=4.3830;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.904;VQSLOD=3.9281;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,133:242:99:3904,0,3018
6	29142064	.	A	G	2787.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.046;DP=230;Dels=0.00;FS=5.492;HRun=0;HaplotypeScore=6.3421;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.659;VQSLOD=3.9646;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,102:230:99:2818,0,3243
6	29142317	.	C	T	1721.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.152;DP=121;Dels=0.00;FS=1.586;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.554;VQSLOD=6.0136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,70:121:99:1751,0,1181
6	29274486	.	T	C	1835.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.395;DP=170;Dels=0.00;FS=1.210;HRun=0;HaplotypeScore=2.9058;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.070;VQSLOD=6.5817;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,78:170:99:1866,0,2320
6	29323838	.	A	C	1301.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.606;DP=117;Dels=0.00;FS=3.494;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.353;VQSLOD=5.1597;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,54:117:99:1332,0,1653
6	29364615	.	G	T	2273.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;DP=163;Dels=0.00;FS=0.600;HRun=2;HaplotypeScore=3.5171;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.635;VQSLOD=6.3928;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,78:163:99:2304,0,2458
6	29364643	.	T	C	1696.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.923;DP=131;Dels=0.00;FS=1.403;HRun=3;HaplotypeScore=2.6766;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.035;VQSLOD=5.8707;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,63:131:99:1727,0,1958
6	29364787	.	C	T	2967.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4303;MQ=59.25;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=9.2485;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3001,247,0
6	29364835	.	T	G	1241.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.860;DP=92;Dels=0.00;FS=3.260;HRun=0;HaplotypeScore=6.2435;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=3.8168;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,49:92:99:1271,0,1255
6	29364951	.	G	A	1763.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.723;DP=144;Dels=0.00;FS=2.970;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.832;VQSLOD=5.5800;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,69:144:99:1794,0,2106
6	29394926	.	C	T	830.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;DP=64;Dels=0.00;FS=8.830;HRun=0;HaplotypeScore=1.8857;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.048;VQSLOD=4.8751;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,31:64:99:861,0,883
6	29407970	.	T	C	2999.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;DP=220;Dels=0.00;FS=1.045;HRun=1;HaplotypeScore=2.7543;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.444;VQSLOD=6.6530;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,108:220:99:3030,0,3081
6	29408313	.	C	A	4041.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.593;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.875;HRun=0;HaplotypeScore=7.3142;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.466;VQSLOD=3.7103;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,119:250:99:3403,0,3391
6	29408528	.	A	G	7909.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5140;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=31.64;ReadPosRankSum=-1.524;VQSLOD=8.0194;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:7908,665,0
6	29408571	.	G	T	3157.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.376;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.487;HRun=0;HaplotypeScore=1.9936;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.259;VQSLOD=4.5209;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3187,0,3702
6	29408600	.	G	T	2962.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=2.968;HRun=1;HaplotypeScore=8.1440;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.563;VQSLOD=3.1467;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,113:245:99:2992,0,3829
6	29523676	.	C	G	3390.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.61;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=7.7382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3390,262,0
6	29523952	.	A	G	1017.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.392;VQSLOD=6.5823;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:73:99:1048,0,988
6	29555809	.	C	T	7476.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4420;MQ=58.12;MQ0=0;QD=33.83;VQSLOD=7.7465;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:221:99:7476,578,0
6	29627222	.	C	A	2369.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.416;DP=187;DS;Dels=0.00;FS=4.659;HRun=0;HaplotypeScore=5.1511;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.699;VQSLOD=3.1965;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,97:187:99:2399,0,2646
6	29634012	.	A	G	6109.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;QD=33.20;VQSLOD=9.5707;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:184:99:6108,496,0
6	29640951	.	T	C	1160.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;DP=125;Dels=0.00;FS=6.397;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.608;VQSLOD=4.4569;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,45:125:99:1190,0,2311
6	29691582	.	C	A	515.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=28;Dels=0.00;FS=3.674;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.539;VQSLOD=3.8765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:546,0,211
6	29693011	.	C	T	3302.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8808;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.75;VQSLOD=8.5606;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3302,268,0
6	29912028	.	AG	A	883.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.286;DP=96;FS=53.915;HRun=2;HaplotypeScore=368.6077;MQ=20.88;MQ0=100;MQRankSum=0.708;QD=4.21;ReadPosRankSum=-2.308;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,59:96:99:922,0,2531
6	30039240	.	G	T	334.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.107;VQSLOD=12.6067;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:85.98:365,0,86
6	30041009	.	A	G	1410.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.734;DP=125;Dels=0.00;FS=5.958;HRun=2;HaplotypeScore=3.5641;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.815;VQSLOD=5.0159;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,56:125:99:1440,0,1608
6	30071330	.	C	T	7315.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.5593;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.23;VQSLOD=5.9468;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:7314,611,0
6	30078275	.	C	T	7694.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=30.78;VQSLOD=8.8931;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7694,602,0
6	30458064	.	G	A	1498.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.110;DP=112;Dels=0.00;FS=0.980;HRun=0;HaplotypeScore=1.9930;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.246;VQSLOD=5.5386;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1529,0,1373
6	30558477	.	G	GA	2639.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.585;DP=132;DS;FS=3.083;HRun=1;HaplotypeScore=321.2259;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=20.00;ReadPosRankSum=0.929;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,68:132:99:2678,0,2008
6	30652781	.	C	T	2699.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.047;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.4821;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.804;VQSLOD=4.1793;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,101:203:99:2730,0,2510
6	30711805	.	C	G	436.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.696;VQSLOD=10.2641;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,17:40:99:467,0,707
6	30862423	.	C	T	1732.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.091;DP=114;Dels=0.00;FS=1.545;HRun=0;HaplotypeScore=8.0845;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.800;VQSLOD=4.2275;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,67:114:99:1762,0,1101
6	30893941	.	G	A	1669.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.694;DP=122;Dels=0.00;FS=3.353;HRun=0;HaplotypeScore=4.8728;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=4.4181;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,64:122:99:1700,0,1517
6	30899524	.	T	C	1272.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8299;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.716;VQSLOD=5.5392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,50:104:99:1302,0,1241
6	30920124	.	G	A	1588.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=133;Dels=0.00;FS=2.254;HRun=1;HaplotypeScore=4.9238;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.270;VQSLOD=5.4365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,62:133:99:1619,0,1781
6	30954245	.	T	C	2836.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.235;HRun=0;HaplotypeScore=8.3262;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.241;VQSLOD=3.5152;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,107:250:99:2866,0,3967
6	31079643	.	T	C	991.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.656;DP=70;Dels=0.00;FS=3.363;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.728;VQSLOD=6.1079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,38:70:99:1022,0,793
6	31079889	.	C	G	1892.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.6360;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.221;VQSLOD=3.7707;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,66:121:99:1922,0,1594
6	31080016	.	C	G	1933.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.624;DP=184;Dels=0.00;FS=1.180;HRun=0;HaplotypeScore=2.5949;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.102;VQSLOD=6.4393;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,84:184:99:1964,0,2497
6	31083813	.	T	C	1469.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8499;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.099;VQSLOD=5.0055;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,65:136:99:1500,0,1918
6	31088145	.	T	A	257.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.358;DP=18;Dels=0.00;FS=6.117;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=5.3005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:288,0,139
6	31105891	.	A	G	752.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.9536;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.277;VQSLOD=4.7595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,33:78:99:783,0,1079
6	31110391	.	G	C	1181.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.016;DP=101;Dels=0.00;FS=18.683;HRun=0;HaplotypeScore=3.9639;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.892;VQSLOD=2.2607;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,42:101:99:1212,0,1587
6	31112737	.	C	A	2121.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=148;Dels=0.00;FS=0.786;HRun=0;HaplotypeScore=7.1207;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.779;VQSLOD=4.3567;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,78:148:99:2152,0,1974
6	31122482	.	G	A	1118.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.424;DP=71;Dels=0.00;FS=3.840;HRun=0;HaplotypeScore=5.5940;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.688;VQSLOD=3.9894;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,40:71:99:1148,0,776
6	31122500	.	G	A	701.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;DP=58;Dels=0.00;FS=6.141;HRun=0;HaplotypeScore=4.9891;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.503;VQSLOD=4.5282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,27:58:99:732,0,896
6	31124849	.	C	T	299.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.734;VQSLOD=11.2072;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,13:35:99:329,0,575
6	31129310	.	C	T	1326.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=106;Dels=0.00;FS=13.953;HRun=0;HaplotypeScore=4.9168;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.397;VQSLOD=3.7510;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,51:106:99:1356,0,1541
6	31129616	.	A	G	509.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.416;DP=63;Dels=0.00;FS=7.290;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.290;VQSLOD=3.9821;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,21:63:99:539,0,1110
6	31239101	.	G	T	800.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;DP=61;Dels=0.00;FS=7.955;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.557;VQSLOD=4.2334;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,33:61:99:830,0,811
6	31473546	.	A	G	999.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.934;DP=69;Dels=0.00;FS=1.162;HRun=0;HaplotypeScore=1.9612;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.169;VQSLOD=5.7217;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,33:69:99:1029,0,918
6	31473561	.	A	G	754.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.450;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.585;VQSLOD=5.2121;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,26:57:99:785,0,928
6	31473957	.	C	G	732.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=53;Dels=0.00;FS=2.794;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.112;VQSLOD=2.8900;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,27:53:99:762,0,751
6	31474000	.	G	A	1243.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=104;Dels=0.00;FS=0.828;HRun=1;HaplotypeScore=3.4610;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.673;VQSLOD=5.2840;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,46:104:99:1273,0,1429
6	31477681	.	A	G	2384.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.254;DP=169;Dels=0.00;FS=11.346;HRun=0;HaplotypeScore=3.2446;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=14.11;ReadPosRankSum=2.138;VQSLOD=3.1019;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,89:169:99:2414,0,1942
6	31496925	.	G	A	2064.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=176;Dels=0.00;FS=2.045;HRun=1;HaplotypeScore=7.9555;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.178;VQSLOD=3.9456;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,85:176:99:2094,0,2464
6	31525912	.	C	T	217.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.904;DP=32;Dels=0.00;FS=1.666;HRun=0;HaplotypeScore=3.5134;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.079;VQSLOD=3.6825;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,11:32:99:248,0,554
6	31540784	.	C	A	706.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;DP=45;Dels=0.00;FS=2.907;HRun=1;HaplotypeScore=2.5712;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.470;VQSLOD=5.6561;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,30:45:99:736,0,369
6	31595882	.	C	A	2146.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=207;Dels=0.00;FS=5.028;HRun=1;HaplotypeScore=9.4208;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.847;VQSLOD=3.6603;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,80:207:99:2177,0,3402
6	31601344	.	T	C	617.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.295;VQSLOD=6.2587;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,24:64:99:648,0,1108
6	31602967	.	G	A	1470.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=91;Dels=0.00;FS=4.130;HRun=0;HaplotypeScore=2.4532;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.622;VQSLOD=5.3654;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,53:91:99:1501,0,975
6	31604044	.	T	G	2380.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.752;DP=214;Dels=0.00;FS=4.091;HRun=3;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.956;VQSLOD=5.8123;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,100:214:99:2410,0,3040
6	31627523	.	C	T	936.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=67;Dels=0.00;FS=8.886;HRun=0;HaplotypeScore=3.8514;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=4.6817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,35:67:99:966,0,805
6	31632134	.	C	A	853.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.171;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=13.76;ReadPosRankSum=-2.468;VQSLOD=5.4918;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,34:62:99:883,0,688
6	31733466	.	T	C	280.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.558;DP=17;Dels=0.00;FS=1.913;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.854;VQSLOD=5.6902;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:311,0,162
6	31749884	.	G	A	946.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;DP=70;Dels=0.00;FS=0.918;HRun=0;HaplotypeScore=2.6202;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.565;VQSLOD=4.8954;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,37:70:99:977,0,917
6	31778272	.	G	A	3224.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.489;VQSLOD=6.6598;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,115:223:99:3254,0,2991
6	32026107	.	C	T	371.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.747;DP=31;Dels=0.00;FS=1.992;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.376;VQSLOD=5.9095;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:402,0,492
6	32064726	.	T	C	473.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;DP=36;Dels=0.00;FS=1.330;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.475;VQSLOD=5.9873;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:503,0,472
6	32122386	.	C	G	6851.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.6333;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.78;VQSLOD=7.4421;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:6851,542,0
6	32122472	.	C	A	1807.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.133;DP=115;Dels=0.00;FS=3.163;HRun=0;HaplotypeScore=9.6766;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.140;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.308;VQSLOD=2.3089;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,67:115:99:1837,0,1036
6	32134510	.	G	A	938.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2555;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.593;VQSLOD=5.0863;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,32:60:99:969,0,685
6	32188383	.	T	C	2742.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8857;MQ=59.38;MQ0=0;QD=35.15;VQSLOD=9.6450;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,77:78:99:2775,220,0
6	32188640	.	T	C	2765.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.713;DP=227;DS;Dels=0.00;FS=0.497;HRun=1;HaplotypeScore=10.7418;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.412;VQSLOD=4.1335;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,108:227:99:2795,0,2939
6	32190390	.	T	G	1516.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=109;Dels=0.00;FS=8.061;HRun=2;HaplotypeScore=8.1230;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=13.91;ReadPosRankSum=2.120;VQSLOD=3.4443;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,57:109:99:1546,0,1419
6	32261507	.	T	C	4203.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.601;DP=242;Dels=0.00;FS=4.552;HRun=0;HaplotypeScore=4.5892;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.393;VQSLOD=4.6763;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,131:242:99:3586,0,2910
6	32299822	.	G	A	1162.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.834;DP=98;Dels=0.00;FS=2.603;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.86;ReadPosRankSum=-2.661;VQSLOD=5.4371;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:98:99:1193,0,1263
6	32303692	.	T	A	1222.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.824;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.085;VQSLOD=5.8976;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,50:112:99:1252,0,1555
6	32337686	.	A	G	7715.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6936;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=8.6327;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:247:99:7684,638,0
6	32362741	.	C	T	2572.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=235;DS;Dels=0.00;FS=0.520;HRun=0;HaplotypeScore=4.0539;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.581;VQSLOD=2.2847;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,102:235:99:2603,0,3682
6	32363816	.	T	C	1082.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.974;DP=74;Dels=0.00;FS=1.184;HRun=1;HaplotypeScore=1.8924;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.884;VQSLOD=5.8778;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,39:74:99:1113,0,974
6	32411646	.	T	G	1703.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.693;DP=129;Dels=0.00;FS=3.572;HRun=0;HaplotypeScore=2.9738;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.440;VQSLOD=5.9688;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,62:129:99:1733,0,1877
6	32811629	.	G	T	1912.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.723;DP=153;Dels=0.00;FS=0.655;HRun=1;HaplotypeScore=4.8153;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.188;VQSLOD=5.8858;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,73:153:99:1943,0,2187
6	32825090	.	G	A	1444.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.106;DP=108;Dels=0.00;FS=7.504;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.036;VQSLOD=4.0226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,56:108:99:1475,0,1231
6	32904981	.	G	A	4750.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.58;MQ0=0;QD=32.99;VQSLOD=9.9261;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4750,379,0
6	33036853	.	A	C	3006.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.040;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.160;HRun=0;HaplotypeScore=11.3876;MQ=57.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.533;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.737;VQSLOD=2.6868;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,114:250:99:3037,0,3977
6	33036951	.	A	G	2729.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.192;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.542;HRun=1;HaplotypeScore=5.9692;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.047;VQSLOD=3.5327;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,104:230:99:2759,0,3794
6	33036999	.	T	C	2192.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.262;DP=174;Dels=0.00;FS=5.670;HRun=1;HaplotypeScore=7.6330;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.379;VQSLOD=4.2122;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,79:174:99:2222,0,2636
6	33052958	.	C	T	2589.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.461;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=0.513;HRun=0;HaplotypeScore=9.7070;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.174;VQSLOD=2.8792;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,104:220:99:2620,0,3048
6	33053577	.	G	A	1336	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=94;Dels=0.00;FS=6.765;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.205;VQSLOD=4.3815;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,51:94:99:1366,0,1042
6	33153528	.	C	T	812.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=67;Dels=0.00;FS=0.942;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.948;VQSLOD=4.9599;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,35:67:99:843,0,719
6	33256471	.	T	C	1663.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.29;MQ0=0;QD=31.39;VQSLOD=9.6769;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1697,129,0
6	33272855	.	G	C	2357.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=161;DS;Dels=0.00;FS=3.676;HRun=0;HaplotypeScore=5.2400;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.792;VQSLOD=5.1090;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,77:161:99:2388,0,2528
6	33283766	.	T	C	2385.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.712;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3163;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.322;VQSLOD=5.1861;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,89:165:99:2416,0,1751
6	33382288	.	G	A	5235.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.2277;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=8.2407;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5235,403,0
6	33384473	.	C	T	1539.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.438;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1517;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.749;VQSLOD=5.1452;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,61:120:99:1570,0,1296
6	33659472	.	C	G	1246.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.685;DP=91;Dels=0.00;FS=0.844;HRun=3;HaplotypeScore=5.3560;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.053;VQSLOD=4.8321;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,45:91:99:1277,0,1277
6	33690796	.	C	T	566.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.020;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.892;VQSLOD=6.4401;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:597,0,586
6	33768897	.	A	G	2874.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.302;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.4262;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.701;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.239;VQSLOD=4.2398;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,99:199:99:2904,0,2476
6	34214322	.	C	G	2190.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8932;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.00;VQSLOD=8.2658;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:73:99:2223,184,0
6	34824636	.	A	G	1309.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;DP=94;Dels=0.00;FS=3.851;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=6.5140;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,49:94:99:1340,0,1184
6	34826921	.	G	C	862.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=77;Dels=0.00;FS=6.264;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.789;VQSLOD=3.2016;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,31:77:99:892,0,1432
6	34831856	.	T	C	900.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.885;DP=100;Dels=0.00;FS=7.273;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.823;VQSLOD=4.6878;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,35:100:99:930,0,1736
6	35027927	.	T	C	831.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9164;MQ=56.66;MQ0=0;QD=27.70;VQSLOD=4.5009;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:30:66.21:864,66,0
6	35285720	.	A	C	1519.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.73;MQ0=0;QD=29.23;VQSLOD=8.4848;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1553,117,0
6	35477025	.	C	G	8593.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;QD=34.51;VQSLOD=9.6957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8593,665,0
6	35477032	.	A	G	8693.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.89;MQ0=0;QD=34.77;VQSLOD=9.7746;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8693,680,0
6	35748931	.	T	C	2018.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.425;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.5821;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.560;VQSLOD=4.5601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,78:157:99:2048,0,1996
6	35762937	.	G	A	961.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.073;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3459;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.696;VQSLOD=3.9406;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,44:191:99:992,0,4049
6	35960390	.	C	T	3197	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.190;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.532;HRun=1;HaplotypeScore=6.8022;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=12.79;ReadPosRankSum=-2.093;VQSLOD=3.5008;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,126:250:99:3227,0,3111
6	35967772	.	T	C	3084.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=3.540;HRun=0;HaplotypeScore=11.0460;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.684;VQSLOD=3.2452;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,126:247:99:3115,0,3164
6	35980121	.	C	T	2199.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.150;DP=154;DS;Dels=0.00;FS=4.370;HRun=0;HaplotypeScore=3.2758;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.273;VQSLOD=5.4736;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,76:154:99:2230,0,2075
6	36269725	.	A	G	1209.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.003;DP=93;Dels=0.00;FS=5.332;HRun=1;HaplotypeScore=5.5984;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.467;VQSLOD=4.5983;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,42:93:99:1240,0,1437
6	36270130	.	C	A	2472.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.937;DP=176;Dels=0.00;FS=2.718;HRun=0;HaplotypeScore=5.8443;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.561;VQSLOD=4.1714;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,88:176:99:2502,0,2619
6	36274153	.	C	T	1994.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.680;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.121;VQSLOD=6.6799;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,85:182:99:2024,0,2377
6	36275458	.	T	C	1169.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.683;DP=114;Dels=0.00;FS=1.542;HRun=1;HaplotypeScore=2.6797;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.521;VQSLOD=6.0409;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,48:114:99:1200,0,1735
6	36287312	.	G	C	1882.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.954;DP=151;Dels=0.00;FS=1.386;HRun=0;HaplotypeScore=3.7008;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.579;VQSLOD=5.7574;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,72:151:99:1912,0,2218
6	38650628	.	T	G	1448.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;DP=114;Dels=0.00;FS=1.521;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.544;VQSLOD=6.4465;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,61:114:99:1478,0,1139
6	38821025	.	C	T	1051.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=60;Dels=0.00;FS=10.003;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.381;VQSLOD=2.2250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,41:60:99:1081,0,494
6	38951998	.	C	T	1032.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.082;VQSLOD=6.6936;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,42:88:99:1063,0,1124
6	39041502	.	A	C	7416.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4091;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.83;VQSLOD=8.7401;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:7416,581,0
6	39859415	.	A	G	451.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.844;VQSLOD=4.6778;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,17:44:99:482,0,667
6	40998167	.	T	C	1776.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.718;DP=141;Dels=0.00;FS=6.268;HRun=1;HaplotypeScore=2.4964;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.956;VQSLOD=5.2985;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,74:141:99:1806,0,1721
6	41162518	.	T	C	1002.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.179;DP=81;Dels=0.00;FS=1.892;HRun=1;HaplotypeScore=3.6750;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.927;VQSLOD=6.0900;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,36:81:99:1032,0,1181
6	41196605	.	T	C	1466.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;DP=129;Dels=0.00;FS=3.203;HRun=3;HaplotypeScore=1.8308;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.352;VQSLOD=6.4959;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,53:129:99:1496,0,2132
6	41197857	.	C	T	2521.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.012;DP=197;Dels=0.00;FS=0.571;HRun=0;HaplotypeScore=10.1529;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.091;VQSLOD=4.4194;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,101:197:99:2551,0,2424
6	41250466	.	T	A	1977.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;DP=152;Dels=0.00;FS=0.614;HRun=0;HaplotypeScore=1.9248;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.326;VQSLOD=5.8067;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,80:152:99:2007,0,1782
6	41303993	.	C	T	1024.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.722;DP=70;Dels=0.00;FS=3.254;HRun=0;HaplotypeScore=4.3000;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.182;VQSLOD=4.7869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,36:70:99:1055,0,965
6	41318438	.	A	G	5454.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6918;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=8.9513;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:5453,433,0
6	41895150	.	G	A	2159.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.562;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5581;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.795;VQSLOD=6.3033;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,87:165:99:2190,0,1956
6	41900406	.	C	T	1220.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.780;DP=150;Dels=0.00;FS=3.388;HRun=0;HaplotypeScore=3.7925;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.526;VQSLOD=4.9398;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,50:150:99:1251,0,2783
6	41903782	.	A	C	512.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.222;VQSLOD=6.1585;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:42:99:543,0,542
6	42196127	.	C	T	1911.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;DP=150;Dels=0.00;FS=0.649;HRun=1;HaplotypeScore=3.5495;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.260;VQSLOD=5.8905;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,73:150:99:1941,0,2197
6	42627434	.	G	A	653.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.259;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.193;VQSLOD=6.8877;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,23:45:99:684,0,571
6	42666061	.	T	C	3588.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.92;MQ0=0;QD=33.22;VQSLOD=10.1024;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3588,280,0
6	42666145	.	C	T	3610.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.35;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=9.8996;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3610,286,0
6	42666164	.	G	C	3573.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=9.0257;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3572,301,0
6	42713618	.	A	G	3702.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.65;MQ0=0;QD=34.28;VQSLOD=9.8094;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3702,292,0
6	42891022	.	G	A	1740.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.891;DP=144;Dels=0.00;FS=7.810;HRun=0;HaplotypeScore=11.0433;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.792;VQSLOD=3.1591;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,69:144:99:1770,0,2053
6	43014299	.	T	C	2550.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;QD=28.65;VQSLOD=7.4716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2583,211,0
6	43184132	.	A	C	1788.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.494;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.4822;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.977;VQSLOD=4.2458;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,66:130:99:1819,0,1767
6	43273604	.	A	G	1411.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.338;DP=126;Dels=0.00;FS=2.324;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.431;VQSLOD=6.3646;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,56:126:99:1441,0,1753
6	43306346	.	A	G	1546.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38;VQSLOD=14.2156;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1580,126,0
6	43418528	.	C	T	1400.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;DP=123;Dels=0.00;FS=0.675;HRun=0;HaplotypeScore=5.9487;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=11.39;ReadPosRankSum=2.826;VQSLOD=3.9015;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,56:123:99:1431,0,1913
6	43968814	.	A	G	2106.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.908;DP=172;Dels=0.00;FS=0.580;HRun=0;HaplotypeScore=1.8606;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.820;VQSLOD=6.6575;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,85:172:99:2136,0,2267
6	44198362	.	T	C	993.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.860;DP=106;Dels=0.00;FS=2.740;HRun=1;HaplotypeScore=6.2784;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=2.445;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.874;VQSLOD=2.9990;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,40:106:99:1023,0,1490
6	44255459	.	G	A	3491.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=58.75;MQ0=0;QD=33.57;VQSLOD=10.0250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3491,280,0
6	44275011	.	T	C	1953.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;QD=29.16;VQSLOD=8.8932;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1987,159,0
6	44310854	.	G	A	607.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.778;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.779;VQSLOD=5.5751;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,30:96:99:638,0,1894
6	45290634	.	G	A	424.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;DP=34;Dels=0.00;FS=1.532;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.190;VQSLOD=5.5680;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,18:34:99:454,0,466
6	46107752	.	C	G	3863.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.25;MQ0=0;QD=32.20;VQSLOD=7.9729;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3863,301,0
6	46135489	.	T	C	5134.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9863;MQ=59.58;MQ0=0;QD=32.30;VQSLOD=8.8951;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:5135,394,0
6	46135984	.	G	T	1525	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7840;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.409;VQSLOD=7.6926;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,54:55:99:1558,120,0
6	46563817	.	A	T	364.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;DP=36;Dels=0.00;FS=1.357;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.187;VQSLOD=5.5444;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:394,0,583
6	46620252	.	C	G	3931.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.036;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=5.977;HRun=1;HaplotypeScore=4.3388;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.549;VQSLOD=4.8695;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,132:249:99:3298,0,3083
6	46632594	.	T	C	399.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.954;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.017;VQSLOD=6.0777;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,18:36:99:429,0,444
6	46657057	.	A	G	8479.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9246;MQ=59.48;MQ0=0;QD=33.92;VQSLOD=8.7521;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8479,662,0
6	46658905	.	C	G	518.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.537;VQSLOD=5.9102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,20:45:99:548,0,713
6	46672943	.	A	G	2037.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.87;VQSLOD=9.3519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2070,159,0
6	46684222	.	C	T	946.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.310;DP=72;Dels=0.00;FS=4.811;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.352;VQSLOD=4.5720;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,37:72:99:977,0,857
6	46803018	.	A	T	355.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.353;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.81;MQ0=2;MQRankSum=0.277;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.416;VQSLOD=4.4495;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:385,0,427
6	46803102	.	A	G	173.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.402;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.601;VQSLOD=5.1884;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:203,0,345
6	46827073	.	A	G	891.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=80;Dels=0.00;FS=1.854;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=5.4330;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,35:80:99:922,0,1187
6	46834685	.	G	A	2413.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.37;MQ0=0;QD=29.79;VQSLOD=8.8950;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2446,187,0
6	47646748	.	T	C	2091.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.118;DP=166;Dels=0.00;FS=2.784;HRun=3;HaplotypeScore=6.3900;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.267;VQSLOD=4.8064;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,80:166:99:2121,0,2215
6	47646842	.	A	G	2103.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.124;DP=174;Dels=0.00;FS=0.577;HRun=1;HaplotypeScore=3.9412;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.045;VQSLOD=6.3593;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,85:174:99:2134,0,2393
6	47649265	.	T	A	2027.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=208;Dels=0.00;FS=1.738;HRun=0;HaplotypeScore=4.8478;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.558;VQSLOD=5.2353;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,82:208:99:2058,0,3426
6	47649574	.	A	G	2769.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.000;DP=200;Dels=0.00;FS=1.206;HRun=0;HaplotypeScore=5.9362;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.408;VQSLOD=4.7181;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,95:200:99:2800,0,2888
6	47649694	.	A	G	3201.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;DP=215;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7365;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.397;VQSLOD=6.1289;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,119:215:99:3232,0,2432
6	47682604	.	A	C	6275.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0821;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=8.7486;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6274,535,0
6	48036327	.	A	C	119.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=10;Dels=0.00;FS=7.782;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.742;VQSLOD=2.9307;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:20.53:149,0,21
6	49403282	.	T	C	1894.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7870;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.70;VQSLOD=7.9162;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:66:99:1927,162,0
6	49412433	.	C	T	2029.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.773;DP=161;DS;Dels=0.00;FS=0.722;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.954;VQSLOD=6.0262;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,75:161:99:2059,0,2281
6	49439805	.	G	A	1297.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=88;Dels=0.00;FS=1.795;HRun=0;HaplotypeScore=3.6115;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.010;VQSLOD=5.2300;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,48:88:99:1327,0,1068
6	49701439	.	C	A	634.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;DP=89;Dels=0.00;FS=2.246;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.188;VQSLOD=5.1560;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,29:89:99:665,0,1624
6	49701523	.	A	G	1308.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.657;DP=133;Dels=0.00;FS=1.385;HRun=2;HaplotypeScore=3.9544;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.504;VQSLOD=5.5361;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,56:133:99:1339,0,2083
6	50683009	.	T	C	2622.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;DP=208;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.5066;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.077;VQSLOD=4.5271;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,98:208:99:2653,0,3216
6	51483961	.	T	C	1039.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;DP=95;Dels=0.00;FS=17.704;HRun=0;HaplotypeScore=3.4083;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.939;VQSLOD=3.2574;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,46:95:99:1070,0,1321
6	51491884	.	T	C	1426.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.597;DP=137;Dels=0.00;FS=2.216;HRun=1;HaplotypeScore=3.9053;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.195;VQSLOD=4.8909;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,58:137:99:1457,0,2283
6	51875250	.	A	C	3676.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8238;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=8.7881;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3676,280,0
6	51890823	.	G	A	1299.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=80;Dels=0.00;FS=9.697;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.183;VQSLOD=3.7487;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,45:80:99:1329,0,912
6	51910905	.	T	C	1305.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.024;DP=125;Dels=0.00;FS=1.505;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.418;VQSLOD=4.4476;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,54:125:99:1335,0,1894
6	51914956	.	G	A	1038.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.011;DP=77;Dels=0.00;FS=4.669;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.341;VQSLOD=6.2005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,39:77:99:1068,0,895
6	52129484	.	C	T	4275.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.071;HRun=2;HaplotypeScore=7.3178;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.372;VQSLOD=3.4139;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,128:250:99:3628,0,3056
6	52701143	.	C	T	5552.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.3785;MQ=59.18;MQ0=0;QD=32.28;VQSLOD=8.6715;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,171:172:99:5525,436,0
6	53519605	.	C	T	4397.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=34.09;VQSLOD=9.5623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4397,358,0
6	53883843	.	G	A	402.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.434;DP=46;Dels=0.00;FS=4.427;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.455;VQSLOD=5.8177;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,17:46:99:432,0,692
6	53989526	.	G	A	1495.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.066;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7498;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.495;VQSLOD=5.6483;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,60:110:99:1526,0,1424
6	54054686	.	T	A	857.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.285;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.8153;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.878;VQSLOD=4.6285;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,39:91:99:888,0,1205
6	54186147	.	T	C	1176.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.034;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.133;VQSLOD=6.2748;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,47:78:99:1207,0,781
6	55142337	.	A	G	791.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.158;DP=89;Dels=0.00;FS=7.444;HRun=1;HaplotypeScore=2.8465;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.616;VQSLOD=4.2501;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,31:89:99:821,0,1499
6	55196587	.	C	T	814.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.428;DP=83;Dels=0.00;FS=3.033;HRun=0;HaplotypeScore=2.7888;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.095;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.236;VQSLOD=6.1037;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,33:83:99:845,0,1180
6	55266625	.	T	C	2975.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8681;MQ=57.66;MQ0=0;QD=29.17;VQSLOD=5.8527;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3008,226,0
6	56327849	.	C	T	1212.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=116;Dels=0.00;FS=2.766;HRun=0;HaplotypeScore=4.5607;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.356;VQSLOD=4.8869;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,51:116:99:1243,0,1767
6	56417282	.	C	T	1499.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5650;MQ=58.97;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=9.4812;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1532,123,0
6	56417545	.	T	C	1916.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.17;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=8.6372;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1949,153,0
6	56497826	.	T	C	938.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.042;DP=88;Dels=0.00;FS=2.837;HRun=0;HaplotypeScore=2.7321;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.737;VQSLOD=4.7001;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,38:88:99:968,0,1333
6	57244780	.	G	A	145.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.220;VQSLOD=10.2136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:175,0,162
6	57246884	.	A	G	1085.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.859;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.599;VQSLOD=5.0484;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,43:87:99:1115,0,1168
6	57393112	.	T	C	30.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.382;VQSLOD=3.8184;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:60.03:60,0,191
6	57393125	.	A	G	326.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.34;MQ0=0;QD=25.15;VQSLOD=6.7718;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:27.06:360,27,0
6	57398186	.	G	GA	1032.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=238;DS;FS=10.326;HRun=4;HaplotypeScore=1758.4476;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.910;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.490;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,45:238:99:1071,0,5499
6	57512476	.	G	A	1425.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.326;DP=80;Dels=0.00;FS=4.463;HRun=0;HaplotypeScore=1.6646;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.351;VQSLOD=4.0451;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,54:80:99:1455,0,675
6	57512510	.	T	G	4742.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.80;MQ0=0;QD=32.71;VQSLOD=8.5561;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4742,370,0
6	57512565	.	T	C	5086.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.706;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4101;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.491;VQSLOD=3.5298;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,144:249:99:4402,0,2803
6	66044927	.	T	C	712.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.813;VQSLOD=6.1318;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,27:54:99:743,0,687
6	69666684	.	A	G	4183.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.99;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=8.9316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4183,328,0
6	70407465	.	A	T	1107.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.905;DP=90;Dels=0.00;FS=1.716;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.186;VQSLOD=4.5497;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,49:90:99:1137,0,970
6	70961833	.	T	C	4538.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=6.7834;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=29.28;ReadPosRankSum=-1.573;VQSLOD=6.0545;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,153:155:99:4509,366,0
6	71238105	.	A	G	4592.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.14;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=9.0516;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,151:151:99:4592,346,0
6	71665982	.	G	C	165.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.421;VQSLOD=4.6228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:196,0,162
6	73904557	.	C	T	1085.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;DP=89;Dels=0.00;FS=2.970;HRun=0;HaplotypeScore=4.5067;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.129;VQSLOD=4.8228;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,42:89:99:1116,0,1334
6	74073531	.	C	G	2281.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=13.8505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2314,178,0
6	74079024	.	A	G	2508.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5241;MQ=58.96;MQ0=0;QD=32.17;VQSLOD=8.0535;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2542,199,0
6	74125875	.	A	G	1909.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=8.5318;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1942,147,0
6	74125888	.	A	G	1702.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.37;VQSLOD=8.2033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1735,135,0
6	74155346	.	G	T	1435.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7870;MQ=58.73;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=8.8077;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:48:99:1468,114,0
6	74161801	.	G	T	403.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86;VQSLOD=13.1067;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.09:437,36,0
6	74493432	.	A	C	743.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.374;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9557;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.911;VQSLOD=5.4335;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,32:69:99:774,0,964
6	75797302	.	C	T	3588.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=9.2167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3588,271,0
6	76633385	.	C	T	684.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.250;DP=76;Dels=0.00;FS=1.957;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.492;VQSLOD=5.1584;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,30:76:99:714,0,1204
6	76660551	.	G	C	798.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;DP=75;Dels=0.00;FS=2.009;HRun=0;HaplotypeScore=2.4095;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.325;VQSLOD=5.4755;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,30:75:99:828,0,1293
6	78172750	.	A	C	2374.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.000;DP=150;Dels=0.00;FS=1.348;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=15.83;ReadPosRankSum=-2.098;VQSLOD=5.7751;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,79:150:99:2404,0,1945
6	79675701	.	A	G	3193.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.106;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=11.539;HRun=1;HaplotypeScore=8.0118;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.631;VQSLOD=3.4929;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,124:247:99:3223,0,3169
6	79692751	.	G	A	766.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.033;DP=76;Dels=0.00;FS=3.418;HRun=0;HaplotypeScore=3.9882;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.876;VQSLOD=3.1615;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,35:76:99:797,0,1102
6	79708000	.	A	C	3670.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.29;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.9702;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3670,283,0
6	80228535	.	T	G	4091.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.063;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.180;HRun=0;HaplotypeScore=2.3969;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.783;VQSLOD=5.6578;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,126:248:99:3461,0,3204
6	80228541	.	A	G	8372.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3953;MQ=58.82;MQ0=0;QD=33.49;VQSLOD=9.4087;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8371,653,0
6	84233831	.	G	A	961.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.343;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5233;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.396;VQSLOD=6.1027;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,34:78:99:991,0,1194
6	86199233	.	A	G	1298.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8300;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.890;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.654;VQSLOD=5.2348;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,52:132:99:1329,0,1977
6	87967636	.	A	G	1704.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.507;DP=141;Dels=0.00;FS=1.382;HRun=0;HaplotypeScore=6.2004;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.855;VQSLOD=5.1721;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,67:141:99:1735,0,1772
6	87970650	.	G	A	249.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=6.4601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:280,0,192
6	87994015	.	A	G	1364.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.180;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.908;VQSLOD=7.0258;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,52:96:99:1395,0,1281
6	87994572	.	G	A	1303.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.771;DP=126;Dels=0.00;FS=0.679;HRun=1;HaplotypeScore=1.9799;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.064;VQSLOD=6.7875;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,55:126:99:1333,0,2032
6	88125542	.	G	A	1262.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=101;Dels=0.00;FS=2.649;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.840;VQSLOD=5.8959;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,46:101:99:1293,0,1225
6	88126423	.	G	C	609.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=50;Dels=0.00;FS=1.164;HRun=0;HaplotypeScore=1.9982;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.899;VQSLOD=5.3156;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,23:50:99:639,0,670
6	88140811	.	C	A	773.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.689;DP=62;Dels=0.00;FS=11.302;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.310;VQSLOD=4.0454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,31:62:99:803,0,852
6	89926962	.	T	C	998.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;DP=100;Dels=0.00;FS=1.651;HRun=0;HaplotypeScore=2.4909;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.898;VQSLOD=5.4507;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,43:100:99:1028,0,1314
6	90315789	.	A	G	846.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=13.0495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:69.22:879,69,0
6	90390443	.	C	A	936.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=76;Dels=0.00;FS=6.112;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.125;VQSLOD=5.6451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,37:76:99:967,0,1035
6	90402482	.	G	A	1658.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;DP=121;Dels=0.00;FS=1.516;HRun=0;HaplotypeScore=3.4816;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.703;VQSLOD=6.2899;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,59:121:99:1688,0,1943
6	90448092	.	C	T	1547.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;DP=126;Dels=0.00;FS=2.282;HRun=1;HaplotypeScore=1.9465;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.426;VQSLOD=5.5410;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,65:126:99:1578,0,1665
6	90661242	.	C	T	2379.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;DP=164;Dels=0.00;FS=7.155;HRun=0;HaplotypeScore=6.6748;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.302;VQSLOD=2.7907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,90:164:99:2409,0,1808
6	96651740	.	A	G	475.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72;VQSLOD=13.8668;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.13:509,39,0
6	97058553	.	A	G	7543.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.6034;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.654;VQSLOD=4.8676;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,241:242:99:7504,578,0
6	97063522	.	C	G	2149.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=30.70;VQSLOD=8.2515;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2182,166,0
6	97677118	.	G	A	2572.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.88;MQ0=0;QD=27.96;VQSLOD=8.1950;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2605,199,0
6	99817601	.	A	G	5920.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7320;MQ=58.82;MQ0=0;QD=33.26;VQSLOD=9.6787;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5920,460,0
6	99819379	.	T	C	2537.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.56;MQ0=0;QD=29.51;VQSLOD=8.1700;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2571,196,0
6	99883704	.	T	C	4548.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6369;MQ=58.53;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=7.5564;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4548,346,0
6	100964147	.	G	C	1878.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.169;DP=125;Dels=0.00;FS=1.604;HRun=0;HaplotypeScore=2.7252;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.450;VQSLOD=5.3726;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,68:125:99:1909,0,1554
6	101296389	.	G	A	1038.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;DP=59;Dels=0.00;FS=5.403;HRun=2;HaplotypeScore=1.8154;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.039;VQSLOD=4.7942;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,37:59:99:1069,0,617
6	106967185	.	A	C	2836.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.6699;MQ=59.50;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=7.5850;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2869,226,0
6	106987370	.	A	C	5186.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=10.0238;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5186,394,0
6	106999822	.	G	A	4254.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.89;MQ0=0;QD=30.39;VQSLOD=8.4566;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4253,340,0
6	109768568	.	G	T	670.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;DP=67;Dels=0.00;FS=1.005;HRun=2;HaplotypeScore=2.6921;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.933;VQSLOD=5.9126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,26:67:99:701,0,1108
6	110760008	.	A	G	1952.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.981;DP=139;Dels=0.00;FS=3.234;HRun=0;HaplotypeScore=6.6478;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.677;VQSLOD=4.5207;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,73:139:99:1982,0,1632
6	110778128	.	T	C	1224.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.181;DP=82;Dels=0.00;FS=4.297;HRun=0;HaplotypeScore=1.7653;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.023;VQSLOD=4.9503;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,44:82:99:1255,0,1023
6	111695887	.	G	A	1309.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.047;DP=119;Dels=0.00;FS=0.682;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.351;VQSLOD=5.9160;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,55:119:99:1339,0,1805
6	111901453	.	G	T	1586.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75;VQSLOD=9.4201;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1619,123,0
6	112457390	.	C	T	2611.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.71;MQ0=0;QD=32.24;VQSLOD=9.0176;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2645,205,0
6	112493872	.	A	G	3662.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=9.1850;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3662,274,0
6	112508770	.	G	T	2033.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.46;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=8.3861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2066,168,0
6	112671611	.	G	A	1985.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.924;DP=115;Dels=0.00;FS=15.160;HRun=0;HaplotypeScore=1.8910;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.638;VQSLOD=2.9182;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,74:115:99:2016,0,1155
6	116325142	.	C	T	694.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.354;DP=60;Dels=0.00;FS=11.933;HRun=0;HaplotypeScore=2.9313;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.776;VQSLOD=4.5590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,30:60:99:725,0,758
6	116446576	.	A	G	2420.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;DP=205;Dels=0.00;FS=1.756;HRun=0;HaplotypeScore=10.9546;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.067;VQSLOD=3.7860;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,103:205:99:2451,0,2555
6	116574452	.	C	T	161.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.245;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7519;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.147;VQSLOD=2.7293;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:191,0,619
6	116575083	.	C	A	455.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.294;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.535;VQSLOD=6.7547;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,18:34:99:485,0,384
6	116600774	.	C	G	816.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=81;Dels=0.00;FS=12.451;HRun=2;HaplotypeScore=3.6336;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.358;VQSLOD=3.0647;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,35:81:99:846,0,1354
6	116600810	.	G	A	1158.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=90;Dels=0.00;FS=0.830;HRun=1;HaplotypeScore=1.8662;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.583;VQSLOD=5.4906;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,43:90:99:1189,0,1204
6	116756773	.	T	C	1015.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.298;DP=91;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=0;HaplotypeScore=3.5217;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.240;VQSLOD=4.7316;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,40:91:99:1045,0,1181
6	116950734	.	G	A	897.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=98;Dels=0.00;FS=4.104;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.051;VQSLOD=5.4500;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,37:98:99:928,0,1531
6	116950833	.	T	C	2638.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.184;DP=209;Dels=0.00;FS=6.754;HRun=1;HaplotypeScore=8.0288;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.891;VQSLOD=4.3295;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,102:209:99:2668,0,2729
6	116973182	.	T	C	2077.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.862;DP=171;Dels=0.00;FS=1.254;HRun=0;HaplotypeScore=1.9298;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.138;VQSLOD=5.7998;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,89:171:99:2107,0,2065
6	117083172	.	C	T	2368.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.447;DP=215;Dels=0.00;FS=1.690;HRun=0;HaplotypeScore=3.9497;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.953;VQSLOD=4.6905;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,100:215:99:2398,0,2860
6	117086378	.	C	A	1096.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.067;DP=131;Dels=0.00;FS=8.194;HRun=2;HaplotypeScore=2.8397;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.646;VQSLOD=4.0716;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,44:131:99:1127,0,2416
6	117130704	.	G	A	729.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.601;DP=76;Dels=0.00;FS=0.914;HRun=0;HaplotypeScore=3.7223;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.073;VQSLOD=6.0561;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,33:76:99:760,0,1104
6	118886961	.	G	T	1509.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.931;DP=162;Dels=0.00;FS=0.608;HRun=0;HaplotypeScore=1.6634;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.627;VQSLOD=6.1486;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,66:162:99:1540,0,2643
6	118887303	.	T	C	1464.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=150;Dels=0.00;FS=8.971;HRun=1;HaplotypeScore=3.2798;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.706;VQSLOD=4.4466;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,60:150:99:1495,0,2585
6	121577370	.	T	C	579.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=45;Dels=0.00;FS=4.546;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.494;VQSLOD=6.1954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,26:45:99:609,0,481
6	121620608	.	G	T	921.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.90;MQ0=0;QD=27.11;VQSLOD=7.4986;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:72.23:955,72,0
6	122773119	.	T	C	2489.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;QD=28.29;VQSLOD=8.4990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2522,208,0
6	123122464	.	C	T	2877.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.956;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.404;HRun=0;HaplotypeScore=2.7320;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.606;VQSLOD=5.2191;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,119:250:99:2907,0,3617
6	123687288	.	A	C	1344.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.83;MQ0=0;QD=28.01;VQSLOD=8.4292;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1378,102,0
6	123833457	.	G	C	293.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.52;MQ0=0;QD=26.68;VQSLOD=7.1233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:24.08:326,24,0
6	127771452	.	T	G	1768.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.17;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=7.9900;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1802,147,0
6	128040839	.	T	C	1086.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.893;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=6.2444;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,45:109:99:1116,0,1688
6	129571330	.	G	A	1783.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;DP=146;Dels=0.00;FS=1.390;HRun=0;HaplotypeScore=4.6364;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=3.187;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.636;VQSLOD=3.6353;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,71:146:99:1813,0,1989
6	129722453	.	C	A	2260.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.212;DP=166;Dels=0.00;FS=2.770;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.221;VQSLOD=5.3704;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,87:166:99:2290,0,1980
6	129807629	.	C	T	663.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.679;DP=73;Dels=0.00;FS=0.970;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.263;VQSLOD=6.0360;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,30:73:99:694,0,1178
6	130031215	.	T	C	1355.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.620;DP=124;Dels=0.00;FS=2.398;HRun=1;HaplotypeScore=1.9142;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.239;VQSLOD=6.2558;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,55:124:99:1385,0,1711
6	130152520	.	A	C	762.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.479;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9916;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=5.3303;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,34:77:99:792,0,980
6	130154667	.	T	C	1735.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.178;DP=149;Dels=0.00;FS=3.837;HRun=2;HaplotypeScore=2.2243;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.085;VQSLOD=5.8832;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,72:149:99:1766,0,1947
6	130154686	.	A	G	4636.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.62;MQ0=0;QD=29.53;VQSLOD=8.7681;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,156:157:99:4636,352,0
6	130374102	.	C	A	1276.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=108;Dels=0.00;FS=2.516;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=11.82;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=5.3166;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,51:108:99:1307,0,1640
6	132859609	.	T	A	3115.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.6646;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.79;VQSLOD=9.5671;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3148,250,0
6	132891675	.	C	T	2000.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6312;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.024;VQSLOD=4.3831;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,85:205:99:2030,0,3547
6	133035098	.	G	A	3936.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6809;MQ=59.80;MQ0=0;QD=34.84;VQSLOD=9.2773;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:113:99:3936,325,0
6	133070995	.	G	T	1801.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.90;VQSLOD=7.1769;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1835,138,0
6	133789728	.	G	A	956.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=85;Dels=0.00;FS=4.327;HRun=0;HaplotypeScore=5.6393;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=1.568;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.565;VQSLOD=4.8494;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,36:85:99:986,0,1277
6	136590698	.	C	T	240.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.003;VQSLOD=2.3698;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,13:44:99:270,0,775
6	136597281	.	A	T	1663.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;DP=125;Dels=0.00;FS=3.335;HRun=0;HaplotypeScore=1.8675;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.038;VQSLOD=3.8511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,64:125:99:1693,0,1753
6	136597288	.	A	C	1745.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.613;DP=123;Dels=0.00;FS=0.682;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.362;VQSLOD=4.1586;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,65:123:99:1775,0,1622
6	136599393	.	G	C	2595.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.091;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.2164;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.542;VQSLOD=4.0847;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,104:244:99:2626,0,4027
6	136599822	.	C	G	879.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=98;Dels=0.00;FS=2.911;HRun=0;HaplotypeScore=2.8575;MQ=56.73;MQ0=1;MQRankSum=-0.151;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.602;VQSLOD=2.9620;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,37:98:99:909,0,1753
6	136682172	.	G	A	410.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=8.0057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:36.11:443,36,0
6	137323213	.	G	A	2447.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.89;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=8.8618;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2481,193,0
6	137325847	.	C	T	2817.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7714;MQ=59.97;MQ0=0;QD=33.54;VQSLOD=9.1066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2850,241,0
6	138413333	.	G	C	2355.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7675;MQ=58.88;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=8.8208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2388,196,0
6	142758631	.	A	G	3173.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8793;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.67;VQSLOD=6.8006;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3206,256,0
6	143091263	.	A	G	2811.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.49;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=9.5909;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:2845,238,0
6	143825104	.	G	T	595.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.905;DP=53;Dels=0.00;FS=6.015;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=5.3849;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,24:53:99:625,0,769
6	146125793	.	A	T	1282.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;DP=118;Dels=0.00;FS=1.478;HRun=1;HaplotypeScore=2.4923;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.022;VQSLOD=5.5636;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,53:118:99:1313,0,1794
6	146126419	.	C	T	2104.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.715;DP=184;Dels=0.00;FS=0.554;HRun=0;HaplotypeScore=1.6630;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.530;VQSLOD=6.7768;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,82:184:99:2135,0,2643
6	146351069	.	G	A	1226.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=97;Dels=0.00;FS=0.771;HRun=0;HaplotypeScore=3.4698;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.514;VQSLOD=4.7869;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,45:97:99:1256,0,1409
6	146755324	.	T	C	1681.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.241;DP=136;Dels=0.00;FS=16.318;HRun=3;HaplotypeScore=1.9311;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.141;VQSLOD=3.0421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,59:136:99:1711,0,2029
6	147635413	.	A	G	1194.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.016;DP=125;Dels=0.00;FS=0.706;HRun=0;HaplotypeScore=2.8178;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.069;VQSLOD=4.1148;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,47:125:99:1224,0,2037
6	148865257	.	A	G	7985.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8300;MQ=59.40;MQ0=0;QD=32.20;VQSLOD=9.7410;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:7984,668,0
6	149721690	.	G	A	3122.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.982;HRun=1;HaplotypeScore=6.4476;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.535;VQSLOD=5.0042;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,112:250:99:3153,0,3996
6	150211123	.	A	T	1092.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.231;VQSLOD=6.9730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,40:90:99:1123,0,1301
6	150342232	.	G	A	8089.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4814;MQ=50.51;MQ0=2;QD=32.36;VQSLOD=3.6012;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8088,677,0
6	150346532	.	T	C	2270.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7774;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.87;VQSLOD=8.1462;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2303,178,0
6	151669875	.	A	G	1300.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=13.5956;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1334,120,0
6	151670172	.	A	C	4392.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5774;MQ=59.86;MQ0=0;QD=33.28;VQSLOD=9.7590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4392,340,0
6	151674326	.	A	C	2560.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.43;MQ0=0;QD=35.08;VQSLOD=9.7814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2594,205,0
6	151894505	.	T	C	1421.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.792;DP=111;Dels=0.00;FS=1.534;HRun=1;HaplotypeScore=5.0335;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.799;VQSLOD=5.1944;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,55:111:99:1451,0,1473
6	151939181	.	G	A	4172.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=59.40;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=9.3192;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4172,346,0
6	152469188	.	C	G	2724.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=34.94;VQSLOD=9.6200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2758,214,0
6	152489294	.	T	C	2191.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2755;MQ=57.71;MQ0=0;QD=28.83;VQSLOD=6.6306;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2224,198,0
6	152540278	.	A	C	4395.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=32.08;ReadPosRankSum=1.530;VQSLOD=9.0624;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,136:137:99:4395,337,0
6	152647681	.	A	T	2347.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.9559;MQ=59.18;MQ0=0;QD=29.71;VQSLOD=8.8142;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2380,184,0
6	152652034	.	A	T	7071.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5700;MQ=58.75;MQ0=0;QD=29.10;VQSLOD=8.3781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,243:243:99:7071,572,0
6	152658141	.	C	A	582.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.223;VQSLOD=6.3563;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,23:58:99:612,0,899
6	152658142	.	T	C	1786.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.49;VQSLOD=9.5581;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1820,141,0
6	152665261	.	C	A	4141.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.54;MQ0=0;QD=31.37;VQSLOD=9.5462;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:132:99:4141,343,0
6	152772264	.	A	G	2072.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.866;DP=153;Dels=0.00;FS=0.650;HRun=0;HaplotypeScore=2.1992;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.272;VQSLOD=6.8079;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,74:153:99:2102,0,2020
6	153043035	.	G	A	3015.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=232;Dels=0.00;FS=1.641;HRun=0;HaplotypeScore=4.7845;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.283;VQSLOD=5.8412;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,108:232:99:3046,0,3200
6	153296370	.	G	A	1447.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=99;Dels=0.00;FS=5.127;HRun=1;HaplotypeScore=1.8410;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.910;VQSLOD=5.8172;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,57:99:99:1478,0,1173
6	153296541	.	G	C	3505.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.32;MQ0=0;QD=34.03;VQSLOD=9.9912;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3505,274,0
6	153323594	.	C	T	2440.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.08;MQ0=0;QD=30.89;VQSLOD=6.9185;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2473,199,0
6	154414446	.	A	T	7837.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7235;MQ=59.24;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=8.5239;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:246:99:7836,620,0
6	155451352	.	G	A	3522.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.92;VQSLOD=9.8723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3522,280,0
6	155561760	.	T	C	3900.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.43;MQ0=0;QD=34.52;VQSLOD=9.5017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3900,310,0
6	158517308	.	A	G	1905.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=9.7473;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1938,156,0
6	158910698	.	G	A	1945.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;DP=146;Dels=0.00;FS=2.157;HRun=1;HaplotypeScore=1.9148;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.306;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.342;VQSLOD=5.7874;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,76:146:99:1975,0,1864
6	159185563	.	T	A	3719.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4533;MQ=59.46;MQ0=0;QD=30.24;VQSLOD=8.0711;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:3719,286,0
6	159652931	.	G	C	1864.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.02;MQ0=0;QD=30.07;VQSLOD=8.0733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:62:99:1897,147,0
6	159655084	.	C	G	1016.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=39;Dels=0.00;FS=3.606;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.111;VQSLOD=3.3001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,38:39:56.59:1049,57,0
6	159655383	.	A	G	733.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32;VQSLOD=13.4716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:72.13:766,72,0
6	160113872	.	A	G	1306.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3639;MQ=58.74;MQ0=0;QD=35.31;VQSLOD=9.4090;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1340,108,0
6	160196343	.	A	G	2567.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3483;MQ=58.59;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=7.3534;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2600,199,0
6	160494409	.	A	G	2501.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.87;MQ0=0;QD=31.26;VQSLOD=9.3760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2534,211,0
6	160551204	.	G	C	6674.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9874;MQ=59.04;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=9.7285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,210:210:99:6674,518,0
6	160560845	.	A	G	2349.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=49.19;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=5.4558;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2382,202,0
6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	2187.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=377.4654;MQ=40.27;MQ0=0;QD=52.09;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:14,28:42:87.28:2230,87,0
6	160670282	.	A	C	4425.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5929;MQ=59.40;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=9.3200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:139:99:4426,334,0
6	160969629	.	A	G	1678.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;DP=152;Dels=0.00;FS=7.229;HRun=0;HaplotypeScore=5.3636;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.093;VQSLOD=2.3085;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,65:152:99:1709,0,2406
6	161152240	.	G	A	2126.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;DP=178;Dels=0.00;FS=1.190;HRun=1;HaplotypeScore=3.4161;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.584;VQSLOD=6.4474;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,84:178:99:2156,0,2314
6	161469774	.	G	A	3558.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.79;MQ0=0;QD=32.05;VQSLOD=9.6076;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3558,283,0
6	161807855	.	C	G	1594.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=149;Dels=0.00;FS=0.608;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=6.8186;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,61:149:99:1625,0,2205
6	166721224	.	C	G	440.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;VQSLOD=12.7259;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:36.11:473,36,0
6	166739646	.	T	C	816.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;DP=71;Dels=0.00;FS=4.868;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.650;VQSLOD=5.1056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,37:71:99:847,0,840
6	166780349	.	G	T	1772.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.127;DP=166;Dels=0.00;FS=1.263;HRun=0;HaplotypeScore=7.3439;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.580;VQSLOD=3.8489;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,80:166:99:1803,0,2067
6	167571048	.	T	C	1285.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.42;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=8.7886;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:40:99:1318,108,0
6	167754661	.	A	G	3618.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.9049;MQ=59.13;MQ0=0;QD=33.82;VQSLOD=9.7471;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3618,289,0
6	167754721	.	G	A	1883.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;DP=149;Dels=0.00;FS=11.353;HRun=1;HaplotypeScore=9.2038;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.754;VQSLOD=3.5971;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,68:149:99:1913,0,2425
6	168459845	.	G	C	302.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53;VQSLOD=12.8594;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:27.08:336,27,0
6	170176648	.	A	G	1052.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.171;DP=94;Dels=0.00;FS=6.817;HRun=1;HaplotypeScore=1.6642;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.010;VQSLOD=4.8148;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:94:99:1083,0,1510
6	170627797	.	A	G	4364.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.425;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.557;HRun=0;HaplotypeScore=6.1919;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.047;VQSLOD=2.9990;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,131:250:99:3699,0,3152
6	170628009	.	T	G	1330.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.707;DP=84;Dels=0.00;FS=3.641;HRun=1;HaplotypeScore=1.7552;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.187;VQSLOD=6.2820;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,43:84:99:1360,0,1046
6	170862300	.	G	C	1478.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.08;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=8.9174;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1511,117,0
7	810219	.	T	C	1093.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=78;Dels=0.00;FS=4.447;HRun=0;HaplotypeScore=1.6598;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.543;VQSLOD=5.5543;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,46:78:99:1124,0,768
7	814788	.	G	A	856.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.226;VQSLOD=6.4863;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:74:99:887,0,1003
7	881668	.	C	T	1779.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.949;DP=116;Dels=0.00;FS=2.442;HRun=0;HaplotypeScore=3.9248;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.617;VQSLOD=5.4277;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,68:116:99:1810,0,1209
7	940181	.	C	T	1101.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.10;MQ0=0;QD=26.87;VQSLOD=7.7759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:90.25:1135,90,0
7	1028376	.	C	T	452.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.482;DP=34;Dels=0.00;FS=3.211;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=4.4350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:482,0,357
7	1049749	.	C	A	636.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.077;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.858;VQSLOD=5.7167;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:666,0,629
7	1608812	.	C	G	1580.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.7438;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.961;VQSLOD=3.1051;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,63:148:99:1610,0,2176
7	1976457	.	C	T	257.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7649;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.767;VQSLOD=4.5187;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:288,0,283
7	2515382	.	G	GC	432.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=22.8192;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.34;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33.11:475,33,0
7	2854010	.	G	A	2065.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.63;MQ0=0;QD=28.69;VQSLOD=8.7414;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2098,162,0
7	4116665	.	G	A	1583.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.332;DP=136;Dels=0.00;FS=3.281;HRun=1;HaplotypeScore=6.0845;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.151;VQSLOD=4.8089;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,65:136:99:1614,0,1575
7	4213975	.	A	G	8034.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.59;MQ0=0;QD=32.40;VQSLOD=9.2901;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:248:99:8033,662,0
7	4308362	.	C	T	2837.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.895;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=2.300;HRun=0;HaplotypeScore=6.9775;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.637;VQSLOD=3.9257;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,103:229:99:2867,0,3187
7	4841470	.	T	C	371.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.23;VQSLOD=11.6307;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:33.10:405,33,0
7	4876057	.	C	T	173.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=21;Dels=0.00;FS=1.922;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.261;VQSLOD=3.5375;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:203,0,337
7	4901385	.	A	C	690.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7990;MQ=57.97;MQ0=0;QD=30.01;VQSLOD=7.6753;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:23:57.17:723,57,0
7	5391702	.	C	G	270.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;DP=22;Dels=0.00;FS=15.092;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.824;VQSLOD=3.1437;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:300,0,349
7	5410425	.	G	C	235.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.333;DP=15;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=2;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.400;VQSLOD=4.0959;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:265,0,100
7	5540244	.	A	C	866.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.293;DP=60;Dels=0.00;FS=1.219;HRun=0;HaplotypeScore=1.7878;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.207;VQSLOD=6.4481;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,31:60:99:897,0,778
7	6026775	.	T	C	6459.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.202;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8490;MQ=45.80;MQ0=11;MQRankSum=-1.699;QD=29.23;ReadPosRankSum=1.102;VQSLOD=2.7483;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,220:221:99:6423,506,0
7	6026988	.	G	A	2568.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.951;DP=217;Dels=0.00;FS=3.092;HRun=0;HaplotypeScore=5.5246;MQ=56.57;MQ0=1;MQRankSum=2.777;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.089;VQSLOD=2.2290;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,105:217:99:2598,0,2904
7	6370194	.	C	T	5604.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=9.3897;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:5604,442,0
7	6370305	.	C	G	2479.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.08;MQ0=0;QD=33.06;VQSLOD=7.9287;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2513,199,0
7	6370406	.	C	T	3295.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7085;MQ=58.01;MQ0=0;QD=32.96;VQSLOD=8.1029;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3295,256,0
7	6449496	.	T	C	1265.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.357;DP=100;Dels=0.00;FS=2.324;HRun=0;HaplotypeScore=2.4440;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.155;VQSLOD=6.2965;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,48:100:99:1295,0,1543
7	6476104	.	G	A	2365.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;DP=189;Dels=0.00;FS=0.573;HRun=0;HaplotypeScore=8.0985;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.830;VQSLOD=4.4684;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,96:189:99:2396,0,2438
7	6621277	.	G	A	1039.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.330;DP=81;Dels=0.00;FS=4.319;HRun=0;HaplotypeScore=1.5661;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.694;VQSLOD=6.0454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,40:81:99:1070,0,974
7	6731672	.	G	C	671.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.238;VQSLOD=5.8449;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,29:79:99:702,0,1336
7	7495735	.	T	C	621.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.214;DP=74;Dels=0.00;FS=1.056;HRun=2;HaplotypeScore=4.9868;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.831;VQSLOD=3.4242;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,25:74:99:652,0,1286
7	7514235	.	C	G	1031.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.440;DP=109;Dels=0.00;FS=1.598;HRun=0;HaplotypeScore=6.9731;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.483;VQSLOD=3.7913;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,45:109:99:1062,0,1692
7	7545691	.	G	C	1180.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.985;DP=86;Dels=0.00;FS=1.835;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.402;VQSLOD=6.2079;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,44:86:99:1210,0,1078
7	7571094	.	G	C	1616.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.32;VQSLOD=9.2797;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1649,129,0
7	11581121	.	T	C	2996.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.07;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=9.2115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3029,241,0
7	13978809	.	T	C	1403.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.431;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.2877;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.305;VQSLOD=4.9728;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,56:106:99:1433,0,1359
7	18066569	.	C	A	4514.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.230;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.008;HRun=0;HaplotypeScore=2.9366;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.077;VQSLOD=6.0047;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,137:250:99:3830,0,3405
7	20687604	.	A	G	102.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.186;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.749;VQSLOD=4.6252;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:132,0,129
7	20691047	.	T	C	1087.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=78;Dels=0.00;FS=4.580;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.425;VQSLOD=5.3061;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,38:78:99:1118,0,1110
7	20698270	.	A	G	3727.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=58.59;MQ0=0;QD=28.02;VQSLOD=8.1059;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:3726,283,0
7	20762646	.	G	T	1679.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.443;DP=125;Dels=0.00;FS=2.684;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.671;VQSLOD=6.2602;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,67:125:99:1709,0,1688
7	20778646	.	G	A	880.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;DP=64;Dels=0.00;FS=3.500;HRun=3;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.507;VQSLOD=6.6322;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,36:64:99:910,0,723
7	21640361	.	T	C	8641.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.3578;MQ=59.04;MQ0=0;QD=34.57;VQSLOD=8.2162;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8606,671,0
7	21640405	.	A	G	7323.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6966;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=32.12;ReadPosRankSum=0.191;VQSLOD=6.9235;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,227:228:99:7297,582,0
7	21779278	.	A	G	1349.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.598;DP=102;Dels=0.00;FS=0.769;HRun=0;HaplotypeScore=2.4326;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.505;VQSLOD=6.3609;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,54:102:99:1380,0,1230
7	21856151	.	G	A	581.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.768;DP=35;Dels=0.00;FS=5.610;HRun=0;HaplotypeScore=2.9921;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.364;VQSLOD=4.6157;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:611,0,377
7	21893993	.	G	T	608.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.087;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.471;VQSLOD=6.9433;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,27:53:99:639,0,725
7	21924014	.	A	G	2945.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8893;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=8.4991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2979,238,0
7	21932044	.	C	T	7858.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7799;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=9.2041;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:7858,620,0
7	23775454	.	G	A	801.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=81;Dels=0.00;FS=0.859;HRun=1;HaplotypeScore=4.8174;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.385;VQSLOD=4.9633;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,31:81:99:832,0,1440
7	23775477	.	G	T	859.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.652;VQSLOD=5.7987;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,38:105:99:890,0,1820
7	23794029	.	G	A	1618.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.009;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7601;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.731;VQSLOD=6.0540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,62:135:99:1648,0,1951
7	23811795	.	T	G	454.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.791;DP=38;Dels=0.00;FS=3.132;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.881;VQSLOD=3.7305;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:485,0,529
7	23811800	.	G	T	514.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=39;Dels=0.00;FS=4.945;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.098;VQSLOD=4.2227;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:544,0,543
7	25181912	.	T	C	1746.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7016;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.140;VQSLOD=5.8559;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,76:114:99:1776,0,855
7	25182405	.	G	T	1563.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.238;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6764;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.435;VQSLOD=5.7411;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,61:106:99:1594,0,1070
7	25194665	.	G	C	958.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.939;DP=82;Dels=0.00;FS=0.849;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.752;VQSLOD=5.5677;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,36:82:99:989,0,1218
7	25194753	.	C	T	1017.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.760;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8455;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.417;VQSLOD=6.6571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,41:79:99:1048,0,889
7	25267963	.	G	C	1943.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5762;MQ=59.12;MQ0=0;QD=28.17;VQSLOD=7.9009;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1977,147,0
7	27196113	.	C	T	2702.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5494;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.038;VQSLOD=4.4173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:19,100:120:99:2735,241,0
7	28996220	.	G	A	553.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.96;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=8.6684;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:45.14:586,45,0
7	28996944	.	T	C	1320.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.16;MQ0=0;QD=34.75;VQSLOD=8.9320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1353,108,0
7	28997596	.	G	GC	902.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=41.2029;MQ=60.00;MQ0=0;QD=42.98;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63.21:945,63,0
7	29160604	.	C	T	1330.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.764;DP=102;Dels=0.00;FS=10.252;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.038;VQSLOD=3.7030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,49:102:99:1360,0,1253
7	30492237	.	C	T	1957.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.254;DP=136;Dels=0.00;FS=5.459;HRun=1;HaplotypeScore=2.6580;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.438;VQSLOD=4.9073;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,71:136:99:1988,0,1720
7	30795331	.	A	G	8625.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=7.4437;MQ=59.72;MQ0=0;QD=34.50;VQSLOD=6.1609;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8625,671,0
7	30795436	.	T	G	7076.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.715;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3913;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=34.18;ReadPosRankSum=-0.561;VQSLOD=8.5665;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,206:207:99:7076,545,0
7	31592733	.	C	A	375.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;DP=30;Dels=0.00;FS=1.485;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.622;VQSLOD=6.5276;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:405,0,357
7	31618008	.	A	G	2136.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=8.3095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2170,181,0
7	31682453	.	C	T	2962.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=1.553;HRun=0;HaplotypeScore=5.4337;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.355;VQSLOD=5.5093;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,115:248:99:2992,0,3238
7	31683410	.	G	A	1544.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.641;DP=129;Dels=0.00;FS=8.089;HRun=0;HaplotypeScore=1.8600;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.500;VQSLOD=5.1151;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:129:99:1574,0,2041
7	32209425	.	A	G	3808.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=34.01;VQSLOD=9.1288;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3808,298,0
7	32338337	.	G	A	550.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=57.20;MQ0=0;QD=25.03;VQSLOD=5.6397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:22:48.12:584,48,0
7	34818113	.	A	T	931.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;DP=88;Dels=0.00;FS=0.819;HRun=2;HaplotypeScore=2.8387;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.270;VQSLOD=6.3832;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,40:88:99:962,0,1053
7	35709842	.	C	T	1690.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.71;VQSLOD=8.5125;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1723,135,0
7	36320821	.	G	A	939.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=14.2498;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:78.24:972,78,0
7	36763672	.	C	T	970.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.538;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.3482;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.269;VQSLOD=4.7568;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,39:79:99:1001,0,992
7	37907304	.	T	C	2856.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9323;MQ=59.75;MQ0=0;QD=30.38;VQSLOD=8.4652;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2889,226,0
7	43664280	.	A	G	1307.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8561;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.608;VQSLOD=5.4867;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,51:101:99:1337,0,1183
7	43810764	.	G	A	1145.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.089;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.972;VQSLOD=6.0757;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,49:99:99:1176,0,1456
7	43916727	.	T	G	1219.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.997;DP=103;Dels=0.00;FS=1.699;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=6.4554;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,44:103:99:1249,0,1582
7	44147485	.	C	A	632.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50;VQSLOD=12.7066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.13:665,57,0
7	44444122	.	G	A	3085.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.002;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.274;VQSLOD=6.9261;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,123:232:99:3115,0,2583
7	44530193	.	T	G	466.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.312;VQSLOD=5.3947;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,18:27:99:497,0,203
7	44578740	.	C	G	1729.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.965;DP=132;Dels=0.00;FS=8.840;HRun=1;HaplotypeScore=2.5160;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.804;VQSLOD=2.3775;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,70:132:99:1759,0,1739
7	44800176	.	G	T	2163.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.309;DP=195;Dels=0.00;FS=0.541;HRun=2;HaplotypeScore=6.9539;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=4.3678;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,87:195:99:2193,0,3010
7	45004063	.	T	C	5477.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.7985;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.98;VQSLOD=7.7908;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:5476,436,0
7	45009341	.	A	G	4317.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4890;MQ=58.85;MQ0=0;QD=29.78;VQSLOD=7.8647;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4316,370,0
7	45016621	.	C	T	1030.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=87;Dels=0.00;FS=13.017;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=11.84;ReadPosRankSum=-2.436;VQSLOD=2.6079;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,41:87:99:1060,0,1102
7	45217015	.	T	C	1752.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;DP=140;Dels=0.00;FS=1.373;HRun=0;HaplotypeScore=4.6867;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.632;VQSLOD=5.6975;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,69:140:99:1783,0,1789
7	45932669	.	A	G	1409	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.348;DP=99;Dels=0.00;FS=0.908;HRun=0;HaplotypeScore=4.4963;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.352;VQSLOD=5.0727;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,50:99:99:1439,0,1177
7	47840310	.	C	G	1380.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=101;Dels=0.00;FS=1.651;HRun=1;HaplotypeScore=3.6267;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.078;VQSLOD=4.2590;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,55:101:99:1410,0,1194
7	47913579	.	T	C	3135.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7297;MQ=58.44;MQ0=0;QD=28.25;VQSLOD=7.8398;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3169,262,0
7	47968927	.	C	A	3104.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.143;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.468;HRun=2;HaplotypeScore=5.1262;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.290;VQSLOD=4.5955;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,113:249:99:3135,0,3735
7	48081095	.	G	T	458.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.907;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.003;VQSLOD=6.5968;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:489,0,395
7	48086077	.	C	T	942.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.803;DP=89;Dels=0.00;FS=1.775;HRun=0;HaplotypeScore=3.6592;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.016;VQSLOD=6.1080;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,38:89:99:973,0,1267
7	48086161	.	T	C	880.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.832;DP=78;Dels=0.00;FS=0.903;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.657;VQSLOD=6.6970;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,36:78:99:911,0,1201
7	48089571	.	C	A	652.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.619;DP=54;Dels=0.00;FS=1.128;HRun=0;HaplotypeScore=1.8606;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=6.1742;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,27:54:99:683,0,709
7	48285485	.	C	T	810.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.665;DP=56;Dels=0.00;FS=1.053;HRun=0;HaplotypeScore=3.7256;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.133;VQSLOD=6.2024;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,33:56:99:841,0,592
7	48287840	.	G	A	274.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.802;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.495;VQSLOD=6.1962;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:305,0,297
7	48315796	.	C	A	330.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=27.53;VQSLOD=7.8650;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:27.09:363,27,0
7	48349647	.	C	T	2761.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.594;HRun=0;HaplotypeScore=7.8327;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.067;VQSLOD=3.8689;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:2792,0,3800
7	48506566	.	A	G	2274.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.413;DP=216;Dels=0.00;FS=1.830;HRun=0;HaplotypeScore=8.2883;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=4.1304;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,102:216:99:2305,0,3062
7	48506642	.	A	G	2381.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=199;DS;Dels=0.00;FS=1.241;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.464;VQSLOD=6.5202;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,95:199:99:2411,0,2828
7	48528923	.	G	C	407.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.532;DP=39;Dels=0.00;FS=1.378;HRun=0;HaplotypeScore=4.9999;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.048;VQSLOD=4.2562;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,19:39:99:437,0,498
7	48545976	.	A	G	6036.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.57;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=8.8249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:203:99:6035,472,0
7	50611735	.	T	C	7776.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6421;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=9.4350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7775,665,0
7	51096036	.	G	C	1391.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.392;DP=164;Dels=0.00;FS=3.884;HRun=0;HaplotypeScore=6.3103;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.578;VQSLOD=4.0192;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,60:164:99:1422,0,3007
7	51096974	.	C	T	4435.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6927;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.86;VQSLOD=9.2418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:4435,358,0
7	51097063	.	T	G	1887.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=33.70;VQSLOD=10.0510;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1920,156,0
7	53103554	.	C	G	967.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;DP=61;Dels=0.00;FS=3.609;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.035;VQSLOD=5.2855;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,33:61:99:997,0,630
7	56136260	.	C	A	2078.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8773;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.48;VQSLOD=9.8363;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2111,165,0
7	64291991	.	T	A	2390.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8410;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=8.5269;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2423,193,0
7	64438667	.	G	A	3036.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.115;DP=96;Dels=0.00;FS=3.245;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.013;VQSLOD=3.7752;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,94:96:99:3069,192,0
7	64439613	.	T	G	933.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11;VQSLOD=14.0228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:78.23:966,78,0
7	64439701	.	C	T	725.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;QD=32.98;VQSLOD=9.0252;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:63.19:758,63,0
7	64452698	.	T	C	1433.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.205;DP=114;Dels=0.00;FS=9.881;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.699;VQSLOD=4.0244;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,54:114:99:1463,0,1702
7	64453136	.	G	A	2621.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=30.49;VQSLOD=8.8088;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2655,214,0
7	65425894	.	A	G	7576.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.5057;MQ=58.86;MQ0=0;QD=30.43;VQSLOD=8.7266;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:7575,641,0
7	69064806	.	A	G	387.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.376;VQSLOD=4.9960;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:418,0,267
7	72297549	.	G	A	1202.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.203;DP=107;Dels=0.00;FS=1.599;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.013;VQSLOD=4.0323;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,53:107:99:1233,0,1525
7	72745738	.	C	T	2364.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.023;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.0324;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=2.7982;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,86:162:99:2395,0,1837
7	72985148	.	C	T	2014.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.716;DP=155;DS;Dels=0.00;FS=4.011;HRun=0;HaplotypeScore=2.2424;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.383;VQSLOD=6.3750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,77:155:99:2045,0,2208
7	73097654	.	C	T	2489.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=198;DS;Dels=0.00;FS=6.024;HRun=1;HaplotypeScore=2.8653;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=4.9813;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,94:198:99:2520,0,2858
7	73249165	.	T	A	3846.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.39;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=8.2936;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:128:99:3846,307,0
7	73249299	.	G	C	1679.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.1101;MQ=58.73;MQ0=0;QD=34.98;VQSLOD=8.9989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1712,132,0
7	73254812	.	T	C	646.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;QD=29.37;VQSLOD=8.1981;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:57.15:679,57,0
7	73275565	.	T	A	1923.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;QD=28.71;VQSLOD=7.6689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1956,156,0
7	73279482	.	T	C	3328.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5572;MQ=59.47;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=8.8415;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:105:99:3328,304,0
7	73470714	.	G	A	3791.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.4639;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=6.0422;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3791,301,0
7	73814749	.	G	C	4562.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.4529;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.82;VQSLOD=6.9893;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:164:99:4561,391,0
7	73969541	.	A	G	2205.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;DP=175;Dels=0.00;FS=0.575;HRun=0;HaplotypeScore=5.6779;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.416;VQSLOD=4.3959;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,88:175:99:2235,0,2116
7	75051368	.	T	C	521.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.875;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=45.55;MQ0=7;MQRankSum=0.509;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.509;VQSLOD=3.9694;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,22:36:99:551,0,319
7	75442730	.	T	G	976.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.391;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5362;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.834;VQSLOD=6.3766;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,37:72:99:1007,0,842
7	75621827	.	A	G	346.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.04;MQ0=0;QD=28.87;VQSLOD=7.4171;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:30.09:379,30,0
7	76144455	.	A	C	309.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;QD=23.81;VQSLOD=7.1281;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:27.08:343,27,0
7	76144483	.	A	G	151.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.722;VQSLOD=4.9275;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:181,0,212
7	76240785	.	CA	C	1560.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=132;FS=15.665;HRun=1;HaplotypeScore=329.6323;MQ=52.23;MQ0=4;MQRankSum=-6.759;QD=11.39;ReadPosRankSum=2.685;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,53:132:99:1600,0,3548
7	77035392	.	T	C	989.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;QD=27.49;VQSLOD=7.5899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:78.25:1023,78,0
7	77247821	.	G	A	1690.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.2998;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.917;VQSLOD=4.4137;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,72:166:99:1721,0,2295
7	77256713	.	A	G	3214.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.675;DP=241;Dels=0.00;FS=5.293;HRun=0;HaplotypeScore=2.3639;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.801;VQSLOD=5.7416;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,120:241:99:3244,0,2994
7	77552127	.	G	A	279.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92;VQSLOD=12.7156;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:24.08:312,24,0
7	81588616	.	T	G	942.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.888;DP=67;Dels=0.00;FS=2.117;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.680;VQSLOD=5.9864;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,39:67:99:972,0,668
7	82453708	.	A	C	710.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3796;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.482;VQSLOD=5.2351;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,29:87:99:741,0,1382
7	82581859	.	C	T	2263.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.473;DP=165;Dels=0.00;FS=0.590;HRun=0;HaplotypeScore=1.5983;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.258;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.779;VQSLOD=5.8760;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,89:165:99:2294,0,1986
7	82582846	.	C	T	871.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=99;Dels=0.00;FS=0.794;HRun=0;HaplotypeScore=1.6671;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.849;VQSLOD=6.4588;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,39:99:99:902,0,1715
7	82764393	.	C	T	2635.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.069;DP=196;DS;Dels=0.00;FS=0.537;HRun=0;HaplotypeScore=4.4810;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.204;VQSLOD=5.1365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,99:196:99:2665,0,2793
7	82764425	.	C	G	5932.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=5.7404;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=32.60;ReadPosRankSum=1.351;VQSLOD=6.4003;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,181:182:99:5910,448,0
7	82785097	.	T	C	1222.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=82;Dels=0.00;FS=5.690;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.609;VQSLOD=5.5421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,44:82:99:1253,0,996
7	87160618	.	A	C	1979.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.118;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4048;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.168;VQSLOD=5.8429;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,61:127:99:2013,123,0
7	87537177	.	A	G	1306.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.020;DP=100;Dels=0.00;FS=5.439;HRun=0;HaplotypeScore=5.8946;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.636;VQSLOD=2.5872;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,46:100:99:1337,0,1341
7	87564497	.	C	G	1263.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14;VQSLOD=13.4248;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1296,102,0
7	87913361	.	C	T	3569.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.60;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=9.2022;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3569,295,0
7	88964196	.	T	A	1679.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;QD=30.00;VQSLOD=9.3647;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1713,138,0
7	88965021	.	G	A	1689.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=8.9463;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=3.527;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.042;VQSLOD=2.4729;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,69:136:99:1720,0,1857
7	89854446	.	T	G	4253.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=32.22;VQSLOD=9.4236;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4253,328,0
7	89861832	.	G	A	1119.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93;VQSLOD=9.2752;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:90.28:1152,90,0
7	89861890	.	G	T	821.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=9.4222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:69.20:855,69,0
7	89912301	.	G	A	2712.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.14;MQ0=0;QD=33.49;VQSLOD=9.8994;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2746,226,0
7	89938588	.	C	G	1493.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=9.6698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1526,117,0
7	89938680	.	C	T	1715.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.35;MQ0=0;QD=28.59;VQSLOD=8.7033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1748,132,0
7	89983808	.	T	G	1979.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=29.11;VQSLOD=8.4991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2012,153,0
7	89984409	.	A	G	2474.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=9.1248;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2508,190,0
7	91503228	.	C	T	2218.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9954;MQ=59.36;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=9.3307;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2252,181,0
7	91714911	.	C	T	2197.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=8.4123;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2230,178,0
7	92028039	.	C	A	1493.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7323;MQ=57.91;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=8.3943;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1527,126,0
7	92733766	.	C	A	1031.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;DP=76;Dels=0.00;FS=4.498;HRun=1;HaplotypeScore=1.8490;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.956;VQSLOD=5.6535;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,39:76:99:1062,0,985
7	92734983	.	A	G	2399.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.790;DP=156;Dels=0.00;FS=3.824;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.546;VQSLOD=6.3132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,92:156:99:2430,0,1564
7	92764489	.	C	T	882.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=75;Dels=0.00;FS=0.902;HRun=0;HaplotypeScore=2.4923;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.699;VQSLOD=6.6674;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,33:75:99:913,0,1228
7	93540153	.	G	C	1403.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.827;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8136;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.082;VQSLOD=5.4497;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,52:82:99:1434,0,737
7	94043239	.	C	G	1041.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.899;DP=95;Dels=0.00;FS=8.590;HRun=0;HaplotypeScore=4.7481;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.851;VQSLOD=3.8653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,43:95:99:1071,0,1372
7	94898811	.	G	A	4290.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.46;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=9.2671;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4290,331,0
7	94946084	.	A	T	2254.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.372;DP=184;DS;Dels=0.00;FS=5.561;HRun=0;HaplotypeScore=5.1282;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.120;VQSLOD=4.1875;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,86:184:99:2284,0,2639
7	95034775	.	G	C	1710.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=135;Dels=0.00;FS=1.360;HRun=0;HaplotypeScore=3.8439;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.103;VQSLOD=5.8245;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,65:135:99:1741,0,1945
7	95041016	.	G	C	424.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=41;Dels=0.00;FS=6.816;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.198;VQSLOD=4.7528;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:454,0,714
7	95216415	.	C	CA	294.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=66;FS=67.469;HRun=2;HaplotypeScore=391.7316;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=2.547;QD=4.40;ReadPosRankSum=-4.235;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,32:66:99:334,0,674
7	97488569	.	A	T	1524.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.857;DP=101;Dels=0.00;FS=2.762;HRun=1;HaplotypeScore=4.2988;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.490;VQSLOD=5.5381;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,61:101:99:1555,0,930
7	97852399	.	G	A	220.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=13.80;ReadPosRankSum=-1.356;VQSLOD=11.0498;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:251,0,154
7	99306685	.	C	G	4103.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5895;MQ=58.02;MQ0=0;QD=30.85;VQSLOD=7.4689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:4103,310,0
7	99474427	.	A	G	5417.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6405;MQ=59.53;MQ0=0;QD=32.44;VQSLOD=9.1378;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5417,421,0
7	99662511	.	GTAGT	G	5235.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.754;DP=212;FS=3.573;HRun=0;HaplotypeScore=997.2276;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.147;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,101:212:99:5235,0,7381
7	99696797	.	T	C	3002.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.199;DP=203;Dels=0.00;FS=5.411;HRun=0;HaplotypeScore=2.7692;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.902;VQSLOD=5.5302;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,105:203:99:3033,0,2403
7	99757612	.	G	A	1105.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.194;DP=94;Dels=0.00;FS=2.786;HRun=0;HaplotypeScore=1.8737;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.578;VQSLOD=6.1507;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,45:94:99:1135,0,1307
7	99817859	.	A	G	201.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.540;VQSLOD=6.8664;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:91.78:231,0,92
7	100228635	.	T	C	136.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.139;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.054;VQSLOD=5.1262;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:20:99:167,0,291
7	100371100	.	C	A	1591.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.71;MQ0=0;QD=30.60;VQSLOD=9.1219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1624,129,0
7	100371114	.	C	T	1162.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.27;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=8.2719;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1195,102,0
7	100371473	.	C	T	602.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9846;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14;VQSLOD=7.0534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.16:636,48,0
7	100371479	.	G	C	321.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.137;VQSLOD=11.0733;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:352,0,218
7	100374087	.	A	G	671.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;DP=25;Dels=0.00;FS=3.188;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=3.9405;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:21.61:704,22,0
7	100386900	.	T	C	2480.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.043;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9791;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.260;VQSLOD=7.2872;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,79:80:99:2513,174,0
7	100388628	.	C	A	142.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=19;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=2;HaplotypeScore=2.8306;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.803;VQSLOD=4.0059;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:173,0,361
7	100391581	.	T	C	1704.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39;VQSLOD=13.5851;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1737,147,0
7	100395003	.	G	C	1482.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.07;MQ0=0;QD=32.94;VQSLOD=8.6253;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1515,120,0
7	100466441	.	G	A	604.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.829;DP=29;Dels=0.00;FS=2.741;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=4.9702;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,26:29:58.44:634,0,58
7	100486754	.	G	C	800.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=60;Dels=0.00;FS=7.558;HRun=1;HaplotypeScore=3.6458;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.606;VQSLOD=4.2079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,31:60:99:831,0,839
7	100552018	.	T	G	2737.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.879;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.140;HRun=0;HaplotypeScore=5.4377;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.402;VQSLOD=4.1579;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,100:250:99:2767,0,4543
7	100552094	.	G	C	2658.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.303;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7982;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.279;VQSLOD=5.7676;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,96:249:99:2688,0,4770
7	100552117	.	G	T	2669.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.778;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.473;HRun=1;HaplotypeScore=5.6541;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.697;VQSLOD=4.5392;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,100:250:99:2700,0,4793
7	100552135	.	T	C	2514.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.110;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=5.303;HRun=1;HaplotypeScore=7.9709;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.218;VQSLOD=3.6741;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,98:246:99:2544,0,4342
7	100610069	.	C	T	2175.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.972;DP=186;Dels=0.00;FS=5.226;HRun=0;HaplotypeScore=6.4448;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.001;VQSLOD=4.1899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,84:186:99:2206,0,2576
7	100731638	.	C	T	157.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;DP=16;Dels=0.00;FS=5.021;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.473;VQSLOD=4.4949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:187,0,232
7	100771717	.	G	A	1542.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.557;DP=142;Dels=0.00;FS=1.372;HRun=0;HaplotypeScore=9.3421;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.454;VQSLOD=3.3801;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,64:142:99:1572,0,2074
7	101200669	.	A	AG	2870.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=173.2311;MQ=60.91;MQ0=0;QD=40.43;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,68:71:99:2913,205,0
7	101200727	.	G	A	379.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;DP=43;Dels=0.00;FS=3.249;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.193;VQSLOD=5.2819;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,16:43:99:409,0,655
7	101917521	.	G	A	4603.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6740;MQ=59.12;MQ0=0;QD=29.89;VQSLOD=7.9401;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:154:99:4603,364,0
7	102098010	.	G	A	1145.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;QD=29.37;VQSLOD=8.8531;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1179,105,0
7	102113226	.	C	T	484.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.972;DP=42;Dels=0.00;FS=7.090;HRun=0;HaplotypeScore=1.9427;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.922;VQSLOD=3.3764;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,17:42:99:515,0,656
7	102668001	.	A	C	3367.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.49;MQ0=0;QD=33.68;VQSLOD=9.4628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3367,259,0
7	102743893	.	C	T	2816.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.64;VQSLOD=8.7147;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2849,223,0
7	105177041	.	A	T	3064.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.034;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.153;HRun=0;HaplotypeScore=7.4441;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.511;VQSLOD=4.2823;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,121:249:99:3094,0,3257
7	107593989	.	T	C	1612.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.426;DP=118;Dels=0.00;FS=6.719;HRun=1;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.159;VQSLOD=5.0892;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,58:118:99:1642,0,1756
7	107834613	.	G	C	6790.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8585;MQ=59.05;MQ0=0;QD=32.49;VQSLOD=8.5202;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:6790,515,0
7	113518434	.	C	A	851.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=73;Dels=0.00;FS=8.380;HRun=0;HaplotypeScore=1.9683;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=4.7174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,34:73:99:882,0,1108
7	113518502	.	A	T	1988.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.48;MQ0=0;QD=30.59;VQSLOD=9.2851;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2021,156,0
7	113519719	.	A	T	1356.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=8.9611;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1389,108,0
7	113519796	.	C	T	2900.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=9.3988;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2933,229,0
7	115624478	.	C	G	2616.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=209;DS;Dels=0.00;FS=0.543;HRun=0;HaplotypeScore=3.3945;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.777;VQSLOD=5.7530;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,101:209:99:2646,0,3015
7	120776097	.	C	G	175.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.204;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.857;VQSLOD=4.3775;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:205,0,276
7	121513561	.	T	G	675.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.672;VQSLOD=6.6906;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,24:62:99:706,0,976
7	121653398	.	G	A	2870.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9707;MQ=55.75;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=4.1145;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2904,238,0
7	122635024	.	C	T	1868	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;DP=154;Dels=0.00;FS=16.610;HRun=0;HaplotypeScore=4.6574;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.395;VQSLOD=3.1384;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,72:154:99:1898,0,2196
7	123599845	.	A	T	1139.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;DP=69;Dels=0.00;FS=6.002;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=4.7513;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,43:69:99:1170,0,612
7	126542667	.	A	T	741.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.458;DP=62;Dels=0.00;FS=2.182;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.345;VQSLOD=2.4048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:62:99:772,0,650
7	127251188	.	T	G	963.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39;VQSLOD=14.2882;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:78.24:996,78,0
7	128363287	.	G	A	2925.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=217;DS;Dels=0.00;FS=4.842;HRun=1;HaplotypeScore=6.6864;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.037;VQSLOD=4.2605;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,103:217:99:2955,0,2986
7	128494922	.	G	A	1751.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.989;DP=134;Dels=0.00;FS=2.189;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.971;VQSLOD=4.0434;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,67:134:99:1782,0,1687
7	129938598	.	G	T	1321.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.690;DP=94;Dels=0.00;FS=1.673;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.083;VQSLOD=5.5206;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,53:94:99:1352,0,988
7	129950740	.	G	T	4190.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.233;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.994;HRun=0;HaplotypeScore=13.1832;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.176;VQSLOD=2.4883;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,139:250:99:3573,0,3024
7	131195712	.	G	A	1740.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.425;DP=146;Dels=0.00;FS=3.366;HRun=2;HaplotypeScore=4.8941;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.093;VQSLOD=5.5047;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,67:146:99:1770,0,2122
7	131195959	.	C	T	4166.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.811;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=13.455;HRun=0;HaplotypeScore=5.0763;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=3.7697;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,126:250:99:3512,0,3074
7	132070054	.	T	C	438.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.915;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.951;VQSLOD=11.3886;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,17:36:99:468,0,483
7	133932357	.	T	C	1190.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;DP=115;Dels=0.00;FS=2.368;HRun=0;HaplotypeScore=2.5310;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.014;VQSLOD=5.8899;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1220,0,1356
7	134225827	.	A	G	864.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4303;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.790;VQSLOD=6.5271;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,36:82:99:894,0,1225
7	134849213	.	G	A	2290.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.085;DP=157;Dels=0.00;FS=7.759;HRun=0;HaplotypeScore=8.0148;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=14.59;ReadPosRankSum=-2.275;VQSLOD=3.5895;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,82:157:99:2321,0,1812
7	134849280	.	T	A	7751.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6384;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=9.1214;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:246:99:7750,623,0
7	134889141	.	G	A	634.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=61;Dels=0.00;FS=2.330;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.770;VQSLOD=5.9400;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,25:61:99:665,0,1072
7	135048804	.	C	T	5254.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4909;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=7.8302;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5253,424,0
7	135269655	.	T	C	1052.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.941;DP=71;Dels=0.00;FS=0.891;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.376;VQSLOD=5.8629;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,39:71:99:1082,0,826
7	135269656	.	G	A	1046.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;DP=69;Dels=0.00;FS=0.916;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.525;VQSLOD=6.0387;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,38:69:99:1076,0,850
7	135304273	.	G	C	3217.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=9.1566;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3251,247,0
7	137600690	.	C	T	902.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;DP=88;Dels=0.00;FS=0.807;HRun=1;HaplotypeScore=2.3893;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=6.7297;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,37:88:99:932,0,1420
7	138312122	.	A	C	791.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.105;DP=54;Dels=0.00;FS=7.785;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.370;VQSLOD=4.4772;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,29:54:99:822,0,620
7	138455988	.	A	G	2524.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.263;DP=236;DS;Dels=0.01;FS=5.133;HRun=0;HaplotypeScore=10.1922;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.001;VQSLOD=4.0459;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,103:236:99:2554,0,3304
7	138486096	.	G	C	985.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.63;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=8.7933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:78.25:1019,78,0
7	138601572	.	C	T	442.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.814;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.775;VQSLOD=4.6488;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:472,0,361
7	138601706	.	C	A	369.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.582;VQSLOD=5.3077;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:400,0,274
7	138602432	.	G	C	450.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.463;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.488;VQSLOD=6.2354;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:480,0,612
7	138602523	.	T	C	33.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.401;VQSLOD=8.1571;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:63.11:63,0,345
7	138603282	.	T	C	3970.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.850;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.096;HRun=0;HaplotypeScore=6.7336;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.045;VQSLOD=4.4312;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,112:250:99:3310,0,3581
7	138732497	.	G	A	4161.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.08;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=9.7344;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4161,331,0
7	138740037	.	G	C	4292.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;QD=35.18;VQSLOD=9.3626;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4292,334,0
7	139653196	.	A	C	4572.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9066;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.58;VQSLOD=8.1538;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:4572,340,0
7	139757712	.	C	A	2028.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=116;Dels=0.00;FS=7.430;HRun=1;HaplotypeScore=1.9806;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=17.49;ReadPosRankSum=-2.424;VQSLOD=3.0560;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,68:116:99:2058,0,1390
7	139797431	.	G	T	1298.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.240;DP=105;Dels=0.00;FS=0.760;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.618;VQSLOD=6.2936;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,52:105:99:1328,0,1352
7	140080087	.	C	G	1122.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;DP=88;Dels=0.00;FS=3.272;HRun=0;HaplotypeScore=1.8991;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.402;VQSLOD=5.3548;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,41:88:99:1152,0,1264
7	140125750	.	T	C	2566.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=1.099;HRun=0;HaplotypeScore=10.6317;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.772;VQSLOD=4.1161;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,94:212:99:2597,0,2955
7	140301731	.	G	T	5220.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.9399;MQ=58.86;MQ0=0;QD=29.66;VQSLOD=4.0995;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,170:176:99:5219,454,0
7	141672705	.	G	A	4051.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;DP=133;Dels=0.00;FS=2.696;HRun=1;HaplotypeScore=5.4739;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.730;VQSLOD=4.0905;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,131:133:99:3991,280,0
7	141747658	.	A	G	1438.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=7.6092;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1472,111,0
7	142724062	.	C	T	2051.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.614;DP=162;Dels=0.00;FS=2.842;HRun=0;HaplotypeScore=1.7998;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=6.5391;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,81:162:99:2082,0,2042
7	142750147	.	C	T	3014.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=5.407;HRun=1;HaplotypeScore=11.8805;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.487;VQSLOD=3.4935;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,111:241:99:3045,0,3798
7	142919731	.	C	A	2456.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.041;DP=208;Dels=0.00;FS=3.196;HRun=0;HaplotypeScore=2.5365;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.855;VQSLOD=6.4261;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,93:208:99:2486,0,3124
7	143017807	.	G	T	5231.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8498;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=32.29;ReadPosRankSum=-1.689;VQSLOD=7.6215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,161:162:99:5231,400,0
7	143043240	.	C	T	1333.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;DP=100;Dels=0.00;FS=3.820;HRun=2;HaplotypeScore=3.5286;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.100;VQSLOD=5.6432;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,50:100:99:1363,0,1257
7	143088867	.	T	C	2393.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.4725;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=9.5108;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2426,187,0
7	143097100	.	A	G	1574.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=9.6446;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1607,135,0
7	143657427	.	C	T	2284.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=202;DS;Dels=0.00;FS=1.179;HRun=0;HaplotypeScore=1.8614;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=11.31;ReadPosRankSum=2.127;VQSLOD=3.2574;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,79:202:99:2315,0,3238
7	143701516	.	C	T	1935.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.671;DP=125;Dels=0.00;FS=2.420;HRun=0;HaplotypeScore=2.8645;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.731;VQSLOD=5.8090;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,68:125:99:1965,0,1541
7	149426305	.	G	GC	956.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=72.7088;MQ=60.38;MQ0=0;QD=38.24;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:72.23:998,72,0
7	149503916	.	GGATA	G	200.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=12;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=59.0828;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.466;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:240,0,438
7	149506211	.	G	GC	720.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=37.7854;MQ=60.00;MQ0=0;QD=42.41;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51.17:763,51,0
7	149511985	.	A	G	274.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48;VQSLOD=13.1856;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:24.08:308,24,0
7	149515775	.	C	G	456.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=42;Dels=0.00;FS=4.581;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=2.434;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.102;VQSLOD=3.2475;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,17:42:99:486,0,654
7	149517978	.	G	T	393.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.263;DP=30;Dels=0.00;FS=3.568;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=13.12;ReadPosRankSum=-1.185;VQSLOD=5.2110;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:423,0,430
7	149519184	.	C	T	418.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.587;DP=40;Dels=0.00;FS=3.410;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.204;VQSLOD=4.8949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,17:40:99:449,0,626
7	149521183	.	G	A	440.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.983;DP=28;Dels=0.00;FS=1.515;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.455;VQSLOD=5.4445;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:471,0,259
7	149522162	.	G	T	301.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=20;Dels=0.00;FS=2.058;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.867;VQSLOD=6.0994;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:332,0,191
7	149523277	.	A	G	1491.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=8.5817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1525,126,0
7	149523584	.	C	T	353.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.951;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.820;VQSLOD=10.7701;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:383,0,329
7	149524913	.	G	A	462.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.100;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=13.60;ReadPosRankSum=-1.206;VQSLOD=6.3674;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,17:34:99:492,0,397
7	149528262	.	C	T	216.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.123;DP=25;Dels=0.00;FS=1.734;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.934;VQSLOD=6.1988;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:247,0,468
7	150269542	.	G	T	1492.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.102;DP=100;Dels=0.00;FS=7.940;HRun=0;HaplotypeScore=4.9828;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.284;VQSLOD=4.3019;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,55:100:99:1523,0,1326
7	150389678	.	T	C	636.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.580;DP=54;Dels=0.00;FS=1.065;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.745;VQSLOD=4.6863;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:54:99:666,0,840
7	150490376	.	C	T	873.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=85;Dels=0.00;FS=7.784;HRun=0;HaplotypeScore=3.3875;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.184;VQSLOD=4.7677;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,34:85:99:903,0,1450
7	150491084	.	T	G	1953.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;DP=171;Dels=0.00;FS=1.952;HRun=0;HaplotypeScore=6.7950;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.480;VQSLOD=4.9951;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,83:171:99:1983,0,2199
7	150500729	.	A	G	4514.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.52;MQ0=0;QD=32.25;VQSLOD=8.5875;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4514,343,0
7	150501516	.	A	G	4250.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8245;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=8.4237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4250,319,0
7	150556055	.	C	G	941.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;QD=33.64;VQSLOD=8.4689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:78.24:975,78,0
7	150696111	.	T	G	5377.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7915;MQ=58.63;MQ0=0;QD=30.38;VQSLOD=6.8348;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:5376,415,0
7	150713902	.	G	GC	2444.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=119.8410;MQ=60.12;MQ0=0;QD=39.43;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,61:62:99:2487,172,0
7	150715817	.	A	G	603.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=13.5045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:51.14:637,51,0
7	150730999	.	G	A	1273.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.362;DP=88;Dels=0.00;FS=0.866;HRun=0;HaplotypeScore=2.6566;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.310;VQSLOD=6.5633;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,52:88:99:1304,0,843
7	150739054	.	G	A	1413.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.668;DP=121;Dels=0.00;FS=3.308;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.258;VQSLOD=5.5750;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,57:121:99:1443,0,1543
7	151680072	.	T	C	4199.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.88;VQSLOD=9.1403;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4198,334,0
7	151684256	.	A	G	270.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.937;DP=35;Dels=0.00;FS=3.580;HRun=1;HaplotypeScore=1.8997;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.122;VQSLOD=4.8349;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,12:35:99:301,0,616
7	151800292	.	A	G	1566.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;DP=138;Dels=0.00;FS=5.113;HRun=0;HaplotypeScore=1.8313;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=5.0056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,63:138:99:1596,0,1991
7	151945071	.	G	GT	2563.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-11.045;DP=240;DS;FS=14.776;HRun=1;HaplotypeScore=783.8574;MQ=47.88;MQ0=2;MQRankSum=0.389;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.017;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,77:240:99:2603,0,4857
7	155531080	.	A	G	846.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.529;DP=77;Dels=0.00;FS=4.632;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.233;VQSLOD=5.8903;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:77:99:876,0,1146
7	156469133	.	C	G	1365.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.273;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4127;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.013;VQSLOD=5.0620;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,57:112:99:1395,0,1303
7	156469179	.	C	T	897.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.681;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5059;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.739;VQSLOD=5.2365;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,33:65:99:927,0,831
7	156761818	.	G	A	889.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7969;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.048;VQSLOD=5.9016;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,37:80:99:919,0,1087
7	156762224	.	G	C	2442.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=172;Dels=0.00;FS=2.753;HRun=0;HaplotypeScore=7.9070;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.354;VQSLOD=3.7440;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,91:172:99:2472,0,2351
7	156762248	.	G	A	2728.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.175;DP=234;Dels=0.00;FS=1.859;HRun=0;HaplotypeScore=5.8248;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.688;VQSLOD=5.2135;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,111:234:99:2758,0,3378
7	157931003	.	C	T	791.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;DP=70;Dels=0.00;FS=2.482;HRun=0;HaplotypeScore=2.3913;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=11.31;ReadPosRankSum=-2.007;VQSLOD=5.2367;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:821,0,1066
7	157931144	.	C	T	2120.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.313;DP=167;Dels=0.00;FS=4.540;HRun=1;HaplotypeScore=4.9950;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=12.70;ReadPosRankSum=2.042;VQSLOD=4.5150;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,82:167:99:2150,0,2395
7	157959911	.	A	G	3030.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=8.8114;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3064,241,0
7	157985149	.	C	G	1289.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;DP=121;Dels=0.00;FS=2.368;HRun=0;HaplotypeScore=5.2249;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.671;VQSLOD=4.8891;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,53:121:99:1319,0,1847
7	158672405	.	C	G	248.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.064;DP=36;Dels=0.00;FS=7.847;HRun=0;HaplotypeScore=3.4485;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.487;VQSLOD=2.6556;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,12:36:99:278,0,671
7	158672476	.	C	G	974.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48;VQSLOD=13.3939;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:81.25:1008,81,0
7	158672619	.	A	G	1309.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=184;Dels=0.00;FS=1.951;HRun=0;HaplotypeScore=1.9155;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.250;VQSLOD=5.9893;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,66:184:99:1339,0,3061
8	381344	.	C	G	882.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.865;DP=56;Dels=0.00;FS=1.688;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.883;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.386;VQSLOD=3.7548;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:56:99:912,0,731
8	2037874	.	C	T	1169.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.376;DP=85;Dels=0.00;FS=0.838;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=13.76;ReadPosRankSum=-2.317;VQSLOD=4.9267;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,44:85:99:1199,0,1116
8	2808730	.	T	A	344.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.826;VQSLOD=5.5763;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:24:99:375,0,171
8	2909992	.	G	A	198.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.365;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.109;VQSLOD=5.7614;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:228,0,146
8	6296550	.	G	T	2061.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8628;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.534;VQSLOD=5.8577;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,69:70:99:2095,153,0
8	6302183	.	G	C	2038.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3869;MQ=57.51;MQ0=0;QD=29.97;VQSLOD=6.9433;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:68:99:2071,159,0
8	6302418	.	A	G	3096.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.62;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=9.1249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3130,238,0
8	6479042	.	C	T	2670.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6774;MQ=58.61;MQ0=0;QD=30.70;VQSLOD=8.1624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:87:99:2704,223,0
8	6500544	.	C	T	1024.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;DP=93;Dels=0.00;FS=1.708;HRun=0;HaplotypeScore=1.8625;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.796;VQSLOD=5.3646;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,40:93:99:1055,0,1441
8	6690276	.	T	C	4836.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8930;MQ=59.36;MQ0=0;QD=31.41;VQSLOD=9.7149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4836,364,0
8	8176221	.	C	T	729.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.759;DP=44;Dels=0.00;FS=1.505;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=16.58;ReadPosRankSum=-1.298;VQSLOD=5.8524;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,30:44:99:760,0,305
8	8176554	.	C	T	2209.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=4.216;HRun=0;HaplotypeScore=7.7441;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.375;VQSLOD=3.7574;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,88:203:99:2239,0,3230
8	8235578	.	C	T	543.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.199;DP=62;Dels=0.00;FS=6.601;HRun=1;HaplotypeScore=1.4450;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.066;VQSLOD=2.8036;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,22:62:99:573,0,1140
8	8747894	.	A	G	3330.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2339;MQ=58.75;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=8.8194;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3330,256,0
8	8887542	.	TAAC	T	2275.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.259;DP=139;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=520.0780;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.477;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,57:139:99:2315,0,4310
8	10383226	.	C	G	1563.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=34.00;VQSLOD=9.3464;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1597,132,0
8	10390452	.	C	T	3547.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9344;MQ=59.81;MQ0=0;QD=29.56;VQSLOD=7.7661;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,119:120:99:3547,286,0
8	10396056	.	G	C	1472.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;DP=102;Dels=0.00;FS=2.631;HRun=1;HaplotypeScore=3.9704;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.010;VQSLOD=5.0595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,55:102:99:1502,0,1426
8	10465748	.	T	C	8384.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.9382;MQ=58.92;MQ0=0;QD=33.54;VQSLOD=3.1783;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8384,662,0
8	10465771	.	G	T	4561.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.012;HRun=0;HaplotypeScore=9.1836;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.282;VQSLOD=2.5620;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,135:250:99:3886,0,2827
8	10465942	.	T	A	3150.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.033;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.992;HRun=1;HaplotypeScore=10.0342;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.438;VQSLOD=3.7034;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,119:250:99:3181,0,3529
8	10466089	.	G	C	2590.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=1.600;HRun=2;HaplotypeScore=10.1180;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.717;VQSLOD=2.9702;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,98:248:99:2621,0,4401
8	10466161	.	C	T	3131.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.132;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=6.039;HRun=0;HaplotypeScore=4.4956;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.336;VQSLOD=4.5576;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3161,0,3830
8	10467124	.	G	C	3508.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7972;MQ=59.61;MQ0=0;QD=32.49;VQSLOD=7.0935;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3508,298,0
8	10467207	.	C	A	6465.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8932;MQ=59.78;MQ0=0;QD=31.23;VQSLOD=8.8106;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6464,542,0
8	10468172	.	G	A	1238.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.164;DP=112;Dels=0.00;FS=1.617;HRun=1;HaplotypeScore=1.7206;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.024;VQSLOD=6.2750;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,45:112:99:1269,0,1789
8	10469233	.	A	G	809.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.858;DP=98;Dels=0.00;FS=8.938;HRun=2;HaplotypeScore=3.8281;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.497;VQSLOD=3.2545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,36:98:99:839,0,1641
8	10470068	.	C	T	1292.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.985;DP=79;Dels=0.00;FS=8.244;HRun=0;HaplotypeScore=1.9157;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.631;VQSLOD=3.6650;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,49:79:99:1322,0,616
8	11301753	.	A	C	2944.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.95;MQ0=0;QD=33.47;VQSLOD=9.3124;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2978,253,0
8	11660362	.	T	C	249.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.173;VQSLOD=5.9531;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:280,0,393
8	11710888	.	G	C	1261.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.237;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9903;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.462;VQSLOD=5.0742;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,53:120:99:1291,0,1882
8	12878637	.	A	G	1615.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=32.31;VQSLOD=9.3535;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1649,144,0
8	12878807	.	T	G	2245.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.991;DP=189;DS;Dels=0.00;FS=1.165;HRun=1;HaplotypeScore=4.6666;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.273;VQSLOD=4.9910;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,85:189:99:2276,0,2913
8	12879099	.	G	A	1541.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5304;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.348;VQSLOD=4.5919;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,55:94:99:1572,0,1012
8	12879539	.	A	G	561.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.308;DP=35;Dels=0.00;FS=1.344;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.712;VQSLOD=5.6307;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,19:35:99:592,0,439
8	12957475	.	C	T	2396.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.539;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6191;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.210;VQSLOD=5.1559;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,90:170:99:2426,0,2190
8	13356802	.	G	A	7090.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7614;MQ=56.35;MQ0=0;QD=31.10;VQSLOD=4.5230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,228:228:99:7089,563,0
8	13356818	.	T	C	6899.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5570;MQ=56.38;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=3.3789;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,228:228:99:6898,563,0
8	13356819	.	T	G	6991.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5570;MQ=56.43;MQ0=0;QD=30.27;VQSLOD=4.2315;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:6990,572,0
8	17157677	.	T	G	2034.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.829;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2775;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.108;VQSLOD=4.5926;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,77:150:99:2065,0,1960
8	17230644	.	G	C	1400.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=8.7780;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1434,111,0
8	17419461	.	G	A	3130.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.341;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.824;HRun=0;HaplotypeScore=4.6201;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.400;VQSLOD=4.2259;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,119:250:99:3160,0,3089
8	17611809	.	G	C	2554.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.504;DP=227;Dels=0.00;FS=4.549;HRun=0;HaplotypeScore=6.3772;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.770;VQSLOD=2.8872;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,101:227:99:2584,0,3688
8	17612875	.	A	G	2661.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=194;DS;Dels=0.00;FS=3.274;HRun=1;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.281;VQSLOD=4.9556;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,99:194:99:2691,0,2609
8	17722223	.	C	T	386.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.741;DP=36;Dels=0.00;FS=3.410;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.621;VQSLOD=4.9110;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,16:36:99:417,0,466
8	17739538	.	T	C	5490.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4703;MQ=58.79;MQ0=0;QD=30.17;VQSLOD=8.3206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5490,439,0
8	17743020	.	G	A	1554.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.35;MQ0=0;QD=27.27;VQSLOD=8.1063;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1588,120,0
8	17796382	.	A	G	1926.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=57.56;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=7.4999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:60:99:1960,153,0
8	17814915	.	A	G	3615.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.48;MQ0=0;QD=31.17;VQSLOD=9.3240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3615,289,0
8	17918934	.	A	G	3464.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.353;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6148;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.840;VQSLOD=7.1527;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,117:120:99:3383,181,0
8	18257854	.	T	C	2365.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.211;DP=195;Dels=0.00;FS=6.152;HRun=0;HaplotypeScore=2.9947;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.229;VQSLOD=4.8522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,96:195:99:2396,0,2521
8	18258316	.	G	A	428.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;DP=39;Dels=0.00;FS=1.235;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.592;VQSLOD=5.2841;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:39:99:459,0,576
8	18729529	.	C	G	1415.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;DP=108;Dels=0.00;FS=3.750;HRun=0;HaplotypeScore=4.3488;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=4.6865;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,54:108:99:1445,0,1497
8	18729817	.	G	A	1533.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.017;DP=115;Dels=0.00;FS=0.721;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.003;VQSLOD=6.1472;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,55:115:99:1563,0,1596
8	18729818	.	T	G	1622.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.235;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.172;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.597;VQSLOD=5.8171;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,58:118:99:1653,0,1578
8	19221700	.	G	A	3786.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=3.6951;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.816;VQSLOD=7.9041;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,121:122:99:3786,310,0
8	19362768	.	C	T	1848.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;DP=133;Dels=0.00;FS=1.411;HRun=1;HaplotypeScore=6.2594;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.311;VQSLOD=3.8006;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,73:133:99:1878,0,1585
8	20036713	.	A	G	3521.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7653;MQ=59.07;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=9.5818;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3521,280,0
8	20038466	.	T	G	78.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7998;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.495;VQSLOD=3.9461;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:15:99:109,0,245
8	21550800	.	A	T	879.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.248;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8197;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.663;VQSLOD=5.4102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:77:99:909,0,1252
8	21956108	.	A	G	576.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=13.3571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:48.14:609,48,0
8	21965113	.	T	C	1635.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0744;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=5.6969;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,58:116:99:1666,0,1546
8	21984945	.	C	T	870.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.647;DP=56;Dels=0.00;FS=6.921;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.533;VQSLOD=4.4363;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,33:56:99:900,0,532
8	21996199	.	G	A	1121.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.040;DP=72;Dels=0.00;FS=7.017;HRun=0;HaplotypeScore=1.7880;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=15.57;ReadPosRankSum=2.596;VQSLOD=3.2652;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,45:72:99:1151,0,619
8	22262321	.	T	C	2636.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.001;DP=207;Dels=0.00;FS=1.722;HRun=3;HaplotypeScore=4.8768;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.969;VQSLOD=5.4667;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,105:207:99:2666,0,2720
8	22428658	.	T	C	2735.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.7808;MQ=59.04;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=8.5718;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2769,223,0
8	22428708	.	A	G	638.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.948;DP=81;Dels=0.00;FS=5.526;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.266;VQSLOD=4.7858;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,29:81:99:668,0,1275
8	22584718	.	T	C	410.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.210;DP=41;Dels=0.00;FS=6.658;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.887;VQSLOD=5.0538;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:441,0,697
8	22886020	.	A	G	7062.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.5731;MQ=59.18;MQ0=0;QD=34.62;VQSLOD=8.9990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:7062,557,0
8	22974450	.	T	C	5205.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.35;MQ0=7;QD=31.74;VQSLOD=8.1217;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:164:99:5205,415,0
8	23001988	.	A	G	3460.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4258;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.37;VQSLOD=8.2809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3460,301,0
8	23004486	.	G	A	1783.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9962;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.349;VQSLOD=4.8313;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,67:131:99:1814,0,1591
8	23049292	.	C	T	1428.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;DP=102;Dels=0.00;FS=8.789;HRun=2;HaplotypeScore=4.6457;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.450;VQSLOD=4.7559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,55:102:99:1459,0,1390
8	23058220	.	T	G	2411.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9278;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.208;VQSLOD=5.1848;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,102:187:99:2442,0,2054
8	23059324	.	C	G	1298.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.331;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8035;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.583;VQSLOD=5.5869;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,49:102:99:1328,0,1365
8	23060256	.	T	C	2085.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.283;DP=186;DS;Dels=0.00;FS=5.088;HRun=0;HaplotypeScore=3.8444;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.692;VQSLOD=5.2150;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,85:186:99:2115,0,2763
8	23167353	.	T	G	622.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.991;DP=67;Dels=0.00;FS=0.950;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.208;VQSLOD=6.1655;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,27:67:99:652,0,999
8	24211331	.	G	A	5615.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.98;MQ0=0;QD=28.51;VQSLOD=8.0647;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:5615,427,0
8	24261526	.	A	G	959.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.221;DP=85;Dels=0.00;FS=13.887;HRun=0;HaplotypeScore=1.8110;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.022;VQSLOD=4.3035;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,38:85:99:990,0,1271
8	24774683	.	C	A	2915.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.72;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=9.3157;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2949,235,0
8	25222165	.	A	G	933.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.44;VQSLOD=7.3790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:75.23:966,75,0
8	25234858	.	A	G	3354.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=8.2912;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3354,253,0
8	25364834	.	A	T	3964.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6249;MQ=58.46;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=7.7539;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:3964,328,0
8	26628028	.	A	G	2904.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.752;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.536;HRun=1;HaplotypeScore=5.4818;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.295;VQSLOD=4.5475;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,115:250:99:2935,0,3724
8	27308585	.	A	C	1231.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.737;DP=117;Dels=0.00;FS=0.696;HRun=0;HaplotypeScore=1.8675;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.489;VQSLOD=6.6593;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,49:117:99:1262,0,1735
8	27324822	.	T	C	1304.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;DP=117;Dels=0.00;FS=1.486;HRun=0;HaplotypeScore=4.5377;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.511;VQSLOD=5.9347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,56:117:99:1334,0,1471
8	27328511	.	G	A	798.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.382;DP=72;Dels=0.00;FS=2.007;HRun=0;HaplotypeScore=3.3288;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.295;VQSLOD=5.5366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,37:72:99:828,0,1043
8	27358505	.	A	G	1466.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.195;DP=148;Dels=0.00;FS=3.089;HRun=0;HaplotypeScore=5.5389;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.141;VQSLOD=4.7323;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,59:148:99:1496,0,2221
8	27903069	.	C	T	912.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;DP=72;Dels=0.00;FS=5.025;HRun=1;HaplotypeScore=2.3620;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.236;VQSLOD=5.3565;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,36:72:99:943,0,1036
8	27918057	.	T	C	1977.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;QD=28.66;VQSLOD=8.0150;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2010,174,0
8	27925204	.	T	C	1920.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.17;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=8.7485;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1954,150,0
8	28304769	.	C	T	1862.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.100;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7099;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.450;VQSLOD=5.9872;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,78:159:99:1893,0,2188
8	30608976	.	C	T	1317.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.19;MQ0=0;QD=28.65;VQSLOD=8.8532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1351,102,0
8	30620840	.	G	GT	4915.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=263.5284;MQ=59.87;MQ0=0;QD=38.11;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:9,120:129:99:4916,364,0
8	33318891	.	T	C	2051.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.326;DP=180;Dels=0.00;FS=0.616;HRun=2;HaplotypeScore=1.9774;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.174;VQSLOD=4.5126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,78:180:99:2081,0,2736
8	33356074	.	A	G	1377.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.906;DP=119;Dels=0.00;FS=7.113;HRun=1;HaplotypeScore=7.0688;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.040;VQSLOD=3.7895;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,53:119:99:1408,0,1718
8	33369944	.	T	C	2116.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=140;Dels=0.00;FS=5.208;HRun=1;HaplotypeScore=1.7719;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.829;VQSLOD=5.7012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,78:140:99:2146,0,1642
8	36767024	.	T	C	3745.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5769;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.50;VQSLOD=7.9174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:3745,319,0
8	37728017	.	A	G	2504.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=28.78;ReadPosRankSum=-0.591;VQSLOD=7.5210;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,86:87:99:2537,166,0
8	37730368	.	G	A	5103.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3281;MQ=59.14;MQ0=0;QD=30.93;VQSLOD=8.0400;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:165:99:5103,421,0
8	38095662	.	C	T	2606.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.264;DP=220;Dels=0.00;FS=4.675;HRun=0;HaplotypeScore=4.7874;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.947;VQSLOD=3.9457;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,101:220:99:2636,0,2901
8	39080632	.	C	G	882.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43;VQSLOD=13.7037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:72.20:915,72,0
8	39840234	.	A	G	598.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.223;DP=37;Dels=0.00;FS=2.944;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.046;VQSLOD=4.7283;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,22:37:99:629,0,317
8	39862881	.	C	T	508.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.773;VQSLOD=11.4307;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,21:54:99:539,0,832
8	39872935	.	T	A	1050.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.629;DP=83;Dels=0.00;FS=9.271;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.242;VQSLOD=4.2520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,39:83:99:1081,0,1254
8	40011079	.	G	A	3465.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.47;MQ0=0;QD=30.40;VQSLOD=9.3419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3465,268,0
8	40438757	.	T	C	1592.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.677;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.895;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.656;VQSLOD=4.0992;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,61:138:99:1622,0,1872
8	41906095	.	A	G	1019.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.456;DP=73;Dels=0.00;FS=3.943;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.436;VQSLOD=6.3518;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,37:73:99:1049,0,984
8	48805816	.	A	AG	1104.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=52.5045;MQ=58.67;MQ0=0;QD=40.89;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:78.26:1146,78,0
8	48885436	.	T	A	2730.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.41;MQ0=0;QD=31.75;VQSLOD=8.5770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2764,220,0
8	52321243	.	T	C	897.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.90;VQSLOD=14.1742;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75.23:931,75,0
8	53586706	.	A	G	2949.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=5.538;HRun=0;HaplotypeScore=7.7623;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=3.112;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.900;VQSLOD=2.9842;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,112:226:99:2979,0,3088
8	53852871	.	A	T	1123.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.322;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.565;VQSLOD=6.3907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,46:85:99:1154,0,869
8	55539395	.	A	T	2039.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.380;DP=162;Dels=0.00;FS=11.532;HRun=1;HaplotypeScore=1.9945;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.932;VQSLOD=3.6465;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,73:162:99:2069,0,2232
8	55542540	.	G	A	716.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=85;Dels=0.00;FS=0.825;HRun=0;HaplotypeScore=1.8100;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=5.3436;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,34:85:99:746,0,1281
8	56686224	.	T	C	1713.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.1010;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.08;VQSLOD=8.5149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1746,132,0
8	64098729	.	A	AG	4631.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=197.1804;MQ=59.93;MQ0=0;QD=46.31;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,99:100:99:4631,292,0
8	65493429	.	T	G	184.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.036;VQSLOD=11.0286;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:215,0,337
8	67592152	.	T	C	462.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.524;DP=28;Dels=0.00;FS=4.265;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.599;VQSLOD=5.9210;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:493,0,286
8	67796120	.	C	G	1179.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;DP=76;Dels=0.00;FS=0.874;HRun=1;HaplotypeScore=2.6812;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.413;VQSLOD=5.6456;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,42:76:99:1210,0,872
8	68536470	.	A	G	1308.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.654;DP=128;Dels=0.00;FS=2.361;HRun=0;HaplotypeScore=5.6046;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.306;VQSLOD=5.1078;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,54:128:99:1338,0,1833
8	69699756	.	G	A	544.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.657;DP=46;Dels=0.00;FS=3.830;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.681;VQSLOD=6.0466;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,23:46:99:575,0,687
8	70980738	.	T	C	941.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.131;DP=68;Dels=0.00;FS=6.688;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.007;VQSLOD=5.0227;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,38:68:99:972,0,736
8	71039118	.	C	G	967.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=83;Dels=0.00;FS=2.924;HRun=2;HaplotypeScore=3.7336;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.722;VQSLOD=4.8236;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,35:83:99:998,0,1336
8	72936145	.	T	C	578.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.070;DP=59;Dels=0.00;FS=3.940;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.031;VQSLOD=4.6949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,27:59:99:609,0,903
8	72975801	.	T	G	1083.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.418;DP=85;Dels=0.00;FS=6.520;HRun=0;HaplotypeScore=3.9761;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.321;VQSLOD=4.9233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,40:85:99:1114,0,1087
8	72977703	.	C	T	871.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;DP=57;Dels=0.00;FS=1.182;HRun=2;HaplotypeScore=4.9512;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.870;VQSLOD=4.1106;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,34:57:99:901,0,607
8	73982161	.	A	G	3918.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4820;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.266;VQSLOD=8.9086;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,129:130:99:3879,277,0
8	74527996	.	C	T	4573.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3281;MQ=59.07;MQ0=0;QD=29.13;VQSLOD=8.4299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:4572,361,0
8	74917084	.	A	G	5064.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=29.10;VQSLOD=8.3577;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:5064,382,0
8	76452313	.	G	A	2747.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=9.2742;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2781,220,0
8	76468282	.	G	A	1729.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.03;VQSLOD=8.3222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1763,132,0
8	77895865	.	A	G	4579.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9482;MQ=58.50;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=8.2790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4579,355,0
8	86021994	.	G	A	647.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=54;Dels=0.00;FS=2.386;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.199;VQSLOD=4.5245;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,28:54:99:677,0,733
8	86049708	.	T	C	1297.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.163;DP=100;Dels=0.00;FS=2.888;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.266;VQSLOD=5.0723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,54:100:99:1327,0,1200
8	86351997	.	G	A	860.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.739;DP=74;Dels=0.00;FS=6.182;HRun=0;HaplotypeScore=1.8920;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.585;VQSLOD=5.3092;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,35:74:99:891,0,881
8	87235273	.	C	T	5284.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;QD=30.37;VQSLOD=9.4237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:174:99:5248,412,0
8	87519315	.	T	G	1776.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.457;DP=128;Dels=0.00;FS=3.446;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.164;VQSLOD=6.5817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,66:128:99:1806,0,1565
8	87588198	.	T	C	1388.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.966;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8482;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=0.535;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.230;VQSLOD=6.5203;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,55:139:99:1419,0,2195
8	87666251	.	T	G	1067.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.43;VQSLOD=7.7672;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:42:81.25:1101,81,0
8	87679303	.	A	C	3407.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=59.78;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=9.0381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3407,265,0
8	90990479	.	C	G	2473.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.93;MQ0=0;QD=28.10;VQSLOD=7.8555;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2506,187,0
8	94808165	.	A	G	1191.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.730;DP=122;Dels=0.00;FS=4.486;HRun=0;HaplotypeScore=6.7934;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.562;VQSLOD=4.4052;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,52:122:99:1221,0,1728
8	95143172	.	T	G	3627.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=14.2375;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3626,295,0
8	95143186	.	C	G	3625.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96;VQSLOD=8.1129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3625,283,0
8	95188850	.	T	C	1250.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;DP=98;Dels=0.00;FS=3.991;HRun=0;HaplotypeScore=8.8859;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.145;VQSLOD=4.4382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,51:98:99:1280,0,1237
8	95272605	.	G	C	919.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;DP=75;Dels=0.00;FS=4.904;HRun=1;HaplotypeScore=5.4349;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.855;VQSLOD=3.5476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,38:75:99:949,0,906
8	97614661	.	T	A	5622.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5868;MQ=59.17;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=8.3839;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,180:180:99:5622,451,0
8	98656966	.	G	T	299.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.959;DP=22;Dels=0.00;FS=9.332;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.386;VQSLOD=3.6095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:330,0,207
8	98703317	.	A	G	1851.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.685;DP=140;Dels=0.00;FS=3.116;HRun=0;HaplotypeScore=3.4379;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.864;VQSLOD=4.7027;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,72:140:99:1882,0,1792
8	98991221	.	A	G	4319.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.07;VQSLOD=9.5853;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4319,328,0
8	99148791	.	A	G	2401.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.470;DP=226;Dels=0.00;FS=0.491;HRun=0;HaplotypeScore=8.4417;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.013;VQSLOD=2.6786;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,96:226:99:2431,0,3053
8	100133706	.	T	G	4571.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1908;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=31.75;ReadPosRankSum=-1.516;VQSLOD=8.5322;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,143:144:99:4571,349,0
8	100994274	.	A	G	2356.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.601;DP=153;DS;Dels=0.00;FS=3.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.196;VQSLOD=4.5416;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,81:153:99:2386,0,1942
8	101206391	.	G	A	561.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;DP=44;Dels=0.00;FS=2.614;HRun=1;HaplotypeScore=1.9950;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.869;VQSLOD=3.7498;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,21:44:99:591,0,575
8	101252680	.	T	C	3068.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7776;MQ=59.77;MQ0=0;QD=28.68;VQSLOD=7.9268;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3102,259,0
8	101586133	.	T	C	1475.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.616;DP=138;Dels=0.00;FS=0.647;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.046;VQSLOD=5.6869;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,60:138:99:1506,0,1879
8	101648164	.	C	G	2898.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.58;MQ0=0;QD=28.99;VQSLOD=7.9367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:2932,217,0
8	104312432	.	A	G	1807.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.099;DP=151;Dels=0.00;FS=16.269;HRun=0;HaplotypeScore=2.8015;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.414;VQSLOD=3.5025;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,67:151:99:1837,0,2125
8	104427359	.	A	C	1604.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.700;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.025;VQSLOD=12.2206;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,53:99:99:1634,0,1246
8	105361354	.	G	C	4086.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.760;DP=246;Dels=0.00;FS=0.987;HRun=0;HaplotypeScore=5.1250;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.304;VQSLOD=3.9497;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,126:246:99:3475,0,3239
8	105367121	.	A	G	866.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=53;Dels=0.00;FS=4.135;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=3.1568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,32:53:99:897,0,495
8	108970367	.	A	G	6284.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7813;MQ=59.20;MQ0=0;QD=32.40;VQSLOD=9.5750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:194:99:6284,500,0
8	110301998	.	T	C	645.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=64;Dels=0.00;FS=1.065;HRun=0;HaplotypeScore=1.8154;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.345;VQSLOD=4.0482;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,28:64:99:676,0,891
8	110302047	.	T	G	1051.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=78;Dels=0.00;FS=1.832;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=3.574;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.845;VQSLOD=3.0026;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,40:78:99:1081,0,993
8	110413762	.	T	C	567.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.779;DP=38;Dels=0.00;FS=2.910;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.330;VQSLOD=6.0875;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,26:38:99:598,0,273
8	110437384	.	A	G	535.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.281;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.511;VQSLOD=11.6572;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:566,0,602
8	110455321	.	C	A	2606.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=2.246;HRun=0;HaplotypeScore=6.2877;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.248;VQSLOD=3.6977;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,104:242:99:2637,0,3211
8	110460488	.	G	T	468.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;DP=46;Dels=0.00;FS=2.444;HRun=1;HaplotypeScore=1.9956;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.587;VQSLOD=5.2099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,20:46:99:498,0,756
8	113241088	.	T	G	2109.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;QD=29.29;VQSLOD=8.1175;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2142,163,0
8	117783914	.	A	C	402.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=59;Dels=0.00;FS=1.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.144;VQSLOD=5.2942;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,18:59:99:432,0,1086
8	117783975	.	C	T	590.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.347;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.583;VQSLOD=6.2240;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,23:53:99:620,0,797
8	118184783	.	C	T	2080.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.815;DP=163;Dels=0.00;FS=0.587;HRun=0;HaplotypeScore=4.7383;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.731;VQSLOD=4.9875;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,72:163:99:2110,0,2278
8	120596023	.	A	G	4247.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5145;MQ=58.58;MQ0=0;QD=31.46;VQSLOD=7.7317;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4247,325,0
8	120803637	.	C	G	2102.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=142;Dels=0.00;FS=1.414;HRun=0;HaplotypeScore=3.9238;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.101;VQSLOD=5.3068;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,82:142:99:2133,0,1491
8	120847188	.	T	C	1362.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;DP=131;Dels=0.00;FS=2.244;HRun=0;HaplotypeScore=5.7298;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.102;VQSLOD=5.0261;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,57:131:99:1393,0,1713
8	121013770	.	A	G	1780.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=60.18;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=8.1607;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1814,138,0
8	121061879	.	G	A	3923.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.434;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.112;VQSLOD=7.2104;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,124:230:99:3324,0,3049
8	124206324	.	G	A	1316.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.292;DP=99;Dels=0.00;FS=9.516;HRun=0;HaplotypeScore=2.6548;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.724;VQSLOD=4.7339;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,50:99:99:1347,0,1280
8	124440174	.	A	G	5689.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2770;MQ=58.92;MQ0=0;QD=30.59;VQSLOD=8.2121;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5689,427,0
8	124448736	.	A	G	4631.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.078;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=32.39;ReadPosRankSum=-1.441;VQSLOD=9.1966;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,142:143:99:4596,323,0
8	124448804	.	T	A	4664.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9317;MQ=58.97;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=8.6190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4664,367,0
8	124449466	.	C	T	2588.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9621;MQ=58.50;MQ0=0;QD=29.75;VQSLOD=8.3069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2622,199,0
8	124658214	.	C	T	1419.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.756;DP=106;Dels=0.00;FS=1.597;HRun=0;HaplotypeScore=6.1683;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.269;VQSLOD=4.9106;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,56:106:99:1450,0,1436
8	124664130	.	C	T	1925.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.746;DP=153;Dels=0.00;FS=1.321;HRun=1;HaplotypeScore=4.5844;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.960;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.350;VQSLOD=4.7289;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,69:153:99:1956,0,2238
8	124664167	.	T	C	3701.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.25;MQ0=0;QD=31.91;VQSLOD=9.5393;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,115:116:99:3701,319,0
8	124664874	.	T	C	2085.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=8.3526;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2119,177,0
8	124665124	.	C	T	1861.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.742;DP=124;Dels=0.00;FS=3.397;HRun=1;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.826;VQSLOD=4.5769;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,69:124:99:1892,0,1332
8	124696867	.	C	T	5213.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=1;QD=31.41;VQSLOD=9.2030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5213,415,0
8	124710729	.	C	T	2676.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.943;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6946;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.177;VQSLOD=5.4849;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,105:211:99:2707,0,2559
8	124824826	.	G	A	3125.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2424;MQ=42.79;MQ0=2;QD=28.41;VQSLOD=2.2032;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3158,262,0
8	125076589	.	T	G	6885.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8295;MQ=58.79;MQ0=0;QD=30.07;VQSLOD=9.2301;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,229:229:99:6884,518,0
8	125463250	.	T	C	1517.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.503;DP=119;Dels=0.00;FS=6.349;HRun=0;HaplotypeScore=4.7180;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.128;VQSLOD=4.5874;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,61:119:99:1547,0,1614
8	125562029	.	C	T	1068.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;DP=84;Dels=0.00;FS=5.683;HRun=0;HaplotypeScore=1.4942;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.436;VQSLOD=5.5845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,42:84:99:1099,0,1243
8	125565328	.	T	C	3001.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.222;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.430;HRun=0;HaplotypeScore=4.1747;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.360;VQSLOD=5.9208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,109:250:99:3032,0,3735
8	130789767	.	G	A	2433.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.551;DP=217;Dels=0.00;FS=1.057;HRun=0;HaplotypeScore=3.3612;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.921;VQSLOD=5.7830;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,100:217:99:2464,0,3095
8	131124559	.	T	C	900.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.863;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.156;VQSLOD=6.6793;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,31:49:99:930,0,468
8	133053309	.	T	C	6419.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2401;MQ=59.17;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=8.2749;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:6419,509,0
8	133053318	.	T	C	6876.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.8037;MQ=58.81;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=5.7516;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:6875,548,0
8	133920518	.	A	G	1774.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9734;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=30.59;ReadPosRankSum=-0.896;VQSLOD=6.2912;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:1807,112,0
8	133975283	.	G	A	8102.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.361;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.8327;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=33.90;ReadPosRankSum=-0.447;VQSLOD=8.2194;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,237:239:99:8034,594,0
8	134108546	.	T	C	7545.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4068;MQ=58.64;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=9.0448;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,244:244:99:7544,635,0
8	139165273	.	G	A	5132.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4649;MQ=56.97;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=5.3596;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5132,400,0
8	139165289	.	T	C	4633.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=57.48;MQ0=0;QD=31.10;VQSLOD=6.7848;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4633,358,0
8	139701209	.	G	T	2352.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.087;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=11.0553;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.570;VQSLOD=3.5572;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,95:167:99:2382,0,1779
8	139838912	.	T	C	1753.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.2359;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.799;VQSLOD=4.8316;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,70:167:99:1783,0,2480
8	142222445	.	T	C	927.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.795;VQSLOD=6.3678;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,38:80:99:958,0,1213
8	142446923	.	C	T	792.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.58;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=8.5007;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:66.21:825,66,0
8	142458053	.	A	G	697.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.24;MQ0=0;QD=27.88;VQSLOD=7.8430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:54.18:730,54,0
8	142490079	.	G	A	3512.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=8.8174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3512,280,0
8	142490120	.	G	T	2549.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=9.5184;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,78:79:99:2583,205,0
8	142505578	.	C	A	3817.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=9.6641;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3817,289,0
8	142506436	.	C	T	797	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.417;DP=65;Dels=0.00;FS=2.332;HRun=0;HaplotypeScore=1.8928;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.292;VQSLOD=5.6786;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,28:65:99:827,0,1043
8	142506461	.	A	G	2629.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.73;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=9.3594;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2662,202,0
8	142517222	.	A	G	2464.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34;VQSLOD=14.0232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:84:99:2497,190,0
8	142517227	.	C	T	2524.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=14.1930;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2558,196,0
8	143413136	.	C	T	576.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=16.03;ReadPosRankSum=-1.746;VQSLOD=6.5191;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,23:36:99:607,0,282
8	143425720	.	T	C	144.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=12;Dels=0.00;FS=3.310;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.896;VQSLOD=3.3383;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:90.93:175,0,91
8	143427178	.	C	G	1404.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.474;DP=107;Dels=0.00;FS=1.918;HRun=2;HaplotypeScore=1.7860;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.135;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.302;VQSLOD=5.0274;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,52:107:99:1434,0,1649
8	143436034	.	A	G	320.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.117;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.531;VQSLOD=10.7513;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,16:42:99:350,0,686
8	143746050	.	C	T	882.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67;VQSLOD=14.1781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.20:915,72,0
8	143816828	.	G	A	446.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=12.7290;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.11:479,39,0
8	143833850	.	G	A	2172.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.933;VQSLOD=7.3686;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,77:79:99:2205,177,0
8	143833856	.	C	T	2291.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;QD=31.39;VQSLOD=8.8505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2324,184,0
8	144124609	.	T	C	484.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.892;DP=33;Dels=0.00;FS=3.247;HRun=1;HaplotypeScore=4.2842;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.940;VQSLOD=4.7205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:514,0,370
8	144332012	.	T	C	432.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.01;MQ0=0;QD=22.75;VQSLOD=6.8857;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:39.10:465,39,0
8	144406705	.	C	T	2243.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.311;DP=169;Dels=0.00;FS=4.054;HRun=0;HaplotypeScore=1.6624;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.565;VQSLOD=5.3938;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,87:169:99:2273,0,2171
8	144620183	.	T	C	1393.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.581;DP=107;Dels=0.00;FS=0.773;HRun=1;HaplotypeScore=1.4538;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.034;VQSLOD=6.5989;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,56:107:99:1423,0,1447
8	144620342	.	T	C	797.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.093;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6463;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.909;VQSLOD=4.6957;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,34:88:99:827,0,1426
8	144620660	.	G	A	2278.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.280;DP=171;Dels=0.00;FS=1.996;HRun=0;HaplotypeScore=7.6919;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.134;VQSLOD=3.1990;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,84:171:99:2309,0,2210
8	144621035	.	G	A	415.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.443;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.308;VQSLOD=6.8141;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,16:27:99:445,0,275
8	144621084	.	T	G	603.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.022;DP=36;Dels=0.00;FS=1.715;HRun=0;HaplotypeScore=5.9673;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.032;VQSLOD=4.8183;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,21:36:99:633,0,437
8	144621091	.	A	T	567.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9799;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.147;VQSLOD=4.9359;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:39:99:598,0,490
8	144649968	.	C	T	316.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78;VQSLOD=13.4212;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:30.08:350,30,0
8	144654249	.	G	A	773.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76;VQSLOD=13.6562;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:72.17:807,72,0
8	144654255	.	A	G	637.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99;VQSLOD=12.8790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:60.14:671,60,0
8	144654594	.	G	T	319.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.20;MQ0=0;QD=24.57;VQSLOD=6.4036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:30.08:352,30,0
8	144671685	.	G	C	488.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=8.4876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.13:521,42,0
8	144681777	.	G	T	416.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75;VQSLOD=14.6118;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.11:450,36,0
8	144688736	.	C	G	1608.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=8.3641;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1642,132,0
8	144732418	.	A	G	5648.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0295;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=8.5783;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:5647,463,0
8	144775871	.	C	A	1353.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23;VQSLOD=13.6215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1387,108,0
8	144811338	.	C	G	6940.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=8.7607;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,220:220:99:6939,536,0
8	144893084	.	G	A	657.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;DP=52;Dels=0.00;FS=2.371;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.612;VQSLOD=6.3408;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:688,0,666
8	144941181	.	G	C	1754.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;DP=141;Dels=0.00;FS=1.538;HRun=2;HaplotypeScore=6.9485;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.466;VQSLOD=4.0120;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,63:141:99:1784,0,2394
8	144942903	.	T	C	327.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.668;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=6.9809;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:14:1.89:358,3,0
8	144945792	.	T	C	944.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.58;VQSLOD=8.4919;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:75.24:978,75,0
8	144946818	.	C	T	239.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=26;Dels=0.00;FS=3.741;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.090;VQSLOD=4.6462;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:270,0,324
8	144997783	.	G	A	131.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;DP=20;Dels=0.00;FS=2.452;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.127;VQSLOD=2.9896;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:161,0,325
8	145057868	.	A	G	284.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;DP=18;Dels=0.00;FS=1.913;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.815;VQSLOD=3.9347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:315,0,137
8	145150832	.	A	G	3820.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7959;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.17;VQSLOD=8.1852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:3820,331,0
8	145161823	.	G	A	519.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32;VQSLOD=13.5831;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:42.13:552,42,0
8	145223288	.	C	T	1513.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8237;MQ=58.60;MQ0=0;QD=28.56;VQSLOD=7.7659;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1547,138,0
8	145639726	.	T	C	88.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=11;Dels=0.00;FS=2.808;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.336;VQSLOD=5.2229;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:11:99:118,0,130
8	145640411	.	A	G	1137.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;DP=86;Dels=0.00;FS=6.948;HRun=1;HaplotypeScore=3.3636;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.739;VQSLOD=3.6899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,42:86:99:1168,0,1286
8	145641564	.	T	G	192.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.780;VQSLOD=6.5617;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:15:99:223,0,137
8	145642002	.	C	T	188.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;DP=14;Dels=0.00;FS=5.756;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.627;VQSLOD=5.7649;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:219,0,174
8	145661675	.	G	A	503.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;DP=39;Dels=0.00;FS=3.274;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.524;VQSLOD=6.3839;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,22:39:99:534,0,447
8	145665407	.	C	T	502.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.448;VQSLOD=11.6470;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,21:52:99:532,0,875
8	145742514	.	A	G	967.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5592;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.84;VQSLOD=8.1708;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:78.25:1001,78,0
8	146067054	.	G	A	1840.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.340;DP=134;Dels=0.00;FS=2.408;HRun=0;HaplotypeScore=2.7095;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.541;VQSLOD=6.4246;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,66:134:99:1871,0,1925
9	399255	.	G	A	1199.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;DP=82;Dels=0.00;FS=0.952;HRun=1;HaplotypeScore=1.8245;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=4.7072;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,46:82:99:1229,0,854
9	449874	.	G	C	1679.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;DP=144;Dels=0.00;FS=2.256;HRun=1;HaplotypeScore=1.9814;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.106;VQSLOD=6.4695;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,66:144:99:1710,0,1999
9	712156	.	T	G	2761.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.73;MQ0=0;QD=32.87;VQSLOD=9.4621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2794,214,0
9	732536	.	T	C	5982.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7900;MQ=58.91;MQ0=0;QD=32.69;VQSLOD=9.1876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:5982,466,0
9	990653	.	G	T	1923.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=169;Dels=0.00;FS=0.592;HRun=0;HaplotypeScore=5.3614;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.124;VQSLOD=5.2681;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,75:169:99:1954,0,2449
9	1056728	.	G	C	1993.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=172;Dels=0.00;FS=2.745;HRun=1;HaplotypeScore=6.3170;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.997;VQSLOD=4.3623;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,76:172:99:2024,0,2853
9	2191309	.	C	G	1409.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;DP=93;Dels=0.00;FS=5.328;HRun=0;HaplotypeScore=3.3245;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.211;VQSLOD=4.2395;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,52:93:99:1439,0,1089
9	2718712	.	C	A	1644.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=131;Dels=0.00;FS=4.523;HRun=0;HaplotypeScore=3.8287;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.123;VQSLOD=3.5735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,64:131:99:1675,0,1965
9	4118208	.	A	G	254.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.18;VQSLOD=11.6947;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:21.07:288,21,0
9	5557672	.	T	C	6848.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6796;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.09;VQSLOD=8.7960;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6848,536,0
9	5557708	.	T	C	2124.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.000;DP=156;DS;Dels=0.00;FS=1.388;HRun=0;HaplotypeScore=2.8181;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=6.4698;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,71:156:99:2155,0,2401
9	6328947	.	T	C	5385.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6640;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=9.7342;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:170:99:5385,418,0
9	6986464	.	G	C	1484.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6299;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=-1.169;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.530;VQSLOD=4.9187;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,55:108:99:1515,0,1427
9	7046901	.	C	G	761.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.686;VQSLOD=5.4196;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,29:64:99:791,0,994
9	7798518	.	G	C	3109.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8877;MQ=56.52;MQ0=0;QD=29.62;VQSLOD=3.5781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3143,238,0
9	7799653	.	G	T	740.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=59;Dels=0.00;FS=3.608;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.346;VQSLOD=4.3306;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,30:59:99:771,0,744
9	8518052	.	G	C	2507.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;DP=218;Dels=0.00;FS=8.921;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.241;VQSLOD=4.1074;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,96:218:99:2537,0,3494
9	14737506	.	T	G	504.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.407;DP=37;Dels=0.00;FS=1.271;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.874;VQSLOD=6.5280;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:534,0,422
9	14816829	.	G	C	170.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.518;DP=19;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.115;VQSLOD=4.5230;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:201,0,302
9	15784631	.	A	G	833.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.137;DP=59;Dels=0.00;FS=9.379;HRun=0;HaplotypeScore=2.6613;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.253;VQSLOD=4.5782;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,34:59:99:864,0,646
9	17273731	.	A	G	1620.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.518;DP=132;Dels=0.00;FS=5.583;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=-1.388;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.460;VQSLOD=4.6035;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,60:132:99:1650,0,1757
9	17394536	.	C	T	299.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.06;VQSLOD=12.8575;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:24.08:333,24,0
9	18775810	.	C	A	591.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.84;MQ0=0;QD=29.57;VQSLOD=8.5492;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:51.15:624,51,0
9	18777196	.	A	C	523.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.074;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.182;VQSLOD=5.9093;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,21:44:99:553,0,632
9	18829952	.	A	G	490.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.256;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.9025;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.460;VQSLOD=5.6100;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:520,0,373
9	18950787	.	G	A	2754.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.497;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=1.578;HRun=0;HaplotypeScore=8.1695;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.727;VQSLOD=4.6676;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,111:244:99:2785,0,3284
9	18950895	.	T	C	2458.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.400;DP=170;Dels=0.00;FS=6.930;HRun=0;HaplotypeScore=3.7569;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.285;VQSLOD=4.9393;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,93:170:99:2489,0,1898
9	20866974	.	C	G	2717.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=57.10;MQ0=0;QD=29.54;VQSLOD=5.3940;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2751,208,0
9	20953049	.	A	G	1751.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=14.6366;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1785,138,0
9	20988426	.	A	G	1614.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=9.6321;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1647,129,0
9	21970916	.	C	T	772.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.313;DP=80;Dels=0.00;FS=4.592;HRun=0;HaplotypeScore=2.1500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.325;VQSLOD=5.7322;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,32:80:99:803,0,1100
9	25677953	.	T	C	403.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=13.3624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.10:436,39,0
9	27183463	.	A	C	7293.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8052;MQ=59.00;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.6175;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,240:241:99:7253,569,0
9	27524731	.	A	G	5564.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.02;MQ0=0;QD=33.52;VQSLOD=10.1556;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5564,445,0
9	32480251	.	A	T	1901.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.954;DP=163;Dels=0.00;FS=2.815;HRun=1;HaplotypeScore=2.1992;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.589;VQSLOD=5.5101;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,74:163:99:1932,0,2206
9	32550896	.	G	C	710.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9947;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=13.66;ReadPosRankSum=-2.260;VQSLOD=4.9973;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:740,0,612
9	33264540	.	C	G	509.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5661;MQ=58.55;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=8.2558;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:45.14:542,45,0
9	33927899	.	G	A	3373.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6841;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=29.59;ReadPosRankSum=-0.453;VQSLOD=7.8718;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,113:114:99:3373,286,0
9	33941759	.	T	C	4238.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=57.88;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=8.0730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:134:99:4238,328,0
9	34257095	.	G	A	2973.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=8.9846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3006,232,0
9	34310927	.	T	C	5157.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8594;MQ=59.36;MQ0=0;QD=30.52;VQSLOD=8.5144;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:169:99:5157,436,0
9	34311020	.	T	C	776.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;DP=66;Dels=0.00;FS=3.565;HRun=1;HaplotypeScore=3.8198;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.244;VQSLOD=5.6256;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,31:66:99:806,0,1026
9	34371454	.	G	C	447.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=45;Dels=0.00;FS=1.161;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.199;VQSLOD=6.1408;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,20:45:99:477,0,697
9	34372783	.	G	C	1391.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5968;MQ=57.20;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=6.6166;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1425,117,0
9	34372873	.	C	G	3754.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.8047;MQ=58.82;MQ0=0;QD=31.82;VQSLOD=8.1043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3754,295,0
9	34372931	.	T	A	3083.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=29.65;VQSLOD=8.5178;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3116,256,0
9	34379692	.	C	T	2548.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.0731;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.70;VQSLOD=7.3988;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2582,211,0
9	34622389	.	A	C	684.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.511;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.356;VQSLOD=6.4132;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,26:63:99:714,0,1122
9	35043291	.	G	T	5938.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.403;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6887;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=32.45;ReadPosRankSum=1.523;VQSLOD=8.1708;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,181:183:99:5893,428,0
9	35546735	.	A	G	4250.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5508;MQ=59.33;MQ0=0;QD=34.28;VQSLOD=9.6846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:4250,328,0
9	35606884	.	G	A	1406.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.385;DP=101;Dels=0.00;FS=3.875;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.341;VQSLOD=6.5879;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,59:101:99:1436,0,1171
9	35660990	.	A	G	4738.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.1553;MQ=59.68;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=8.6397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4738,379,0
9	35662251	.	T	C	1697.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.286;DP=149;Dels=0.00;FS=4.260;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.629;VQSLOD=6.3485;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,72:149:99:1727,0,2087
9	35674053	.	G	A	971.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;DP=88;Dels=0.00;FS=5.406;HRun=0;HaplotypeScore=3.5823;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.285;VQSLOD=4.7611;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,40:88:99:1002,0,1335
9	35675799	.	C	A	538.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.360;DP=51;Dels=0.00;FS=2.471;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.162;VQSLOD=5.7932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,22:51:99:569,0,725
9	35712003	.	G	A	4817.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.76;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=9.3230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4817,370,0
9	35870001	.	T	C	2632.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8730;MQ=59.43;MQ0=0;QD=32.50;VQSLOD=9.5593;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2665,226,0
9	37503087	.	G	A	5284.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.0804;MQ=59.54;MQ0=0;QD=35.47;VQSLOD=7.6678;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:5285,415,0
9	37692654	.	A	C	2647.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.045;DP=189;Dels=0.00;FS=1.828;HRun=2;HaplotypeScore=5.4124;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=14.01;ReadPosRankSum=-2.424;VQSLOD=3.6919;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,107:189:99:2678,0,1970
9	38396002	.	C	T	2139.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.624;DP=165;Dels=0.00;FS=1.290;HRun=0;HaplotypeScore=4.5770;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.194;VQSLOD=5.9108;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,85:165:99:2170,0,2223
9	38396065	.	G	T	3094.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6406;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.557;VQSLOD=5.9903;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,115:248:99:3125,0,3204
9	38396502	.	G	A	4733.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1879;MQ=58.99;MQ0=0;QD=31.99;VQSLOD=8.2273;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4733,379,0
9	71628207	.	G	C	2595.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;DP=174;Dels=0.00;FS=5.523;HRun=1;HaplotypeScore=3.4767;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.807;VQSLOD=4.5163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,98:174:99:2626,0,2100
9	71865988	.	C	T	2249.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.625;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=3.012;HRun=1;HaplotypeScore=4.5457;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.204;VQSLOD=4.4934;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,96:225:99:2280,0,3422
9	72741312	.	G	A	2296.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6421;MQ=58.29;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=8.8250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2329,187,0
9	72897434	.	G	A	3002.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6193;MQ=58.69;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=8.2247;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3035,241,0
9	72897440	.	T	C	977.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=97;Dels=0.00;FS=0.783;HRun=0;HaplotypeScore=1.8317;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.264;VQSLOD=6.1957;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,40:97:99:1008,0,1400
9	73150873	.	T	G	2199.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.670;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.1200;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=13.66;ReadPosRankSum=1.206;VQSLOD=5.8372;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,80:161:99:2229,0,1989
9	73150918	.	C	T	2869.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.021;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.0931;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.810;VQSLOD=3.9319;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,100:199:99:2899,0,2910
9	73150984	.	C	T	4199.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.664;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=7.0053;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.80;ReadPosRankSum=-1.255;VQSLOD=3.9130;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,120:250:99:3513,0,3500
9	74360096	.	C	T	1200.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.768;DP=108;Dels=0.00;FS=20.438;HRun=0;HaplotypeScore=1.9117;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.144;VQSLOD=2.6476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,43:108:99:1230,0,1591
9	78937974	.	C	T	296.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=11.8574;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:326,0,202
9	79318677	.	T	C	2113.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;QD=35.22;VQSLOD=9.7345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2146,169,0
9	79318998	.	A	G	4361.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.21;MQ0=0;QD=33.81;VQSLOD=10.0723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4362,340,0
9	79320640	.	C	T	3930.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.5304;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:126:99:3930,316,0
9	79321276	.	T	C	6506.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2018;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=7.9716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:6505,506,0
9	79322068	.	G	T	3141.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9852;MQ=58.97;MQ0=0;QD=33.42;VQSLOD=9.4780;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3175,250,0
9	79322674	.	A	G	863.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77;VQSLOD=13.7236;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:72.22:896,72,0
9	79324179	.	G	A	2958.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=47.37;MQ0=0;QD=32.16;VQSLOD=4.6740;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2991,256,0
9	79324741	.	T	C	1175.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=30.95;VQSLOD=9.0237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:93.29:1209,93,0
9	90500193	.	C	G	2638.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=157;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5671;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.352;VQSLOD=4.6825;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,88:157:99:2669,0,1907
9	90500405	.	A	C	1017.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.699;DP=71;Dels=0.00;FS=2.103;HRun=2;HaplotypeScore=2.8898;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.869;VQSLOD=6.2851;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,37:71:99:1047,0,925
9	90501448	.	C	A	1008.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;DP=80;Dels=0.00;FS=11.876;HRun=1;HaplotypeScore=2.8861;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.896;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.877;VQSLOD=3.0184;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,39:80:99:1039,0,1172
9	90501500	.	G	A	969.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.389;DP=101;Dels=0.00;FS=1.677;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.017;VQSLOD=5.7094;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,39:101:99:999,0,1568
9	90501514	.	C	G	850.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;DP=100;Dels=0.00;FS=3.929;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.074;VQSLOD=5.5361;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,37:100:99:880,0,1788
9	90501609	.	C	T	898.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3365;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.469;VQSLOD=5.3059;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,40:87:99:929,0,1347
9	90502458	.	T	A	1520.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.502;DP=95;Dels=0.00;FS=3.904;HRun=0;HaplotypeScore=5.2433;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.019;VQSLOD=3.9300;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,53:95:99:1550,0,1158
9	90503007	.	A	G	479.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.642;VQSLOD=6.3212;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:509,0,441
9	90503451	.	G	A	1441.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.698;DP=115;Dels=0.00;FS=4.685;HRun=0;HaplotypeScore=3.7842;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.049;VQSLOD=4.8385;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,58:115:99:1472,0,1414
9	94486321	.	C	T	2741.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.62;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=9.1772;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2774,232,0
9	94495608	.	T	C	1939.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.03;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.6527;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.95;VQSLOD=7.9636;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1973,159,0
9	95179071	.	G	A	932.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=87;Dels=0.00;FS=1.765;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.399;VQSLOD=5.7871;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:963,0,1437
9	95284982	.	T	G	2118.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.010;DP=197;Dels=0.00;FS=1.796;HRun=1;HaplotypeScore=1.9937;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.126;VQSLOD=6.0667;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,93:197:99:2148,0,2565
9	95887320	.	G	T	1476.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=108;Dels=0.00;FS=2.873;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.337;VQSLOD=5.5510;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,55:108:99:1506,0,1426
9	96021312	.	G	A	560.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.038;DP=42;Dels=0.00;FS=2.709;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.887;VQSLOD=6.0483;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,21:42:99:591,0,586
9	96209943	.	T	C	1847.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.204;DP=131;Dels=0.00;FS=1.451;HRun=0;HaplotypeScore=2.2880;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.405;VQSLOD=6.1165;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,72:131:99:1878,0,1471
9	96212813	.	C	T	1502.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7981;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.264;VQSLOD=4.6637;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,58:109:99:1533,0,1437
9	96214928	.	G	A	511.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.395;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.822;VQSLOD=6.2720;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,21:41:99:541,0,556
9	97055310	.	C	T	997.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;DP=80;Dels=0.00;FS=0.857;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.554;VQSLOD=6.4107;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,40:80:99:1028,0,984
9	97349666	.	C	G	5657.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9966;MQ=59.25;MQ0=0;QD=33.88;VQSLOD=9.5946;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5657,442,0
9	97369149	.	C	T	4203.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.0857;MQ=59.29;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=8.5310;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4203,325,0
9	99581568	.	T	C	1266.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.406;DP=105;Dels=0.00;FS=3.643;HRun=0;HaplotypeScore=10.0270;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.356;VQSLOD=4.0069;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,53:105:99:1297,0,1217
9	100194406	.	T	C	1734.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.869;DP=167;Dels=0.00;FS=2.779;HRun=0;HaplotypeScore=4.6017;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.997;VQSLOD=5.2855;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,68:167:99:1764,0,2607
9	100388119	.	G	T	1373.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=121;Dels=0.00;FS=0.697;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.247;VQSLOD=5.2083;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,57:121:99:1403,0,1762
9	100388197	.	C	T	1109.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.397;DP=81;Dels=0.00;FS=0.960;HRun=0;HaplotypeScore=2.7214;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.269;VQSLOD=6.5942;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,40:81:99:1140,0,911
9	100991430	.	C	A	988.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=88;Dels=0.00;FS=7.129;HRun=0;HaplotypeScore=2.3322;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.246;VQSLOD=5.0589;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,42:88:99:1018,0,1247
9	100995721	.	A	G	1521.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4936;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.664;VQSLOD=3.6752;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,61:133:99:1552,0,2086
9	100995758	.	G	T	2541.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.035;DP=214;Dels=0.00;FS=1.250;HRun=0;HaplotypeScore=8.1868;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=11.88;ReadPosRankSum=-2.111;VQSLOD=3.8164;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,104:214:99:2572,0,3055
9	101056122	.	T	C	2158.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=165;Dels=0.00;FS=13.685;HRun=0;HaplotypeScore=1.9950;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=2.159;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=3.5099;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,78:165:99:2189,0,2397
9	101533220	.	C	T	1360.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94;VQSLOD=8.3799;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1393,111,0
9	101748234	.	G	A	3165.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=2.339;HRun=0;HaplotypeScore=5.7830;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.156;VQSLOD=4.5418;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,118:220:99:3196,0,2496
9	101748356	.	A	G	3414.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=9.3972;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3414,274,0
9	101797330	.	C	T	1399.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=107;Dels=0.00;FS=6.308;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.540;VQSLOD=4.8602;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,50:107:99:1429,0,1606
9	104133628	.	C	T	5258.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7772;MQ=58.98;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=9.0391;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:169:99:5257,403,0
9	104335682	.	C	T	2827.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.568;DP=220;Dels=0.00;FS=0.498;HRun=0;HaplotypeScore=2.7427;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.210;VQSLOD=6.3575;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,110:220:99:2858,0,2792
9	107266596	.	T	C	3781.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7136;MQ=59.07;MQ0=0;QD=33.77;VQSLOD=8.0206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3782,298,0
9	107266844	.	A	G	5569.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.1608;MQ=59.13;MQ0=0;QD=34.17;VQSLOD=6.6720;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5569,445,0
9	107266943	.	G	A	3816.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.45;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.6472;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3816,313,0
9	107267304	.	C	T	5695.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;QD=32.55;VQSLOD=10.0046;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5695,454,0
9	107360768	.	GT	G	1803.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.078;DP=125;FS=0.673;HRun=1;HaplotypeScore=383.2546;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.612;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,53:125:99:1843,0,3018
9	107360826	.	A	G	1611.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.525;DP=154;Dels=0.00;FS=5.059;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.642;VQSLOD=5.7044;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,68:154:99:1641,0,2304
9	107360851	.	T	C	1897.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;DP=161;Dels=0.00;FS=3.654;HRun=0;HaplotypeScore=2.5338;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.480;VQSLOD=6.1731;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,75:161:99:1927,0,2313
9	107360922	.	A	G	2000.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.296;DP=166;Dels=0.00;FS=2.728;HRun=0;HaplotypeScore=8.8098;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.329;VQSLOD=4.6593;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,76:166:99:2030,0,2508
9	107361129	.	C	T	3032.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.731;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=1.619;HRun=0;HaplotypeScore=2.7802;MQ=56.19;MQ0=1;MQRankSum=1.083;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.488;VQSLOD=2.8049;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,115:237:99:3062,0,3194
9	107367392	.	TGTTA	T	2641.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.097;DP=187;DS;FS=12.868;HRun=0;HaplotypeScore=896.8413;MQ=46.59;MQ0=5;MQRankSum=-6.698;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.711;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,69:187:99:2681,0,10220
9	107367664	.	AGC	A	1630.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=93;FS=1.925;HRun=0;HaplotypeScore=401.1849;MQ=23.74;MQ0=77;MQRankSum=1.713;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.077;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,63:93:99:1670,0,2478
9	107457532	.	C	T	2180.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.649;DP=174;Dels=0.00;FS=1.882;HRun=1;HaplotypeScore=7.8752;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.550;VQSLOD=4.8645;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,79:174:99:2210,0,2366
9	107515214	.	G	A	3803.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9774;MQ=58.77;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=8.8680;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3803,289,0
9	107562804	.	T	C	5295.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.228;DP=181;Dels=0.00;FS=2.873;HRun=0;HaplotypeScore=3.8545;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=29.26;ReadPosRankSum=-1.052;VQSLOD=4.0249;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,179:181:99:5223,331,0
9	108363426	.	C	T	278.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;DP=26;Dels=0.00;FS=4.075;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.026;VQSLOD=4.7568;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:308,0,371
9	109687403	.	A	G	1190.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.258;DP=112;Dels=0.00;FS=1.571;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.267;VQSLOD=5.9414;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,45:112:99:1220,0,1751
9	109689752	.	C	T	3185.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.099;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.566;HRun=1;HaplotypeScore=8.9727;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.203;VQSLOD=4.5568;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,114:250:99:3216,0,3761
9	109691676	.	A	G	2010.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.368;DP=173;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4856;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=6.4571;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,71:173:99:2040,0,2720
9	111945049	.	T	G	5941.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6515;MQ=58.70;MQ0=1;QD=31.44;VQSLOD=9.3392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:5941,463,0
9	112687354	.	C	T	1371.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.240;DP=117;Dels=0.00;FS=4.487;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.278;VQSLOD=3.6009;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,55:117:99:1402,0,1493
9	112900199	.	T	C	771.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7351;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.071;VQSLOD=6.3158;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,37:90:99:802,0,1536
9	112969744	.	AT	A	1899	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.954;DP=107;DS;FS=0.928;HRun=1;HaplotypeScore=280.6207;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.120;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,54:107:99:1938,0,2081
9	113091523	.	T	G	427.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.585;DP=64;Dels=0.00;FS=1.047;HRun=0;HaplotypeScore=1.8300;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.282;VQSLOD=5.0905;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,20:64:99:457,0,1013
9	113166792	.	A	T	4053.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.599;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.617;VQSLOD=6.0267;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3406,0,3447
9	113192279	.	A	T	999.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;DP=66;Dels=0.00;FS=3.735;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.860;VQSLOD=3.9468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,40:66:99:1029,0,575
9	113234507	.	T	C	2490.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.522;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.5036;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.610;VQSLOD=5.0663;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,96:206:99:2521,0,2895
9	113276356	.	C	G	241.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=33;Dels=0.00;FS=1.533;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.286;VQSLOD=3.3809;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,11:33:99:272,0,622
9	113457799	.	A	G	244.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.251;VQSLOD=6.4825;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:275,0,127
9	113538122	.	G	A	992.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;DP=153;Dels=0.00;FS=2.449;HRun=0;HaplotypeScore=6.7441;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.003;VQSLOD=2.7986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,46:153:99:1023,0,2983
9	114359624	.	C	A	782.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.387;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9900;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.054;VQSLOD=6.4559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,33:64:99:812,0,878
9	114454580	.	A	G	3495.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29;VQSLOD=9.1274;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3495,274,0
9	114462322	.	A	G	1468.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=9.4829;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1502,117,0
9	114464487	.	T	C	2558.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=33.22;VQSLOD=9.2928;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2591,199,0
9	114468966	.	A	C	2098.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.677;DP=170;Dels=0.00;FS=7.712;HRun=0;HaplotypeScore=5.7936;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.248;VQSLOD=4.8227;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,84:170:99:2128,0,2050
9	114476748	.	T	A	2548.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=188;Dels=0.00;FS=6.260;HRun=1;HaplotypeScore=5.7539;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.420;VQSLOD=4.3998;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,106:188:99:2579,0,2071
9	114490308	.	T	C	1224.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.04;VQSLOD=6.9875;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1257,99,0
9	114982463	.	T	C	274.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.115;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.380;VQSLOD=6.7482;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:304,0,256
9	114982549	.	C	T	315.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;DP=34;Dels=0.00;FS=10.991;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=9.27;ReadPosRankSum=2.036;VQSLOD=3.8160;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:345,0,519
9	115818949	.	A	T	1454.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.842;DP=120;Dels=0.00;FS=0.842;HRun=0;HaplotypeScore=7.8712;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.614;VQSLOD=3.1886;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,60:120:99:1484,0,1476
9	115950706	.	A	C	864.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.217;DP=56;Dels=0.00;FS=1.059;HRun=0;HaplotypeScore=3.5825;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.008;VQSLOD=5.5836;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,31:56:99:895,0,554
9	116053252	.	C	T	2265.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=149;Dels=0.00;FS=4.373;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.039;VQSLOD=4.0911;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,85:149:99:2295,0,1677
9	116060124	.	T	C	938.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.318;VQSLOD=6.8089;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,34:70:99:968,0,1058
9	116060221	.	C	T	1265.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.309;DP=98;Dels=0.00;FS=3.918;HRun=0;HaplotypeScore=4.9959;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.854;VQSLOD=5.1014;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,46:98:99:1296,0,1228
9	116082647	.	C	G	2358.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;DP=188;Dels=0.00;FS=2.561;HRun=0;HaplotypeScore=2.8933;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.413;VQSLOD=6.2332;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,86:188:99:2388,0,2635
9	116132334	.	C	T	1470.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.588;DP=109;Dels=0.00;FS=2.576;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=6.8698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,55:109:99:1501,0,1450
9	116136198	.	C	T	8250.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.1116;MQ=59.50;MQ0=0;QD=33.00;VQSLOD=6.7809;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8249,659,0
9	116356516	.	A	G	3761.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8857;MQ=59.53;MQ0=0;QD=35.83;VQSLOD=8.3660;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:105:99:3762,289,0
9	116356529	.	C	G	3167.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34;VQSLOD=13.6149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3201,253,0
9	116931099	.	G	A	2319.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.398;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=1.056;HRun=0;HaplotypeScore=2.6906;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.620;VQSLOD=6.4910;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,98:225:99:2350,0,3278
9	116931666	.	A	T	1542.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.987;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5588;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.665;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.163;VQSLOD=5.0050;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,66:159:99:1572,0,2243
9	117124731	.	G	A	450.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=30;Dels=0.00;FS=3.312;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.642;VQSLOD=5.8154;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:480,0,388
9	117166246	.	A	G	1630.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;DP=192;DS;Dels=0.00;FS=1.228;HRun=0;HaplotypeScore=5.4898;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.760;VQSLOD=4.8042;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,70:192:99:1661,0,3155
9	117166338	.	G	C	3588.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=32.93;VQSLOD=9.4053;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3589,280,0
9	117169033	.	A	G	645.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.033;VQSLOD=6.8928;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,24:46:99:676,0,589
9	117188566	.	C	T	3422.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7046;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.84;VQSLOD=9.1922;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3422,277,0
9	117792583	.	C	G	7769.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5580;MQ=59.33;MQ0=0;QD=34.38;VQSLOD=7.8244;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,226:226:99:7768,626,0
9	117808785	.	T	A	6930.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8068;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.81;VQSLOD=8.8416;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6930,542,0
9	117853237	.	C	T	1218.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.591;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.1673;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.202;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.543;VQSLOD=3.9401;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,45:102:99:1249,0,1418
9	118163563	.	C	T	2825.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=8.7906;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:95:99:2859,232,0
9	119106881	.	C	A	6372.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=3.738;HRun=0;HaplotypeScore=4.4217;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=30.93;ReadPosRankSum=-1.681;VQSLOD=3.9082;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,205:206:99:6346,499,0
9	119413896	.	T	C	2104.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=159;Dels=0.00;FS=2.105;HRun=0;HaplotypeScore=6.1434;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.128;VQSLOD=3.4926;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,81:159:99:2134,0,1993
9	121971069	.	C	T	1551.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.440;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.734;VQSLOD=6.0859;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,57:108:99:1581,0,1367
9	123170733	.	C	G	1623.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;DP=117;Dels=0.00;FS=0.761;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.953;VQSLOD=5.5386;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,60:117:99:1653,0,1574
9	123291036	.	C	G	2104.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;QD=30.95;VQSLOD=9.5508;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2138,160,0
9	123688217	.	G	A	1365.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.109;DP=106;Dels=0.00;FS=0.734;HRun=0;HaplotypeScore=2.5773;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.068;VQSLOD=5.0795;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,56:106:99:1396,0,1239
9	123725926	.	T	G	1025.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=108;Dels=0.00;FS=0.777;HRun=0;HaplotypeScore=1.7866;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.010;VQSLOD=5.5626;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,47:108:99:1056,0,1581
9	123769200	.	C	T	1184.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.406;DP=92;Dels=0.00;FS=0.810;HRun=0;HaplotypeScore=4.8848;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.119;VQSLOD=5.8410;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,53:92:99:1214,0,875
9	123850770	.	G	A	2769.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=30.10;VQSLOD=8.4670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:92:99:2802,217,0
9	123860689	.	C	T	1268	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.306;DP=88;Dels=0.00;FS=5.750;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.985;VQSLOD=5.4543;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,48:88:99:1298,0,1062
9	124088908	.	C	G	317.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.472;DP=25;Dels=0.00;FS=1.760;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.819;VQSLOD=3.5954;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:347,0,368
9	124089692	.	C	T	404.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.185;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=22.48;ReadPosRankSum=-2.369;VQSLOD=11.4814;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:46.36:435,0,46
9	124103523	.	A	G	3920.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.674;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.912;HRun=0;HaplotypeScore=3.7812;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.805;VQSLOD=4.8552;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,133:250:99:3312,0,3087
9	124855211	.	C	T	492.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.50;MQ0=0;QD=28.96;VQSLOD=7.5783;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:42.13:525,42,0
9	125133479	.	T	C	2525.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;QD=35.07;VQSLOD=10.0301;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2558,205,0
9	125315557	.	T	C	1299.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;DP=109;Dels=0.00;FS=1.582;HRun=0;HaplotypeScore=4.7157;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.775;VQSLOD=5.7096;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,50:109:99:1330,0,1593
9	125316179	.	T	G	2770.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=0.509;HRun=1;HaplotypeScore=5.3901;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.027;VQSLOD=5.1446;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,103:223:99:2800,0,3218
9	125316350	.	C	T	1076.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.611;DP=120;Dels=0.00;FS=0.702;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.506;VQSLOD=5.9288;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,44:120:99:1106,0,1967
9	125330125	.	C	G	674.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.312;VQSLOD=6.0705;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,25:54:99:705,0,767
9	125330678	.	T	G	1385.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.991;DP=95;Dels=0.00;FS=0.788;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.374;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.826;VQSLOD=5.0208;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,52:95:99:1416,0,1086
9	125377087	.	A	G	7063.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=9.1436;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,238:238:99:7062,584,0
9	125377505	.	A	G	6555.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.0464;MQ=59.27;MQ0=0;QD=34.68;VQSLOD=7.0919;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:6554,512,0
9	125390874	.	A	C	2765.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=9.4542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,84:85:99:2798,217,0
9	125391026	.	A	C	2936.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2924;MQ=59.73;MQ0=0;QD=34.54;VQSLOD=9.2568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2969,232,0
9	125391369	.	A	G	2565.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.83;VQSLOD=8.9045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2599,223,0
9	125391770	.	C	CA	4140.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=283.0730;MQ=60.22;MQ0=0;QD=32.35;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,119:127:99:4140,355,0
9	125486968	.	G	A	8536.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.95;MQ0=4;QD=35.28;VQSLOD=7.5692;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:242:99:8536,680,0
9	126125318	.	C	A	3054.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.84;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=8.9807;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3087,253,0
9	126128211	.	T	C	599.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.786;DP=64;Dels=0.00;FS=1.058;HRun=0;HaplotypeScore=1.8295;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.026;VQSLOD=5.7970;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,25:64:99:629,0,1077
9	126128253	.	G	C	545.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.689;VQSLOD=5.4396;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:575,0,722
9	126133547	.	T	C	7248.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8655;MQ=59.19;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=6.2221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,240:240:99:7247,623,0
9	127566378	.	A	G	856.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=71;Dels=0.00;FS=0.928;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.505;VQSLOD=6.8105;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,35:71:99:887,0,851
9	127616537	.	A	G	7579.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.918;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=4.999;HRun=1;HaplotypeScore=4.5458;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.934;VQSLOD=4.9000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,217:218:99:7542,562,0
9	127618776	.	A	G	1128.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94;VQSLOD=7.9987;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1162,99,0
9	127618839	.	C	G	1681.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=9.5645;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1715,132,0
9	127674200	.	A	C	5477.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7192;MQ=59.65;MQ0=0;QD=29.61;VQSLOD=8.5630;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:185:99:5476,448,0
9	127818276	.	C	T	808.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.96;VQSLOD=8.2383;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:66.20:842,66,0
9	130191186	.	C	T	707.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.22;VQSLOD=8.1203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:57.18:741,57,0
9	130197414	.	A	G	3552.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=9.6023;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3552,271,0
9	130242166	.	A	G	2044.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9532;MQ=59.68;MQ0=0;QD=28.80;VQSLOD=8.2687;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2078,174,0
9	130475442	.	A	C	518.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.675;DP=49;Dels=0.00;FS=4.233;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.288;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.844;VQSLOD=3.9107;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:49:99:549,0,697
9	130495633	.	C	G	735.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;DP=61;Dels=0.00;FS=1.085;HRun=0;HaplotypeScore=1.6640;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.443;VQSLOD=5.8306;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:766,0,971
9	130536717	.	G	A	1063.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.0520;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.070;VQSLOD=4.9019;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,39:76:99:1093,0,1036
9	130698029	.	G	C	2798.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=8.5134;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2832,214,0
9	131019738	.	T	C	875.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;DP=62;Dels=0.00;FS=1.358;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=5.0346;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,31:62:99:905,0,982
9	131085373	.	G	C	684.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.36;VQSLOD=6.7502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:60.15:718,60,0
9	131285955	.	A	G	2987.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7351;MQ=59.39;MQ0=0;QD=32.47;VQSLOD=9.0948;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3020,241,0
9	131565554	.	T	C	1206.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.815;DP=80;Dels=0.00;FS=0.878;HRun=0;HaplotypeScore=1.9148;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=5.9113;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,46:80:99:1236,0,867
9	131588888	.	G	C	1028.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;DP=85;Dels=0.00;FS=0.814;HRun=0;HaplotypeScore=2.9718;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.182;VQSLOD=5.6466;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,43:85:99:1058,0,1086
9	131696121	.	G	A	2239.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.252;DP=178;Dels=0.00;FS=1.181;HRun=0;HaplotypeScore=1.8893;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=12.58;ReadPosRankSum=3.165;VQSLOD=2.8443;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,89:178:99:2270,0,2210
9	131860901	.	G	T	5086.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6611;MQ=59.01;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=9.0769;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,151:151:99:5086,409,0
9	131909736	.	C	T	1342.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.520;DP=91;Dels=0.00;FS=0.923;HRun=1;HaplotypeScore=6.3572;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.011;VQSLOD=4.8263;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,58:91:99:1372,0,652
9	132377900	.	C	T	967.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;DP=99;Dels=0.00;FS=5.592;HRun=1;HaplotypeScore=2.7396;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.197;VQSLOD=4.2761;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,39:99:99:997,0,1698
9	133927878	.	A	G	1422.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.472;DP=138;Dels=0.00;FS=4.168;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.290;VQSLOD=6.3407;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,60:138:99:1453,0,2018
9	133936571	.	C	G	1614.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.30;VQSLOD=9.5430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1648,132,0
9	133948049	.	A	G	260.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.452;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.452;VQSLOD=6.5017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:290,0,119
9	133963008	.	G	A	1333.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.996;DP=82;Dels=0.00;FS=1.951;HRun=0;HaplotypeScore=1.7206;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=6.2700;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,43:82:99:1364,0,1101
9	134020092	.	C	T	2307.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3135;MQ=58.48;MQ0=0;QD=27.81;VQSLOD=7.5748;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:83:99:2341,187,0
9	134183379	.	C	T	1064.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.149;DP=66;Dels=0.00;FS=1.094;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.908;VQSLOD=3.5858;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,39:66:99:1094,0,634
9	134334588	.	A	G	2156.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.869;DP=158;Dels=0.00;FS=3.711;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.506;VQSLOD=6.0153;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,87:158:99:2186,0,1748
9	134350323	.	C	G	134.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.059;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.177;VQSLOD=11.0008;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:164,0,204
9	134350458	.	C	T	486.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.198;VQSLOD=12.2000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,19:37:99:517,0,419
9	134350647	.	T	C	931.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=13.8959;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:78.24:964,78,0
9	134351343	.	C	T	2676.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=8.9184;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:88:99:2710,226,0
9	134385435	.	C	T	1186.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.045;DP=85;Dels=0.00;FS=1.038;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.139;VQSLOD=4.2555;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1216,0,1007
9	134385436	.	A	G	2780.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.4538;MQ=58.31;MQ0=0;QD=33.50;VQSLOD=9.3407;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2813,223,0
9	134401335	.	C	T	4243.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3905;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.43;VQSLOD=7.6928;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4242,343,0
9	134406071	.	C	G	1698.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=119;Dels=0.00;FS=2.296;HRun=1;HaplotypeScore=5.5601;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.713;VQSLOD=4.4235;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,62:119:99:1729,0,1403
9	135105964	.	A	G	374.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.95;MQ0=0;QD=26.78;VQSLOD=7.8095;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:33.10:408,33,0
9	135202829	.	T	C	4849.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.92;MQ0=0;QD=28.86;VQSLOD=7.7989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:4848,391,0
9	135203231	.	C	T	4460.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.52;MQ0=0;QD=31.41;VQSLOD=8.9628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4460,340,0
9	135203409	.	A	C	2224.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8857;MQ=58.41;MQ0=0;QD=33.71;VQSLOD=8.6712;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2258,175,0
9	135470414	.	T	C	1937.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.755;DP=155;Dels=0.00;FS=0.620;HRun=0;HaplotypeScore=2.9196;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.920;VQSLOD=5.9967;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,76:155:99:1968,0,2101
9	136004699	.	G	A	226.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.053;VQSLOD=10.5965;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:256,0,234
9	136131289	.	C	T	808.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.914;DP=50;Dels=0.00;FS=8.478;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.262;VQSLOD=4.0490;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,30:50:99:839,0,575
9	136131347	.	G	A	152.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=16;Dels=0.00;FS=3.010;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.573;VQSLOD=4.6246;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:182,0,329
9	136131437	.	C	T	117.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.098;VQSLOD=10.8347;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:148,0,150
9	136131472	.	A	T	112.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.000;VQSLOD=10.4452;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:142,0,146
9	136132873	.	T	C	1278.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.166;DP=98;Dels=0.00;FS=3.216;HRun=0;HaplotypeScore=9.5980;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.651;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.070;VQSLOD=3.4731;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,53:98:99:1308,0,1165
9	136132908	.	T	TC	1049.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=69;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=279.9689;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.389;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,27:69:99:1088,0,1496
9	136133506	.	A	G	936.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.811;DP=90;Dels=0.00;FS=1.875;HRun=1;HaplotypeScore=5.5229;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.984;VQSLOD=4.6552;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,38:90:99:967,0,1397
9	136135237	.	A	G	1250.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;DP=128;Dels=0.00;FS=5.547;HRun=0;HaplotypeScore=2.4131;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.732;VQSLOD=3.9133;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,56:128:99:1281,0,1960
9	136135238	.	T	C	1286.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=128;Dels=0.00;FS=3.275;HRun=0;HaplotypeScore=2.4131;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.823;VQSLOD=4.7178;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,56:128:99:1317,0,1908
9	136136770	.	A	C	182.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.534;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.9985;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.295;VQSLOD=6.1317;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:212,0,178
9	136227260	.	A	G	1477.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=34.36;VQSLOD=9.9154;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1510,120,0
9	136270538	.	T	G	886.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.241;DP=61;Dels=0.00;FS=5.263;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.270;VQSLOD=5.7695;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,35:61:99:916,0,602
9	136277979	.	G	A	1823.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=117;Dels=0.00;FS=2.440;HRun=0;HaplotypeScore=5.3801;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.981;VQSLOD=3.2030;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,70:117:99:1854,0,1227
9	136555629	.	T	C	1294.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;DP=127;Dels=0.00;FS=9.574;HRun=0;HaplotypeScore=2.6547;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.280;VQSLOD=4.7252;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,55:127:99:1325,0,1908
9	136643994	.	T	C	1395.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;DP=104;Dels=0.00;FS=0.745;HRun=0;HaplotypeScore=5.6715;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.397;VQSLOD=4.9716;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,59:104:99:1425,0,1159
9	138377498	.	G	T	985.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=82;Dels=0.00;FS=0.900;HRun=0;HaplotypeScore=3.9226;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.903;VQSLOD=5.2716;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,39:82:99:1015,0,1104
9	138378856	.	A	G	7149.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3386;MQ=59.27;MQ0=0;QD=28.94;VQSLOD=6.8361;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:247:99:7148,584,0
9	138439806	.	C	T	832.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.879;DP=58;Dels=0.00;FS=3.832;HRun=0;HaplotypeScore=4.4358;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.117;VQSLOD=4.4685;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,30:58:99:862,0,682
9	138439809	.	T	C	844.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=57;Dels=0.00;FS=3.796;HRun=1;HaplotypeScore=3.5691;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.056;VQSLOD=5.2020;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,29:57:99:875,0,695
9	138440554	.	G	C	1172.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.893;DP=115;Dels=0.00;FS=5.080;HRun=0;HaplotypeScore=2.5769;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.476;VQSLOD=3.3883;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,46:115:99:1202,0,1919
9	138440562	.	C	T	1286.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;DP=123;Dels=0.00;FS=0.738;HRun=1;HaplotypeScore=5.3728;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.141;VQSLOD=4.2989;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,51:123:99:1317,0,1946
9	138440641	.	T	C	1451.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.872;DP=156;Dels=0.00;FS=10.622;HRun=0;HaplotypeScore=4.4055;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.251;VQSLOD=2.3593;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,68:156:99:1481,0,2399
9	138516119	.	G	A	1512.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=165;Dels=0.00;FS=1.255;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.647;VQSLOD=6.3830;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,64:165:99:1543,0,2873
9	138586966	.	G	A	270.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;QD=27.05;VQSLOD=6.6646;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:24.07:303,24,0
9	138590928	.	C	T	1178.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5212;MQ=58.59;MQ0=0;QD=35.70;VQSLOD=7.9739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1211,99,0
9	138710347	.	C	T	425.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.766;DP=31;Dels=0.00;FS=3.407;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.171;VQSLOD=4.6043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,17:31:99:455,0,368
9	139616742	.	A	G	1097.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26;VQSLOD=13.9680;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:90.28:1131,90,0
9	139701108	.	A	C	1948.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.61;MQ0=0;QD=33.03;VQSLOD=9.0428;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1982,156,0
9	139748483	.	G	A	2289.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;DP=223;Dels=0.00;FS=6.815;HRun=0;HaplotypeScore=5.2801;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.472;VQSLOD=4.3816;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,97:223:99:2319,0,3208
9	139752899	.	T	G	1240.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.36;MQ0=0;QD=31.00;VQSLOD=8.7444;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:40:99:1273,105,0
9	139840543	.	A	G	1210.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27;VQSLOD=13.0977;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:96.29:1244,96,0
9	139913239	.	T	G	3174.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6706;MQ=58.65;MQ0=0;QD=31.74;VQSLOD=7.6569;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3207,253,0
9	139973820	.	C	T	2951.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.593;DP=236;Dels=0.00;FS=1.634;HRun=0;HaplotypeScore=3.2851;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.864;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.833;VQSLOD=4.3727;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,123:236:99:2981,0,2928
9	140008750	.	G	C	297.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.465;VQSLOD=6.0118;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:327,0,141
9	140100317	.	C	G	569.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.542;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.589;VQSLOD=6.0474;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:600,0,323
9	140127051	.	G	A	1141.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.788;DP=88;Dels=0.00;FS=6.021;HRun=0;HaplotypeScore=1.8055;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.242;VQSLOD=4.8621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,46:88:99:1171,0,1048
9	140130606	.	A	T	316.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.116;DP=28;Dels=0.00;FS=9.467;HRun=0;HaplotypeScore=2.9320;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.116;VQSLOD=4.1250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:347,0,448
9	140243844	.	C	T	125.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=20;Dels=0.00;FS=1.862;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=3.2130;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:156,0,385
9	140243968	.	C	T	524.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.312;DP=23;Dels=0.00;FS=2.205;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=22.81;ReadPosRankSum=1.419;VQSLOD=3.2617;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,19:23:32.28:555,0,32
9	140250818	.	C	T	691.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.18;MQ0=0;QD=31.45;VQSLOD=8.7216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:57.18:725,57,0
9	140262426	.	C	T	658.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.725;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.395;VQSLOD=11.9843;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,27:48:99:688,0,530
9	140317999	.	C	G	317.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.42;VQSLOD=6.2221;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:27.08:350,27,0
9	140332478	.	A	G	2057.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.37;MQ0=0;QD=31.17;VQSLOD=9.7234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2090,166,0
9	140357972	.	A	G	436.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=13.9066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.12:469,36,0
9	140358581	.	C	T	520.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.356;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8255;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.222;VQSLOD=4.6328;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,22:37:99:551,0,328
9	140374861	.	A	G	2526.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.68;MQ0=0;QD=35.09;VQSLOD=9.5381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2559,202,0
9	141016262	.	T	G	2642.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.26;MQ0=0;QD=30.03;VQSLOD=8.6036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2675,229,0
10	1230968	.	C	T	584.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.539;DP=31;Dels=0.00;FS=1.937;HRun=0;HaplotypeScore=2.1992;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.765;VQSLOD=4.8411;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:615,0,203
10	1405261	.	G	A	473.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=24;Dels=0.00;FS=4.548;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.900;VQSLOD=2.5738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:503,0,173
10	3180227	.	T	C	494.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=29.08;VQSLOD=9.1333;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:42.12:527,42,0
10	3200292	.	G	A	2692.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5038;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.20;VQSLOD=6.8995;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:99:99:2726,214,0
10	3202065	.	T	C	538.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.66;VQSLOD=8.1837;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:42.13:572,42,0
10	5255025	.	A	G	2176.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8713;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.66;VQSLOD=8.3990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2210,192,0
10	5415954	.	A	G	158.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=8.79;ReadPosRankSum=2.208;VQSLOD=5.7963;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:188,0,278
10	5781628	.	T	G	2708.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24;VQSLOD=14.0973;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2741,208,0
10	5788608	.	G	C	4896.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=34.97;VQSLOD=10.2158;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4896,382,0
10	5790420	.	T	C	3294.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.37;VQSLOD=9.4930;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3294,268,0
10	5804531	.	G	A	870.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.146;VQSLOD=6.5504;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,35:72:99:901,0,1067
10	5920121	.	T	C	2292.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.380;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=1.094;HRun=3;HaplotypeScore=6.3571;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.569;VQSLOD=4.0777;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,94:242:99:2323,0,4449
10	6527143	.	G	A	2590.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=3.789;HRun=0;HaplotypeScore=4.6214;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.993;QD=11.31;ReadPosRankSum=-2.098;VQSLOD=4.1620;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,98:229:99:2620,0,3537
10	7605067	.	C	T	8434.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6332;MQ=59.23;MQ0=0;QD=34.15;VQSLOD=9.2072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:247:99:8434,662,0
10	7605101	.	A	G	8429.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7799;MQ=59.02;MQ0=0;QD=33.72;VQSLOD=9.1709;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8397,671,0
10	7618686	.	T	G	1004.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.389;DP=84;Dels=0.00;FS=18.681;HRun=2;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.272;VQSLOD=3.1471;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,35:84:99:1035,0,1273
10	7622009	.	G	A	225.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;DP=27;Dels=0.00;FS=2.944;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.962;VQSLOD=4.5688;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:255,0,461
10	7763661	.	A	G	8134.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3242;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.80;VQSLOD=7.0898;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8133,632,0
10	7780646	.	C	G	1850.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.028;DP=154;Dels=0.00;FS=1.304;HRun=0;HaplotypeScore=3.6781;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.919;VQSLOD=5.5756;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,67:154:99:1880,0,2544
10	8006798	.	A	G	2202.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.419;DP=138;Dels=0.00;FS=0.705;HRun=0;HaplotypeScore=2.4434;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.392;VQSLOD=6.3426;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,77:138:99:2232,0,1643
10	11789382	.	G	A	5205.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4942;MQ=59.20;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=9.6899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5204,415,0
10	11797467	.	G	A	3099.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7569;MQ=58.63;MQ0=0;QD=30.39;VQSLOD=8.4829;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:102:99:3133,259,0
10	12046546	.	T	C	359.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.918;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.600;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.131;VQSLOD=5.1876;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:390,0,432
10	12111090	.	T	C	845.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=13.5597;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:69.21:878,69,0
10	12131081	.	T	G	6764.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5572;MQ=59.60;MQ0=0;QD=32.68;VQSLOD=9.8939;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6764,536,0
10	12143105	.	C	G	6201.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5741;MQ=58.96;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=8.1395;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:193:99:6201,475,0
10	12595329	.	A	G	1806.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.059;DP=129;Dels=0.00;FS=0.802;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.643;VQSLOD=6.3109;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,64:129:99:1836,0,1847
10	13166076	.	A	G	1806.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62;VQSLOD=13.5009;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1840,144,0
10	13239651	.	A	G	545.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.658;DP=45;Dels=0.00;FS=1.184;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.587;VQSLOD=5.2934;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,21:45:99:575,0,688
10	15008493	.	A	C	1899.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=9.5461;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:62:99:1932,147,0
10	15573050	.	A	G	4310.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.72;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=9.5724;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4311,319,0
10	16943371	.	G	C	5372.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4672;MQ=59.45;MQ0=0;QD=32.17;VQSLOD=9.1456;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5372,412,0
10	16948390	.	G	C	1001.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.489;DP=70;Dels=0.00;FS=2.147;HRun=0;HaplotypeScore=4.0741;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=2.534;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.303;VQSLOD=3.7433;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,40:70:99:1032,0,841
10	16967401	.	C	T	1852.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=56.65;MQ0=0;QD=29.41;VQSLOD=6.3783;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1886,153,0
10	17024503	.	G	A	2524.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.45;MQ0=0;QD=30.05;VQSLOD=8.6792;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2557,205,0
10	17147521	.	G	T	2935.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58;VQSLOD=13.7276;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2969,244,0
10	17156151	.	A	G	1348.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31;VQSLOD=8.1571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:46:99:1381,108,0
10	17636309	.	G	A	808.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.715;DP=93;Dels=0.00;FS=0.877;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.608;VQSLOD=5.7136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,37:93:99:838,0,1602
10	18266989	.	G	A	872.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;DP=75;Dels=0.00;FS=0.903;HRun=1;HaplotypeScore=1.8914;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.079;VQSLOD=5.6476;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,37:75:99:903,0,960
10	18828486	.	C	G	1648.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=121;Dels=0.00;FS=0.705;HRun=2;HaplotypeScore=2.7554;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.412;VQSLOD=5.4675;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,66:121:99:1678,0,1390
10	20506418	.	G	A	1543.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=125;Dels=0.00;FS=2.345;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.05;MQ0=1;MQRankSum=-0.357;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.087;VQSLOD=5.1743;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,62:125:99:1574,0,1439
10	20534333	.	A	G	5831.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.5285;MQ=59.68;MQ0=0;QD=30.85;VQSLOD=5.6682;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:5830,511,0
10	21414892	.	C	G	1637.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.480;DP=107;Dels=0.00;FS=4.804;HRun=0;HaplotypeScore=1.8930;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.514;VQSLOD=6.0043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,55:107:99:1667,0,1389
10	21415006	.	T	C	2070.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.779;DP=185;Dels=0.00;FS=0.546;HRun=2;HaplotypeScore=1.8910;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.944;VQSLOD=6.3347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,86:185:99:2101,0,2548
10	21435340	.	ACACT	A	3533.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.753;DP=152;FS=4.886;HRun=0;HaplotypeScore=711.1509;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.269;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.507;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,72:152:99:3533,0,5448
10	22019855	.	G	A	1901.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=143;Dels=0.00;FS=3.407;HRun=0;HaplotypeScore=1.9623;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=4.7451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,74:143:99:1931,0,1763
10	23482635	.	T	C	4062.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.644;HRun=5;HaplotypeScore=2.5562;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.284;VQSLOD=6.1316;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,128:250:99:3420,0,3042
10	24908686	.	T	C	1302.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.741;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.337;VQSLOD=3.0144;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,54:105:99:1333,0,1330
10	25273744	.	T	C	1203.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.800;DP=99;Dels=0.00;FS=5.079;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=4.7064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,46:99:99:1233,0,1395
10	25701341	.	C	G	4036.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=1.060;HRun=1;HaplotypeScore=3.2071;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.337;VQSLOD=5.3758;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,116:243:99:3403,0,3405
10	25888180	.	A	G	588.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.164;DP=69;Dels=0.00;FS=3.605;HRun=1;HaplotypeScore=1.8808;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.935;VQSLOD=4.9307;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,26:69:99:619,0,1105
10	26355906	.	G	A	721.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.194;DP=77;Dels=0.00;FS=0.912;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.743;VQSLOD=3.6743;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,31:77:99:751,0,1129
10	26355992	.	A	G	2460.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.94;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=8.6998;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2494,193,0
10	26357748	.	G	A	2383.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.72;VQSLOD=7.8997;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2417,184,0
10	26434455	.	G	T	637	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.403;VQSLOD=5.7801;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,25:48:99:667,0,550
10	26446312	.	G	A	2106.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.109;DP=134;Dels=0.00;FS=3.179;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.828;VQSLOD=6.1693;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,80:134:99:2136,0,1457
10	26463043	.	A	T	862.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=75;Dels=0.00;FS=3.132;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.516;VQSLOD=4.9483;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,34:75:99:892,0,1070
10	26463130	.	C	A	5832.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.089;DP=196;Dels=0.00;FS=2.617;HRun=0;HaplotypeScore=6.9178;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.661;VQSLOD=3.4610;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,194:196:99:5787,416,0
10	27389197	.	T	C	719.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.762;DP=91;Dels=0.00;FS=5.574;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.823;VQSLOD=4.3902;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,36:91:99:749,0,1595
10	27687225	.	A	G	269.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.453;VQSLOD=5.3477;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:300,0,402
10	27687775	.	T	C	945.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7005;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=16.02;ReadPosRankSum=-1.137;VQSLOD=5.9915;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,33:59:99:975,0,694
10	27687965	.	A	G	899.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;DP=95;Dels=0.00;FS=4.096;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.300;VQSLOD=6.0453;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,38:95:99:930,0,1532
10	27688109	.	T	C	1102.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.792;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8309;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.961;VQSLOD=5.6222;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,44:100:99:1132,0,1435
10	27692279	.	A	C	920.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=95;Dels=0.00;FS=0.805;HRun=1;HaplotypeScore=8.7752;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.067;VQSLOD=3.9692;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,42:95:99:950,0,1422
10	27702256	.	G	GC	1889.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.582;DP=141;DS;FS=2.524;HRun=6;HaplotypeScore=350.0383;MQ=60.30;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.271;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,61:141:99:1929,0,1487
10	28378758	.	T	C	2306.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7876;MQ=59.66;MQ0=0;QD=34.42;VQSLOD=9.7326;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2339,193,0
10	29839787	.	A	G	5405.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3933;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=30.03;ReadPosRankSum=0.885;VQSLOD=6.9845;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,179:180:99:5369,407,0
10	30316072	.	C	G	2199.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.910;DP=211;Dels=0.00;FS=4.871;HRun=0;HaplotypeScore=3.9821;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.426;VQSLOD=4.5014;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,89:211:99:2229,0,3242
10	30316208	.	T	C	3050.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.149;DP=194;Dels=0.00;FS=3.282;HRun=1;HaplotypeScore=3.1976;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.810;VQSLOD=6.0099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,106:194:99:3080,0,2346
10	30629226	.	G	A	1143.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.854;DP=106;Dels=0.00;FS=1.635;HRun=0;HaplotypeScore=2.8311;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.171;VQSLOD=6.2175;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,43:106:99:1174,0,1571
10	31138817	.	G	A	6414.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.43;MQ0=0;QD=30.84;VQSLOD=8.9841;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:208:99:6414,521,0
10	31810679	.	A	G	1072.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=87;Dels=0.00;FS=7.124;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.425;VQSLOD=3.4421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:1102,0,1407
10	32128611	.	A	G	476.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.811;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.372;VQSLOD=5.7694;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,21:56:99:506,0,865
10	32745248	.	A	C	2052.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.041;DP=152;Dels=0.00;FS=4.938;HRun=0;HaplotypeScore=4.6294;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.594;VQSLOD=4.8889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,85:152:99:2082,0,1725
10	32856746	.	A	C	1053.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.489;DP=89;Dels=0.00;FS=3.993;HRun=0;HaplotypeScore=1.8401;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.731;VQSLOD=5.8264;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,42:89:99:1083,0,1185
10	32974969	.	A	G	1834.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97;VQSLOD=13.9507;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:1867,135,0
10	33123824	.	G	C	863.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.29;MQ0=0;QD=33.19;VQSLOD=8.5369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:69.22:896,69,0
10	33137551	.	T	C	1740.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.348;DP=145;Dels=0.00;FS=3.963;HRun=0;HaplotypeScore=3.3954;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.655;VQSLOD=5.8987;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,70:145:99:1771,0,1868
10	33143396	.	G	A	1802.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.28;MQ0=0;QD=28.17;VQSLOD=8.3175;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1836,141,0
10	33552696	.	A	G	3831.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.276;VQSLOD=8.2294;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,129:130:99:3792,271,0
10	37488689	.	G	C	1103.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.67;VQSLOD=7.4844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:84.27:1137,84,0
10	37505141	.	G	A	184.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.079;VQSLOD=5.3005;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:214,0,444
10	37505159	.	G	A	472.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;DP=30;Dels=0.00;FS=6.301;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.301;VQSLOD=2.9605;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,19:30:99:502,0,259
10	37505192	.	C	T	274	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.395;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.230;VQSLOD=5.9381;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:304,0,396
10	38344700	.	C	G	2174	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;DP=127;Dels=0.00;FS=0.671;HRun=3;HaplotypeScore=2.5612;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.204;VQSLOD=5.2534;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,76:127:99:2204,0,1439
10	43089965	.	G	A	1098.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.097;DP=69;Dels=0.00;FS=2.033;HRun=0;HaplotypeScore=1.9858;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.192;VQSLOD=5.3487;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,39:69:99:1128,0,729
10	43678796	.	C	T	2500.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.635;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=5.810;HRun=2;HaplotypeScore=4.2898;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.175;VQSLOD=5.0388;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,95:216:99:2531,0,3373
10	44052903	.	A	C	4682.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7052;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=34.18;ReadPosRankSum=1.707;VQSLOD=8.2531;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,136:137:99:4660,342,0
10	44053013	.	G	C	7875.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2366;MQ=58.73;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=7.9468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7875,602,0
10	45496120	.	A	T	640.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=6.5274;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,27:56:99:670,0,688
10	45953767	.	A	G	879.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.493;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9155;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.557;VQSLOD=6.2153;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,33:80:99:909,0,1296
10	46143958	.	T	G	1444.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.056;DP=135;Dels=0.00;FS=3.207;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.371;VQSLOD=6.6726;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,58:135:99:1474,0,2069
10	46965018	.	C	G	264.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=51;Dels=0.00;FS=1.191;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.707;VQSLOD=3.7516;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,14:51:99:295,0,1037
10	46998894	.	G	A	605.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=97;Dels=0.00;FS=3.068;HRun=0;HaplotypeScore=2.5105;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.532;VQSLOD=4.3524;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,32:97:99:635,0,1655
10	46999019	.	G	A	354.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=61;Dels=0.00;FS=1.118;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.32;MQ0=1;MQRankSum=0.115;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.083;VQSLOD=3.2482;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,17:61:99:384,0,1121
10	46999178	.	A	C	530.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.447;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9958;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.343;VQSLOD=5.1810;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:561,0,543
10	46999190	.	A	G	620.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.814;DP=40;Dels=0.00;FS=1.378;HRun=1;HaplotypeScore=8.2643;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.956;VQSLOD=2.2620;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,24:40:99:651,0,380
10	46999484	.	G	T	444.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=50;Dels=0.00;FS=3.956;HRun=0;HaplotypeScore=1.5661;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.280;VQSLOD=4.5564;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,19:50:99:475,0,914
10	46999863	.	C	G	937.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.123;DP=105;Dels=0.00;FS=0.775;HRun=0;HaplotypeScore=3.6141;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.735;VQSLOD=4.8188;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,38:105:99:967,0,1721
10	47000004	.	T	C	2884.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.37;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=7.8177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2917,238,0
10	47000217	.	G	A	47.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=12;Dels=0.00;FS=2.730;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=2.9995;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:12:77.38:77,0,215
10	47087078	.	G	T	2075.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.739;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=6.124;HRun=0;HaplotypeScore=7.9719;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.853;VQSLOD=2.5262;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,82:250:99:2106,0,4567
10	47087501	.	C	T	1340.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.672;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=1.980;HRun=0;HaplotypeScore=5.2610;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.078;VQSLOD=2.7495;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,56:212:99:1370,0,3985
10	48370747	.	C	T	423.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.256;DP=40;Dels=0.00;FS=7.521;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.256;VQSLOD=4.4022;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,16:40:99:454,0,655
10	48371277	.	C	T	1382.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.274;DP=103;Dels=0.00;FS=3.964;HRun=0;HaplotypeScore=3.6787;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.685;VQSLOD=4.6181;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,57:103:99:1412,0,1269
10	49447720	.	G	A	675.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.271;DP=80;Dels=0.00;FS=0.893;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.317;VQSLOD=5.4926;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,30:80:99:706,0,1212
10	50122109	.	C	T	1313.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=109;Dels=0.00;FS=1.559;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.585;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.302;VQSLOD=5.6206;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,51:109:99:1343,0,1551
10	50315893	.	A	G	1066.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.328;DP=94;Dels=0.00;FS=0.794;HRun=1;HaplotypeScore=2.4691;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.251;VQSLOD=6.7934;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:94:99:1097,0,1411
10	50532683	.	T	C	2680.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.56;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=9.2083;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2713,208,0
10	50724016	.	C	T	6073.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.2337;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6072,466,0
10	50820345	.	C	A	6750.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7163;MQ=59.51;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=8.9840;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:217:99:6749,542,0
10	50824117	.	G	A	4049.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.622;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=5.356;HRun=1;HaplotypeScore=3.5043;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.33;ReadPosRankSum=-1.076;VQSLOD=4.7689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,130:248:99:3438,0,3186
10	50824619	.	G	A	600.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=52;Dels=0.00;FS=4.176;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.784;VQSLOD=4.8729;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:631,0,736
10	50856652	.	G	A	964.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14;VQSLOD=14.1442;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:81.24:998,81,0
10	50901917	.	C	A	1481.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;DP=148;Dels=0.00;FS=7.708;HRun=2;HaplotypeScore=2.7258;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.956;VQSLOD=2.6905;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,58:148:99:1512,0,2447
10	50916484	.	A	G	6147.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.8267;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.23;VQSLOD=6.1759;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:185:99:6118,475,0
10	50916542	.	C	T	2751.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.061;DP=241;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6433;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.484;VQSLOD=6.5232;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,105:241:99:2782,0,3573
10	50950976	.	G	A	1042.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.071;DP=100;Dels=0.00;FS=3.649;HRun=0;HaplotypeScore=1.9463;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.197;VQSLOD=5.5019;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,46:100:99:1072,0,1402
10	51827934	.	G	A	281.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=48.91;MQ0=1;MQRankSum=0.791;QD=23.46;ReadPosRankSum=-0.158;VQSLOD=3.8580;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:0.34:310,0,0
10	53458646	.	A	C	437.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.102;DP=30;Dels=0.00;FS=6.429;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.725;VQSLOD=3.4017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:468,0,416
10	54531242	.	G	A	2058.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.752;DP=169;Dels=0.00;FS=8.043;HRun=0;HaplotypeScore=3.7592;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.616;VQSLOD=4.2164;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,81:169:99:2088,0,2097
10	55568972	.	T	G	1118.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.034;DP=66;Dels=0.00;FS=1.017;HRun=0;HaplotypeScore=4.4816;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.809;VQSLOD=4.4485;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,41:66:99:1149,0,597
10	55755491	.	C	T	1446.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.800;DP=102;Dels=0.00;FS=0.738;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.844;VQSLOD=5.1844;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,53:102:99:1477,0,1249
10	58118630	.	T	C	5863.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.7083;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.619;VQSLOD=7.4654;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,197:198:99:5862,478,0
10	60588553	.	T	C	2240.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7989;MQ=59.47;MQ0=0;QD=32.01;VQSLOD=9.1046;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2273,178,0
10	61005244	.	G	C	2702.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;QD=32.56;VQSLOD=8.2748;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2736,217,0
10	61414011	.	G	T	4000.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.376;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=3.689;HRun=1;HaplotypeScore=5.2385;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.232;VQSLOD=4.9297;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,122:249:99:3355,0,3620
10	61552692	.	G	T	2273.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.267;DP=192;DS;Dels=0.00;FS=1.250;HRun=0;HaplotypeScore=1.8455;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.929;VQSLOD=6.4345;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,92:192:99:2304,0,2754
10	61831271	.	T	C	2633.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.645;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.579;HRun=1;HaplotypeScore=3.5468;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.892;VQSLOD=5.0300;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,104:249:99:2663,0,4051
10	63958112	.	T	C	3917.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7653;MQ=58.73;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=8.8216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:3916,334,0
10	64159333	.	G	T	7098.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=59.00;MQ0=0;QD=29.45;VQSLOD=8.7177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,239:241:99:7097,572,0
10	64415184	.	A	G	876.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;DP=99;Dels=0.00;FS=5.506;HRun=0;HaplotypeScore=2.6163;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.763;VQSLOD=4.7156;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,38:99:99:906,0,1604
10	64927823	.	C	G	1084.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.882;DP=123;Dels=0.00;FS=0.690;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.070;VQSLOD=5.0800;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,51:123:99:1114,0,1853
10	64974537	.	A	T	5594.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.9143;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,187:187:99:5594,448,0
10	68040325	.	C	T	1145.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.520;DP=84;Dels=0.00;FS=0.861;HRun=4;HaplotypeScore=2.7855;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.488;VQSLOD=4.4224;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,42:84:99:1175,0,1145
10	69926334	.	C	G	1856.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.405;DP=128;Dels=0.00;FS=1.430;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.467;VQSLOD=4.7528;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,70:128:99:1886,0,1564
10	69933921	.	G	A	2792.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.178;DP=212;Dels=0.00;FS=3.154;HRun=1;HaplotypeScore=9.4392;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.423;VQSLOD=4.0121;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,114:212:99:2823,0,2594
10	69933969	.	G	A	2309.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.493;DP=204;Dels=0.00;FS=0.517;HRun=1;HaplotypeScore=3.7102;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.490;VQSLOD=6.3186;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,92:204:99:2340,0,3114
10	69934258	.	C	G	1074.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.443;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4404;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.273;VQSLOD=6.0023;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,44:93:99:1105,0,1321
10	69959242	.	C	A	1045.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.396;DP=128;Dels=0.00;FS=2.347;HRun=0;HaplotypeScore=4.7338;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.067;VQSLOD=3.4237;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,46:128:99:1076,0,2313
10	70405855	.	A	G	1411.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.11;MQ0=0;QD=33.61;VQSLOD=9.9625;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1445,108,0
10	70641860	.	T	C	1289.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.483;DP=110;Dels=0.00;FS=1.733;HRun=0;HaplotypeScore=1.8519;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.151;VQSLOD=6.4573;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,51:110:99:1320,0,1520
10	70645376	.	A	C	2068.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=191;Dels=0.00;FS=1.800;HRun=0;HaplotypeScore=5.6471;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.550;VQSLOD=4.4876;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,84:191:99:2098,0,2883
10	70748784	.	G	A	590.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4688;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.763;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.052;VQSLOD=3.3228;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,23:76:99:620,0,1458
10	70856852	.	G	A	1722.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=9.4303;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1756,135,0
10	70892791	.	C	T	739.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.414;DP=71;Dels=0.00;FS=0.948;HRun=0;HaplotypeScore=4.7504;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.191;VQSLOD=5.2223;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,31:71:99:770,0,979
10	70992664	.	C	T	2695.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.060;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=2.941;HRun=0;HaplotypeScore=8.2612;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.111;VQSLOD=4.5652;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,108:238:99:2725,0,3521
10	71018660	.	T	C	2203.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5810;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.877;VQSLOD=8.0873;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,76:77:99:2236,184,0
10	71168685	.	A	T	479.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27;VQSLOD=13.6803;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.13:513,39,0
10	71176012	.	A	G	1529.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=125;Dels=0.00;FS=8.330;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.433;VQSLOD=4.7104;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,54:125:99:1560,0,1915
10	72195439	.	T	C	1081.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.273;DP=82;Dels=0.00;FS=0.931;HRun=0;HaplotypeScore=3.7306;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.517;VQSLOD=5.9451;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,40:82:99:1112,0,1150
10	72289778	.	C	T	1389.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;DP=108;Dels=0.00;FS=2.506;HRun=1;HaplotypeScore=4.7861;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.601;VQSLOD=5.5778;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,55:108:99:1420,0,1321
10	72500763	.	T	C	2967.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.28;VQSLOD=9.3759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:3001,235,0
10	72535007	.	C	T	2975.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.00;MQ0=0;QD=30.68;VQSLOD=8.5673;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3009,229,0
10	73082563	.	A	G	2754.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.0335;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.761;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.037;VQSLOD=5.4253;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,104:221:99:2785,0,3257
10	73115942	.	G	A	1928.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=12.69;ReadPosRankSum=2.825;VQSLOD=5.5258;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,76:152:99:1959,0,2127
10	73121913	.	A	G	7671.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.6291;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.690;VQSLOD=3.3206;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:7632,630,0
10	73501556	.	G	A	726.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06;VQSLOD=7.8779;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:66.17:760,66,0
10	73520632	.	A	C	4111.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2311;MQ=58.96;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=7.4817;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4111,313,0
10	73533177	.	A	G	57.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=3.6551;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.065;VQSLOD=3.3628;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:87.21:87,0,275
10	73537614	.	G	A	1618.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.391;DP=115;Dels=0.00;FS=3.399;HRun=0;HaplotypeScore=1.8660;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.782;VQSLOD=6.4468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,61:115:99:1649,0,1417
10	73550117	.	C	G	1687.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=58.77;MQ0=0;QD=31.83;VQSLOD=8.9889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:53:99:1720,132,0
10	76854564	.	C	T	1722.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.65;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=8.8652;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1756,147,0
10	76867899	.	T	C	990.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.681;DP=65;Dels=0.00;FS=1.026;HRun=3;HaplotypeScore=1.9657;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.465;VQSLOD=6.6185;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,40:65:99:1020,0,688
10	79616564	.	G	A	613.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3210;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.722;VQSLOD=2.5413;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,28:59:99:644,0,765
10	79616605	.	T	C	1186.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.26;VQSLOD=7.9703;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1220,105,0
10	81701722	.	T	C	1742.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;DP=158;Dels=0.00;FS=2.880;HRun=0;HaplotypeScore=4.6133;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.816;VQSLOD=5.1443;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,72:158:99:1772,0,2430
10	81706324	.	A	G	990.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.948;VQSLOD=6.3864;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,38:75:99:1021,0,953
10	81841692	.	G	T	4614.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7323;MQ=59.69;MQ0=0;QD=34.44;VQSLOD=9.0959;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4614,367,0
10	81926702	.	G	A	440.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.442;DP=29;Dels=0.00;FS=1.527;HRun=1;HaplotypeScore=1.9623;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.153;VQSLOD=3.1239;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:470,0,262
10	85981801	.	T	G	1632.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.615;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.5452;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.748;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.839;VQSLOD=3.6268;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,60:136:99:1663,0,2139
10	85981842	.	A	G	887.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.237;DP=78;Dels=0.00;FS=0.907;HRun=2;HaplotypeScore=2.8323;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.127;VQSLOD=5.9350;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,32:78:99:917,0,1174
10	85984323	.	G	A	1319.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;DP=117;Dels=0.00;FS=1.727;HRun=1;HaplotypeScore=3.3864;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.172;VQSLOD=6.0790;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,44:117:99:1350,0,2070
10	88277457	.	C	T	1342.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.544;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8930;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=6.4830;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,53:112:99:1372,0,1522
10	88422116	.	C	T	115.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;DP=15;Dels=0.00;FS=2.027;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.752;VQSLOD=5.0872;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:145,0,226
10	88702350	.	G	C	1791.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99;VQSLOD=9.1164;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1824,141,0
10	88719789	.	C	G	304.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;DP=30;Dels=0.00;FS=3.544;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.058;VQSLOD=4.9922;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:335,0,438
10	88722398	.	A	T	289.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.581;VQSLOD=4.9981;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,13:39:99:319,0,731
10	88768253	.	A	G	2684.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.717;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.960;HRun=0;HaplotypeScore=4.5297;MQ=57.25;MQ0=1;MQRankSum=0.442;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.874;VQSLOD=3.6292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:2714,0,3911
10	88930249	.	A	T	3425.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;QD=29.79;VQSLOD=7.9825;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3425,259,0
10	90342837	.	C	G	1309.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.082;DP=131;Dels=0.00;FS=0.655;HRun=0;HaplotypeScore=4.2863;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.202;VQSLOD=5.3620;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,58:131:99:1340,0,1998
10	90356598	.	A	G	1718.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.54;MQ0=0;QD=28.64;VQSLOD=8.2541;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1751,138,0
10	90429652	.	A	G	2770.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5478;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.010;VQSLOD=5.1748;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,102:248:99:2801,0,3918
10	90512306	.	G	C	236.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.200;DP=16;Dels=0.00;FS=2.307;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.573;VQSLOD=5.5862;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:267,0,165
10	91007360	.	T	G	3118.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.4105;MQ=59.58;MQ0=0;QD=28.35;VQSLOD=8.1846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3152,235,0
10	91066769	.	C	A	1110.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.659;DP=100;Dels=0.00;FS=1.636;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.868;VQSLOD=6.7581;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,46:100:99:1140,0,1398
10	91405044	.	C	T	547.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6655;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.190;VQSLOD=5.2295;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,24:67:99:578,0,1095
10	91468925	.	C	G	814.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=98;Dels=0.00;FS=9.696;HRun=2;HaplotypeScore=3.9535;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.578;VQSLOD=3.7964;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,34:98:99:844,0,1549
10	91487649	.	A	T	673.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.563;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.846;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.003;VQSLOD=4.2304;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,30:69:99:703,0,899
10	91488979	.	A	T	1310.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.428;DP=102;Dels=0.00;FS=3.817;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.131;VQSLOD=5.1571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,51:102:99:1340,0,1155
10	91498127	.	T	C	1405.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=29.89;VQSLOD=8.6360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1438,120,0
10	94594565	.	G	A	2750.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.00;MQ0=0;QD=28.35;VQSLOD=7.9320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:2783,217,0
10	94695617	.	C	T	1530.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6809;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35;VQSLOD=7.3732;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:54:99:1564,120,0
10	95262981	.	A	G	3644.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6642;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=30.63;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=8.8331;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,118:119:99:3608,259,0
10	95279506	.	A	T	2800.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=14.4210;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2833,217,0
10	95441272	.	G	A	554.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;DP=47;Dels=0.00;FS=1.139;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.968;VQSLOD=6.2594;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,23:47:99:584,0,608
10	95454681	.	G	C	1492.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=122;DS;Dels=0.00;FS=4.725;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.439;VQSLOD=5.8007;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,56:122:99:1523,0,1818
10	95459817	.	C	T	2428.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=28.24;VQSLOD=8.1488;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2461,199,0
10	96493058	.	C	T	1972.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.459;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.421;VQSLOD=7.0609;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,75:150:99:2003,0,1920
10	96602623	.	G	A	2771.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.625;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.388;HRun=0;HaplotypeScore=12.4330;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.099;VQSLOD=2.6398;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,107:250:99:2802,0,3936
10	96741053	.	A	C	4325.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.104;DP=233;Dels=0.00;FS=3.685;HRun=1;HaplotypeScore=9.9064;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.584;VQSLOD=3.2369;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,127:233:99:3717,0,2767
10	97023630	.	T	C	774.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5080;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.419;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.088;VQSLOD=4.1604;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,31:86:99:804,0,1348
10	97192324	.	A	G	3211.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=32.12;VQSLOD=9.4380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3245,253,0
10	97916272	.	C	T	341.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.402;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.083;VQSLOD=4.1804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,15:43:99:371,0,818
10	97917556	.	G	C	1371.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.842;DP=118;Dels=0.00;FS=3.404;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.019;VQSLOD=5.8699;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,54:118:99:1401,0,1777
10	97920099	.	T	TC	3139.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=157.7742;MQ=58.86;MQ0=0;QD=43.61;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,70:72:99:3182,214,0
10	98078239	.	A	G	7433.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.06;MQ0=0;QD=33.48;VQSLOD=10.0421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:7432,578,0
10	98469693	.	C	T	1378.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.875;DP=115;Dels=0.00;FS=3.441;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.569;VQSLOD=6.4049;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,54:115:99:1409,0,1625
10	99240758	.	G	C	176.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.299;VQSLOD=6.0397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:207,0,172
10	99439541	.	G	C	352.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.123;DP=40;Dels=0.00;FS=5.711;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.659;VQSLOD=4.5145;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:383,0,631
10	99439556	.	A	C	446.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.495;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9465;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.334;VQSLOD=5.4611;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:477,0,230
10	99504630	.	G	T	613.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.183;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9937;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=6.3860;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,21:39:99:643,0,494
10	99968670	.	A	G	1789.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HRun=0;HaplotypeScore=3.5350;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.269;VQSLOD=5.6537;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,63:125:99:1820,0,1553
10	99969568	.	A	G	5001.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9465;MQ=58.94;MQ0=0;QD=29.95;VQSLOD=9.2109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5001,400,0
10	99991408	.	A	G	3207.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=58.36;MQ0=0;QD=28.38;VQSLOD=8.0454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:113:99:3240,253,0
10	100017453	.	T	G	7471.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7700;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.618;VQSLOD=8.5175;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,230:231:99:7471,575,0
10	100144782	.	C	T	729.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.901;DP=56;Dels=0.00;FS=5.141;HRun=0;HaplotypeScore=2.6198;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.053;VQSLOD=5.8206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,34:56:99:759,0,315
10	100148176	.	A	G	691.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.236;DP=51;Dels=0.00;FS=2.732;HRun=0;HaplotypeScore=3.7109;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.010;VQSLOD=5.8864;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,27:51:99:722,0,623
10	100189568	.	C	A	3012.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.518;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.488;HRun=1;HaplotypeScore=8.0944;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.677;VQSLOD=4.6924;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,112:228:99:3042,0,2951
10	101544447	.	A	T	5241.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9907;MQ=59.86;MQ0=0;QD=32.16;VQSLOD=9.0749;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5241,427,0
10	101639877	.	A	C	3198.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.397;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.832;HRun=1;HaplotypeScore=7.3389;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.477;VQSLOD=4.5925;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,113:249:99:3229,0,3651
10	101667814	.	A	G	1098.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.280;VQSLOD=6.4921;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,50:118:99:1128,0,1627
10	102116311	.	A	C	933.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.687;VQSLOD=5.5416;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,34:67:99:963,0,873
10	102222957	.	G	C	1088.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=112;Dels=0.00;FS=7.811;HRun=0;HaplotypeScore=2.8799;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.068;VQSLOD=3.7711;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,45:112:99:1118,0,1736
10	102247408	.	C	A	612.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.864;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.476;VQSLOD=6.1638;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,27:68:99:643,0,1121
10	102265183	.	G	A	1541.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.837;DP=157;Dels=0.00;FS=4.212;HRun=0;HaplotypeScore=7.7483;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.946;VQSLOD=4.3734;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,63:157:99:1571,0,2524
10	102269085	.	C	A	2624.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.921;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8874;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=11.51;ReadPosRankSum=2.591;VQSLOD=5.5331;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,98:228:99:2655,0,3832
10	102269206	.	A	G	951.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.626;DP=68;Dels=0.00;FS=1.341;HRun=0;HaplotypeScore=6.6855;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.049;VQSLOD=4.7450;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,33:68:99:982,0,913
10	102295836	.	C	G	225.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;DP=21;Dels=0.00;FS=2.098;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.684;VQSLOD=5.7948;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:21:99:255,0,328
10	102684380	.	C	A	1295.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.254;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1326;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=6.0031;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,52:116:99:1325,0,1711
10	103298099	.	G	T	1806.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.746;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.1699;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.627;VQSLOD=4.1418;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,75:172:99:1836,0,2512
10	103900729	.	G	A	1933.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.084;DP=170;Dels=0.00;FS=5.644;HRun=0;HaplotypeScore=8.2052;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.221;VQSLOD=4.1719;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,78:170:99:1963,0,2488
10	103920475	.	T	C	1768.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.404;DP=110;Dels=0.00;FS=1.656;HRun=1;HaplotypeScore=2.8586;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.568;VQSLOD=6.0616;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,58:110:99:1799,0,1423
10	104934709	.	T	C	2119.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.552;DP=168;DS;Dels=0.00;FS=0.632;HRun=0;HaplotypeScore=6.5987;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.826;VQSLOD=5.0247;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,79:168:99:2150,0,2109
10	105194086	.	C	T	2190.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;DP=181;Dels=0.00;FS=11.283;HRun=1;HaplotypeScore=1.8640;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.991;VQSLOD=4.0064;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,81:181:99:2220,0,2742
10	105205302	.	A	C	1121.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.907;DP=63;Dels=0.00;FS=1.179;HRun=1;HaplotypeScore=3.7387;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.175;VQSLOD=5.7430;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,37:63:99:1151,0,645
10	105218252	.	A	G	621.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;DP=49;Dels=0.00;FS=2.687;HRun=1;HaplotypeScore=1.5572;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.493;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.376;VQSLOD=3.9657;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,26:49:99:651,0,568
10	105657316	.	G	C	2866.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.25;MQ0=0;QD=30.82;VQSLOD=8.4688;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,92:93:99:2899,217,0
10	105659826	.	T	C	4340.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8136;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.93;VQSLOD=8.2702;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:4340,328,0
10	105762591	.	G	A	1935.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.700;DP=150;Dels=0.00;FS=3.765;HRun=0;HaplotypeScore=2.6465;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.032;VQSLOD=6.2686;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,76:150:99:1966,0,2050
10	105810400	.	T	C	5252.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7207;MQ=59.87;MQ0=0;QD=30.01;VQSLOD=7.6309;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:175:99:5252,394,0
10	105816916	.	C	T	5429.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4761;MQ=58.60;MQ0=0;QD=34.58;VQSLOD=9.3120;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:5429,418,0
10	105824333	.	G	A	1114.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=14.1871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:90.29:1147,90,0
10	105891927	.	G	C	727.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=74;Dels=0.00;FS=2.022;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.197;VQSLOD=5.7297;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,31:74:99:758,0,1202
10	112641053	.	A	G	1606.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.258;DP=122;Dels=0.00;FS=1.450;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.288;VQSLOD=6.0280;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,65:122:99:1637,0,1378
10	113935379	.	T	C	2594.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.571;DP=210;Dels=0.00;FS=1.684;HRun=1;HaplotypeScore=5.7888;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.147;VQSLOD=5.1269;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,105:210:99:2625,0,2545
10	113940329	.	T	C	707.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=73;Dels=0.00;FS=1.924;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.979;VQSLOD=5.7573;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,30:73:99:738,0,1241
10	115350597	.	G	A	1543.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.448;DP=123;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=0;HaplotypeScore=7.0535;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.666;VQSLOD=4.9469;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,58:123:99:1573,0,1780
10	115370274	.	T	C	4001.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=27.41;ReadPosRankSum=1.376;VQSLOD=6.9195;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,145:146:99:3964,282,0
10	115381747	.	G	A	2088.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.942;DP=174;Dels=0.00;FS=0.566;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.424;VQSLOD=6.8261;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,77:174:99:2119,0,2595
10	115392919	.	T	A	1100.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.229;DP=94;Dels=0.00;FS=0.815;HRun=1;HaplotypeScore=3.9852;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.068;VQSLOD=6.2513;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,47:94:99:1131,0,1246
10	115393929	.	G	A	2855.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.639;DP=210;DS;Dels=0.00;FS=3.356;HRun=1;HaplotypeScore=1.6483;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.151;VQSLOD=5.9495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,108:210:99:2886,0,2667
10	115405615	.	T	C	1529.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=143;Dels=0.00;FS=2.113;HRun=2;HaplotypeScore=4.9858;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.510;VQSLOD=4.4758;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,63:143:99:1559,0,2078
10	115405664	.	C	T	1491.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=135;Dels=0.00;FS=0.654;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.393;VQSLOD=6.4358;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,59:135:99:1522,0,1954
10	115410234	.	T	C	1387.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.971;DP=113;Dels=0.00;FS=1.539;HRun=0;HaplotypeScore=5.6806;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.387;VQSLOD=4.7371;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,53:113:99:1418,0,1519
10	115411614	.	A	G	4017.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2964;MQ=59.21;MQ0=0;QD=28.49;VQSLOD=7.2246;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4017,313,0
10	115609915	.	C	G	2391.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.209;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5902;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=0.614;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.094;VQSLOD=4.6054;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,93:181:99:2421,0,2544
10	115644040	.	G	A	468.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.275;DP=54;Dels=0.00;FS=1.072;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.558;VQSLOD=4.3823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,19:54:99:499,0,908
10	115805056	.	G	C	1291.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=29.34;VQSLOD=8.4778;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1324,117,0
10	115910928	.	G	T	2853.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;QD=32.06;VQSLOD=9.1360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2887,235,0
10	115922492	.	C	T	2226.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7356;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=8.1530;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2260,172,0
10	115922774	.	G	A	2724.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=8.9056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2757,223,0
10	116008497	.	G	A	4725.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.419;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.4996;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.576;VQSLOD=5.7365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,161:163:99:4724,373,0
10	116046066	.	C	T	1490.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.926;DP=120;Dels=0.00;FS=5.652;HRun=0;HaplotypeScore=3.3072;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=12.42;ReadPosRankSum=-2.175;VQSLOD=2.5045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,56:120:99:1520,0,1802
10	116057112	.	C	T	532.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.517;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.978;VQSLOD=4.6030;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:57:99:562,0,952
10	116719543	.	G	A	1688.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.1643;MQ=57.85;MQ0=0;QD=28.61;VQSLOD=6.0943;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1721,129,0
10	116931101	.	C	CTT	2122.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=95.8840;MQ=57.40;MQ0=0;QD=48.25;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:9,35:44:99:2165,117,0
10	117075175	.	G	A	1374.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;DP=134;Dels=0.00;FS=2.198;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.545;VQSLOD=6.7272;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,61:134:99:1405,0,2058
10	117849353	.	T	C	1361.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.166;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5312;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=15.29;ReadPosRankSum=-2.157;VQSLOD=4.7821;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,53:89:99:1391,0,968
10	118231360	.	G	A	5499.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3880;MQ=58.52;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=8.0236;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:5498,442,0
10	118231363	.	A	G	5363.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.3880;MQ=58.44;MQ0=0;QD=32.51;VQSLOD=8.4929;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:165:99:5363,415,0
10	118383463	.	A	AG	3233.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=147.8984;MQ=59.28;MQ0=0;QD=40.41;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,78:80:99:3276,220,0
10	119043554	.	C	T	956.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.557;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.289;VQSLOD=7.0695;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,32:64:99:987,0,789
10	120353910	.	T	C	2158.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.65;MQ0=0;QD=33.20;VQSLOD=10.0497;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2191,184,0
10	121679013	.	A	G	3654.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7530;MQ=58.69;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=8.4871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3654,283,0
10	123844172	.	G	T	1529.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;DP=103;Dels=0.00;FS=17.132;HRun=0;HaplotypeScore=1.6918;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.017;VQSLOD=3.1006;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,55:103:99:1560,0,1205
10	123845322	.	T	C	2467.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6634;MQ=59.30;MQ0=0;QD=28.36;VQSLOD=8.4175;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2500,208,0
10	123903133	.	G	A	1772.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.581;DP=123;Dels=0.00;FS=2.318;HRun=2;HaplotypeScore=3.5830;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.946;VQSLOD=5.4870;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,66:123:99:1802,0,1495
10	123970530	.	T	C	612.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=68;Dels=0.00;FS=7.946;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.790;VQSLOD=4.3977;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,27:68:99:642,0,1133
10	123970569	.	C	T	536.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.190;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.014;VQSLOD=6.5997;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:566,0,709
10	123970722	.	T	A	815.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;DP=59;Dels=0.00;FS=3.702;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.496;VQSLOD=3.8314;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,34:59:99:846,0,643
10	124089036	.	G	A	3529.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.25;MQ0=0;QD=32.68;VQSLOD=10.1383;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3529,271,0
10	124096061	.	A	C	608.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.126;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.206;VQSLOD=6.1521;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,24:66:99:638,0,1196
10	124189197	.	A	G	4887.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9664;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.93;VQSLOD=7.1022;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,173:175:99:4887,397,0
10	124214251	.	G	A	1785.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.632;DP=127;Dels=0.00;FS=10.806;HRun=0;HaplotypeScore=4.3568;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.850;VQSLOD=4.1727;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,68:127:99:1815,0,1399
10	124457452	.	C	T	2493.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=196;Dels=0.00;FS=1.787;HRun=0;HaplotypeScore=4.6632;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.428;VQSLOD=5.6020;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,97:196:99:2524,0,2529
10	124610027	.	G	A	2094.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=173;Dels=0.00;FS=0.613;HRun=1;HaplotypeScore=4.9633;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.991;VQSLOD=5.4265;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,77:173:99:2125,0,2542
10	124742895	.	G	C	2411.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9921;MQ=58.43;MQ0=0;QD=30.52;VQSLOD=7.6668;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2444,199,0
10	125506302	.	T	C	3300.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=9.2240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3300,265,0
10	125780752	.	CG	C	96.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;HRun=12;HaplotypeScore=57.7278;MQ=53.36;MQ0=0;QD=8.75;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,5:11:17.85:138,18,0
10	126172863	.	A	G	3507.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.98;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=8.8649;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3507,289,0
10	126714714	.	G	C	4143.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0220;MQ=59.21;MQ0=0;QD=30.46;VQSLOD=6.8616;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:136:99:4142,349,0
10	126714966	.	A	G	1392.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17;VQSLOD=13.7967;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1426,114,0
10	126715692	.	C	T	1003.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.465;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.5479;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.693;VQSLOD=4.9657;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,35:70:99:1034,0,879
10	127462525	.	A	G	244.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.233;DP=30;Dels=0.00;FS=3.638;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.910;VQSLOD=5.2215;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:274,0,479
10	127737958	.	T	C	2560.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.775;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=5.134;HRun=0;HaplotypeScore=5.4402;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.850;VQSLOD=3.8173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,87:162:99:2591,0,2053
10	128019025	.	C	G	2546.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.229;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1047;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.723;VQSLOD=4.7336;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,109:250:99:2577,0,3858
10	128974220	.	G	A	1161.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;DP=94;Dels=0.00;FS=0.792;HRun=0;HaplotypeScore=2.8448;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.654;VQSLOD=6.6756;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,48:94:99:1192,0,1196
10	129245684	.	G	A	424.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.330;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=6.1575;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:454,0,407
10	129249662	.	G	A	771.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.58;MQ0=0;QD=28.56;VQSLOD=7.2635;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:66.19:804,66,0
10	129350856	.	G	C	1678.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.903;DP=154;DS;Dels=0.00;FS=0.684;HRun=0;HaplotypeScore=6.8008;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.483;VQSLOD=4.9700;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,60:154:99:1709,0,2737
10	129903802	.	A	G	3183.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.008;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=2.182;HRun=0;HaplotypeScore=9.9030;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.818;VQSLOD=3.8410;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,112:245:99:3213,0,3569
10	129917560	.	T	C	1959.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24;VQSLOD=13.0450;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1992,147,0
10	131959150	.	C	T	1281.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.628;DP=112;Dels=0.00;FS=5.983;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.634;VQSLOD=5.5322;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1312,0,1562
10	133963499	.	C	T	192.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=29;Dels=0.00;FS=3.645;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=2.495;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.562;VQSLOD=3.0932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:222,0,487
10	134218269	.	C	T	2053.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=9.1522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2086,189,0
10	134218296	.	C	G	805.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7792;MQ=55.53;MQ0=0;QD=25.98;VQSLOD=2.9419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,30:31:75.17:838,75,0
10	134598628	.	A	G	1576.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7862;MQ=59.56;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=8.0303;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1609,129,0
10	134623959	.	T	C	1926.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.9569;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.491;VQSLOD=4.9680;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,77:148:99:1957,0,1832
10	134646988	.	C	T	2590.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.316;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.494;HRun=0;HaplotypeScore=14.7935;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=2.4794;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,104:228:99:2621,0,3023
10	134748331	.	C	T	1120.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.667;DP=120;Dels=0.00;FS=1.545;HRun=1;HaplotypeScore=5.9162;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.623;VQSLOD=4.4544;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,46:120:99:1150,0,1970
10	135000159	.	A	G	502.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.436;VQSLOD=6.4851;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,23:47:99:532,0,611
10	135012162	.	T	C	193.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=14;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.133;VQSLOD=6.2800;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:224,0,123
10	135053604	.	G	A	914.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.766;DP=59;Dels=0.00;FS=13.232;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.342;VQSLOD=3.9181;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,32:59:99:944,0,680
10	135053710	.	C	A	432.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.041;DP=30;Dels=0.00;FS=1.617;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.288;VQSLOD=5.4304;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,17:30:99:463,0,245
10	135053721	.	C	A	418.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;DP=31;Dels=0.00;FS=1.484;HRun=0;HaplotypeScore=1.8653;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.275;VQSLOD=6.0367;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:449,0,382
10	135053773	.	G	A	476.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=38;Dels=0.00;FS=1.323;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.248;VQSLOD=6.1847;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:506,0,486
10	135082346	.	A	G	755.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.983;DP=57;Dels=0.00;FS=1.008;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=5.9751;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,27:57:99:786,0,846
10	135087521	.	G	A	392.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;VQSLOD=13.4240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:15:33.10:426,33,0
10	135165790	.	A	G	5197.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=10.6927;MQ=59.39;MQ0=0;QD=29.53;VQSLOD=2.8279;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:5196,433,0
10	135184126	.	G	A	1149.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=14.4190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1182,99,0
10	135204950	.	C	G	799.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.754;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.562;VQSLOD=5.9972;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,28:52:99:830,0,689
10	135233541	.	A	G	5914.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1827;MQ=59.23;MQ0=1;QD=29.43;VQSLOD=6.3652;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:201:99:5913,484,0
10	135237166	.	G	A	291.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=47.68;MQ0=0;QD=29.12;VQSLOD=6.0580;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:27.08:324,27,0
11	193112	.	C	T	347.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.523;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7732;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.243;VQSLOD=3.4461;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,21:88:99:378,0,1626
11	237087	.	A	G	614.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.404;DP=38;Dels=0.00;FS=5.041;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.348;VQSLOD=5.9130;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,24:38:99:645,0,262
11	280464	.	C	G	272.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.897;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.224;VQSLOD=5.6164;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:302,0,370
11	280816	.	A	T	4556.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.7791;MQ=59.57;MQ0=0;QD=32.78;VQSLOD=8.8645;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4556,364,0
11	314207	.	C	G	5923.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.2864;MQ=58.36;MQ0=0;QD=33.28;VQSLOD=7.5204;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5923,460,0
11	406483	.	T	C	3284.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8857;MQ=58.16;MQ0=0;QD=28.08;VQSLOD=7.9796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3284,277,0
11	428385	.	A	G	475.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7965;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.623;VQSLOD=5.6374;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,21:49:99:505,0,740
11	428489	.	T	C	994.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;DP=86;Dels=0.00;FS=5.586;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.043;VQSLOD=5.5122;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,39:86:99:1024,0,1201
11	433387	.	A	G	4363.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7134;MQ=59.36;MQ0=0;QD=30.95;VQSLOD=8.0556;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4363,346,0
11	551753	.	G	A	240.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.362;DP=23;Dels=0.00;FS=7.060;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.543;VQSLOD=3.8455;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:270,0,400
11	554047	.	G	A	2375.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.371;DP=153;DS;Dels=0.00;FS=1.661;HRun=0;HaplotypeScore=4.5351;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.961;VQSLOD=4.5643;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,80:153:99:2405,0,1983
11	554166	.	C	G	1818.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=33.67;ReadPosRankSum=1.476;VQSLOD=9.2766;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,53:54:99:1851,114,0
11	554214	.	G	C	2305.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41;VQSLOD=9.0501;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2338,184,0
11	558884	.	C	T	1108.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66;VQSLOD=8.5580;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1141,99,0
11	613208	.	T	C	141.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.775;VQSLOD=10.0571;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:172,0,467
11	614318	.	T	C	310.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=22;Dels=0.00;FS=4.612;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.334;VQSLOD=4.9231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:341,0,237
11	617967	.	C	G	1239.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.26;MQ0=0;QD=35.43;VQSLOD=9.2468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1273,99,0
11	618013	.	C	T	375.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;DP=34;Dels=0.00;FS=1.485;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.869;VQSLOD=3.8284;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,17:34:99:405,0,395
11	618998	.	G	A	939.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.362;DP=76;Dels=0.00;FS=3.973;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.132;VQSLOD=4.7303;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,38:76:99:970,0,853
11	619789	.	T	G	307.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.808;DP=18;Dels=0.00;FS=5.008;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.453;VQSLOD=4.3568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:338,0,167
11	802379	.	T	C	1543.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4875;MQ=57.73;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=7.5953;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1577,138,0
11	870446	.	G	A	1080.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.88;MQ0=0;QD=27.01;VQSLOD=7.9083;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:87.27:1113,87,0
11	870467	.	C	T	1075.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.88;VQSLOD=7.9990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,39:40:81.26:1108,81,0
11	1018088	.	TG	T	544.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.574;DP=180;DS;FS=49.327;HRun=3;HaplotypeScore=1626.3210;MQ=40.53;MQ0=6;MQRankSum=-6.293;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.842;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,59:180:99:584,0,5823
11	1018093	.	G	GT	647.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.268;DP=186;DS;FS=52.174;HRun=1;HaplotypeScore=1680.1075;MQ=41.69;MQ0=4;MQRankSum=-6.998;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.880;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,58:186:99:686,0,5175
11	1027811	.	C	T	195.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.035;DP=21;Dels=0.00;FS=1.740;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.514;VQSLOD=5.8917;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:226,0,289
11	1081074	.	T	C	532.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.408;VQSLOD=4.8800;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,22:40:99:562,0,445
11	1081112	.	G	C	549.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.595;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.775;VQSLOD=6.2804;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,23:44:99:579,0,521
11	1081757	.	G	C	591.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=51;Dels=0.00;FS=6.004;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.293;VQSLOD=4.6476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,24:51:99:622,0,679
11	1082353	.	C	T	218.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.247;DP=26;Dels=0.00;FS=1.685;HRun=1;HaplotypeScore=1.9975;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.471;VQSLOD=4.1260;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:248,0,382
11	1151695	.	C	T	322.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.26;MQ0=0;QD=29.29;VQSLOD=7.7931;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:30.09:355,30,0
11	1158073	.	T	C	703.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.98;MQ0=0;QD=28.12;VQSLOD=7.5426;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:60.17:736,60,0
11	1158092	.	C	G	307.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;DP=19;Dels=0.00;FS=1.808;HRun=0;HaplotypeScore=1.9916;MQ=56.30;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.658;VQSLOD=2.5285;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:337,0,153
11	1161315	.	T	C	265.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.10;VQSLOD=12.3489;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:24.07:298,24,0
11	1215580	.	A	G	408.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=8.6498;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.10:441,39,0
11	1216316	.	G	GC	928.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=143.3056;MQ=39.04;MQ0=0;QD=37.16;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:8,17:25:66.22:971,66,0
11	1216333	.	TA	T	1258.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=144.3446;MQ=45.74;MQ0=0;QD=38.13;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:93.31:1300,93,0
11	1217228	.	T	C	1436.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9965;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18;VQSLOD=6.8299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1470,120,0
11	1218128	.	G	A	536.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.96;MQ0=0;QD=29.81;VQSLOD=8.6607;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:45.14:570,45,0
11	1220599	.	T	C	514.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.62;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.4470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:45.13:547,45,0
11	1246941	.	A	G	347.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72;VQSLOD=14.3356;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30.10:380,30,0
11	1262189	.	C	T	471.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.707;DP=34;Dels=0.00;FS=1.376;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.294;VQSLOD=5.9327;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,18:34:99:502,0,403
11	1263523	.	G	A	837.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;DP=84;Dels=0.00;FS=5.863;HRun=1;HaplotypeScore=5.5328;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.014;VQSLOD=4.7951;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,34:84:99:867,0,1493
11	1263776	.	C	T	3204.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;DP=217;Dels=0.00;FS=0.572;HRun=0;HaplotypeScore=12.0912;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.298;VQSLOD=2.8487;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,113:217:99:3234,0,3103
11	1272709	.	G	A	1296.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.303;DP=118;Dels=0.00;FS=13.924;HRun=0;HaplotypeScore=3.0271;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.556;VQSLOD=3.3768;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,56:118:99:1327,0,1619
11	1272754	.	A	G	1190.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.788;DP=65;Dels=0.00;FS=4.256;HRun=0;HaplotypeScore=3.5623;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.214;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.463;VQSLOD=3.4462;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,41:65:99:1220,0,559
11	1272800	.	C	T	435.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.229;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4313;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.114;VQSLOD=5.5395;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,17:46:99:465,0,774
11	1857173	.	T	C	1845.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;QD=28.39;VQSLOD=8.3833;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1878,156,0
11	1857751	.	C	G	1042.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9827;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=32.58;ReadPosRankSum=1.516;VQSLOD=8.0397;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,31:32:64.58:1076,65,0
11	1858572	.	C	T	960.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=13.9840;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:84.25:994,84,0
11	2016619	.	A	G	957.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.23;MQ0=0;QD=31.92;VQSLOD=9.4559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:81.22:990,81,0
11	2016659	.	T	C	340.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.923;DP=26;Dels=0.00;FS=1.623;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.154;VQSLOD=6.3128;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:371,0,335
11	2016662	.	T	C	270.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=24;Dels=0.00;FS=1.674;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.664;VQSLOD=6.3038;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:301,0,353
11	2190951	.	C	T	2294.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=30.59;VQSLOD=9.4947;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2327,184,0
11	2424684	.	A	C	546.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=13.6423;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:45.14:579,45,0
11	2924610	.	G	A	1522.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.234;DP=106;Dels=0.00;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=3.0675;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.811;VQSLOD=5.9043;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,52:106:99:1552,0,1388
11	3111866	.	C	T	326.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;DP=32;Dels=0.00;FS=1.779;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.853;VQSLOD=5.8879;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:357,0,503
11	3249552	.	C	T	244.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.849;VQSLOD=6.5577;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:274,0,102
11	3249984	.	C	T	850.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.571;DP=63;Dels=0.00;FS=1.122;HRun=0;HaplotypeScore=2.9332;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.106;VQSLOD=6.0700;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,32:63:99:881,0,723
11	3381369	.	G	C	1685.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.468;DP=157;Dels=0.00;FS=15.385;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.532;VQSLOD=2.8945;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,71:157:99:1715,0,2449
11	3659993	.	G	T	1852.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.575;DP=163;Dels=0.00;FS=4.896;HRun=1;HaplotypeScore=3.0714;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.418;VQSLOD=5.6345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,74:163:99:1883,0,2211
11	3681519	.	T	C	982.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=124;Dels=0.00;FS=6.057;HRun=1;HaplotypeScore=3.9039;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=7.92;ReadPosRankSum=-2.683;VQSLOD=2.9994;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,45:124:99:1012,0,2013
11	4389404	.	AG	A	2164.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=158.7837;MQ=61.09;MQ0=0;QD=34.91;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,60:62:99:2206,181,0
11	4510285	.	A	G	4876.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.26;MQ0=0;QD=30.87;VQSLOD=9.1071;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:4876,391,0
11	4510587	.	C	T	5892.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=185;Dels=0.00;FS=2.264;HRun=0;HaplotypeScore=5.4191;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=2.586;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.523;VQSLOD=2.8611;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,181:185:99:5822,409,0
11	4567335	.	C	G	2104.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.79;MQ0=0;QD=31.89;VQSLOD=9.6323;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2138,166,0
11	4661285	.	A	G	1452.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.973;DP=106;Dels=0.00;FS=3.595;HRun=0;HaplotypeScore=2.7604;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.321;VQSLOD=5.7947;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,53:106:99:1483,0,1507
11	4791111	.	T	C	2114.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=8.7355;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2147,163,0
11	4869649	.	G	A	2039.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.562;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=0.586;HRun=1;HaplotypeScore=4.4833;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.439;VQSLOD=6.0090;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,74:183:99:2070,0,3190
11	4869906	.	A	C	6441.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4272;MQ=60.27;MQ0=0;QD=29.55;VQSLOD=7.9471;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:218:99:6440,532,0
11	4870261	.	G	C	1537.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.013;DP=119;Dels=0.00;FS=0.691;HRun=1;HaplotypeScore=4.9059;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.320;VQSLOD=4.7993;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,58:119:99:1568,0,1678
11	4870269	.	A	T	1495.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.625;DP=121;Dels=0.00;FS=0.681;HRun=1;HaplotypeScore=1.5779;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.650;VQSLOD=5.9340;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,57:121:99:1525,0,1708
11	4928621	.	G	A	757.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.435;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.918;VQSLOD=11.5836;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:787,0,967
11	4928841	.	T	C	2264.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;DP=189;Dels=0.00;FS=4.334;HRun=0;HaplotypeScore=11.3787;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.762;VQSLOD=3.7539;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,87:189:99:2295,0,2653
11	4936608	.	C	G	851.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.435;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8625;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.390;VQSLOD=5.6476;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,33:69:99:882,0,1098
11	4945196	.	T	G	1892.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=130;Dels=0.00;FS=13.336;HRun=1;HaplotypeScore=3.6896;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.161;VQSLOD=3.7419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,73:130:99:1922,0,1505
11	4945229	.	G	A	1793.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.160;DP=148;Dels=0.00;FS=3.946;HRun=1;HaplotypeScore=2.8534;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.085;VQSLOD=5.6820;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,69:148:99:1823,0,2243
11	4967468	.	G	A	5668.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9092;MQ=51.84;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=3.0937;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:196:99:5667,448,0
11	5080844	.	T	C	3117.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=1;QD=29.14;VQSLOD=8.7785;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,106:107:99:3151,235,0
11	5172786	.	A	G	2756.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.36;MQ0=0;QD=34.03;VQSLOD=8.6708;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2790,220,0
11	5221645	.	C	A	2044.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8348;MQ=59.60;MQ0=0;QD=16.62;VQSLOD=5.7671;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,66:123:99:2077,168,0
11	5221825	.	G	A	5440.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.4140;MQ=59.65;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=8.2590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,171:172:99:5440,448,0
11	5323071	.	C	T	1996.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.577;DP=157;Dels=0.00;FS=2.018;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.337;VQSLOD=6.5979;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,77:157:99:2026,0,2106
11	5344681	.	G	A	1369.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.808;DP=106;Dels=0.00;FS=3.645;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.433;VQSLOD=6.2821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,52:106:99:1399,0,1396
11	5344902	.	C	G	1080.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.73;VQSLOD=9.3237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:33:87.27:1113,87,0
11	5345128	.	G	A	1687.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.907;DP=135;Dels=0.00;FS=3.059;HRun=2;HaplotypeScore=6.1757;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.717;VQSLOD=4.1617;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,65:135:99:1717,0,1904
11	5345170	.	A	G	3823.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=9.6667;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3822,325,0
11	5364276	.	G	A	2511.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.69;MQ0=0;QD=33.95;VQSLOD=9.6079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2545,202,0
11	5364450	.	A	G	2896.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=9.7700;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2929,229,0
11	5372856	.	A	G	1461.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.683;DP=93;Dels=0.00;FS=10.592;HRun=0;HaplotypeScore=1.9985;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.336;VQSLOD=4.2362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,51:93:99:1491,0,1123
11	5373006	.	T	C	1551.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=100;Dels=0.00;FS=11.938;HRun=0;HaplotypeScore=1.8650;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.988;VQSLOD=2.8694;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,58:100:99:1582,0,1119
11	5373104	.	A	G	1234.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.978;DP=89;Dels=0.00;FS=4.058;HRun=0;HaplotypeScore=2.8502;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.949;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.349;VQSLOD=2.4187;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,44:89:99:1264,0,1227
11	5373114	.	G	A	2872.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7809;MQ=52.77;MQ0=0;QD=33.40;VQSLOD=3.8130;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2905,244,0
11	5373242	.	T	G	1328.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.458;DP=149;Dels=0.00;FS=0.652;HRun=0;HaplotypeScore=4.8119;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.183;VQSLOD=4.4241;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,55:149:99:1359,0,2584
11	5373251	.	C	T	1298.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.153;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.809;VQSLOD=6.1947;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,57:160:99:1329,0,2847
11	5373311	.	T	C	993.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.282;DP=137;Dels=0.00;FS=4.635;HRun=2;HaplotypeScore=5.7094;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.798;VQSLOD=3.3869;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,40:137:99:1023,0,2730
11	5373497	.	G	C	2415.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=168;Dels=0.00;FS=2.709;HRun=0;HaplotypeScore=2.9760;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.928;VQSLOD=5.6273;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,82:168:99:2446,0,2409
11	5373562	.	C	A	1462.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.309;DP=162;Dels=0.00;FS=2.095;HRun=0;HaplotypeScore=3.5648;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.890;VQSLOD=5.7513;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,60:162:99:1493,0,3043
11	5410934	.	T	G	4285.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.713;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.066;HRun=0;HaplotypeScore=8.7340;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.259;VQSLOD=3.7653;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:249:99:3616,0,3361
11	5411031	.	C	T	4284.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=9.1424;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.700;VQSLOD=3.6627;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,129:250:99:3610,0,3499
11	5411239	.	T	C	2544.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.039;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=3.367;HRun=1;HaplotypeScore=6.2076;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.864;VQSLOD=4.5188;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,92:200:99:2574,0,3081
11	5411395	.	C	A	1947.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=132;Dels=0.00;FS=2.500;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.833;VQSLOD=5.4092;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,73:132:99:1977,0,1612
11	5411398	.	T	G	1871.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.385;DP=128;Dels=0.00;FS=1.625;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.133;VQSLOD=6.6541;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,69:128:99:1901,0,1456
11	5411580	.	T	C	166.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.455;DP=21;Dels=0.00;FS=4.506;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.336;VQSLOD=3.8645;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:196,0,368
11	5443867	.	C	T	2240.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.761;DP=217;DS;Dels=0.00;FS=1.078;HRun=1;HaplotypeScore=5.7095;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.339;VQSLOD=5.0815;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,88:217:99:2271,0,3906
11	5443887	.	T	C	2340.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.968;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9877;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.836;VQSLOD=5.7903;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,96:230:99:2371,0,4086
11	5443893	.	G	A	2392.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=232;DS;Dels=0.00;FS=1.641;HRun=0;HaplotypeScore=3.8544;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.665;VQSLOD=4.9903;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,94:232:99:2423,0,4152
11	5443963	.	G	A	2900.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=9.494;HRun=0;HaplotypeScore=1.8808;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.883;VQSLOD=4.5446;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,111:242:99:2930,0,3388
11	5444061	.	G	A	3104.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.934;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=9.430;HRun=0;HaplotypeScore=1.9385;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.898;VQSLOD=4.7009;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,116:243:99:3135,0,3329
11	5444136	.	C	T	1979.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.374;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5770;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.191;VQSLOD=6.7372;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,76:176:99:2009,0,2605
11	5444353	.	T	C	636.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.934;DP=56;Dels=0.00;FS=7.137;HRun=2;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.841;VQSLOD=5.1551;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,25:56:99:666,0,817
11	5461991	.	C	A	1620.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.430;DP=98;Dels=0.00;FS=4.351;HRun=0;HaplotypeScore=1.5650;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.524;VQSLOD=5.4322;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,61:98:99:1651,0,978
11	5462255	.	C	G	1971.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=142;Dels=0.00;FS=6.704;HRun=0;HaplotypeScore=2.6565;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.069;VQSLOD=3.7926;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,73:142:99:2001,0,1860
11	5475431	.	T	TCA	12480.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=602.6794;MQ=60.98;MQ0=0;QD=49.92;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:16,230:250:99:12481,701,0
11	5510688	.	T	C	5848.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.9009;MQ=59.38;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=8.2505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5847,460,0
11	5528918	.	C	T	4679.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6912;MQ=58.75;MQ0=0;QD=34.66;VQSLOD=7.9227;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:135:99:4679,373,0
11	5536537	.	A	C	6111.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=7.1988;MQ=59.11;MQ0=0;QD=34.33;VQSLOD=6.2246;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:6111,475,0
11	5536848	.	G	A	3010.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=32.38;VQSLOD=9.6427;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:3044,247,0
11	5566030	.	A	G	2893.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=31.45;VQSLOD=9.3845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2927,244,0
11	5566051	.	C	A	1232.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;DP=87;Dels=0.00;FS=12.821;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.344;VQSLOD=4.3177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,44:87:99:1262,0,1296
11	5566365	.	T	C	4137.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8782;MQ=58.14;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=7.9760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4137,334,0
11	5566489	.	C	T	1644.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.888;DP=143;Dels=0.00;FS=2.110;HRun=3;HaplotypeScore=1.9148;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.780;VQSLOD=6.5481;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,62:143:99:1674,0,2359
11	5602275	.	A	G	1612.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.404;DP=131;Dels=0.00;FS=1.523;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.897;VQSLOD=6.7102;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,62:131:99:1643,0,1929
11	5602438	.	T	A	2507.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=186;DS;Dels=0.00;FS=12.872;HRun=0;HaplotypeScore=9.6207;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.281;VQSLOD=2.8154;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,94:186:99:2537,0,2596
11	5602605	.	G	A	2752.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.921;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=3.679;HRun=0;HaplotypeScore=3.0313;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.380;VQSLOD=5.7988;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,106:246:99:2782,0,3688
11	5602615	.	A	G	2950.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.784;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=9.304;HRun=0;HaplotypeScore=4.1658;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.148;VQSLOD=4.8017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,110:243:99:2981,0,3657
11	5602968	.	G	A	7546.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.5074;MQ=59.39;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=5.2881;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:7515,599,0
11	5701001	.	C	T	1852.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.809;DP=136;Dels=0.00;FS=1.547;HRun=0;HaplotypeScore=6.3734;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.721;VQSLOD=4.1724;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,68:136:99:1883,0,1818
11	5718517	.	G	A	980.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.59;MQ0=0;QD=27.24;VQSLOD=8.0568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:78.24:1014,78,0
11	5719750	.	G	C	1716.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60;VQSLOD=8.4504;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1750,150,0
11	5758062	.	T	C	1832.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7172;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59;VQSLOD=9.1536;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1865,156,0
11	5776287	.	C	T	5997.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9107;MQ=59.78;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=9.3590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:5996,484,0
11	5776470	.	T	G	7427.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.9043;MQ=59.45;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=5.4275;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:238:99:7394,608,0
11	5776484	.	A	T	4113.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.410;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=7.106;HRun=0;HaplotypeScore=2.7870;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=17.28;ReadPosRankSum=2.298;VQSLOD=3.0225;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,120:238:99:3483,0,3322
11	5776623	.	A	T	5852.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6109;MQ=59.52;MQ0=0;QD=33.44;VQSLOD=7.1688;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5852,481,0
11	5809308	.	A	T	4442.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9850;MQ=55.39;MQ0=0;QD=33.15;VQSLOD=3.6992;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4442,361,0
11	5809548	.	G	A	1874.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;DP=137;Dels=0.00;FS=5.260;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=5.8895;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,72:137:99:1905,0,1634
11	5809673	.	C	T	2137.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.632;DP=175;Dels=0.00;FS=1.213;HRun=0;HaplotypeScore=6.1215;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.510;VQSLOD=4.9007;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,86:175:99:2167,0,2402
11	5809746	.	C	T	1971.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;DP=181;Dels=0.00;FS=1.178;HRun=0;HaplotypeScore=5.6573;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.590;VQSLOD=4.8494;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,82:181:99:2002,0,2708
11	5842310	.	T	G	2791.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=178;Dels=0.00;FS=0.568;HRun=0;HaplotypeScore=4.1074;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.001;VQSLOD=5.9564;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,91:178:99:2822,0,2391
11	5842356	.	A	G	2794.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.399;DP=182;Dels=0.00;FS=0.556;HRun=0;HaplotypeScore=5.8977;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.625;VQSLOD=4.4834;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,104:182:99:2825,0,1986
11	5862532	.	A	C	4831.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7005;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=32.21;ReadPosRankSum=-1.546;VQSLOD=4.1743;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,149:150:99:4830,376,0
11	5862653	.	T	C	7567.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2278;MQ=50.43;MQ0=4;QD=31.40;VQSLOD=4.1972;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,241:241:99:7566,629,0
11	5862845	.	A	G	7481.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6726;MQ=55.13;MQ0=1;QD=33.10;VQSLOD=3.7579;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,226:226:99:7481,587,0
11	5862937	.	C	A	6614.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6786;MQ=57.94;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=6.8811;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:209:99:6613,530,0
11	5862984	.	G	C	6039.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0798;MQ=58.56;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=7.5764;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:179:99:6039,472,0
11	5863013	.	T	C	6396.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9427;MQ=58.77;MQ0=0;QD=33.66;VQSLOD=9.4400;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:6396,500,0
11	5906048	.	G	A	5191.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.122;DP=159;Dels=0.00;FS=4.800;HRun=0;HaplotypeScore=3.6985;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=32.65;ReadPosRankSum=1.100;VQSLOD=4.5546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,158:159:99:5156,387,0
11	5906073	.	G	T	5711.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7661;MQ=58.31;MQ0=0;QD=33.20;VQSLOD=8.8223;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5710,463,0
11	5906205	.	G	A	6552.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.78;VQSLOD=8.3589;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,219:220:99:6551,536,0
11	6007272	.	A	G	1842.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6249;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.994;VQSLOD=7.4192;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,60:61:99:1876,135,0
11	6007613	.	T	G	6843.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6238;MQ=54.38;MQ0=1;QD=32.28;VQSLOD=4.3610;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6843,539,0
11	6007680	.	A	G	5440.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=51.16;MQ0=2;QD=31.82;VQSLOD=3.9260;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,171:171:99:5440,442,0
11	6023640	.	T	C	1280.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;DP=111;Dels=0.00;FS=0.704;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.157;VQSLOD=6.4359;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,52:111:99:1311,0,1541
11	6023762	.	C	T	1183.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.108;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2645;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.669;VQSLOD=5.8891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,43:83:99:1213,0,1053
11	6129837	.	C	T	5463.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.0993;MQ=59.61;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=8.9545;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5463,427,0
11	6221169	.	A	G	7871.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.7424;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=5.8455;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7870,695,0
11	6221214	.	T	A	8663.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6202;MQ=59.47;MQ0=0;QD=34.65;VQSLOD=8.7324;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8662,692,0
11	6231731	.	C	T	3916.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=30.36;ReadPosRankSum=-0.443;VQSLOD=8.9351;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,128:129:99:3916,319,0
11	6340416	.	G	A	3984.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6126;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=5.5263;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,117:243:99:3325,0,3494
11	6340706	.	A	G	507.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;DP=42;Dels=0.00;FS=12.708;HRun=1;HaplotypeScore=1.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=4.2433;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,19:42:99:537,0,623
11	6341684	.	C	G	621.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.01;MQ0=0;QD=32.71;VQSLOD=8.6710;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:54.16:654,54,0
11	6648424	.	G	A	993.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=79;Dels=0.00;FS=0.856;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.295;VQSLOD=6.2611;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,39:79:99:1024,0,1013
11	6790106	.	T	C	3594.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=56.32;MQ0=0;QD=32.09;VQSLOD=6.6677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3594,277,0
11	6816792	.	T	C	2643.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.503;DP=185;Dels=0.00;FS=1.139;HRun=0;HaplotypeScore=5.0651;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=14.29;ReadPosRankSum=2.210;VQSLOD=4.4288;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,95:185:99:2674,0,2383
11	6816872	.	G	T	1871.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=148;Dels=0.00;FS=6.081;HRun=1;HaplotypeScore=5.8704;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.405;VQSLOD=2.8954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,71:148:99:1901,0,2151
11	6816875	.	G	A	1949.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.462;DP=147;Dels=0.00;FS=4.948;HRun=0;HaplotypeScore=5.8704;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.609;VQSLOD=4.6817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,74:147:99:1979,0,1846
11	6891704	.	T	C	4488.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6495;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=3.933;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.674;VQSLOD=2.3519;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,135:250:99:3844,0,2863
11	6891758	.	A	C	3062.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.534;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6809;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.462;VQSLOD=6.4811;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,121:245:99:3092,0,3576
11	6898663	.	G	A	2440.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=177;Dels=0.00;FS=13.274;HRun=1;HaplotypeScore=4.6175;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.545;VQSLOD=3.8621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,87:177:99:2470,0,2223
11	6913127	.	A	G	779.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=66;Dels=0.00;FS=11.257;HRun=0;HaplotypeScore=2.7041;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.558;VQSLOD=4.4260;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,31:66:99:809,0,908
11	6913244	.	A	G	3543.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=58.87;MQ0=0;QD=35.79;VQSLOD=8.7456;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3543,283,0
11	6913290	.	A	G	1907.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.566;DP=156;Dels=0.00;FS=9.558;HRun=1;HaplotypeScore=5.5677;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.074;VQSLOD=4.2851;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,66:156:99:1938,0,2285
11	6942695	.	C	T	5418.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.2434;MQ=59.29;MQ0=0;QD=33.45;VQSLOD=9.8889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5418,436,0
11	6977175	.	G	C	962.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.469;DP=63;Dels=0.00;FS=0.949;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.090;VQSLOD=6.0876;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,35:63:99:992,0,702
11	7022160	.	A	G	1856.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=56.23;MQ0=0;QD=32.00;VQSLOD=6.6103;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1889,153,0
11	7022531	.	A	T	3082.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.81;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=8.8169;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3116,262,0
11	7022717	.	T	C	3487.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.148;DP=99;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9967;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=35.22;ReadPosRankSum=2.374;VQSLOD=6.6634;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,96:99:99:3380,205,0
11	7059960	.	A	C	2328	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.00;MQ0=0;QD=34.75;VQSLOD=9.8921;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2361,187,0
11	7079038	.	G	A	2312.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=57.68;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=7.7601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2345,181,0
11	7507182	.	A	G	1297.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=105;Dels=0.00;FS=1.579;HRun=0;HaplotypeScore=1.8658;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.560;VQSLOD=6.0169;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,49:105:99:1327,0,1500
11	7670440	.	A	G	3160.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;QD=29.00;VQSLOD=8.8214;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3194,247,0
11	7687715	.	T	C	1864.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.02;VQSLOD=7.7018;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1898,153,0
11	7712561	.	T	A	452.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.573;DP=35;Dels=0.00;FS=6.130;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.613;VQSLOD=5.6208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:483,0,471
11	7716855	.	T	A	1491.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.89;MQ0=0;QD=30.43;VQSLOD=7.1554;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1524,123,0
11	7721870	.	G	A	1668.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=29.27;VQSLOD=8.9072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1701,132,0
11	7727886	.	C	T	156.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.239;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.536;VQSLOD=11.6263;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:91.16:187,0,91
11	7817538	.	T	C	2360.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.965;DP=201;Dels=0.00;FS=4.037;HRun=0;HaplotypeScore=2.4969;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.164;VQSLOD=5.7846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,93:201:99:2391,0,2891
11	7817852	.	C	G	1743	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;DP=174;Dels=0.00;FS=2.755;HRun=1;HaplotypeScore=2.8929;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.430;VQSLOD=5.3373;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,67:174:99:1773,0,3149
11	7817856	.	C	T	1682.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.830;DP=175;Dels=0.00;FS=1.985;HRun=0;HaplotypeScore=3.8920;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.387;VQSLOD=4.9949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,68:175:99:1713,0,2804
11	7818056	.	T	C	1541.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=98;Dels=0.00;FS=6.621;HRun=0;HaplotypeScore=4.5859;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.836;VQSLOD=4.3204;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,52:98:99:1571,0,1266
11	7949350	.	A	G	1493.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.594;DP=133;Dels=0.00;FS=0.654;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=6.3764;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,59:133:99:1523,0,1948
11	8414089	.	C	CA	462.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.332;DP=158;FS=3.851;HRun=0;HaplotypeScore=618.4830;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-6.826;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.051;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,20:158:99:502,0,4235
11	8414090	.	G	GAACCA	2554.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=161;FS=4.617;HRun=0;HaplotypeScore=872.7179;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=-7.299;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.103;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,20:161:99:2593,0,7022
11	8751889	.	C	G	1365.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.572;DP=99;Dels=0.00;FS=0.759;HRun=0;HaplotypeScore=6.5546;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.801;VQSLOD=4.5045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,50:99:99:1396,0,1288
11	8933064	.	G	A	242.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.575;VQSLOD=6.8727;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:272,0,371
11	8942942	.	C	T	2465.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.140;DP=166;Dels=0.00;FS=1.234;HRun=0;HaplotypeScore=3.6745;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.586;VQSLOD=6.2147;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,87:166:99:2495,0,2033
11	8942999	.	G	A	7095.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1172;MQ=59.56;MQ0=0;QD=29.81;VQSLOD=7.2546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,238:238:99:7094,578,0
11	8947021	.	A	G	4398.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.83;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=9.6360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:137:99:4398,340,0
11	8947283	.	G	C	1063.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.029;DP=122;Dels=0.00;FS=2.473;HRun=1;HaplotypeScore=6.1122;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.089;VQSLOD=3.4079;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,41:122:99:1094,0,2299
11	8947586	.	C	G	1786.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=144;Dels=0.00;FS=3.071;HRun=0;HaplotypeScore=5.5279;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.747;VQSLOD=3.9772;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,69:144:99:1817,0,1786
11	8959545	.	C	A	2326.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.334;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=12.4962;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=15.61;ReadPosRankSum=-1.588;VQSLOD=2.7701;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,83:149:99:2356,0,1917
11	9052423	.	A	C	4033.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06;VQSLOD=14.0872;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4033,313,0
11	9537904	.	G	C	2119.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74;VQSLOD=13.0902;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2152,169,0
11	9769562	.	C	G	1836.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;DP=117;Dels=0.00;FS=3.813;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=15.70;ReadPosRankSum=2.284;VQSLOD=4.7814;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,67:117:99:1866,0,1275
11	10503736	.	C	T	1653.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.384;DP=141;DS;Dels=0.00;FS=3.971;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.980;VQSLOD=5.1583;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,62:141:99:1683,0,2009
11	10647995	.	G	A	486.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;DP=53;Dels=0.00;FS=2.491;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=6.1043;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,19:53:99:516,0,909
11	10655609	.	C	T	1141.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6377;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.86;VQSLOD=7.7803;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:96.29:1175,96,0
11	10673739	.	T	C	366.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.021;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.603;VQSLOD=6.8067;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:397,0,295
11	11913585	.	G	T	2045.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.332;DP=170;Dels=0.00;FS=2.714;HRun=0;HaplotypeScore=5.4185;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.357;VQSLOD=5.3153;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,84:170:99:2076,0,2246
11	11986061	.	T	C	1430.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=127;Dels=0.00;FS=8.838;HRun=3;HaplotypeScore=8.1208;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=11.26;ReadPosRankSum=-2.003;VQSLOD=2.6803;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,64:127:99:1461,0,1482
11	12315891	.	G	A	5743.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8809;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.944;VQSLOD=6.5542;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,190:192:99:5742,463,0
11	12315915	.	A	G	2091.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.2337;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.789;VQSLOD=6.2709;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,92:199:99:2122,0,2968
11	12316146	.	C	A	1316.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=114;Dels=0.00;FS=4.595;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.828;VQSLOD=5.4473;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,52:114:99:1346,0,1887
11	13984583	.	C	T	132.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=7.782;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.365;VQSLOD=2.5251;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:162,0,115
11	14101493	.	G	GC	4521.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=210.1110;MQ=60.00;MQ0=0;QD=43.90;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,100:103:99:4522,307,0
11	14264916	.	A	G	97.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.256;DP=17;Dels=0.00;FS=2.077;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.050;VQSLOD=4.6879;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:128,0,301
11	14991539	.	T	C	3198.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.08;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=9.3806;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:3232,256,0
11	17333663	.	G	A	3896.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=7.9704;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:3896,304,0
11	17408630	.	C	T	2505.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;DP=196;Dels=0.00;FS=2.548;HRun=0;HaplotypeScore=5.6799;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=4.6855;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,99:196:99:2535,0,2483
11	17409572	.	T	C	1654.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=130;Dels=0.00;FS=7.447;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.174;VQSLOD=4.7090;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,66:130:99:1685,0,1712
11	17414570	.	C	T	1526.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.146;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9389;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.551;VQSLOD=4.9885;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,62:126:99:1557,0,1551
11	17418477	.	C	A	863.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;DP=95;Dels=0.00;FS=1.949;HRun=0;HaplotypeScore=3.0748;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.192;VQSLOD=6.1085;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,40:95:99:894,0,1456
11	17519742	.	C	G	7569.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.5928;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.28;VQSLOD=5.5234;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7531,656,0
11	18159254	.	A	G	7100.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2653;MQ=59.15;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=7.0310;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:7100,554,0
11	18194827	.	C	G	8678.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5149;MQ=54.68;MQ0=1;QD=34.71;VQSLOD=4.1204;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8677,689,0
11	18194878	.	T	G	8408.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1800;MQ=55.89;MQ0=1;QD=33.63;VQSLOD=3.6768;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8407,665,0
11	18194964	.	A	G	8132.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7158;MQ=58.04;MQ0=0;QD=34.17;VQSLOD=5.9895;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,236:238:99:8107,635,0
11	18195051	.	T	C	5774.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5012;MQ=59.09;MQ0=0;QD=32.81;VQSLOD=7.8834;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:5773,490,0
11	18253176	.	C	T	2539.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.27;MQ0=0;QD=29.52;VQSLOD=8.5799;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2572,208,0
11	18267027	.	C	T	5078.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5336;MQ=59.61;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=7.5691;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:167:99:5077,403,0
11	18633897	.	T	C	1384.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=126;Dels=0.00;FS=2.433;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.233;VQSLOD=6.2723;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,56:126:99:1415,0,1950
11	18735947	.	T	C	6790.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7682;MQ=59.47;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=6.6169;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:6789,545,0
11	18737095	.	C	T	6559.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5323;MQ=58.90;MQ0=0;QD=33.81;VQSLOD=9.2077;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:194:99:6559,518,0
11	18738281	.	C	T	5573.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.1623;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=9.0693;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:5573,457,0
11	18743180	.	C	G	1964.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.973;DP=204;DS;Dels=0.00;FS=2.526;HRun=2;HaplotypeScore=1.8583;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.122;VQSLOD=6.0615;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,76:204:99:1995,0,3339
11	19167850	.	A	G	1261.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=14.1518;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1295,99,0
11	19854088	.	G	A	4299.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.570;HRun=1;HaplotypeScore=4.5942;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.414;VQSLOD=4.9200;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:250:99:3590,0,3650
11	20065673	.	G	T	1708.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;DP=160;Dels=0.00;FS=2.011;HRun=1;HaplotypeScore=2.5279;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.608;VQSLOD=5.7000;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,68:160:99:1739,0,2506
11	20065779	.	C	G	2527	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=9.3057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2560,202,0
11	20404613	.	T	G	546.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.881;DP=54;Dels=0.00;FS=3.991;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.184;VQSLOD=4.5756;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,20:54:99:577,0,909
11	20529886	.	G	A	4916.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.9736;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=29.09;ReadPosRankSum=1.138;VQSLOD=6.6638;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,168:169:99:4886,344,0
11	20622975	.	G	A	325.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.156;VQSLOD=13.1460;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:75.69:356,0,76
11	20623042	.	T	C	1051.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=8.2304;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:84.27:1085,84,0
11	20623156	.	C	G	1818	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.77;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=7.3596;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1851,144,0
11	20805286	.	G	A	3595.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3900;MQ=59.09;MQ0=0;QD=30.73;VQSLOD=9.3180;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3595,277,0
11	22271870	.	A	T	903.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.598;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.138;VQSLOD=6.9823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,36:77:99:934,0,1008
11	25098938	.	G	C	6848.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.5570;MQ=59.15;MQ0=0;QD=28.77;VQSLOD=7.3197;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,238:238:99:6848,503,0
11	26586801	.	G	A	749.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=60;Dels=0.00;FS=0.971;HRun=0;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.977;VQSLOD=6.6655;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,34:60:99:780,0,667
11	27362359	.	T	G	2313.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=57.63;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=7.1967;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2347,172,0
11	28057957	.	T	C	395.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.620;DP=39;Dels=0.00;FS=1.287;HRun=0;HaplotypeScore=1.7820;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.297;VQSLOD=6.7485;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:426,0,559
11	28110151	.	T	C	1486.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.3548;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=12.82;ReadPosRankSum=2.200;VQSLOD=5.8809;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,63:116:99:1517,0,1269
11	32954344	.	G	A	2901.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=96;Dels=0.00;FS=3.104;HRun=0;HaplotypeScore=6.9156;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.480;VQSLOD=3.6842;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,95:96:99:2935,214,0
11	32956244	.	A	G	3435.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8930;MQ=58.59;MQ0=0;QD=33.35;VQSLOD=9.2121;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3435,265,0
11	33079580	.	A	G	1318.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.706;DP=84;Dels=0.00;FS=5.874;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=5.5799;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,52:84:99:1348,0,889
11	34152939	.	T	C	3758.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6320;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.97;VQSLOD=8.8560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3758,289,0
11	34910397	.	C	T	450.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.459;VQSLOD=6.5168;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,18:36:99:481,0,446
11	34916657	.	C	T	1128.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.334;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8857;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.123;VQSLOD=5.7726;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,44:87:99:1158,0,1217
11	34937813	.	G	A	351.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.736;DP=20;Dels=0.00;FS=4.481;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=5.5770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:382,0,174
11	34969112	.	A	G	1822.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.858;DP=161;Dels=0.00;FS=3.652;HRun=0;HaplotypeScore=1.9463;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.853;VQSLOD=6.0174;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,74:161:99:1853,0,1975
11	35226155	.	A	G	3354.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7620;MQ=59.39;MQ0=0;QD=31.64;VQSLOD=9.5748;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3354,259,0
11	35229673	.	T	C	3220.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;QD=29.28;VQSLOD=8.3214;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3254,247,0
11	36422792	.	G	A	3133.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8737;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84;VQSLOD=8.5105;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:105:99:3166,256,0
11	36484167	.	C	T	503.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.396;DP=52;Dels=0.00;FS=8.561;HRun=0;HaplotypeScore=2.7196;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.418;VQSLOD=4.0968;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,20:52:99:533,0,929
11	36595600	.	A	G	1721.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;DP=144;Dels=0.00;FS=4.057;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.405;VQSLOD=5.7734;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,66:144:99:1751,0,2163
11	43876698	.	C	T	1720.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;DP=113;Dels=0.00;FS=0.802;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=15.23;ReadPosRankSum=-2.061;VQSLOD=5.6741;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,63:113:99:1750,0,1268
11	43940602	.	C	G	2962.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.068;HRun=0;HaplotypeScore=5.6992;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.678;VQSLOD=4.7673;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,116:250:99:2992,0,3843
11	44080210	.	T	C	3883.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20;VQSLOD=8.3991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:3883,319,0
11	44089352	.	G	A	1306.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.991;DP=105;Dels=0.00;FS=6.326;HRun=1;HaplotypeScore=4.2173;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.676;VQSLOD=3.9908;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,51:105:99:1336,0,1384
11	44104981	.	C	T	699.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;DP=62;Dels=0.00;FS=3.541;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.298;VQSLOD=6.5306;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,27:62:99:730,0,947
11	44331509	.	C	G	117.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.336;VQSLOD=11.3409;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:148,0,126
11	44640268	.	A	G	1417.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=14.5023;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1450,120,0
11	45937267	.	C	T	7945.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8093;MQ=59.11;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=7.3195;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7944,653,0
11	46387868	.	A	G	124.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.184;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.570;VQSLOD=5.0063;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:155,0,375
11	46890165	.	C	T	1136.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.436;DP=89;Dels=0.00;FS=1.732;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.055;VQSLOD=6.4104;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,43:89:99:1166,0,1200
11	46893108	.	T	C	239.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.958;VQSLOD=6.4623;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:270,0,402
11	46898771	.	T	C	2258.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;DP=169;Dels=0.00;FS=1.896;HRun=0;HaplotypeScore=4.4687;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.676;VQSLOD=5.7012;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,90:169:99:2288,0,2195
11	47431728	.	A	G	3385.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5640;MQ=59.76;MQ0=0;QD=34.90;VQSLOD=8.1514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3385,280,0
11	47464284	.	C	T	1557.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.333;DP=130;Dels=0.00;FS=2.260;HRun=0;HaplotypeScore=2.6601;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.530;VQSLOD=5.4247;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,60:130:99:1588,0,1916
11	47640429	.	G	C	4094.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8790;MQ=58.87;MQ0=0;QD=28.04;VQSLOD=7.4502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,145:146:99:4093,334,0
11	47701528	.	C	A	4350.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.97;MQ0=0;QD=28.07;VQSLOD=8.4313;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4350,328,0
11	48166267	.	G	C	2322.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=8.4983;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2355,187,0
11	48285842	.	A	G	4587.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;QD=32.77;VQSLOD=10.0544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4587,358,0
11	48286231	.	T	A	5460.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9960;MQ=59.17;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=9.0367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:5460,421,0
11	48286256	.	C	T	4036.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4916;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.58;VQSLOD=8.5160;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4036,328,0
11	48510654	.	A	C	3925.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=56.49;MQ0=0;QD=31.66;VQSLOD=6.6723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3925,307,0
11	48510777	.	G	A	3477.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.06;MQ0=0;QD=34.10;VQSLOD=8.0531;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3477,286,0
11	49974371	.	G	A	4943.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9454;MQ=48.66;MQ0=0;QD=33.17;VQSLOD=3.7522;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4942,412,0
11	50003191	.	C	A	1076.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.434;DP=87;Dels=0.00;FS=8.841;HRun=1;HaplotypeScore=4.6588;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=12.38;ReadPosRankSum=-2.381;VQSLOD=2.8001;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,43:87:99:1107,0,1097
11	55111238	.	C	A	2976.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=3.538;HRun=0;HaplotypeScore=4.5477;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=3.012;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.374;VQSLOD=3.6972;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,112:249:99:3006,0,4045
11	55111584	.	A	T	541.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.452;DP=51;Dels=0.00;FS=10.670;HRun=0;HaplotypeScore=1.9916;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=2.786;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.151;VQSLOD=3.3214;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,22:51:99:572,0,800
11	55135435	.	C	T	757.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.537;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9945;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.092;VQSLOD=5.5277;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,29:52:99:787,0,587
11	55339652	.	C	T	1431.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.288;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9697;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.360;VQSLOD=6.2184;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,61:138:99:1462,0,2141
11	55339829	.	A	G	2712.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.120;DP=235;Dels=0.00;FS=1.646;HRun=0;HaplotypeScore=3.8855;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.156;VQSLOD=6.1899;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,103:235:99:2743,0,3741
11	55340379	.	T	C	1873.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.249;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.7696;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.720;VQSLOD=4.4481;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,73:165:99:1903,0,2380
11	55433040	.	T	C	2351.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=160;Dels=0.00;FS=4.615;HRun=1;HaplotypeScore=2.7316;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.324;VQSLOD=5.4437;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,83:160:99:2381,0,2057
11	55541098	.	G	A	3766.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=30.87;VQSLOD=9.2857;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3766,313,0
11	55563776	.	T	G	4657.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.50;MQ0=0;QD=33.75;VQSLOD=9.7796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4658,361,0
11	55563900	.	T	C	807.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;DP=101;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=1;HaplotypeScore=2.7861;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.976;VQSLOD=5.8893;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,37:101:99:838,0,1577
11	55587511	.	A	G	8364.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8993;MQ=59.57;MQ0=0;QD=33.46;VQSLOD=8.8655;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8338,650,0
11	55587914	.	A	G	2111.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=164;Dels=0.00;FS=2.848;HRun=0;HaplotypeScore=4.7271;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.214;VQSLOD=5.0290;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,81:164:99:2142,0,2087
11	55606693	.	G	A	1583.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;DP=129;Dels=0.00;FS=9.872;HRun=0;HaplotypeScore=4.6605;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.046;VQSLOD=4.5752;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,59:129:99:1614,0,1815
11	55681494	.	G	A	3057.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8055;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.026;VQSLOD=7.3492;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,103:104:99:3090,219,0
11	55703011	.	G	A	180.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.542;VQSLOD=5.4724;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:211,0,554
11	55761221	.	C	T	4169.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=32.57;VQSLOD=9.0049;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4169,331,0
11	55872876	.	C	T	7158.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9762;MQ=50.83;MQ0=4;QD=31.82;VQSLOD=4.2381;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:7158,593,0
11	55873024	.	A	G	8321.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6807;MQ=58.46;MQ0=0;QD=33.28;VQSLOD=9.1027;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8321,641,0
11	55873368	.	G	A	4810.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.0181;MQ=57.55;MQ0=0;QD=29.70;VQSLOD=4.3770;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:162:99:4810,373,0
11	55890257	.	C	T	5529.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=179;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=43.01;MQ0=5;MQRankSum=-0.199;QD=30.89;ReadPosRankSum=-1.234;VQSLOD=4.0352;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,178:179:99:5488,456,0
11	56000403	.	C	G	1845.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=9.3626;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1878,144,0
11	56058535	.	C	T	1490.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.499;DP=127;Dels=0.00;FS=8.333;HRun=0;HaplotypeScore=3.8201;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.553;VQSLOD=4.4230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,61:127:99:1520,0,1701
11	56086147	.	T	G	1820.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.749;DP=138;Dels=0.00;FS=1.356;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.006;VQSLOD=6.4125;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,72:138:99:1850,0,1841
11	56113516	.	T	C	1051.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.086;DP=71;Dels=0.00;FS=2.544;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.030;VQSLOD=5.6962;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,40:71:99:1081,0,788
11	56113575	.	A	G	1003.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;DP=88;Dels=0.00;FS=4.488;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.915;VQSLOD=5.8428;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,42:88:99:1033,0,1162
11	56113593	.	C	A	1185.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=98;Dels=0.00;FS=10.238;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.144;VQSLOD=4.4326;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,49:98:99:1215,0,1359
11	56128081	.	A	G	2035.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.332;DP=181;Dels=0.00;FS=1.180;HRun=0;HaplotypeScore=8.5792;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.245;VQSLOD=4.5095;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,78:181:99:2066,0,2777
11	56143977	.	A	G	1652.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.320;DP=157;Dels=0.00;FS=2.323;HRun=1;HaplotypeScore=5.5798;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.439;VQSLOD=4.8080;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,67:157:99:1683,0,2545
11	56184888	.	G	A	1821.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=129;Dels=0.00;FS=3.231;HRun=2;HaplotypeScore=1.8305;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.097;VQSLOD=4.9136;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,68:129:99:1851,0,1613
11	56185159	.	A	G	1666.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.490;DP=113;Dels=0.00;FS=1.558;HRun=4;HaplotypeScore=1.4972;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.711;VQSLOD=5.8581;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,58:113:99:1697,0,1630
11	56185327	.	T	C	2181.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.954;DP=142;Dels=0.00;FS=7.760;HRun=1;HaplotypeScore=2.7407;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.809;VQSLOD=3.6242;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,79:142:99:2211,0,1612
11	56185345	.	A	G	4254.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;QD=31.29;VQSLOD=9.4484;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4254,343,0
11	56185689	.	A	G	1010.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.830;DP=111;Dels=0.00;FS=0.758;HRun=0;HaplotypeScore=1.8907;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.517;VQSLOD=6.1943;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,42:111:99:1041,0,1784
11	56237722	.	T	A	1002.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.365;DP=76;Dels=0.00;FS=1.841;HRun=2;HaplotypeScore=2.5728;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.863;VQSLOD=6.0315;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,39:76:99:1032,0,970
11	56310222	.	C	T	2078.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5326;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=35.22;ReadPosRankSum=-0.851;VQSLOD=7.8371;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,58:59:99:2111,151,0
11	56344260	.	A	G	4006.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.216;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4432;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.130;VQSLOD=5.0704;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,128:222:99:3485,0,2323
11	56344993	.	C	A	4911.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.9399;MQ=45.94;MQ0=8;QD=29.77;VQSLOD=2.7089;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:165:99:4911,403,0
11	56380546	.	CCAGA	C	1622.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.769;DP=83;FS=0.860;HRun=0;HaplotypeScore=372.0741;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.271;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,42:83:99:1661,0,3338
11	56409010	.	A	T	737.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.690;DP=79;Dels=0.00;FS=0.885;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.296;VQSLOD=4.7418;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,31:79:99:768,0,1319
11	56431216	.	C	T	8010.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4658;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=9.3921;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8009,620,0
11	56510623	.	A	G	1256.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=117;Dels=0.00;FS=3.641;HRun=0;HaplotypeScore=2.6616;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.577;VQSLOD=5.1683;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,49:117:99:1286,0,1786
11	56510672	.	T	C	2320.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.84;VQSLOD=9.6450;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2354,187,0
11	56756399	.	G	T	1456.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.229;DP=161;Dels=0.00;FS=4.077;HRun=0;HaplotypeScore=2.8658;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.315;VQSLOD=4.8272;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,64:161:99:1487,0,2539
11	56756664	.	G	A	2867.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=14.4722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2901,229,0
11	57137424	.	C	T	1051.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.492;DP=90;Dels=0.00;FS=0.810;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.957;VQSLOD=6.4801;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,42:90:99:1082,0,1199
11	57148175	.	A	G	901.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;VQSLOD=13.8522;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:69.22:935,69,0
11	57155001	.	G	A	2376.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=9.1752;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2410,184,0
11	57799108	.	AC	A	3498.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.653;DP=188;FS=1.843;HRun=1;HaplotypeScore=487.7480;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.938;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,99:188:99:3499,0,3522
11	57799371	.	G	C	3040.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;QD=34.16;VQSLOD=8.5337;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:3073,238,0
11	57947163	.	G	A	2981.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.202;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=1.674;HRun=0;HaplotypeScore=2.8810;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.607;VQSLOD=6.1052;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,110:225:99:3011,0,3115
11	57958497	.	T	C	1240.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.364;DP=86;Dels=0.00;FS=1.891;HRun=1;HaplotypeScore=5.7268;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.475;VQSLOD=4.2607;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,46:86:99:1270,0,1218
11	57982229	.	A	G	3509.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9916;MQ=58.93;MQ0=0;QD=31.91;VQSLOD=9.4945;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:110:99:3480,262,0
11	57982584	.	T	C	2735.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.668;DP=213;Dels=0.00;FS=4.858;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.97;MQ0=5;MQRankSum=-2.052;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.245;VQSLOD=2.4249;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,113:213:99:2766,0,2885
11	57995777	.	G	A	2697.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7490;MQ=59.28;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=8.9306;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2731,232,0
11	57996312	.	C	G	8041.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.9889;MQ=58.80;MQ0=0;QD=32.29;VQSLOD=7.8745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8040,626,0
11	58125620	.	T	C	5225.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=9.0588;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5225,400,0
11	58126305	.	A	T	2372.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3581;MQ=58.08;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=7.6680;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:76:99:2406,199,0
11	58190136	.	A	G	1637.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.66;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=9.6846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1670,147,0
11	58206714	.	C	T	537.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;DP=61;Dels=0.00;FS=1.006;HRun=0;HaplotypeScore=2.6639;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.943;VQSLOD=5.3545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,24:61:99:568,0,935
11	58207204	.	A	G	4279.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9806;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.264;VQSLOD=7.6646;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,147:148:99:4254,325,0
11	58478084	.	T	C	2663.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.425;DP=217;Dels=0.00;FS=2.322;HRun=0;HaplotypeScore=2.8466;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.892;VQSLOD=5.6302;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,100:217:99:2693,0,3063
11	58491921	.	A	T	1683.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.228;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.9646;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.306;VQSLOD=5.4449;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,66:131:99:1714,0,1504
11	58602309	.	C	T	841.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.16;VQSLOD=7.4625;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:69.21:875,69,0
11	58978940	.	C	T	4811.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5157;MQ=59.37;MQ0=0;QD=29.16;VQSLOD=7.5920;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:165:99:4811,394,0
11	59189912	.	G	A	1384.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;DP=111;Dels=0.00;FS=0.732;HRun=0;HaplotypeScore=1.7853;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.180;VQSLOD=6.7208;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,54:111:99:1415,0,1580
11	59190120	.	A	G	1209.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.310;DP=83;Dels=0.00;FS=7.279;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.169;VQSLOD=5.1051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,40:83:99:1239,0,1186
11	59224608	.	A	G	1085.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.211;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9947;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.678;VQSLOD=5.5727;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,38:93:99:1115,0,1529
11	59224720	.	A	G	6848.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6031;MQ=58.83;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=8.3872;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:218:99:6848,521,0
11	59224885	.	G	C	5664.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1950;MQ=59.11;MQ0=0;QD=33.92;VQSLOD=7.8228;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5664,448,0
11	59225221	.	T	C	4932.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8097;MQ=59.73;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=8.0779;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:4931,394,0
11	59271637	.	T	C	3873.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=0.499;HRun=0;HaplotypeScore=8.3068;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.249;VQSLOD=3.3122;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,115:222:99:3292,0,2778
11	59480951	.	T	C	1765.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4809;MQ=58.65;MQ0=0;QD=32.10;VQSLOD=9.4027;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1799,153,0
11	59480969	.	A	G	853.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.859;DP=59;Dels=0.00;FS=0.997;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.099;VQSLOD=6.1216;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,29:59:99:883,0,791
11	59481119	.	G	T	782.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=55;Dels=0.00;FS=9.749;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.766;VQSLOD=3.9492;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:813,0,799
11	59612859	.	T	C	2139.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.023;DP=153;Dels=0.00;FS=6.290;HRun=1;HaplotypeScore=2.3984;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.073;VQSLOD=5.1117;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,87:153:99:2169,0,1676
11	59940599	.	T	A	2173.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=7.219;HRun=0;HaplotypeScore=10.5304;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.042;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.073;VQSLOD=3.0469;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,80:183:99:2203,0,2755
11	60102384	.	A	G	2412.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.644;DP=176;Dels=0.00;FS=10.332;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.721;VQSLOD=4.5487;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,101:176:99:2442,0,1919
11	60102396	.	A	G	2215.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.740;DP=181;Dels=0.00;FS=13.096;HRun=1;HaplotypeScore=3.4612;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.291;VQSLOD=3.4276;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,95:181:99:2246,0,2202
11	60102507	.	G	T	831.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.781;DP=78;Dels=0.00;FS=5.312;HRun=2;HaplotypeScore=5.3133;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=4.7322;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,36:78:99:861,0,1242
11	60183132	.	G	C	549.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.450;DP=51;Dels=0.00;FS=3.896;HRun=0;HaplotypeScore=4.9112;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.718;VQSLOD=2.7443;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,21:51:99:580,0,758
11	60197299	.	G	A	506.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;DP=42;Dels=0.00;FS=2.888;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.264;VQSLOD=6.7572;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:42:99:537,0,612
11	60285575	.	A	G	2461.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.15;MQ0=0;QD=29.31;VQSLOD=8.1274;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2495,199,0
11	60291413	.	C	T	2732.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8237;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.07;VQSLOD=8.7499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2766,208,0
11	60531346	.	T	G	1256.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=113;DS;Dels=0.00;FS=4.992;HRun=5;HaplotypeScore=1.6281;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.325;VQSLOD=5.3914;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,47:113:99:1286,0,2014
11	60610056	.	G	C	785.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.144;DP=53;Dels=0.00;FS=1.132;HRun=1;HaplotypeScore=3.7087;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.177;VQSLOD=4.7259;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,31:53:99:816,0,552
11	60620585	.	A	G	632.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;QD=30.10;VQSLOD=8.2062;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:60.14:665,60,0
11	60636698	.	G	A	1248	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;DP=98;Dels=0.00;FS=0.805;HRun=1;HaplotypeScore=4.1940;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.210;VQSLOD=3.7378;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,47:98:99:1278,0,1340
11	60637164	.	C	T	3105.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.1955;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.111;VQSLOD=7.3218;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,108:109:99:3139,224,0
11	60704213	.	C	T	289.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;DP=26;Dels=0.00;FS=4.809;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.797;VQSLOD=5.1546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:320,0,418
11	60785263	.	A	G	2501.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=184;Dels=0.00;FS=4.323;HRun=0;HaplotypeScore=6.6465;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.361;VQSLOD=4.6920;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,92:184:99:2531,0,2340
11	60886423	.	C	T	812.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=60;Dels=0.00;FS=1.007;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.030;VQSLOD=4.8342;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,33:60:99:842,0,575
11	60892606	.	A	G	2519.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8315;MQ=59.71;MQ0=0;QD=31.89;VQSLOD=8.9482;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2552,205,0
11	60893235	.	C	T	1130.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.046;DP=97;Dels=0.00;FS=1.657;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.375;VQSLOD=6.1635;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,47:97:99:1160,0,1205
11	61165741	.	G	C	1220.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.69;MQ0=0;QD=28.39;VQSLOD=7.1623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1254,102,0
11	61908440	.	T	C	1306.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.099;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3472;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.508;VQSLOD=5.2716;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,55:103:99:1337,0,1177
11	61913196	.	G	T	104.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.271;VQSLOD=11.5122;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:135,0,239
11	62010863	.	C	T	2703.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.476;DP=209;Dels=0.00;FS=1.724;HRun=0;HaplotypeScore=8.4697;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.353;VQSLOD=4.5045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,102:209:99:2733,0,2762
11	62292882	.	G	T	8016.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6443;MQ=56.63;MQ0=0;QD=34.85;VQSLOD=4.7817;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:8015,641,0
11	62381106	.	G	C	1302.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.36;MQ0=0;QD=33.41;VQSLOD=9.0835;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1336,111,0
11	62458275	.	T	C	971	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.202;DP=111;Dels=0.00;FS=0.758;HRun=1;HaplotypeScore=4.2012;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.107;VQSLOD=5.2963;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,37:111:99:1001,0,2040
11	62931484	.	T	C	3971.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=246;Dels=0.00;FS=3.601;HRun=0;HaplotypeScore=1.8318;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.553;VQSLOD=6.1935;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,135:246:99:3377,0,2784
11	62951221	.	C	G	2181.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;DP=154;DS;Dels=0.00;FS=5.459;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.418;VQSLOD=4.1036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,78:154:99:2211,0,2041
11	62984868	.	T	C	1135.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.145;DP=95;Dels=0.00;FS=3.876;HRun=1;HaplotypeScore=1.8625;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.087;VQSLOD=5.9609;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,42:95:99:1166,0,1522
11	63057925	.	G	A	1387.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.145;DP=144;Dels=0.00;FS=3.057;HRun=0;HaplotypeScore=3.9679;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.957;VQSLOD=5.5136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,61:144:99:1417,0,2175
11	63072310	.	C	T	1732.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.357;DP=187;Dels=0.00;FS=0.563;HRun=0;HaplotypeScore=4.3697;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.637;VQSLOD=5.5641;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,69:187:99:1763,0,3204
11	63258416	.	T	C	206.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=57.66;MQ0=0;QD=20.66;VQSLOD=5.3478;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:21.04:240,21,0
11	63487386	.	T	C	3375.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.26;VQSLOD=9.4498;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3375,262,0
11	63991581	.	G	A	1148.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;DP=104;Dels=0.00;FS=0.750;HRun=0;HaplotypeScore=2.5998;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.880;VQSLOD=5.4725;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,46:104:99:1178,0,1525
11	63991801	.	T	C	1539.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;DP=155;Dels=0.00;FS=0.628;HRun=0;HaplotypeScore=3.8076;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.327;VQSLOD=6.0521;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,66:155:99:1569,0,2259
11	63997329	.	A	G	2230.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=57.91;MQ0=0;QD=30.98;VQSLOD=8.4117;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2264,189,0
11	63997338	.	T	C	2365.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=57.68;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=7.2825;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2398,184,0
11	64009879	.	G	A	1270.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.067;DP=90;Dels=0.00;FS=2.843;HRun=0;HaplotypeScore=5.9836;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.206;VQSLOD=4.9313;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,48:90:99:1301,0,969
11	64085785	.	A	G	856.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.89;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=7.5508;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:69.22:890,69,0
11	64111928	.	T	C	315.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.856;DP=28;Dels=0.00;FS=7.832;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.645;VQSLOD=4.8276;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:346,0,438
11	64116843	.	A	C	743.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;VQSLOD=12.3877;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:57.18:776,57,0
11	64572018	.	T	C	4623.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4440;MQ=59.53;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=9.5064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4622,421,0
11	64597506	.	T	C	1510.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7134;MQ=58.04;MQ0=0;QD=27.46;VQSLOD=6.8334;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1543,132,0
11	64677293	.	G	C	1548.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=8.2089;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1581,132,0
11	64789194	.	T	C	722.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.36;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=9.4226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.19:755,57,0
11	64882789	.	C	T	6771.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.7827;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=29.06;ReadPosRankSum=1.329;VQSLOD=4.8219;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,231:233:99:6733,489,0
11	64981837	.	C	T	202.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.679;DP=31;Dels=0.00;FS=8.873;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.267;VQSLOD=2.6314;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,9:31:99:232,0,560
11	64981853	.	G	T	442.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.983;VQSLOD=5.5707;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:473,0,182
11	64990041	.	G	C	2068.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=8.5582;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2102,159,0
11	65144075	.	T	C	4820.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.57;MQ0=0;QD=30.13;VQSLOD=7.9313;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:4819,415,0
11	65347636	.	G	C	2168.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=31.43;VQSLOD=8.7775;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2202,175,0
11	65349849	.	A	T	1022.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.84;MQ0=0;QD=26.91;VQSLOD=7.1439;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:38:90.21:1056,90,0
11	65385606	.	A	G	367.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62;VQSLOD=13.6414;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:33.10:400,33,0
11	65403651	.	C	A	186	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;DP=14;Dels=0.00;FS=8.436;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.027;VQSLOD=4.5765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:216,0,198
11	65404018	.	G	A	200.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.096;VQSLOD=11.3388;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:230,0,195
11	65408937	.	C	T	581.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;DP=50;Dels=0.00;FS=1.133;HRun=1;HaplotypeScore=6.1208;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.445;VQSLOD=5.1833;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,23:50:99:611,0,768
11	65547333	.	G	A	791.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.087;DP=72;Dels=0.00;FS=2.279;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=6.7451;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,35:72:99:821,0,965
11	65629934	.	G	C	2240.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=29.09;VQSLOD=7.4524;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2273,177,0
11	65636053	.	T	C	3736.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6714;MQ=58.60;MQ0=0;QD=32.21;VQSLOD=8.6660;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3735,334,0
11	65649774	.	A	G	3194.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7781;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.02;VQSLOD=8.4606;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3227,262,0
11	65685225	.	T	C	1837.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.01;MQ0=0;QD=30.13;VQSLOD=8.1910;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1871,162,0
11	65713207	.	T	C	2103.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=8.4115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2137,174,0
11	65788072	.	C	T	557.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79;VQSLOD=14.3813;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:48.15:590,48,0
11	65793454	.	C	T	3282.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.75;MQ0=0;QD=35.29;VQSLOD=9.4634;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:3282,256,0
11	66083129	.	T	C	1502.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.485;DP=107;Dels=0.00;FS=2.629;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.317;VQSLOD=6.5391;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,59:107:99:1533,0,1193
11	66105194	.	G	A	163.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;DP=19;Dels=0.00;FS=2.935;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.803;VQSLOD=5.3704;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:194,0,381
11	66254085	.	G	T	1286.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.003;DP=111;Dels=0.00;FS=1.599;HRun=0;HaplotypeScore=5.8915;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.623;VQSLOD=5.1708;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,53:111:99:1316,0,1638
11	66272237	.	G	A	1333.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;DP=104;Dels=0.00;FS=3.812;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.914;VQSLOD=6.0448;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,57:104:99:1364,0,1202
11	66313203	.	T	C	314.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=13.4760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30.08:347,30,0
11	66327673	.	G	A	695.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.8779;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.18:729,57,0
11	66328055	.	A	G	816.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=71;Dels=0.00;FS=7.805;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.664;VQSLOD=4.7424;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,32:71:99:846,0,1108
11	66328095	.	T	C	4301.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.6160;MQ=59.25;MQ0=0;QD=35.26;VQSLOD=6.7766;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4301,343,0
11	66328719	.	T	C	442.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.45;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=7.7233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.11:475,39,0
11	66328741	.	A	C	228.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.956;VQSLOD=5.7754;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:258,0,258
11	66329639	.	G	A	1524.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.657;DP=87;Dels=0.00;FS=0.887;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.757;VQSLOD=4.9065;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,52:87:99:1555,0,1022
11	66329732	.	A	G	7356.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.9177;MQ=59.08;MQ0=0;QD=29.42;VQSLOD=7.4451;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7354,611,0
11	66468469	.	A	G	1055.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;DP=85;Dels=0.00;FS=5.671;HRun=0;HaplotypeScore=2.4203;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.269;VQSLOD=5.3782;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,45:85:99:1085,0,1003
11	66472274	.	T	C	1243.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=34.55;VQSLOD=9.1743;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1277,102,0
11	66837965	.	T	C	6423.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7845;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=9.0206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6422,505,0
11	67079177	.	G	A	1063.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.356;DP=82;Dels=0.00;FS=7.934;HRun=0;HaplotypeScore=2.8906;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.361;VQSLOD=4.9853;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,43:82:99:1093,0,1078
11	67120530	.	C	G	205.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.854;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.236;VQSLOD=4.9227;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:235,0,217
11	67186271	.	C	A	132.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=13;Dels=0.00;FS=3.310;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.259;VQSLOD=4.9474;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:13:99:162,0,117
11	67202156	.	C	T	310.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;DP=21;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.833;VQSLOD=5.7028;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:341,0,206
11	67257823	.	C	A	2826.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5251;MQ=59.01;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=9.9043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2859,226,0
11	67258391	.	A	G	904.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=12.8997;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:75.23:938,75,0
11	67288594	.	C	T	1664.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9800;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.140;VQSLOD=5.7544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,57:88:99:1694,0,731
11	67352689	.	A	G	833.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;DP=52;Dels=0.00;FS=2.559;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=16.03;ReadPosRankSum=-1.202;VQSLOD=5.7921;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,34:52:99:864,0,393
11	67402362	.	T	G	1107.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.065;DP=108;Dels=0.00;FS=0.734;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.545;VQSLOD=6.4172;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,47:108:99:1137,0,1720
11	67430762	.	T	C	2479.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=58.83;MQ0=0;QD=29.87;VQSLOD=9.0400;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:83:99:2512,231,0
11	67432804	.	T	C	4349.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9315;MQ=53.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.493;QD=31.07;ReadPosRankSum=1.454;VQSLOD=3.4297;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,139:140:99:4348,364,0
11	67433869	.	C	T	613.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=14.2734;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:51.16:646,51,0
11	67765163	.	A	AG	2321.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=104.5350;MQ=60.11;MQ0=0;QD=42.21;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2364,160,0
11	67786064	.	A	AC	441.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=26.1370;MQ=62.89;MQ0=0;QD=40.15;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33.11:484,33,0
11	67789293	.	G	GC	4645.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=228.8771;MQ=51.05;MQ0=1;QD=41.47;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,110:107:99:4645,316,0
11	67957518	.	A	T	7442.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4440;MQ=58.78;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=7.0028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:237:99:7442,593,0
11	68030173	.	C	A	918.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.952;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5578;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.307;VQSLOD=5.6471;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,36:73:99:948,0,1115
11	68512543	.	A	G	1276.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;DP=126;Dels=0.00;FS=8.282;HRun=0;HaplotypeScore=1.9988;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.282;VQSLOD=4.4912;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,53:126:99:1307,0,1889
11	68566802	.	G	A	887.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;DP=71;Dels=0.00;FS=0.889;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.524;VQSLOD=3.1110;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,37:71:99:917,0,871
11	68678962	.	T	C	3057.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4912;MQ=59.75;MQ0=0;QD=33.23;VQSLOD=7.9199;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3090,247,0
11	68682402	.	A	G	1631.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.000;DP=159;Dels=0.00;FS=5.924;HRun=0;HaplotypeScore=4.4075;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.695;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.755;VQSLOD=3.9087;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,67:159:99:1661,0,2716
11	68704028	.	C	T	394.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.427;DP=44;Dels=0.00;FS=2.661;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.256;VQSLOD=6.5302;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,16:44:99:424,0,740
11	68705674	.	C	A	2108.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.1658;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.187;VQSLOD=5.3543;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,86:187:99:2139,0,2311
11	68831364	.	G	A	538.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.470;DP=49;Dels=0.00;FS=4.843;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.470;VQSLOD=5.5194;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,24:49:99:568,0,644
11	68846399	.	A	T	2398.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.456;DP=181;Dels=0.00;FS=7.941;HRun=1;HaplotypeScore=5.8521;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.022;VQSLOD=2.8308;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,93:181:99:2428,0,2316
11	68851414	.	T	C	1825.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7851;MQ=57.60;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=7.8254;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1859,150,0
11	68855363	.	G	A	184.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;DP=19;Dels=0.00;FS=1.820;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.124;VQSLOD=6.4648;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:214,0,340
11	69063476	.	C	T	2584.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.297;DP=211;DS;Dels=0.00;FS=10.810;HRun=0;HaplotypeScore=7.0139;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.077;VQSLOD=3.4743;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,98:211:99:2615,0,2800
11	70118489	.	G	A	6507.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3862;MQ=58.83;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=8.2436;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:217:99:6507,515,0
11	71169547	.	G	C	5494.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2385;MQ=59.29;MQ0=0;QD=33.71;VQSLOD=7.3500;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5494,436,0
11	71184678	.	A	C	4144.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.56;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=8.7534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4144,334,0
11	71259822	.	A	G	4169.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.264;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.343;HRun=0;HaplotypeScore=6.8275;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.285;VQSLOD=3.6062;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,117:250:99:3482,0,3433
11	71548465	.	A	G	6346.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9686;MQ=52.92;MQ0=0;QD=30.66;VQSLOD=3.0316;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6346,497,0
11	71548492	.	C	T	6579.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6263;MQ=49.28;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=3.3475;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:6578,541,0
11	71548520	.	A	T	5550.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=42.19;MQ0=3;QD=29.84;VQSLOD=2.2043;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5549,457,0
11	71948536	.	C	G	836.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;DP=58;Dels=0.00;FS=1.037;HRun=4;HaplotypeScore=1.5317;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.468;VQSLOD=5.1023;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,31:58:99:867,0,772
11	72408055	.	G	C	893.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8664;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.081;VQSLOD=6.0879;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,30:58:99:924,0,872
11	72945341	.	C	T	8014.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.8066;MQ=58.65;MQ0=0;QD=32.32;VQSLOD=6.8144;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8014,623,0
11	72946140	.	G	C	2029.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7700;MQ=58.93;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=8.8282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2062,168,0
11	72946279	.	T	C	3945.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.639;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.827;HRun=1;HaplotypeScore=4.7304;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.081;VQSLOD=4.9523;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,128:250:99:3352,0,3189
11	73020846	.	G	T	1264.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.248;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5106;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.700;VQSLOD=5.0886;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,50:97:99:1295,0,1138
11	73620537	.	C	G	1909.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=131;Dels=0.00;FS=3.106;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.670;VQSLOD=5.7144;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,67:131:99:1939,0,1786
11	74053547	.	C	T	2641.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.03;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=8.5816;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2675,211,0
11	74559446	.	G	C	473.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.993;DP=58;Dels=0.00;FS=5.792;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.577;VQSLOD=4.3113;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,24:58:99:504,0,979
11	74904362	.	T	C	4601.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.0794;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=31.52;ReadPosRankSum=0.522;VQSLOD=6.4513;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,145:146:99:4601,370,0
11	75152243	.	C	T	642.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;DP=56;Dels=0.00;FS=4.568;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.261;VQSLOD=5.9448;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:56:99:673,0,666
11	76506691	.	G	A	1083.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.338;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2367;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=15.04;ReadPosRankSum=-1.108;VQSLOD=2.9239;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,40:72:99:1113,0,788
11	76507403	.	G	A	2068.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.800;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.9324;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.462;VQSLOD=5.0388;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,79:162:99:2098,0,2220
11	76637651	.	G	A	2656.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.57;VQSLOD=8.2319;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2690,205,0
11	76751166	.	G	A	370.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=47;Dels=0.00;FS=3.024;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.234;VQSLOD=5.1282;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,15:47:99:401,0,782
11	76912636	.	A	T	1800.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;DP=128;Dels=0.00;FS=3.380;HRun=0;HaplotypeScore=2.2859;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.017;VQSLOD=5.8351;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,64:128:99:1831,0,1768
11	76954788	.	T	TA	2371.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.237;DP=121;FS=1.507;HRun=1;HaplotypeScore=487.0771;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.128;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,62:121:99:2410,0,1652
11	76954812	.	T	C	1446.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.729;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5130;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.103;VQSLOD=5.1623;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,61:126:99:1477,0,1735
11	76954833	.	G	A	1480.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.896;DP=119;Dels=0.00;FS=3.447;HRun=0;HaplotypeScore=3.3906;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.420;VQSLOD=5.7879;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,59:119:99:1511,0,1612
11	77825320	.	T	C	670.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.310;DP=57;Dels=0.00;FS=9.624;HRun=0;HaplotypeScore=2.8917;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.455;VQSLOD=4.3231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,24:57:99:701,0,823
11	77921527	.	G	C	6760.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.7825;MQ=58.29;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=5.8926;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:206:99:6759,533,0
11	78279790	.	T	G	2437.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5415;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.690;VQSLOD=7.0888;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,81:82:99:2471,190,0
11	78433746	.	G	A	2560.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;DP=203;Dels=0.00;FS=2.585;HRun=0;HaplotypeScore=4.3999;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.290;VQSLOD=3.5726;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,97:203:99:2591,0,2766
11	78433753	.	T	C	2285.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.766;DP=176;Dels=0.00;FS=2.081;HRun=2;HaplotypeScore=2.4303;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.846;VQSLOD=4.6023;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,86:176:99:2315,0,2300
11	78449583	.	G	A	1019.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.510;VQSLOD=4.7779;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,40:93:99:1050,0,1359
11	82564294	.	T	G	755.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.912;DP=78;Dels=0.00;FS=5.961;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.547;VQSLOD=4.5302;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,34:78:99:786,0,1024
11	82643760	.	G	T	1152.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.245;DP=99;Dels=0.00;FS=2.646;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.242;VQSLOD=6.4447;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,47:99:99:1183,0,1479
11	82644904	.	G	A	438.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.974;DP=44;Dels=0.00;FS=3.327;HRun=0;HaplotypeScore=1.9536;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.895;VQSLOD=5.7442;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:468,0,735
11	82996986	.	A	C	327.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.471;DP=37;Dels=0.00;FS=3.093;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.770;VQSLOD=6.0356;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,15:37:99:358,0,502
11	85420401	.	G	A	2130.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=221;Dels=0.00;FS=0.504;HRun=0;HaplotypeScore=3.9100;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.388;VQSLOD=5.8872;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,91:221:99:2160,0,3331
11	85445734	.	T	C	925.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.763;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.053;VQSLOD=10.7379;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,41:92:99:956,0,1294
11	86161388	.	C	G	1032.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=81;Dels=0.00;FS=6.183;HRun=0;HaplotypeScore=6.3983;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.256;VQSLOD=4.8745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,42:81:99:1063,0,873
11	86663296	.	G	A	2827.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.781;DP=208;Dels=0.00;FS=7.907;HRun=0;HaplotypeScore=4.7404;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.193;VQSLOD=3.7443;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,108:208:99:2857,0,2779
11	86666031	.	G	A	368.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.528;VQSLOD=5.3039;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:31:99:398,0,295
11	87013438	.	G	A	3919.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.80;MQ0=0;QD=30.86;VQSLOD=9.1333;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:3919,295,0
11	88045583	.	A	G	4495.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.316;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.552;HRun=0;HaplotypeScore=7.7160;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.888;VQSLOD=3.7061;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,133:250:99:3839,0,3074
11	88911696	.	C	A	2340.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.099;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=11.594;HRun=0;HaplotypeScore=2.8598;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.507;VQSLOD=4.2091;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,92:220:99:2371,0,3624
11	89133449	.	C	T	3774.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7820;MQ=51.08;MQ0=5;QD=28.17;VQSLOD=3.7870;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:3774,304,0
11	89880604	.	G	A	1353	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.351;VQSLOD=6.2212;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,53:97:99:1383,0,1199
11	89935586	.	G	T	2622.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=56.57;MQ0=0;QD=28.50;VQSLOD=6.0980;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2655,211,0
11	92086513	.	C	T	451.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.701;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.045;VQSLOD=6.2530;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:481,0,610
11	92531356	.	A	G	3740.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.0228;MQ=59.29;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=7.4802;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3740,304,0
11	92534442	.	A	G	1470.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01;VQSLOD=13.9682;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1503,129,0
11	92590448	.	A	G	3969.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5291;MQ=59.45;MQ0=0;QD=30.07;VQSLOD=8.5347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:3968,328,0
11	92895920	.	T	C	1168.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;DP=111;Dels=0.00;FS=2.448;HRun=0;HaplotypeScore=4.5041;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.524;VQSLOD=4.9485;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,51:111:99:1198,0,1437
11	93797619	.	A	G	1703.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.73;MQ0=0;QD=28.87;VQSLOD=8.6309;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1736,138,0
11	94800902	.	G	GC	4059.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=212.5685;MQ=60.34;MQ0=0;QD=42.29;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,91:96:99:4060,274,0
11	94862577	.	G	T	3110.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.208;DP=229;Dels=0.00;FS=2.237;HRun=0;HaplotypeScore=6.5951;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.741;VQSLOD=4.7265;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,118:229:99:3141,0,2815
11	95713077	.	C	T	734.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.445;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.556;VQSLOD=6.5299;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:764,0,612
11	96116444	.	T	C	452.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=35;Dels=0.00;FS=1.320;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.035;VQSLOD=5.9999;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,19:35:99:482,0,341
11	99690286	.	T	G	1171.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.309;DP=102;Dels=0.00;FS=3.264;HRun=0;HaplotypeScore=8.5785;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.091;VQSLOD=2.9178;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,46:102:99:1202,0,1407
11	99690376	.	C	T	1956.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.493;DP=153;Dels=0.00;FS=2.142;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.743;VQSLOD=5.0981;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,82:153:99:1987,0,1650
11	100061865	.	A	G	324.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=32;Dels=0.00;FS=1.475;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.435;VQSLOD=2.9519;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:354,0,480
11	101771248	.	G	A	3565.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7803;MQ=58.23;MQ0=0;QD=29.96;VQSLOD=8.5511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3565,280,0
11	101832478	.	G	T	1415.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=14.4544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1449,111,0
11	101857758	.	G	A	2635.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9941;MQ=58.50;MQ0=0;QD=28.96;VQSLOD=7.4636;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2669,208,0
11	102477377	.	G	T	2596.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.44;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=9.6958;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2629,211,0
11	102477395	.	A	G	2667.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.83;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=9.5698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2700,205,0
11	102495998	.	T	G	4125.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6541;MQ=58.82;MQ0=0;QD=31.73;VQSLOD=8.7228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:130:99:4088,337,0
11	102567207	.	T	A	841.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.136;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.075;VQSLOD=6.4878;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,36:66:99:871,0,823
11	102575379	.	T	C	1431.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.003;DP=115;Dels=0.00;FS=0.740;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.036;VQSLOD=5.0128;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,54:115:99:1461,0,1652
11	102576358	.	T	C	3385.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.97;MQ0=0;QD=29.70;VQSLOD=9.1533;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3385,256,0
11	102576375	.	G	A	3765.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4481;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.10;VQSLOD=7.2969;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:3765,286,0
11	102576382	.	G	A	1423.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6821;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.704;VQSLOD=5.3720;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,61:137:99:1454,0,1832
11	102593248	.	T	C	895.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.006;DP=83;Dels=0.00;FS=10.681;HRun=1;HaplotypeScore=3.9831;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.835;VQSLOD=4.2032;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,35:83:99:925,0,1448
11	102595492	.	G	A	2098.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;DP=195;Dels=0.00;FS=1.846;HRun=1;HaplotypeScore=3.2768;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.018;VQSLOD=5.8455;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,83:195:99:2129,0,2900
11	102713620	.	T	C	313.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.264;VQSLOD=6.1126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:343,0,343
11	102738793	.	G	GT	1333.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=175.1878;MQ=58.55;MQ0=0;QD=41.68;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96.32:1376,96,0
11	102738795	.	G	T	951.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;QD=29.72;VQSLOD=7.9566;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:75.24:984,75,0
11	103158278	.	C	T	1136.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.945;VQSLOD=6.4916;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,43:44:93.28:1169,93,0
11	104878040	.	G	GT	562.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;DP=74;FS=1.047;HRun=10;HaplotypeScore=194.2523;MQ=59.81;MQ0=1;MQRankSum=0.383;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.543;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,27:74:99:602,0,528
11	107299631	.	G	A	1588.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=132;Dels=0.00;FS=3.115;HRun=0;HaplotypeScore=4.9087;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=2.881;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.460;VQSLOD=3.8179;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,67:132:99:1618,0,1792
11	108032707	.	G	T	1182.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.915;DP=103;Dels=0.00;FS=4.491;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.969;VQSLOD=4.4184;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,48:103:99:1213,0,1472
11	108043988	.	C	T	1878.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.775;DP=140;Dels=0.00;FS=7.097;HRun=2;HaplotypeScore=1.9954;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=5.2717;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,68:140:99:1909,0,1973
11	108175544	.	C	CG	183.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.548;DP=76;FS=98.848;HRun=1;HaplotypeScore=418.9612;MQ=60.52;MQ0=0;MQRankSum=3.225;QD=2.42;ReadPosRankSum=-4.933;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,31:76:99:223,0,1153
11	108183167	.	A	G	4323.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.89;VQSLOD=8.0955;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4323,319,0
11	108380335	.	T	C	6728.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7229;MQ=59.18;MQ0=0;QD=29.51;VQSLOD=8.9200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,228:228:99:6728,503,0
11	108381247	.	C	T	3083.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.707;DP=223;Dels=0.00;FS=4.726;HRun=0;HaplotypeScore=6.5618;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.348;VQSLOD=4.7518;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,111:223:99:3113,0,2964
11	108384207	.	C	T	1251.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.177;DP=88;Dels=0.00;FS=0.796;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.942;VQSLOD=6.0017;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,50:88:99:1281,0,1018
11	108409784	.	T	A	2509.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=206;Dels=0.00;FS=4.828;HRun=0;HaplotypeScore=6.9394;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.809;VQSLOD=4.3236;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,103:206:99:2540,0,2557
11	108464209	.	T	C	4460.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.34;VQSLOD=9.1100;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4460,361,0
11	111637064	.	C	G	634.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.857;VQSLOD=4.2263;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,28:61:99:664,0,793
11	111707001	.	T	C	1102.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;DP=95;Dels=0.00;FS=4.004;HRun=0;HaplotypeScore=2.7348;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.361;VQSLOD=3.7031;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,46:95:99:1133,0,1250
11	111749349	.	A	T	388.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.939;DP=38;Dels=0.00;FS=1.290;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.646;VQSLOD=6.2055;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:418,0,522
11	111853106	.	G	GC	2175.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=112.7211;MQ=60.03;MQ0=0;QD=41.05;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,51:53:99:2218,157,0
11	112065434	.	T	C	4076.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.72;MQ0=0;QD=27.73;VQSLOD=8.3481;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4076,316,0
11	112088499	.	A	C	2233.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=8.7195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2267,172,0
11	113194168	.	A	C	851.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.431;DP=86;Dels=0.00;FS=10.030;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.384;VQSLOD=4.5915;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,34:86:99:882,0,1334
11	113222885	.	A	T	1710.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.206;DP=165;Dels=0.00;FS=5.792;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.165;VQSLOD=4.4075;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,70:165:99:1740,0,2384
11	113268059	.	G	A	398.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.716;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.226;VQSLOD=5.8708;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,16:36:99:428,0,605
11	113270015	.	G	C	312.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.027;VQSLOD=11.4043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:343,0,307
11	113270160	.	A	G	212.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.203;VQSLOD=6.4574;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:242,0,191
11	113561054	.	A	G	272.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.383;DP=37;Dels=0.00;FS=3.954;HRun=0;HaplotypeScore=3.1999;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.560;VQSLOD=4.8331;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,13:37:99:302,0,685
11	113803028	.	A	C	4287.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.364;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=5.8024;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.992;VQSLOD=4.7162;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,140:250:99:3703,0,2599
11	114393652	.	C	T	2027.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.25;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=9.2667;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2060,160,0
11	114441943	.	G	A	4954.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.44;MQ0=0;QD=30.03;VQSLOD=8.9924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:165:99:4954,409,0
11	114442103	.	A	G	8895.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1153;MQ=59.20;MQ0=0;QD=35.87;VQSLOD=7.2259;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8895,698,0
11	116633947	.	G	A	1668.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.665;DP=189;DS;Dels=0.00;FS=3.037;HRun=4;HaplotypeScore=4.9455;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.423;VQSLOD=4.8142;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,66:189:99:1699,0,3419
11	116692334	.	C	T	2917.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.16;VQSLOD=13.7897;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2951,241,0
11	117160347	.	A	G	4593.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7234;MQ=59.56;MQ0=0;QD=29.45;VQSLOD=6.7613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4592,403,0
11	117267884	.	A	G	1310.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.340;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8309;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.377;VQSLOD=6.2297;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,55:130:99:1340,0,1987
11	117869670	.	A	G	1057.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;DP=85;Dels=0.00;FS=4.763;HRun=3;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.693;VQSLOD=5.4196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,41:85:99:1087,0,1205
11	117869878	.	C	T	748.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=46;Dels=0.00;FS=2.695;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.860;VQSLOD=5.8231;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,25:46:99:778,0,530
11	117982495	.	T	G	1577.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.558;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.4512;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.002;VQSLOD=5.2861;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,56:99:99:1608,0,1144
11	118074337	.	A	G	2500.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.274;DP=158;DS;Dels=0.00;FS=0.673;HRun=0;HaplotypeScore=3.5282;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=5.3190;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,89:158:99:2531,0,1857
11	118081345	.	A	T	4283.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;DP=237;Dels=0.00;FS=3.788;HRun=1;HaplotypeScore=3.4020;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.006;VQSLOD=4.9219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,140:237:99:3696,0,2385
11	118221350	.	G	T	2298.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;DP=181;Dels=0.00;FS=0.548;HRun=2;HaplotypeScore=2.8224;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.939;VQSLOD=5.8382;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,82:181:99:2329,0,2890
11	118529017	.	T	G	462.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=33.04;VQSLOD=8.5927;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.12:496,39,0
11	118529044	.	C	CG	821.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=163.5739;MQ=58.78;MQ0=0;QD=43.23;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:54.18:863,54,0
11	118529069	.	G	C	643.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.24;VQSLOD=7.8989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:54.16:676,54,0
11	118529078	.	G	C	686.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;QD=32.71;VQSLOD=8.1375;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:57.18:720,57,0
11	118529127	.	G	A	245.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.147;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.025;VQSLOD=5.9932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:275,0,391
11	118534082	.	C	T	140.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.670;VQSLOD=6.1804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:170,0,104
11	118939939	.	T	TC	9629.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;DS;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=492.0123;MQ=60.63;MQ0=0;QD=40.63;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,227:237:99:9630,677,0
11	118947634	.	C	T	636.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.743;DP=59;Dels=0.00;FS=2.286;HRun=0;HaplotypeScore=1.9889;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.915;VQSLOD=6.5595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,26:59:99:666,0,907
11	118967758	.	T	C	1044.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;DP=115;Dels=0.00;FS=3.836;HRun=0;HaplotypeScore=3.9199;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.943;VQSLOD=4.6711;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,41:115:99:1075,0,2014
11	119005132	.	C	T	935.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=66;Dels=0.00;FS=1.185;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=14.18;ReadPosRankSum=-2.523;VQSLOD=4.1743;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,38:66:99:966,0,861
11	119043656	.	C	T	1597.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.694;DP=123;Dels=0.00;FS=4.427;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.188;VQSLOD=4.8695;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,65:123:99:1628,0,1539
11	119052826	.	C	A	2751.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=2.498;HRun=0;HaplotypeScore=4.2995;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.540;VQSLOD=5.1133;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,99:231:99:2782,0,3542
11	119059404	.	G	A	1700.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=130;Dels=0.00;FS=1.484;HRun=0;HaplotypeScore=2.6203;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.626;VQSLOD=6.2888;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,69:130:99:1730,0,1372
11	119063908	.	C	T	1755.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.625;DP=138;Dels=0.00;FS=6.345;HRun=0;HaplotypeScore=3.8247;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.632;VQSLOD=5.1237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,70:138:99:1785,0,1743
11	119216504	.	C	T	2022.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.525;DP=170;Dels=0.00;FS=2.746;HRun=0;HaplotypeScore=3.8587;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.483;VQSLOD=5.3257;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,78:170:99:2053,0,2229
11	119510644	.	A	C	1263.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=29.38;VQSLOD=8.5658;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1296,99,0
11	120099658	.	A	G	1427.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8533;MQ=59.54;MQ0=0;QD=28.55;VQSLOD=7.6632;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1460,123,0
11	120099679	.	G	A	1893.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.84;MQ0=0;QD=30.06;VQSLOD=8.6792;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1927,159,0
11	120175749	.	A	G	1753.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;DP=146;Dels=0.00;FS=4.435;HRun=0;HaplotypeScore=4.3050;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.451;VQSLOD=5.2587;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,80:146:99:1783,0,1704
11	120989335	.	A	G	5781.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3893;MQ=59.00;MQ0=0;QD=31.77;VQSLOD=9.6880;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5781,466,0
11	121000774	.	T	C	3878.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3639;MQ=58.62;MQ0=0;QD=32.59;VQSLOD=9.2750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3878,301,0
11	121032978	.	G	A	2979.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3913;MQ=59.12;MQ0=0;QD=31.36;VQSLOD=8.8560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3012,247,0
11	121437819	.	C	G	3406.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.83;VQSLOD=9.5126;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3406,265,0
11	121491782	.	G	A	1920.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10;VQSLOD=13.5113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:1953,147,0
11	122646967	.	G	A	1229.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.019;DP=108;Dels=0.00;FS=4.846;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.191;VQSLOD=6.0868;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,57:108:99:1259,0,1312
11	123600475	.	A	G	871.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.895;VQSLOD=5.8168;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,41:107:99:901,0,1634
11	123624658	.	G	T	1749.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.914;DP=154;Dels=0.00;FS=9.966;HRun=1;HaplotypeScore=4.5407;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.516;VQSLOD=3.8346;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,66:154:99:1780,0,2432
11	123753937	.	A	G	4112.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2604;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.88;VQSLOD=8.4564;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4112,340,0
11	123753958	.	C	T	1447.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.485;DP=112;Dels=0.00;FS=4.894;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.515;VQSLOD=5.5540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,53:112:99:1477,0,1569
11	123754844	.	T	C	3654.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9961;MQ=57.14;MQ0=0;QD=29.24;VQSLOD=5.4953;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:125:99:3609,271,0
11	123777302	.	T	G	2745.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.834;DP=225;Dels=0.00;FS=3.902;HRun=0;HaplotypeScore=2.8202;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.598;VQSLOD=5.8089;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,108:225:99:2775,0,3213
11	123777412	.	A	G	3210.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.467;HRun=0;HaplotypeScore=2.6141;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.257;VQSLOD=6.7129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3241,0,3426
11	123777497	.	G	A	7462.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5205;MQ=59.49;MQ0=0;QD=32.59;VQSLOD=6.9953;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,228:229:99:7462,635,0
11	123777502	.	C	T	3226.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.728;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=1.712;HRun=1;HaplotypeScore=8.6236;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.370;VQSLOD=3.8020;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,110:224:99:3256,0,3002
11	123777536	.	G	A	3029.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;DP=204;Dels=0.00;FS=7.983;HRun=1;HaplotypeScore=3.4443;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.672;VQSLOD=4.6181;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,102:204:99:3059,0,2998
11	123777986	.	T	C	3489.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8284;MQ=58.39;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=8.2365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3489,262,0
11	123778031	.	G	A	692.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;DP=66;Dels=0.00;FS=1.064;HRun=3;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.587;VQSLOD=6.2322;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,27:66:99:722,0,1086
11	123810492	.	A	C	1911.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.393;DP=143;Dels=0.00;FS=3.075;HRun=1;HaplotypeScore=9.4297;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.539;VQSLOD=4.0903;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,70:143:99:1941,0,1962
11	123848121	.	T	C	1024.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;DP=78;Dels=0.00;FS=0.858;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.785;VQSLOD=6.4130;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,38:78:99:1054,0,1076
11	123848212	.	C	T	1306.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;DP=67;Dels=0.00;FS=3.533;HRun=0;HaplotypeScore=9.4562;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.926;VQSLOD=2.6224;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,42:67:99:1336,0,646
11	124095414	.	C	G	653.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.276;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.243;VQSLOD=6.0328;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,22:36:99:684,0,377
11	124095525	.	T	C	3103.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.274;HRun=2;HaplotypeScore=5.3175;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.627;VQSLOD=4.0786;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3133,0,3915
11	124095647	.	A	C	4546.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.3373;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.147;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.057;VQSLOD=2.4236;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,130:250:99:3859,0,3267
11	124120821	.	T	C	2433.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;DP=188;DS;Dels=0.00;FS=1.221;HRun=0;HaplotypeScore=1.9150;MQ=53.18;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.223;VQSLOD=2.2982;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,93:188:99:2464,0,2536
11	124121199	.	G	C	1691.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.574;DP=135;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4788;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.834;VQSLOD=4.5206;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,65:135:99:1721,0,1876
11	124135438	.	G	A	2711.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;DP=199;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5830;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.671;VQSLOD=6.5166;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,99:199:99:2741,0,2968
11	124180082	.	A	G	1294.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.047;DP=78;Dels=0.00;FS=12.123;HRun=2;HaplotypeScore=1.9248;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.630;VQSLOD=4.1104;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,50:78:99:1325,0,708
11	124180282	.	A	C	690.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.404;DP=61;Dels=0.00;FS=9.224;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.066;VQSLOD=4.3757;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,25:61:99:721,0,975
11	124789755	.	T	C	1788.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;DP=132;Dels=0.00;FS=0.658;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.416;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.822;VQSLOD=5.1960;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,69:132:99:1818,0,1619
11	124793682	.	T	C	1165.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.150;DP=118;Dels=0.00;FS=2.392;HRun=0;HaplotypeScore=3.4308;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.652;VQSLOD=6.0565;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,51:118:99:1196,0,1782
11	125351472	.	A	T	2748.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.097;DP=227;Dels=0.00;FS=0.487;HRun=1;HaplotypeScore=8.1621;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.319;VQSLOD=3.4346;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,109:227:99:2778,0,2728
11	125452300	.	A	AC	1207.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=160.7434;MQ=58.02;MQ0=0;QD=38.95;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,30:31:90.30:1249,90,0
11	125452313	.	A	G	840.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.34;MQ0=0;QD=26.26;VQSLOD=6.7514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:66.20:873,66,0
11	125525195	.	A	G	1895.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6320;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.48;VQSLOD=7.5981;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1929,150,0
11	125547869	.	C	T	4539.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=4.427;HRun=0;HaplotypeScore=5.2661;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.429;VQSLOD=3.6110;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,131:245:99:3876,0,2937
11	125617610	.	A	G	2161.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.876;DP=178;Dels=0.00;FS=3.438;HRun=1;HaplotypeScore=4.1575;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.281;VQSLOD=5.3707;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,86:178:99:2192,0,2418
11	125766044	.	C	A	4056.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.546;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.466;HRun=0;HaplotypeScore=7.4786;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.395;VQSLOD=4.3410;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,137:248:99:3490,0,2752
11	125766173	.	A	C	1185.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.622;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=6.6661;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,41:96:99:1215,0,1533
11	125830970	.	A	T	1379.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.507;DP=106;Dels=0.00;FS=4.003;HRun=1;HaplotypeScore=2.4602;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.840;VQSLOD=5.7323;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,53:106:99:1409,0,1417
11	125871715	.	G	A	699.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.052;DP=81;Dels=0.00;FS=1.935;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.014;VQSLOD=6.0425;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,32:81:99:729,0,1399
11	125891269	.	C	T	1222.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.948;DP=109;Dels=0.00;FS=1.572;HRun=0;HaplotypeScore=3.4571;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.020;VQSLOD=5.6370;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,49:109:99:1252,0,1617
11	128782012	.	C	G	6944.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3351;MQ=58.87;MQ0=0;QD=30.87;VQSLOD=6.7722;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:6943,590,0
11	129794950	.	T	C	7962.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.068;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4075;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.106;VQSLOD=6.9884;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,244:246:99:7929,626,0
11	130281488	.	G	A	2325.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=9.2141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2359,199,0
11	130750642	.	A	C	4501.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.3063;MQ=57.79;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=6.7558;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4500,367,0
11	130780225	.	C	A	1992.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.57;MQ0=0;QD=31.13;VQSLOD=8.1081;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2025,159,0
11	130784754	.	C	G	2284.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=34.09;VQSLOD=9.4982;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2317,181,0
11	133714522	.	G	A	1393.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=128;Dels=0.00;FS=2.355;HRun=2;HaplotypeScore=1.9985;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.002;VQSLOD=6.5960;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,58:128:99:1423,0,1870
11	134128923	.	C	G	1496.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.794;DP=126;Dels=0.00;FS=13.121;HRun=0;HaplotypeScore=5.1605;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.069;VQSLOD=3.1296;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,57:126:99:1526,0,1815
11	134151975	.	G	C	644.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=43.43;MQ0=4;QD=23.01;VQSLOD=3.6399;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:51.16:677,51,0
11	134182375	.	G	A	2191.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.65;MQ0=0;QD=33.21;VQSLOD=9.5825;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2225,181,0
12	427575	.	A	G	1881.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.120;DP=160;Dels=0.00;FS=3.839;HRun=0;HaplotypeScore=4.9044;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.511;VQSLOD=5.0128;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,75:160:99:1911,0,2149
12	657404	.	G	A	1525.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.291;DP=144;Dels=0.00;FS=1.346;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.105;VQSLOD=6.7237;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,64:144:99:1556,0,2003
12	661656	.	A	G	1613.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.249;DP=127;Dels=0.00;FS=2.271;HRun=1;HaplotypeScore=3.2145;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=0.385;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.083;VQSLOD=5.8511;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,63:127:99:1644,0,1741
12	990912	.	A	C	1916.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.344;DP=201;Dels=0.00;FS=1.800;HRun=3;HaplotypeScore=3.6372;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.139;VQSLOD=4.6315;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,83:201:99:1946,0,2913
12	994487	.	G	C	8868.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5264;MQ=59.82;MQ0=0;QD=35.48;VQSLOD=8.9492;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8868,719,0
12	998365	.	G	T	1926.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.946;DP=182;Dels=0.00;FS=2.638;HRun=1;HaplotypeScore=2.2243;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=6.2375;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,87:182:99:1956,0,2491
12	1137217	.	A	G	1335.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;DP=107;Dels=0.00;FS=11.051;HRun=1;HaplotypeScore=3.7152;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.328;VQSLOD=4.3809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,50:107:99:1365,0,1739
12	1910786	.	C	T	306.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4535;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.276;VQSLOD=4.5386;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:337,0,393
12	1995403	.	T	C	1124.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;DP=96;Dels=0.00;FS=2.720;HRun=0;HaplotypeScore=1.9552;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.469;VQSLOD=6.2366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,47:96:99:1155,0,1336
12	2791130	.	C	T	4506.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5756;MQ=58.70;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=9.1743;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4506,343,0
12	2791132	.	A	G	4409.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4078;MQ=58.85;MQ0=0;QD=30.20;VQSLOD=8.3366;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4409,337,0
12	2791205	.	A	G	3719.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.39;MQ0=0;QD=31.26;VQSLOD=8.1761;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3719,292,0
12	2968090	.	G	C	832.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.488;DP=76;Dels=0.00;FS=4.491;HRun=0;HaplotypeScore=2.4675;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.363;VQSLOD=5.0830;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,32:76:99:862,0,1260
12	2968169	.	A	G	923.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.433;DP=84;Dels=0.00;FS=2.929;HRun=3;HaplotypeScore=3.6518;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.746;VQSLOD=5.9456;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,36:84:99:953,0,1328
12	3782647	.	A	T	1567.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.806;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9132;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.973;VQSLOD=4.8451;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,59:130:99:1597,0,1934
12	3788145	.	C	T	6198.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.893;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7649;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=31.95;ReadPosRankSum=1.019;VQSLOD=8.3059;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,192:194:99:6130,423,0
12	3788222	.	G	A	3935.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0445;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=30.28;ReadPosRankSum=-0.693;VQSLOD=7.8811;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,129:130:99:3897,287,0
12	3789452	.	C	T	3661.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9782;MQ=58.86;MQ0=0;QD=29.77;VQSLOD=9.0417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:123:99:3638,292,0
12	3806147	.	T	C	761.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.68;MQ0=1;QD=33.11;VQSLOD=9.2455;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:63.19:795,63,0
12	4554630	.	A	G	4107.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.065;DP=134;Dels=0.00;FS=4.048;HRun=0;HaplotypeScore=3.5755;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=30.65;ReadPosRankSum=-1.081;VQSLOD=4.1688;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,133:134:99:4072,306,0
12	4702211	.	A	T	1513.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.906;DP=149;Dels=0.00;FS=6.279;HRun=0;HaplotypeScore=3.5868;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.850;VQSLOD=4.0737;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,66:149:99:1544,0,2075
12	4736495	.	C	T	1801.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.60;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=9.5006;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:58:99:1835,144,0
12	4736677	.	G	C	2224.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=58.95;MQ0=0;QD=33.71;VQSLOD=9.5234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2258,181,0
12	4737404	.	C	T	1674.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;DP=157;Dels=0.00;FS=8.798;HRun=1;HaplotypeScore=3.9114;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.982;VQSLOD=3.2011;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,67:157:99:1704,0,2472
12	4737715	.	C	T	4209.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8364;MQ=59.52;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=8.1917;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4210,337,0
12	4830000	.	T	G	1382.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.738;DP=117;Dels=0.00;FS=3.453;HRun=0;HaplotypeScore=10.8157;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.323;VQSLOD=3.2828;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,61:117:99:1413,0,1456
12	4853806	.	A	G	685.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=61;Dels=0.00;FS=5.473;HRun=3;HaplotypeScore=2.4923;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.966;VQSLOD=4.9003;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,28:61:99:715,0,829
12	4873163	.	G	T	1381.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.697;DP=131;Dels=0.00;FS=5.444;HRun=2;HaplotypeScore=4.4178;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.175;VQSLOD=4.7574;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,55:131:99:1411,0,1902
12	6078424	.	A	T	650.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;DP=40;Dels=0.00;FS=1.639;HRun=0;HaplotypeScore=1.9953;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.571;VQSLOD=6.0220;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,25:40:99:681,0,356
12	6143984	.	T	C	3479.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4404;MQ=59.80;MQ0=0;QD=30.00;VQSLOD=8.4663;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3479,295,0
12	6172202	.	T	C	2001.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43;VQSLOD=13.5909;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2034,165,0
12	6457062	.	T	C	233.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.106;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.482;VQSLOD=11.6189;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:263,0,171
12	6560473	.	A	G	2656.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5929;MQ=58.90;MQ0=0;QD=29.85;VQSLOD=9.1126;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:89:99:2690,214,0
12	6562753	.	A	G	737.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;DP=63;Dels=0.00;FS=6.906;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.213;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.379;VQSLOD=4.5853;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,29:63:99:768,0,1020
12	6562810	.	A	G	513.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=61;Dels=0.00;FS=3.794;HRun=0;HaplotypeScore=4.8780;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.204;VQSLOD=3.7134;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,23:61:99:543,0,978
12	6619284	.	C	G	1033.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;DP=87;Dels=0.00;FS=0.802;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.433;VQSLOD=5.5273;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,41:87:99:1064,0,1365
12	6630988	.	A	G	802.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;DP=80;Dels=0.00;FS=6.130;HRun=1;HaplotypeScore=1.5518;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.356;VQSLOD=5.1681;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,31:80:99:833,0,1316
12	6887020	.	T	C	2107.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.614;DP=149;Dels=0.00;FS=0.619;HRun=2;HaplotypeScore=2.4983;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.126;VQSLOD=6.2075;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,77:149:99:2138,0,1767
12	6939850	.	A	G	1072.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=58.55;MQ0=0;QD=33.51;VQSLOD=9.5924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:87.26:1105,87,0
12	6941021	.	G	A	793.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40;VQSLOD=14.1376;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:63.20:827,63,0
12	6946247	.	G	T	1246.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=13.8802;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1280,105,0
12	7080210	.	A	AG	754.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=104.1168;MQ=61.13;MQ0=0;QD=39.69;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57.18:796,57,0
12	7551022	.	A	T	6475.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5765;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.74;VQSLOD=9.0210;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:6475,527,0
12	7637769	.	G	A	2532.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.276;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.357;VQSLOD=5.7206;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,90:162:99:2563,0,1889
12	7649484	.	T	C	4719.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5335;MQ=59.29;MQ0=0;QD=32.32;VQSLOD=8.9692;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4719,361,0
12	7805236	.	C	G	489.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;DP=53;Dels=0.00;FS=4.550;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.628;VQSLOD=4.8072;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,21:53:99:519,0,957
12	7842932	.	C	T	1446.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=97;Dels=0.00;FS=2.664;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.834;VQSLOD=6.0050;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,52:97:99:1476,0,1293
12	7894056	.	G	A	2281.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=195;Dels=0.00;FS=0.530;HRun=1;HaplotypeScore=2.3046;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.786;VQSLOD=6.1856;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,93:195:99:2312,0,2527
12	8278181	.	A	T	2283.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7256;MQ=58.80;MQ0=0;QD=32.62;VQSLOD=9.5264;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2316,181,0
12	8278195	.	G	A	1158.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.547;DP=82;Dels=0.00;FS=0.872;HRun=0;HaplotypeScore=4.7687;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.643;VQSLOD=4.9174;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,45:82:99:1188,0,885
12	8374770	.	G	A	1796	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=48.83;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=6.6267;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1829,159,0
12	8376110	.	T	C	1659.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;DP=67;Dels=0.00;FS=3.505;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=47.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.367;VQSLOD=2.4475;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,65:67:99:1692,102,0
12	9013755	.	C	T	2654.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.311;DP=193;Dels=0.00;FS=0.540;HRun=0;HaplotypeScore=10.0677;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.200;VQSLOD=4.2205;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,96:193:99:2684,0,2544
12	9016573	.	A	G	2299.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.64;MQ0=0;QD=35.93;VQSLOD=9.6522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2332,187,0
12	9020489	.	A	G	4868.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.64;VQSLOD=8.6792;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:170:99:4867,394,0
12	9086898	.	A	G	4714.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6548;MQ=49.79;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=3.1233;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4713,385,0
12	9248233	.	T	C	4218.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7825;MQ=55.66;MQ0=0;QD=31.02;VQSLOD=4.2150;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4218,343,0
12	9307373	.	T	G	2687.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=9.2006;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2721,214,0
12	9316773	.	T	C	2260.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.753;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.694;VQSLOD=6.6699;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,87:176:99:2290,0,2316
12	9750669	.	A	G	243.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.980;DP=19;Dels=0.00;FS=5.180;HRun=0;HaplotypeScore=1.8136;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.511;VQSLOD=5.1542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:273,0,220
12	9833524	.	C	G	613.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.152;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.350;VQSLOD=5.3256;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,23:55:99:643,0,877
12	9885707	.	A	ATAAGT	2141.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.257;DP=70;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=285.1199;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.757;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.521;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,26:70:99:2180,0,1969
12	10137557	.	A	C	827.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=28.55;ReadPosRankSum=-0.538;VQSLOD=8.0876;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,28:29:36.64:861,37,0
12	10149851	.	C	T	1580.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3134;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=30.40;ReadPosRankSum=1.266;VQSLOD=8.0539;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,51:52:99:1614,132,0
12	10150961	.	G	A	2375.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;DP=192;DS;Dels=0.00;FS=5.722;HRun=1;HaplotypeScore=3.7026;MQ=57.16;MQ0=2;MQRankSum=1.644;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.245;VQSLOD=4.1039;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,95:192:99:2405,0,2667
12	10150974	.	A	G	2093.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=167;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8962;MQ=57.37;MQ0=1;MQRankSum=0.037;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.722;VQSLOD=4.3984;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,83:167:99:2124,0,2232
12	10151642	.	T	C	6285.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9792;MQ=59.03;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=7.1575;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:6285,485,0
12	10167277	.	G	C	1108.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;DP=91;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.465;VQSLOD=6.6834;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,43:91:99:1138,0,1321
12	10251445	.	C	G	944.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=29.52;VQSLOD=8.1924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:75.23:978,75,0
12	10462052	.	T	G	2434.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=9.4544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2468,184,0
12	10532326	.	T	C	1125.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=102;Dels=0.00;FS=0.742;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.947;VQSLOD=6.6643;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,50:102:99:1156,0,1268
12	10560957	.	T	C	495.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.033;DP=55;Dels=0.00;FS=1.105;HRun=0;HaplotypeScore=1.9931;MQ=56.81;MQ0=1;MQRankSum=-1.734;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.273;VQSLOD=2.6995;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,22:55:99:526,0,852
12	10562089	.	A	C	2741.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=183;Dels=0.00;FS=6.409;HRun=0;HaplotypeScore=4.0987;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.228;VQSLOD=4.3025;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,103:183:99:2771,0,1964
12	10570965	.	C	G	6038.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=52.06;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=3.4610;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:6038,451,0
12	10587111	.	A	G	3452.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=48.07;MQ0=2;QD=27.62;VQSLOD=3.2646;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3452,262,0
12	10603670	.	T	C	2804.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=9.7553;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2837,226,0
12	10958658	.	T	C	1297.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=30.17;VQSLOD=8.6842;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1330,102,0
12	10962115	.	A	G	1400.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.051;DP=128;Dels=0.00;FS=3.324;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.189;VQSLOD=5.9844;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:128:99:1431,0,1738
12	10978402	.	G	A	1209.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.64;MQ0=0;QD=31.00;VQSLOD=8.6880;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1242,99,0
12	10999708	.	T	C	6836.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.760;VQSLOD=9.6361;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,220:221:99:6836,545,0
12	10999780	.	C	T	4252.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.004;DP=250;Dels=0.00;FS=5.117;HRun=1;HaplotypeScore=8.9582;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.210;VQSLOD=3.9221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,129:250:99:3590,0,3149
12	11061122	.	T	C	676.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.352;DP=45;Dels=0.00;FS=7.817;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.715;VQSLOD=4.7514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,23:45:99:706,0,646
12	11138852	.	C	T	1832.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.164;DP=161;Dels=0.00;FS=2.003;HRun=0;HaplotypeScore=2.5637;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.390;VQSLOD=5.5334;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,70:161:99:1863,0,2533
12	11149711	.	C	A	1459.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.249;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7915;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.799;VQSLOD=6.1409;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,53:108:99:1490,0,1497
12	11149720	.	A	G	1525.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.587;DP=112;Dels=0.00;FS=3.754;HRun=0;HaplotypeScore=1.9305;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.399;VQSLOD=5.4166;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,53:112:99:1555,0,1679
12	11149769	.	T	C	2113.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=187;Dels=0.00;FS=2.932;HRun=0;HaplotypeScore=2.7994;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.400;VQSLOD=5.1915;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,80:187:99:2143,0,2763
12	11150033	.	G	T	1881.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;DP=157;DS;Dels=0.00;FS=0.625;HRun=3;HaplotypeScore=6.9823;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.196;VQSLOD=4.9530;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,72:157:99:1912,0,2413
12	11150046	.	G	T	1684.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.838;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.0685;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.373;VQSLOD=4.6420;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,64:139:99:1715,0,2101
12	11338613	.	C	G	600.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.255;DP=51;Dels=0.00;FS=1.332;HRun=1;HaplotypeScore=1.7206;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.670;VQSLOD=5.5149;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,24:51:99:631,0,755
12	11338781	.	C	A	1129.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.692;DP=74;Dels=0.00;FS=6.131;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.27;ReadPosRankSum=2.219;VQSLOD=4.5445;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,39:74:99:1160,0,1046
12	11338957	.	A	G	919.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.146;DP=73;Dels=0.00;FS=1.972;HRun=2;HaplotypeScore=2.9918;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.983;VQSLOD=5.5573;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:73:99:950,0,983
12	11339020	.	T	A	535.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.811;DP=51;Dels=0.00;FS=1.086;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=6.3594;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,23:51:99:565,0,692
12	12301898	.	C	T	7958.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8314;MQ=58.32;MQ0=0;QD=32.09;VQSLOD=6.6393;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:248:99:7958,644,0
12	12496086	.	C	T	2322.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.656;DP=182;Dels=0.00;FS=0.550;HRun=0;HaplotypeScore=3.6629;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.053;VQSLOD=6.0234;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,93:182:99:2352,0,2240
12	12814818	.	C	T	3736.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7312;MQ=59.68;MQ0=0;QD=32.49;VQSLOD=9.3822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3736,304,0
12	13103266	.	G	T	2141.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.989;DP=197;Dels=0.00;FS=5.141;HRun=0;HaplotypeScore=5.5971;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.951;VQSLOD=4.6740;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,88:197:99:2171,0,2980
12	14587301	.	A	G	1476.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=6.6539;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,61:138:99:1507,0,1849
12	14688644	.	C	T	5200.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=58.94;MQ0=0;QD=31.91;VQSLOD=9.5790;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:163:99:5200,412,0
12	14829893	.	A	C	2794.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.0635;MQ=59.18;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=8.6614;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2828,211,0
12	15776164	.	A	C	774.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.856;DP=89;Dels=0.00;FS=1.847;HRun=1;HaplotypeScore=4.7184;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.724;VQSLOD=5.3505;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,33:89:99:804,0,1450
12	18435452	.	C	T	425.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.179;VQSLOD=6.5354;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:455,0,266
12	18649057	.	C	T	312.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.66;MQ0=0;QD=28.40;VQSLOD=7.9618;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:27.08:345,27,0
12	20905250	.	C	T	580.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.522;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.058;VQSLOD=6.3521;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,25:50:99:610,0,679
12	21011480	.	T	G	3654.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.74;MQ0=0;QD=29.47;VQSLOD=8.8974;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3654,277,0
12	21015760	.	G	A	5153.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.16;MQ0=0;QD=28.32;VQSLOD=7.7048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5153,400,0
12	21028208	.	G	C	2400.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9905;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.683;VQSLOD=5.4197;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,89:172:99:2431,0,2110
12	21176135	.	T	C	1038.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;QD=29.68;VQSLOD=8.4754;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:81.26:1072,81,0
12	21329738	.	A	G	1190.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.605;VQSLOD=6.5834;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,51:104:99:1221,0,1366
12	21331549	.	T	C	1513.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.757;DP=112;Dels=0.00;FS=1.676;HRun=0;HaplotypeScore=1.8561;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.047;VQSLOD=5.4500;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,60:112:99:1543,0,1256
12	21624546	.	C	G	933.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;DP=68;Dels=0.00;FS=1.004;HRun=0;HaplotypeScore=3.4279;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.637;VQSLOD=2.7062;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,34:68:99:963,0,877
12	21713402	.	T	C	5180.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2263;MQ=59.25;MQ0=0;QD=31.98;VQSLOD=8.6468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5180,394,0
12	25148755	.	C	G	1097.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=17.99;VQSLOD=6.9522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:61:90.27:1130,90,0
12	25261735	.	G	T	627.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=8.3778;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:57.15:661,57,0
12	25311489	.	G	T	1724.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=59.60;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=9.0393;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1757,135,0
12	25671759	.	T	A	5935.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.6217;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.61;VQSLOD=4.6143;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:215:99:5934,481,0
12	27800746	.	G	T	6170.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.3123;MQ=58.44;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.7378;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:193:99:6170,490,0
12	27849796	.	A	G	3724.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7406;MQ=59.00;MQ0=0;QD=30.78;VQSLOD=8.4375;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3724,313,0
12	27850113	.	A	T	1712.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.281;DP=120;Dels=0.00;FS=0.700;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.440;VQSLOD=6.0269;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,68:120:99:1743,0,1276
12	27867727	.	G	A	980.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=160;Dels=0.00;FS=4.136;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.650;VQSLOD=4.0199;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,46:160:99:1011,0,2772
12	28412372	.	G	A	489	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=45;Dels=0.00;FS=1.192;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.446;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.354;VQSLOD=5.5169;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,21:45:99:519,0,708
12	29630081	.	G	A	1465.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.53;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=8.8708;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1498,120,0
12	31135579	.	T	C	310.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.284;DP=28;Dels=0.00;FS=4.630;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.290;VQSLOD=5.3751;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:341,0,378
12	31605044	.	G	T	2619.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.566;DP=214;Dels=0.00;FS=1.760;HRun=1;HaplotypeScore=5.6107;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.873;VQSLOD=5.1159;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,96:214:99:2649,0,3446
12	32134638	.	T	C	1582.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.852;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6658;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.887;VQSLOD=5.4320;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,60:109:99:1612,0,1290
12	32135441	.	T	C	1665.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.56;MQ0=0;QD=32.66;VQSLOD=8.8908;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1698,132,0
12	39713776	.	C	A	576.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.738;DP=39;Dels=0.00;FS=1.342;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.736;VQSLOD=6.0745;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,24:39:99:607,0,386
12	39726179	.	T	C	3906.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.042;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=7.305;HRun=0;HaplotypeScore=4.0815;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.536;VQSLOD=3.0418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,123:249:99:3316,0,3181
12	40085906	.	A	T	239.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;DP=24;Dels=0.00;FS=4.310;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.144;VQSLOD=5.7780;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:269,0,348
12	40619082	.	G	A	1099.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33;VQSLOD=14.1674;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:93.28:1132,93,0
12	41946539	.	G	A	1246.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.821;DP=98;Dels=0.00;FS=8.232;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.372;VQSLOD=5.0092;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,43:98:99:1277,0,1379
12	46321514	.	A	T	2080.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;QD=29.72;VQSLOD=8.4900;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,69:70:99:2113,172,0
12	48137441	.	C	T	831.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.317;DP=63;Dels=0.00;FS=3.665;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.148;VQSLOD=4.5670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,32:63:99:861,0,747
12	48142636	.	C	T	2008.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.692;DP=164;Dels=0.00;FS=1.262;HRun=0;HaplotypeScore=8.4084;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.012;VQSLOD=4.5343;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,80:164:99:2038,0,1999
12	48151822	.	C	G	98.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.635;VQSLOD=4.7597;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:129,0,229
12	48272895	.	A	G	2400.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.38;VQSLOD=8.7987;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2433,190,0
12	48358203	.	A	G	746.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.688;DP=53;Dels=0.00;FS=2.897;HRun=0;HaplotypeScore=3.7353;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.727;VQSLOD=5.1165;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,30:53:99:776,0,616
12	48538908	.	G	A	1453.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.521;DP=116;Dels=0.00;FS=1.510;HRun=0;HaplotypeScore=3.5996;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.217;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.216;VQSLOD=4.5959;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,52:116:99:1484,0,1667
12	48596484	.	A	T	724.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=52;Dels=0.00;FS=1.192;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.716;VQSLOD=5.3820;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,28:52:99:755,0,690
12	48596546	.	C	T	407.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=44;Dels=0.00;FS=4.581;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.131;VQSLOD=5.4559;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:438,0,714
12	48596579	.	C	T	731.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.628;DP=53;Dels=0.00;FS=2.461;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.383;VQSLOD=6.5845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,28:53:99:762,0,628
12	48736985	.	T	G	1688.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.415;DP=148;Dels=0.00;FS=6.202;HRun=1;HaplotypeScore=2.8552;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.677;VQSLOD=5.1509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,66:148:99:1719,0,2322
12	48888594	.	C	T	2473.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.487;DP=176;Dels=0.00;FS=2.038;HRun=1;HaplotypeScore=2.7280;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.522;VQSLOD=6.4045;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,93:176:99:2503,0,2285
12	48919556	.	A	G	5562.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5131;MQ=59.46;MQ0=0;QD=29.12;VQSLOD=7.6952;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:5561,445,0
12	48919659	.	T	C	1875.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.949;DP=142;Dels=0.00;FS=5.056;HRun=1;HaplotypeScore=1.8737;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.913;VQSLOD=5.7598;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,65:142:99:1906,0,2169
12	48919796	.	C	T	2595.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=189;Dels=0.00;FS=0.540;HRun=0;HaplotypeScore=2.6494;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=13.73;ReadPosRankSum=-1.067;VQSLOD=6.5190;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,98:189:99:2626,0,2440
12	48920073	.	G	A	1935.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.525;DP=126;Dels=0.00;FS=0.671;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.205;VQSLOD=6.2847;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,67:126:99:1965,0,1522
12	49308284	.	A	G	1728.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;DP=154;Dels=0.00;FS=8.578;HRun=0;HaplotypeScore=5.5168;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.123;VQSLOD=3.6567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,68:154:99:1758,0,2231
12	49314994	.	A	G	852.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.353;DP=70;Dels=0.00;FS=6.908;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.024;VQSLOD=4.9792;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:883,0,983
12	49430947	.	T	C	1131.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=117;Dels=0.00;FS=0.698;HRun=0;HaplotypeScore=3.4442;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.097;VQSLOD=5.0249;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,48:117:99:1162,0,1847
12	51208122	.	C	G	1555.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.785;DP=134;Dels=0.00;FS=3.199;HRun=1;HaplotypeScore=3.8259;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.754;VQSLOD=5.3381;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,58:134:99:1585,0,2120
12	51236802	.	T	C	179.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.493;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.972;VQSLOD=11.2097;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:209,0,298
12	51237816	.	G	A	250.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.695;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.275;VQSLOD=6.2637;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:280,0,320
12	51681903	.	T	C	1197	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.665;DP=119;Dels=0.00;FS=2.601;HRun=0;HaplotypeScore=3.5782;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.617;VQSLOD=5.3242;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,54:119:99:1227,0,1739
12	51707626	.	C	T	1831.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=143;Dels=0.00;FS=3.983;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.740;VQSLOD=6.2001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,76:143:99:1862,0,1704
12	51723499	.	T	C	1463.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.140;DP=98;Dels=0.00;FS=6.773;HRun=2;HaplotypeScore=2.9285;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.447;VQSLOD=4.1437;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,57:98:99:1494,0,1021
12	51737607	.	G	A	769.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.373;DP=51;Dels=0.00;FS=6.646;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.392;VQSLOD=5.1920;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,30:51:99:800,0,556
12	52282873	.	A	T	1342.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.305;DP=105;Dels=0.00;FS=5.223;HRun=1;HaplotypeScore=5.4959;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.850;VQSLOD=4.2654;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,53:105:99:1372,0,1330
12	52284500	.	A	G	683.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=51;Dels=0.00;FS=2.488;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.426;VQSLOD=5.6072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,28:51:99:713,0,643
12	52284668	.	C	A	695.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;DP=44;Dels=0.00;FS=4.336;HRun=2;HaplotypeScore=1.8288;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.370;VQSLOD=5.9648;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,26:44:99:726,0,496
12	52285086	.	G	A	651.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;DP=44;Dels=0.00;FS=1.451;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=14.81;ReadPosRankSum=2.251;VQSLOD=5.2309;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,24:44:99:681,0,491
12	52579259	.	C	T	1494.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.009;DP=112;Dels=0.00;FS=3.842;HRun=0;HaplotypeScore=2.4029;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.103;VQSLOD=4.3991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,53:112:99:1525,0,1480
12	52631313	.	A	G	4079.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.81;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=8.8417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4078,328,0
12	52639302	.	G	C	6397.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.0538;MQ=58.95;MQ0=0;QD=31.52;VQSLOD=5.8409;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:203:99:6397,517,0
12	52681925	.	A	C	5427.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7439;MQ=43.57;MQ0=5;QD=27.27;VQSLOD=2.7060;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,196:199:99:5388,502,0
12	52710721	.	G	C	8327.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=3.101;HRun=1;HaplotypeScore=4.6347;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.841;VQSLOD=3.9865;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,240:242:99:8299,619,0
12	52713088	.	G	A	2220.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=171;DS;Dels=0.00;FS=3.865;HRun=0;HaplotypeScore=4.8458;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.091;VQSLOD=4.3822;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,79:171:99:2250,0,2435
12	52774235	.	A	G	5765.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5640;MQ=59.81;MQ0=0;QD=29.88;VQSLOD=8.1397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:193:99:5765,463,0
12	52788928	.	G	A	2751.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.24;MQ0=0;QD=30.24;VQSLOD=9.0209;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2785,223,0
12	52866060	.	C	T	5132.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9164;MQ=48.09;MQ0=10;QD=29.84;VQSLOD=3.8821;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,167:172:99:5131,418,0
12	52965173	.	T	G	1796.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.531;DP=138;Dels=0.00;FS=9.122;HRun=0;HaplotypeScore=6.9615;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.547;VQSLOD=4.0817;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,70:138:99:1826,0,1756
12	52981442	.	C	A	3062.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.622;HRun=0;HaplotypeScore=7.9048;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.848;VQSLOD=3.8686;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,115:250:99:3092,0,3789
12	52986187	.	T	C	1364.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.779;DP=102;Dels=0.00;FS=4.044;HRun=0;HaplotypeScore=5.1919;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.201;VQSLOD=4.5978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,51:102:99:1395,0,1312
12	52992812	.	T	C	3031.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=7.257;HRun=1;HaplotypeScore=9.3993;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=13.72;ReadPosRankSum=-2.278;VQSLOD=3.3334;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,109:221:99:3061,0,2843
12	53069014	.	T	C	2223.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.739;DP=174;DS;Dels=0.00;FS=1.358;HRun=1;HaplotypeScore=2.8798;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.087;VQSLOD=6.1748;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,83:174:99:2253,0,2370
12	53086645	.	G	A	2074.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.944;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2593;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.971;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.580;VQSLOD=3.9368;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,83:148:99:2104,0,1652
12	53088484	.	C	T	1711.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.739;DP=104;Dels=0.00;FS=0.823;HRun=1;HaplotypeScore=2.6488;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.679;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.163;VQSLOD=5.2462;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,62:104:99:1741,0,1150
12	53091566	.	C	A	4105.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.493;HRun=0;HaplotypeScore=9.6540;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.953;VQSLOD=3.8576;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,113:250:99:3364,0,3737
12	53165940	.	C	T	1824.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2383;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.318;VQSLOD=4.0229;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,74:150:99:1855,0,1962
12	53165949	.	C	T	2074.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.349;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8661;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.308;VQSLOD=5.5328;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,80:153:99:2105,0,1802
12	53186088	.	G	C	851.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.289;DP=72;Dels=0.00;FS=0.892;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.130;VQSLOD=5.2950;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:882,0,970
12	53189696	.	C	G	1266.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.900;DP=94;Dels=0.00;FS=1.902;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.572;VQSLOD=5.2385;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,46:94:99:1296,0,1311
12	53200999	.	T	A	1321.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.176;DP=98;Dels=0.00;FS=0.789;HRun=0;HaplotypeScore=1.9367;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.508;VQSLOD=5.0908;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:98:99:1351,0,1464
12	53227803	.	A	G	415.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.002;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9084;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.163;VQSLOD=4.6096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,19:47:99:446,0,834
12	53242440	.	A	G	1453.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.448;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.8645;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.611;VQSLOD=6.3223;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,57:122:99:1483,0,1834
12	53442956	.	G	C	614.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.812;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.982;VQSLOD=6.0576;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,27:40:99:644,0,326
12	53509933	.	C	T	2068.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1163;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.378;VQSLOD=5.5696;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,80:157:99:2099,0,1964
12	53586536	.	C	T	1549.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.618;DP=139;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=0;HaplotypeScore=2.8926;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.699;VQSLOD=5.4099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,61:139:99:1580,0,2107
12	53662624	.	C	A	588.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.699;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.400;VQSLOD=11.0990;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,24:39:99:618,0,394
12	53670545	.	C	A	1630.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.391;DP=116;Dels=0.00;FS=4.400;HRun=0;HaplotypeScore=1.9994;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.659;VQSLOD=6.1030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,62:116:99:1660,0,1473
12	53681883	.	A	T	2102.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=13.5095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2136,175,0
12	53682457	.	G	A	2015.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.052;DP=145;Dels=0.00;FS=0.617;HRun=0;HaplotypeScore=5.9633;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.109;VQSLOD=3.7661;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,79:145:99:2046,0,1436
12	53686703	.	G	A	2589.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=9.6262;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2623,211,0
12	53693532	.	A	G	1687.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.14;VQSLOD=9.0440;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1721,156,0
12	53693533	.	A	C	1994.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.78;MQ0=0;QD=34.99;VQSLOD=9.7975;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2027,159,0
12	53700848	.	C	T	5734.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7621;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=8.0441;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:5734,454,0
12	53700860	.	A	G	5298.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.32;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=8.7844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:171:99:5298,430,0
12	53702252	.	TCAGA	T	5469.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.918;DP=245;DS;FS=2.232;HRun=0;HaplotypeScore=1143.7843;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=22.32;ReadPosRankSum=1.289;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,111:245:99:5469,0,9080
12	54109659	.	C	T	1791.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8401;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=16.90;ReadPosRankSum=3.104;VQSLOD=3.8032;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,64:106:99:1821,0,1149
12	54422504	.	C	T	1809.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.369;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3898;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.466;VQSLOD=3.3893;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,64:126:99:1839,0,1758
12	54911426	.	C	T	1623.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=135;Dels=0.00;FS=0.736;HRun=1;HaplotypeScore=1.6439;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.201;VQSLOD=6.5196;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,60:135:99:1654,0,1828
12	54975837	.	T	C	2096.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=31.29;VQSLOD=9.0268;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2129,172,0
12	55356258	.	C	T	2499.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.822;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=4.572;HRun=0;HaplotypeScore=6.1697;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.141;VQSLOD=4.3613;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,95:240:99:2529,0,3657
12	55688894	.	T	G	1627.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.389;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.408;VQSLOD=5.0716;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,59:98:99:1657,0,931
12	55714772	.	G	A	1076.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=9.1042;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:93.28:1110,93,0
12	55714876	.	C	G	1370.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.3131;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1403,108,0
12	55715119	.	G	A	4379.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8049;MQ=58.34;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=8.9386;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4378,349,0
12	55794976	.	A	G	5014.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5750;MQ=58.95;MQ0=0;QD=33.43;VQSLOD=9.8262;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:5014,388,0
12	55863224	.	C	G	6484.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8097;MQ=58.52;MQ0=0;QD=32.58;VQSLOD=8.0149;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,199:199:99:6484,497,0
12	55863381	.	A	G	6310.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.5357;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=8.0851;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,198:198:99:6310,485,0
12	55886294	.	G	A	3546.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.211;DP=126;Dels=0.00;FS=3.125;HRun=0;HaplotypeScore=2.7594;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.380;VQSLOD=4.1339;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,122:126:99:3511,260,0
12	55886489	.	T	A	4041.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=30.39;ReadPosRankSum=0.394;VQSLOD=8.8005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,131:133:99:4041,319,0
12	55886507	.	A	G	1369.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;DP=129;Dels=0.00;FS=0.657;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.682;VQSLOD=4.6653;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,56:129:99:1399,0,1952
12	55887087	.	G	T	1304.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;QD=29.64;VQSLOD=7.9998;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1337,105,0
12	55945119	.	A	G	5506.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8051;MQ=58.72;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=9.0760;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5506,421,0
12	56089357	.	C	T	1210.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;DP=138;Dels=0.00;FS=7.060;HRun=0;HaplotypeScore=5.1445;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.491;VQSLOD=3.4296;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,50:138:99:1240,0,2219
12	56722060	.	T	G	6168.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.87;MQ0=0;QD=34.08;VQSLOD=9.8703;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:6168,482,0
12	56814653	.	G	A	2570.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.01;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=9.0467;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2604,202,0
12	56862886	.	T	C	3046.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9046;MQ=57.73;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=7.5205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3080,253,0
12	57109792	.	A	G	933.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;DP=52;Dels=0.00;FS=5.177;HRun=1;HaplotypeScore=2.6605;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.368;VQSLOD=4.7643;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,33:52:99:963,0,529
12	57109931	.	A	T	234.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;DP=31;Dels=0.00;FS=3.831;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.642;VQSLOD=4.9853;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:31:99:264,0,466
12	57114100	.	A	G	1719.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.735;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.633;VQSLOD=6.7624;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,58:89:99:1749,0,846
12	57114307	.	A	T	498.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.104;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.198;VQSLOD=5.6649;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,16:25:99:529,0,223
12	57569339	.	G	A	1514.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=127;Dels=0.00;FS=5.446;HRun=0;HaplotypeScore=2.5494;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.078;VQSLOD=4.6216;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,55:127:99:1544,0,1952
12	57589784	.	A	C	3324.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.4407;MQ=59.77;MQ0=0;QD=33.24;VQSLOD=7.1073;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3324,256,0
12	57843711	.	G	A	1752.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=134;Dels=0.00;FS=1.394;HRun=0;HaplotypeScore=4.8564;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.574;VQSLOD=5.3171;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,65:134:99:1783,0,1694
12	57865321	.	G	A	3383.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.09;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=8.8868;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3383,277,0
12	57865821	.	G	C	4107.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.81;MQ0=0;QD=33.67;VQSLOD=9.3834;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4108,313,0
12	57869582	.	T	C	382.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42;VQSLOD=13.5448;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:33.10:415,33,0
12	57870155	.	A	C	1713.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=32.33;VQSLOD=9.4018;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1746,135,0
12	58010163	.	A	G	646.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.557;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8606;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.835;VQSLOD=6.1285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,24:48:99:677,0,682
12	58015494	.	G	A	178.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.382;VQSLOD=12.2948;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:79.03:209,0,79
12	58019472	.	T	G	3047.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74;VQSLOD=9.1523;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3080,238,0
12	58204283	.	T	C	4789.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7471;MQ=58.92;MQ0=0;QD=30.70;VQSLOD=7.1430;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4789,364,0
12	58335626	.	A	T	457.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2931;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.465;VQSLOD=5.5451;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,17:40:99:488,0,632
12	62928633	.	G	A	1171.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.784;DP=120;Dels=0.00;FS=0.766;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.525;VQSLOD=6.1763;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,49:120:99:1201,0,1956
12	64587633	.	C	A	1814.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=8.7759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1848,150,0
12	64609562	.	C	T	2022.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8455;MQ=59.65;MQ0=0;QD=30.65;VQSLOD=9.1082;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2056,165,0
12	66605228	.	A	G	2003.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;QD=29.04;VQSLOD=8.7447;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2036,150,0
12	66698895	.	T	C	4721.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8930;MQ=59.07;MQ0=0;QD=30.27;VQSLOD=9.2802;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4721,355,0
12	66786091	.	G	C	2476.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4446;MQ=59.03;MQ0=0;QD=34.40;VQSLOD=8.5387;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2510,202,0
12	68707287	.	G	A	1128.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;DP=97;Dels=0.00;FS=5.128;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.437;VQSLOD=5.0809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,47:97:99:1158,0,1189
12	68708761	.	C	T	4029.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.299;HRun=0;HaplotypeScore=4.8223;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.458;VQSLOD=4.5099;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,123:249:99:3384,0,3360
12	68720627	.	G	A	735.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.719;DP=78;Dels=0.00;FS=3.415;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.486;VQSLOD=5.1528;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,29:78:99:765,0,1366
12	69744014	.	C	A	1565.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.533;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.8440;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.430;VQSLOD=5.7155;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,66:152:99:1596,0,2277
12	71139664	.	T	C	2736.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7030;MQ=58.82;MQ0=0;QD=32.97;VQSLOD=8.4503;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2770,217,0
12	71523134	.	A	C	442.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.510;DP=39;Dels=0.00;FS=2.814;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.183;VQSLOD=4.9720;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:473,0,405
12	71533534	.	C	G	2520.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.633;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=6.531;HRun=0;HaplotypeScore=4.5019;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.270;VQSLOD=3.4637;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,95:223:99:2550,0,3513
12	77449790	.	A	G	1608.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.740;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5718;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.940;VQSLOD=5.5225;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,66:144:99:1639,0,1849
12	78225374	.	A	G	4045.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.986;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2001;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=33.16;ReadPosRankSum=-1.522;VQSLOD=8.4972;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,120:122:99:4000,271,0
12	80747242	.	A	G	305.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.077;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.495;VQSLOD=6.9486;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:336,0,256
12	80752660	.	A	G	345.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=13.4331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:30.09:379,30,0
12	80765800	.	A	G	789.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.945;DP=68;Dels=0.00;FS=2.217;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.724;VQSLOD=6.4778;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,35:68:99:820,0,904
12	82752543	.	T	G	1434.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.431;DP=91;Dels=0.00;FS=5.269;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=4.9217;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,48:91:99:1465,0,1089
12	82752559	.	T	G	1085.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.353;DP=74;Dels=0.00;FS=8.344;HRun=1;HaplotypeScore=3.1064;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.275;VQSLOD=4.3930;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,38:74:99:1116,0,994
12	82792787	.	C	A	930.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=14.2739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:75.24:964,75,0
12	85277561	.	T	A	1249.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.616;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.778;VQSLOD=6.2038;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,58:123:99:1279,0,1536
12	88440676	.	G	C	1309.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.685;DP=134;Dels=0.00;FS=0.673;HRun=1;HaplotypeScore=4.6355;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.660;VQSLOD=3.0128;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,50:134:99:1340,0,2103
12	89745477	.	C	A	743.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=9.2625;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:63.19:777,63,0
12	89916811	.	C	T	304.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.616;DP=38;Dels=0.00;FS=3.633;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.136;VQSLOD=5.8460;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,14:38:99:335,0,781
12	89917518	.	A	G	1543.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.99;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=9.9891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1576,123,0
12	93139348	.	A	G	1963.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.938;DP=137;Dels=0.00;FS=0.716;HRun=1;HaplotypeScore=4.9658;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.841;VQSLOD=5.0649;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,75:137:99:1993,0,1533
12	93150102	.	T	C	1150.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=98;Dels=0.00;FS=2.611;HRun=0;HaplotypeScore=3.4917;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.400;VQSLOD=5.3622;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,49:98:99:1181,0,1257
12	93196422	.	T	G	1370.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.45;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=9.7195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1403,108,0
12	95660182	.	A	G	2966.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=1.643;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.713;VQSLOD=6.5123;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,113:223:99:2997,0,2964
12	95694111	.	T	G	312.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.424;DP=31;Dels=0.00;FS=6.245;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.220;VQSLOD=4.8678;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:343,0,419
12	95694394	.	G	A	3168.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6385;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.532;VQSLOD=9.1634;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,100:101:99:3201,262,0
12	95927762	.	T	C	1695.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;DP=125;Dels=0.00;FS=1.437;HRun=0;HaplotypeScore=1.6517;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.099;VQSLOD=6.7254;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1726,0,1612
12	96288860	.	T	C	2032.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.892;DP=153;Dels=0.00;FS=4.041;HRun=0;HaplotypeScore=3.7797;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.210;VQSLOD=5.4953;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,77:153:99:2063,0,2104
12	96371731	.	C	T	1510.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.621;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4962;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.526;VQSLOD=5.2536;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,57:140:99:1541,0,2247
12	96374614	.	C	T	3961.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5432;MQ=59.15;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=9.3650;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:126:99:3961,313,0
12	97098549	.	T	C	741.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;DP=62;Dels=0.00;FS=3.558;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.125;VQSLOD=3.4883;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,34:62:99:772,0,596
12	97102578	.	G	A	832.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=63;Dels=0.00;FS=2.178;HRun=2;HaplotypeScore=2.9800;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.833;VQSLOD=3.5225;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,33:63:99:863,0,785
12	97136239	.	G	A	529.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;DP=51;Dels=0.00;FS=1.064;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.450;VQSLOD=6.1513;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,21:51:99:559,0,827
12	98927830	.	C	G	1070.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.262;DP=109;Dels=0.00;FS=2.508;HRun=0;HaplotypeScore=3.4504;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.262;VQSLOD=5.4683;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,44:109:99:1100,0,1769
12	99007623	.	C	T	1740.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.8323;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.355;VQSLOD=5.4786;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,72:181:99:1771,0,2864
12	100042040	.	C	G	1795.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.278;DP=133;Dels=0.00;FS=1.568;HRun=2;HaplotypeScore=4.6834;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.010;VQSLOD=5.3163;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,66:133:99:1825,0,1783
12	100042163	.	A	G	2549.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.089;DP=204;Dels=0.00;FS=2.468;HRun=0;HaplotypeScore=2.8271;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.269;VQSLOD=6.0906;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,93:204:99:2579,0,3194
12	100708367	.	C	T	605.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;DP=65;Dels=0.00;FS=0.984;HRun=0;HaplotypeScore=2.8637;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.267;VQSLOD=4.9644;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,26:65:99:636,0,1077
12	101560328	.	C	A	1145.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.702;DP=97;Dels=0.00;FS=2.651;HRun=1;HaplotypeScore=4.9802;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.643;VQSLOD=4.6080;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,52:97:99:1176,0,1048
12	101587518	.	C	T	1919.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.535;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.3302;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.885;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.122;VQSLOD=3.4750;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,76:150:99:1949,0,2046
12	101693534	.	C	G	1303.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.239;DP=95;Dels=0.00;FS=1.726;HRun=0;HaplotypeScore=1.9905;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.701;VQSLOD=6.1786;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,51:95:99:1333,0,1125
12	101750814	.	T	A	3681.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.80;MQ0=0;QD=32.01;VQSLOD=9.2560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3681,289,0
12	101761753	.	A	G	2827.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.758;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=3.097;HRun=2;HaplotypeScore=1.5616;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.194;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.412;VQSLOD=4.6186;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,105:231:99:2858,0,3578
12	101776996	.	G	C	908.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.207;DP=67;Dels=0.00;FS=8.488;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.232;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.289;VQSLOD=2.7410;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,36:67:99:939,0,858
12	103872172	.	T	G	669.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.46;MQ0=0;QD=25.75;VQSLOD=7.2037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:54.17:702,54,0
12	104139034	.	C	A	485.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;DP=47;Dels=0.00;FS=1.225;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.353;VQSLOD=6.2673;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,21:47:99:516,0,746
12	104373728	.	G	GA	719.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.530;DP=61;FS=2.434;HRun=6;HaplotypeScore=116.3083;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.130;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:758,0,616
12	104645363	.	G	A	1660.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2312;MQ=58.55;MQ0=0;QD=34.58;VQSLOD=9.1477;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1693,135,0
12	104645384	.	C	G	682	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.036;DP=57;Dels=0.00;FS=4.100;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=11.96;ReadPosRankSum=2.684;VQSLOD=3.4243;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,26:57:99:712,0,878
12	104645405	.	T	C	2396.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=28.88;VQSLOD=8.7697;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2430,190,0
12	104709559	.	C	T	777.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;DP=61;Dels=0.00;FS=2.971;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.224;VQSLOD=6.7940;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,31:61:99:807,0,837
12	105546172	.	G	A	1958.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23;VQSLOD=13.8621;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1992,150,0
12	105583877	.	G	A	1990.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.321;DP=157;Dels=0.00;FS=4.223;HRun=0;HaplotypeScore=6.9810;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.403;VQSLOD=4.8065;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,81:157:99:2020,0,1959
12	108051406	.	G	A	1893.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=122;Dels=0.00;FS=2.409;HRun=0;HaplotypeScore=7.4142;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.007;VQSLOD=4.2649;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,69:122:99:1924,0,1406
12	108954862	.	G	C	2229.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.8625;MQ=57.74;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=7.1008;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2262,175,0
12	108985945	.	A	G	1218.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.945;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7200;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.356;VQSLOD=6.3374;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,46:96:99:1248,0,1376
12	109017264	.	T	C	1429.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.075;DP=123;Dels=0.00;FS=6.103;HRun=0;HaplotypeScore=2.8944;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=4.9214;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,55:123:99:1460,0,1953
12	109017266	.	G	A	1391.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.278;DP=123;Dels=0.00;FS=9.314;HRun=1;HaplotypeScore=1.8997;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.180;VQSLOD=4.4839;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,54:123:99:1422,0,2006
12	109623516	.	G	A	814.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;DP=66;Dels=0.00;FS=1.028;HRun=0;HaplotypeScore=2.5949;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.341;VQSLOD=5.7444;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,34:66:99:844,0,910
12	110034320	.	G	A	1128.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.901;DP=86;Dels=0.00;FS=9.762;HRun=0;HaplotypeScore=3.9855;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.343;VQSLOD=3.6239;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,49:86:99:1159,0,816
12	111353547	.	G	T	2640.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=2.903;HRun=2;HaplotypeScore=7.1121;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.790;VQSLOD=2.4905;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,108:239:99:2671,0,3311
12	111786082	.	G	C	7236.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6109;MQ=58.98;MQ0=0;QD=32.60;VQSLOD=7.5621;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:7236,575,0
12	111884608	.	T	C	375.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=38;Dels=0.00;FS=1.301;HRun=0;HaplotypeScore=4.1101;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.812;VQSLOD=5.9357;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:38:99:405,0,550
12	113348870	.	G	A	3467.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8519;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=9.3669;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3467,265,0
12	113357209	.	G	A	6038.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=9.5347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,196:196:99:6038,493,0
12	113357237	.	G	C	6214.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8118;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.39;VQSLOD=7.8089;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,198:198:99:6213,508,0
12	113376388	.	G	A	956.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;VQSLOD=6.4680;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:36:72.24:990,72,0
12	113403675	.	C	T	630.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.261;VQSLOD=5.1914;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,22:38:99:660,0,384
12	113425154	.	C	G	1019.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88;VQSLOD=13.5282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.26:1052,81,0
12	113448288	.	A	G	4797.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.66;MQ0=0;QD=35.02;VQSLOD=9.5925;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4797,379,0
12	113553481	.	C	T	496.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;DP=44;Dels=0.00;FS=19.099;HRun=0;HaplotypeScore=3.5968;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.204;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.071;VQSLOD=2.3956;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,19:44:99:526,0,672
12	113825679	.	C	T	4045.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.063;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=1.228;HRun=0;HaplotypeScore=6.5659;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.486;VQSLOD=3.9404;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,117:229:99:3397,0,2917
12	114282496	.	C	T	928.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15;VQSLOD=14.0845;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:75.24:961,75,0
12	114377899	.	G	C	6441.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.3264;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=5.5070;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6440,530,0
12	116457069	.	C	T	1594.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=126;Dels=0.00;FS=2.676;HRun=0;HaplotypeScore=6.8552;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.238;VQSLOD=3.2592;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,64:126:99:1625,0,1603
12	117383320	.	G	A	2967.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8216;MQ=59.04;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=9.6437;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3001,235,0
12	117693817	.	G	A	1015.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;DP=114;Dels=0.00;FS=1.639;HRun=3;HaplotypeScore=2.6878;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.449;VQSLOD=6.1989;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,42:114:99:1045,0,1783
12	118509191	.	G	A	2219.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.958;DP=181;Dels=0.00;FS=1.996;HRun=0;HaplotypeScore=3.4597;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=3.197;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.348;VQSLOD=3.6208;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,92:181:99:2249,0,2429
12	118682751	.	C	T	6083.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.0210;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.2797;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:6082,472,0
12	119588962	.	G	A	1861.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.930;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.288;VQSLOD=6.4695;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,73:138:99:1891,0,1552
12	119866533	.	A	G	871.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.88;MQ0=0;QD=30.04;VQSLOD=9.3739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:69.22:904,69,0
12	119916900	.	A	G	1363.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.539;DP=134;Dels=0.00;FS=0.717;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.898;VQSLOD=6.2037;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,61:134:99:1394,0,2054
12	120313953	.	C	T	1174.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.343;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4750;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.259;VQSLOD=6.0585;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,47:112:99:1204,0,1782
12	120575549	.	A	C	1665.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.26;MQ0=0;QD=32.65;VQSLOD=9.4628;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1698,138,0
12	120954490	.	C	T	2073.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.284;DP=177;DS;Dels=0.00;FS=2.003;HRun=0;HaplotypeScore=5.8085;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.495;VQSLOD=4.9036;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,75:177:99:2104,0,3101
12	121416650	.	A	C	1191.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=42;Dels=0.00;FS=5.119;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.660;VQSLOD=3.7382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,41:42:71.85:1225,72,0
12	121437382	.	A	G	867.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=56.94;MQ0=0;QD=27.10;VQSLOD=6.0262;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:72.20:900,72,0
12	121600253	.	T	C	471.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.285;DP=43;Dels=0.00;FS=1.172;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.455;VQSLOD=6.3097;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,20:43:99:502,0,511
12	121615103	.	G	A	1467.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;DP=120;Dels=0.00;FS=1.476;HRun=0;HaplotypeScore=1.7334;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.646;VQSLOD=6.6710;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,58:120:99:1497,0,1732
12	121622304	.	A	C	469.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;DP=49;Dels=0.00;FS=1.134;HRun=0;HaplotypeScore=1.5775;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.162;VQSLOD=6.1301;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,21:49:99:500,0,779
12	121622520	.	A	T	450.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06;VQSLOD=13.3271;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.12:484,39,0
12	122186317	.	G	A	3016.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=9.3920;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3049,244,0
12	122295335	.	T	C	2286.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.94;VQSLOD=8.3340;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2319,196,0
12	122326812	.	T	C	444.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=29.62;VQSLOD=9.0357;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:36.12:477,36,0
12	122353796	.	A	G	968.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.20;MQ0=0;QD=28.49;VQSLOD=8.0994;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:78.24:1002,78,0
12	122396395	.	C	T	7396.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.2150;MQ=59.24;MQ0=1;QD=30.44;VQSLOD=6.2427;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:243:99:7395,593,0
12	122405912	.	G	T	4238.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8907;MQ=59.68;MQ0=0;QD=29.85;VQSLOD=8.7849;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4238,340,0
12	122617989	.	A	G	681.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;DP=60;Dels=0.00;FS=3.245;HRun=1;HaplotypeScore=1.8410;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=6.1874;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,25:60:99:711,0,1067
12	122622795	.	A	G	887.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.321;DP=72;Dels=0.00;FS=4.783;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.765;VQSLOD=4.8058;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:918,0,1009
12	122674780	.	C	A	2923.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=223;Dels=0.00;FS=10.088;HRun=1;HaplotypeScore=8.7601;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.378;VQSLOD=3.6230;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,112:223:99:2953,0,3249
12	123200247	.	G	C	3559.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.564;DP=112;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9940;MQ=44.32;MQ0=9;MQRankSum=-0.420;QD=31.78;ReadPosRankSum=-1.732;VQSLOD=2.3651;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,111:112:99:3528,263,0
12	123200768	.	T	G	1985.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=129;Dels=0.00;FS=0.666;HRun=1;HaplotypeScore=4.3028;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.573;VQSLOD=2.3399;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,69:129:99:2016,0,1600
12	124097766	.	A	G	1188.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.629;DP=107;Dels=0.00;FS=2.522;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.720;VQSLOD=6.1179;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,51:107:99:1219,0,1343
12	124274474	.	A	G	869.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=61;Dels=0.00;FS=2.856;HRun=1;HaplotypeScore=1.4450;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.367;VQSLOD=6.4822;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,34:61:99:899,0,716
12	124325977	.	T	G	7538.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9650;MQ=59.25;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=7.7572;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:7538,599,0
12	124427306	.	T	A	2703.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=176;Dels=0.00;FS=4.642;HRun=0;HaplotypeScore=3.5507;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.248;VQSLOD=5.0344;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,111:176:99:2734,0,1643
12	124856830	.	C	T	788.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.543;DP=70;Dels=0.00;FS=0.977;HRun=1;HaplotypeScore=1.9318;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.515;VQSLOD=3.1148;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,32:70:99:819,0,979
12	124857033	.	C	T	413.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.285;VQSLOD=5.0401;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:443,0,738
12	125453115	.	C	T	4266.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0405;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.395;VQSLOD=5.1708;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,131:249:99:3637,0,2999
12	131276448	.	G	T	5491.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.53;VQSLOD=8.8041;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5491,421,0
12	131306314	.	C	G	2516.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;QD=31.85;VQSLOD=9.1232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2549,199,0
12	131311749	.	A	C	1383.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.098;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7760;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.886;VQSLOD=2.5871;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,63:144:99:1413,0,1897
12	132237848	.	T	C	3721.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6595;MQ=59.41;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=6.6783;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3721,310,0
12	132335592	.	G	A	921.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12;VQSLOD=9.2762;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:75.24:954,75,0
12	132403161	.	A	G	965.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.96;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=7.7050;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.24:998,81,0
12	132626668	.	T	C	873.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5544;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.715;VQSLOD=6.3108;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,38:92:99:903,0,1406
12	133257837	.	C	A	2250.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=2.405;HRun=0;HaplotypeScore=5.6830;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.288;VQSLOD=4.2830;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,90:221:99:2281,0,3332
12	133357412	.	T	C	3211.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.356;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=5.532;HRun=2;HaplotypeScore=2.8589;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.573;VQSLOD=5.2821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,112:203:99:3242,0,2492
12	133384864	.	G	A	2725.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.625;DP=182;Dels=0.00;FS=5.848;HRun=0;HaplotypeScore=7.3981;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.181;VQSLOD=4.0881;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,103:182:99:2755,0,2024
12	133428242	.	G	A	2093.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.784;DP=177;DS;Dels=0.00;FS=7.910;HRun=0;HaplotypeScore=8.7204;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.230;VQSLOD=4.2032;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,84:177:99:2123,0,2489
12	133778796	.	C	T	551.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.083;DP=40;Dels=0.00;FS=1.189;HRun=0;HaplotypeScore=1.9933;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.623;VQSLOD=6.0848;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,21:40:99:582,0,513
13	20000630	.	T	C	5123.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=58.57;MQ0=1;QD=30.31;VQSLOD=8.6716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,167:169:99:5123,385,0
13	20398669	.	T	C	249.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;DP=28;Dels=0.00;FS=7.181;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.894;VQSLOD=4.5262;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:279,0,393
13	20797025	.	A	T	1381.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=100;Dels=0.00;FS=0.761;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.386;VQSLOD=5.8476;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,55:100:99:1412,0,1142
13	21189941	.	G	A	940.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.937;DP=91;Dels=0.00;FS=2.805;HRun=0;HaplotypeScore=5.9284;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.912;VQSLOD=3.4236;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,42:91:99:971,0,1212
13	21205192	.	G	A	1490.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;DP=143;Dels=0.00;FS=0.628;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.484;VQSLOD=5.0545;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,61:143:99:1521,0,2088
13	21562832	.	C	T	1053.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48;VQSLOD=13.4196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:84.24:1087,84,0
13	21562948	.	G	A	472.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52;VQSLOD=12.5031;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.13:506,42,0
13	21735998	.	T	C	562.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.517;DP=43;Dels=0.00;FS=1.279;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.377;VQSLOD=6.4464;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:43:99:592,0,480
13	23898664	.	A	G	2715.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4443;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=30.51;ReadPosRankSum=-0.276;VQSLOD=8.2817;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,88:89:99:2748,211,0
13	24411772	.	T	C	8424.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6067;MQ=59.67;MQ0=0;QD=33.83;VQSLOD=7.1922;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8424,650,0
13	24436475	.	C	T	259.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=34;Dels=0.00;FS=3.176;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.106;VQSLOD=5.7258;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:289,0,539
13	25000617	.	C	G	1058.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.183;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.752;VQSLOD=5.6709;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,41:85:99:1088,0,1176
13	25008588	.	A	G	4173	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9650;MQ=58.91;MQ0=0;QD=33.38;VQSLOD=9.3752;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:4173,325,0
13	25008630	.	A	G	4350.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.21;MQ0=0;QD=30.21;VQSLOD=8.6989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4349,355,0
13	25008903	.	G	T	770.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=49.95;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=7.3151;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:69.16:804,69,0
13	25009099	.	A	C	2365.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.48;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=8.8988;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2398,184,0
13	25009297	.	G	T	2325.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=165;Dels=0.00;FS=11.758;HRun=0;HaplotypeScore=6.3130;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.125;VQSLOD=4.0750;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,91:165:99:2355,0,1956
13	25009441	.	C	G	1681.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.750;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1871;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=10.13;ReadPosRankSum=-2.720;VQSLOD=4.2964;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,69:166:99:1712,0,2503
13	25009485	.	C	G	1801.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.421;DP=163;Dels=0.00;FS=1.279;HRun=1;HaplotypeScore=4.1500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.897;VQSLOD=4.4557;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,73:163:99:1832,0,2317
13	25020863	.	G	A	1733.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.38;VQSLOD=8.8889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1766,132,0
13	25027744	.	A	G	5050.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6188;MQ=59.30;MQ0=0;QD=28.22;VQSLOD=7.0328;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:179:99:5050,406,0
13	25029218	.	C	T	3108.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.001;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.002;HRun=0;HaplotypeScore=8.0612;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.115;VQSLOD=4.8745;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,114:250:99:3139,0,3599
13	25029295	.	C	T	3035.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.053;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=1.335;HRun=1;HaplotypeScore=3.9665;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.640;VQSLOD=5.7580;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,111:214:99:3066,0,3043
13	25367282	.	A	C	3200.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.336;DP=208;Dels=0.00;FS=0.533;HRun=0;HaplotypeScore=3.7675;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=1.114;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.131;VQSLOD=5.5109;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,122:208:99:3231,0,2151
13	25831888	.	T	C	1278.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.42;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=9.1480;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1312,102,0
13	25876011	.	G	A	159.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.146;VQSLOD=11.5671;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:189,0,329
13	28009031	.	G	C	958.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.491;VQSLOD=6.7817;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,36:82:99:988,0,1315
13	28009920	.	G	C	6036.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2920;MQ=59.08;MQ0=0;QD=35.09;VQSLOD=8.7578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:172:99:5991,463,0
13	28143229	.	A	G	8158.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.8638;MQ=59.57;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=8.8549;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8157,644,0
13	28537317	.	G	A	1176.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.546;DP=91;Dels=0.00;FS=2.771;HRun=0;HaplotypeScore=2.5326;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=2.564;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.308;VQSLOD=4.7127;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,48:91:99:1207,0,1070
13	28624294	.	G	A	1389.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.228;DP=108;Dels=0.00;FS=5.134;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.209;VQSLOD=6.1355;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,51:108:99:1419,0,1480
13	29898768	.	A	C	408.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=31.46;VQSLOD=8.4385;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:36.10:442,36,0
13	31480720	.	G	A	743.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;DP=47;Dels=0.00;FS=11.792;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.748;VQSLOD=4.0605;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,28:47:99:774,0,495
13	31480827	.	A	G	422.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=53.24;MQ0=0;QD=30.21;VQSLOD=5.4201;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.11:456,39,0
13	31891746	.	G	A	6207.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2145;MQ=59.62;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=8.7444;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,198:199:99:6207,484,0
13	32811607	.	G	A	1894.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=144;Dels=0.00;FS=3.065;HRun=0;HaplotypeScore=2.9423;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.539;VQSLOD=5.9105;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,70:144:99:1925,0,1845
13	32906729	.	A	C	4021.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.758;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.463;HRun=0;HaplotypeScore=6.3352;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.082;VQSLOD=4.7842;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3403,0,3297
13	32929387	.	T	C	1951.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=9.0924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:1984,150,0
13	36202269	.	A	G	608.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.782;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=11.70;ReadPosRankSum=-2.395;VQSLOD=5.2122;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,24:52:99:638,0,704
13	37583831	.	G	A	2126.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.000;DP=172;Dels=0.00;FS=1.217;HRun=0;HaplotypeScore=4.9195;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=3.510;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.707;VQSLOD=3.8157;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,85:172:99:2157,0,2058
13	39263714	.	T	C	3989.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=3.8709;MQ=59.14;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=8.5674;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:3989,316,0
13	39264690	.	T	C	2598.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.035;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.3579;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.383;VQSLOD=3.9489;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,90:194:99:2628,0,2758
13	39430314	.	C	T	1671.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.837;DP=107;Dels=0.00;FS=2.675;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.968;VQSLOD=5.9289;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,66:107:99:1702,0,963
13	39587677	.	A	G	2630.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.153;DP=212;Dels=0.00;FS=3.271;HRun=0;HaplotypeScore=5.4777;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.451;VQSLOD=5.0126;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,105:212:99:2660,0,2833
13	41382711	.	A	T	2096.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.37;MQ0=0;QD=33.28;VQSLOD=8.6854;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2129,169,0
13	41515286	.	T	A	4623.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.24;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=9.0195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4623,367,0
13	41533052	.	T	C	6574.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7192;MQ=59.61;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=8.0253;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6574,503,0
13	41814531	.	C	T	1378.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.984;DP=100;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=0;HaplotypeScore=1.9736;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.107;VQSLOD=5.0603;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,52:100:99:1408,0,1241
13	41835039	.	T	C	676.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=60;Dels=0.00;FS=4.424;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.547;VQSLOD=5.3095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,24:60:99:706,0,946
13	42404710	.	C	T	1167.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.394;DP=106;Dels=0.00;FS=1.567;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.676;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.843;VQSLOD=5.3340;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,52:106:99:1198,0,1269
13	42875089	.	C	T	1478.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=121;Dels=0.00;FS=7.084;HRun=1;HaplotypeScore=2.5677;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.316;VQSLOD=4.8183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,55:121:99:1509,0,1677
13	43597865	.	A	G	906.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21;VQSLOD=14.3701;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:72.23:939,72,0
13	44411432	.	A	G	864.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.244;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9943;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.347;VQSLOD=5.8156;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,34:88:99:895,0,1359
13	44457925	.	A	G	607.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=63;Dels=0.00;FS=5.399;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.563;VQSLOD=5.0627;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,27:63:99:637,0,913
13	45563464	.	G	C	665.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.82;MQ0=1;QD=27.75;VQSLOD=7.4647;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:54.17:699,54,0
13	46103935	.	A	G	706.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.101;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.349;VQSLOD=6.7291;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,26:51:99:736,0,728
13	46108853	.	T	C	517.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;QD=30.45;VQSLOD=8.8735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:45.12:551,45,0
13	46287373	.	C	A	873.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.229;DP=59;Dels=0.00;FS=1.629;HRun=0;HaplotypeScore=2.3569;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.740;VQSLOD=6.0313;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,33:59:99:904,0,751
13	46288145	.	A	G	112.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.470;VQSLOD=11.9109;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:142,0,101
13	46541673	.	T	A	1003.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=97;Dels=0.00;FS=1.685;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.410;VQSLOD=5.8945;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,43:97:99:1033,0,1345
13	46543092	.	C	T	3161.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.193;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=7.424;HRun=0;HaplotypeScore=3.4090;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.628;VQSLOD=3.0805;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,114:225:99:3192,0,2833
13	46629944	.	A	G	1809.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.786;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.306;VQSLOD=6.2331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,75:133:99:1840,0,1398
13	46648094	.	C	T	1332.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=93;Dels=0.00;FS=6.579;HRun=2;HaplotypeScore=2.7737;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=14.33;ReadPosRankSum=-1.657;VQSLOD=4.6711;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,53:93:99:1363,0,1099
13	46708291	.	T	C	3227.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.82;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=8.5478;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3260,247,0
13	48547467	.	A	T	2022.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.39;MQ0=0;QD=29.32;VQSLOD=7.6719;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2056,168,0
13	50050620	.	A	G	737.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3976;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.489;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.125;VQSLOD=4.9961;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,29:85:99:767,0,1572
13	50057097	.	G	A	645.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.670;DP=39;Dels=0.00;FS=1.639;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=16.56;ReadPosRankSum=-3.294;VQSLOD=2.7318;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,25:39:99:676,0,399
13	50141345	.	G	A	2592.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6439;MQ=59.32;MQ0=0;QD=31.23;VQSLOD=8.8502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2625,214,0
13	50205025	.	T	C	518.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.231;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.713;VQSLOD=6.3397;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,22:50:99:549,0,805
13	52440130	.	A	G	1221.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=87;Dels=0.00;FS=0.853;HRun=0;HaplotypeScore=1.8519;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.065;VQSLOD=6.5835;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,48:87:99:1251,0,884
13	52515354	.	A	G	1780.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.843;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=5.8319;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.609;VQSLOD=4.5845;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,68:139:99:1810,0,1858
13	52523808	.	C	T	1288.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;DP=110;Dels=0.00;FS=3.637;HRun=1;HaplotypeScore=5.8139;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.199;VQSLOD=4.9053;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,47:110:99:1318,0,1796
13	52524488	.	T	C	1314.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;DP=115;Dels=0.00;FS=8.894;HRun=2;HaplotypeScore=4.9270;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.168;VQSLOD=4.7752;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,51:115:99:1345,0,1785
13	52542680	.	A	G	1352.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.159;DP=109;Dels=0.00;FS=1.559;HRun=1;HaplotypeScore=6.4142;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.006;VQSLOD=3.2632;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,49:109:99:1382,0,1519
13	52544805	.	C	G	1442.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;DP=136;DS;Dels=0.00;FS=1.741;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.263;VQSLOD=5.8572;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,53:136:99:1472,0,2419
13	52548140	.	A	C	2223.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.745;DP=154;DS;Dels=0.00;FS=7.183;HRun=0;HaplotypeScore=3.4832;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.516;VQSLOD=4.0861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,81:154:99:2253,0,2124
13	52603194	.	G	T	6858.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4875;MQ=59.75;MQ0=0;QD=30.89;VQSLOD=8.7837;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:222:99:6857,563,0
13	52603241	.	A	G	2049.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.260;DP=168;DS;Dels=0.00;FS=3.669;HRun=0;HaplotypeScore=5.3561;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=2.479;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.369;VQSLOD=3.8660;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,76:168:99:2080,0,2388
13	52676275	.	T	G	2703.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.006;DP=198;Dels=0.00;FS=1.969;HRun=0;HaplotypeScore=8.5143;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.496;VQSLOD=4.1720;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,97:198:99:2733,0,2636
13	53035925	.	A	G	4437.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6766;MQ=58.22;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=8.2653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4437,334,0
13	61989175	.	G	T	443.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=33;Dels=0.00;FS=6.037;HRun=0;HaplotypeScore=2.7523;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.422;VQSLOD=5.1888;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:474,0,276
13	73350079	.	T	C	1971.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;QD=30.32;VQSLOD=8.6000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2004,153,0
13	75884216	.	C	T	1612.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;QD=29.32;VQSLOD=8.5328;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1646,135,0
13	76382100	.	C	T	876.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.741;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.7273;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.725;VQSLOD=5.8259;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,35:82:99:907,0,1276
13	76423248	.	T	C	724.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.671;DP=73;Dels=0.00;FS=1.142;HRun=0;HaplotypeScore=2.5929;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.133;VQSLOD=5.6292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,29:73:99:754,0,1214
13	77574983	.	A	G	245.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.766;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.975;VQSLOD=11.5871;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:276,0,412
13	92345579	.	C	T	1609.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;DP=121;Dels=0.00;FS=0.728;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.542;VQSLOD=6.7511;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,66:121:99:1639,0,1369
13	96638636	.	A	C	1092.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=28.75;ReadPosRankSum=-1.277;VQSLOD=7.4840;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,37:38:84.27:1126,84,0
13	99479139	.	T	C	301.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;DP=26;Dels=0.00;FS=1.619;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.287;VQSLOD=6.6166;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:26:99:332,0,294
13	100518580	.	A	G	1575.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=144;Dels=0.00;FS=2.979;HRun=0;HaplotypeScore=8.5408;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.601;VQSLOD=4.2584;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,67:144:99:1605,0,1854
13	101287340	.	C	T	1558.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.169;DP=112;Dels=0.00;FS=0.764;HRun=0;HaplotypeScore=5.8135;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.763;VQSLOD=3.7971;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,59:112:99:1588,0,1328
13	103527849	.	G	C	5754.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7523;MQ=59.26;MQ0=0;QD=28.77;VQSLOD=6.9426;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:5753,457,0
13	103527930	.	G	C	3126.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.461;DP=109;Dels=0.00;FS=4.897;HRun=0;HaplotypeScore=3.9574;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=28.69;ReadPosRankSum=1.700;VQSLOD=3.0642;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,108:109:99:3160,244,0
13	109777503	.	A	G	657.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.698;DP=64;Dels=0.00;FS=2.090;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.021;VQSLOD=6.3933;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,26:64:99:687,0,1035
13	110839550	.	T	G	4186.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7898;MQ=59.81;MQ0=0;QD=34.60;VQSLOD=9.0099;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:4186,328,0
13	111082772	.	G	T	402.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;DP=57;Dels=0.00;FS=1.052;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.216;VQSLOD=4.7264;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,21:57:99:432,0,975
13	113053470	.	T	A	1402.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.880;DP=53;Dels=0.00;FS=10.263;HRun=0;HaplotypeScore=3.8816;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.071;VQSLOD=2.1962;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,50:53:66.44:1436,66,0
13	113479820	.	A	G	4365.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.56;MQ0=0;QD=32.10;VQSLOD=9.9425;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4365,349,0
14	20216298	.	T	C	1412.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;DP=114;Dels=0.00;FS=1.530;HRun=1;HaplotypeScore=3.5686;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.835;VQSLOD=5.0204;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,52:114:99:1442,0,1738
14	20295834	.	T	C	6935.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.024;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8039;MQ=48.91;MQ0=12;MQRankSum=1.578;QD=29.14;ReadPosRankSum=1.424;VQSLOD=2.9353;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,228:238:99:6913,532,0
14	20345346	.	A	T	572.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.317;DP=35;Dels=0.00;FS=3.463;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.517;VQSLOD=4.9056;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,20:35:99:602,0,360
14	20404091	.	G	A	1505.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;DP=135;Dels=0.00;FS=4.189;HRun=0;HaplotypeScore=2.8793;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.528;VQSLOD=5.7708;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,62:135:99:1536,0,2015
14	20404614	.	C	A	829.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.673;DP=79;Dels=0.00;FS=1.880;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.247;VQSLOD=5.4372;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,34:79:99:860,0,1181
14	20404735	.	C	T	720.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8393;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=2.590;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.830;VQSLOD=3.9803;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,30:61:99:750,0,800
14	20444441	.	C	A	1388.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.240;VQSLOD=4.2160;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,50:101:99:1418,0,1503
14	20528359	.	G	T	6413.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.68;MQ0=0;QD=30.83;VQSLOD=8.9232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,208:208:99:6412,518,0
14	20586042	.	G	C	3186.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=5.7004;MQ=58.75;MQ0=0;QD=34.26;VQSLOD=7.3490;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:3219,256,0
14	20665790	.	T	A	6175.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.47;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=9.2532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:203:99:6175,502,0
14	20665840	.	G	A	3961.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6546;MQ=59.26;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=8.7936;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3961,322,0
14	20666175	.	C	CA	4546.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=273.0452;MQ=60.55;MQ0=0;QD=34.19;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,121:133:99:4547,370,0
14	20770036	.	T	C	1821	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.437;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2245;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.437;VQSLOD=6.0321;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,69:132:99:1851,0,1604
14	20872881	.	G	T	1085.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;DP=118;Dels=0.00;FS=4.720;HRun=2;HaplotypeScore=5.2177;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.515;VQSLOD=4.7705;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,44:118:99:1116,0,2120
14	20876253	.	A	G	2613.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.765;DP=193;Dels=0.00;FS=9.932;HRun=1;HaplotypeScore=5.4107;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=4.3196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,90:193:99:2643,0,2861
14	20925154	.	T	G	1341.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=32.72;VQSLOD=9.6424;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1375,105,0
14	21024619	.	A	G	3197.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=14.2592;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3231,247,0
14	21024786	.	A	G	1780.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.15;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=8.6523;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1813,141,0
14	21109385	.	C	T	2176.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5584;MQ=59.16;MQ0=0;QD=30.23;VQSLOD=9.0449;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:72:99:2210,175,0
14	21109726	.	G	A	5284.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=9.4351;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:5284,433,0
14	21250124	.	G	A	7029.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8477;MQ=58.59;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=9.2334;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:214:99:7029,548,0
14	21360216	.	C	G	1405.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.555;DP=149;Dels=0.00;FS=3.117;HRun=1;HaplotypeScore=8.8066;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.615;VQSLOD=3.4527;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,54:149:99:1435,0,2469
14	21467913	.	T	G	1397.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.474;DP=151;Dels=0.00;FS=1.311;HRun=0;HaplotypeScore=5.2833;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.960;VQSLOD=5.1175;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,63:151:99:1427,0,2376
14	21469151	.	T	C	4329.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.691;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=5.873;HRun=0;HaplotypeScore=7.2076;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.411;VQSLOD=3.7237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,122:233:99:3673,0,3226
14	21511458	.	G	C	8283.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.6006;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=33.14;ReadPosRankSum=1.704;VQSLOD=8.2859;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,248:250:99:8259,626,0
14	21511497	.	C	T	7543.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=9.0362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7542,626,0
14	21526079	.	C	T	1492.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.144;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2332;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.801;VQSLOD=5.1996;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,54:88:99:1523,0,900
14	21551069	.	T	C	3636.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.06;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=9.9048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3636,280,0
14	21623290	.	T	C	2407.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27;VQSLOD=13.3377;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2441,205,0
14	21623836	.	G	A	3809.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9053;MQ=59.78;MQ0=0;QD=35.60;VQSLOD=9.2174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3809,298,0
14	21770730	.	A	G	771	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.667;VQSLOD=13.6825;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:31.42:804,31,0
14	21790040	.	G	T	525.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.085;DP=39;Dels=0.00;FS=1.293;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.188;VQSLOD=5.2260;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,24:39:99:556,0,399
14	21859687	.	G	A	1166.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.834;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.708;VQSLOD=5.7518;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,43:76:99:1196,0,837
14	21972019	.	G	A	1391.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.657;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8564;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.299;VQSLOD=4.5774;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,48:95:99:1421,0,1327
14	21993498	.	G	A	2964.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4245;MQ=58.96;MQ0=0;QD=29.95;VQSLOD=9.0183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:99:99:2998,241,0
14	21993638	.	G	C	1632.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;DP=103;Dels=0.00;FS=1.678;HRun=0;HaplotypeScore=2.6002;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.204;VQSLOD=5.8627;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,57:103:99:1663,0,1266
14	22038562	.	T	C	1244.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.175;VQSLOD=6.2564;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,43:81:99:1275,0,886
14	22038659	.	T	C	795.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.264;DP=66;Dels=0.00;FS=3.325;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.837;VQSLOD=5.2192;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,28:66:99:826,0,1018
14	22133648	.	G	A	8406.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4893;MQ=59.48;MQ0=0;QD=33.63;VQSLOD=8.6587;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8405,701,0
14	22133997	.	A	G	3124.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;QD=31.56;VQSLOD=9.4183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3158,259,0
14	22134018	.	C	T	1384.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.650;DP=91;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=1;HaplotypeScore=4.1638;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.764;VQSLOD=5.2032;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,51:91:99:1415,0,997
14	23236524	.	C	T	1860.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.60;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=9.2971;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1894,165,0
14	23299286	.	T	C	1060.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14;VQSLOD=14.1382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:84.27:1094,84,0
14	23306048	.	C	T	1505.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7131;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=8.1984;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:49:99:1538,117,0
14	23375564	.	G	A	2187.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.850;DP=153;Dels=0.00;FS=3.901;HRun=1;HaplotypeScore=2.6871;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.217;VQSLOD=5.4353;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,79:153:99:2218,0,1851
14	23549319	.	A	G	5603.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.5897;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.96;VQSLOD=7.2115;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:170:99:5603,445,0
14	23549379	.	C	G	4505.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.00;MQ0=0;QD=33.38;VQSLOD=9.4079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4505,355,0
14	23549785	.	T	C	5585.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.13;MQ0=0;QD=31.73;VQSLOD=9.4472;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:5585,424,0
14	23745533	.	C	T	804.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.296;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4314;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.082;VQSLOD=4.5910;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,29:63:99:835,0,658
14	23777374	.	A	G	1411.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.03;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=8.6211;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1445,114,0
14	23829490	.	C	T	599.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;DP=55;Dels=0.00;FS=5.642;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.910;VQSLOD=5.1519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:55:99:629,0,902
14	24030824	.	A	AT	1101.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=93;FS=5.748;HRun=6;HaplotypeScore=231.5748;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.068;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,37:93:99:1141,0,1195
14	24533539	.	C	A	257.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.062;VQSLOD=10.6520;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,11:23:99:288,0,340
14	24567498	.	A	C	1694.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4620;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=7.5106;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1727,135,0
14	24587639	.	G	A	1760.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.630;DP=172;Dels=0.00;FS=0.579;HRun=0;HaplotypeScore=3.4300;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.061;VQSLOD=6.2017;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,72:172:99:1791,0,2488
14	24614361	.	T	G	6705.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7747;MQ=58.34;MQ0=1;QD=34.39;VQSLOD=9.1720;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6705,521,0
14	24656694	.	GTC	G	1573.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.692;DP=109;FS=0.741;HRun=0;HaplotypeScore=341.1591;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.068;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,45:109:99:1612,0,2989
14	24679877	.	C	T	3844.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.78;MQ0=0;QD=31.52;VQSLOD=9.5757;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3844,289,0
14	24839083	.	G	C	890.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=13.0854;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:75.22:924,75,0
14	24845841	.	T	C	5419.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.20;MQ0=0;QD=34.52;VQSLOD=8.8299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:5419,427,0
14	24883887	.	G	A	590.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=46;Dels=0.00;FS=11.205;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.154;VQSLOD=4.8735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,23:46:99:621,0,604
14	24901249	.	A	C	824.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=82;Dels=0.00;FS=1.938;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.851;VQSLOD=6.0633;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,31:82:99:855,0,1419
14	24901276	.	G	T	2418.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06;VQSLOD=9.4116;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2452,193,0
14	24909362	.	T	C	1030.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.45;VQSLOD=8.7312;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:93.21:1064,93,0
14	24909475	.	C	G	1442.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.72;VQSLOD=7.4806;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1476,123,0
14	24910973	.	T	G	1038.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=9.6348;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:84.26:1072,84,0
14	25102160	.	C	T	5258.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;QD=32.86;VQSLOD=9.7316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:5258,412,0
14	31099738	.	A	G	3900.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.9916;MQ=58.93;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=8.4999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:3901,292,0
14	31355096	.	C	G	1630.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.779;DP=138;Dels=0.00;FS=4.248;HRun=0;HaplotypeScore=3.9890;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.322;VQSLOD=5.5144;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,62:138:99:1661,0,2136
14	31381351	.	T	C	3019.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.529;DP=219;Dels=0.00;FS=9.846;HRun=0;HaplotypeScore=5.5616;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.679;VQSLOD=4.0457;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,114:219:99:3049,0,2611
14	31582380	.	A	G	700.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.36;MQ0=0;QD=30.45;VQSLOD=9.2193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.16:733,57,0
14	31790886	.	T	G	329.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.433;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.866;VQSLOD=4.4191;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:360,0,146
14	31819047	.	C	T	602.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;DP=50;Dels=0.00;FS=1.137;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.431;VQSLOD=6.0296;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:632,0,593
14	34269167	.	G	C	546.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.908;DP=39;Dels=0.00;FS=1.239;HRun=1;HaplotypeScore=1.9966;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.117;VQSLOD=6.5357;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:39:99:576,0,451
14	35230980	.	C	T	1773.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;DP=127;Dels=0.00;FS=6.708;HRun=5;HaplotypeScore=5.7915;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.857;VQSLOD=4.5367;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,60:127:99:1804,0,1720
14	35231108	.	A	T	2382.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.678;DP=195;Dels=0.00;FS=1.785;HRun=2;HaplotypeScore=9.1637;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.781;VQSLOD=3.3474;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,90:195:99:2413,0,2717
14	35735967	.	A	G	3013.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.840;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.703;HRun=0;HaplotypeScore=7.2361;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.806;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.524;VQSLOD=3.8355;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,113:250:99:3043,0,3482
14	36789729	.	T	G	4706.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.0265;MQ=56.13;MQ0=0;QD=32.91;VQSLOD=3.6193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4706,373,0
14	36789775	.	A	T	3342.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=56.25;MQ0=0;QD=29.84;VQSLOD=5.2057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:112:99:3342,280,0
14	37736325	.	A	G	1315.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;DP=90;Dels=0.00;FS=1.760;HRun=1;HaplotypeScore=3.8225;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=4.2096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,55:90:99:1346,0,930
14	38061742	.	C	T	1763.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94;VQSLOD=13.7070;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1797,150,0
14	38277999	.	C	T	2224.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.620;DP=249;Dels=0.00;FS=0.471;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.721;VQSLOD=6.3604;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,101:249:99:2254,0,3824
14	39556185	.	G	C	3051.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.93;MQ0=0;QD=29.06;VQSLOD=8.0720;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3085,226,0
14	39650234	.	A	T	3124.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7323;MQ=59.76;MQ0=0;QD=32.22;VQSLOD=9.0125;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3158,259,0
14	39736680	.	T	C	1719.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14;VQSLOD=13.5419;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1752,132,0
14	39777676	.	G	C	1686.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.31;MQ0=0;QD=32.44;VQSLOD=8.4564;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1720,135,0
14	39818028	.	A	G	4111.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.519;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.644;HRun=0;HaplotypeScore=1.9662;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.618;VQSLOD=4.3387;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,117:250:99:3452,0,3533
14	39818145	.	G	A	2279.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.301;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8178;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.264;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.999;VQSLOD=3.7471;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,90:161:99:2310,0,1863
14	44974966	.	G	A	1258.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.395;DP=91;Dels=0.00;FS=15.157;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.042;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.888;VQSLOD=3.2373;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,49:91:99:1288,0,1262
14	44975052	.	A	G	3022.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.956;DP=234;Dels=0.00;FS=1.013;HRun=1;HaplotypeScore=4.5904;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.324;VQSLOD=5.8436;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,118:234:99:3053,0,3101
14	44975511	.	G	A	1436.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.371;DP=108;Dels=0.00;FS=6.184;HRun=0;HaplotypeScore=2.5550;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=5.0518;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,51:108:99:1466,0,1470
14	44975606	.	G	T	2046.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.649;DP=164;Dels=0.00;FS=7.156;HRun=1;HaplotypeScore=5.0432;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.623;VQSLOD=4.5889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,78:164:99:2077,0,2304
14	45636328	.	A	G	1499.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.191;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.281;VQSLOD=5.5878;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,55:87:99:1529,0,832
14	45644589	.	G	T	691.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6246;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.134;VQSLOD=5.0278;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,29:78:99:722,0,1314
14	45650900	.	A	G	212.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.941;DP=29;Dels=0.00;FS=1.744;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.491;VQSLOD=3.5984;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:243,0,476
14	45665468	.	C	G	3228.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.028;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=5.102;HRun=0;HaplotypeScore=1.5778;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.329;VQSLOD=5.1347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,113:203:99:3258,0,2448
14	45711988	.	C	A	1579.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.690;DP=140;Dels=0.00;FS=2.269;HRun=0;HaplotypeScore=4.5980;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.204;VQSLOD=4.1176;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,69:140:99:1609,0,1806
14	50074122	.	T	A	1355.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.975;DP=134;Dels=0.00;FS=2.242;HRun=1;HaplotypeScore=3.7853;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.352;VQSLOD=5.6310;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,58:134:99:1385,0,1912
14	50074520	.	C	T	1180.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=90;Dels=0.00;FS=6.878;HRun=2;HaplotypeScore=1.7719;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.964;VQSLOD=5.0415;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,44:90:99:1210,0,1180
14	50298962	.	T	A	3849.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.90;VQSLOD=7.8515;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:3849,292,0
14	50583083	.	G	T	275.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.179;VQSLOD=5.2573;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:305,0,582
14	50778816	.	A	C	721.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.73;VQSLOD=7.5837;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:63.17:755,63,0
14	50788213	.	C	T	2113.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.10;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=9.7776;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2146,165,0
14	50799126	.	G	C	3618.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6511;MQ=58.75;MQ0=0;QD=31.74;VQSLOD=9.1173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3619,274,0
14	51223789	.	C	T	2531.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=9.2610;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2564,199,0
14	51224374	.	T	G	5848.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7046;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.167;VQSLOD=8.2289;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,196:197:99:5848,472,0
14	52496387	.	C	A	3233.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9950;MQ=59.22;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=9.1999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3265,271,0
14	52507429	.	A	G	6074.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.454;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.7622;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=30.53;ReadPosRankSum=1.332;VQSLOD=6.4142;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,198:199:99:6046,436,0
14	52520368	.	C	T	2293.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.124;DP=168;DS;Dels=0.00;FS=3.052;HRun=0;HaplotypeScore=2.7077;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.266;VQSLOD=5.5763;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,86:168:99:2324,0,2231
14	52535648	.	G	T	2204.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=58.39;MQ0=0;QD=32.90;VQSLOD=9.3363;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2238,178,0
14	53098902	.	G	A	485.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.581;DP=35;Dels=0.00;FS=1.608;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.908;VQSLOD=4.0158;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,17:35:99:516,0,428
14	53619500	.	C	G	84.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.82;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.289;VQSLOD=4.5229;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:114,0,237
14	54417522	.	A	G	1381.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.167;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5692;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.237;VQSLOD=5.3001;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,54:95:99:1412,0,1047
14	55448409	.	G	C	691.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;DP=76;Dels=0.00;FS=2.062;HRun=0;HaplotypeScore=2.8829;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.169;VQSLOD=5.9048;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,32:76:99:722,0,1067
14	55605036	.	A	C	256.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.010;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7843;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.914;VQSLOD=5.7050;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:287,0,241
14	55618524	.	C	G	1618.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.761;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6482;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.009;VQSLOD=4.4800;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,65:115:99:1648,0,1311
14	55818517	.	T	A	1234.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;DP=120;Dels=0.00;FS=0.720;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.902;VQSLOD=6.0133;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,50:120:99:1265,0,1751
14	55818706	.	T	C	3103.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.944;DP=239;Dels=0.00;FS=8.189;HRun=1;HaplotypeScore=5.5662;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.605;VQSLOD=4.6651;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,128:239:99:3133,0,2705
14	55907172	.	C	G	2429.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4721;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=9.1274;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2462,205,0
14	57075920	.	G	T	2228.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.977;DP=205;DS;Dels=0.00;FS=2.106;HRun=0;HaplotypeScore=7.4706;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.022;VQSLOD=4.4470;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,86:205:99:2259,0,3301
14	57099859	.	G	A	1085.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;DP=101;Dels=0.00;FS=3.784;HRun=5;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.482;VQSLOD=5.8107;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,45:101:99:1115,0,1457
14	57938260	.	T	C	902.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.39;MQ0=0;QD=33.42;VQSLOD=8.2743;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.23:935,72,0
14	58605790	.	G	A	4827.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9243;MQ=59.85;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=8.9566;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:4826,400,0
14	58937416	.	T	C	1780.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=8.1040;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1813,138,0
14	58953746	.	C	G	4600.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.1404;MQ=58.69;MQ0=0;QD=29.87;VQSLOD=8.2129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,154:154:99:4599,346,0
14	59112732	.	C	T	1260.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=111;Dels=0.00;FS=7.570;HRun=1;HaplotypeScore=3.6236;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.199;VQSLOD=5.0282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,50:111:99:1291,0,1706
14	59939727	.	T	C	3479.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6825;MQ=59.45;MQ0=0;QD=31.63;VQSLOD=9.2967;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,110:110:99:3479,265,0
14	59950676	.	A	C	169.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=12;Dels=0.00;FS=10.561;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.278;VQSLOD=3.7541;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:95.57:199,0,96
14	60582053	.	G	A	2531.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.008;DP=225;Dels=0.00;FS=3.752;HRun=0;HaplotypeScore=8.3457;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.132;VQSLOD=4.6660;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,100:225:99:2562,0,3184
14	60585131	.	A	G	352.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8273;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.378;VQSLOD=4.7178;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:40:99:383,0,544
14	60591887	.	G	A	296.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.626;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=13.46;ReadPosRankSum=-2.143;VQSLOD=10.7210;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:326,0,213
14	60923783	.	C	T	1538.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.38;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=8.6222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1572,123,0
14	60976537	.	C	A	914.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.483;DP=70;Dels=0.00;FS=8.288;HRun=1;HaplotypeScore=3.5067;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.193;VQSLOD=4.1999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,36:70:99:944,0,903
14	61180657	.	T	G	1706.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12;VQSLOD=9.2623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1739,138,0
14	61445967	.	A	G	2994.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.77;MQ0=0;QD=29.65;VQSLOD=8.3733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3027,226,0
14	61449328	.	T	A	5059.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6885;MQ=58.61;MQ0=0;QD=28.26;VQSLOD=8.2132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5059,385,0
14	62462766	.	T	C	1278.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79;VQSLOD=9.0032;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1312,99,0
14	63174960	.	C	T	1768.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.927;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=15.38;ReadPosRankSum=-2.007;VQSLOD=5.9960;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,64:115:99:1798,0,1366
14	63784407	.	A	AG	2394.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=135.8437;MQ=60.93;MQ0=0;QD=41.29;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,55:58:99:2437,166,0
14	64469828	.	C	T	680.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.419;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.643;VQSLOD=5.8223;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,31:78:99:711,0,1196
14	64491695	.	T	C	3101.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.22;MQ0=0;QD=28.98;VQSLOD=8.3020;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3134,253,0
14	64496749	.	C	T	1664.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.37;MQ0=0;QD=28.22;VQSLOD=8.0249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1698,129,0
14	64497930	.	G	A	5132.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5191;MQ=59.49;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=8.3500;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5132,415,0
14	64498037	.	G	A	2536.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8808;MQ=59.22;MQ0=0;QD=28.50;VQSLOD=8.5344;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2570,208,0
14	64519035	.	A	G	2428.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.4972;MQ=59.76;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.5904;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:78:99:2462,199,0
14	64519455	.	A	G	1534.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.29;MQ0=0;QD=29.50;VQSLOD=8.5776;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1567,123,0
14	64522674	.	G	C	1833.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.88;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=8.4286;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1866,147,0
14	64522843	.	A	G	3153.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=14.1013;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3186,259,0
14	64612858	.	C	A	639.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=61;Dels=0.00;FS=2.210;HRun=0;HaplotypeScore=1.8237;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.068;VQSLOD=6.5840;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,24:61:99:669,0,1024
14	64687258	.	A	T	1046.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;DP=87;Dels=0.00;FS=1.819;HRun=0;HaplotypeScore=3.8814;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=12.03;ReadPosRankSum=-2.568;VQSLOD=3.3177;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,43:87:99:1077,0,1188
14	64882380	.	A	G	2679.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7046;MQ=59.43;MQ0=0;QD=30.45;VQSLOD=8.7470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2712,211,0
14	64908845	.	G	A	1853.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.656;DP=142;Dels=0.00;FS=1.357;HRun=0;HaplotypeScore=5.6518;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.313;VQSLOD=5.0535;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,70:142:99:1884,0,1821
14	64935411	.	C	T	2534.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.952;DP=151;Dels=0.00;FS=1.352;HRun=0;HaplotypeScore=2.7404;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=6.1477;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,90:151:99:2564,0,1581
14	64935720	.	C	T	6454.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7157;MQ=59.48;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=8.2448;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,206:206:99:6454,518,0
14	64954410	.	G	A	4626.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.195;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.866;HRun=1;HaplotypeScore=4.6490;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.578;VQSLOD=3.0731;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,137:250:99:3949,0,3204
14	65031534	.	C	T	3152.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.361;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=11.653;HRun=1;HaplotypeScore=11.4130;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.034;VQSLOD=2.2280;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,117:250:99:3182,0,3877
14	65253232	.	T	C	1042.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.194;DP=76;Dels=0.00;FS=11.299;HRun=2;HaplotypeScore=3.7192;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=13.72;ReadPosRankSum=-2.344;VQSLOD=2.8229;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,44:76:99:1072,0,676
14	67671482	.	C	CT	3233.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.872;DP=191;FS=0.569;HRun=0;HaplotypeScore=1047.8152;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.081;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,94:191:99:3272,0,3351
14	67671483	.	A	C	2397.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.687;DP=192;Dels=0.00;FS=0.575;HRun=1;HaplotypeScore=3.9308;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.822;VQSLOD=4.0917;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,95:192:99:2428,0,2630
14	68029313	.	G	A	422.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.278;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.619;VQSLOD=5.9555;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:452,0,159
14	68042574	.	A	G	1872.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.126;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7319;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.879;VQSLOD=7.3617;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,68:70:99:1905,136,0
14	68234539	.	T	C	3770.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5862;MQ=57.90;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=7.8512;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3770,289,0
14	68257352	.	T	A	2355.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.457;DP=182;Dels=0.00;FS=0.601;HRun=0;HaplotypeScore=2.9041;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.94;ReadPosRankSum=-2.380;VQSLOD=4.9346;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,85:182:99:2385,0,2512
14	69704553	.	G	T	311.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.785;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.292;VQSLOD=10.7544;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,13:38:99:341,0,706
14	71109153	.	C	G	183	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=12;Dels=0.00;FS=2.398;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.380;VQSLOD=5.6790;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:213,0,123
14	72054708	.	G	A	2455.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=1.666;HRun=0;HaplotypeScore=9.4106;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=3.3561;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,96:223:99:2485,0,3336
14	72055745	.	A	G	1451.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.293;DP=90;Dels=0.00;FS=0.791;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.556;VQSLOD=4.5142;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,50:90:99:1482,0,1103
14	73717720	.	G	A	1455.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;DP=161;Dels=0.00;FS=5.013;HRun=0;HaplotypeScore=4.6002;MQ=59.67;MQ0=1;MQRankSum=0.643;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.067;VQSLOD=4.6729;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,61:161:99:1486,0,2710
14	73727509	.	T	G	292.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.792;DP=35;Dels=0.00;FS=3.290;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.314;VQSLOD=4.8260;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,13:35:99:323,0,540
14	73957981	.	G	GC	587.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=27.6846;MQ=58.66;MQ0=0;QD=41.98;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42.14:630,42,0
14	74060511	.	T	TTCAA	2271.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.162;DP=127;FS=1.724;HRun=0;HaplotypeScore=854.0808;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-8.270;QD=17.88;ReadPosRankSum=2.186;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,31:127:99:2310,0,5560
14	74060513	.	GCTTA	G	1514.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.187;DP=128;FS=1.736;HRun=0;HaplotypeScore=931.0379;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-8.171;QD=11.83;ReadPosRankSum=2.152;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,31:128:99:1553,0,7676
14	74489735	.	G	A	344.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=26;Dels=0.00;FS=3.682;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.051;VQSLOD=6.4090;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:375,0,394
14	74514674	.	A	T	854.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.48;VQSLOD=8.3383;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:72.22:888,72,0
14	74523869	.	A	G	1178.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.754;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.899;VQSLOD=6.8098;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,44:89:99:1209,0,1232
14	74759006	.	C	T	7478.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=9.2430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,241:241:99:7478,575,0
14	74759477	.	C	T	1886.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=30.93;ReadPosRankSum=1.051;VQSLOD=8.9816;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,60:61:99:1920,131,0
14	74876355	.	G	C	782.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.562;DP=65;Dels=0.00;FS=11.563;HRun=1;HaplotypeScore=2.7822;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.034;VQSLOD=3.9870;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,29:65:99:813,0,1027
14	75230953	.	C	T	1091.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;DP=84;Dels=0.00;FS=3.033;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=5.7757;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,42:84:99:1121,0,1200
14	75513828	.	G	A	1980.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;DP=144;Dels=0.00;FS=1.341;HRun=1;HaplotypeScore=4.8664;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.091;VQSLOD=5.4363;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,68:144:99:2010,0,2093
14	75513883	.	T	C	4974.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.89;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=9.5406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,159:160:99:4974,382,0
14	75538217	.	G	T	706.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.394;DP=53;Dels=0.00;FS=1.095;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=13.32;ReadPosRankSum=-1.167;VQSLOD=6.2061;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,28:53:99:736,0,597
14	75574087	.	C	T	1127.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.762;DP=119;Dels=0.00;FS=3.423;HRun=0;HaplotypeScore=2.3046;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.068;VQSLOD=6.1527;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,45:119:99:1158,0,1940
14	75904660	.	A	G	766.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50;VQSLOD=14.0092;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:66.19:800,66,0
14	76156609	.	C	T	1346.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.470;DP=126;Dels=0.00;FS=3.281;HRun=4;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.936;VQSLOD=5.5598;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,57:126:99:1377,0,1776
14	77332408	.	T	C	318.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.363;VQSLOD=6.5293;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:349,0,507
14	77793207	.	G	A	197.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.023;DP=25;Dels=0.00;FS=6.545;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.582;VQSLOD=4.5296;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:227,0,365
14	77794283	.	T	C	1219.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.327;DP=105;Dels=0.00;FS=3.605;HRun=0;HaplotypeScore=2.8244;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.813;VQSLOD=5.4428;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,50:105:99:1250,0,1563
14	77843814	.	T	C	1230.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.405;DP=107;Dels=0.00;FS=1.640;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.654;VQSLOD=6.2394;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,49:107:99:1260,0,1658
14	77844265	.	G	A	2357.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.936;DP=202;DS;Dels=0.00;FS=6.478;HRun=0;HaplotypeScore=8.8658;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.057;VQSLOD=4.0511;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,94:202:99:2388,0,2899
14	77844869	.	A	G	1858.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.073;DP=151;Dels=0.00;FS=2.062;HRun=1;HaplotypeScore=1.8824;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=3.997;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.357;VQSLOD=3.7261;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,73:151:99:1888,0,1800
14	77845121	.	A	G	1022.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.511;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9833;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.029;QD=14.01;ReadPosRankSum=2.361;VQSLOD=4.4316;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,39:73:99:1053,0,945
14	77951124	.	C	T	2570.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=59.76;MQ0=0;QD=33.39;VQSLOD=10.0177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2604,217,0
14	78140355	.	T	A	854.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=71;Dels=0.00;FS=3.246;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.445;VQSLOD=5.4801;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,32:71:99:885,0,1057
14	78184566	.	C	A	7631.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.905;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4051;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.777;VQSLOD=7.1664;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,242:243:99:7595,573,0
14	78399644	.	C	A	1943.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=6.5410;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.809;VQSLOD=3.2699;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,71:152:99:1973,0,2161
14	78710044	.	G	A	1701.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5444;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.244;VQSLOD=5.7304;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,63:117:99:1732,0,1618
14	80669580	.	T	C	487.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.503;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.707;VQSLOD=11.9634;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,18:34:99:517,0,340
14	81251255	.	T	C	1474.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=120;Dels=0.00;FS=5.971;HRun=0;HaplotypeScore=5.9815;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=4.2683;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,57:120:99:1505,0,1580
14	81575005	.	C	A	1707.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.273;DP=137;Dels=0.00;FS=10.786;HRun=1;HaplotypeScore=4.9411;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=12.46;ReadPosRankSum=-2.026;VQSLOD=3.6435;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,65:137:99:1737,0,1778
14	81610583	.	G	C	5234.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0174;MQ=59.02;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=7.4302;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:5234,406,0
14	81737076	.	A	C	3995.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=2.820;HRun=0;HaplotypeScore=6.4290;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.041;VQSLOD=4.0588;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,127:245:99:3347,0,3341
14	81743718	.	C	T	1509.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.248;DP=116;Dels=0.00;FS=4.925;HRun=0;HaplotypeScore=1.9867;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.208;VQSLOD=5.6785;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,54:116:99:1539,0,1667
14	81744736	.	A	G	6605.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5704;MQ=59.82;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.2038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,206:206:99:6605,515,0
14	88401213	.	T	C	1498.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.73;MQ0=0;QD=28.28;VQSLOD=7.8882;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1532,123,0
14	88407888	.	A	G	1365.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=107;Dels=0.00;FS=3.915;HRun=0;HaplotypeScore=1.7234;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.626;VQSLOD=4.3010;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,55:107:99:1395,0,1388
14	88442712	.	C	T	996.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.713;DP=148;Dels=0.00;FS=1.416;HRun=1;HaplotypeScore=6.0621;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.334;VQSLOD=3.5663;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,47:148:99:1027,0,2732
14	88651962	.	C	T	2031.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=153;Dels=0.00;FS=4.739;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.334;VQSLOD=6.3358;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,76:153:99:2062,0,1935
14	88862529	.	G	A	1656.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.16;MQ0=0;QD=28.57;VQSLOD=7.1573;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1690,129,0
14	88938652	.	A	G	3795.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.63;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=8.7688;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3794,298,0
14	88946622	.	G	A	3017.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7199;MQ=59.54;MQ0=0;QD=29.87;VQSLOD=8.6678;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3050,235,0
14	91642395	.	G	A	284.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.600;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.664;VQSLOD=5.3333;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,15:51:99:314,0,1140
14	91739081	.	A	G	1073.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=14.1792;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:87.28:1107,87,0
14	91773494	.	G	A	435.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;DP=51;Dels=0.00;FS=2.692;HRun=0;HaplotypeScore=4.2748;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.785;VQSLOD=5.1638;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:51:99:465,0,759
14	92268615	.	T	G	3311.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8625;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.37;VQSLOD=6.9331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3311,268,0
14	92441066	.	C	T	536.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.847;DP=41;Dels=0.00;FS=1.786;HRun=0;HaplotypeScore=1.8924;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=13.08;ReadPosRankSum=-1.526;VQSLOD=5.8646;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:566,0,510
14	92548785	.	C	T	1557.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.798;DP=138;Dels=0.00;FS=4.111;HRun=1;HaplotypeScore=2.8264;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.306;VQSLOD=5.3503;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,62:138:99:1587,0,1966
14	93118038	.	A	G	2550.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.71;MQ0=0;QD=31.88;VQSLOD=8.8686;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2583,226,0
14	93276654	.	T	C	850.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=69;Dels=0.00;FS=0.945;HRun=0;HaplotypeScore=2.9782;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.069;VQSLOD=5.7214;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,30:69:99:880,0,1016
14	93399101	.	C	T	197.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.202;DP=15;Dels=0.00;FS=2.522;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.201;VQSLOD=5.9767;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:227,0,123
14	94088266	.	G	A	2176.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.554;DP=157;Dels=0.00;FS=5.878;HRun=1;HaplotypeScore=6.9601;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.874;VQSLOD=3.9750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,78:157:99:2206,0,2040
14	94088734	.	G	A	1712.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=177;Dels=0.00;FS=1.213;HRun=2;HaplotypeScore=9.8165;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=2.2986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,70:177:99:1743,0,2858
14	94391699	.	G	A	1850.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.9630;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1883,153,0
14	94756794	.	T	C	598.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.984;DP=55;Dels=0.00;FS=6.032;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.263;VQSLOD=5.2832;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,22:55:99:628,0,953
14	94931105	.	A	G	1245.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.342;DP=96;Dels=0.00;FS=8.366;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=12.97;ReadPosRankSum=2.579;VQSLOD=3.8573;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,53:96:99:1275,0,1110
14	94935901	.	G	C	1343.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.930;DP=114;Dels=0.00;FS=4.795;HRun=0;HaplotypeScore=2.4866;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.219;VQSLOD=5.7316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,52:114:99:1373,0,1781
14	94936110	.	G	A	2047.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.301;DP=144;Dels=0.00;FS=5.063;HRun=0;HaplotypeScore=3.8985;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.405;VQSLOD=3.9733;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,80:144:99:2077,0,1609
14	95053890	.	G	A	883.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7653;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.191;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.553;VQSLOD=5.0422;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,33:51:99:913,0,470
14	95912388	.	G	A	3097.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.025;DP=227;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2321;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.222;VQSLOD=5.2675;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,114:227:99:3127,0,2810
14	96010424	.	G	A	777.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.277;DP=47;Dels=0.00;FS=5.282;HRun=0;HaplotypeScore=3.5640;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.520;VQSLOD=4.3164;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,30:47:99:807,0,383
14	96157187	.	G	A	4922.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.18;MQ0=0;QD=34.66;VQSLOD=9.6951;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4922,382,0
14	96771959	.	A	G	1497.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=8.8997;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1530,114,0
14	96777468	.	G	C	3092.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;DP=242;Dels=0.00;FS=0.494;HRun=0;HaplotypeScore=5.9395;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.565;VQSLOD=5.0212;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,114:242:99:3122,0,3525
14	96781912	.	T	C	1058.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9831;MQ=55.71;MQ0=0;QD=28.62;VQSLOD=3.5711;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:81.26:1092,81,0
14	96922752	.	C	G	1361.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.954;DP=127;Dels=0.00;FS=6.948;HRun=0;HaplotypeScore=3.9960;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.755;VQSLOD=4.5402;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,52:127:99:1392,0,1998
14	99182626	.	T	C	1198.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;DP=96;Dels=0.00;FS=5.233;HRun=0;HaplotypeScore=3.2426;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.202;VQSLOD=5.6061;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,48:96:99:1229,0,1245
14	100380948	.	T	C	993.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.389;DP=76;Dels=0.00;FS=4.608;HRun=1;HaplotypeScore=1.8910;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.173;VQSLOD=5.9167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,37:76:99:1023,0,970
14	100795139	.	G	T	3144.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9800;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.45;VQSLOD=9.3738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3177,256,0
14	100847523	.	T	C	2438.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6420;MQ=57.77;MQ0=0;QD=30.48;VQSLOD=8.0451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2471,208,0
14	100847707	.	A	G	4068.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=58.48;MQ0=0;QD=30.82;VQSLOD=9.3115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4068,334,0
14	101198417	.	A	G	2821.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.76;MQ0=0;QD=29.39;VQSLOD=8.0411;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2855,244,0
14	102568367	.	T	A	5963.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.8006;MQ=58.71;MQ0=0;QD=28.54;VQSLOD=8.1609;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,208:209:99:5938,469,0
14	103576415	.	A	G	632.09	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=30.10;VQSLOD=8.2501;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:54.13:665,54,0
14	103934488	.	T	C	5074.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2312;MQ=58.59;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=6.6067;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:166:99:5074,403,0
14	104165753	.	G	A	313.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.164;VQSLOD=5.8846;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:344,0,485
14	104618742	.	C	G	44.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=3.010;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.214;VQSLOD=3.0980;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:74.04:74,0,211
14	105405599	.	G	C	2296.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62;VQSLOD=13.3871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2330,184,0
14	105406238	.	A	C	8312.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.31;MQ0=0;QD=33.93;VQSLOD=9.7636;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:8312,662,0
14	105406372	.	C	T	5665.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6875;MQ=59.86;MQ0=0;QD=35.63;VQSLOD=5.8088;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,158:159:99:5665,463,0
14	105407798	.	T	C	2333.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=9.3483;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2367,190,0
14	105408955	.	A	G	7714.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8457;MQ=52.70;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=2.9726;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:7713,656,0
14	105409907	.	T	C	7481.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3755;MQ=51.03;MQ0=2;QD=29.93;VQSLOD=3.1872;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7445,671,0
14	105410183	.	T	C	8248.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7270;MQ=58.72;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=8.5125;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:8247,707,0
14	105410411	.	C	T	8828.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.9386;MQ=59.35;MQ0=0;QD=35.31;VQSLOD=5.7868;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8827,710,0
14	105410827	.	C	T	8520.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0688;MQ=57.84;MQ0=0;QD=34.08;VQSLOD=5.9657;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:8520,686,0
14	105411700	.	A	G	8032	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.4227;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=32.13;ReadPosRankSum=0.263;VQSLOD=3.8486;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:7992,654,0
14	105411781	.	G	A	7702.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=3.880;HRun=0;HaplotypeScore=6.6118;MQ=53.12;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=30.94;ReadPosRankSum=-1.352;VQSLOD=2.2917;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,246:249:99:7664,575,0
14	105413204	.	G	T	8344.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8935;MQ=52.49;MQ0=3;QD=33.38;VQSLOD=3.2760;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8319,677,0
14	105414238	.	C	A	7666.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9606;MQ=39.73;MQ0=5;QD=30.67;VQSLOD=2.1903;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7664,686,0
14	105414280	.	T	G	7616.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.123;HRun=0;HaplotypeScore=6.6198;MQ=51.72;MQ0=1;MQRankSum=0.043;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.866;VQSLOD=2.1953;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:250:99:7538,640,0
14	105414629	.	G	A	8316.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5445;MQ=59.06;MQ0=0;QD=33.27;VQSLOD=6.8035;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8316,671,0
14	105414790	.	A	G	8934.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.316;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=5.3063;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=35.74;ReadPosRankSum=1.690;VQSLOD=6.4895;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:8900,686,0
14	105415745	.	C	G	7654.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6203;MQ=48.92;MQ0=5;QD=30.62;VQSLOD=3.1722;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:250:99:7653,626,0
14	105415748	.	G	A	7573.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=49.45;MQ0=4;QD=30.29;VQSLOD=4.2765;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7572,647,0
14	105416220	.	T	A	7728.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0988;MQ=51.25;MQ0=5;QD=31.04;VQSLOD=2.6052;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:249:99:7619,644,0
14	105417103	.	G	A	6796.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1797;MQ=47.82;MQ0=4;QD=27.19;VQSLOD=2.3937;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:6794,562,0
14	105418391	.	C	T	8266.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5521;MQ=53.61;MQ0=1;QD=33.07;VQSLOD=3.6970;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8265,683,0
14	105930406	.	G	A	4019.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5757;MQ=58.83;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=9.4155;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4019,319,0
14	105935824	.	G	A	1988.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82;VQSLOD=13.7756;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2022,162,0
15	22853786	.	C	T	162.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.130;DP=40;Dels=0.00;FS=3.223;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.648;VQSLOD=2.4292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,9:40:99:193,0,882
15	22864369	.	G	A	799.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.505;VQSLOD=4.9096;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,33:89:99:830,0,1519
15	24921649	.	T	C	680.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.186;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.093;VQSLOD=6.6760;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,25:49:99:711,0,631
15	24922230	.	C	G	4824.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5661;MQ=59.69;MQ0=0;QD=32.38;VQSLOD=8.6467;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4824,373,0
15	25926179	.	C	T	1303.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.926;DP=113;Dels=0.00;FS=0.727;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.385;VQSLOD=6.1164;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,55:113:99:1333,0,1394
15	29346242	.	G	A	1077.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.858;DP=107;Dels=0.00;FS=2.850;HRun=0;HaplotypeScore=4.5596;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.706;VQSLOD=4.0803;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,43:107:99:1107,0,1705
15	30025358	.	G	C	656.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.661;VQSLOD=5.1244;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,27:82:99:687,0,1422
15	30665280	.	TCA	T	797.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.287;DP=34;DS;FS=1.317;HRun=0;HaplotypeScore=115.1815;MQ=9.49;MQ0=192;MQRankSum=0.052;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.542;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,122:34:99:837,0,750
15	31197564	.	G	A	1838.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.4942;MQ=58.93;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=9.2299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1872,150,0
15	31362352	.	C	T	3019.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.845;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=6.076;HRun=3;HaplotypeScore=9.0314;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=-1.079;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.394;VQSLOD=3.9092;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,111:249:99:3049,0,4035
15	31369123	.	A	G	3567.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.97;MQ0=0;QD=28.77;VQSLOD=8.8495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3567,283,0
15	33357262	.	A	G	1841.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;DP=129;DS;Dels=0.00;FS=2.153;HRun=2;HaplotypeScore=4.4829;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.441;VQSLOD=5.8403;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,62:129:99:1872,0,2010
15	33359370	.	C	T	2002.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=169;Dels=0.00;FS=2.743;HRun=0;HaplotypeScore=3.9300;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.272;VQSLOD=5.9002;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,80:169:99:2033,0,2170
15	33359574	.	C	A	797.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=78;Dels=0.00;FS=6.504;HRun=1;HaplotypeScore=2.7122;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.990;VQSLOD=5.0339;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,32:78:99:828,0,1285
15	33954652	.	C	T	3353.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.76;MQ0=0;QD=35.30;VQSLOD=9.7481;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3353,262,0
15	34016274	.	G	A	2152.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.391;VQSLOD=8.4722;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,71:72:99:2185,175,0
15	34638198	.	A	G	2524.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.737;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.8186;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.671;VQSLOD=5.2412;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,106:189:99:2554,0,2073
15	34640218	.	C	T	6246.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2346;MQ=58.77;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=7.9862;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:192:99:6246,485,0
15	34649336	.	G	A	1083.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.817;DP=82;Dels=0.00;FS=1.923;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.517;VQSLOD=3.3659;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,42:82:99:1114,0,1120
15	36946303	.	C	G	81.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;DP=16;Dels=0.00;FS=6.317;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.061;VQSLOD=3.2422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:112,0,299
15	38988815	.	C	G	1116.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;DP=80;Dels=0.00;FS=0.839;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.265;VQSLOD=5.8003;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,41:80:99:1146,0,1017
15	40018945	.	C	A	280.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=43;Dels=0.00;FS=1.406;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.501;VQSLOD=3.6071;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,12:43:99:310,0,825
15	40265799	.	A	G	5519.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6732;MQ=58.90;MQ0=0;QD=30.16;VQSLOD=9.1085;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:5519,418,0
15	40308859	.	G	T	1139.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.277;DP=98;Dels=0.00;FS=2.660;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.523;VQSLOD=5.7637;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,43:98:99:1170,0,1449
15	40477831	.	G	A	1648.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=147;Dels=0.01;FS=1.439;HRun=1;HaplotypeScore=2.6053;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.371;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.671;VQSLOD=6.3239;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,67:147:99:1678,0,2027
15	40558064	.	A	G	1899.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=9.1454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:1933,150,0
15	40558482	.	A	G	831.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;QD=30.78;VQSLOD=8.8546;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.21:864,72,0
15	40655845	.	C	G	3001.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=0.481;HRun=1;HaplotypeScore=6.0282;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.935;VQSLOD=4.5243;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,116:237:99:3031,0,3302
15	40685406	.	A	T	1556.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;DP=130;Dels=0.00;FS=1.392;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=5.3824;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,65:130:99:1587,0,1506
15	40750740	.	A	G	2862.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.248;DP=223;DS;Dels=0.00;FS=3.291;HRun=2;HaplotypeScore=8.0888;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.659;VQSLOD=4.4469;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,103:223:99:2892,0,3238
15	40751555	.	C	A	1515.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.964;DP=128;Dels=0.00;FS=0.652;HRun=1;HaplotypeScore=2.9142;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.533;VQSLOD=6.3765;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,62:128:99:1545,0,1752
15	40898643	.	G	C	1076.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.91;VQSLOD=7.3796;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:40:81.27:1109,81,0
15	40913840	.	G	T	1497.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=14.1050;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1530,123,0
15	40914177	.	T	C	2100.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=9.2411;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2134,172,0
15	40915190	.	A	G	2514.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8401;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=32.65;ReadPosRankSum=1.282;VQSLOD=8.7354;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,76:77:99:2547,199,0
15	40916801	.	A	G	1230.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.657;DP=86;Dels=0.00;FS=3.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.057;VQSLOD=6.6601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,48:86:99:1260,0,969
15	41105926	.	T	G	984.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95;VQSLOD=13.8506;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:75.24:1017,75,0
15	41247859	.	A	T	1289	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.970;DP=114;Dels=0.00;FS=0.768;HRun=1;HaplotypeScore=2.6665;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.278;VQSLOD=5.2993;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,47:114:99:1319,0,1872
15	41339697	.	T	C	375.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.261;DP=34;Dels=0.00;FS=1.317;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.05;ReadPosRankSum=3.157;VQSLOD=4.4396;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:406,0,459
15	41476209	.	T	C	3660.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.80;MQ0=0;QD=31.83;VQSLOD=9.5789;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3660,283,0
15	41679685	.	G	C	1438.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.792;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8561;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.266;VQSLOD=5.1219;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,54:105:99:1469,0,1239
15	41815516	.	G	C	1528.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.60;MQ0=0;QD=31.84;VQSLOD=8.9475;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1562,120,0
15	41819716	.	C	T	1306.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.151;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9788;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.050;VQSLOD=6.3612;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,50:85:99:1336,0,802
15	41991315	.	A	T	569.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90;VQSLOD=12.9407;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:48.14:603,48,0
15	42032383	.	C	G	874.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;DP=82;Dels=0.00;FS=4.817;HRun=0;HaplotypeScore=3.5634;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.513;VQSLOD=4.6811;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,34:82:99:904,0,1354
15	42115747	.	G	C	1792.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.664;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6205;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.142;VQSLOD=4.4577;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,64:118:99:1822,0,1285
15	42145936	.	G	C	172.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.177;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.236;VQSLOD=4.8357;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:203,0,233
15	42149596	.	C	G	231.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=17;Dels=0.00;FS=1.913;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=13.60;ReadPosRankSum=1.708;VQSLOD=5.6205;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:261,0,218
15	42150888	.	G	A	267.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.171;DP=27;Dels=0.00;FS=1.507;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.561;VQSLOD=6.2035;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:297,0,406
15	42166500	.	C	T	928.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;DP=94;Dels=0.00;FS=2.780;HRun=0;HaplotypeScore=4.8561;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.760;VQSLOD=4.6030;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,39:94:99:958,0,1498
15	42168400	.	C	T	964.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=52;Dels=0.00;FS=7.012;HRun=0;HaplotypeScore=2.6342;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.757;VQSLOD=3.9422;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,37:52:99:994,0,359
15	42171537	.	A	G	3046.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.82;MQ0=0;QD=28.20;VQSLOD=7.7115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3079,247,0
15	42178155	.	T	C	244.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.47;VQSLOD=12.6818;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:21.07:278,21,0
15	42278168	.	C	T	349.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.300;DP=25;Dels=0.00;FS=6.402;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.804;VQSLOD=4.6280;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:380,0,246
15	42434837	.	T	C	1255.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;DP=103;Dels=0.00;FS=4.941;HRun=0;HaplotypeScore=3.5751;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.052;VQSLOD=5.4340;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,50:103:99:1286,0,1392
15	42568547	.	C	G	1194.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14;VQSLOD=6.6915;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:90.29:1227,90,0
15	42570718	.	A	G	1359.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.981;DP=138;Dels=0.00;FS=2.198;HRun=2;HaplotypeScore=1.4972;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.486;VQSLOD=6.6148;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,63:138:99:1389,0,1890
15	42643529	.	T	C	1408.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.984;DP=96;Dels=0.00;FS=3.059;HRun=0;HaplotypeScore=1.9933;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.150;VQSLOD=6.0823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,50:96:99:1438,0,1313
15	42681199	.	G	A	2015.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4610;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.390;VQSLOD=5.1957;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,79:159:99:2045,0,2318
15	42742435	.	T	C	3871.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.769;DP=230;Dels=0.00;FS=0.484;HRun=0;HaplotypeScore=3.8813;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.534;VQSLOD=5.4579;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,118:230:99:3302,0,2794
15	43317071	.	T	C	3001.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.347;DP=240;Dels=0.00;FS=2.194;HRun=0;HaplotypeScore=6.9753;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=3.4781;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,114:240:99:3032,0,3384
15	43712823	.	C	T	1425.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=120;Dels=0.00;FS=1.478;HRun=2;HaplotypeScore=6.6496;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.911;VQSLOD=4.5800;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,53:120:99:1455,0,1653
15	44120559	.	T	G	1546.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.0031;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.463;VQSLOD=4.2982;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,58:115:99:1577,0,1483
15	45047573	.	C	T	667.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.039;DP=59;Dels=0.00;FS=1.118;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.057;VQSLOD=5.5542;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,27:59:99:698,0,792
15	45361180	.	A	T	173.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.040;DP=15;Dels=0.00;FS=3.123;HRun=0;HaplotypeScore=1.5449;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.652;VQSLOD=2.8745;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:203,0,172
15	45392075	.	G	A	2127.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7653;MQ=59.63;MQ0=0;QD=33.77;VQSLOD=9.5248;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2161,175,0
15	45404066	.	G	A	1413.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.61;MQ0=0;QD=29.45;VQSLOD=8.5093;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1446,114,0
15	45408414	.	C	G	5653.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9970;MQ=59.16;MQ0=0;QD=30.40;VQSLOD=8.7451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:186:99:5620,442,0
15	45444133	.	T	C	1449.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.692;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.0748;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.927;VQSLOD=4.9174;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,58:127:99:1480,0,1968
15	45446156	.	C	T	758.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.248;DP=96;Dels=0.00;FS=5.523;HRun=1;HaplotypeScore=2.6500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.129;VQSLOD=3.5548;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,35:96:99:789,0,1686
15	45467540	.	C	G	545.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28;VQSLOD=13.3743;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:45.14:578,45,0
15	45545478	.	C	T	1296.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=30.88;VQSLOD=8.6431;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1330,102,0
15	45554267	.	C	A	6288.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9075;MQ=59.22;MQ0=0;QD=28.85;VQSLOD=8.5255;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:218:99:6287,488,0
15	48058071	.	G	A	1148.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.533;DP=111;Dels=0.00;FS=0.761;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.991;VQSLOD=6.4215;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,48:111:99:1179,0,1724
15	48443699	.	T	C	6179.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.2887;MQ=58.34;MQ0=0;QD=27.59;VQSLOD=5.3865;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:224:99:6179,472,0
15	48460927	.	C	T	4427.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.59;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=7.6550;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4427,349,0
15	48623812	.	G	A	164.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.741;VQSLOD=11.5347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:194,0,120
15	48807637	.	C	T	3166.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.05;VQSLOD=8.2177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3200,268,0
15	49293194	.	C	A	1154.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.493;DP=88;Dels=0.00;FS=2.909;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=6.6747;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,47:88:99:1184,0,1141
15	50189566	.	A	G	1685.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.009;DP=205;Dels=0.00;FS=1.138;HRun=0;HaplotypeScore=8.5349;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=1.551;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.426;VQSLOD=2.9246;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,78:205:99:1715,0,3178
15	50226313	.	G	T	1382.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.608;DP=88;Dels=0.00;FS=1.961;HRun=1;HaplotypeScore=4.5050;MQ=58.21;MQ0=1;MQRankSum=-0.074;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.232;VQSLOD=4.2543;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,54:88:99:1412,0,873
15	50279662	.	T	C	766	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.096;VQSLOD=6.6321;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,28:80:99:796,0,1300
15	50474766	.	A	C	926.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=33.09;VQSLOD=8.8521;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:78.24:960,78,0
15	51217361	.	T	C	864.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.167;DP=92;Dels=0.00;FS=0.827;HRun=4;HaplotypeScore=1.7128;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.749;VQSLOD=6.5038;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,38:92:99:895,0,1435
15	51689772	.	G	A	1519.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=9.3329;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1553,126,0
15	51791559	.	A	G	8157.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.32;MQ0=0;QD=33.03;VQSLOD=9.8017;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:247:99:8156,632,0
15	52689631	.	T	G	4468.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8628;MQ=59.33;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=9.0284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4468,343,0
15	52901433	.	C	T	1288.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90;VQSLOD=13.8027;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1321,108,0
15	54003091	.	G	A	1147.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;DP=89;Dels=0.00;FS=4.008;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=12.90;ReadPosRankSum=2.614;VQSLOD=4.7218;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,44:89:99:1178,0,1112
15	54008845	.	T	C	4462.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.82;MQ0=0;QD=28.24;VQSLOD=8.0888;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:4461,355,0
15	54306925	.	G	A	5698.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.93;MQ0=0;QD=31.83;VQSLOD=9.3980;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5698,442,0
15	55632859	.	G	T	461.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;DP=39;Dels=0.00;FS=1.264;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=11.85;ReadPosRankSum=2.149;VQSLOD=5.8753;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:492,0,510
15	55652187	.	T	C	3777	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.895;DP=206;Dels=0.00;FS=6.006;HRun=1;HaplotypeScore=2.9930;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.902;VQSLOD=2.5891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,121:206:99:3301,0,1990
15	55789910	.	C	T	1113.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=120;Dels=0.00;FS=7.828;HRun=0;HaplotypeScore=4.8233;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.699;VQSLOD=4.4275;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,47:120:99:1143,0,1947
15	56152729	.	T	C	3297.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.82;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=9.3810;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3297,253,0
15	56152872	.	C	T	4951.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=9.6172;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:4951,385,0
15	56386577	.	T	G	6680.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4167;MQ=59.43;MQ0=0;QD=33.24;VQSLOD=9.5586;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:6680,515,0
15	56923895	.	C	A	1915.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.710;DP=152;Dels=0.00;FS=0.636;HRun=0;HaplotypeScore=2.3017;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.105;VQSLOD=5.6705;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,72:152:99:1945,0,2146
15	57731335	.	A	C	5457.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.048;DP=168;Dels=0.00;FS=4.616;HRun=1;HaplotypeScore=1.9937;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=4.7069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,167:168:99:5421,395,0
15	57731573	.	C	T	1027.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;DP=78;Dels=0.00;FS=1.883;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.657;VQSLOD=6.8234;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,36:78:99:1057,0,1245
15	57731728	.	A	G	1128.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=114;Dels=0.00;FS=2.573;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.811;VQSLOD=6.1077;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,44:114:99:1158,0,1827
15	58256127	.	C	T	1876.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=125;Dels=0.00;FS=6.933;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.076;VQSLOD=5.0746;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,71:125:99:1907,0,1347
15	58476281	.	A	G	4025.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.02;MQ0=0;QD=34.12;VQSLOD=9.8043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:4026,313,0
15	58838010	.	A	G	4388.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=9.3645;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4388,340,0
15	59499179	.	G	A	474.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;DP=65;Dels=0.00;FS=2.284;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.087;VQSLOD=3.8321;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,20:65:99:504,0,1214
15	59499228	.	C	T	965.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.115;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1179;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.094;VQSLOD=4.4595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,37:93:99:995,0,1582
15	59500116	.	T	C	2080.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.703;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.5997;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.014;VQSLOD=4.2759;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,81:156:99:2111,0,1922
15	62202482	.	C	T	2082.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77;VQSLOD=13.6584;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2116,163,0
15	63414083	.	A	C	281.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.46;VQSLOD=13.1536;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:24.07:314,24,0
15	63433766	.	G	A	1410.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.330;VQSLOD=6.4167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,54:106:99:1440,0,1445
15	63889941	.	A	G	638.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=62;Dels=0.00;FS=1.057;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.316;VQSLOD=4.4888;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,25:62:99:668,0,963
15	63937209	.	C	G	1640.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;DP=149;Dels=0.00;FS=0.644;HRun=1;HaplotypeScore=4.6499;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.931;VQSLOD=5.2484;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,66:149:99:1671,0,2264
15	63988357	.	C	G	792.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;DP=46;Dels=0.00;FS=1.280;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.280;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=3.6581;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,32:46:99:822,0,286
15	65108504	.	A	T	811.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.107;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.5777;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.813;VQSLOD=6.2863;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:78:99:842,0,1033
15	65157482	.	C	T	974.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=92;Dels=0.00;FS=0.797;HRun=0;HaplotypeScore=6.4731;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.715;VQSLOD=4.5728;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,41:92:99:1004,0,1417
15	65235776	.	A	G	1547.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;DP=153;DS;Dels=0.00;FS=10.594;HRun=0;HaplotypeScore=3.4321;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.416;VQSLOD=3.8957;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,58:153:99:1578,0,2711
15	65489128	.	C	T	2326.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.1557;MQ=58.86;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=9.1026;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:74:99:2360,190,0
15	65489688	.	T	C	4389.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.3588;MQ=59.28;MQ0=0;QD=30.91;VQSLOD=8.2235;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,142:142:99:4389,358,0
15	65490901	.	T	C	4521.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=59.11;MQ0=0;QD=32.76;VQSLOD=9.8051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4521,358,0
15	65494212	.	A	G	701.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.490;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.510;VQSLOD=7.1436;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,26:50:99:731,0,606
15	65621441	.	C	A	191.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.757;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.019;VQSLOD=5.7772;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:222,0,375
15	65676726	.	C	T	3130.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-11.649;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.935;HRun=0;HaplotypeScore=4.3595;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.189;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.073;VQSLOD=3.8612;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,124:250:99:3161,0,3594
15	65677446	.	C	A	335.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.586;VQSLOD=5.7571;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:365,0,467
15	65916527	.	A	T	1109.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.826;DP=73;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=1;HaplotypeScore=5.8578;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.085;VQSLOD=4.8739;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,38:73:99:1139,0,854
15	66257408	.	T	C	539.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.71;MQ0=0;QD=29.97;VQSLOD=9.0498;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:48.13:572,48,0
15	66618342	.	A	G	4923.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.7253;MQ=59.24;MQ0=0;QD=33.96;VQSLOD=9.0623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4923,388,0
15	66644521	.	C	G	2341.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6965;MQ=59.55;MQ0=0;QD=28.21;VQSLOD=7.9423;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2375,175,0
15	66735693	.	G	T	608.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.035;DP=52;Dels=0.00;FS=7.260;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.368;VQSLOD=3.4847;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,23:52:99:638,0,766
15	67528374	.	T	G	1854.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=158;Dels=0.00;FS=1.281;HRun=1;HaplotypeScore=5.8276;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.310;VQSLOD=5.1540;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,77:158:99:1884,0,1957
15	67768151	.	G	C	3049.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=8.7721;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3082,235,0
15	68624396	.	A	C	536.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.83;VQSLOD=8.0391;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.13:570,48,0
15	69238445	.	G	A	3866.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=8.7513;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:127:99:3866,295,0
15	69328226	.	C	T	7608.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.9735;MQ=58.87;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=7.3751;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,237:238:99:7576,593,0
15	69561518	.	G	A	7866.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6120;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=32.24;ReadPosRankSum=1.704;VQSLOD=7.1826;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,243:244:99:7865,641,0
15	72191266	.	C	T	7175.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.1229;MQ=58.30;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=7.0271;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:7174,563,0
15	72432583	.	A	G	2500.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.69;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=9.2316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2533,193,0
15	72638892	.	T	C	6476.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7596;MQ=59.91;MQ0=0;QD=30.69;VQSLOD=8.0132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6475,530,0
15	73027478	.	T	C	3044.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.77;MQ0=0;QD=30.44;VQSLOD=9.1496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3077,232,0
15	74219582	.	G	A	1007.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.180;DP=81;Dels=0.00;FS=5.992;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.033;VQSLOD=4.9436;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,41:81:99:1038,0,1112
15	74328116	.	A	G	1515.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=109;Dels=0.00;FS=9.087;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.106;VQSLOD=4.0028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,53:109:99:1545,0,1652
15	74328206	.	G	C	2521.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.203;DP=186;Dels=0.00;FS=5.237;HRun=2;HaplotypeScore=3.8281;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.246;VQSLOD=4.1485;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,98:186:99:2551,0,2279
15	74336633	.	T	C	5946.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;QD=32.49;VQSLOD=9.5403;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:5945,463,0
15	74622678	.	G	A	161.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.910;VQSLOD=11.3215;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:191,0,227
15	75108636	.	G	A	289.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.279;DP=20;Dels=0.00;FS=2.629;HRun=0;HaplotypeScore=3.3544;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.912;VQSLOD=4.0971;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:319,0,214
15	75130093	.	T	C	709.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;QD=30.86;VQSLOD=8.6353;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:60.17:743,60,0
15	75336729	.	A	G	2934.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6407;MQ=58.92;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=8.9627;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2967,226,0
15	75499861	.	G	A	3785.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.3433;MQ=59.16;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=6.1207;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,126:127:99:3784,310,0
15	75503147	.	G	A	2090.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.63;MQ0=0;QD=33.19;VQSLOD=9.6129;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2124,178,0
15	75970070	.	C	T	5899.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.5859;MQ=59.77;MQ0=0;QD=29.06;VQSLOD=4.2671;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,195:202:99:5898,490,0
15	76017452	.	C	T	3325.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6026;MQ=58.87;MQ0=0;QD=33.26;VQSLOD=9.1005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:100:99:3326,262,0
15	77407114	.	C	G	819.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=62;Dels=0.00;FS=3.617;HRun=4;HaplotypeScore=4.4757;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.637;VQSLOD=4.3910;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,33:62:99:850,0,823
15	77450964	.	C	T	747.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;DP=77;Dels=0.00;FS=4.633;HRun=1;HaplotypeScore=1.5115;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.941;VQSLOD=5.9164;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,29:77:99:778,0,1421
15	78390414	.	T	C	401.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9662;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.723;VQSLOD=6.6412;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,17:35:99:432,0,463
15	78466037	.	C	G	1263.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.405;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.138;VQSLOD=4.7066;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,49:119:99:1293,0,1806
15	78466127	.	T	C	1245.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=95;Dels=0.00;FS=5.265;HRun=0;HaplotypeScore=4.9518;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.951;VQSLOD=5.0241;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,45:95:99:1275,0,1308
15	78758677	.	G	C	2156.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.28;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=8.5785;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2189,172,0
15	78780104	.	T	C	3996.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4896;MQ=58.62;MQ0=0;QD=30.51;VQSLOD=9.2539;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:3996,307,0
15	79054900	.	C	G	281.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=29;Dels=0.00;FS=3.780;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.111;VQSLOD=5.1859;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:312,0,512
15	80191343	.	G	A	2981.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.351;DP=100;Dels=0.00;FS=3.424;HRun=0;HaplotypeScore=7.9753;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=29.82;ReadPosRankSum=1.351;VQSLOD=2.6512;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,99:100:99:3015,204,0
15	80263217	.	C	T	3200.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.052;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=2.875;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.997;VQSLOD=6.6443;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,127:243:99:3231,0,3211
15	80263345	.	A	C	2782.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8136;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.420;VQSLOD=6.1643;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,105:192:99:2813,0,2257
15	80263406	.	C	T	1544.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=108;Dels=0.00;FS=3.737;HRun=0;HaplotypeScore=9.5864;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.640;VQSLOD=4.4018;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,57:108:99:1574,0,1480
15	80855492	.	T	A	3963.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.622;DP=224;DS;Dels=0.00;FS=3.236;HRun=0;HaplotypeScore=5.1080;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.225;VQSLOD=3.0957;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,115:224:99:3340,0,3006
15	81624768	.	C	T	458.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.36;MQ0=1;QD=30.58;VQSLOD=8.4800;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.12:492,39,0
15	81625385	.	C	T	4891.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.59;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=10.0597;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4891,394,0
15	82555242	.	A	G	102.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.424;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.312;VQSLOD=5.2508;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:132,0,196
15	82563991	.	C	T	808.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.087;DP=73;Dels=0.00;FS=0.936;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.003;VQSLOD=6.0405;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,33:73:99:838,0,958
15	82574879	.	T	C	1295.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;DP=102;Dels=0.00;FS=3.898;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.275;VQSLOD=5.8416;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,50:102:99:1325,0,1394
15	83495214	.	T	A	3143.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.704;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.545;HRun=2;HaplotypeScore=1.9134;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.055;VQSLOD=5.7569;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,128:249:99:3173,0,3149
15	83680287	.	A	G	522.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.805;VQSLOD=6.4476;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,23:52:99:553,0,830
15	83781599	.	T	G	2332.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.342;DP=190;Dels=0.00;FS=1.122;HRun=1;HaplotypeScore=3.8066;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.437;VQSLOD=5.2272;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,94:190:99:2363,0,2550
15	84539619	.	C	G	2622.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;QD=31.60;VQSLOD=9.8389;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2656,202,0
15	84611367	.	G	C	1932	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.226;DP=143;Dels=0.00;FS=0.644;HRun=0;HaplotypeScore=1.7878;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.882;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.269;VQSLOD=4.3163;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,76:143:99:1962,0,1708
15	84639350	.	C	T	3009.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.866;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=5.738;HRun=1;HaplotypeScore=3.4868;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.371;VQSLOD=5.3217;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,116:220:99:3040,0,2655
15	85149771	.	G	T	2252.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=9.5696;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2285,178,0
15	85163998	.	G	C	3562.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.4993;MQ=59.62;MQ0=0;QD=32.09;VQSLOD=8.7713;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3562,283,0
15	85401259	.	C	T	82.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.278;VQSLOD=10.3940;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:113,0,176
15	85478729	.	G	A	4778.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5707;MQ=59.07;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.2447;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4778,370,0
15	86122654	.	T	C	2706.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=8.6001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2739,223,0
15	86122779	.	T	C	3722.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.54;VQSLOD=8.9910;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3722,304,0
15	86123019	.	C	T	6166.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=30.23;VQSLOD=9.0354;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:204:99:6166,469,0
15	86123170	.	G	T	1383.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.648;DP=112;Dels=0.00;FS=3.570;HRun=0;HaplotypeScore=1.9976;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.120;VQSLOD=6.2941;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,52:112:99:1413,0,1826
15	86123364	.	G	A	1998.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.603;DP=170;DS;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=11.76;ReadPosRankSum=-2.261;VQSLOD=4.7845;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,73:170:99:2029,0,2615
15	86123833	.	T	C	5511.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.8114;MQ=59.12;MQ0=0;QD=31.68;VQSLOD=6.0631;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:5511,427,0
15	86123988	.	G	A	4777.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8308;MQ=59.56;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=9.1878;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4777,388,0
15	86124483	.	C	G	4521.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=9.2049;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,134:134:99:4521,346,0
15	86124555	.	G	A	4740.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8273;MQ=59.84;MQ0=0;QD=33.86;VQSLOD=9.1901;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4740,370,0
15	86124946	.	T	C	2092.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.32;VQSLOD=9.3739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2125,177,0
15	86278309	.	G	A	4006.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.517;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=1.692;HRun=0;HaplotypeScore=8.4258;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.252;VQSLOD=4.2919;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,119:239:99:3371,0,3227
15	87217613	.	A	G	1315.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.09;MQ0=0;QD=28.59;VQSLOD=8.2747;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:46:99:1348,114,0
15	89169858	.	A	G	6185.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.89;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=9.1285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:6184,490,0
15	89398605	.	G	T	2690.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9980;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=32.42;ReadPosRankSum=1.398;VQSLOD=3.8108;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,82:83:99:2724,195,0
15	89398631	.	T	A	3544.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=54.35;MQ0=0;QD=34.41;VQSLOD=6.7593;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,103:103:99:3544,292,0
15	89400339	.	A	C	3940.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7257;MQ=59.33;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=8.5519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3940,304,0
15	89401109	.	A	G	3568.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4359;MQ=58.91;MQ0=0;QD=34.99;VQSLOD=8.6186;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3568,286,0
15	89402051	.	A	G	1085.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=8.6923;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:93.26:1118,93,0
15	89417238	.	A	G	455.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;DP=45;Dels=0.00;FS=2.781;HRun=1;HaplotypeScore=2.9929;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.730;VQSLOD=5.6120;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,18:45:99:485,0,702
15	89450587	.	G	T	3811.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7329;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=29.32;ReadPosRankSum=-1.061;VQSLOD=8.3074;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,129:130:99:3771,262,0
15	89804043	.	C	T	4502.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.01;MQ0=0;QD=30.22;VQSLOD=9.0578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4502,355,0
15	89836228	.	G	C	2661.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.77;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=8.8759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2695,205,0
15	90126121	.	C	T	1492.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=135;Dels=0.00;FS=3.368;HRun=0;HaplotypeScore=3.4088;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.204;VQSLOD=5.5337;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,58:135:99:1522,0,1903
15	90128966	.	C	T	626.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.047;DP=54;Dels=0.00;FS=1.335;HRun=0;HaplotypeScore=4.6250;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.644;VQSLOD=5.2232;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,23:54:99:657,0,830
15	90168108	.	C	T	7547.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9770;MQ=59.55;MQ0=0;QD=33.11;VQSLOD=9.2417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,228:228:99:7547,587,0
15	90168171	.	C	T	2224.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.667;DP=196;Dels=0.00;FS=1.798;HRun=0;HaplotypeScore=1.9025;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.945;VQSLOD=4.8412;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,91:196:99:2254,0,2799
15	90168693	.	T	A	829.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.887;DP=71;Dels=0.00;FS=0.893;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.458;VQSLOD=6.8166;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,31:71:99:859,0,1114
15	90170237	.	C	T	4322.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.889;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=1;HaplotypeScore=6.6390;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.314;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.380;VQSLOD=3.4376;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,131:243:99:3671,0,2842
15	90174824	.	C	T	122.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.355;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=5.6305;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:153,0,227
15	90213229	.	G	C	1304.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=8.8867;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1338,105,0
15	90245174	.	T	A	2551.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.50;VQSLOD=8.8938;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2585,208,0
15	90260145	.	T	A	1822.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.20;VQSLOD=8.0532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1856,144,0
15	90335788	.	C	T	1187.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.402;DP=88;Dels=0.00;FS=6.388;HRun=1;HaplotypeScore=6.1905;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.411;VQSLOD=4.2611;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,45:88:99:1218,0,1213
15	90610934	.	C	G	141.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.275;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.380;VQSLOD=2.7291;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:172,0,468
15	90764219	.	G	A	384.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=13.27;ReadPosRankSum=-1.069;VQSLOD=5.8475;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:415,0,378
15	90771750	.	T	G	487.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47;VQSLOD=13.2192;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.12:520,42,0
15	90784207	.	A	G	7527.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.5619;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=30.11;ReadPosRankSum=1.621;VQSLOD=6.7141;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,248:249:99:7494,621,0
15	90784250	.	T	C	7817.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.61;MQ0=0;QD=31.27;VQSLOD=8.7738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7815,656,0
15	90903311	.	A	G	3755.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.129;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8640;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.816;VQSLOD=8.7404;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,120:121:99:3718,251,0
15	91454691	.	C	A	1894.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=147;DS;Dels=0.00;FS=5.606;HRun=0;HaplotypeScore=1.5717;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.777;VQSLOD=4.0284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,71:147:99:1925,0,1873
15	91524841	.	G	T	3361.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8255;MQ=59.06;MQ0=0;QD=30.84;VQSLOD=8.5693;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3361,265,0
15	92647645	.	G	C	3450	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=8.2304;MQ=59.36;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=4.9155;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3450,268,0
15	92690379	.	A	G	1703.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.264;DP=185;Dels=0.00;FS=8.961;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=2.1952;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,73:185:99:1733,0,3175
15	93588336	.	A	C	713.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=12.6380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:60.18:747,60,0
15	98513845	.	T	C	1703.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.14;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=9.1669;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1737,135,0
15	98995081	.	A	G	1546.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.38;MQ0=0;QD=30.93;VQSLOD=7.1867;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1579,126,0
15	99511793	.	C	G	802.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=8.9491;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:63.21:835,63,0
15	99511804	.	A	AC	1032.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=138.7008;MQ=59.51;MQ0=0;QD=41.32;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:72.24:1075,72,0
15	99653800	.	T	C	1559.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.5345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1592,129,0
15	99669628	.	A	T	2403.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=215;Dels=0.00;FS=1.769;HRun=0;HaplotypeScore=4.5711;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.082;VQSLOD=5.3039;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,95:215:99:2434,0,3377
15	99670161	.	C	T	864.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.660;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3883;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.069;VQSLOD=4.4238;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,31:68:99:894,0,941
15	99670278	.	C	T	934.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=79;Dels=0.00;FS=0.870;HRun=0;HaplotypeScore=5.3644;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.087;VQSLOD=5.2087;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,37:79:99:964,0,1064
15	99670989	.	T	C	2591.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;QD=33.23;VQSLOD=9.6130;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2625,202,0
15	99671760	.	T	C	868.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95;VQSLOD=13.7373;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:69.22:901,69,0
15	99672722	.	A	G	8599.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.8754;MQ=59.44;MQ0=0;QD=34.40;VQSLOD=7.4551;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8599,671,0
15	100269680	.	G	C	1959.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.135;DP=152;Dels=0.00;FS=3.884;HRun=1;HaplotypeScore=6.4589;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.662;VQSLOD=4.0206;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,72:152:99:1989,0,2355
15	100514614	.	T	C	4014.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.541;DP=128;Dels=0.00;FS=3.479;HRun=0;HaplotypeScore=2.8305;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=31.36;ReadPosRankSum=1.405;VQSLOD=4.4098;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,126:128:99:3982,306,0
15	100692845	.	A	G	2394.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.934;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.578;HRun=0;HaplotypeScore=6.4130;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.943;VQSLOD=4.3114;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,102:245:99:2424,0,3750
15	100692953	.	G	A	1969.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.472;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6475;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.115;VQSLOD=4.2484;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,71:103:99:2000,0,846
15	100942962	.	T	C	2110.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.18;MQ0=0;QD=28.53;VQSLOD=8.5780;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2144,172,0
15	101109677	.	C	A	988.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.228;DP=80;Dels=0.00;FS=6.120;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.828;VQSLOD=5.3060;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,39:80:99:1019,0,1120
15	101109794	.	C	G	1615.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6522;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.074;VQSLOD=5.9243;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,66:150:99:1645,0,2211
15	101110302	.	C	G	1131.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=87;Dels=0.00;FS=0.813;HRun=1;HaplotypeScore=1.8930;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.794;VQSLOD=5.8778;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,43:87:99:1162,0,1079
15	101113862	.	C	T	1416.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.58;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=9.3557;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1450,117,0
15	101120963	.	T	C	771.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.420;VQSLOD=6.4009;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,31:43:99:801,0,254
15	101606889	.	G	A	2562.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.706;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=6.841;HRun=0;HaplotypeScore=6.5968;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.762;VQSLOD=3.8246;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,101:216:99:2592,0,3161
15	101924546	.	C	T	637.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;DP=45;Dels=0.00;FS=1.157;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.490;VQSLOD=6.1260;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,24:45:99:668,0,593
15	102192548	.	A	C	607.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=27.59;ReadPosRankSum=-1.073;VQSLOD=5.7380;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:60.14:640,60,0
15	102264476	.	C	A	209.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.031;DP=23;Dels=0.00;FS=1.808;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.651;VQSLOD=5.3654;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:239,0,355
16	103517	.	A	C	2251.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.11;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=8.4363;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2285,187,0
16	138772	.	A	AG	1259.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=77.9109;MQ=58.82;MQ0=0;QD=42.00;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,29:30:87.29:1302,87,0
16	319511	.	A	G	546.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.494;DP=64;Dels=0.00;FS=1.023;HRun=0;HaplotypeScore=2.9882;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.260;VQSLOD=5.8774;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,26:64:99:577,0,984
16	320583	.	C	T	52.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=8.8690;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:82.04:82,0,169
16	320629	.	C	T	211.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=16;Dels=0.00;FS=2.081;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.788;VQSLOD=5.6054;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:241,0,188
16	334890	.	G	A	1275.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.572;DP=80;Dels=0.00;FS=9.486;HRun=1;HaplotypeScore=2.9978;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.684;VQSLOD=4.1608;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,43:80:99:1306,0,846
16	336396	.	G	A	719.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.626;DP=69;Dels=0.00;FS=8.959;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.217;VQSLOD=4.1152;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,30:69:99:749,0,952
16	336916	.	C	T	137.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;DP=15;Dels=0.00;FS=2.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.295;VQSLOD=3.7821;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:168,0,264
16	417757	.	T	C	940.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.521;DP=70;Dels=0.00;FS=8.737;HRun=0;HaplotypeScore=1.7900;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.857;VQSLOD=3.5511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,35:70:99:971,0,910
16	420140	.	G	A	293.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.087;VQSLOD=6.0653;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:324,0,213
16	426432	.	T	C	1102.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;QD=29.78;VQSLOD=8.7540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1135,102,0
16	427479	.	T	C	651.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31;VQSLOD=12.6094;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.16:684,57,0
16	615048	.	G	A	163.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.176;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.220;VQSLOD=5.0962;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:193,0,163
16	624114	.	A	G	256.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.272;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.527;VQSLOD=5.3225;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,13:37:99:286,0,676
16	633125	.	T	C	2265.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.6624;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.084;VQSLOD=6.7462;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,83:174:99:2296,0,2632
16	633353	.	T	C	1397.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.947;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6880;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.054;VQSLOD=4.2126;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,51:110:99:1427,0,1627
16	633354	.	G	A	1309.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.6880;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.192;VQSLOD=4.9299;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,51:110:99:1340,0,1692
16	774692	.	A	G	203.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.102;VQSLOD=5.9428;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:233,0,290
16	818559	.	A	G	333.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;DP=21;Dels=0.00;FS=4.123;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.178;VQSLOD=5.7739;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:363,0,249
16	1129872	.	C	T	295.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.876;DP=28;Dels=0.00;FS=1.520;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.091;VQSLOD=6.5894;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:326,0,395
16	1270162	.	G	A	88.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.676;VQSLOD=5.6028;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:119,0,143
16	1271890	.	G	T	197.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=14;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.386;VQSLOD=6.5816;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:227,0,180
16	1272038	.	G	A	600.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;DP=54;Dels=0.00;FS=7.729;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.349;VQSLOD=4.4352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,24:54:99:631,0,806
16	1306681	.	G	A	998.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.613;DP=92;Dels=0.00;FS=7.329;HRun=0;HaplotypeScore=6.5867;MQ=57.85;MQ0=1;MQRankSum=0.017;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.454;VQSLOD=3.2354;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,39:92:99:1029,0,1311
16	1394507	.	A	C	7346.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4207;MQ=59.16;MQ0=0;QD=34.17;VQSLOD=9.2242;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,215:215:99:7346,575,0
16	1536535	.	C	T	872.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2808;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.367;VQSLOD=6.3555;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,34:72:99:902,0,1098
16	1537839	.	G	A	3087.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.810;DP=232;Dels=0.00;FS=3.478;HRun=0;HaplotypeScore=5.7643;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.053;VQSLOD=4.6659;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,110:232:99:3117,0,3062
16	1538363	.	C	A	1111.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=85;Dels=0.00;FS=10.673;HRun=0;HaplotypeScore=2.7889;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.965;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.330;VQSLOD=3.6148;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,42:85:99:1142,0,1155
16	1538464	.	C	T	380.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9496;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.748;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.131;VQSLOD=3.4902;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,24:78:99:410,0,1503
16	1544301	.	G	C	1979.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;DP=134;Dels=0.00;FS=1.028;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.223;VQSLOD=6.0040;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,68:134:99:2010,0,1955
16	1544302	.	A	G	1799.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.985;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.8210;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.618;VQSLOD=6.5295;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,70:137:99:1829,0,1758
16	1838640	.	T	C	962.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09;VQSLOD=14.2061;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:81.23:996,81,0
16	1838703	.	G	A	732.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.028;DP=52;Dels=0.00;FS=16.104;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.547;VQSLOD=3.4212;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,30:52:99:763,0,554
16	1961674	.	G	C	523.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;DP=40;Dels=0.00;FS=3.847;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.08;ReadPosRankSum=-1.192;VQSLOD=5.6387;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:553,0,626
16	1962132	.	G	A	101.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.674;VQSLOD=6.0745;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:131,0,327
16	1997004	.	C	T	1306.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.865;DP=84;Dels=0.00;FS=11.256;HRun=0;HaplotypeScore=2.5657;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.460;VQSLOD=3.7417;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,47:84:99:1336,0,957
16	2003016	.	G	A	1139.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;DP=91;Dels=0.00;FS=1.723;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.457;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.128;VQSLOD=4.0746;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,48:91:99:1169,0,1058
16	2070200	.	G	C	179.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.858;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.041;VQSLOD=10.9710;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:210,0,215
16	2070568	.	A	C	337.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.776;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.151;VQSLOD=11.5163;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:368,0,388
16	2133726	.	C	T	393.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=25;Dels=0.00;FS=1.685;HRun=0;HaplotypeScore=2.9810;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.028;VQSLOD=4.0917;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:423,0,255
16	2140680	.	T	C	531.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.363;DP=46;Dels=0.00;FS=2.772;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.121;VQSLOD=5.9020;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,22:46:99:561,0,664
16	2260567	.	C	T	681.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.857;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9553;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.301;VQSLOD=5.2808;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,29:57:99:712,0,772
16	2282256	.	G	A	1656.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.56;MQ0=0;QD=31.25;VQSLOD=8.8736;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:53:99:1689,147,0
16	2812939	.	C	A	3061.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.550;HRun=2;HaplotypeScore=7.8346;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.549;VQSLOD=4.5805;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,113:250:99:3091,0,3926
16	2821573	.	C	T	3485.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.0388;MQ=59.26;MQ0=0;QD=30.05;VQSLOD=7.0922;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3485,280,0
16	3019781	.	T	TC	184.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=28;FS=26.946;HRun=1;HaplotypeScore=161.8037;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.637;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:224,0,120
16	3073240	.	G	T	789.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=44;Dels=0.00;FS=2.751;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.892;VQSLOD=5.2806;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,27:44:99:819,0,416
16	3119297	.	C	CG	1237.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.553;DP=192;FS=1.349;HRun=6;HaplotypeScore=613.4101;MQ=55.06;MQ0=1;MQRankSum=-2.477;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.985;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,45:192:99:1277,0,3377
16	3254470	.	T	C	4468.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.528;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.925;HRun=1;HaplotypeScore=9.8479;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.522;VQSLOD=3.1215;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,137:249:99:3799,0,3145
16	3293888	.	C	T	583.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.395;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.732;VQSLOD=6.4232;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,22:51:99:613,0,765
16	3293922	.	A	T	251.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.767;DP=33;Dels=0.00;FS=1.533;HRun=1;HaplotypeScore=3.8855;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.879;VQSLOD=5.1392;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,12:33:99:282,0,523
16	3406387	.	C	G	3864.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4973;MQ=59.22;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=8.5418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3864,301,0
16	3432993	.	G	C	1416.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=75;Dels=0.00;FS=3.494;HRun=0;HaplotypeScore=4.8786;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.606;VQSLOD=2.3981;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,47:75:99:1447,0,765
16	3724465	.	G	C	2259.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=8.3282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2292,196,0
16	4033436	.	T	C	592.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.779;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.982;VQSLOD=6.4591;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:623,0,126
16	4432029	.	A	C	367.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;DP=21;Dels=0.00;FS=2.017;HRun=0;HaplotypeScore=1.7326;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.195;VQSLOD=5.7147;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:398,0,167
16	4445327	.	C	T	889.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.399;DP=61;Dels=0.00;FS=3.665;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.401;VQSLOD=6.4504;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,35:61:99:919,0,630
16	4476089	.	T	C	398.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.222;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.092;VQSLOD=6.1035;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,18:41:99:429,0,613
16	4484396	.	A	T	1770.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.135;DP=156;Dels=0.00;FS=19.808;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=2.2073;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,65:156:99:1800,0,2431
16	4751045	.	C	T	2382.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.647;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=2.947;HRun=0;HaplotypeScore=7.1796;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.554;VQSLOD=4.5296;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,96:247:99:2413,0,4195
16	4794873	.	C	T	1659.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.677;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9862;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.074;VQSLOD=5.3853;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1689,0,1505
16	4796393	.	A	G	988.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=113;Dels=0.00;FS=2.555;HRun=3;HaplotypeScore=1.6647;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=5.7489;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,44:113:99:1019,0,1928
16	4797457	.	C	T	1120.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7229;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=15.57;ReadPosRankSum=2.566;VQSLOD=3.6257;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,38:72:99:1151,0,876
16	4861709	.	G	C	2187.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.68;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=8.4060;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2220,172,0
16	4933939	.	G	C	5504.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.2366;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.00;VQSLOD=7.2737;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5504,427,0
16	4938160	.	T	G	5138.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.36;MQ0=0;QD=31.92;VQSLOD=9.5000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:5138,400,0
16	4942099	.	C	T	4019.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7293;MQ=59.82;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=8.6840;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:4019,307,0
16	5140541	.	G	C	2282.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.828;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7073;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.065;VQSLOD=5.5178;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,86:163:99:2312,0,2020
16	8738499	.	G	A	7438.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8348;MQ=59.69;MQ0=0;QD=33.06;VQSLOD=6.2831;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:225:99:7438,641,0
16	8839954	.	A	G	1164.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;DP=88;Dels=0.00;FS=2.427;HRun=2;HaplotypeScore=0.9996;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.931;VQSLOD=6.6494;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,44:88:99:1195,0,1322
16	10769958	.	T	C	2198.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.024;DP=173;DS;Dels=0.00;FS=3.921;HRun=1;HaplotypeScore=2.8495;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.633;VQSLOD=5.8261;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,89:173:99:2229,0,2396
16	10995933	.	A	G	6610.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9178;MQ=58.80;MQ0=0;QD=34.79;VQSLOD=7.6365;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:6610,530,0
16	11002927	.	A	G	2596.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;QD=32.86;VQSLOD=9.4023;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2629,226,0
16	11362729	.	G	A	703.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.686;DP=42;Dels=0.00;FS=1.209;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.635;VQSLOD=6.0913;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,26:42:99:733,0,382
16	11873158	.	T	C	1501.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=158;Dels=0.00;FS=1.300;HRun=0;HaplotypeScore=2.8636;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.190;VQSLOD=4.8432;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,69:158:99:1532,0,2106
16	11876203	.	T	C	2657.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.584;DP=194;Dels=0.00;FS=3.366;HRun=0;HaplotypeScore=6.3909;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.591;VQSLOD=4.5291;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,97:194:99:2687,0,2389
16	12060163	.	A	G	3936.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=9.7054;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3936,301,0
16	12758966	.	T	C	2310.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=8.9445;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2343,184,0
16	14042077	.	A	G	2373.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.310;DP=160;Dels=0.00;FS=1.288;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.759;VQSLOD=6.6935;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,85:160:99:2404,0,1990
16	14742400	.	T	G	4083.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=2.205;HRun=3;HaplotypeScore=4.2741;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.721;VQSLOD=5.5445;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,119:244:99:3469,0,3211
16	15729650	.	C	T	1236.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.236;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.058;VQSLOD=4.7372;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,46:109:99:1267,0,1683
16	15820863	.	C	T	2412.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.196;DP=232;DS;Dels=0.00;FS=0.531;HRun=0;HaplotypeScore=5.7166;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.253;VQSLOD=4.9934;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,93:232:99:2442,0,3511
16	16251599	.	C	T	1039.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.986;DP=71;Dels=0.00;FS=4.780;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.239;VQSLOD=5.2067;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,41:71:99:1069,0,758
16	16271357	.	T	C	4169.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.12;MQ0=0;QD=30.43;VQSLOD=8.1500;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4169,346,0
16	16278863	.	G	T	1874.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.577;VQSLOD=7.6655;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,62:63:99:1908,119,0
16	16281007	.	A	G	1681.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.4991;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1714,129,0
16	20370810	.	C	T	2782.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.700;DP=210;DS;Dels=0.00;FS=2.448;HRun=0;HaplotypeScore=4.3043;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=1.444;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.358;VQSLOD=5.7497;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,102:210:99:2812,0,3062
16	20370816	.	C	T	2694.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;DP=199;DS;Dels=0.00;FS=1.123;HRun=1;HaplotypeScore=4.7281;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=3.466;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.046;VQSLOD=4.0167;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,94:199:99:2724,0,3045
16	20410547	.	C	T	2687.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.838;DP=208;Dels=0.00;FS=8.180;HRun=0;HaplotypeScore=6.5955;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.306;VQSLOD=4.5954;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,108:208:99:2718,0,2385
16	21190853	.	A	C	4100.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8914;MQ=59.66;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=9.2568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4101,316,0
16	22137603	.	G	A	1941.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.003;DP=179;DS;Dels=0.00;FS=1.276;HRun=0;HaplotypeScore=9.6379;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.496;VQSLOD=3.9512;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,74:179:99:1971,0,2925
16	22149688	.	T	C	279.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=10.5565;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:310,0,149
16	22155629	.	A	G	924.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.133;DP=66;Dels=0.00;FS=1.088;HRun=0;HaplotypeScore=1.7998;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.248;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.385;VQSLOD=6.0509;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,35:66:99:955,0,798
16	22161136	.	T	C	2021.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=53.95;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=7.7169;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2054,165,0
16	22269867	.	A	G	3554.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.80;MQ0=0;QD=31.18;VQSLOD=9.3473;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3554,301,0
16	23080634	.	C	A	1773.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.786;DP=136;Dels=0.00;FS=4.309;HRun=0;HaplotypeScore=6.9242;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.997;VQSLOD=4.7292;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,67:136:99:1804,0,1637
16	23098422	.	A	G	1023.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=79;Dels=0.00;FS=1.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.349;VQSLOD=5.7001;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,36:79:99:1053,0,1206
16	23489711	.	C	G	2611.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=169;Dels=0.00;FS=2.695;HRun=1;HaplotypeScore=3.6628;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.833;VQSLOD=5.5974;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,93:169:99:2642,0,2121
16	23536684	.	T	C	2410.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=152;Dels=0.00;FS=2.077;HRun=1;HaplotypeScore=2.8633;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.480;VQSLOD=6.2665;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,88:152:99:2441,0,1653
16	24372717	.	G	A	2008.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=185;Dels=0.00;FS=12.899;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.641;VQSLOD=2.5366;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,89:185:99:2039,0,2343
16	24815534	.	A	G	894.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;DP=68;Dels=0.00;FS=4.662;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.924;VQSLOD=4.3499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,37:68:99:925,0,831
16	24888646	.	T	C	2905.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.081;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=10.1994;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.880;VQSLOD=4.1252;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,99:226:99:2935,0,3821
16	24918048	.	C	T	1582.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.182;DP=145;Dels=0.00;FS=3.065;HRun=1;HaplotypeScore=2.9131;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.777;VQSLOD=6.3191;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,65:145:99:1613,0,1930
16	25239805	.	G	C	1316.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;DP=86;Dels=0.00;FS=3.046;HRun=1;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.065;VQSLOD=6.1674;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,46:86:99:1347,0,953
16	27356203	.	A	G	864.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.365;DP=70;Dels=0.00;FS=2.279;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.353;VQSLOD=5.0143;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:895,0,959
16	27772901	.	G	A	2685.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8533;MQ=57.54;MQ0=0;QD=27.69;VQSLOD=5.9875;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:2718,220,0
16	27781309	.	G	A	2007.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.035;DP=166;DS;Dels=0.00;FS=8.781;HRun=0;HaplotypeScore=4.0918;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=4.6883;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,72:166:99:2037,0,2483
16	27784497	.	G	A	403.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.767;VQSLOD=6.4200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:433,0,300
16	28507644	.	C	G	499.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.380;VQSLOD=5.5510;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:530,0,406
16	28508716	.	T	C	634.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;VQSLOD=13.3239;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:51.16:668,51,0
16	28513403	.	A	G	345.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;DP=35;Dels=0.00;FS=2.026;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.397;VQSLOD=6.2051;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:375,0,678
16	28550174	.	C	T	548.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=49;Dels=0.00;FS=2.940;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.270;VQSLOD=4.7567;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,23:49:99:578,0,718
16	28603655	.	T	G	2632.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.482;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=1.780;HRun=3;HaplotypeScore=6.3170;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.408;VQSLOD=4.1426;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,102:228:99:2663,0,3439
16	28883241	.	A	G	1445.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.603;DP=104;Dels=0.00;FS=4.865;HRun=0;HaplotypeScore=3.5811;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.90;ReadPosRankSum=2.079;VQSLOD=4.8855;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,50:104:99:1476,0,1481
16	28944396	.	C	G	1053.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.130;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6426;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.392;VQSLOD=5.1895;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,41:82:99:1083,0,1009
16	29708350	.	A	G	799.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62;VQSLOD=13.9135;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.18:833,72,0
16	30408765	.	C	T	2328.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=218;Dels=0.00;FS=2.338;HRun=0;HaplotypeScore=4.7225;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.036;VQSLOD=5.4709;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,98:218:99:2358,0,3076
16	30456729	.	C	T	195.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;DP=19;Dels=0.00;FS=3.274;HRun=0;HaplotypeScore=2.2859;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.177;VQSLOD=4.7707;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:225,0,286
16	30536918	.	C	G	5298.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.30;MQ0=0;QD=29.11;VQSLOD=7.7381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5297,427,0
16	30566747	.	G	A	206.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;DP=19;Dels=0.00;FS=1.871;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.184;VQSLOD=5.4986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:237,0,219
16	30569349	.	C	T	462.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.912;DP=33;Dels=0.00;FS=3.506;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.548;VQSLOD=5.2264;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:492,0,377
16	30680655	.	G	A	268	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.387;VQSLOD=6.0303;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:298,0,351
16	30779716	.	A	G	1575.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.18;MQ0=0;QD=30.89;VQSLOD=8.4908;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1608,147,0
16	30999142	.	A	G	2994.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.522;DP=225;Dels=0.00;FS=0.500;HRun=0;HaplotypeScore=4.3823;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.202;VQSLOD=4.9007;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,112:225:99:3024,0,2904
16	31072909	.	G	A	3362.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6647;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.414;VQSLOD=7.7538;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,114:119:99:3322,268,0
16	31075708	.	C	G	2228.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.57;MQ0=0;QD=32.30;VQSLOD=8.7230;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2262,175,0
16	31336888	.	C	T	1014.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.024;DP=76;Dels=0.00;FS=0.968;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.140;VQSLOD=6.4042;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,43:76:99:1044,0,859
16	31343005	.	C	T	159.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;DP=27;Dels=0.04;FS=3.769;HRun=1;HaplotypeScore=1.8606;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.982;VQSLOD=3.1883;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:189,0,477
16	31374535	.	C	G	1847.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.920;DP=157;Dels=0.00;FS=2.168;HRun=0;HaplotypeScore=5.4035;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.292;VQSLOD=4.8886;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,81:157:99:1877,0,1991
16	31391381	.	G	A	1053.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.602;DP=94;Dels=0.00;FS=1.750;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.167;VQSLOD=3.7410;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,41:94:99:1084,0,1352
16	31473275	.	A	G	1499.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.249;DP=145;Dels=0.00;FS=1.355;HRun=0;HaplotypeScore=5.5232;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.366;VQSLOD=4.2699;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,63:145:99:1530,0,2202
16	31476458	.	C	T	1913.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;DP=143;Dels=0.00;FS=0.625;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.009;VQSLOD=6.5534;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,74:143:99:1944,0,1715
16	31926619	.	G	A	5173.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9510;MQ=57.81;MQ0=0;QD=30.08;VQSLOD=7.9141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5173,406,0
16	46655210	.	A	G	2123.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=28.32;VQSLOD=8.0488;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2157,183,0
16	46773999	.	C	A	3839.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.912;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=1.597;HRun=1;HaplotypeScore=3.8641;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.884;VQSLOD=5.9414;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,133:237:99:3300,0,2555
16	48122582	.	G	A	3679.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.361;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=33.14;ReadPosRankSum=0.787;VQSLOD=9.2624;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,109:111:99:3649,259,0
16	48174765	.	C	A	1610.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.774;DP=157;Dels=0.00;FS=0.613;HRun=2;HaplotypeScore=2.9792;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.657;VQSLOD=4.4362;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,62:157:99:1640,0,2640
16	48175235	.	G	T	2082.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.374;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.938;VQSLOD=6.9944;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,80:170:99:2113,0,2304
16	48201432	.	T	C	2174.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.381;DP=168;Dels=0.00;FS=1.954;HRun=0;HaplotypeScore=2.9561;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.105;VQSLOD=6.4743;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,83:168:99:2205,0,2356
16	48250026	.	G	T	2645.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.084;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.989;HRun=0;HaplotypeScore=2.7652;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.567;VQSLOD=5.2117;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,105:250:99:2676,0,3665
16	48265777	.	C	T	2727.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.527;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.003;HRun=0;HaplotypeScore=1.8646;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.469;VQSLOD=6.8387;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,106:250:99:2757,0,3814
16	50744624	.	C	T	1190.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=9.3754;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1224,105,0
16	50745926	.	C	T	941.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.513;DP=68;Dels=0.00;FS=0.924;HRun=0;HaplotypeScore=2.8627;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=6.5100;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,32:68:99:972,0,940
16	51171175	.	C	T	4419.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.14;MQ0=0;QD=31.79;VQSLOD=8.9069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4418,361,0
16	52497872	.	C	T	2986.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.692;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=2.167;HRun=0;HaplotypeScore=2.7865;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.138;VQSLOD=6.2044;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,121:246:99:3017,0,3167
16	53341748	.	T	G	1369.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=33.40;VQSLOD=10.0176;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1403,108,0
16	53341803	.	A	G	668.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.927;DP=47;Dels=0.00;FS=1.271;HRun=0;HaplotypeScore=1.9416;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.118;VQSLOD=6.0195;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,26:47:99:699,0,493
16	53358439	.	A	G	537.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.798;DP=47;Dels=0.00;FS=2.621;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.245;VQSLOD=5.6921;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,24:47:99:567,0,605
16	54318172	.	C	A	432.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=57;Dels=0.00;FS=1.067;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.303;VQSLOD=5.4099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,22:57:99:463,0,879
16	54967096	.	C	A	206.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.480;VQSLOD=11.7500;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:41.75:237,0,42
16	55562466	.	G	A	2285.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;DP=169;Dels=0.00;FS=1.258;HRun=0;HaplotypeScore=8.7850;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.471;VQSLOD=4.2586;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,92:169:99:2316,0,1811
16	55897289	.	C	T	2408.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.159;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.1123;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.160;VQSLOD=3.9810;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,100:230:99:2439,0,3374
16	56500132	.	C	T	1240.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.168;DP=106;Dels=0.00;FS=1.608;HRun=1;HaplotypeScore=3.7776;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.879;VQSLOD=5.8696;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,49:106:99:1270,0,1530
16	56545175	.	T	C	1829.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=133;Dels=0.00;FS=4.159;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=13.75;ReadPosRankSum=2.718;VQSLOD=4.7795;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,69:133:99:1859,0,1526
16	56548501	.	C	T	3271.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=13.6387;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3271,253,0
16	56601720	.	A	G	6235.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.20;MQ0=0;QD=32.65;VQSLOD=9.6038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:6235,482,0
16	56601722	.	T	C	5571.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.19;MQ0=0;QD=29.63;VQSLOD=9.1747;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,188:188:99:5570,463,0
16	56667282	.	C	A	7090.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9932;MQ=54.46;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=3.6319;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:7090,551,0
16	56673227	.	C	A	4763.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6904;MQ=58.73;MQ0=0;QD=28.70;VQSLOD=7.6040;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,165:166:99:4763,379,0
16	56904587	.	C	G	3471.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.6781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:116:99:3471,268,0
16	57016092	.	G	A	723.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.411;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7791;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.639;VQSLOD=5.1382;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,29:67:99:753,0,950
16	57071114	.	A	G	4937.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2259;MQ=59.28;MQ0=0;QD=30.67;VQSLOD=8.5079;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:4937,388,0
16	57080528	.	C	A	698.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.497;DP=66;Dels=0.00;FS=3.536;HRun=1;HaplotypeScore=2.7865;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.823;VQSLOD=5.2393;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,28:66:99:729,0,1027
16	57201066	.	T	A	1540.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.000;DP=128;Dels=0.00;FS=0.728;HRun=1;HaplotypeScore=5.6032;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.285;VQSLOD=2.8477;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:128:99:1570,0,1953
16	57392733	.	A	C	7760.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6532;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.29;VQSLOD=9.0920;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,247:248:99:7760,596,0
16	57562804	.	G	A	1187.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.38;VQSLOD=7.2293;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:90.29:1220,90,0
16	57689385	.	C	G	877.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.994;DP=59;Dels=0.00;FS=2.245;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.145;VQSLOD=6.0683;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,30:59:99:908,0,714
16	57693498	.	T	C	2668.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5237;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.044;VQSLOD=5.4273;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,103:188:99:2699,0,2180
16	57949224	.	G	T	75.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.692;VQSLOD=3.9700;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,5:26:99:106,0,625
16	57957216	.	A	G	726.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.211;VQSLOD=6.1088;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,33:77:99:757,0,1085
16	57996960	.	C	T	785.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.973;DP=78;Dels=0.00;FS=4.479;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.352;VQSLOD=5.7351;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,32:78:99:815,0,1152
16	58019396	.	G	A	3921.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5953;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=29.49;ReadPosRankSum=-1.102;VQSLOD=8.3100;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,132:133:99:3921,316,0
16	58318604	.	T	C	1613.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.318;DP=116;Dels=0.00;FS=4.702;HRun=1;HaplotypeScore=4.4549;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.671;VQSLOD=5.0233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,60:116:99:1644,0,1321
16	58713798	.	G	A	1250.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=71;Dels=0.00;FS=1.011;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.912;VQSLOD=5.7919;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,43:71:99:1280,0,799
16	58743454	.	A	C	8734.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6484;MQ=59.31;MQ0=0;QD=34.94;VQSLOD=8.4168;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8734,689,0
16	58768129	.	C	A	339.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;DP=34;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=0;HaplotypeScore=1.6646;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.705;VQSLOD=5.5375;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:369,0,511
16	65016087	.	A	C	4432.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8592;MQ=59.27;MQ0=0;QD=29.75;VQSLOD=8.5103;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4432,358,0
16	66432423	.	T	C	1880.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.583;DP=136;Dels=0.00;FS=1.380;HRun=1;HaplotypeScore=4.2539;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=2.5477;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,72:136:99:1911,0,1605
16	66614008	.	T	C	7607.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2463;MQ=59.19;MQ0=0;QD=33.22;VQSLOD=8.7778;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,229:229:99:7607,593,0
16	66948130	.	G	A	1351.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;DP=102;Dels=0.00;FS=0.795;HRun=0;HaplotypeScore=1.5773;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.493;VQSLOD=6.6390;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,53:102:99:1382,0,1308
16	67691668	.	A	G	1208.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.512;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.428;VQSLOD=6.4389;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,45:90:99:1238,0,1132
16	68025801	.	G	C	3629.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5707;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50;VQSLOD=7.7071;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,119:119:99:3629,298,0
16	68057096	.	T	C	426.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.989;DP=37;Dels=0.00;FS=1.316;HRun=0;HaplotypeScore=2.7518;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.843;VQSLOD=6.5970;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:37:99:456,0,537
16	68344696	.	C	T	1344.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.722;DP=115;Dels=0.00;FS=9.129;HRun=0;HaplotypeScore=2.4078;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.554;VQSLOD=4.4495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,57:115:99:1374,0,1501
16	68719113	.	G	A	1500.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.571;DP=122;Dels=0.00;FS=0.706;HRun=0;HaplotypeScore=2.4959;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.231;VQSLOD=6.3941;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,63:122:99:1530,0,1431
16	68721533	.	G	C	7249.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6837;MQ=59.40;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=9.0783;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:7248,593,0
16	69377470	.	A	G	2119.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=196;Dels=0.00;FS=2.476;HRun=0;HaplotypeScore=10.3971;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.187;VQSLOD=3.0851;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,91:196:99:2149,0,2532
16	69385641	.	A	G	1929.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.040;DP=139;Dels=0.00;FS=0.837;HRun=1;HaplotypeScore=8.7825;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.108;VQSLOD=4.3427;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,66:139:99:1959,0,2073
16	69782855	.	C	T	490.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.478;DP=38;Dels=0.00;FS=1.675;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.813;VQSLOD=2.2592;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,17:38:99:521,0,607
16	70164334	.	A	G	557.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.759;DP=62;Dels=0.00;FS=1.153;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.390;VQSLOD=3.3613;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,22:62:99:588,0,1153
16	70548297	.	G	A	712.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;DP=67;Dels=0.00;FS=3.425;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.289;VQSLOD=6.3489;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,26:67:99:743,0,1117
16	70690989	.	G	C	1686.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.948;DP=142;Dels=0.00;FS=6.692;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.968;VQSLOD=4.8721;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,61:142:99:1717,0,2228
16	71318001	.	G	T	252.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;DP=28;Dels=0.00;FS=6.054;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.082;VQSLOD=5.1075;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:282,0,416
16	71319646	.	G	A	2242.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.14;VQSLOD=9.1978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2275,184,0
16	72156842	.	T	G	530.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.671;DP=77;Dels=0.00;FS=6.517;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.408;VQSLOD=4.1785;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,25:77:99:561,0,1426
16	72993159	.	A	G	2104.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.754;DP=176;Dels=0.00;FS=4.916;HRun=1;HaplotypeScore=4.6192;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.757;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=3.2675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,76:176:99:2135,0,2688
16	74425548	.	A	G	8223.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6594;MQ=57.03;MQ0=0;QD=33.43;VQSLOD=5.4500;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:246:99:8223,653,0
16	74425569	.	C	T	7739.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7635;MQ=56.84;MQ0=0;QD=30.96;VQSLOD=4.5549;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7738,611,0
16	74664743	.	T	C	1337.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.449;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.864;VQSLOD=6.6032;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,49:108:99:1367,0,1591
16	74695079	.	G	T	3000.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.429;DP=225;Dels=0.00;FS=1.621;HRun=1;HaplotypeScore=7.6600;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.563;VQSLOD=4.6506;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,114:225:99:3030,0,2964
16	75238103	.	C	T	4516.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8909;MQ=59.58;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=8.7532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:149:99:4515,367,0
16	75276775	.	G	A	1316.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=53.99;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=5.5405;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1349,114,0
16	75563330	.	G	A	2001.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;DP=138;Dels=0.00;FS=1.528;HRun=0;HaplotypeScore=4.3807;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.383;VQSLOD=5.9478;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,71:138:99:2031,0,1876
16	75646685	.	G	T	1706.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.066;DP=126;Dels=0.00;FS=1.429;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.830;VQSLOD=5.7046;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,65:126:99:1736,0,1704
16	76311602	.	G	GT	767.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=36.7933;MQ=60.00;MQ0=0;QD=42.65;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54.18:810,54,0
16	76532583	.	A	G	1732.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.83;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=9.6266;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1766,138,0
16	76587202	.	T	G	1094.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.13;MQ0=0;QD=31.26;VQSLOD=8.2064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:87.27:1127,87,0
16	77323235	.	C	G	2381.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=4.635;HRun=0;HaplotypeScore=7.1672;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.144;VQSLOD=4.5737;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,81:162:99:2411,0,2304
16	77353973	.	G	T	800.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;DP=82;Dels=0.00;FS=0.864;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.106;VQSLOD=5.8935;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,33:82:99:831,0,1256
16	77359919	.	A	T	978.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.728;DP=81;Dels=0.00;FS=2.063;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.252;VQSLOD=5.7059;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,40:81:99:1009,0,1211
16	77401545	.	A	G	2165.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.059;DP=135;Dels=0.00;FS=2.194;HRun=1;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.869;QD=16.04;ReadPosRankSum=-2.327;VQSLOD=4.2153;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,72:135:99:2195,0,1627
16	77775672	.	A	G	4207.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9941;MQ=59.67;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=9.0421;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4207,322,0
16	78064733	.	C	A	1812.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=163;Dels=0.00;FS=2.457;HRun=2;HaplotypeScore=2.6639;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.851;VQSLOD=6.3804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,69:163:99:1843,0,2769
16	78420775	.	G	A	4156.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=28.66;VQSLOD=8.6874;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4156,319,0
16	81010073	.	C	T	242.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=39;Dels=0.00;FS=1.378;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.137;VQSLOD=3.4211;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,12:39:99:272,0,633
16	81050965	.	A	T	4989.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.40;MQ0=0;QD=28.68;VQSLOD=7.7947;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:4989,379,0
16	81056441	.	T	G	656.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.935;DP=65;Dels=0.00;FS=4.043;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.342;VQSLOD=6.0578;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,25:65:99:687,0,1060
16	81061827	.	G	A	1266.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;DP=93;Dels=0.00;FS=1.864;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.889;VQSLOD=5.2099;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,49:93:99:1296,0,1227
16	81076821	.	T	C	1598.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.200;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.347;VQSLOD=6.6869;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,61:120:99:1628,0,1515
16	81094951	.	A	G	1813.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.569;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6443;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.271;VQSLOD=6.3120;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,61:129:99:1843,0,1799
16	81134860	.	C	G	323.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;DP=35;Dels=0.00;FS=3.643;HRun=1;HaplotypeScore=1.9559;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.330;VQSLOD=5.1777;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,12:35:99:354,0,620
16	81145807	.	C	G	8320.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.0673;MQ=59.55;MQ0=0;QD=33.42;VQSLOD=7.1797;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8320,638,0
16	81145976	.	C	T	920.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.303;DP=75;Dels=0.00;FS=2.100;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.072;VQSLOD=4.8730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,34:75:99:950,0,1217
16	81151122	.	A	C	7529.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5315;MQ=59.15;MQ0=0;QD=31.91;VQSLOD=9.1033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,236:236:99:7529,605,0
16	81151123	.	C	G	3055.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.268;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=1.017;HRun=0;HaplotypeScore=2.5315;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.098;VQSLOD=5.5876;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,119:233:99:3085,0,3148
16	81157324	.	G	A	5672.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9906;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.17;VQSLOD=8.7181;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5672,448,0
16	81157353	.	G	A	2266.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=165;Dels=0.00;FS=1.253;HRun=0;HaplotypeScore=2.6939;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.433;VQSLOD=6.2742;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,89:165:99:2296,0,1962
16	81157385	.	G	T	1471.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;DP=128;Dels=0.00;FS=3.411;HRun=0;HaplotypeScore=2.8266;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.414;VQSLOD=5.9775;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:128:99:1502,0,1958
16	81161473	.	G	GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC	3190.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=56;FS=11.685;HRun=0;HaplotypeScore=804.9637;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.187;QD=56.97;ReadPosRankSum=0.146;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,3:56:99:3230,0,4842
16	81161578	.	G	A	1377.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9803;MQ=54.47;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=3.5369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1411,111,0
16	81173136	.	T	C	333.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=25.62;VQSLOD=7.8185;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:33.06:366,33,0
16	81180988	.	C	G	3226.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.062;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=1.723;HRun=0;HaplotypeScore=3.7687;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.530;VQSLOD=5.9160;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,120:218:99:3257,0,2679
16	81181097	.	G	T	865.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.100;VQSLOD=6.3233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:895,0,1015
16	81183325	.	T	A	568.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;DP=41;Dels=0.00;FS=6.658;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.510;VQSLOD=4.8193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,22:41:99:599,0,514
16	81190601	.	T	C	1196.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=29.18;VQSLOD=8.1985;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1229,108,0
16	81190613	.	A	G	1125.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;QD=35.17;VQSLOD=9.2056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:90.28:1159,90,0
16	81193321	.	C	T	1013.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.36;MQ0=0;QD=34.94;VQSLOD=9.4523;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:84.26:1046,84,0
16	81194382	.	T	C	1971.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=13.8881;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2005,165,0
16	81209247	.	C	T	1724.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.177;DP=130;Dels=0.00;FS=2.306;HRun=0;HaplotypeScore=1.9448;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.693;VQSLOD=5.3063;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,66:130:99:1755,0,1622
16	81213378	.	A	G	1430.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.51;VQSLOD=10.0151;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1463,120,0
16	81232275	.	G	A	2569.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.16;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=9.3173;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2603,202,0
16	81232564	.	T	G	5543.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6054;MQ=59.10;MQ0=0;QD=33.00;VQSLOD=8.2085;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:5543,424,0
16	81242194	.	T	C	5035.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.3117;MQ=59.09;MQ0=0;QD=33.13;VQSLOD=9.3881;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,152:152:99:5035,394,0
16	81242198	.	G	A	4857.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5760;MQ=59.19;MQ0=0;QD=33.97;VQSLOD=8.7127;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4857,376,0
16	81249927	.	C	T	4266.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=8.1277;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4266,352,0
16	81249954	.	T	A	3785.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8482;MQ=59.63;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=8.3335;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3785,298,0
16	81253759	.	A	G	6415.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1295;MQ=59.21;MQ0=0;QD=31.29;VQSLOD=7.2059;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6414,521,0
16	81253917	.	A	G	5082.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.79;MQ0=0;QD=32.79;VQSLOD=9.8832;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:5082,394,0
16	84012104	.	T	C	3023.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=2.917;HRun=0;HaplotypeScore=4.3880;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.042;VQSLOD=4.8235;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,116:246:99:3053,0,3500
16	84028014	.	C	G	564.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.000;DP=41;Dels=0.00;FS=5.633;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.013;VQSLOD=5.6657;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:595,0,606
16	84203612	.	A	G	2832.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.51;MQ0=0;QD=32.93;VQSLOD=9.2990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2865,223,0
16	84203939	.	C	T	2726.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.79;MQ0=0;QD=31.33;VQSLOD=9.2623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:2759,217,0
16	84209738	.	T	C	1183.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=13.8243;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1217,99,0
16	84209815	.	C	G	1143.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.596;VQSLOD=5.8570;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,42:78:99:1173,0,1006
16	84209816	.	T	C	1010.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.508;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.516;VQSLOD=5.5960;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,36:79:99:1040,0,1076
16	84209864	.	G	C	999.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.581;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.413;VQSLOD=5.3916;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,37:94:99:1029,0,1654
16	84213434	.	A	T	198.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.941;VQSLOD=5.1046;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:228,0,520
16	84217062	.	C	T	1026.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.31;VQSLOD=7.7630;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:87.24:1059,87,0
16	84256103	.	C	T	1145.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.840;DP=110;Dels=0.00;FS=1.642;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.747;VQSLOD=6.1559;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,44:110:99:1175,0,1686
16	84256422	.	C	T	456.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.476;DP=38;Dels=0.00;FS=2.984;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.242;VQSLOD=6.0781;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:486,0,455
16	84256619	.	C	T	339.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.783;DP=49;Dels=0.00;FS=1.249;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.226;VQSLOD=3.6352;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,15:49:99:370,0,926
16	84270743	.	G	A	927.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.525;DP=99;Dels=0.00;FS=2.840;HRun=0;HaplotypeScore=6.9053;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.960;VQSLOD=4.2034;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,37:99:99:958,0,1821
16	84360533	.	A	G	4915.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=9.7969;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,152:152:99:4915,376,0
16	84444349	.	A	C	3037.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9636;MQ=57.48;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=6.9750;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3071,238,0
16	84476200	.	A	T	2254.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=0.683;HRun=1;HaplotypeScore=7.3717;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.771;VQSLOD=4.0507;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,83:169:99:2284,0,2214
16	84513562	.	G	A	779.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.277;DP=66;Dels=0.00;FS=0.956;HRun=2;HaplotypeScore=2.7850;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.490;VQSLOD=5.9473;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,32:66:99:809,0,785
16	84520396	.	A	G	2461.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=9.8749;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2494,205,0
16	84520537	.	T	C	2965.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=31.89;VQSLOD=9.1698;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:2999,253,0
16	84879464	.	A	G	964.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;DP=86;Dels=0.00;FS=3.386;HRun=1;HaplotypeScore=3.4463;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.436;VQSLOD=5.5897;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,36:86:99:995,0,1355
16	84906098	.	C	G	1904.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;DP=165;Dels=0.00;FS=0.583;HRun=0;HaplotypeScore=1.8675;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.545;VQSLOD=6.1827;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,79:165:99:1934,0,2155
16	85834818	.	G	A	2604.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.473;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.032;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=3.571;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.307;VQSLOD=3.8091;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,111:249:99:2635,0,3586
16	86565826	.	C	G	468.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=13.1820;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.12:501,42,0
16	87445839	.	C	T	2835.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;QD=32.98;VQSLOD=9.9954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2869,238,0
16	88552370	.	A	G	652.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4479;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.238;VQSLOD=5.6183;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,25:67:99:683,0,1076
16	88713236	.	A	G	1189.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.453;DP=84;Dels=0.00;FS=3.061;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=6.6015;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,46:84:99:1220,0,930
16	88779132	.	C	T	998.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=13.3234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:84.25:1032,84,0
16	88872145	.	T	C	1831.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.28;MQ0=0;QD=28.61;VQSLOD=8.1215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:1864,156,0
16	88872229	.	A	G	383.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5458;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.606;VQSLOD=6.0216;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,18:41:99:414,0,566
16	89293271	.	A	C	3757.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=9.7654;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3758,292,0
16	89294381	.	T	C	4116.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9931;MQ=59.81;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=9.3390;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4116,319,0
16	89294439	.	G	T	4834.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.70;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=9.1384;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4834,382,0
16	89350038	.	G	A	6409.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8629;MQ=59.53;MQ0=0;QD=29.00;VQSLOD=8.1814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:221:99:6382,532,0
16	89613123	.	A	G	4045.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.40;MQ0=0;QD=32.89;VQSLOD=8.5931;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:4045,328,0
16	89620328	.	G	A	3536.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.4646;MQ=58.92;MQ0=0;QD=30.48;VQSLOD=5.1285;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3536,274,0
16	89776278	.	C	T	2397.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.415;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6898;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=4.5871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,100:176:99:2428,0,2003
16	89985844	.	G	T	3120.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8548;MQ=59.14;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=8.4736;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3153,259,0
16	90141355	.	A	C	3121.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.385;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4725;MQ=54.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.898;QD=28.37;ReadPosRankSum=-1.443;VQSLOD=3.9233;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,109:110:99:3154,212,0
17	69519	.	T	C	1607.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=157;Dels=0.00;FS=1.326;HRun=1;HaplotypeScore=4.0054;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=3.9419;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,69:157:99:1637,0,2379
17	648186	.	G	A	1886.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8628;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=9.1226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:59:99:1919,156,0
17	648498	.	C	T	975.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.23;MQ0=0;QD=32.53;VQSLOD=9.6513;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:81.25:1009,81,0
17	649067	.	A	G	602.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;DP=43;Dels=0.00;FS=1.206;HRun=0;HaplotypeScore=3.6261;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=14.00;ReadPosRankSum=-1.284;VQSLOD=6.1047;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,24:43:99:632,0,499
17	649547	.	G	C	4248.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.4225;MQ=59.63;MQ0=0;QD=34.26;VQSLOD=6.8496;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:4248,331,0
17	649935	.	G	C	3796.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=9.0786;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3797,295,0
17	685640	.	G	T	303.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.094;DP=25;Dels=0.00;FS=6.455;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.061;VQSLOD=4.9251;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:334,0,337
17	1183354	.	T	C	5945.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.8937;MQ=59.33;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.6831;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5945,466,0
17	1183464	.	A	G	4970.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=159;Dels=0.00;FS=5.248;HRun=1;HaplotypeScore=2.5640;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=31.26;ReadPosRankSum=1.332;VQSLOD=4.0748;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,158:159:99:4937,365,0
17	1373518	.	T	C	226.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.227;VQSLOD=5.7549;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:257,0,149
17	1383868	.	C	T	1818.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.082;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.050;VQSLOD=5.5838;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,75:195:99:1848,0,2995
17	1538546	.	C	T	1997.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.04;MQ0=0;QD=29.38;VQSLOD=9.0247;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2031,171,0
17	1538628	.	C	G	1076.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.67;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=8.2974;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1109,99,0
17	1542190	.	G	A	733.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;DP=55;Dels=0.00;FS=21.585;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.547;VQSLOD=2.9154;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,27:55:99:763,0,759
17	1657653	.	G	A	2966.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;DP=209;Dels=0.00;FS=0.515;HRun=1;HaplotypeScore=3.7884;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.206;VQSLOD=5.7248;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,106:209:99:2997,0,2911
17	1673276	.	C	T	4098.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.71;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=9.4949;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4098,322,0
17	1686410	.	T	C	1601.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.540;DP=110;Dels=0.00;FS=4.771;HRun=0;HaplotypeScore=3.8129;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.763;VQSLOD=5.3014;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,59:110:99:1632,0,1174
17	1703543	.	G	C	2626.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.975;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=3.942;HRun=0;HaplotypeScore=5.3852;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.585;VQSLOD=5.0869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,109:219:99:2656,0,3040
17	1704296	.	C	A	2767.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=199;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.276;VQSLOD=6.4489;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,100:199:99:2798,0,2847
17	1940232	.	A	G	887.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.992;DP=75;Dels=0.00;FS=3.134;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.189;VQSLOD=4.6294;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,31:75:99:917,0,1148
17	1943880	.	C	G	2004.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=179;Dels=0.00;FS=1.983;HRun=0;HaplotypeScore=2.6823;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.484;VQSLOD=5.8004;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,75:179:99:2034,0,2840
17	2091765	.	C	T	1818.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.236;DP=139;Dels=0.00;FS=1.400;HRun=0;HaplotypeScore=5.3202;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=0.886;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.443;VQSLOD=5.2728;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,70:139:99:1849,0,1688
17	2203025	.	T	G	2730.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.989;DP=205;Dels=0.00;FS=4.147;HRun=1;HaplotypeScore=3.6545;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.717;VQSLOD=5.7709;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,97:205:99:2761,0,2731
17	2203175	.	C	G	2588.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.698;DP=164;Dels=0.00;FS=7.088;HRun=1;HaplotypeScore=5.8391;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.371;VQSLOD=3.9960;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,86:164:99:2618,0,1906
17	3101578	.	G	T	1774.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.808;DP=148;Dels=0.00;FS=1.300;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.791;VQSLOD=6.2248;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,68:148:99:1805,0,2451
17	3101691	.	G	T	1374.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.984;DP=151;Dels=0.00;FS=3.065;HRun=0;HaplotypeScore=4.4197;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.814;VQSLOD=4.7292;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,57:151:99:1405,0,2612
17	3119297	.	G	A	1969.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.3381;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.640;VQSLOD=4.6113;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,79:181:99:2000,0,2252
17	3119611	.	G	A	3151.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.433;DP=232;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4080;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.614;VQSLOD=5.1162;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,115:232:99:3181,0,3180
17	3195503	.	C	T	2447.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.517;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=0.627;HRun=1;HaplotypeScore=5.8918;MQ=58.89;MQ0=2;MQRankSum=-0.193;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.428;VQSLOD=4.4742;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,86:183:99:2477,0,2431
17	3324810	.	A	G	1908.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.315;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=3.9882;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.428;VQSLOD=6.1907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,76:148:99:1939,0,1910
17	3446885	.	T	C	7431.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.46;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=9.3455;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,229:229:99:7431,572,0
17	3458072	.	T	C	1258.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=1;QD=27.97;VQSLOD=8.5192;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1292,108,0
17	3480447	.	T	C	265.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.313;VQSLOD=11.8710;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:296,0,266
17	3486702	.	G	A	290.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;DP=21;Dels=0.00;FS=1.971;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.669;VQSLOD=6.3956;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:321,0,291
17	3495374	.	G	A	363.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;DP=32;Dels=0.00;FS=6.327;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.462;VQSLOD=4.8149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:394,0,496
17	3514028	.	G	C	8182.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.3264;MQ=58.72;MQ0=0;QD=33.67;VQSLOD=3.2107;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,243:243:99:8181,653,0
17	3526637	.	C	T	2666.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3862;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.450;VQSLOD=6.2357;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,100:250:99:2696,0,4347
17	3561396	.	C	T	4683.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0884;MQ=59.68;MQ0=0;QD=32.75;VQSLOD=8.7438;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4683,391,0
17	3594276	.	TG	T	723.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=55;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=134.5250;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.740;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:763,0,870
17	3628362	.	T	C	1094.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.252;DP=89;Dels=0.00;FS=4.167;HRun=1;HaplotypeScore=1.7825;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.384;VQSLOD=5.9177;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,40:89:99:1124,0,1276
17	3631241	.	A	G	1292.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.128;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.132;VQSLOD=6.9029;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,54:79:99:1322,0,570
17	3657159	.	C	T	1324.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.793;DP=116;Dels=0.00;FS=0.708;HRun=0;HaplotypeScore=4.3998;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.320;VQSLOD=5.2922;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,52:116:99:1354,0,1454
17	3657175	.	T	C	2787.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.67;MQ0=0;QD=29.03;VQSLOD=8.5243;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:2820,235,0
17	3775848	.	T	C	554.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.832;DP=59;Dels=0.00;FS=3.753;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.527;VQSLOD=6.0438;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,26:59:99:584,0,817
17	3916824	.	C	T	1366.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2131;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.003;VQSLOD=3.9898;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,58:119:99:1397,0,1715
17	3926110	.	C	G	1281.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;DP=146;Dels=0.00;FS=2.313;HRun=0;HaplotypeScore=2.5584;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.402;VQSLOD=5.2232;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,49:146:99:1312,0,2529
17	3947644	.	T	C	776.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.104;DP=54;Dels=0.00;FS=2.681;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.027;VQSLOD=6.4821;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,30:54:99:807,0,630
17	3953102	.	A	G	2023.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.448;DP=163;DS;Dels=0.00;FS=6.195;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.342;VQSLOD=5.5954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,74:163:99:2054,0,2365
17	3981290	.	A	G	823.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.529;VQSLOD=6.4222;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,35:89:99:854,0,1428
17	4352636	.	G	A	1124.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.088;DP=83;Dels=0.00;FS=0.982;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.040;VQSLOD=5.0059;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,42:83:99:1154,0,1187
17	4356375	.	G	T	2332.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=192;Dels=0.00;FS=1.848;HRun=1;HaplotypeScore=6.3842;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.871;VQSLOD=4.7057;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,91:192:99:2363,0,2911
17	4457116	.	T	C	394.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.956;VQSLOD=5.7012;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,18:51:99:425,0,847
17	4461748	.	G	A	569.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.142;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=6.2811;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,19:37:99:599,0,534
17	4463023	.	G	A	1053.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.48;VQSLOD=8.3407;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:93.26:1087,93,0
17	4495740	.	G	A	3309.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6399;MQ=59.15;MQ0=0;QD=30.09;VQSLOD=8.7847;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:110:99:3284,271,0
17	4638563	.	G	A	676.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.149;VQSLOD=6.7332;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,26:41:99:707,0,415
17	4638737	.	A	G	812.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.548;DP=55;Dels=0.00;FS=7.653;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.177;VQSLOD=4.8926;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,29:55:99:842,0,702
17	4689572	.	T	C	350.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.652;DP=32;Dels=0.00;FS=3.743;HRun=1;HaplotypeScore=2.9835;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.214;VQSLOD=6.1207;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:381,0,543
17	4693170	.	T	C	321.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=21.44;VQSLOD=6.2234;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:33.07:355,33,0
17	4720469	.	C	T	2967.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.588;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=8.040;HRun=0;HaplotypeScore=9.7202;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.432;VQSLOD=3.1762;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,113:249:99:2998,0,4081
17	4722876	.	G	A	567.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.432;DP=48;Dels=0.00;FS=4.576;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.491;VQSLOD=4.5205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,20:48:99:598,0,792
17	4856376	.	A	G	3189.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.40;MQ0=0;QD=29.27;VQSLOD=7.9533;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:109:99:3223,244,0
17	4856580	.	T	C	7178.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=235;DS;Dels=0.00;FS=3.164;HRun=0;HaplotypeScore=6.7039;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=30.55;ReadPosRankSum=-1.732;VQSLOD=2.3415;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,234:235:99:7148,591,0
17	4883818	.	C	G	2639.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6817;MQ=58.40;MQ0=0;QD=32.19;VQSLOD=8.7567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2673,214,0
17	4936972	.	G	A	2273.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48;VQSLOD=13.1044;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2307,196,0
17	4937575	.	T	C	3226.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6795;MQ=59.77;MQ0=0;QD=31.94;VQSLOD=8.3279;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:101:99:3260,271,0
17	5042894	.	T	C	1298.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7990;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.488;VQSLOD=6.3159;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,50:116:99:1329,0,1740
17	5058808	.	G	A	5413.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.9243;MQ=58.03;MQ0=0;QD=31.66;VQSLOD=3.7914;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:171:99:5413,421,0
17	5087040	.	A	G	1786.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.909;DP=131;Dels=0.00;FS=0.658;HRun=0;HaplotypeScore=10.5759;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.012;VQSLOD=4.1357;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,70:131:99:1816,0,1478
17	5366947	.	G	A	1492.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=116;Dels=0.00;FS=1.267;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.623;VQSLOD=6.4183;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,51:116:99:1523,0,1971
17	5425077	.	T	C	3542.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7359;MQ=58.45;MQ0=0;QD=30.54;VQSLOD=8.1695;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3542,271,0
17	5436263	.	C	T	1534.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=29.51;VQSLOD=8.6745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1568,123,0
17	5485367	.	A	T	878.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78;VQSLOD=8.7483;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:75.23:911,75,0
17	6406883	.	C	T	662.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.285;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.993;VQSLOD=6.2257;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,27:63:99:693,0,912
17	6441376	.	G	A	517.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.674;VQSLOD=10.5245;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,23:51:99:548,0,733
17	6493198	.	T	C	2599.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9970;MQ=59.49;MQ0=0;QD=31.71;VQSLOD=9.5206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2633,226,0
17	6513329	.	G	A	1494.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=140;Dels=0.00;FS=0.629;HRun=0;HaplotypeScore=3.6811;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.658;VQSLOD=6.2452;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,59:140:99:1525,0,2186
17	6515387	.	A	G	5993.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7839;MQ=59.54;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=8.8240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:5992,472,0
17	6515454	.	C	T	3548.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.1537;MQ=59.79;MQ0=0;QD=31.97;VQSLOD=8.4471;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3548,280,0
17	6524298	.	T	A	578.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.913;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.0451;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.538;VQSLOD=3.8219;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,27:50:99:608,0,615
17	6555546	.	C	CG	1004.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=74.8968;MQ=61.19;MQ0=0;QD=38.65;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78.22:1047,78,0
17	6683215	.	C	T	1463.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.872;DP=128;Dels=0.00;FS=9.654;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.679;VQSLOD=4.7034;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,59:128:99:1493,0,1893
17	6716242	.	G	A	2898.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=197;DS;Dels=0.00;FS=15.177;HRun=0;HaplotypeScore=3.7121;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=14.71;ReadPosRankSum=2.341;VQSLOD=2.4795;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,105:197:99:2929,0,2456
17	6904934	.	A	G	7767.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.845;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.6363;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=31.07;ReadPosRankSum=1.677;VQSLOD=4.8207;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:7733,568,0
17	7155861	.	G	A	135.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.762;DP=23;Dels=0.00;FS=2.105;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.775;VQSLOD=4.6293;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:165,0,425
17	7163739	.	A	G	4423.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5367;MQ=58.15;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=7.8761;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4423,343,0
17	7230845	.	G	T	1115.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.789;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6624;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.177;VQSLOD=5.5698;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,42:90:99:1146,0,1412
17	7254315	.	G	A	710.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.647;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=9.60;ReadPosRankSum=-2.746;VQSLOD=5.2893;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,29:74:99:740,0,1155
17	7292107	.	G	A	557.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;VQSLOD=6.6250;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:21:48.14:591,48,0
17	7329134	.	G	A	3233.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.805;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.585;HRun=0;HaplotypeScore=2.8893;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.138;VQSLOD=6.0477;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3266,0,3716
17	7329632	.	T	G	3834.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6507;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.63;VQSLOD=7.3269;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:144:99:3809,334,0
17	7366651	.	C	G	268.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.755;VQSLOD=6.1024;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:299,0,178
17	7385454	.	G	A	1670.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.309;DP=127;Dels=0.00;FS=0.822;HRun=0;HaplotypeScore=2.7186;MQ=49.89;MQ0=1;MQRankSum=1.454;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.859;VQSLOD=2.2276;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,63:127:99:1701,0,1802
17	7386055	.	C	T	5146.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4018;MQ=47.75;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=3.4004;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:163:99:5145,418,0
17	7462969	.	A	G	531.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.157;DP=65;Dels=0.00;FS=2.311;HRun=0;HaplotypeScore=2.6607;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.063;VQSLOD=4.7811;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,21:65:99:562,0,1100
17	7484101	.	C	A	1804.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.510;DP=140;Dels=0.00;FS=0.659;HRun=1;HaplotypeScore=6.1412;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.993;VQSLOD=4.7940;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,66:140:99:1835,0,1874
17	7484812	.	G	A	2194.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.518;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=3.027;HRun=0;HaplotypeScore=2.6000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=12.98;ReadPosRankSum=2.546;VQSLOD=5.4489;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,90:169:99:2224,0,2153
17	7490810	.	G	A	2831.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.252;DP=222;Dels=0.00;FS=5.586;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=12.75;ReadPosRankSum=2.568;VQSLOD=4.8190;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,114:222:99:2861,0,2760
17	7529902	.	G	A	954.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.256;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8045;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=3.4231;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,39:109:99:984,0,1975
17	7592168	.	C	G	1955.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.815;DP=144;Dels=0.00;FS=2.112;HRun=3;HaplotypeScore=8.2263;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.609;VQSLOD=4.1045;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,70:144:99:1986,0,1887
17	7606722	.	C	G	1112.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.490;DP=90;Dels=0.00;FS=2.866;HRun=7;HaplotypeScore=3.1233;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.737;VQSLOD=5.9045;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,42:90:99:1142,0,1155
17	7722365	.	C	T	267.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.306;VQSLOD=6.7431;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:298,0,672
17	7735063	.	T	G	1171.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.006;DP=107;Dels=0.00;FS=0.775;HRun=1;HaplotypeScore=4.7595;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.543;VQSLOD=5.3631;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,47:107:99:1202,0,1506
17	7735934	.	G	A	3911.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.206;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=1.115;HRun=0;HaplotypeScore=5.7572;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.446;VQSLOD=3.5948;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,109:200:99:3314,0,2577
17	7760704	.	A	G	882.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.665;DP=91;Dels=0.00;FS=5.543;HRun=1;HaplotypeScore=2.6653;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.057;VQSLOD=5.3342;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,38:91:99:912,0,1456
17	7761512	.	C	A	1294.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.740;DP=112;Dels=0.00;FS=7.809;HRun=1;HaplotypeScore=6.5949;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.594;VQSLOD=4.4174;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,48:112:99:1324,0,1660
17	7847955	.	C	A	1729.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.161;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=5.758;HRun=1;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=-0.858;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.276;VQSLOD=4.1591;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,77:240:99:1759,0,4557
17	7849130	.	G	A	1451.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=173;Dels=0.00;FS=3.018;HRun=0;HaplotypeScore=5.3597;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.092;VQSLOD=3.1154;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,60:173:99:1482,0,2960
17	8046772	.	C	G	1283.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.41;MQ0=0;QD=32.92;VQSLOD=9.6111;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1317,105,0
17	8108331	.	A	G	1222.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.65;MQ0=0;QD=32.18;VQSLOD=8.7384;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1256,105,0
17	8132763	.	T	C	1597.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.282;DP=129;Dels=0.00;FS=4.054;HRun=0;HaplotypeScore=2.8888;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.299;VQSLOD=5.7373;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,67:129:99:1628,0,1681
17	8135061	.	T	C	3557.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6342;MQ=58.73;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=8.4846;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3557,289,0
17	8157310	.	C	T	3513.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8271;MQ=59.25;MQ0=0;QD=33.14;VQSLOD=9.2061;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3513,277,0
17	8161149	.	C	T	1308.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=93;Dels=0.00;FS=10.489;HRun=0;HaplotypeScore=1.6120;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=14.07;ReadPosRankSum=2.034;VQSLOD=3.7257;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,51:93:99:1338,0,1161
17	8167600	.	T	C	615.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.1462;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.876;VQSLOD=5.5643;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,26:71:99:645,0,1262
17	8224276	.	T	C	1697.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.857;DP=135;Dels=0.00;FS=1.379;HRun=1;HaplotypeScore=3.3631;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=12.58;ReadPosRankSum=2.244;VQSLOD=5.2798;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,70:135:99:1728,0,1529
17	8243469	.	T	C	917.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;DP=75;Dels=0.00;FS=4.546;HRun=0;HaplotypeScore=3.5099;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.175;VQSLOD=5.7653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,40:75:99:947,0,950
17	8243661	.	G	A	324.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.098;DP=27;Dels=0.00;FS=1.576;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.512;VQSLOD=6.7047;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:355,0,439
17	8243785	.	A	G	958.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=61;Dels=0.00;FS=5.415;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.115;VQSLOD=5.4851;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,37:61:99:989,0,579
17	8700982	.	C	T	1145.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;DP=62;Dels=0.00;FS=2.370;HRun=0;HaplotypeScore=3.3269;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.041;VQSLOD=5.3485;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,41:62:99:1176,0,547
17	8701423	.	A	G	795.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.724;DP=81;Dels=0.00;FS=1.962;HRun=0;HaplotypeScore=2.8926;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.073;VQSLOD=5.9089;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,30:81:99:825,0,1370
17	8701799	.	G	T	1684.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.127;DP=137;Dels=0.00;FS=1.414;HRun=0;HaplotypeScore=5.8724;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.304;VQSLOD=4.8917;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,69:137:99:1715,0,1900
17	8725214	.	A	AG	1049.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=62.5299;MQ=60.83;MQ0=0;QD=40.38;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78.25:1092,78,0
17	9515777	.	G	A	3501.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.94;MQ0=0;QD=30.19;VQSLOD=9.2850;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3501,268,0
17	9729503	.	G	C	473.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.705;DP=33;Dels=0.00;FS=3.166;HRun=0;HaplotypeScore=1.4105;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.754;VQSLOD=5.2527;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:503,0,424
17	10219113	.	C	T	1390.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.343;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4505;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.445;VQSLOD=5.3212;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,47:92:99:1420,0,1300
17	10223714	.	T	C	255.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9132;MQ=54.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.025;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.110;VQSLOD=2.2252;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:286,0,445
17	10297658	.	A	G	1950.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.795;DP=193;Dels=0.00;FS=5.179;HRun=0;HaplotypeScore=3.5152;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.560;VQSLOD=3.4242;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,80:193:99:1980,0,2895
17	10346781	.	T	C	2618.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.565;DP=208;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.4743;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=12.59;ReadPosRankSum=2.123;VQSLOD=3.2979;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,100:208:99:2648,0,3017
17	10355371	.	C	T	1669.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;DP=136;Dels=0.00;FS=10.917;HRun=1;HaplotypeScore=3.6614;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.386;VQSLOD=3.5099;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,60:136:99:1699,0,2385
17	10355763	.	T	C	1699.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.795;DP=136;Dels=0.00;FS=6.679;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.769;VQSLOD=5.0024;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,66:136:99:1729,0,1687
17	10415269	.	A	G	4423.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.372;VQSLOD=6.6505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,126:250:99:3727,0,3577
17	10614442	.	A	G	940.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.875;DP=88;Dels=0.00;FS=15.569;HRun=1;HaplotypeScore=2.5873;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.056;VQSLOD=3.8281;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,34:88:99:971,0,1374
17	11523082	.	A	G	4821.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6629;MQ=59.73;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=8.4949;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:154:99:4798,388,0
17	11865462	.	G	A	1857.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=145;Dels=0.00;FS=6.399;HRun=0;HaplotypeScore=7.6727;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.188;VQSLOD=4.0723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,68:145:99:1888,0,2269
17	13980350	.	G	A	1882.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=9.0763;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1915,147,0
17	15217437	.	C	G	1911.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=142;Dels=0.00;FS=1.346;HRun=1;HaplotypeScore=3.6560;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.652;VQSLOD=5.8313;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,68:142:99:1941,0,1920
17	15234895	.	C	T	542.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.920;DP=39;Dels=0.00;FS=1.795;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.042;VQSLOD=5.1052;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:573,0,526
17	15406197	.	A	T	729.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.889;VQSLOD=6.0928;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,31:58:99:759,0,765
17	15611495	.	T	C	460.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.186;VQSLOD=5.8943;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,19:46:99:490,0,764
17	15644506	.	C	T	1848.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.174;DP=135;Dels=0.00;FS=2.246;HRun=3;HaplotypeScore=4.7763;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.252;VQSLOD=5.2079;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,68:135:99:1879,0,1760
17	15645289	.	G	A	1563.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.221;DP=118;Dels=0.00;FS=2.432;HRun=1;HaplotypeScore=4.5506;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.106;VQSLOD=5.6230;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,63:118:99:1594,0,1375
17	17046024	.	C	A	2079.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=137;Dels=0.00;FS=6.143;HRun=1;HaplotypeScore=4.4256;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.309;VQSLOD=4.5288;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,73:137:99:2110,0,1695
17	17409560	.	C	T	265.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.537;VQSLOD=7.8237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:42.49:295,0,42
17	17425631	.	C	T	679.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=45;Dels=0.00;FS=9.048;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.614;VQSLOD=4.5070;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,27:45:99:709,0,456
17	17907768	.	C	T	309.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.140;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.030;VQSLOD=11.2225;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:340,0,183
17	18046898	.	T	C	156.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=7.782;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=4.6933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:186,0,103
17	18137141	.	A	G	2525.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=197;Dels=0.00;FS=3.333;HRun=1;HaplotypeScore=7.9136;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.255;VQSLOD=3.8848;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,103:197:99:2555,0,2755
17	18220770	.	G	A	4066.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9965;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.480;VQSLOD=4.9863;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,130:249:99:3427,0,3134
17	18221010	.	A	G	1483.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=107;Dels=0.00;FS=8.009;HRun=0;HaplotypeScore=5.5051;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.798;VQSLOD=4.6440;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,55:107:99:1513,0,1315
17	18565423	.	G	A	498.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;DP=30;Dels=0.00;FS=1.485;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.418;VQSLOD=2.5043;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:528,0,303
17	19232078	.	T	C	4295.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9840;MQ=59.71;MQ0=0;QD=33.04;VQSLOD=9.4111;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4295,331,0
17	19247075	.	G	A	1876.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8814;MQ=57.31;MQ0=0;QD=30.77;VQSLOD=6.3072;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:1910,156,0
17	19474875	.	C	T	1039.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.809;DP=84;Dels=0.00;FS=0.886;HRun=0;HaplotypeScore=2.6503;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.979;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.434;VQSLOD=4.7869;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,45:84:99:1069,0,976
17	19713740	.	C	T	7142.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.1309;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.69;VQSLOD=7.8540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7142,542,0
17	19812541	.	T	C	1415.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;DP=118;Dels=0.00;FS=0.690;HRun=0;HaplotypeScore=1.5115;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.865;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.256;VQSLOD=5.6356;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,58:118:99:1445,0,1413
17	19813277	.	G	T	920.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=84;Dels=0.00;FS=0.827;HRun=2;HaplotypeScore=2.4370;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.139;VQSLOD=3.5126;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,40:84:99:950,0,1127
17	19861458	.	C	T	1751.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.760;DP=163;Dels=0.00;FS=9.804;HRun=0;HaplotypeScore=6.1285;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.975;VQSLOD=3.6741;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,69:163:99:1782,0,2362
17	20108239	.	A	T	6256.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.61;MQ0=0;QD=32.59;VQSLOD=9.2946;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,192:192:99:6255,514,0
17	21202191	.	C	A	1167.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8448;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.278;VQSLOD=2.1896;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,50:102:99:1197,0,1325
17	21203893	.	T	C	242.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.162;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.782;VQSLOD=5.4068;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,10:31:99:273,0,521
17	21215557	.	G	A	868.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=73;Dels=0.00;FS=6.387;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.160;VQSLOD=4.4030;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,34:73:99:898,0,1027
17	21318698	.	C	T	864.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.444;DP=101;Dels=0.00;FS=1.002;HRun=1;HaplotypeScore=1.9819;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.817;VQSLOD=3.9425;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,35:101:99:894,0,1932
17	21319208	.	C	T	1354.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.676;DP=216;DS;Dels=0.00;FS=1.842;HRun=0;HaplotypeScore=6.9732;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.627;VQSLOD=2.3698;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,65:216:99:1384,0,4796
17	21319230	.	G	C	1174.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.532;DP=175;DS;Dels=0.00;FS=6.405;HRun=0;HaplotypeScore=4.8773;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.841;VQSLOD=2.5852;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,54:175:99:1204,0,3598
17	26684390	.	G	GC	398.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=79.5495;MQ=61.31;MQ0=0;QD=28.46;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,12:14:36.10:440,36,0
17	26684394	.	T	G	366.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=63.51;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=6.7100;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:30.10:399,30,0
17	26691321	.	A	G	644.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01;VQSLOD=13.9895;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:54.16:677,54,0
17	26696680	.	T	A	969.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=57;Dels=0.00;FS=1.053;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=17.01;ReadPosRankSum=-1.472;VQSLOD=5.1315;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,34:57:99:1000,0,644
17	26708302	.	G	T	452.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.95;MQ0=0;QD=28.31;VQSLOD=7.6196;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:39.12:486,39,0
17	26708304	.	T	G	388.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.347;VQSLOD=7.3923;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:33.10:422,33,0
17	26824156	.	A	G	2152.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=208;Dels=0.00;FS=1.818;HRun=1;HaplotypeScore=3.7646;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.307;VQSLOD=5.8222;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,81:208:99:2182,0,3185
17	26864302	.	G	C	1082.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;DP=68;Dels=0.00;FS=4.950;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.665;VQSLOD=4.9567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,37:68:99:1113,0,898
17	27284443	.	A	G	1020.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.843;DP=93;Dels=0.00;FS=13.953;HRun=0;HaplotypeScore=5.3462;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.945;VQSLOD=3.2454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,39:93:99:1051,0,1468
17	27286851	.	T	C	537	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;DP=43;Dels=0.00;FS=1.256;HRun=0;HaplotypeScore=2.3972;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=6.7076;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:43:99:567,0,473
17	27438469	.	G	A	367.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23;VQSLOD=13.8665;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:33.10:400,33,0
17	27889986	.	T	C	3362.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.77;MQ0=0;QD=33.96;VQSLOD=9.9756;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:99:99:3362,262,0
17	28320248	.	T	A	1462.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68;VQSLOD=13.6938;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1496,120,0
17	28576076	.	T	C	1724.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=131;Dels=0.00;FS=5.436;HRun=0;HaplotypeScore=4.0679;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.274;VQSLOD=4.8376;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,63:131:99:1754,0,1702
17	29161202	.	A	T	1518.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.718;DP=105;Dels=0.00;FS=5.119;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.126;VQSLOD=4.5568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,59:105:99:1548,0,1033
17	29161358	.	C	T	1406.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.252;DP=107;Dels=0.00;FS=0.737;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.362;VQSLOD=6.4556;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,52:107:99:1436,0,1507
17	29161517	.	G	A	2878.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.678;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4122;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.415;VQSLOD=2.6976;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,112:249:99:2909,0,3276
17	29161845	.	G	A	1455.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;DP=121;Dels=0.00;FS=4.953;HRun=1;HaplotypeScore=1.9978;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.607;VQSLOD=4.8642;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,54:121:99:1486,0,1901
17	29167653	.	A	C	2700.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.493;DP=199;Dels=0.00;FS=5.773;HRun=0;HaplotypeScore=7.7475;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.532;VQSLOD=3.1010;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,108:199:99:2731,0,2365
17	29214387	.	T	C	1649.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.880;DP=94;Dels=0.00;FS=3.254;HRun=0;HaplotypeScore=1.7876;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=3.097;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.493;VQSLOD=4.2893;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,59:94:99:1679,0,843
17	29226228	.	T	C	2746.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.494;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=3.691;HRun=0;HaplotypeScore=4.3202;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.485;VQSLOD=4.8283;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,97:190:99:2777,0,2668
17	30183857	.	T	C	7752.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.6288;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.13;VQSLOD=6.9189;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:7751,671,0
17	30692396	.	G	T	1228.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=104;Dels=0.00;FS=4.926;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.340;VQSLOD=5.5958;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,49:104:99:1258,0,1482
17	32612894	.	G	A	3131.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.366;DP=202;DS;Dels=0.00;FS=9.271;HRun=0;HaplotypeScore=9.3582;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.656;VQSLOD=3.3769;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,115:202:99:3162,0,2369
17	32904586	.	C	T	583.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.121;DP=52;Dels=0.00;FS=3.296;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.621;VQSLOD=6.0688;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,22:52:99:614,0,962
17	33288882	.	T	G	5518.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=34.71;VQSLOD=9.7019;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:5518,436,0
17	33430313	.	T	C	308.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=11.0557;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:338,0,476
17	33448818	.	T	C	2190.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.983;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6685;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.691;VQSLOD=5.7261;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,91:199:99:2220,0,2821
17	33464864	.	C	T	2022.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7474;MQ=58.27;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=8.4389;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2055,153,0
17	33679559	.	G	A	1990.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.961;DP=190;DS;Dels=0.00;FS=4.688;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.531;VQSLOD=3.9422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,81:190:99:2020,0,3044
17	33689926	.	T	C	6795.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9087;MQ=59.10;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.7271;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,224:224:99:6794,515,0
17	33690466	.	C	A	2521.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9454;MQ=58.90;MQ0=0;QD=33.18;VQSLOD=9.3631;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2554,205,0
17	33749546	.	A	G	1081.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=28.46;VQSLOD=8.0336;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:93.25:1114,93,0
17	33749919	.	A	C	5300.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.35;MQ0=0;QD=32.52;VQSLOD=9.8550;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5300,406,0
17	34072555	.	G	A	2102.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.006;DP=165;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.251;VQSLOD=6.5707;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,79:165:99:2132,0,2343
17	34100350	.	G	GC	613.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=30.1353;MQ=58.60;MQ0=0;QD=43.85;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42.14:656,42,0
17	34328461	.	A	G	2371.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.46;MQ0=0;QD=30.02;VQSLOD=9.0247;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2404,181,0
17	34340284	.	C	T	2794.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=31.40;VQSLOD=9.2194;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2828,223,0
17	34854280	.	G	A	2374.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7295;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.084;VQSLOD=6.3568;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,92:185:99:2404,0,2443
17	34862932	.	C	T	462.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;DP=56;Dels=0.00;FS=2.377;HRun=0;HaplotypeScore=3.3153;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.642;VQSLOD=3.5381;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,21:56:99:493,0,941
17	35743010	.	C	G	131.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.134;VQSLOD=5.9676;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:161,0,205
17	35771468	.	C	T	2842.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=207;Dels=0.00;FS=1.725;HRun=1;HaplotypeScore=5.6246;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=13.73;ReadPosRankSum=-1.137;VQSLOD=4.8667;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,111:207:99:2872,0,2499
17	35937637	.	T	C	2482.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.803;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=3.299;HRun=0;HaplotypeScore=11.0486;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.414;VQSLOD=3.6225;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,94:218:99:2512,0,3205
17	35984410	.	T	C	1383.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;DP=103;Dels=0.00;FS=2.595;HRun=0;HaplotypeScore=2.9870;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.529;VQSLOD=6.4365;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,58:103:99:1414,0,1166
17	36861983	.	T	C	991.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34;VQSLOD=7.1109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:81.24:1025,81,0
17	37101380	.	T	C	1270.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.114;DP=103;Dels=0.00;FS=3.895;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=5.6638;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,53:103:99:1301,0,1300
17	37224211	.	C	T	1237.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.606;DP=88;Dels=0.00;FS=5.228;HRun=0;HaplotypeScore=3.9902;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.444;VQSLOD=4.4992;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,45:88:99:1268,0,1096
17	37884037	.	C	G	335.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.017;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.383;VQSLOD=5.8752;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:366,0,534
17	37898543	.	T	C	7495.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3520;MQ=59.17;MQ0=0;QD=30.59;VQSLOD=7.3810;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:7494,641,0
17	38028634	.	G	T	1248.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.346;DP=71;Dels=0.00;FS=2.243;HRun=1;HaplotypeScore=3.7841;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.748;VQSLOD=5.1517;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,46:71:99:1278,0,555
17	38062217	.	C	T	1185.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.135;VQSLOD=6.4486;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,41:84:99:1215,0,1060
17	38121993	.	G	A	376.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.024;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9016;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.036;VQSLOD=3.3602;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:407,0,388
17	38122680	.	G	T	1007.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9657;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.766;VQSLOD=6.3253;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,41:90:99:1037,0,1290
17	38122686	.	G	A	1036.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.114;DP=84;Dels=0.00;FS=1.022;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.278;VQSLOD=6.2993;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,42:84:99:1067,0,1186
17	38457151	.	G	A	4061.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.288;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.517;HRun=2;HaplotypeScore=3.8596;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.964;VQSLOD=5.5232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,123:250:99:3405,0,3635
17	38855772	.	T	C	4000.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.318;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.846;HRun=0;HaplotypeScore=4.6048;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.317;VQSLOD=5.4495;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,132:249:99:3352,0,3185
17	38857446	.	C	A	1451.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.376;VQSLOD=6.6294;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,65:152:99:1482,0,2433
17	38858134	.	CA	C	1828.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.387;DP=108;FS=0.795;HRun=1;HaplotypeScore=268.3103;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.599;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,54:108:99:1867,0,2205
17	38911363	.	G	A	1955.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=148;Dels=0.00;FS=9.951;HRun=1;HaplotypeScore=5.4872;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.280;VQSLOD=4.3253;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,73:148:99:1985,0,1944
17	38935812	.	A	G	1299.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.075;DP=111;Dels=0.00;FS=3.563;HRun=1;HaplotypeScore=1.8136;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.626;VQSLOD=5.8870;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,55:111:99:1329,0,1376
17	38936659	.	C	T	699.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;DP=48;Dels=0.00;FS=6.118;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.797;VQSLOD=5.3169;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,26:48:99:729,0,575
17	38938591	.	C	G	1134.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;DP=97;Dels=0.00;FS=1.904;HRun=1;HaplotypeScore=4.3148;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=1.277;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.778;VQSLOD=5.4536;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,47:97:99:1165,0,1325
17	38955991	.	C	T	4492.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.5893;MQ=59.53;MQ0=0;QD=30.56;VQSLOD=5.2262;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4491,379,0
17	38978536	.	A	C	3364.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=107;Dels=0.00;FS=5.357;HRun=0;HaplotypeScore=4.8117;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=31.45;ReadPosRankSum=1.505;VQSLOD=3.4005;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,106:107:99:3334,234,0
17	38991052	.	T	G	6382.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=6.333;HRun=0;HaplotypeScore=7.7575;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=2.055;QD=29.28;ReadPosRankSum=2.022;VQSLOD=2.5940;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,216:218:99:6314,475,0
17	39084504	.	T	C	3919.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.714;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=3.741;HRun=1;HaplotypeScore=3.5100;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.244;VQSLOD=5.3885;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,119:228:99:3344,0,2783
17	39305956	.	G	A	1374.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.174;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.635;VQSLOD=5.3105;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,54:113:99:1404,0,1527
17	39334133	.	T	C	4538.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8188;MQ=56.82;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=5.6733;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4538,358,0
17	39334241	.	G	C	2046.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;DP=151;Dels=0.00;FS=1.340;HRun=0;HaplotypeScore=5.7387;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.745;VQSLOD=2.3335;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,72:151:99:2076,0,2308
17	39340707	.	C	T	7072.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9880;MQ=58.48;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=8.4884;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:7071,590,0
17	39340910	.	T	C	3357.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0265;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.45;ReadPosRankSum=0.690;VQSLOD=5.2717;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,113:114:99:3356,292,0
17	39406409	.	C	A	7319.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.446;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5726;MQ=53.27;MQ0=1;MQRankSum=1.337;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.446;VQSLOD=3.3738;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,239:240:99:7284,604,0
17	39535859	.	A	G	2106.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.670;DP=145;Dels=0.00;FS=1.373;HRun=0;HaplotypeScore=3.4317;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.093;VQSLOD=5.9640;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,78:145:99:2136,0,1860
17	39580559	.	T	A	1658.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=110;Dels=0.00;FS=10.977;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.119;VQSLOD=4.1398;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,57:110:99:1689,0,1541
17	39580562	.	T	C	1573.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.515;DP=102;Dels=0.00;FS=7.734;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.405;VQSLOD=3.3144;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,54:102:99:1604,0,1405
17	39580660	.	T	C	1737.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=120;Dels=0.00;FS=7.149;HRun=0;HaplotypeScore=2.8896;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.127;VQSLOD=3.9623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,63:120:99:1767,0,1592
17	39580739	.	C	A	1908.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.434;DP=152;Dels=0.00;FS=0.631;HRun=0;HaplotypeScore=3.5230;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=1.676;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.427;VQSLOD=5.8222;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,79:152:99:1939,0,1952
17	39593768	.	A	G	581.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.88;MQ0=0;QD=29.07;VQSLOD=8.5047;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.15:614,48,0
17	39616430	.	G	T	762.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.98;MQ0=0;QD=30.52;VQSLOD=8.4667;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:66.20:796,66,0
17	39619094	.	T	C	1881.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.212;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2814;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.519;VQSLOD=4.0647;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,66:151:99:1911,0,2283
17	39619115	.	G	A	2103.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.427;DP=184;Dels=0.00;FS=0.596;HRun=0;HaplotypeScore=5.7948;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.711;VQSLOD=4.5358;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,82:184:99:2134,0,2482
17	39620565	.	C	T	1796.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;DP=103;Dels=0.00;FS=3.892;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.004;VQSLOD=5.8779;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,70:103:99:1826,0,774
17	39622068	.	G	T	1929.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.198;DP=152;Dels=0.00;FS=1.338;HRun=0;HaplotypeScore=6.9688;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.610;VQSLOD=4.4142;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,76:152:99:1960,0,1906
17	39623363	.	T	C	1107.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.612;DP=102;Dels=0.00;FS=6.176;HRun=2;HaplotypeScore=4.2988;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.010;VQSLOD=4.6409;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,46:102:99:1138,0,1614
17	39633349	.	G	C	628.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.299;DP=63;Dels=0.00;FS=9.769;HRun=0;HaplotypeScore=1.5362;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=9.98;ReadPosRankSum=-2.049;VQSLOD=3.1592;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,27:63:99:659,0,1064
17	39637244	.	A	G	1309.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.089;DP=98;Dels=0.00;FS=14.783;HRun=1;HaplotypeScore=2.5367;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.36;ReadPosRankSum=-2.013;VQSLOD=2.9693;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,56:98:99:1339,0,1086
17	39643646	.	G	A	734.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.268;DP=71;Dels=0.00;FS=6.881;HRun=0;HaplotypeScore=1.5770;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.458;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.646;VQSLOD=4.3201;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,27:71:99:765,0,1203
17	39659194	.	T	C	8439.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1526;MQ=58.79;MQ0=0;QD=33.89;VQSLOD=9.5057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:249:99:8438,695,0
17	39670912	.	G	C	3061.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=9.2821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,97:98:99:3095,235,0
17	39671724	.	T	C	2021.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3913;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.195;VQSLOD=5.5898;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,73:153:99:2052,0,2349
17	39742899	.	C	T	397.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=49.32;MQ0=1;QD=26.48;VQSLOD=6.3621;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:36.08:430,36,0
17	39881289	.	G	C	8644.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.12;MQ0=0;QD=34.72;VQSLOD=9.0393;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8644,689,0
17	39883350	.	G	A	182.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.062;DP=15;Dels=0.00;FS=5.426;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.648;VQSLOD=5.9080;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:212,0,162
17	39884065	.	C	A	675.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;DP=83;Dels=0.00;FS=10.418;HRun=2;HaplotypeScore=4.9216;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.484;VQSLOD=2.8827;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,29:83:99:705,0,1362
17	39884583	.	G	A	2135.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.66;VQSLOD=8.9381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2168,180,0
17	39890715	.	A	T	965.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=8.5625;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.24:999,81,0
17	39890876	.	T	C	62.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.365;VQSLOD=4.4461;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:92.22:92,0,131
17	39912145	.	T	A	1508.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=7.7502;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1542,117,0
17	39967442	.	T	C	3989.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.329;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=7.181;HRun=4;HaplotypeScore=7.0420;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=15.96;ReadPosRankSum=-1.696;VQSLOD=3.8084;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,124:250:99:3320,0,3640
17	39983808	.	G	C	2373.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=231;Dels=0.00;FS=0.495;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.558;VQSLOD=5.4174;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,94:231:99:2404,0,3873
17	39983820	.	G	A	2052.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.052;VQSLOD=6.2416;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,87:228:99:2083,0,3795
17	40065774	.	T	G	1411.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.512;DP=133;Dels=0.00;FS=11.710;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.498;VQSLOD=4.5459;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,62:133:99:1442,0,1957
17	40094835	.	C	T	2685.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.665;DP=206;Dels=0.00;FS=11.674;HRun=0;HaplotypeScore=3.1987;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.259;VQSLOD=4.6797;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,107:206:99:2715,0,2638
17	40696233	.	C	G	799.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.660;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.306;VQSLOD=6.3890;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,33:51:99:830,0,429
17	40706906	.	G	A	54.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=2.932;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.930;VQSLOD=2.7454;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:84.79:85,0,268
17	40714804	.	C	A	1466.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.706;DP=127;Dels=0.00;FS=0.678;HRun=0;HaplotypeScore=1.7326;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.508;VQSLOD=6.4634;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,60:127:99:1497,0,1940
17	40818699	.	A	G	1483.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.766;DP=147;Dels=0.00;FS=3.119;HRun=0;HaplotypeScore=6.5950;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.009;VQSLOD=3.9072;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,67:147:99:1514,0,2235
17	41133071	.	T	C	341.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45;VQSLOD=13.4356;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:30.09:374,30,0
17	41165493	.	A	G	8390.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5953;MQ=59.08;MQ0=0;QD=33.56;VQSLOD=9.3165;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8389,662,0
17	41931375	.	A	G	2424.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15;VQSLOD=14.3046;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2458,199,0
17	41960633	.	C	G	920.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70;VQSLOD=13.1532;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:75.23:954,75,0
17	41960634	.	G	C	991.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99;VQSLOD=13.2357;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:81.25:1025,81,0
17	42030531	.	G	C	2432.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.9104;MQ=58.97;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=6.4584;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2466,193,0
17	42030743	.	G	C	650.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.44;MQ0=0;QD=27.10;VQSLOD=7.5364;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:54.15:683,54,0
17	42225547	.	A	C	3192.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.190;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.466;HRun=1;HaplotypeScore=7.5928;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.562;VQSLOD=4.6755;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,114:250:99:3223,0,3678
17	42248346	.	A	T	1477.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.44;VQSLOD=8.9906;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1510,126,0
17	42254281	.	A	G	265.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.443;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.666;VQSLOD=11.2343;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:296,0,198
17	42398052	.	A	G	4834.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7325;MQ=59.48;MQ0=0;QD=30.03;VQSLOD=9.1452;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:4834,361,0
17	42744238	.	A	C	346.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.074;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.317;VQSLOD=6.7957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:377,0,329
17	42927721	.	G	A	251.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=31;Dels=0.00;FS=3.448;HRun=1;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.061;VQSLOD=5.8504;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:281,0,491
17	42987523	.	G	A	1416.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.385;DP=136;Dels=0.00;FS=4.906;HRun=0;HaplotypeScore=6.5423;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.883;VQSLOD=3.9213;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,60:136:99:1446,0,1717
17	42987524	.	T	C	1468.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.792;DP=137;Dels=0.00;FS=4.785;HRun=0;HaplotypeScore=5.5465;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.847;VQSLOD=4.0868;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,62:137:99:1498,0,1820
17	43192549	.	T	TC	317.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=17.6780;MQ=56.16;MQ0=0;QD=31.78;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:24.08:360,24,0
17	43192821	.	A	G	356.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=34;Dels=0.00;FS=10.961;HRun=0;HaplotypeScore=1.8110;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.902;VQSLOD=4.0176;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:387,0,440
17	43333125	.	C	T	2044.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.437;DP=159;Dels=0.00;FS=7.275;HRun=0;HaplotypeScore=9.5287;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.334;VQSLOD=3.8900;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,77:159:99:2075,0,2091
17	43342141	.	G	C	496.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.048;VQSLOD=6.2502;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,21:51:99:526,0,850
17	43364293	.	C	CG	3155.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=170.5425;MQ=60.02;MQ0=0;QD=40.99;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,76:77:99:3198,217,0
17	43923180	.	G	A	3823.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.408;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3105;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=31.08;ReadPosRankSum=-0.515;VQSLOD=6.8232;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,115:123:99:3823,325,0
17	44109474	.	G	A	1415.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.721;DP=110;Dels=0.00;FS=0.732;HRun=0;HaplotypeScore=6.3074;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.307;VQSLOD=5.1945;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,58:110:99:1446,0,1339
17	44144993	.	C	G	2855.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;QD=32.44;VQSLOD=7.7896;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2888,220,0
17	44248848	.	G	A	2004.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.117;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.304;HRun=3;HaplotypeScore=3.7103;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.148;VQSLOD=5.7152;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,83:250:99:2035,0,4729
17	44950122	.	T	C	707.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.86;MQ0=0;QD=26.22;VQSLOD=7.7413;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:60.18:741,60,0
17	45008570	.	G	A	2378.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9262;MQ=59.68;MQ0=0;QD=32.58;VQSLOD=9.1686;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2412,190,0
17	45234406	.	CA	C	1993.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.634;DP=118;FS=7.666;HRun=1;HaplotypeScore=787.9733;MQ=46.20;MQ0=9;MQRankSum=-4.934;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.593;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,78:118:99:2033,0,2412
17	45360730	.	T	C	1283.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=136;Dels=0.00;FS=3.311;HRun=1;HaplotypeScore=3.7488;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.621;VQSLOD=5.6992;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,55:136:99:1314,0,2238
17	45915788	.	T	C	3669.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=7.3671;MQ=59.18;MQ0=0;QD=32.48;VQSLOD=6.6205;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3669,295,0
17	46262171	.	C	T	1867.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.096;DP=148;Dels=0.00;FS=0.847;HRun=0;HaplotypeScore=3.2798;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.008;VQSLOD=6.5531;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,65:148:99:1897,0,2110
17	46607021	.	T	C	6457.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7613;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.32;VQSLOD=8.9007;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:213:99:6457,524,0
17	46607958	.	T	A	1939.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;DP=146;Dels=0.00;FS=10.130;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.012;VQSLOD=4.7652;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,77:146:99:1970,0,1825
17	46688135	.	G	A	429.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;DP=28;Dels=0.00;FS=4.494;HRun=2;HaplotypeScore=1.9301;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.070;VQSLOD=5.3241;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:460,0,341
17	46688256	.	T	C	3315.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.318;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.406;VQSLOD=8.3033;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,111:113:99:3315,253,0
17	46847364	.	C	A	948.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=83;Dels=0.00;FS=0.834;HRun=1;HaplotypeScore=2.7041;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.441;VQSLOD=6.4250;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,40:83:99:979,0,1173
17	46939658	.	C	G	947.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=101;Dels=0.00;FS=2.661;HRun=0;HaplotypeScore=2.6210;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.956;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.170;VQSLOD=4.4729;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,43:101:99:977,0,1657
17	47039132	.	T	C	531.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=44;Dels=0.00;FS=4.388;HRun=1;HaplotypeScore=6.4660;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.998;VQSLOD=4.1733;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,22:44:99:562,0,590
17	47210506	.	C	A	87.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.437;VQSLOD=5.1277;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:117,0,228
17	47783663	.	C	T	459.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.654;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.870;VQSLOD=6.0130;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:37:99:490,0,464
17	48226811	.	C	T	304.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.511;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.919;VQSLOD=12.1695;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:335,0,124
17	48265495	.	T	C	405.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=13.8390;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.11:438,39,0
17	48356260	.	G	C	3340.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.7313;MQ=58.76;MQ0=0;QD=32.43;VQSLOD=8.9206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:103:99:3304,262,0
17	48432324	.	G	C	1846.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;DP=137;Dels=0.00;FS=0.661;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.041;VQSLOD=5.9994;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,71:137:99:1877,0,1755
17	48437456	.	C	G	643.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;DP=64;Dels=0.00;FS=9.185;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.688;VQSLOD=3.6131;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,26:64:99:674,0,1037
17	48452776	.	A	C	3791.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=120;Dels=0.00;FS=4.357;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.635;VQSLOD=4.5353;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,119:120:99:3760,263,0
17	48456193	.	T	C	1271.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.293;DP=110;Dels=0.00;FS=1.579;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.817;VQSLOD=5.4116;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,51:110:99:1301,0,1526
17	48557326	.	G	A	1050.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.857;DP=89;Dels=0.00;FS=9.193;HRun=0;HaplotypeScore=7.2887;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.392;VQSLOD=4.0457;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,46:89:99:1080,0,1111
17	48557348	.	T	C	1100.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.533;DP=112;Dels=0.00;FS=0.704;HRun=0;HaplotypeScore=2.9639;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=9.83;ReadPosRankSum=2.455;VQSLOD=5.4033;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,48:112:99:1131,0,1781
17	51900729	.	C	T	2471.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.605;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8238;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.039;VQSLOD=5.9207;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,90:159:99:2501,0,1718
17	51901643	.	C	T	3770.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.85;MQ0=0;QD=29.93;VQSLOD=8.4782;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3770,298,0
17	51901703	.	C	G	3350.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.77;MQ0=0;QD=33.51;VQSLOD=9.2877;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3350,262,0
17	53076799	.	G	A	3949.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.2664;MQ=58.87;MQ0=0;QD=34.35;VQSLOD=6.5530;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3950,307,0
17	54534634	.	G	A	2462.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.95;MQ0=0;QD=30.03;VQSLOD=8.5613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2495,193,0
17	54978794	.	G	A	2713.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=237;Dels=0.00;FS=2.423;HRun=0;HaplotypeScore=3.7727;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.297;VQSLOD=6.0115;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,108:237:99:2744,0,3547
17	56247101	.	C	A	6000.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.8878;MQ=59.62;MQ0=0;QD=34.49;VQSLOD=4.5246;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:6000,499,0
17	56270442	.	A	G	2413.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.901;DP=196;Dels=0.00;FS=7.694;HRun=1;HaplotypeScore=4.8478;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.964;VQSLOD=4.2258;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,87:196:99:2443,0,3036
17	56271094	.	G	C	692.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;DP=55;Dels=0.00;FS=2.307;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.531;VQSLOD=5.7940;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,26:55:99:722,0,810
17	56332327	.	G	A	1008.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.207;DP=119;DS;Dels=0.00;FS=5.401;HRun=0;HaplotypeScore=1.9988;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.442;VQSLOD=5.0744;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,43:119:99:1038,0,2138
17	56386383	.	C	CT	730.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;DP=137;FS=171.598;HRun=2;HaplotypeScore=494.7743;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=4.418;QD=5.33;ReadPosRankSum=-4.329;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,48:137:99:770,0,1671
17	56386732	.	C	T	1310.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.298;DP=121;Dels=0.00;FS=3.857;HRun=1;HaplotypeScore=2.7838;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.466;VQSLOD=5.3053;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,50:121:99:1341,0,1733
17	56388238	.	C	G	403.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.153;VQSLOD=12.0355;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:433,0,370
17	56405046	.	C	T	1017.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8237;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.210;VQSLOD=5.7196;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,36:82:99:1048,0,1370
17	56435080	.	G	C	2427.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;DP=197;Dels=0.00;FS=3.276;HRun=0;HaplotypeScore=3.7192;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.850;VQSLOD=5.6357;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,100:197:99:2458,0,2669
17	56435885	.	G	T	665.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.160;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.160;VQSLOD=6.7147;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,24:47:99:695,0,670
17	56436109	.	C	T	289.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=4.786;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.181;VQSLOD=2.9826;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:319,0,177
17	56492800	.	T	C	1734.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=118;Dels=0.00;FS=0.710;HRun=0;HaplotypeScore=3.1633;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.613;VQSLOD=6.3920;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,68:118:99:1765,0,1227
17	56544280	.	T	G	2556.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5439;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.20;VQSLOD=7.6989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2590,193,0
17	56584205	.	A	C	373.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.348;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.066;VQSLOD=6.1029;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:404,0,643
17	56584508	.	T	C	831.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;DP=78;Dels=0.00;FS=1.939;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.138;VQSLOD=6.3721;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,36:78:99:862,0,1192
17	56585872	.	G	C	1702.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=134;Dels=0.00;FS=6.523;HRun=0;HaplotypeScore=4.8738;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.861;VQSLOD=4.6307;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,66:134:99:1733,0,1767
17	56598991	.	T	A	2264.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=164;Dels=0.00;FS=2.845;HRun=0;HaplotypeScore=7.4968;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=13.81;ReadPosRankSum=2.265;VQSLOD=4.2306;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,89:164:99:2295,0,1987
17	56621286	.	G	T	2538.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7523;MQ=58.98;MQ0=0;QD=28.85;VQSLOD=7.7837;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,85:88:99:2572,214,0
17	56659018	.	C	T	1084.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.614;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=6.5631;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,41:75:99:1115,0,1006
17	57963537	.	A	G	835.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=98;Dels=0.00;FS=3.137;HRun=0;HaplotypeScore=3.7966;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.917;VQSLOD=5.5476;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,38:98:99:866,0,1632
17	58786625	.	A	G	2510.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.27;MQ0=0;QD=29.89;VQSLOD=8.7957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2544,193,0
17	59534904	.	G	C	1685.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.778;DP=147;Dels=0.01;FS=2.169;HRun=1;HaplotypeScore=7.3320;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.268;VQSLOD=3.1300;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,63:147:99:1715,0,2022
17	59557600	.	C	T	1495.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=89;Dels=0.00;FS=8.453;HRun=0;HaplotypeScore=1.6630;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.281;VQSLOD=4.4843;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,53:89:99:1526,0,660
17	59761411	.	CTCTT	C	1754.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.940;DP=76;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=349.1594;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.955;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,38:76:99:1794,0,2237
17	59763347	.	A	G	5292.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.4684;MQ=59.81;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=8.1290;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,167:167:99:5292,403,0
17	59955426	.	T	G	2561.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7329;MQ=58.70;MQ0=0;QD=30.49;VQSLOD=9.3299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2594,202,0
17	60767015	.	G	A	492.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.05;MQ0=0;QD=30.78;VQSLOD=8.6463;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:45.13:525,45,0
17	60814273	.	A	G	8435.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5063;MQ=59.65;MQ0=0;QD=34.02;VQSLOD=7.4179;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8435,674,0
17	61417560	.	G	T	2278.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.025;DP=150;Dels=0.00;FS=3.953;HRun=0;HaplotypeScore=2.3293;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=4.0971;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,86:150:99:2308,0,1716
17	61497577	.	G	A	310.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.759;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.050;VQSLOD=5.5283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:340,0,113
17	61623052	.	C	T	2039.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.037;DP=158;Dels=0.00;FS=0.612;HRun=0;HaplotypeScore=4.6350;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.273;VQSLOD=5.4752;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,80:158:99:2069,0,2071
17	61901197	.	T	A	5950.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=4.095;HRun=0;HaplotypeScore=4.6470;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=30.52;ReadPosRankSum=-1.268;VQSLOD=3.6468;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,193:195:99:5912,456,0
17	61903445	.	G	C	6538.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2071;MQ=58.81;MQ0=0;QD=32.37;VQSLOD=8.6663;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:202:99:6538,512,0
17	62041068	.	T	C	288.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.441;VQSLOD=10.7338;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:319,0,647
17	63554591	.	G	A	1464.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=117;Dels=0.00;FS=1.501;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.156;VQSLOD=6.5801;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,56:117:99:1495,0,1726
17	63822357	.	T	C	4276.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.278;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.473;HRun=1;HaplotypeScore=3.4634;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=2.184;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.258;VQSLOD=4.2104;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,122:250:99:3616,0,3367
17	64023624	.	T	C	267.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.326;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.011;VQSLOD=5.4982;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:297,0,395
17	64208285	.	C	G	581.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.423;DP=54;Dels=0.00;FS=15.480;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.303;VQSLOD=3.6085;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:611,0,705
17	64210757	.	C	A	1897.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.358;DP=143;Dels=0.00;FS=1.390;HRun=1;HaplotypeScore=1.8646;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.613;VQSLOD=5.4824;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,73:143:99:1927,0,1704
17	64216815	.	C	T	1878.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.780;DP=166;Dels=0.00;FS=4.950;HRun=0;HaplotypeScore=8.4373;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.039;VQSLOD=4.0624;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,75:166:99:1908,0,2042
17	64216854	.	A	G	1543.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=112;Dels=0.00;FS=5.030;HRun=1;HaplotypeScore=9.1306;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.566;VQSLOD=3.6411;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1574,0,1398
17	64783081	.	G	A	4254.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.69;MQ0=0;QD=31.99;VQSLOD=9.1433;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:4254,349,0
17	65104743	.	G	A	1834.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.156;DP=143;Dels=0.00;FS=0.622;HRun=1;HaplotypeScore=2.5315;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.797;VQSLOD=6.2301;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,68:143:99:1864,0,2038
17	65989048	.	T	C	1475.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6865;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=-1.520;VQSLOD=8.3857;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,48:49:99:1509,104,0
17	66246416	.	A	G	2657.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.418;DP=189;Dels=0.00;FS=1.138;HRun=0;HaplotypeScore=4.9853;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.161;VQSLOD=5.5065;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,104:189:99:2687,0,2182
17	66364691	.	C	G	2494.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.706;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.176;VQSLOD=8.8000;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,80:81:99:2527,162,0
17	66364804	.	T	C	5222.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;DP=171;Dels=0.00;FS=3.839;HRun=1;HaplotypeScore=2.7599;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=30.54;ReadPosRankSum=-1.307;VQSLOD=4.1126;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,170:171:99:5184,374,0
17	66449122	.	G	A	1060.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9467;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.954;VQSLOD=6.4494;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,45:100:99:1090,0,1543
17	66533655	.	A	G	767.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.291;DP=58;Dels=0.00;FS=3.576;HRun=0;HaplotypeScore=4.4575;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.708;VQSLOD=5.1121;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,30:58:99:797,0,787
17	66538239	.	G	T	1313.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9933;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.092;VQSLOD=6.6824;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,49:88:99:1344,0,1119
17	66872692	.	A	G	2052.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;DP=205;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7824;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.613;VQSLOD=4.4093;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,81:205:99:2083,0,3215
17	66985992	.	T	G	927.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.489;DP=59;Dels=0.00;FS=7.561;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.771;VQSLOD=4.5708;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,33:59:99:958,0,701
17	67031457	.	C	T	5220.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.32;MQ0=0;QD=30.53;VQSLOD=9.1449;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,171:171:99:5220,406,0
17	67081830	.	T	C	2125.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;QD=29.52;VQSLOD=8.5403;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2158,162,0
17	67101718	.	C	T	973.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;QD=31.39;VQSLOD=9.7806;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.25:1006,81,0
17	67125840	.	C	T	3535.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=29.22;VQSLOD=8.5738;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3535,268,0
17	67178316	.	A	G	1929.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.77;MQ0=0;QD=27.96;VQSLOD=7.0595;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1962,153,0
17	67210992	.	T	C	1132.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.86;MQ0=0;QD=28.31;VQSLOD=7.9770;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:87.26:1166,87,0
17	67212423	.	G	A	7580.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7728;MQ=59.38;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=9.3635;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:7580,584,0
17	67273882	.	C	A	2007.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.86;MQ0=0;QD=30.41;VQSLOD=8.6691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2040,159,0
17	70943990	.	T	C	5249.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.5982;MQ=58.40;MQ0=0;QD=32.20;VQSLOD=6.2041;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5249,412,0
17	71232804	.	C	A	1972.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=34.60;VQSLOD=9.5959;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2005,163,0
17	71426656	.	G	T	225.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.154;VQSLOD=6.4471;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:256,0,303
17	72233559	.	G	A	1819.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.954;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8094;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.751;VQSLOD=5.5892;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,66:119:99:1849,0,1279
17	72240168	.	G	A	449.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.651;DP=60;Dels=0.00;FS=9.995;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.196;VQSLOD=2.2570;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,22:60:99:479,0,879
17	72240177	.	T	G	1451.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.39;VQSLOD=6.5824;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1485,120,0
17	72248512	.	C	T	854.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.840;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.329;VQSLOD=6.7063;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,32:64:99:884,0,961
17	72308319	.	G	A	1196.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19;VQSLOD=13.6659;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1230,102,0
17	72346868	.	C	T	1049.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.777;DP=62;Dels=0.00;FS=7.543;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.004;VQSLOD=3.8466;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,36:62:99:1079,0,774
17	72366695	.	C	A	1451.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.55;VQSLOD=9.2345;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1484,117,0
17	72367973	.	T	C	946.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;DP=65;Dels=0.00;FS=3.468;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.099;VQSLOD=4.9132;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,35:65:99:976,0,720
17	72540936	.	G	A	1315.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.208;DP=140;Dels=0.00;FS=1.363;HRun=0;HaplotypeScore=3.3904;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.240;VQSLOD=3.9852;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,56:140:99:1345,0,2307
17	72610089	.	C	T	418.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.231;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.910;VQSLOD=6.7767;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:448,0,589
17	72613589	.	T	G	430.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9941;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=5.6708;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:460,0,545
17	72691928	.	T	C	2826.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.81;MQ0=0;QD=29.14;VQSLOD=8.8533;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:2859,241,0
17	72700943	.	A	G	3313.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.16;VQSLOD=9.7495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:97:99:3313,259,0
17	72784932	.	G	A	3657.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4205;MQ=59.81;MQ0=0;QD=30.48;VQSLOD=8.3581;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3657,286,0
17	72916365	.	C	T	684.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.900;DP=54;Dels=0.00;FS=2.577;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.140;VQSLOD=4.8171;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,24:54:99:714,0,786
17	72927123	.	G	T	5625.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.535;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3012;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=31.25;ReadPosRankSum=-1.240;VQSLOD=7.1819;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,178:180:99:5595,410,0
17	72937605	.	G	A	909.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=9.6460;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:75.23:942,75,0
17	72937851	.	G	A	1226.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.200;DP=82;Dels=0.00;FS=3.518;HRun=1;HaplotypeScore=3.4308;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.247;VQSLOD=5.6709;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,46:82:99:1256,0,931
17	72938100	.	T	C	3602.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5544;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.79;VQSLOD=9.0251;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:117:99:3602,274,0
17	73512884	.	T	G	143.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.188;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.206;VQSLOD=5.1473;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:173,0,277
17	73518203	.	G	C	214.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.061;VQSLOD=5.7619;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:245,0,119
17	73519413	.	C	T	2232.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=173;DS;Dels=0.00;FS=1.254;HRun=0;HaplotypeScore=5.8516;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.254;VQSLOD=5.1227;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,92:173:99:2262,0,2185
17	73552185	.	G	A	1596.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.004;DP=129;Dels=0.00;FS=3.267;HRun=0;HaplotypeScore=2.5575;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.755;VQSLOD=6.1347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,64:129:99:1626,0,1553
17	73565171	.	T	C	1051.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87;VQSLOD=13.9547;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:84.26:1085,84,0
17	73567846	.	C	T	626.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.662;DP=61;Dels=0.00;FS=7.146;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.932;VQSLOD=3.6886;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:656,0,965
17	73570718	.	C	G	297.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.640;DP=31;Dels=0.00;FS=8.695;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.310;VQSLOD=4.0899;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:327,0,563
17	73753098	.	G	A	993.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.002;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.983;VQSLOD=10.5342;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,36:65:99:1023,0,743
17	73753503	.	T	C	2084.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9523;MQ=57.28;MQ0=0;QD=32.58;VQSLOD=7.2167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2118,177,0
17	73827205	.	T	C	1365.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.19;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=8.5117;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1399,114,0
17	73949540	.	G	C	3937.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=59.54;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=9.8533;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:121:99:3900,298,0
17	74014668	.	T	C	1138.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.817;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.336;QD=26.48;ReadPosRankSum=1.471;VQSLOD=5.7953;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,41:43:57.60:1172,58,0
17	74076415	.	G	A	6100	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.0641;MQ=58.89;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=5.5997;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:6099,481,0
17	74287204	.	C	G	2638.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;DP=240;Dels=0.00;FS=2.917;HRun=0;HaplotypeScore=8.7691;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.047;VQSLOD=3.2399;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,107:240:99:2668,0,3603
17	74287389	.	T	C	1156.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=87;Dels=0.00;FS=2.880;HRun=0;HaplotypeScore=5.2117;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.201;VQSLOD=5.3469;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,48:87:99:1187,0,1043
17	74287594	.	G	A	2527.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.627;DP=185;Dels=0.00;FS=1.954;HRun=0;HaplotypeScore=2.6722;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.281;VQSLOD=6.0497;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,99:185:99:2558,0,2485
17	74289705	.	A	G	2053.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;DP=156;Dels=0.00;FS=7.282;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.144;VQSLOD=5.1022;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,76:156:99:2084,0,2173
17	74300534	.	C	T	621.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=12.18;ReadPosRankSum=2.355;VQSLOD=4.9484;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,23:51:99:651,0,686
17	74387284	.	C	T	1225.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;DP=99;Dels=0.00;FS=1.681;HRun=0;HaplotypeScore=2.8561;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.160;VQSLOD=6.6601;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:99:99:1255,0,1313
17	74475024	.	G	A	1355.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.39;MQ0=0;QD=35.68;VQSLOD=8.6161;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1389,111,0
17	75190846	.	A	C	6418.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.77;VQSLOD=9.1486;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,199:202:99:6339,488,0
17	75398498	.	C	T	370.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;DP=23;Dels=0.00;FS=7.464;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.613;VQSLOD=4.0572;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:401,0,199
17	75494705	.	A	G	239.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.73;VQSLOD=13.4405;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:21.06:272,21,0
17	76130575	.	A	T	3456.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=58.51;MQ0=0;QD=28.10;VQSLOD=8.2522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:123:99:3456,277,0
17	76219591	.	G	A	2027.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72;VQSLOD=13.9269;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2060,162,0
17	76433898	.	T	C	1820.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36;VQSLOD=13.2379;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1854,156,0
17	76447713	.	C	A	3116.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.301;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=2.212;HRun=2;HaplotypeScore=1.7333;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.231;VQSLOD=4.6139;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,122:248:99:3147,0,3495
17	76491127	.	T	C	775.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=33.73;VQSLOD=9.2828;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:66.19:809,66,0
17	76497920	.	C	A	5011.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8583;MQ=59.39;MQ0=0;QD=33.19;VQSLOD=10.0246;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,151:151:99:5011,394,0
17	76498692	.	C	T	935.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.97;MQ0=0;QD=33.40;VQSLOD=9.1237;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:75.24:968,75,0
17	76503593	.	T	C	1442.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.37;VQSLOD=9.1249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1476,126,0
17	76511089	.	C	T	998.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.147;DP=79;Dels=0.00;FS=10.834;HRun=1;HaplotypeScore=1.8664;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.390;VQSLOD=3.8105;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,39:79:99:1028,0,1014
17	76528790	.	A	G	258.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.269;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.512;VQSLOD=5.7246;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:289,0,370
17	76567707	.	T	C	2875.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=58.47;MQ0=0;QD=30.59;VQSLOD=8.2772;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2909,229,0
17	77081788	.	G	A	427.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.166;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.015;VQSLOD=12.0418;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:457,0,575
17	77704912	.	T	C	446.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.308;VQSLOD=5.5219;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:477,0,559
17	78079597	.	A	G	2252.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7675;MQ=58.85;MQ0=0;QD=29.25;VQSLOD=8.5015;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2286,183,0
17	78079669	.	G	A	1412.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=30.05;ReadPosRankSum=-0.995;VQSLOD=8.8557;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,46:47:99:1445,120,0
17	78091405	.	G	A	3173.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.20;MQ0=0;QD=29.66;VQSLOD=7.6774;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3207,259,0
17	78171944	.	G	C	1675.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.222;DP=193;Dels=0.00;FS=5.682;HRun=1;HaplotypeScore=4.4645;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.380;VQSLOD=4.6840;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,69:193:99:1706,0,3391
17	78184393	.	C	T	937.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=13.9413;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:84.20:971,84,0
17	78293189	.	A	T	5153.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9058;MQ=59.57;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=8.7884;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:5152,412,0
17	79089590	.	A	G	700.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6488;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.293;VQSLOD=6.0043;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,34:94:99:730,0,1660
17	79171967	.	A	G	423.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.45;MQ0=0;QD=28.21;VQSLOD=7.8330;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:15:39.09:456,39,0
17	79173184	.	T	C	171.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=19;Dels=0.00;FS=2.003;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.910;VQSLOD=5.4282;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:202,0,250
17	79220224	.	G	C	375.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=32;Dels=0.00;FS=3.637;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.377;VQSLOD=4.2622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:32:99:406,0,428
17	79409710	.	G	A	172.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;DP=19;Dels=0.00;FS=8.318;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.310;VQSLOD=4.0052;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:202,0,350
17	79424516	.	A	G	445.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85;VQSLOD=13.3923;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:36.12:479,36,0
17	79429852	.	C	T	1915.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.530;DP=138;Dels=0.00;FS=5.115;HRun=0;HaplotypeScore=1.8663;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.383;VQSLOD=6.0559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,71:138:99:1946,0,1715
17	79508400	.	T	C	613.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88;VQSLOD=12.6011;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:22:51.16:646,51,0
17	79609410	.	G	T	540.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=45;Dels=0.00;FS=15.623;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.103;VQSLOD=3.6806;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,20:45:99:570,0,681
17	79612161	.	C	T	216.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=20;Dels=0.00;FS=2.199;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=6.0949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:247,0,402
17	79612333	.	G	A	571.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=40;Dels=0.00;FS=8.272;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.177;VQSLOD=3.9332;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,22:40:99:601,0,534
17	79612382	.	T	C	280.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.903;DP=27;Dels=0.00;FS=6.486;HRun=0;HaplotypeScore=3.7898;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.293;VQSLOD=2.7541;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:311,0,392
17	79612397	.	A	G	683.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6040;MQ=58.05;MQ0=0;QD=28.48;VQSLOD=6.6163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:63.12:716,63,0
17	79612413	.	T	C	505.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.39;MQ0=0;QD=28.06;VQSLOD=7.8526;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:45.13:538,45,0
17	79612443	.	T	C	379.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=8.2648;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.10:413,36,0
17	79612633	.	T	C	81.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=16;Dels=0.00;FS=2.622;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=5.08;ReadPosRankSum=-1.152;VQSLOD=3.5907;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:111,0,347
17	79637367	.	C	G	255.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.850;DP=27;Dels=0.00;FS=9.356;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.074;VQSLOD=4.3504;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:285,0,445
17	79639550	.	G	A	102.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.408;VQSLOD=5.4423;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:133,0,160
17	79639708	.	C	T	193.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.228;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.456;VQSLOD=5.9539;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:224,0,315
17	79650828	.	T	G	248.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;DP=20;Dels=0.00;FS=11.311;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.041;VQSLOD=3.6091;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:278,0,213
17	79668135	.	G	T	1607.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;DP=106;Dels=0.00;FS=0.794;HRun=0;HaplotypeScore=2.5740;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.746;VQSLOD=5.3984;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,64:106:99:1637,0,1034
17	79671714	.	T	C	1559.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.037;DP=156;Dels=0.00;FS=1.339;HRun=1;HaplotypeScore=5.1221;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.101;VQSLOD=5.0030;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,62:156:99:1589,0,2353
17	80006957	.	A	C	3725.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=58.58;MQ0=0;QD=32.39;VQSLOD=8.5631;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3725,295,0
17	80011813	.	C	A	669.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;DP=68;Dels=0.00;FS=7.508;HRun=1;HaplotypeScore=3.1930;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.430;VQSLOD=3.0750;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,28:68:99:699,0,1212
17	80059596	.	T	C	1209.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.207;DP=92;Dels=0.00;FS=1.703;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.681;VQSLOD=5.7375;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,49:92:99:1240,0,1079
17	80085633	.	A	G	624.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.010;DP=36;Dels=0.00;FS=2.707;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.587;VQSLOD=6.0809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,24:36:99:655,0,347
17	80085703	.	G	T	1090.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.069;DP=83;Dels=0.00;FS=5.603;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.178;VQSLOD=5.5141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,43:83:99:1121,0,1055
17	80136418	.	C	T	593.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.489;VQSLOD=6.0048;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,24:45:99:624,0,549
17	80391684	.	A	G	1645.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6640;MQ=59.52;MQ0=0;QD=34.29;VQSLOD=9.7814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:48:99:1679,138,0
17	80789628	.	T	C	859.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;DP=71;Dels=0.00;FS=4.886;HRun=0;HaplotypeScore=2.6492;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.546;VQSLOD=5.1082;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,36:71:99:890,0,962
17	80895933	.	A	G	1193.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11;VQSLOD=14.3552;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:35:96.30:1227,96,0
18	334742	.	C	T	497.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.081;DP=48;Dels=0.00;FS=1.133;HRun=0;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.203;VQSLOD=6.4393;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,22:48:99:528,0,644
18	334994	.	A	G	286.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.223;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.445;VQSLOD=9.9874;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:317,0,481
18	580623	.	T	C	1107.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;DP=81;Dels=0.00;FS=0.838;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.443;VQSLOD=5.5063;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,41:81:99:1137,0,1089
18	658064	.	G	C	47.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.925;DP=12;Dels=0.00;FS=6.264;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.740;VQSLOD=2.3010;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:77.17:77,0,222
18	691266	.	A	G	1656.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.550;DP=136;Dels=0.00;FS=4.267;HRun=0;HaplotypeScore=4.9901;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.291;VQSLOD=5.3195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,62:136:99:1687,0,2004
18	2539016	.	C	G	2367.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8300;MQ=58.71;MQ0=0;QD=29.23;VQSLOD=8.5663;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2400,181,0
18	2547500	.	G	T	732.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;DP=67;Dels=0.00;FS=0.993;HRun=1;HaplotypeScore=1.8628;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.057;VQSLOD=6.6472;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,29:67:99:763,0,992
18	2595443	.	G	T	745.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.188;DP=79;Dels=0.00;FS=1.869;HRun=0;HaplotypeScore=5.6853;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.468;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.283;VQSLOD=3.1981;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,34:79:99:775,0,1278
18	2616457	.	G	C	688.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;DP=74;Dels=0.00;FS=3.454;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.598;VQSLOD=5.9046;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,29:74:99:719,0,1090
18	2707619	.	G	A	1239.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.768;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8284;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.409;VQSLOD=6.4097;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,55:123:99:1270,0,1735
18	2724930	.	A	T	343.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21;VQSLOD=13.1993;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:30.09:376,30,0
18	3126811	.	A	G	559.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.735;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.260;VQSLOD=6.4133;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:590,0,621
18	3176040	.	C	G	241.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.202;VQSLOD=5.5819;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,13:40:99:271,0,705
18	3188976	.	A	G	1627.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.415;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.3595;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.623;VQSLOD=4.3410;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,59:103:99:1657,0,1008
18	3452222	.	CT	C	405.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.604;DP=33;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=91.0296;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.507;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:444,0,640
18	5956238	.	C	T	6697.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0225;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=30.17;ReadPosRankSum=1.102;VQSLOD=6.8063;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,220:222:99:6696,557,0
18	6912143	.	A	C	754.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=34.30;VQSLOD=10.1496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:60.19:788,60,0
18	6980523	.	T	C	2533.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.78;VQSLOD=8.4784;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:88:99:2566,193,0
18	6985270	.	C	T	7758.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.50;MQ0=0;QD=31.41;VQSLOD=9.0890;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:247:99:7758,629,0
18	6993673	.	T	C	6383.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7481;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.50;VQSLOD=7.3677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,224:224:99:6382,499,0
18	6997818	.	A	C	7136.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.90;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=9.3459;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,226:226:99:7136,542,0
18	7008591	.	T	C	4207.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.003;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5475;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.413;QD=29.22;ReadPosRankSum=-0.529;VQSLOD=7.6147;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,140:144:99:4118,229,0
18	8784612	.	A	G	3296.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.47;MQ0=0;QD=32.64;VQSLOD=8.5764;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3296,277,0
18	8825946	.	G	A	728.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;DP=57;Dels=0.00;FS=1.077;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.377;VQSLOD=5.4269;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,29:57:99:759,0,670
18	9117867	.	T	C	2411.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.50;VQSLOD=6.9408;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2444,175,0
18	9255982	.	A	G	95.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;DP=15;Dels=0.00;FS=2.363;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.184;VQSLOD=5.1023;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:125,0,284
18	9887497	.	G	A	4454.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.295;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.467;HRun=1;HaplotypeScore=4.6258;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.167;VQSLOD=4.2582;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,128:250:99:3743,0,3312
18	12984144	.	C	A	2159.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=32.72;VQSLOD=9.9003;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2193,175,0
18	13068132	.	T	C	4495.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=4.6673;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=8.6947;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,139:139:99:4495,349,0
18	13069782	.	C	T	3609.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.10;MQ0=0;QD=31.12;VQSLOD=8.9001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3609,280,0
18	13095609	.	T	C	4202.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7787;MQ=59.57;MQ0=0;QD=30.01;VQSLOD=8.6328;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4201,343,0
18	13116432	.	G	T	3658.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8585;MQ=59.62;MQ0=0;QD=30.49;VQSLOD=7.6485;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:3659,280,0
18	14105923	.	T	C	2996.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=9.6293;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:3029,229,0
18	19154143	.	G	A	2565.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.472;DP=217;Dels=0.00;FS=1.873;HRun=0;HaplotypeScore=5.7605;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.381;VQSLOD=5.2281;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,99:217:99:2595,0,3153
18	20573556	.	G	A	630.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=52;Dels=0.00;FS=2.388;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.833;VQSLOD=5.7752;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:660,0,736
18	21057228	.	C	T	2413.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=166;DS;Dels=0.00;FS=3.339;HRun=1;HaplotypeScore=1.9860;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.176;VQSLOD=4.9759;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,88:166:99:2444,0,1835
18	21119949	.	T	A	1470.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;DP=134;Dels=0.00;FS=1.531;HRun=2;HaplotypeScore=4.5098;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.228;VQSLOD=4.0276;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,60:134:99:1500,0,1932
18	21424991	.	C	A	870.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.214;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9945;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=12.09;ReadPosRankSum=2.208;VQSLOD=4.3753;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,35:72:99:900,0,894
18	21511034	.	C	A	1837.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.338;DP=160;Dels=0.00;FS=1.259;HRun=2;HaplotypeScore=3.5588;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.111;VQSLOD=6.1374;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,76:160:99:1867,0,2035
18	21511089	.	A	G	3955.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5856;MQ=59.81;MQ0=0;QD=31.90;VQSLOD=7.2541;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3955,316,0
18	21736933	.	T	G	2874.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=32.30;ReadPosRankSum=0.331;VQSLOD=14.0333;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,88:89:99:2907,223,0
18	22020543	.	C	G	5272.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=9.5962;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5272,400,0
18	23866185	.	G	C	1187.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;DP=96;Dels=0.00;FS=3.855;HRun=0;HaplotypeScore=8.1384;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.752;VQSLOD=4.1371;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,43:96:99:1217,0,1391
18	28610988	.	C	T	956.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=5.9516;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,40:90:99:986,0,1211
18	28611061	.	A	T	694.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.363;DP=61;Dels=0.00;FS=1.078;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.151;VQSLOD=4.6397;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,30:61:99:725,0,793
18	28737407	.	G	A	1080.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.472;DP=68;Dels=0.00;FS=2.045;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.640;VQSLOD=5.1509;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,37:68:99:1110,0,838
18	28898294	.	A	G	1408.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=132;Dels=0.00;FS=0.654;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.261;VQSLOD=4.9353;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,59:132:99:1438,0,1806
18	28986333	.	A	C	6260.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.240;VQSLOD=9.7589;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,194:195:99:6261,476,0
18	29055957	.	A	G	3934.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7129;MQ=58.68;MQ0=0;QD=31.73;VQSLOD=9.2225;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3934,328,0
18	29101156	.	T	G	1855.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.219;DP=135;Dels=0.00;FS=0.677;HRun=1;HaplotypeScore=3.4433;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.378;VQSLOD=4.5429;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,74:135:99:1886,0,1540
18	29205591	.	T	C	1172.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=128;Dels=0.00;FS=1.435;HRun=0;HaplotypeScore=3.9789;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.228;VQSLOD=5.4583;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,50:128:99:1202,0,2055
18	29412105	.	A	C	1079.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1512;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=3.8673;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,51:104:99:1110,0,1192
18	29497573	.	A	G	7267.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.8021;MQ=59.10;MQ0=0;QD=29.07;VQSLOD=4.3231;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7266,581,0
18	29782953	.	A	G	419.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.648;DP=33;Dels=0.00;FS=1.500;HRun=0;HaplotypeScore=1.9985;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.531;VQSLOD=5.4771;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,16:33:99:450,0,427
18	29795101	.	T	C	1751.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.781;DP=156;Dels=0.00;FS=6.049;HRun=1;HaplotypeScore=3.6972;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.296;VQSLOD=4.8420;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,69:156:99:1781,0,2102
18	29797921	.	C	T	985.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.707;DP=70;Dels=0.00;FS=1.116;HRun=0;HaplotypeScore=7.8029;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.762;VQSLOD=4.0023;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,35:70:99:1015,0,865
18	30804756	.	C	T	2373.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=9.5700;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2406,187,0
18	30804758	.	A	C	1143.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.454;DP=76;Dels=0.00;FS=10.414;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.416;VQSLOD=3.6999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,42:76:99:1173,0,887
18	30846895	.	A	T	385.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=8.2771;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:33.10:419,33,0
18	31320229	.	A	G	404.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.595;DP=34;Dels=0.00;FS=1.456;HRun=0;HaplotypeScore=2.9633;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.035;VQSLOD=6.0221;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:435,0,561
18	31324934	.	A	G	1935.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;DP=151;Dels=0.00;FS=10.111;HRun=0;HaplotypeScore=6.1400;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.091;VQSLOD=4.2797;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,74:151:99:1965,0,1970
18	32917644	.	T	C	3029.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=31.23;VQSLOD=9.7217;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:3062,235,0
18	33557466	.	A	G	1828.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.980;DP=153;Dels=0.00;FS=2.848;HRun=0;HaplotypeScore=3.1570;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.779;VQSLOD=6.0185;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,75:153:99:1859,0,1974
18	33718326	.	A	C	1340.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.573;DP=101;Dels=0.00;FS=0.826;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.208;VQSLOD=6.2571;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,47:101:99:1371,0,1411
18	33725931	.	G	A	3057.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.159;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.463;HRun=1;HaplotypeScore=4.1268;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.597;VQSLOD=5.7100;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,123:250:99:3088,0,3332
18	33779855	.	C	T	2925.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9795;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=31.80;ReadPosRankSum=1.017;VQSLOD=9.1302;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,91:92:99:2959,226,0
18	33779896	.	A	G	3322.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.01;MQ0=0;QD=35.35;VQSLOD=10.1000;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3322,259,0
18	33780020	.	A	G	5601.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5125;MQ=58.94;MQ0=0;QD=28.43;VQSLOD=7.7705;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:197:99:5600,442,0
18	33785093	.	G	A	3579.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6553;MQ=58.65;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=8.5135;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3579,280,0
18	34273279	.	C	G	710.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.071;DP=42;Dels=0.00;FS=3.590;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.394;VQSLOD=4.9509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,24:42:99:741,0,504
18	34647322	.	G	T	1087.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.385;DP=74;Dels=0.00;FS=1.505;HRun=1;HaplotypeScore=2.7535;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.016;VQSLOD=6.3585;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,38:74:99:1118,0,1081
18	42532606	.	G	A	1013.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.337;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.7747;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.483;VQSLOD=3.5509;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,46:112:99:1044,0,1753
18	43206985	.	A	G	7282.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=3.269;HRun=0;HaplotypeScore=2.7754;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=29.37;ReadPosRankSum=1.648;VQSLOD=4.0324;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,247:248:99:7250,570,0
18	43246156	.	G	A	1607.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.147;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8216;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.389;VQSLOD=6.5062;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,64:147:99:1637,0,2238
18	43252883	.	G	A	2714.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.689;DP=199;Dels=0.00;FS=4.254;HRun=0;HaplotypeScore=8.1717;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.061;VQSLOD=4.6330;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,104:199:99:2745,0,2397
18	43262359	.	G	A	7966.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.0146;MQ=58.74;MQ0=0;QD=31.86;VQSLOD=4.7128;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,246:250:99:7937,671,0
18	43319519	.	G	A	1953.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.763;DP=144;Dels=0.00;FS=3.930;HRun=1;HaplotypeScore=2.9874;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.488;VQSLOD=5.6487;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,75:144:99:1984,0,1874
18	43497710	.	A	G	1960.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=155;DS;Dels=0.00;FS=1.400;HRun=0;HaplotypeScore=1.7870;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.377;VQSLOD=6.9076;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,67:155:99:1990,0,2358
18	43534824	.	T	C	1563.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.905;DP=105;Dels=0.00;FS=1.617;HRun=0;HaplotypeScore=5.6765;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.659;VQSLOD=4.9166;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,63:105:99:1594,0,1122
18	44560429	.	C	A	1490.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.623;DP=131;Dels=0.00;FS=0.649;HRun=1;HaplotypeScore=3.2378;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.554;VQSLOD=6.0269;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,58:131:99:1521,0,1750
18	44560875	.	C	A	1352.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.485;DP=103;Dels=0.00;FS=1.724;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.412;VQSLOD=6.7500;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,52:103:99:1382,0,1561
18	44561100	.	C	G	751.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;DP=64;Dels=0.00;FS=1.020;HRun=2;HaplotypeScore=3.9540;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.739;VQSLOD=2.6658;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,31:64:99:782,0,866
18	44585955	.	G	A	2747.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=6.347;HRun=3;HaplotypeScore=13.2607;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=2.273;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.299;VQSLOD=2.4338;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,104:239:99:2778,0,3622
18	47093864	.	C	T	802.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.665;DP=65;Dels=0.00;FS=3.997;HRun=0;HaplotypeScore=1.9962;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.572;VQSLOD=6.1705;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,30:65:99:832,0,897
18	47563299	.	T	C	3145.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=97;Dels=0.00;FS=3.821;HRun=0;HaplotypeScore=5.3280;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=32.42;ReadPosRankSum=1.443;VQSLOD=4.3995;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,96:97:99:3178,245,0
18	47908556	.	G	A	1230.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.714;DP=108;Dels=0.00;FS=3.626;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.086;VQSLOD=5.9622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,57:108:99:1261,0,1327
18	48331553	.	T	C	1535.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.858;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9966;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.255;VQSLOD=6.4576;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,63:151:99:1566,0,2035
18	49867224	.	T	C	5588.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1136;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=8.9133;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5588,430,0
18	50432602	.	C	G	3399.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56;VQSLOD=12.8093;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3399,283,0
18	51820805	.	G	A	2275.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.45;VQSLOD=8.4051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2309,184,0
18	52258548	.	T	C	3881.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5165;MQ=58.39;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=8.7038;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3881,298,0
18	53303101	.	C	G	642.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.15;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=8.3527;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:51.16:676,51,0
18	55021725	.	A	C	1862.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.745;DP=129;Dels=0.00;FS=1.638;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.162;VQSLOD=6.8562;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,68:129:99:1893,0,1681
18	55317676	.	C	T	4174.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.96;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=9.3034;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:4173,346,0
18	56149099	.	T	C	1683.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.069;DP=98;Dels=0.00;FS=8.328;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.967;VQSLOD=3.6724;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,59:98:99:1713,0,1012
18	56203898	.	T	G	2445.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.123;DP=165;Dels=0.00;FS=2.802;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.484;QD=14.82;ReadPosRankSum=-2.608;VQSLOD=4.3184;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,88:165:99:2475,0,2024
18	56204250	.	A	C	2065.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.947;DP=130;Dels=0.00;FS=1.405;HRun=1;HaplotypeScore=3.4423;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.796;VQSLOD=6.0423;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,70:130:99:2095,0,1655
18	56204489	.	C	G	1924.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;DP=156;Dels=0.00;FS=1.313;HRun=0;HaplotypeScore=7.9969;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=12.33;ReadPosRankSum=-2.058;VQSLOD=2.7453;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,74:156:99:1954,0,2287
18	56204747	.	G	A	1087.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=107;Dels=0.00;FS=1.576;HRun=0;HaplotypeScore=2.8596;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.908;VQSLOD=6.1478;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,45:107:99:1118,0,1686
18	56247600	.	C	A	4139.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.035;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5547;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.138;VQSLOD=5.5052;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,126:249:99:3510,0,3262
18	56279025	.	T	G	551.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.967;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.822;VQSLOD=6.4055;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:38:99:581,0,478
18	59174759	.	C	A	1417.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.860;DP=105;Dels=0.00;FS=1.648;HRun=0;HaplotypeScore=4.0144;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.003;VQSLOD=6.0520;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,55:105:99:1447,0,1389
18	59814324	.	G	C	656.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56;VQSLOD=13.1036;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:51.17:690,51,0
18	60021761	.	C	T	748.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.162;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.443;VQSLOD=6.6761;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,34:71:99:779,0,937
18	60027241	.	C	T	1454.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.297;DP=136;Dels=0.00;FS=0.656;HRun=0;HaplotypeScore=4.6877;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.356;VQSLOD=5.7756;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,60:136:99:1484,0,1812
18	61264298	.	G	A	6813.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8803;MQ=59.54;MQ0=0;QD=30.97;VQSLOD=7.1482;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,220:220:99:6813,521,0
18	61377579	.	A	C	3383.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.67;VQSLOD=7.8925;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3383,250,0
18	61390332	.	C	T	558.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=9.9191;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:48.15:591,48,0
18	61390361	.	T	C	499.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78;VQSLOD=13.4610;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:39.13:533,39,0
18	61471523	.	G	A	932.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.375;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.797;VQSLOD=4.6060;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,39:71:99:962,0,796
18	61647069	.	G	A	4633.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.1876;MQ=59.00;MQ0=0;QD=31.31;VQSLOD=4.8382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4633,355,0
18	61654247	.	G	T	928.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.678;DP=89;Dels=0.00;FS=0.817;HRun=0;HaplotypeScore=2.8602;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.193;VQSLOD=4.8800;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,39:89:99:959,0,1482
18	61654463	.	A	G	1122.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.3258;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.401;VQSLOD=3.6102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,54:180:99:1152,0,3259
18	63530016	.	A	G	3651.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.4614;MQ=58.52;MQ0=0;QD=35.11;VQSLOD=4.9554;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3651,295,0
18	64172434	.	C	G	1741.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=161;Dels=0.00;FS=7.236;HRun=0;HaplotypeScore=6.0966;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.029;VQSLOD=3.2381;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,71:161:99:1772,0,2351
18	65179829	.	G	A	744.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.890;DP=59;Dels=0.00;FS=0.998;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.190;VQSLOD=5.7663;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,30:59:99:775,0,894
18	66504459	.	A	T	4763.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.60;MQ0=0;QD=31.34;VQSLOD=8.7807;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,152:152:99:4763,373,0
18	66513615	.	A	G	278.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;DP=40;Dels=0.00;FS=1.360;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.579;VQSLOD=4.6118;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,12:40:99:308,0,635
18	66542006	.	G	T	951.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=73;Dels=0.00;FS=1.923;HRun=3;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.296;VQSLOD=6.4182;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,36:73:99:981,0,1030
18	67531642	.	T	C	4836.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7692;MQ=59.13;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=9.1065;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:4836,388,0
18	67718688	.	A	G	4112.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4567;MQ=59.59;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=8.6996;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4112,313,0
18	67871343	.	A	C	2770.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=30.78;ReadPosRankSum=-1.463;VQSLOD=8.9128;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,89:90:99:2803,217,0
18	70417396	.	C	T	3363.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.77;MQ0=0;QD=33.30;VQSLOD=9.5446;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3363,283,0
18	72103782	.	T	C	601.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=57.17;MQ0=0;QD=24.05;VQSLOD=4.5341;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:60.09:634,60,0
18	72176083	.	T	C	937.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=82;Dels=0.00;FS=0.846;HRun=0;HaplotypeScore=4.4961;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.736;VQSLOD=5.2877;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,40:82:99:968,0,1059
18	72228124	.	A	G	8032.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.2568;MQ=59.00;MQ0=0;QD=32.13;VQSLOD=5.5415;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8031,659,0
18	74580780	.	C	T	1886.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.997;DP=118;Dels=0.00;FS=0.862;HRun=1;HaplotypeScore=1.8295;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.076;VQSLOD=6.2463;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,67:118:99:1917,0,1213
18	74611127	.	A	G	2099.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87;VQSLOD=14.0420;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2133,166,0
18	74980809	.	G	A	5385.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.8246;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.96;VQSLOD=7.6266;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5385,415,0
18	76753588	.	A	G	625.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28;VQSLOD=13.5479;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:54.16:659,54,0
18	76873346	.	G	A	942.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.919;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9794;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.628;VQSLOD=3.5375;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,41:88:99:973,0,1121
18	77097360	.	A	T	1135.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.835;DP=128;Dels=0.00;FS=1.471;HRun=1;HaplotypeScore=4.4899;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.559;VQSLOD=4.5714;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,47:128:99:1166,0,2193
18	77246406	.	T	G	5046.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4867;MQ=59.20;MQ0=0;QD=33.65;VQSLOD=8.9893;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:150:99:5019,406,0
18	77805949	.	A	C	1193.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.841;DP=85;Dels=0.00;FS=6.452;HRun=0;HaplotypeScore=4.1719;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.697;VQSLOD=4.9514;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,42:85:99:1223,0,1040
19	282753	.	G	A	1214.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.230;DP=103;Dels=0.00;FS=1.628;HRun=0;HaplotypeScore=2.7565;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.392;VQSLOD=6.6165;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,48:103:99:1245,0,1258
19	501738	.	C	A	147.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=18;Dels=0.00;FS=1.913;HRun=0;HaplotypeScore=2.7317;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.826;VQSLOD=3.2790;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:177,0,293
19	501743	.	T	C	191.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.468;DP=16;Dels=0.00;FS=5.021;HRun=1;HaplotypeScore=2.7317;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.523;VQSLOD=3.6028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:222,0,180
19	549678	.	A	G	2257.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.5717;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.550;VQSLOD=7.6094;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,76:77:99:2290,165,0
19	651684	.	C	T	88.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.731;VQSLOD=5.1756;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:10:13.61:119,0,14
19	687142	.	G	A	536.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=31.57;VQSLOD=8.7643;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:45.14:570,45,0
19	868115	.	C	T	133.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9993;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.268;VQSLOD=5.0928;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:163,0,255
19	990281	.	G	A	891.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.23;VQSLOD=7.7327;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:72.19:925,72,0
19	1004710	.	C	T	271.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.854;VQSLOD=5.8669;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:302,0,422
19	1004740	.	T	C	851.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;DP=61;Dels=0.00;FS=1.145;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.866;VQSLOD=4.4118;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,34:61:99:881,0,764
19	1004896	.	G	GCGTT	2476.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;DP=97;FS=6.952;HRun=0;HaplotypeScore=461.3256;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.050;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.353;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,25:97:99:2515,0,3271
19	1005230	.	C	T	1240.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;DP=100;Dels=0.00;FS=3.726;HRun=0;HaplotypeScore=1.9912;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.387;VQSLOD=6.3074;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,47:100:99:1270,0,1559
19	1042809	.	A	G	1587.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;QD=33.07;VQSLOD=9.7139;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1620,126,0
19	1055191	.	G	A	1217.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9908;MQ=58.67;MQ0=0;QD=34.80;VQSLOD=8.5657;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1251,105,0
19	1056492	.	G	C	1763.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.54;MQ0=0;QD=35.27;VQSLOD=8.4642;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1796,141,0
19	1068738	.	G	A	1104.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.405;VQSLOD=6.1670;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,44:100:99:1134,0,1512
19	1074000	.	A	T	224.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;DP=23;Dels=0.00;FS=4.216;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.403;VQSLOD=5.7993;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:254,0,372
19	1094004	.	G	A	1667.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.434;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7332;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.179;VQSLOD=6.0005;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:1700,119,0
19	1106615	.	T	C	623.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.96;VQSLOD=6.9965;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:57.14:656,57,0
19	1113701	.	G	A	185.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.896;VQSLOD=5.1232;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:215,0,116
19	1231142	.	T	C	468.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.303;DP=48;Dels=0.00;FS=5.093;HRun=0;HaplotypeScore=1.5767;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.061;VQSLOD=4.9641;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,27:48:99:498,0,392
19	1360575	.	G	A	1322.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;DP=82;Dels=0.00;FS=0.911;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.758;VQSLOD=6.0823;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,48:82:99:1352,0,906
19	1388538	.	C	T	476.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.402;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8109;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.565;VQSLOD=5.1927;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:507,0,359
19	1811603	.	C	T	680.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=46;Dels=0.00;FS=1.192;HRun=0;HaplotypeScore=1.9907;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.985;VQSLOD=5.8556;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,27:46:99:711,0,492
19	2098063	.	A	T	4482.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.052;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.464;HRun=1;HaplotypeScore=2.5769;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.369;VQSLOD=5.3062;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,134:250:99:3780,0,3108
19	2109157	.	T	C	1905.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.997;DP=116;Dels=0.00;FS=7.699;HRun=0;HaplotypeScore=5.5428;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.032;VQSLOD=4.5400;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,70:116:99:1936,0,1093
19	2118692	.	C	T	786.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.512;DP=67;Dels=0.00;FS=2.185;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.158;VQSLOD=4.6996;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,30:67:99:817,0,972
19	2226676	.	G	A	322.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.261;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.156;VQSLOD=5.9210;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:353,0,115
19	2249477	.	G	T	267	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=3.424;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.761;VQSLOD=3.2392;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:42.16:297,0,42
19	2251817	.	T	C	941.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69;VQSLOD=12.9218;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:81.20:975,81,0
19	2252990	.	C	G	104.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=2.463;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.387;VQSLOD=5.5845;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:135,0,154
19	2340154	.	G	GC	718.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=34.6617;MQ=58.60;MQ0=0;QD=37.81;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:54.17:761,54,0
19	2389872	.	G	C	1994.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9747;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.013;VQSLOD=5.9127;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,73:148:99:2024,0,2171
19	2422191	.	G	A	2163.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;DP=173;Dels=0.00;FS=2.656;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.625;VQSLOD=5.4358;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,82:173:99:2193,0,2286
19	2917287	.	C	A	1380.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.351;DP=101;Dels=0.00;FS=3.874;HRun=4;HaplotypeScore=5.3550;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.615;VQSLOD=5.1742;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,49:101:99:1410,0,1521
19	2939396	.	T	C	2107.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.074;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.8313;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.990;VQSLOD=4.7333;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,82:174:99:2137,0,2256
19	2939401	.	C	G	2310.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.592;DP=177;Dels=0.00;FS=3.468;HRun=1;HaplotypeScore=3.8313;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.227;VQSLOD=4.2794;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,88:177:99:2340,0,2369
19	3150238	.	A	G	4406.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5565;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=31.93;ReadPosRankSum=0.139;VQSLOD=9.2513;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,137:138:99:4375,312,0
19	3179427	.	G	A	2794.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;DP=218;DS;Dels=0.00;FS=1.894;HRun=0;HaplotypeScore=8.8479;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.730;VQSLOD=2.5443;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,108:218:99:2825,0,2997
19	3179884	.	G	T	2245.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.016;DP=174;Dels=0.00;FS=5.565;HRun=0;HaplotypeScore=4.6904;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.267;VQSLOD=4.6791;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,86:174:99:2275,0,2091
19	3750615	.	T	C	236.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;DP=24;Dels=0.00;FS=3.755;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.615;VQSLOD=2.8984;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:266,0,339
19	3752874	.	A	G	744.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9947;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.740;VQSLOD=6.3280;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,29:61:99:774,0,727
19	3831709	.	C	T	122.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.365;VQSLOD=11.5279;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:152,0,121
19	3831765	.	G	A	204.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.919;DP=19;Dels=0.00;FS=4.320;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.429;VQSLOD=3.7480;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:235,0,265
19	4180836	.	C	T	1528.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.52;MQ0=0;QD=33.96;VQSLOD=8.3143;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1561,129,0
19	4216910	.	G	A	566.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.305;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5964;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.070;VQSLOD=4.9544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,23:31:99:596,0,185
19	4217207	.	T	G	415.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=34.63;VQSLOD=9.5113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.11:449,36,0
19	4236996	.	G	A	1163.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7803;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.181;VQSLOD=5.6203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,41:92:99:1193,0,1471
19	4288332	.	A	G	2049.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=9.6630;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2083,163,0
19	4292841	.	C	G	2617.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.92;VQSLOD=7.9323;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2650,208,0
19	4442999	.	T	G	325.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.54;MQ0=0;QD=25.07;VQSLOD=7.4781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:27.08:359,27,0
19	4454083	.	C	T	834.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;DP=97;Dels=0.00;FS=4.996;HRun=0;HaplotypeScore=5.1692;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.766;VQSLOD=3.6440;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,35:97:99:864,0,1574
19	4510560	.	C	T	805.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.61;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=8.9106;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:69.20:838,69,0
19	4512669	.	T	C	6952.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.9420;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.104;VQSLOD=7.1107;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,224:226:99:6906,554,0
19	4513559	.	A	G	1206.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9897;MQ=58.07;MQ0=0;QD=34.48;VQSLOD=7.0696;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1240,102,0
19	4847713	.	A	G	261.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.507;DP=36;Dels=0.00;FS=1.614;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.652;VQSLOD=4.5639;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,11:36:99:291,0,642
19	4859937	.	T	C	1578.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.136;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.360;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.371;VQSLOD=7.2364;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,53:55:94.08:1611,94,0
19	4910889	.	G	T	1179.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=108;Dels=0.00;FS=5.329;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.745;VQSLOD=5.4068;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,45:108:99:1210,0,1500
19	4910924	.	C	T	1393.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.673;DP=128;Dels=0.00;FS=11.340;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.065;VQSLOD=3.2464;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,56:128:99:1423,0,1899
19	4945914	.	A	C	508.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.4972;MQ=55.22;MQ0=0;QD=24.23;VQSLOD=3.1215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:45.11:542,45,0
19	4945917	.	C	T	476.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4972;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.734;VQSLOD=2.6262;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:12.64:509,13,0
19	4945974	.	T	C	347.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.22;MQ0=0;QD=26.76;VQSLOD=8.0834;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:36.07:381,36,0
19	4954679	.	G	GC	533.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=24.3986;MQ=43.18;MQ0=1;QD=31.39;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:13:39.13:576,39,0
19	5135392	.	A	G	2252.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;QD=29.64;VQSLOD=8.8893;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2285,178,0
19	5214697	.	A	G	1587.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96;VQSLOD=14.0646;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1621,135,0
19	5844537	.	A	G	6047.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=9.4154;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,198:198:99:6047,496,0
19	5844649	.	G	A	2565.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=32.89;VQSLOD=9.6335;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2599,217,0
19	6042059	.	C	T	1568.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.767;DP=135;Dels=0.00;FS=0.663;HRun=1;HaplotypeScore=3.3081;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=2.371;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.286;VQSLOD=5.5146;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,63:135:99:1599,0,2019
19	6156483	.	T	C	2381.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.078;DP=184;Dels=0.00;FS=7.468;HRun=0;HaplotypeScore=5.4205;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.203;VQSLOD=4.0660;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,86:184:99:2411,0,2662
19	6156510	.	A	G	2641.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.579;DP=198;Dels=0.00;FS=4.981;HRun=0;HaplotypeScore=6.7005;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.696;VQSLOD=4.1028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,97:198:99:2671,0,2710
19	6312290	.	T	C	2182.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9925;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.149;VQSLOD=6.2200;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,82:166:99:2213,0,2404
19	6374890	.	G	A	1473.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.863;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.4778;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.438;VQSLOD=4.5716;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,52:106:99:1503,0,1381
19	6452423	.	C	T	432.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.557;DP=36;Dels=0.00;FS=1.365;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.621;VQSLOD=5.8286;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:462,0,373
19	6665020	.	T	C	6805.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4547;MQ=59.42;MQ0=0;QD=35.45;VQSLOD=8.5544;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:192:99:6772,539,0
19	6737481	.	T	C	138.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;DP=12;Dels=0.00;FS=2.463;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.259;VQSLOD=4.5913;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:169,0,135
19	6850767	.	C	T	1041.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.983;DP=88;Dels=0.00;FS=1.780;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.015;VQSLOD=6.1651;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,42:88:99:1071,0,1110
19	6896483	.	G	A	2612.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.652;DP=181;DS;Dels=0.00;FS=0.613;HRun=0;HaplotypeScore=3.3853;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.541;VQSLOD=5.9328;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,103:181:99:2643,0,1921
19	6897464	.	C	G	959.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=71;Dels=0.00;FS=2.017;HRun=1;HaplotypeScore=3.7129;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.800;VQSLOD=5.2902;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,34:71:99:989,0,1009
19	6901891	.	G	A	4225.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.078;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=9.196;HRun=1;HaplotypeScore=1.8660;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.337;VQSLOD=4.1922;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,127:250:99:3562,0,3499
19	6903920	.	A	G	1627.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.222;DP=116;Dels=0.00;FS=8.942;HRun=0;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.577;VQSLOD=4.6262;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,58:116:99:1658,0,1594
19	6904137	.	C	T	1265.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.520;DP=129;Dels=0.00;FS=11.637;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.171;VQSLOD=3.6992;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,56:129:99:1296,0,2114
19	6913707	.	C	T	1577.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.474;VQSLOD=7.0813;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,59:136:99:1607,0,2151
19	6913811	.	A	G	7769.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.7603;MQ=59.13;MQ0=0;QD=31.58;VQSLOD=6.3133;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:246:99:7769,590,0
19	6919624	.	A	C	5254.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.15;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=9.4113;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:164:99:5254,403,0
19	6919753	.	A	G	2631.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=32.09;VQSLOD=9.5462;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:2664,214,0
19	7528734	.	A	G	543.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.67;MQ0=0;QD=28.58;VQSLOD=7.5511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:48.11:576,48,0
19	7533850	.	A	G	278.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33;VQSLOD=12.1640;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:11:24.08:312,24,0
19	7569282	.	A	G	998.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=87;Dels=0.00;FS=1.912;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.482;VQSLOD=5.6822;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,39:87:99:1029,0,1196
19	7571030	.	T	A	370.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.301;DP=41;Dels=0.00;FS=2.026;HRun=1;HaplotypeScore=1.3670;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.065;VQSLOD=5.4894;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:400,0,581
19	7573098	.	T	A	704.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.278;DP=50;Dels=0.00;FS=1.101;HRun=1;HaplotypeScore=1.8653;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.511;VQSLOD=5.5715;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,29:50:99:734,0,503
19	7573287	.	C	T	345.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;DP=47;Dels=0.00;FS=4.443;HRun=0;HaplotypeScore=1.9459;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.483;VQSLOD=4.5714;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,16:47:99:376,0,826
19	7573297	.	T	C	265.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;DP=45;Dels=0.00;FS=4.741;HRun=2;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.355;VQSLOD=3.2294;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,14:45:99:295,0,921
19	7584223	.	A	G	1138.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.042;DP=99;Dels=0.00;FS=1.704;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.937;VQSLOD=5.9491;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,42:99:99:1169,0,1539
19	7712277	.	A	G	606.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5518;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.727;VQSLOD=6.2056;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,26:58:99:636,0,785
19	7831628	.	G	A	2078.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.979;DP=147;Dels=0.00;FS=2.062;HRun=1;HaplotypeScore=2.9132;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.454;VQSLOD=6.0920;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,78:147:99:2109,0,1750
19	7986638	.	C	G	2057.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=29.82;VQSLOD=8.4832;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2091,169,0
19	7992976	.	T	C	328.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.584;VQSLOD=4.2581;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,16:40:99:358,0,588
19	8121360	.	A	G	625.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;DP=76;Dels=0.00;FS=0.913;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.933;VQSLOD=3.9242;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,28:76:99:656,0,1203
19	8138054	.	C	A	1526.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;DP=120;Dels=0.00;FS=3.712;HRun=0;HaplotypeScore=2.5975;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=12.72;ReadPosRankSum=-1.151;VQSLOD=6.1006;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,59:120:99:1556,0,1677
19	8168545	.	C	T	1152.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.712;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6120;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.407;VQSLOD=5.7104;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,39:79:99:1183,0,1041
19	8196444	.	C	T	2662.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.4095;MQ=57.66;MQ0=0;QD=31.32;VQSLOD=6.7345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:85:99:2695,217,0
19	8326904	.	G	A	427.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;DP=36;Dels=0.00;FS=1.579;HRun=0;HaplotypeScore=1.9577;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.838;VQSLOD=6.0475;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:458,0,506
19	8436164	.	C	T	863.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.005;DP=72;Dels=0.00;FS=3.257;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.168;VQSLOD=6.5538;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:893,0,942
19	8486884	.	G	A	1400.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.181;DP=134;Dels=0.00;FS=2.237;HRun=0;HaplotypeScore=4.5466;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.457;VQSLOD=5.2367;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,60:134:99:1431,0,1979
19	8645786	.	A	C	967.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.50;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.0657;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:78.24:1000,78,0
19	8669931	.	G	C	258.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.415;VQSLOD=11.5692;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:289,0,413
19	8808373	.	G	T	926.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.997;DP=80;Dels=0.00;FS=3.030;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.970;VQSLOD=6.3739;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,35:80:99:956,0,1344
19	8808900	.	A	G	911.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7037;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.241;VQSLOD=6.1651;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,38:108:99:942,0,1751
19	8808942	.	A	G	1150.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.857;DP=104;Dels=0.00;FS=0.786;HRun=4;HaplotypeScore=8.3186;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=11.07;ReadPosRankSum=2.210;VQSLOD=3.2486;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,45:104:99:1181,0,1431
19	8953922	.	C	T	450.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.474;DP=34;Dels=0.00;FS=3.703;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.936;VQSLOD=6.1573;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:481,0,367
19	8961981	.	C	G	908.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.934;DP=66;Dels=0.00;FS=3.159;HRun=0;HaplotypeScore=5.2918;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.522;VQSLOD=4.8436;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,30:66:99:938,0,1086
19	9001833	.	A	G	257.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.564;VQSLOD=5.3852;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:287,0,542
19	9003618	.	C	T	3223.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.658;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.978;HRun=0;HaplotypeScore=8.0142;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.046;VQSLOD=3.9644;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,116:250:99:3253,0,3573
19	9019605	.	C	G	5299.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.5224;MQ=58.91;MQ0=0;QD=30.63;VQSLOD=4.9204;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:5299,400,0
19	9024994	.	C	T	1839.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.651;DP=110;DS;Dels=0.00;FS=5.550;HRun=1;HaplotypeScore=2.5900;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.193;VQSLOD=5.0456;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,62:110:99:1870,0,1114
19	9028373	.	G	A	2819.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=3.549;HRun=0;HaplotypeScore=9.6006;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.556;VQSLOD=4.1605;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,109:203:99:2850,0,2543
19	9047267	.	C	T	2444.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=182;Dels=0.00;FS=6.298;HRun=0;HaplotypeScore=3.6414;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.982;VQSLOD=4.4831;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,91:182:99:2475,0,2635
19	9048035	.	G	C	694.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=50;Dels=0.00;FS=4.093;HRun=1;HaplotypeScore=3.9831;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.884;VQSLOD=5.1537;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,26:50:99:724,0,655
19	9048170	.	G	A	1844.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;DP=127;Dels=0.00;FS=3.307;HRun=1;HaplotypeScore=2.6912;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=14.52;ReadPosRankSum=-1.680;VQSLOD=5.0860;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,68:127:99:1874,0,1554
19	9048342	.	C	T	2113.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.835;DP=151;Dels=0.00;FS=3.827;HRun=1;HaplotypeScore=7.8824;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.303;VQSLOD=4.3701;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,78:151:99:2143,0,2182
19	9049149	.	G	A	4228.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;DP=244;Dels=0.00;FS=6.197;HRun=1;HaplotypeScore=6.7276;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.100;VQSLOD=3.5736;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,127:244:99:3584,0,3221
19	9056941	.	A	G	1313.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=80;Dels=0.00;FS=1.816;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.808;VQSLOD=6.5036;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,44:80:99:1344,0,926
19	9056982	.	G	A	820.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.541;DP=86;Dels=0.00;FS=1.811;HRun=0;HaplotypeScore=1.5779;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.103;VQSLOD=5.7450;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,36:86:99:851,0,1436
19	9057408	.	A	G	2805.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=34.63;VQSLOD=9.5800;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2838,220,0
19	9057687	.	A	G	7048.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6766;MQ=59.26;MQ0=0;QD=33.25;VQSLOD=9.5585;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:7048,554,0
19	9057721	.	C	T	2730.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.964;DP=196;DS;Dels=0.00;FS=1.155;HRun=2;HaplotypeScore=7.7633;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.990;VQSLOD=4.5441;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,97:196:99:2760,0,2772
19	9057750	.	T	A	2526.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.5674;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.152;VQSLOD=4.9371;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,88:173:99:2557,0,2454
19	9057896	.	G	C	3106.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.695;DP=248;Dels=0.00;FS=1.560;HRun=1;HaplotypeScore=1.9958;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.336;VQSLOD=6.1932;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,120:248:99:3136,0,3413
19	9058907	.	G	C	2306.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.487;DP=180;Dels=0.00;FS=0.626;HRun=1;HaplotypeScore=3.4445;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.509;VQSLOD=6.2060;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,85:180:99:2336,0,2418
19	9058942	.	C	T	2817.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.649;HRun=0;HaplotypeScore=4.7752;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.619;VQSLOD=4.6826;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,113:250:99:2847,0,3638
19	9059232	.	T	C	2744.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.815;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=0.490;HRun=1;HaplotypeScore=7.9719;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.319;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.456;VQSLOD=4.1473;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,110:228:99:2775,0,3276
19	9059808	.	A	G	7876.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.4019;MQ=59.16;MQ0=0;QD=32.82;VQSLOD=4.5711;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,239:240:99:7876,608,0
19	9060059	.	A	C	1134.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.123;DP=91;Dels=0.00;FS=0.821;HRun=1;HaplotypeScore=5.7731;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.394;VQSLOD=4.4293;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,40:91:99:1164,0,1468
19	9062415	.	T	G	2504.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.224;DP=192;Dels=0.00;FS=3.306;HRun=1;HaplotypeScore=1.9279;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.170;VQSLOD=6.4795;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,100:192:99:2535,0,2525
19	9062544	.	T	G	4085.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.63;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=9.6864;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:4085,319,0
19	9063678	.	T	G	2256.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.729;DP=187;Dels=0.00;FS=1.141;HRun=1;HaplotypeScore=3.7875;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.330;VQSLOD=6.0903;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,84:187:99:2286,0,2691
19	9065632	.	T	C	2913.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.642;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.0503;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.321;VQSLOD=5.4806;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,115:250:99:2943,0,3700
19	9066259	.	T	C	1341.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.171;DP=135;Dels=0.00;FS=1.477;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.140;VQSLOD=6.7251;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,49:135:99:1372,0,2227
19	9068374	.	A	G	891.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.9480;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.416;VQSLOD=4.8275;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,33:65:99:921,0,798
19	9070194	.	A	G	6985.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.38;MQ0=0;QD=31.46;VQSLOD=9.2658;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,222:222:99:6984,545,0
19	9070225	.	G	C	6239.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5261;MQ=59.49;MQ0=0;QD=34.67;VQSLOD=9.0047;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:180:99:6239,494,0
19	9070402	.	G	T	1222.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.811;DP=106;Dels=0.00;FS=0.805;HRun=0;HaplotypeScore=1.8317;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.960;VQSLOD=5.8692;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,46:106:99:1253,0,1806
19	9070837	.	G	A	4933.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9536;MQ=58.94;MQ0=0;QD=30.27;VQSLOD=9.2044;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:4933,406,0
19	9071562	.	C	T	1688.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;DP=152;Dels=0.00;FS=1.300;HRun=1;HaplotypeScore=4.5048;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.139;VQSLOD=5.2321;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,66:152:99:1718,0,2511
19	9071763	.	T	A	5825.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.7716;MQ=58.85;MQ0=0;QD=31.49;VQSLOD=7.1519;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:185:99:5824,472,0
19	9072313	.	A	G	941.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.537;DP=81;Dels=0.00;FS=3.404;HRun=2;HaplotypeScore=4.3959;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.249;VQSLOD=5.0176;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,33:81:99:971,0,1319
19	9072742	.	T	C	2721.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.042;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=2.178;HRun=0;HaplotypeScore=7.7597;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.277;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.680;VQSLOD=4.1327;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,111:249:99:2751,0,3773
19	9074265	.	G	A	2650.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.325;DP=200;DS;Dels=0.00;FS=5.311;HRun=1;HaplotypeScore=4.2539;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.234;VQSLOD=5.2979;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,96:200:99:2680,0,2859
19	9074950	.	G	T	1849.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;DP=157;Dels=0.00;FS=1.261;HRun=1;HaplotypeScore=2.8098;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.753;VQSLOD=6.0355;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,70:157:99:1879,0,2524
19	9075217	.	T	A	1620.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.265;DP=138;Dels=0.00;FS=8.488;HRun=0;HaplotypeScore=6.5910;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.569;VQSLOD=4.2778;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,67:138:99:1650,0,1659
19	9075346	.	T	A	5486.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.00;VQSLOD=8.9593;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:5486,427,0
19	9075969	.	C	T	4475.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.701;HRun=0;HaplotypeScore=2.4429;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.962;VQSLOD=5.9780;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,141:250:99:3846,0,3061
19	9076083	.	G	A	2818.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.368;DP=226;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7987;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.162;VQSLOD=6.4382;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,108:226:99:2849,0,3474
19	9076278	.	G	A	2141.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.887;DP=202;Dels=0.00;FS=5.978;HRun=0;HaplotypeScore=7.6569;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.443;VQSLOD=4.1757;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,85:202:99:2171,0,2976
19	9076728	.	C	T	1706.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;DP=137;Dels=0.00;FS=0.664;HRun=0;HaplotypeScore=3.5621;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.377;VQSLOD=6.3858;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,64:137:99:1737,0,2041
19	9076858	.	C	T	2891.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.913;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.177;HRun=0;HaplotypeScore=8.8022;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.176;VQSLOD=4.3426;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,108:250:99:2922,0,3738
19	9076929	.	T	G	2326.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.375;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=0.631;HRun=0;HaplotypeScore=2.8724;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.269;VQSLOD=5.9199;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,81:182:99:2356,0,2906
19	9076950	.	C	A	2054.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.873;DP=157;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5023;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.579;VQSLOD=6.1387;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,76:157:99:2084,0,2417
19	9077803	.	T	C	1437.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.007;DP=156;Dels=0.00;FS=2.972;HRun=1;HaplotypeScore=3.6542;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=2.373;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.053;VQSLOD=5.1088;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,60:156:99:1468,0,2595
19	9080462	.	C	G	1322.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.404;DP=118;Dels=0.00;FS=5.229;HRun=1;HaplotypeScore=8.4728;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.431;VQSLOD=3.6734;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,49:118:99:1352,0,1973
19	9083143	.	G	A	741.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=50;Dels=0.00;FS=4.189;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.806;VQSLOD=6.2595;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,29:50:99:771,0,585
19	9083174	.	G	A	788.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9855;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.744;VQSLOD=3.1773;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,26:41:99:818,0,399
19	9084299	.	T	C	1380.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.572;DP=116;Dels=0.00;FS=1.522;HRun=2;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.756;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.733;VQSLOD=5.9166;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,52:116:99:1411,0,1654
19	9086123	.	A	C	927.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.600;DP=82;Dels=0.00;FS=8.162;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.616;VQSLOD=5.0397;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,34:82:99:958,0,1310
19	9087615	.	T	A	4618.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.58;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=9.5560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,144:144:99:4618,367,0
19	9088017	.	T	G	4536.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.187;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.306;HRun=1;HaplotypeScore=5.8037;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.277;VQSLOD=4.2056;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,130:250:99:3847,0,3213
19	9213079	.	A	C	1537.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.085;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.8025;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.179;VQSLOD=6.3291;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,58:128:99:1567,0,1970
19	9213132	.	A	G	1541.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.568;VQSLOD=6.7804;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,64:142:99:1572,0,2173
19	9490814	.	C	T	451.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.041;DP=57;Dels=0.00;FS=3.786;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.254;VQSLOD=3.3947;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,22:57:99:482,0,888
19	10084292	.	C	G	1194.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.757;DP=99;Dels=0.00;FS=5.118;HRun=1;HaplotypeScore=5.9925;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.370;VQSLOD=4.6563;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,44:99:99:1224,0,1402
19	10088271	.	C	G	298.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=30;Dels=0.00;FS=1.518;HRun=3;HaplotypeScore=2.8093;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.417;VQSLOD=6.0191;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:329,0,381
19	10106260	.	G	A	1054.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;DP=87;Dels=0.00;FS=4.075;HRun=0;HaplotypeScore=5.2211;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.430;VQSLOD=2.6930;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,45:87:99:1085,0,1094
19	10112346	.	T	C	3997.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.6112;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.98;VQSLOD=8.5470;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3997,307,0
19	10116508	.	C	T	274.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=27;Dels=0.00;FS=4.222;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.436;VQSLOD=5.1972;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:27:99:305,0,406
19	10224526	.	C	T	973.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=63;Dels=0.00;FS=9.032;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.445;VQSLOD=3.7541;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,35:63:99:1004,0,808
19	10415781	.	T	C	936.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8959;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.331;VQSLOD=6.0889;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,38:78:99:966,0,1047
19	10446568	.	T	C	374.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.269;DP=21;Dels=0.00;FS=5.927;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.611;VQSLOD=4.7653;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:86.41:404,0,86
19	10449358	.	T	C	1366.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.232;DP=142;Dels=0.00;FS=0.635;HRun=1;HaplotypeScore=7.1190;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.745;VQSLOD=4.4050;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,57:142:99:1397,0,2241
19	10475649	.	C	T	877.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.693;DP=74;Dels=0.00;FS=10.126;HRun=0;HaplotypeScore=4.4214;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.278;VQSLOD=3.7226;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,32:74:99:907,0,1106
19	10672493	.	C	T	1551.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.230;DP=154;Dels=0.00;FS=6.125;HRun=0;HaplotypeScore=4.9860;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.188;VQSLOD=4.7978;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,58:154:99:1582,0,2449
19	10742170	.	A	G	3413.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8792;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69;VQSLOD=6.5920;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:119:99:3413,283,0
19	11097098	.	C	T	99.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.718;VQSLOD=4.1687;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:129,0,171
19	11358799	.	G	A	338.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;DP=36;Dels=0.00;FS=1.320;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.317;VQSLOD=6.2051;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:368,0,540
19	11465316	.	G	C	232.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9557;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.416;VQSLOD=5.6241;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:263,0,275
19	11526759	.	G	A	816.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.472;DP=66;Dels=0.00;FS=2.113;HRun=0;HaplotypeScore=3.6079;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=5.7546;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,32:66:99:847,0,1063
19	11526765	.	G	T	881.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3207;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.247;VQSLOD=5.1474;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,30:62:99:911,0,964
19	11558275	.	G	A	618.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;DP=52;Dels=0.00;FS=4.467;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.350;VQSLOD=5.1088;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,24:52:99:649,0,714
19	11617073	.	C	T	987.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;DP=74;Dels=0.00;FS=10.587;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.054;VQSLOD=3.8582;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,38:74:99:1018,0,1084
19	11618630	.	G	A	604.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=49;Dels=0.00;FS=5.167;HRun=0;HaplotypeScore=2.7267;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.265;VQSLOD=4.8126;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,21:49:99:635,0,751
19	11891003	.	G	A	2648.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;QD=31.52;VQSLOD=9.2362;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2681,211,0
19	11942362	.	A	G	3193.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=9.281;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.807;HRun=0;HaplotypeScore=9.8577;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.534;VQSLOD=3.1022;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,121:250:99:3223,0,3294
19	11943697	.	G	A	3126.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7988;MQ=58.23;MQ0=0;QD=28.95;VQSLOD=7.8544;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3159,256,0
19	11978828	.	G	T	1465.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.194;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9976;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.972;VQSLOD=5.5435;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,63:162:99:1496,0,2876
19	11979164	.	T	C	1584.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=9.6547;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.726;VQSLOD=4.4205;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,63:140:99:1614,0,2040
19	12088237	.	G	A	1016.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.517;VQSLOD=4.9259;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,44:82:99:1046,0,945
19	12256912	.	C	T	1385.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.829;DP=92;Dels=0.00;FS=5.283;HRun=0;HaplotypeScore=3.5693;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.686;VQSLOD=5.2430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,52:92:99:1415,0,1034
19	12541532	.	C	A	3339.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.00;MQ0=0;QD=33.74;VQSLOD=8.6520;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3339,265,0
19	12541547	.	T	G	3707.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=33.40;VQSLOD=8.1627;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3707,289,0
19	12786449	.	G	A	394.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;DP=37;Dels=0.00;FS=16.301;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.021;VQSLOD=2.8255;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,17:37:99:425,0,635
19	12921186	.	T	C	906.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.776;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.8382;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.938;VQSLOD=4.7319;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,40:86:99:937,0,1195
19	12936617	.	C	G	379.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.028;DP=25;Dels=0.00;FS=1.973;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.194;VQSLOD=5.7368;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:409,0,239
19	13010520	.	A	G	961.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.0321;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.465;VQSLOD=5.4542;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,39:79:99:991,0,1033
19	13409696	.	C	G	222.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.379;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.020;VQSLOD=4.3577;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:253,0,116
19	14000170	.	T	C	988.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;DP=99;Dels=0.00;FS=1.785;HRun=3;HaplotypeScore=1.3670;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.713;VQSLOD=6.2688;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,42:99:99:1018,0,1571
19	14000870	.	C	T	1115.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;DP=70;Dels=0.00;FS=7.358;HRun=0;HaplotypeScore=1.6642;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.213;VQSLOD=4.6326;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,39:70:99:1146,0,916
19	14015711	.	C	A	1174.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.062;DP=83;Dels=0.00;FS=0.907;HRun=0;HaplotypeScore=3.3559;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.213;VQSLOD=6.2466;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,48:83:99:1205,0,926
19	14038791	.	C	T	1811.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8932;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.015;VQSLOD=5.8880;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,68:139:99:1842,0,1748
19	14083761	.	T	C	280.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.972;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.571;VQSLOD=6.2831;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:310,0,372
19	14580328	.	A	G	1540.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;DP=115;Dels=0.00;FS=2.931;HRun=0;HaplotypeScore=2.6722;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.020;VQSLOD=6.5487;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,58:115:99:1571,0,1550
19	14758168	.	G	A	2404.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.07;MQ0=0;QD=32.06;VQSLOD=9.3505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2437,211,0
19	14769339	.	C	G	1688.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.96;MQ0=0;QD=30.15;VQSLOD=7.8614;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1722,129,0
19	14862430	.	C	G	4589.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9810;MQ=59.43;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=8.8963;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,147:147:99:4589,355,0
19	14877799	.	G	C	560.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=46.34;MQ0=5;QD=22.43;VQSLOD=4.9841;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:51.12:594,51,0
19	14910210	.	C	G	3745.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9726;MQ=59.43;MQ0=0;QD=32.85;VQSLOD=8.8560;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:114:99:3708,292,0
19	14910321	.	A	G	4125.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.54;MQ0=0;QD=31.74;VQSLOD=9.8008;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4125,319,0
19	14910438	.	C	T	6397.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=9.9335;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,192:192:99:6397,503,0
19	14910573	.	C	T	4164.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4708;MQ=59.63;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=8.0863;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:4164,331,0
19	14910654	.	T	C	3480.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4522;MQ=59.59;MQ0=0;QD=32.83;VQSLOD=8.8101;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3480,280,0
19	15133762	.	G	C	987.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.70;MQ0=0;QD=34.06;VQSLOD=9.5002;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:81.25:1021,81,0
19	15198292	.	C	G	2733.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.2857;MQ=59.73;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=8.8372;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2767,241,0
19	15198507	.	T	C	4346.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1526;MQ=59.15;MQ0=0;QD=33.44;VQSLOD=9.3105;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:130:99:4323,340,0
19	15198631	.	A	C	4241.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5824;MQ=59.18;MQ0=0;QD=34.77;VQSLOD=9.2368;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:4241,334,0
19	15198666	.	T	A	1378.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.581;DP=121;Dels=0.00;FS=1.522;HRun=1;HaplotypeScore=7.7737;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.981;VQSLOD=2.9015;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,56:121:99:1409,0,1710
19	15271771	.	G	A	66.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.919;VQSLOD=4.8101;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:96.24:96,0,287
19	15508362	.	G	C	1647.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43;VQSLOD=12.9928;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:56:99:1681,126,0
19	15582863	.	C	T	473.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.680;DP=42;Dels=0.00;FS=1.273;HRun=0;HaplotypeScore=1.9973;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.797;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.719;VQSLOD=6.1616;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,19:42:99:503,0,531
19	15586672	.	A	T	803.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.466;DP=69;Dels=0.00;FS=3.392;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.847;VQSLOD=4.5536;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,33:69:99:833,0,978
19	15587185	.	C	T	1985.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7059;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.039;VQSLOD=6.5430;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,71:152:99:2015,0,1928
19	15587345	.	T	C	673.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.986;DP=51;Dels=0.00;FS=2.637;HRun=1;HaplotypeScore=1.9621;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.141;VQSLOD=6.4451;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,25:51:99:703,0,721
19	15726487	.	G	T	1225.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.540;DP=93;Dels=0.00;FS=3.965;HRun=1;HaplotypeScore=3.7599;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.718;VQSLOD=4.6326;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,45:93:99:1255,0,1388
19	15730498	.	G	GC	3564.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=272.2329;MQ=59.66;MQ0=0;QD=46.90;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,75:76:99:3564,226,0
19	15730502	.	C	T	951.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.630;DP=81;Dels=0.00;FS=3.027;HRun=0;HaplotypeScore=2.5655;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.440;VQSLOD=5.5940;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,39:81:99:981,0,1061
19	15739597	.	A	C	4093.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.21;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=9.7334;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4092,328,0
19	15784386	.	C	T	2618.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.028;DP=202;Dels=0.00;FS=1.847;HRun=0;HaplotypeScore=6.3137;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.340;VQSLOD=3.9039;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,102:202:99:2649,0,2621
19	15789098	.	A	G	3996.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.953;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.472;HRun=1;HaplotypeScore=9.7636;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.458;VQSLOD=3.3055;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,126:249:99:3364,0,3231
19	15990431	.	C	T	2578.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.113;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=4.531;HRun=0;HaplotypeScore=2.4440;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=0.391;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.795;VQSLOD=5.5279;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,105:250:99:2608,0,3662
19	16008388	.	A	C	1061.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.146;DP=97;Dels=0.00;FS=6.622;HRun=2;HaplotypeScore=3.8298;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026;VQSLOD=4.1844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,46:97:99:1091,0,1499
19	16025176	.	C	T	4143.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=6.191;HRun=1;HaplotypeScore=9.3434;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.914;VQSLOD=3.6150;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,119:241:99:3448,0,2905
19	16034714	.	A	G	7289.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5953;MQ=59.56;MQ0=0;QD=31.69;VQSLOD=8.3783;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:7288,605,0
19	16060248	.	A	G	2819.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=213;DS;Dels=0.00;FS=0.514;HRun=0;HaplotypeScore=8.9118;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.891;VQSLOD=4.2718;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,105:213:99:2849,0,3058
19	16060658	.	A	G	4005.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.345;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.173;HRun=0;HaplotypeScore=2.8121;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.423;VQSLOD=5.4553;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:250:99:3397,0,3123
19	16275655	.	C	T	2623.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.526;DP=231;Dels=0.00;FS=6.815;HRun=0;HaplotypeScore=12.2105;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.058;VQSLOD=3.1940;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,118:231:99:2654,0,3067
19	16860105	.	G	A	4216.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4450;MQ=58.86;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=8.2012;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:142:99:4216,346,0
19	16860558	.	G	A	1012.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.515;DP=72;Dels=0.00;FS=0.909;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.298;VQSLOD=5.9564;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,36:72:99:1042,0,997
19	16899838	.	A	T	6447.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=59.37;MQ0=0;QD=29.99;VQSLOD=8.3564;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,215:215:99:6446,515,0
19	16926067	.	A	T	942.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=73;Dels=0.00;FS=2.753;HRun=0;HaplotypeScore=1.6630;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.374;VQSLOD=6.1950;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,37:73:99:972,0,814
19	17004049	.	T	C	106.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.717;VQSLOD=6.6264;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:137,0,154
19	17025292	.	G	A	3418.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6545;MQ=59.80;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=8.3675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:3418,268,0
19	17088299	.	T	C	741.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=72;Dels=0.00;FS=7.237;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.00;MQ0=1;MQRankSum=-0.341;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.607;VQSLOD=2.6631;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:771,0,1049
19	17088319	.	G	T	678.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=55;Dels=0.00;FS=1.225;HRun=1;HaplotypeScore=1.6609;MQ=55.65;MQ0=1;MQRankSum=-0.390;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=2.9883;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,26:55:99:708,0,779
19	17108135	.	C	T	526.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=46.64;MQ0=2;QD=29.25;VQSLOD=5.8769;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:45.14:559,45,0
19	17170885	.	C	T	902.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.147;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9825;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.098;VQSLOD=5.9999;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,39:112:99:933,0,1961
19	17316782	.	T	C	529.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.049;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8188;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.289;VQSLOD=5.7105;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,21:34:99:560,0,252
19	17330060	.	T	C	1676.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.46;MQ0=0;QD=28.41;VQSLOD=8.4951;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1709,144,0
19	17394504	.	A	C	5361.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=4.0972;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=30.47;ReadPosRankSum=1.257;VQSLOD=8.3989;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,175:176:99:5361,418,0
19	17395003	.	A	G	971.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.48;MQ0=0;QD=29.43;VQSLOD=8.6802;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:81.24:1004,81,0
19	17397244	.	C	T	627.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;DP=61;Dels=0.00;FS=0.986;HRun=1;HaplotypeScore=1.9125;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.512;VQSLOD=5.7102;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,28:61:99:657,0,776
19	17450016	.	T	C	419.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.933;DP=44;Dels=0.00;FS=4.201;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.829;VQSLOD=5.6188;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,19:44:99:450,0,680
19	17660300	.	G	A	3048.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.245;DP=224;Dels=0.00;FS=1.637;HRun=0;HaplotypeScore=4.5690;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.600;VQSLOD=5.8057;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,116:224:99:3079,0,2663
19	17662616	.	G	A	812.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.962;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.494;VQSLOD=6.3191;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,28:42:99:842,0,313
19	17746947	.	A	G	483.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.47;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=8.2061;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:39.13:517,39,0
19	17922795	.	G	A	3149.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.437;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=3.618;HRun=0;HaplotypeScore=6.8904;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.476;VQSLOD=4.4725;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,119:246:99:3180,0,3260
19	18123738	.	T	C	731.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.8130;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.005;VQSLOD=5.0894;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,30:83:99:762,0,1352
19	18255359	.	G	A	986.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=14.1115;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.25:1019,81,0
19	18273047	.	T	C	1413.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7128;MQ=59.51;MQ0=0;QD=30.08;VQSLOD=8.7138;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1447,111,0
19	18329784	.	C	T	1206.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=104;Dels=0.00;FS=3.599;HRun=0;HaplotypeScore=4.9823;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.363;VQSLOD=3.4449;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,48:104:99:1236,0,1429
19	18368810	.	G	T	1994.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.147;DP=164;Dels=0.00;FS=1.283;HRun=0;HaplotypeScore=3.6008;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.579;VQSLOD=6.1774;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,77:164:99:2025,0,2493
19	18375846	.	G	A	1485.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.441;DP=111;Dels=0.00;FS=4.741;HRun=0;HaplotypeScore=8.2611;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=13.38;ReadPosRankSum=2.734;VQSLOD=3.3196;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,54:111:99:1516,0,1491
19	18375882	.	G	C	1181.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;DP=85;Dels=0.00;FS=9.021;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.304;VQSLOD=3.6435;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,46:85:99:1212,0,1106
19	18376407	.	T	A	1678.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.212;DP=85;Dels=0.00;FS=1.880;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.060;VQSLOD=5.0248;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,56:85:99:1709,0,743
19	18376522	.	T	G	1465.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.211;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.7988;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.040;VQSLOD=6.4581;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,52:106:99:1496,0,1433
19	18377274	.	A	G	1003.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.186;DP=99;Dels=0.00;FS=5.378;HRun=0;HaplotypeScore=4.4978;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.567;VQSLOD=4.9227;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,41:99:99:1034,0,1530
19	18377496	.	C	G	2619.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;DP=208;Dels=0.00;FS=10.332;HRun=0;HaplotypeScore=3.8276;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.449;VQSLOD=4.0640;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,104:208:99:2650,0,2836
19	18377647	.	G	C	741.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;DP=50;Dels=0.00;FS=1.742;HRun=5;HaplotypeScore=2.5929;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.059;VQSLOD=5.5937;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,28:50:99:772,0,609
19	18377761	.	A	G	667.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.9090;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.324;VQSLOD=5.3188;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:698,0,788
19	18378219	.	A	G	2438.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.7605;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.165;VQSLOD=6.1955;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,97:170:99:2468,0,2000
19	18497024	.	G	C	653.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8918;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.792;VQSLOD=3.5837;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,28:71:99:683,0,1134
19	18502835	.	G	A	1133.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.104;DP=61;Dels=0.00;FS=1.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.615;VQSLOD=5.5821;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,40:61:99:1164,0,539
19	18679379	.	C	G	4736.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.4075;MQ=59.33;MQ0=1;QD=31.79;VQSLOD=8.1691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,149:149:99:4736,379,0
19	18701700	.	G	A	350.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;DP=28;Dels=0.00;FS=1.510;HRun=0;HaplotypeScore=2.4551;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.130;VQSLOD=5.4931;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:28:99:381,0,290
19	18897440	.	T	C	718.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.162;DP=85;Dels=0.00;FS=2.261;HRun=0;HaplotypeScore=2.8034;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.169;VQSLOD=5.3286;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,35:85:99:749,0,1464
19	19017862	.	G	A	291.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9523;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.015;VQSLOD=4.8722;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,15:41:99:321,0,739
19	19040312	.	G	C	257.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.47;VQSLOD=12.1907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:21.07:291,21,0
19	19136541	.	C	T	3798.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.59;MQ0=0;QD=32.74;VQSLOD=9.9097;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3798,301,0
19	19741292	.	C	G	1472.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.144;DP=142;Dels=0.00;FS=0.622;HRun=0;HaplotypeScore=1.9461;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.308;VQSLOD=4.6845;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,67:142:99:1503,0,1865
19	19823270	.	T	A	1125.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.203;DP=107;Dels=0.00;FS=0.739;HRun=0;HaplotypeScore=6.6542;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.587;VQSLOD=4.4106;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,44:107:99:1155,0,1514
19	20807177	.	G	GA	2955.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=348.4313;MQ=50.94;MQ0=2;QD=38.38;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,72:70:99:2997,202,0
19	20807185	.	C	T	2257.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=48.16;MQ0=2;QD=30.09;VQSLOD=6.3304;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2290,196,0
19	20807352	.	C	T	4804.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5853;MQ=52.88;MQ0=2;QD=32.47;VQSLOD=3.2979;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4804,379,0
19	21300462	.	A	G	3995.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6567;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.271;VQSLOD=6.9613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,127:128:99:3962,271,0
19	21477403	.	T	G	2579.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.614;DP=233;Dels=0.00;FS=3.661;HRun=0;HaplotypeScore=9.1690;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.120;VQSLOD=3.7194;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,106:233:99:2609,0,3148
19	21477431	.	T	C	2860.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.757;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6605;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.317;VQSLOD=5.2383;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,114:207:99:2891,0,2316
19	21492062	.	G	A	7523.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.2341;MQ=57.72;MQ0=0;QD=30.09;VQSLOD=5.1040;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,247:250:99:7496,605,0
19	21606429	.	G	T	492.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=45;Dels=0.00;FS=1.204;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.443;VQSLOD=5.0443;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:522,0,632
19	21606719	.	C	G	873.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=93;Dels=0.00;FS=6.912;HRun=0;HaplotypeScore=1.8920;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.889;VQSLOD=3.9653;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,40:93:99:903,0,1529
19	22154732	.	T	C	2260.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=164;Dels=0.00;FS=2.034;HRun=1;HaplotypeScore=6.2310;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.617;VQSLOD=3.7336;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,88:164:99:2290,0,1902
19	22156992	.	C	T	1341.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;DP=111;Dels=0.00;FS=3.562;HRun=1;HaplotypeScore=1.9765;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.787;VQSLOD=5.7109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,46:111:99:1372,0,1832
19	22271717	.	A	C	1045.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.341;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.424;VQSLOD=6.3881;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,36:68:99:1075,0,854
19	22846788	.	C	A	334.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.868;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=2.302;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.548;VQSLOD=4.4520;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,14:37:99:365,0,512
19	22942325	.	G	C	413.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;DP=79;Dels=0.00;FS=2.349;HRun=1;HaplotypeScore=2.7327;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.361;VQSLOD=3.7530;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,19:79:99:443,0,1628
19	23837145	.	A	G	1452.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.42;VQSLOD=7.2730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1486,117,0
19	23837365	.	A	C	5908.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5664;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.82;VQSLOD=8.4496;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:5908,439,0
19	23927252	.	C	T	8346.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6624;MQ=59.69;MQ0=1;QD=33.39;VQSLOD=8.9858;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8346,659,0
19	23927468	.	A	G	5835.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=59.03;MQ0=0;QD=33.73;VQSLOD=9.0495;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,173:173:99:5835,457,0
19	23928102	.	C	G	1506.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.47;MQ0=0;QD=32.06;VQSLOD=8.6966;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1540,120,0
19	24310032	.	A	T	464.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.411;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.646;VQSLOD=5.4364;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:494,0,318
19	33098632	.	G	C	288.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.381;VQSLOD=5.2347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:318,0,277
19	33110204	.	T	C	1469.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=127;Dels=0.00;FS=10.162;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.524;VQSLOD=4.8729;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,59:127:99:1500,0,1981
19	33414420	.	A	G	6372.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4966;MQ=59.69;MQ0=0;QD=29.37;VQSLOD=8.2378;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,217:217:99:6372,473,0
19	33467515	.	T	C	2642.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.668;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=1.079;HRun=0;HaplotypeScore=3.5293;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.320;VQSLOD=5.4253;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,100:207:99:2672,0,2728
19	33600764	.	T	C	1357.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.741;DP=96;Dels=0.00;FS=1.718;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.953;VQSLOD=5.6637;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,48:96:99:1387,0,1281
19	33605300	.	A	G	852.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.956;DP=116;Dels=0.00;FS=7.807;HRun=0;HaplotypeScore=3.4800;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.726;VQSLOD=4.0422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,38:116:99:883,0,2016
19	33605312	.	T	C	969.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.292;DP=111;Dels=0.00;FS=13.388;HRun=0;HaplotypeScore=5.6155;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=3.3450;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,43:111:99:1000,0,1731
19	35422808	.	C	T	1290.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.88;MQ0=0;QD=33.10;VQSLOD=9.9498;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1324,105,0
19	35434238	.	A	G	2348.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.7306;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.31;VQSLOD=7.6602;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2382,196,0
19	35435006	.	G	A	3643.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.065;VQSLOD=9.5672;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,108:109:99:3607,262,0
19	35435059	.	G	A	1356.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.271;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.152;VQSLOD=4.9312;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,49:103:99:1387,0,1493
19	35449486	.	T	C	1014.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.818;DP=94;Dels=0.00;FS=11.736;HRun=0;HaplotypeScore=3.2253;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.127;VQSLOD=4.2363;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,38:94:99:1044,0,1579
19	35450229	.	C	T	8958.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8268;MQ=59.65;MQ0=0;QD=35.84;VQSLOD=8.9008;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8958,704,0
19	35612159	.	C	G	1201.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8434;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.464;VQSLOD=5.8098;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,55:122:99:1231,0,1583
19	35648365	.	T	G	942.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3307;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.287;VQSLOD=6.5308;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,44:85:99:973,0,1066
19	35660508	.	G	A	2271.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8835;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88;VQSLOD=8.0605;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2304,184,0
19	35718938	.	C	T	804.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=65;Dels=0.00;FS=2.216;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.545;VQSLOD=5.9793;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,31:65:99:835,0,924
19	35719020	.	C	T	989.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.541;DP=87;Dels=0.00;FS=2.962;HRun=0;HaplotypeScore=4.5164;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.056;VQSLOD=4.9785;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,40:87:99:1019,0,1369
19	35719106	.	A	G	1649.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.2538;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.413;VQSLOD=5.3175;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,63:113:99:1679,0,1259
19	35843086	.	G	A	733.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9962;MQ=57.54;MQ0=0;QD=29.36;VQSLOD=7.2885;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:63.19:767,63,0
19	35991442	.	T	G	902.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21;VQSLOD=13.3419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:72.22:936,72,0
19	36003962	.	T	C	1232.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.598;DP=81;Dels=0.00;FS=6.159;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.379;VQSLOD=5.3037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,44:81:99:1262,0,951
19	36004106	.	A	G	6078.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.1835;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=34.15;ReadPosRankSum=1.499;VQSLOD=6.1927;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,177:178:99:6078,466,0
19	36050969	.	A	G	2426.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71;VQSLOD=13.7105;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:2460,196,0
19	36243089	.	T	C	527.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76;VQSLOD=13.1331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:45.12:560,45,0
19	36290977	.	C	T	130.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.229;DP=29;Dels=0.00;FS=3.785;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.535;VQSLOD=3.7741;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:160,0,591
19	36303664	.	G	C	739.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8899;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.173;VQSLOD=5.4711;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,30:46:99:769,0,411
19	36342212	.	C	T	437.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=43;Dels=0.00;FS=2.600;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.505;VQSLOD=6.4796;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,18:43:99:468,0,612
19	36355595	.	A	G	3597.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8963;MQ=59.25;MQ0=0;QD=32.12;VQSLOD=8.6735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3597,283,0
19	36497358	.	C	G	1173.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.15;MQ0=0;QD=33.52;VQSLOD=7.8612;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:93.30:1206,93,0
19	36590329	.	T	C	1753.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7205;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76;VQSLOD=7.9267;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1786,147,0
19	36594659	.	A	T	1887.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.159;DP=119;Dels=0.00;FS=8.803;HRun=0;HaplotypeScore=4.3591;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.498;VQSLOD=3.4590;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,69:119:99:1917,0,1378
19	36594853	.	G	A	810.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.288;DP=77;Dels=0.00;FS=0.886;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.037;VQSLOD=5.0820;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,32:77:99:841,0,1168
19	36595436	.	A	C	1509.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=112;Dels=0.00;FS=10.487;HRun=1;HaplotypeScore=2.3913;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=4.3306;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1539,0,1453
19	36674305	.	A	G	4196.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=59.50;MQ0=0;QD=34.68;VQSLOD=8.8677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:4196,331,0
19	36674413	.	G	A	3957.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.578;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=5.472;HRun=0;HaplotypeScore=3.6945;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.409;VQSLOD=2.4747;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3288,0,3444
19	37005998	.	A	G	1884.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;DP=168;Dels=0.00;FS=2.714;HRun=0;HaplotypeScore=3.4373;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.188;VQSLOD=4.9660;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,78:168:99:1914,0,2269
19	37039069	.	A	C	1857.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=13.8347;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1890,162,0
19	37117302	.	A	G	2280.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.682;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=7.1687;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.496;VQSLOD=4.5697;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,94:196:99:2311,0,2418
19	37118439	.	C	T	482.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.131;DP=38;Dels=0.00;FS=5.440;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.306;VQSLOD=4.5889;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,19:38:99:512,0,538
19	37310344	.	T	C	1462.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.903;DP=148;Dels=0.00;FS=2.985;HRun=1;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.560;VQSLOD=5.3962;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,60:148:99:1493,0,2337
19	37441980	.	A	G	760.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=77;Dels=0.00;FS=3.414;HRun=0;HaplotypeScore=1.7465;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.161;VQSLOD=6.4568;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,31:77:99:790,0,1136
19	37854235	.	G	T	4527.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.36;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=9.1574;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:4527,373,0
19	37879589	.	A	G	1734.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=7.6275;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:1767,144,0
19	38055612	.	A	T	2606.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.526;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.9832;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=31.03;ReadPosRankSum=1.155;VQSLOD=6.7354;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,83:84:99:2640,185,0
19	38056574	.	T	A	1754.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.14;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=8.0353;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1788,141,0
19	38056830	.	GA	G	1237.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=63;FS=2.122;HRun=1;HaplotypeScore=155.1217;MQ=60.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.685;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,35:63:99:1276,0,1153
19	38202516	.	A	C	4349.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.9734;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=-0.609;QD=29.19;ReadPosRankSum=1.451;VQSLOD=7.2830;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,148:149:99:4326,302,0
19	38572894	.	C	T	1426.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=112;Dels=0.00;FS=2.502;HRun=0;HaplotypeScore=1.7753;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.888;VQSLOD=5.7093;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1456,0,1326
19	38896204	.	T	G	1243.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;DP=127;Dels=0.00;FS=3.560;HRun=1;HaplotypeScore=5.5898;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.003;VQSLOD=3.9207;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,52:127:99:1273,0,1890
19	38912764	.	A	G	334.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.401;DP=28;Dels=0.00;FS=1.906;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.482;VQSLOD=5.9860;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:364,0,367
19	39322087	.	T	G	1699.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.810;DP=103;Dels=0.00;FS=4.877;HRun=0;HaplotypeScore=4.8382;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.430;VQSLOD=4.8302;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,63:103:99:1729,0,1019
19	39876646	.	A	G	990.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=97;Dels=0.00;FS=4.260;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.001;VQSLOD=4.2278;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,38:97:99:1020,0,1453
19	39915758	.	C	G	70.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.595;VQSLOD=4.4705;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:100,0,489
19	39971432	.	G	C	218.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.263;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.683;VQSLOD=11.1603;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:248,0,249
19	39994711	.	T	C	738.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.796;DP=72;Dels=0.00;FS=1.006;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.606;VQSLOD=6.5754;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,28:72:99:769,0,1098
19	40030704	.	C	T	772.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=55;Dels=0.00;FS=1.067;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.910;VQSLOD=5.8875;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,34:55:99:803,0,496
19	40196611	.	C	T	1363	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.772;DP=151;Dels=0.00;FS=1.324;HRun=0;HaplotypeScore=5.2249;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.036;VQSLOD=4.1059;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,62:151:99:1393,0,2198
19	40197924	.	T	C	2786.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.298;VQSLOD=6.4409;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:2817,0,3919
19	40199914	.	C	G	1109.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;DP=101;Dels=0.00;FS=3.879;HRun=0;HaplotypeScore=2.9314;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.341;VQSLOD=5.6077;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,43:101:99:1139,0,1539
19	40225646	.	G	A	1037.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.040;DP=93;Dels=0.00;FS=1.774;HRun=0;HaplotypeScore=1.9581;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.043;VQSLOD=6.7053;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,41:93:99:1067,0,1446
19	40368498	.	A	C	2476.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9832;MQ=50.19;MQ0=0;QD=33.93;VQSLOD=4.0021;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2510,202,0
19	40886742	.	C	T	2412.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.741;DP=180;Dels=0.00;FS=2.625;HRun=0;HaplotypeScore=4.4863;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.020;VQSLOD=4.6912;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,88:180:99:2443,0,2267
19	40900865	.	C	T	3344.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.53;MQ0=0;QD=34.13;VQSLOD=9.8662;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:3345,268,0
19	40901496	.	T	C	5343.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=59.86;MQ0=0;QD=33.61;VQSLOD=9.6057;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:159:99:5343,412,0
19	40901614	.	A	G	3228.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9783;MQ=57.24;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=6.3827;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3261,280,0
19	40929363	.	T	C	2248.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.68;MQ0=0;QD=30.81;VQSLOD=9.6480;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2282,189,0
19	41111069	.	G	A	821.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=13.0024;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:72.19:854,72,0
19	41118056	.	A	G	400.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.986;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.913;VQSLOD=11.1837;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:430,0,392
19	41123093	.	A	AG	1081.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=52.1603;MQ=60.42;MQ0=0;QD=41.61;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78.26:1124,78,0
19	41129842	.	C	T	191.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;DP=19;Dels=0.00;FS=2.017;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.531;VQSLOD=6.4415;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:222,0,239
19	41211056	.	T	C	1056.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;DP=35;Dels=0.00;FS=3.680;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.644;VQSLOD=4.3651;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,34:35:55.48:1089,55,0
19	41350664	.	A	T	4274.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=51.99;MQ0=6;QD=28.31;VQSLOD=7.3945;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,148:151:99:4273,349,0
19	41383153	.	A	G	1301.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.840;DP=121;Dels=0.00;FS=0.704;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.488;VQSLOD=4.1396;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,59:121:99:1332,0,1705
19	41383799	.	G	A	2590.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.676;DP=211;Dels=0.00;FS=3.244;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=49.94;MQ0=9;MQRankSum=2.438;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.269;VQSLOD=2.2194;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,104:211:99:2620,0,2387
19	41622107	.	G	GC	4200.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.886;DP=232;FS=4.891;HRun=1;HaplotypeScore=585.9002;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.078;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.639;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,109:232:99:4201,0,3660
19	41743861	.	A	G	3429.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=59.04;MQ0=0;QD=33.63;VQSLOD=9.9332;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:102:99:3430,274,0
19	41869392	.	T	C	2441.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.71;VQSLOD=9.7176;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2474,187,0
19	41903220	.	G	A	2574.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.223;DP=197;DS;Dels=0.00;FS=8.340;HRun=0;HaplotypeScore=10.2355;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.039;VQSLOD=3.2947;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,97:197:99:2604,0,2501
19	41932275	.	T	C	1375.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.485;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9454;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=6.5967;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,59:109:99:1405,0,1216
19	41939297	.	C	G	1626.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.619;DP=106;Dels=0.00;FS=13.165;HRun=2;HaplotypeScore=3.3982;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.123;VQSLOD=3.2492;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,57:106:99:1656,0,1454
19	41944237	.	T	C	2239.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.962;DP=140;Dels=0.00;FS=2.702;HRun=0;HaplotypeScore=1.6316;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.294;VQSLOD=6.3180;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,82:140:99:2270,0,1494
19	42083849	.	C	A	2014.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.819;DP=167;Dels=0.00;FS=2.714;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.383;VQSLOD=6.5306;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,82:167:99:2045,0,2374
19	42085873	.	A	G	609.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.296;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=15.64;ReadPosRankSum=2.268;VQSLOD=6.1330;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,21:39:99:640,0,453
19	42132314	.	G	C	1685.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=160;Dels=0.00;FS=1.305;HRun=2;HaplotypeScore=9.9893;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.041;VQSLOD=2.6155;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,72:160:99:1715,0,2263
19	42190859	.	A	T	2403.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;DP=203;Dels=0.00;FS=4.060;HRun=1;HaplotypeScore=3.4629;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.810;VQSLOD=5.4427;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,92:203:99:2433,0,3036
19	42221607	.	A	G	2694.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.891;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=3.687;HRun=0;HaplotypeScore=7.1907;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.359;VQSLOD=4.7645;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,111:240:99:2724,0,3791
19	42265889	.	G	T	1530.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6895;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.504;VQSLOD=5.4995;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,66:138:99:1560,0,1767
19	42728836	.	T	C	1518.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=109;Dels=0.00;FS=9.560;HRun=0;HaplotypeScore=3.7641;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.058;VQSLOD=4.1109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,52:109:99:1549,0,1561
19	43087484	.	A	C	1360.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.428;DP=95;Dels=0.00;FS=1.291;HRun=0;HaplotypeScore=1.6517;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.145;VQSLOD=6.4969;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,47:95:99:1391,0,1419
19	43269705	.	G	A	2400.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.663;DP=226;Dels=0.00;FS=3.844;HRun=0;HaplotypeScore=2.6631;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.121;VQSLOD=2.4446;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,101:226:99:2431,0,3394
19	43420451	.	G	C	8904.73	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1696;MQ=58.36;MQ0=0;QD=35.62;VQSLOD=5.0794;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8904,716,0
19	43439694	.	A	G	4520.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=6.422;HRun=0;HaplotypeScore=1.6598;MQ=57.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.598;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.678;VQSLOD=2.5637;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,140:250:99:3836,0,2987
19	43519442	.	T	C	4116.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.831;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=2.189;HRun=0;HaplotypeScore=3.3215;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.158;VQSLOD=5.3574;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,123:243:99:3472,0,3375
19	43857873	.	G	C	1259.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=142;Dels=0.00;FS=3.214;HRun=1;HaplotypeScore=4.8234;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.612;VQSLOD=4.3120;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,51:142:99:1290,0,2234
19	44047826	.	T	A	4212.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5577;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.037;VQSLOD=8.2973;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,139:140:99:4212,322,0
19	44055726	.	T	C	2698.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8843;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=8.4085;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2732,220,0
19	44223113	.	G	A	205.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.132;VQSLOD=5.7932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:236,0,517
19	44302624	.	T	C	2833.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.709;DP=190;Dels=0.00;FS=3.429;HRun=0;HaplotypeScore=8.7035;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.695;VQSLOD=3.6425;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,96:190:99:2863,0,2516
19	44303066	.	C	G	82.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.152;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.906;VQSLOD=4.4198;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:112,0,314
19	44351694	.	C	T	1752.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.9933;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=2.367;QD=29.70;ReadPosRankSum=1.278;VQSLOD=6.3696;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,57:59:83.60:1785,84,0
19	44352665	.	T	C	1365.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.119;DP=116;Dels=0.00;FS=3.375;HRun=0;HaplotypeScore=3.8373;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.193;VQSLOD=5.7313;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,54:116:99:1395,0,1694
19	44377357	.	C	T	3974.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9950;MQ=58.90;MQ0=0;QD=30.11;VQSLOD=8.0930;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:3974,307,0
19	44377669	.	G	A	1184.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.122;DP=123;Dels=0.00;FS=4.565;HRun=0;HaplotypeScore=1.9966;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.524;VQSLOD=5.8595;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,53:123:99:1214,0,2042
19	44418077	.	C	T	760.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;DP=64;Dels=0.00;FS=6.611;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.995;VQSLOD=4.9674;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,28:64:99:791,0,1051
19	44418693	.	T	C	765.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.330;DP=96;Dels=0.00;FS=11.165;HRun=0;HaplotypeScore=5.9152;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.176;VQSLOD=3.4803;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,29:96:99:795,0,1808
19	44418824	.	C	T	1919.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.7868;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.061;VQSLOD=4.8946;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,71:149:99:1950,0,2180
19	44470189	.	T	A	5376.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7088;MQ=58.67;MQ0=0;QD=33.60;VQSLOD=8.2978;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,160:160:99:5376,433,0
19	44470420	.	T	C	6784.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3322;MQ=59.48;MQ0=0;QD=32.00;VQSLOD=9.3371;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6784,566,0
19	44470663	.	G	C	8073.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.449;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4429;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=32.95;ReadPosRankSum=1.548;VQSLOD=7.9931;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,244:245:99:8040,599,0
19	44471209	.	T	A	1234.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.320;DP=92;Dels=0.00;FS=3.957;HRun=0;HaplotypeScore=4.6574;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.364;VQSLOD=4.1091;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,50:92:99:1264,0,1083
19	44471252	.	T	C	1126.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.801;DP=100;Dels=0.00;FS=3.761;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.018;VQSLOD=4.0074;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,45:100:99:1157,0,1560
19	44471323	.	G	A	1571.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.107;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8268;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.214;VQSLOD=4.7474;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,61:117:99:1602,0,1398
19	44500478	.	A	T	6690.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8274;MQ=59.71;MQ0=0;QD=34.85;VQSLOD=8.6540;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,192:192:99:6690,518,0
19	44500761	.	G	A	6669.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6229;MQ=59.23;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=9.6263;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:6669,533,0
19	44535999	.	G	T	4945.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8490;MQ=59.44;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=9.0278;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:4945,382,0
19	44570393	.	C	A	4088.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8930;MQ=58.85;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=9.6185;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:4088,322,0
19	44610665	.	A	G	3201.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2401;MQ=59.57;MQ0=0;QD=32.67;VQSLOD=8.5221;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:3235,250,0
19	44610798	.	A	T	5214.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.2423;MQ=58.94;MQ0=0;QD=32.39;VQSLOD=9.1474;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:5214,409,0
19	44610843	.	C	T	2658	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=215;Dels=0.00;FS=1.075;HRun=0;HaplotypeScore=9.5792;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.164;VQSLOD=4.1809;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,101:215:99:2688,0,2942
19	44612231	.	A	G	3558.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6979;MQ=58.99;MQ0=0;QD=33.57;VQSLOD=8.8439;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3559,274,0
19	44652954	.	G	A	2800.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.562;HRun=0;HaplotypeScore=7.0705;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.814;VQSLOD=4.7573;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,108:250:99:2830,0,4174
19	44739712	.	G	C	1150.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=88;Dels=0.00;FS=4.132;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.918;VQSLOD=4.3240;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,43:88:99:1181,0,1227
19	44891784	.	T	C	3824.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=56.00;MQ0=0;QD=33.84;VQSLOD=5.4303;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3824,298,0
19	44932521	.	C	T	1515.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.776;DP=111;Dels=0.00;FS=3.511;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.540;VQSLOD=6.2745;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,54:111:99:1546,0,1445
19	44934489	.	G	A	1602.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;DP=149;Dels=0.00;FS=4.979;HRun=2;HaplotypeScore=1.6545;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=6.0571;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,68:149:99:1633,0,2106
19	44981883	.	C	G	3198.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7675;MQ=59.37;MQ0=0;QD=32.31;VQSLOD=9.0803;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3232,250,0
19	44983567	.	C	G	3684.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5043;MQ=59.13;MQ0=0;QD=33.20;VQSLOD=6.7995;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:3684,283,0
19	45001346	.	G	A	478.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=53;Dels=0.00;FS=3.997;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.505;VQSLOD=4.6587;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,24:53:99:508,0,707
19	45016116	.	A	G	282.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=11.7558;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:312,0,193
19	45017249	.	T	C	388.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.356;DP=44;Dels=0.00;FS=2.759;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.943;VQSLOD=5.5986;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:419,0,667
19	45028169	.	C	T	461.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.929;VQSLOD=6.4771;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:491,0,405
19	45150614	.	G	A	357	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.361;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=12.0380;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:387,0,555
19	45162038	.	A	G	5227.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9874;MQ=59.21;MQ0=0;QD=32.47;VQSLOD=9.6039;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:5227,397,0
19	45448036	.	T	C	457.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.18;MQ0=0;QD=25.39;VQSLOD=7.8101;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:39.11:490,39,0
19	45448465	.	T	G	7634.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.9272;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=31.42;ReadPosRankSum=0.539;VQSLOD=6.8768;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,240:243:99:7570,629,0
19	45537779	.	C	T	144.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.031;VQSLOD=4.3802;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:174,0,376
19	45561063	.	A	G	4859.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9557;MQ=59.56;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=9.4140;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,156:156:99:4858,391,0
19	45655333	.	T	C	166.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.059;VQSLOD=10.5712;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:197,0,264
19	45854919	.	T	G	2444.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=9.674;HRun=0;HaplotypeScore=7.7554;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.546;VQSLOD=3.5644;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,92:247:99:2475,0,4239
19	45912736	.	C	A	120.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;DP=11;Dels=0.00;FS=3.424;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.532;VQSLOD=6.0519;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:151,0,156
19	46133256	.	G	A	1081.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=104;Dels=0.00;FS=3.724;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.195;VQSLOD=6.1896;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,42:104:99:1111,0,1531
19	46141845	.	T	C	1640.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.735;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.2859;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.766;VQSLOD=6.5400;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,57:122:99:1670,0,1705
19	46181392	.	G	C	250.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.836;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.671;VQSLOD=5.0835;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:280,0,319
19	46216642	.	G	T	447.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;DP=31;Dels=0.00;FS=3.988;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=14.44;ReadPosRankSum=-1.364;VQSLOD=4.5295;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:478,0,465
19	46268902	.	C	T	1041.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.872;DP=87;Dels=0.00;FS=2.899;HRun=0;HaplotypeScore=1.6316;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.532;VQSLOD=6.4534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,44:87:99:1071,0,1108
19	46269313	.	G	C	320.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;DP=25;Dels=0.00;FS=1.623;HRun=0;HaplotypeScore=1.8937;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=12.84;ReadPosRankSum=-1.304;VQSLOD=5.0899;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:351,0,323
19	46812451	.	C	T	537.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=45;Dels=0.00;FS=4.240;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.354;VQSLOD=4.7126;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,21:45:99:568,0,645
19	46998236	.	C	T	1371.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;DP=107;Dels=0.00;FS=0.731;HRun=0;HaplotypeScore=3.3581;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.153;VQSLOD=6.4821;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,49:107:99:1402,0,1608
19	47177913	.	A	G	2230.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=57.94;MQ0=0;QD=29.74;VQSLOD=8.0656;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:75:99:2264,190,0
19	47278859	.	C	G	3200.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.545;DP=242;Dels=0.00;FS=7.356;HRun=0;HaplotypeScore=5.7074;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.144;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.229;VQSLOD=2.7623;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,116:242:99:3231,0,3156
19	47774772	.	T	C	774.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;DP=75;Dels=0.00;FS=0.924;HRun=1;HaplotypeScore=1.7331;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.307;VQSLOD=5.8998;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,32:75:99:804,0,1225
19	47823484	.	T	C	5491.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.45;MQ0=0;QD=31.93;VQSLOD=8.9772;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5490,445,0
19	47823871	.	G	T	6112.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4839;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.87;VQSLOD=8.9982;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:198:99:6111,493,0
19	47856336	.	C	T	400.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.271;DP=33;Dels=0.00;FS=3.093;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.284;VQSLOD=5.8627;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:431,0,472
19	48184474	.	C	T	51.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=4.8463;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:81.59:82,0,171
19	48525507	.	G	A	1677.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.196;DP=159;Dels=0.00;FS=4.807;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=6.0834;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,63:159:99:1708,0,2568
19	48537585	.	A	G	1138.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.719;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.136;VQSLOD=6.2044;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,49:97:99:1168,0,1127
19	48735017	.	C	CTT	1596.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.443;DP=63;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=172.1683;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.206;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,33:63:99:1636,0,886
19	48737706	.	A	T	1540.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;DP=132;Dels=0.00;FS=4.212;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.528;VQSLOD=6.3688;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,67:132:99:1571,0,1591
19	48800914	.	G	A	382.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=25;Dels=0.00;FS=1.770;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.263;VQSLOD=2.7813;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:412,0,225
19	48954421	.	G	A	1219.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.400;DP=73;Dels=0.00;FS=0.984;HRun=0;HaplotypeScore=3.4948;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.796;VQSLOD=5.8187;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,42:73:99:1249,0,826
19	49001600	.	A	G	573.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.864;DP=41;Dels=0.00;FS=3.151;HRun=2;HaplotypeScore=3.9076;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.691;VQSLOD=4.5299;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,20:41:99:603,0,595
19	49116359	.	T	C	75.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.814;DP=18;Dels=0.00;FS=2.667;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.690;VQSLOD=3.7983;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:106,0,351
19	49244220	.	G	A	924.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.286;DP=79;Dels=0.00;FS=1.985;HRun=0;HaplotypeScore=3.3596;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.203;VQSLOD=6.4909;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,39:79:99:955,0,980
19	49261368	.	T	C	882.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=33.93;VQSLOD=8.7215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:72.23:915,72,0
19	49438363	.	G	A	257.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;DP=19;Dels=0.00;FS=4.320;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.592;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.612;VQSLOD=5.6069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:288,0,174
19	49442849	.	T	TG	1011.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.947;DP=87;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=222.0320;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.052;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,36:87:99:1050,0,1053
19	49445817	.	T	C	880.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.203;DP=66;Dels=0.00;FS=3.589;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.385;VQSLOD=5.9480;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,31:66:99:910,0,907
19	49573438	.	A	G	1790.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.441;DP=136;Dels=0.00;FS=9.352;HRun=0;HaplotypeScore=4.7523;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.253;VQSLOD=4.3165;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,73:136:99:1821,0,1858
19	49574125	.	G	C	444.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;DP=26;Dels=0.00;FS=2.287;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.162;VQSLOD=5.2894;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,17:26:99:474,0,261
19	49621964	.	T	C	4566.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.6904;MQ=59.18;MQ0=0;QD=30.85;VQSLOD=8.3711;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4565,370,0
19	49640002	.	G	T	115.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=10;Dels=0.00;FS=2.808;HRun=1;HaplotypeScore=3.9831;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.573;VQSLOD=2.5449;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:10:93.80:146,0,94
19	49658209	.	A	C	2728.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=179;Dels=0.00;FS=7.717;HRun=0;HaplotypeScore=10.4476;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.352;VQSLOD=3.6459;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,104:179:99:2759,0,1952
19	49658367	.	C	T	1435.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.538;DP=145;Dels=0.00;FS=0.629;HRun=1;HaplotypeScore=5.1477;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.108;VQSLOD=5.0359;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,58:145:99:1465,0,2509
19	49867913	.	G	A	1650.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.434;DP=123;Dels=0.00;FS=1.524;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.745;VQSLOD=6.5978;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,60:123:99:1681,0,1530
19	49869051	.	T	G	675.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.177;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8055;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=2.020;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.608;VQSLOD=5.8099;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,24:68:99:706,0,1188
19	49878115	.	G	A	798.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.712;DP=41;Dels=0.00;FS=14.261;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.406;VQSLOD=2.3932;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,28:41:99:829,0,254
19	49878196	.	G	A	777.05	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.615;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.8315;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.667;VQSLOD=5.8528;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,29:55:99:807,0,672
19	49950298	.	C	T	2960.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;DP=231;Dels=0.00;FS=0.479;HRun=2;HaplotypeScore=10.5736;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.133;VQSLOD=4.2271;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,114:231:99:2990,0,2914
19	49954803	.	C	T	1246.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.989;DP=130;Dels=0.00;FS=5.702;HRun=0;HaplotypeScore=3.4680;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.464;VQSLOD=4.8003;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,53:130:99:1277,0,2022
19	49954807	.	T	G	1277.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.341;DP=126;Dels=0.00;FS=11.021;HRun=0;HaplotypeScore=5.0459;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.229;VQSLOD=3.8370;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,50:126:99:1307,0,1944
19	49964977	.	C	G	166.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=6.3679;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:54.56:197,0,55
19	50383591	.	A	G	2782.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7377;MQ=59.55;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=9.1222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2816,217,0
19	50383636	.	T	C	1076.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.216;DP=75;Dels=0.00;FS=3.266;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.386;VQSLOD=4.9725;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,40:75:99:1106,0,939
19	50412650	.	C	T	1238.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.231;DP=84;Dels=0.00;FS=1.813;HRun=0;HaplotypeScore=1.8401;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.443;VQSLOD=6.0003;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,44:84:99:1269,0,1060
19	50435862	.	C	T	292.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=56.52;MQ0=0;QD=26.58;VQSLOD=6.5344;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:27.08:325,27,0
19	50926264	.	T	C	1994.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.8237;MQ=57.73;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=6.5563;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2028,153,0
19	50926265	.	G	C	1884.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.10;MQ0=0;QD=27.31;VQSLOD=6.9797;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:1917,144,0
19	51323473	.	C	G	5208.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.4725;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60;VQSLOD=8.8559;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:5208,400,0
19	51411636	.	G	T	7989.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=8.1210;MQ=59.11;MQ0=0;QD=32.22;VQSLOD=5.6357;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:7989,629,0
19	51452250	.	T	C	3346.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=30.98;VQSLOD=8.7529;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:3345,271,0
19	51485622	.	A	G	1126.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.20;VQSLOD=9.4798;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:90.28:1160,90,0
19	51520487	.	A	C	104.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;DP=15;Dels=0.00;FS=4.832;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.286;VQSLOD=3.9718;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:135,0,286
19	51728477	.	C	T	1010.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=92;Dels=0.00;FS=5.918;HRun=0;HaplotypeScore=3.1610;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.203;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.079;VQSLOD=3.7168;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,43:92:99:1040,0,1380
19	51728641	.	A	G	1988.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=166;Dels=0.00;FS=2.756;HRun=3;HaplotypeScore=3.1392;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.778;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.785;VQSLOD=5.1631;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,78:166:99:2019,0,2419
19	51738917	.	G	A	607.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.143;DP=37;Dels=0.00;FS=3.069;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.673;VQSLOD=5.4511;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,23:37:99:637,0,322
19	51850290	.	G	A	1456.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.53;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=9.0916;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1490,117,0
19	51919949	.	G	A	2150.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=45.76;MQ0=1;QD=27.56;VQSLOD=5.4642;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,77:78:99:2183,181,0
19	51984725	.	T	A	1612.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;DP=127;Dels=0.00;FS=1.464;HRun=0;HaplotypeScore=9.3142;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=12.69;ReadPosRankSum=2.077;VQSLOD=3.7821;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,61:127:99:1642,0,1626
19	52000624	.	T	G	6222.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.9416;MQ=59.72;MQ0=0;QD=29.35;VQSLOD=8.5611;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,212:212:99:6222,472,0
19	52000672	.	G	A	5785.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.62;MQ0=0;QD=30.45;VQSLOD=8.6481;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,190:190:99:5784,454,0
19	52003331	.	G	C	5950.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.2837;MQ=59.47;MQ0=0;QD=32.70;VQSLOD=7.6089;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5950,457,0
19	52004743	.	G	A	6308.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7311;MQ=58.98;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=7.0019;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:203:99:6308,518,0
19	52004791	.	G	GC	5834.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;DS;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=1107.7637;MQ=59.51;MQ0=0;QD=37.16;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:14,143:157:99:5835,433,0
19	52033742	.	G	A	2414.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.27;MQ0=0;QD=31.36;VQSLOD=9.2051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2448,190,0
19	52090014	.	C	T	1661.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.71;MQ0=0;QD=33.22;VQSLOD=8.5493;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1694,135,0
19	52115645	.	G	C	1485.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=110;Dels=0.00;FS=3.259;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.029;VQSLOD=6.2100;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,59:110:99:1516,0,1380
19	52249947	.	C	G	2367.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.023;DP=205;Dels=0.00;FS=2.460;HRun=1;HaplotypeScore=4.2656;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.855;VQSLOD=5.1568;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,90:205:99:2397,0,3048
19	52250216	.	A	G	1346.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.140;DP=92;Dels=0.00;FS=3.246;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.812;VQSLOD=6.0389;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,47:92:99:1376,0,1111
19	52376507	.	T	C	814.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.253;VQSLOD=6.4206;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,30:45:99:844,0,378
19	52447624	.	C	T	1405.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;DP=111;Dels=0.00;FS=6.558;HRun=1;HaplotypeScore=1.8888;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.145;VQSLOD=4.9586;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,51:111:99:1436,0,1593
19	52471872	.	A	G	2700.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=203;Dels=0.00;FS=0.517;HRun=1;HaplotypeScore=3.7324;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.525;VQSLOD=5.7247;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,104:203:99:2730,0,2709
19	52496149	.	C	T	2853.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;DP=210;Dels=0.00;FS=3.120;HRun=1;HaplotypeScore=1.9862;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.120;VQSLOD=6.5759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,114:210:99:2884,0,2558
19	52497250	.	G	A	1722.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.314;DP=129;Dels=0.00;FS=0.656;HRun=1;HaplotypeScore=8.6524;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.629;VQSLOD=4.6547;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,63:129:99:1752,0,1685
19	52497943	.	G	A	743.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.099;DP=54;Dels=0.00;FS=2.329;HRun=0;HaplotypeScore=1.6634;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.729;VQSLOD=4.7666;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,29:54:99:774,0,677
19	52519608	.	C	T	3211.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.468;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.169;HRun=0;HaplotypeScore=2.8888;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.143;VQSLOD=6.1638;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,120:250:99:3241,0,3613
19	52520607	.	C	T	465.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.802;DP=44;Dels=0.00;FS=2.745;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.014;VQSLOD=5.1083;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:495,0,644
19	52521296	.	G	A	1582.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.534;DP=130;Dels=0.00;FS=1.455;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.112;VQSLOD=6.9181;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,65:130:99:1613,0,1668
19	52619065	.	T	C	4056.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;DP=242;Dels=0.00;FS=4.384;HRun=0;HaplotypeScore=14.0935;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.589;VQSLOD=2.4897;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,131:242:99:3412,0,2905
19	52659872	.	T	C	744.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.681;DP=59;Dels=0.00;FS=9.832;HRun=1;HaplotypeScore=2.8300;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.336;VQSLOD=3.2311;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,26:59:99:774,0,828
19	52660279	.	C	T	869.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8656;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.144;VQSLOD=5.4863;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,34:76:99:900,0,1141
19	52869022	.	G	T	4728.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9151;MQ=59.37;MQ0=0;QD=30.31;VQSLOD=8.4163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:156:99:4693,382,0
19	52869278	.	G	C	1983.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06;VQSLOD=13.3489;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2017,156,0
19	52887437	.	A	C	394.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.838;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.968;VQSLOD=6.2329;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:424,0,479
19	52938361	.	C	A	3270.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=8.7438;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:3270,268,0
19	52941171	.	T	C	2132.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.66;MQ0=0;QD=31.37;VQSLOD=9.0395;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2166,166,0
19	52941540	.	G	A	1823.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.56;VQSLOD=9.6275;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1856,144,0
19	52941618	.	A	C	1877.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.60;MQ0=0;QD=32.36;VQSLOD=9.4933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1910,144,0
19	53014346	.	G	A	2680.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.437;DP=158;Dels=0.00;FS=0.612;HRun=2;HaplotypeScore=6.9796;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=2.090;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.636;VQSLOD=2.7944;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,100:158:99:2711,0,1431
19	53015384	.	A	G	2059.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.298;DP=163;Dels=0.00;FS=4.660;HRun=0;HaplotypeScore=5.3095;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.474;VQSLOD=4.7228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,75:163:99:2090,0,2503
19	53057479	.	G	A	1246.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;DP=94;Dels=0.00;FS=5.252;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.632;VQSLOD=5.2499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,48:94:99:1277,0,1338
19	53077411	.	T	C	7531.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=54.67;MQ0=2;QD=30.62;VQSLOD=7.2636;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,246:246:99:7531,572,0
19	53085659	.	C	T	6389.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5494;MQ=59.57;MQ0=0;QD=32.94;VQSLOD=8.2175;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:194:99:6389,527,0
19	53086124	.	C	A	6598.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7480;MQ=58.02;MQ0=0;QD=32.99;VQSLOD=8.1871;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:6598,512,0
19	53117531	.	C	T	4079.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=13.5928;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4079,316,0
19	53209553	.	G	A	7496.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4648;MQ=50.90;MQ0=5;QD=30.72;VQSLOD=3.1448;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,239:244:99:7495,614,0
19	53209554	.	G	T	7557.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5981;MQ=51.00;MQ0=5;QD=31.23;VQSLOD=3.2492;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,237:242:99:7557,611,0
19	53303527	.	A	G	6587.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.189;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.8051;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=30.36;ReadPosRankSum=1.668;VQSLOD=6.3871;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,216:217:99:6586,557,0
19	53577419	.	G	C	6599.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.4116;MQ=59.06;MQ0=0;QD=28.57;VQSLOD=8.2147;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:6598,539,0
19	53645291	.	T	C	5608.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.74;MQ0=0;QD=31.51;VQSLOD=9.2312;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5608,427,0
19	53669273	.	T	C	7301.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6550;MQ=59.26;MQ0=0;QD=33.19;VQSLOD=9.8141;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,219:220:99:7262,593,0
19	53793042	.	G	A	2669.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3945;MQ=59.70;MQ0=0;QD=34.23;VQSLOD=9.2414;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:78:99:2703,226,0
19	53911973	.	A	G	8725.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7431;MQ=59.11;MQ0=0;QD=34.90;VQSLOD=8.2891;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8725,680,0
19	53958126	.	T	G	6201.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8907;MQ=59.31;MQ0=1;QD=32.99;VQSLOD=9.7771;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,188:188:99:6201,485,0
19	53958263	.	G	A	5816.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;DS;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8628;MQ=59.02;MQ0=1;QD=30.29;VQSLOD=8.8990;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:5815,466,0
19	53959568	.	G	C	3160.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;DP=244;Dels=0.00;FS=0.481;HRun=0;HaplotypeScore=1.9066;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.013;VQSLOD=5.9252;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,117:244:99:3191,0,3501
19	53959715	.	C	T	2547.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.939;DP=201;Dels=0.00;FS=1.736;HRun=0;HaplotypeScore=4.2775;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.989;VQSLOD=3.6329;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,97:201:99:2578,0,2938
19	53994061	.	A	G	2328	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7900;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.167;VQSLOD=4.6568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,84:168:99:2358,0,2235
19	53994802	.	A	T	1271.27	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.754;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.219;VQSLOD=7.1042;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,46:93:99:1301,0,1292
19	54327313	.	C	A	1302.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.682;DP=101;Dels=0.00;FS=3.710;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.542;VQSLOD=6.6516;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,48:101:99:1332,0,1544
19	54545531	.	T	C	2143.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.46;MQ0=0;QD=31.53;VQSLOD=9.3190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2177,184,0
19	54600232	.	A	C	2432.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=59.37;MQ0=0;QD=33.32;VQSLOD=9.6491;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2466,196,0
19	54664209	.	G	C	1282.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5637;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.494;VQSLOD=5.9757;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,55:132:99:1313,0,2084
19	54759361	.	T	C	1174.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.635;DP=75;Dels=0.00;FS=0.869;HRun=1;HaplotypeScore=2.5141;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.346;VQSLOD=5.7847;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,41:75:99:1205,0,817
19	54782407	.	C	T	1285.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.329;DP=101;Dels=0.00;FS=2.139;HRun=0;HaplotypeScore=3.2550;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.871;VQSLOD=4.9784;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,51:101:99:1316,0,1242
19	54783375	.	T	A	7865.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7009;MQ=49.80;MQ0=2;MQRankSum=-0.880;QD=31.71;ReadPosRankSum=-0.256;VQSLOD=3.0881;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,247:248:99:7826,627,0
19	54784130	.	T	C	1250.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=126;Dels=0.00;FS=2.298;HRun=0;HaplotypeScore=3.8025;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.735;VQSLOD=4.1584;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,54:126:99:1281,0,1810
19	54849942	.	G	A	1101.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.265;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0824;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.128;VQSLOD=4.4701;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,38:85:99:1132,0,1411
19	54973653	.	C	T	856.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.332;DP=76;Dels=0.00;FS=10.734;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.845;VQSLOD=3.9380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,37:76:99:887,0,1068
19	55174498	.	T	C	1258.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.907;DP=106;Dels=0.00;FS=0.742;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.811;VQSLOD=6.3317;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,43:106:99:1289,0,1580
19	55175009	.	G	T	1437.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.807;DP=134;Dels=0.00;FS=4.247;HRun=0;HaplotypeScore=4.9060;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.810;VQSLOD=3.6969;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,66:134:99:1468,0,1595
19	55176262	.	A	G	2293.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9578;MQ=57.47;MQ0=0;QD=28.32;VQSLOD=6.8043;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2327,178,0
19	55263898	.	G	A	6720.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=234;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4860;MQ=48.05;MQ0=3;QD=28.72;VQSLOD=2.2701;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,228:234:99:6694,554,0
19	55281315	.	G	T	2571.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.30;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=8.0975;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2604,214,0
19	55512232	.	C	A	891.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.034;DP=66;Dels=0.00;FS=2.021;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.321;VQSLOD=4.8655;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,35:66:99:921,0,744
19	55526345	.	T	G	473.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.525;DP=38;Dels=0.00;FS=5.124;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.028;VQSLOD=5.6557;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:504,0,601
19	55526359	.	A	T	436.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=32;Dels=0.00;FS=3.506;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.159;VQSLOD=4.8382;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,18:32:99:466,0,429
19	55526373	.	G	C	367.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9810;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.598;VQSLOD=4.0204;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:398,0,275
19	55527081	.	C	T	405.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;DP=33;Dels=0.00;FS=7.829;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.356;VQSLOD=4.5383;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:436,0,434
19	55530035	.	C	T	2224.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.579;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=9.2260;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.474;VQSLOD=4.5530;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,92:185:99:2255,0,2190
19	55598724	.	A	G	2054.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=33.67;VQSLOD=9.8124;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2087,169,0
19	55671337	.	C	T	3295.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.85;MQ0=0;QD=31.38;VQSLOD=8.6691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3295,262,0
19	55693244	.	T	C	2439.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.809;DP=172;Dels=0.00;FS=1.220;HRun=0;HaplotypeScore=2.7850;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.955;VQSLOD=6.5048;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,94:172:99:2469,0,2174
19	55699454	.	T	C	3436.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5475;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.24;VQSLOD=8.8634;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:110:99:3436,274,0
19	55710074	.	G	A	1358.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;DP=87;Dels=0.00;FS=11.036;HRun=1;HaplotypeScore=3.8209;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.167;VQSLOD=4.4369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,49:87:99:1388,0,1009
19	55713535	.	G	A	6442.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;DP=218;Dels=0.00;FS=3.622;HRun=0;HaplotypeScore=4.6202;MQ=57.58;MQ0=4;MQRankSum=4.437;QD=29.55;ReadPosRankSum=-1.063;VQSLOD=2.2955;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:11,206:218:99:6288,391,0
19	55715342	.	C	T	1670.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.774;DP=128;Dels=0.00;FS=10.284;HRun=1;HaplotypeScore=2.9314;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.095;VQSLOD=3.7051;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,59:128:99:1701,0,1773
19	55738634	.	T	C	426.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;DP=17;Dels=0.00;FS=4.523;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.327;VQSLOD=3.3980;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:12.50:459,12,0
19	55824332	.	T	G	540.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;DP=43;Dels=0.00;FS=4.561;HRun=0;HaplotypeScore=5.0900;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.214;VQSLOD=4.3406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:43:99:571,0,534
19	55998262	.	C	T	190.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.070;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=53.10;MQ0=1;MQRankSum=0.423;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.588;VQSLOD=4.1205;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:220,0,197
19	56041255	.	C	G	445.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=8.1107;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.12:478,39,0
19	56047448	.	A	G	1418.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36;VQSLOD=7.7423;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1451,123,0
19	56104136	.	T	C	448.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.39;VQSLOD=7.3028;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:42.10:482,42,0
19	56321414	.	C	A	2064.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26;VQSLOD=9.2581;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2098,169,0
19	56459342	.	C	T	2350.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.612;DP=169;DS;Dels=0.00;FS=1.428;HRun=0;HaplotypeScore=1.8614;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.011;VQSLOD=6.6994;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,83:169:99:2380,0,2217
19	56459614	.	G	C	1460.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;DP=112;Dels=0.00;FS=1.502;HRun=0;HaplotypeScore=3.5764;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.438;VQSLOD=5.1672;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,55:112:99:1491,0,1384
19	56467375	.	C	T	2928.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;DP=210;Dels=0.00;FS=2.459;HRun=0;HaplotypeScore=5.8275;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.561;VQSLOD=4.2706;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,116:210:99:2958,0,2379
19	56477710	.	T	C	2905.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8279;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.41;VQSLOD=7.6623;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:2939,256,0
19	56487603	.	A	G	866.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.316;DP=91;Dels=0.00;FS=8.861;HRun=2;HaplotypeScore=1.9960;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.590;VQSLOD=4.6363;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,33:91:99:897,0,1587
19	56499279	.	G	C	928.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.109;DP=86;Dels=0.00;FS=10.732;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.147;VQSLOD=3.9609;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,39:86:99:959,0,1223
19	56543982	.	G	T	461.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.336;DP=44;Dels=0.00;FS=5.299;HRun=0;HaplotypeScore=1.7900;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.592;VQSLOD=5.1751;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,19:44:99:492,0,644
19	56549510	.	T	C	2177.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;DP=191;Dels=0.00;FS=4.315;HRun=0;HaplotypeScore=4.5667;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.812;VQSLOD=5.2124;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,89:191:99:2208,0,2761
19	56565164	.	G	A	2324.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.6640;MQ=58.74;MQ0=0;QD=28.01;VQSLOD=6.9669;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2358,190,0
19	56572832	.	G	A	1924.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.2351;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.656;VQSLOD=5.5063;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,72:178:99:1955,0,3131
19	56693620	.	C	G	1916.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.053;DP=113;Dels=0.00;FS=1.091;HRun=2;HaplotypeScore=0.9789;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=16.96;ReadPosRankSum=1.366;VQSLOD=5.3823;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,66:113:99:1947,0,1086
19	56703248	.	G	A	1073.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.274;DP=76;Dels=0.00;FS=0.898;HRun=0;HaplotypeScore=1.8932;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.797;VQSLOD=5.0646;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,45:76:99:1103,0,795
19	56953963	.	G	A	5047.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.49;MQ0=0;QD=29.35;VQSLOD=8.4545;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:5047,388,0
19	57036653	.	G	A	1105.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=82;Dels=0.00;FS=5.957;HRun=0;HaplotypeScore=7.7769;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.385;VQSLOD=4.6812;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,42:82:99:1136,0,1137
19	57050515	.	C	G	224.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.085;VQSLOD=10.5329;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:254,0,351
19	57058998	.	C	G	1887.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=149;Dels=0.00;FS=7.430;HRun=1;HaplotypeScore=7.8842;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.500;VQSLOD=3.7446;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,69:149:99:1918,0,1917
19	57066013	.	C	T	2118.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.093;DP=165;Dels=0.00;FS=1.942;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.034;VQSLOD=6.6966;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,84:165:99:2149,0,2069
19	57085769	.	G	C	1831.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=153;Dels=0.00;FS=1.291;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.361;VQSLOD=6.0861;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,73:153:99:1862,0,2171
19	57089050	.	C	T	2566.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.53;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=8.0331;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2599,208,0
19	57132968	.	G	A	1378.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.820;DP=103;Dels=0.00;FS=2.683;HRun=0;HaplotypeScore=4.2401;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.894;VQSLOD=5.5847;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,52:103:99:1409,0,1309
19	57325083	.	C	T	1361.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.709;DP=124;Dels=0.00;FS=2.939;HRun=0;HaplotypeScore=0.9867;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.823;VQSLOD=5.8596;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,58:124:99:1391,0,1828
19	57326721	.	C	T	1209.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.183;DP=78;Dels=0.00;FS=7.019;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.185;VQSLOD=4.2195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,40:78:99:1239,0,1010
19	57641146	.	A	G	1228.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.969;DP=85;Dels=0.00;FS=0.814;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.165;VQSLOD=5.5408;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,43:85:99:1259,0,1075
19	57642782	.	C	A	5169.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.5317;MQ=58.86;MQ0=0;QD=31.71;VQSLOD=9.7203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5168,397,0
19	57646393	.	T	A	2051.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;DP=160;Dels=0.00;FS=0.583;HRun=1;HaplotypeScore=2.9202;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.276;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.043;VQSLOD=4.7556;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,77:160:99:2082,0,2246
19	57646570	.	T	C	1491.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;DP=136;Dels=0.00;FS=0.649;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.262;VQSLOD=6.4180;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,63:136:99:1521,0,2062
19	57647236	.	T	C	4241.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.285;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.466;HRun=0;HaplotypeScore=5.9747;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.457;VQSLOD=3.4175;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,132:250:99:3569,0,3374
19	57648277	.	A	T	2197.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;DP=203;Dels=0.00;FS=3.279;HRun=0;HaplotypeScore=6.8031;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.001;VQSLOD=4.4292;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,87:203:99:2227,0,2961
19	57723007	.	G	C	1298.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.848;DP=100;Dels=0.00;FS=13.248;HRun=0;HaplotypeScore=2.6971;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.021;VQSLOD=3.7531;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,51:100:99:1329,0,1405
19	57723013	.	G	A	1253.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.224;DP=100;Dels=0.00;FS=11.523;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.134;VQSLOD=4.7406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,50:100:99:1283,0,1339
19	57839150	.	A	G	1171.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;DP=111;Dels=0.00;FS=3.608;HRun=0;HaplotypeScore=2.4529;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.079;VQSLOD=6.1694;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,52:111:99:1201,0,1644
19	57839567	.	T	A	1269.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;DP=131;Dels=0.00;FS=0.675;HRun=0;HaplotypeScore=4.2227;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.086;VQSLOD=5.3753;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,51:131:99:1300,0,2207
19	57868336	.	A	G	5060.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.61;MQ0=0;QD=28.92;VQSLOD=8.2957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,175:175:99:5059,412,0
19	57909872	.	G	A	1913.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.320;DP=165;Dels=0.00;FS=1.234;HRun=1;HaplotypeScore=4.3453;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.335;VQSLOD=6.1197;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,75:165:99:1944,0,2509
19	57956828	.	T	G	1617.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=148;Dels=0.00;FS=0.618;HRun=0;HaplotypeScore=3.9198;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.576;VQSLOD=5.8108;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,65:148:99:1648,0,1995
19	57985566	.	G	C	1896.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5739;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.796;VQSLOD=5.5766;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,69:125:99:1927,0,1576
19	57985702	.	C	A	1312.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.135;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8288;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.458;VQSLOD=2.8725;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,49:84:99:1343,0,835
19	58004346	.	G	C	535.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=57;Dels=0.00;FS=1.097;HRun=0;HaplotypeScore=1.9153;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.393;VQSLOD=5.8966;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,20:57:99:566,0,943
19	58038964	.	T	A	1141.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57;VQSLOD=13.7163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:96.29:1175,96,0
19	58117083	.	A	G	843.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=2.8553;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.507;VQSLOD=6.4684;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:77:99:873,0,1076
19	58117223	.	T	A	2806.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7468;MQ=59.25;MQ0=0;QD=30.50;VQSLOD=8.0844;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2839,217,0
19	58117399	.	C	T	1129.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.125;DP=73;Dels=0.00;FS=6.572;HRun=0;HaplotypeScore=5.8126;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.158;VQSLOD=4.4162;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,40:73:99:1159,0,879
19	58131623	.	G	A	2502.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;DP=198;Dels=0.00;FS=1.778;HRun=0;HaplotypeScore=7.4395;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.407;VQSLOD=4.4633;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,98:198:99:2532,0,2497
19	58152795	.	C	T	1526.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;DP=112;Dels=0.00;FS=0.716;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.504;VQSLOD=6.4878;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,58:112:99:1556,0,1485
19	58213952	.	C	A	6689.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7674;MQ=59.76;MQ0=0;QD=32.95;VQSLOD=8.5551;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,203:203:99:6689,569,0
19	58572979	.	G	A	4195	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3123;MQ=58.68;MQ0=0;QD=31.78;VQSLOD=9.1562;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:132:99:4194,358,0
19	58718269	.	G	A	364.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.397;VQSLOD=6.6869;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:395,0,103
19	58718360	.	A	AG	990.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=54.3756;MQ=60.39;MQ0=0;QD=41.29;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:69.23:1033,69,0
19	58774071	.	A	G	7453.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.83;MQ0=0;QD=31.06;VQSLOD=9.7002;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,240:240:99:7452,614,0
19	58864479	.	T	C	5140.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9446;MQ=59.58;MQ0=0;QD=31.16;VQSLOD=8.5716;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:165:99:5140,424,0
19	58868480	.	G	T	2050.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04;VQSLOD=14.0730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2084,172,0
19	58928786	.	A	G	1306.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=110;Dels=0.00;FS=0.702;HRun=0;HaplotypeScore=4.5573;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.421;VQSLOD=5.5319;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,49:110:99:1337,0,1559
19	58946056	.	G	A	1242.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;DP=139;Dels=0.00;FS=1.411;HRun=0;HaplotypeScore=2.5105;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.171;VQSLOD=5.9117;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,52:139:99:1273,0,2239
19	58948579	.	T	C	997.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.121;DP=80;Dels=0.00;FS=1.992;HRun=0;HaplotypeScore=2.8278;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.656;VQSLOD=3.8073;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,39:80:99:1028,0,1047
19	58989495	.	A	C	1765.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.285;DP=153;Dels=0.00;FS=7.179;HRun=0;HaplotypeScore=4.2263;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.581;VQSLOD=4.6924;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,72:153:99:1795,0,2010
19	58991900	.	G	A	596.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.070;DP=67;Dels=0.00;FS=3.501;HRun=0;HaplotypeScore=3.7624;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.671;VQSLOD=4.9178;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,27:67:99:626,0,1041
19	59082605	.	C	T	593.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;DP=34;Dels=0.00;FS=3.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.162;VQSLOD=5.7968;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:623,0,337
20	126310	.	ACC	A	1611.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.797;DP=140;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=481.2378;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=-0.384;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.176;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,48:140:99:1650,0,3804
20	139456	.	G	A	747.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;DP=66;Dels=0.00;FS=2.018;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.581;VQSLOD=6.1477;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,29:66:99:778,0,955
20	139576	.	C	A	456.85	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.395;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9142;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.955;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.815;VQSLOD=4.5808;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,18:59:99:487,0,1043
20	168728	.	T	A	2844.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.756;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=3.030;HRun=0;HaplotypeScore=2.7649;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.142;VQSLOD=5.3200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,110:228:99:2874,0,3157
20	256727	.	T	A	2621.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.08;MQ0=0;QD=28.81;VQSLOD=8.6968;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:2654,211,0
20	368905	.	A	G	630.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=48;Dels=0.00;FS=2.621;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.227;VQSLOD=5.3210;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,24:48:99:660,0,657
20	590542	.	C	G	581.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.45;MQ0=0;QD=29.07;VQSLOD=7.3691;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:48.15:614,48,0
20	1099523	.	T	G	1603.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=112;Dels=0.00;FS=3.548;HRun=0;HaplotypeScore=3.6168;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.895;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.791;VQSLOD=4.2780;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,58:112:99:1633,0,1404
20	1115919	.	A	G	577.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.084;VQSLOD=6.3549;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,25:59:99:608,0,918
20	1298963	.	C	T	1020.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.193;DP=103;Dels=0.00;FS=0.766;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.443;VQSLOD=4.5082;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,44:103:99:1050,0,1572
20	1426393	.	C	T	3059.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.871;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=0.486;HRun=1;HaplotypeScore=5.3165;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=13.24;ReadPosRankSum=2.009;VQSLOD=4.4922;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,113:231:99:3089,0,2954
20	1459060	.	T	G	5338.02	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=59.43;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=9.9635;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,165:165:99:5337,436,0
20	1532595	.	T	C	1160.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.281;DP=116;Dels=0.00;FS=0.689;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.740;VQSLOD=5.7083;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,51:116:99:1190,0,1787
20	1600524	.	T	C	1035.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.556;DP=91;Dels=0.00;FS=0.808;HRun=4;HaplotypeScore=2.6912;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.364;VQSLOD=6.5832;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,40:91:99:1066,0,1316
20	1616137	.	G	A	4277.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.347;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=3.803;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.647;VQSLOD=6.0795;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,130:242:99:3648,0,2940
20	1616206	.	A	G	5152.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.563;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.5623;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=31.42;ReadPosRankSum=-0.627;VQSLOD=6.3673;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,163:164:99:5117,375,0
20	2290333	.	C	A	8514.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.4915;MQ=59.37;MQ0=0;QD=34.06;VQSLOD=7.9174;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,249:250:99:8514,656,0
20	2321105	.	G	C	6746.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.0894;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.96;VQSLOD=5.6640;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:233:99:6708,539,0
20	2375262	.	A	G	629.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47;VQSLOD=13.9778;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:54.16:662,54,0
20	2539387	.	G	A	497.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.635;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.514;VQSLOD=7.2167;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:528,0,166
20	3090848	.	T	G	1047.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=122;Dels=0.00;FS=6.067;HRun=3;HaplotypeScore=2.8288;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.062;VQSLOD=4.4421;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,45:122:99:1078,0,1957
20	3102998	.	G	A	1083.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.597;DP=101;Dels=0.00;FS=3.705;HRun=0;HaplotypeScore=6.7224;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.728;VQSLOD=4.4533;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,45:101:99:1114,0,1403
20	3128854	.	A	G	1452.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=144;Dels=0.00;FS=1.325;HRun=0;HaplotypeScore=3.9635;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.371;VQSLOD=4.3521;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,60:144:99:1483,0,1988
20	3204084	.	G	A	2162.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.74;MQ0=0;QD=30.46;VQSLOD=8.6369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2196,175,0
20	3285140	.	T	C	2647.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.30;MQ0=0;QD=30.78;VQSLOD=9.3354;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2680,202,0
20	4680251	.	A	G	2159.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.85;MQ0=0;QD=30.85;VQSLOD=8.5679;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2193,186,0
20	4705718	.	C	T	703.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.432;DP=54;Dels=0.00;FS=1.209;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.169;VQSLOD=6.3636;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,26:54:99:734,0,701
20	5547384	.	C	T	1230.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.244;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5362;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.187;VQSLOD=5.3683;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,53:115:99:1260,0,1497
20	5556512	.	G	A	2202.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.605;DP=169;Dels=0.00;FS=5.627;HRun=1;HaplotypeScore=4.8045;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.747;VQSLOD=4.0208;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,86:169:99:2232,0,2183
20	5753579	.	C	T	5402.23	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5827;MQ=59.65;MQ0=0;QD=30.35;VQSLOD=8.1984;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:5401,436,0
20	5903067	.	T	A	1475.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.173;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5592;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.423;VQSLOD=5.4899;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,60:110:99:1505,0,1307
20	5903323	.	G	A	4310.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.92;MQ0=0;QD=29.32;VQSLOD=8.5342;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,146:147:99:4310,328,0
20	5903517	.	A	G	1787.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=59.17;MQ0=0;QD=30.82;VQSLOD=9.3019;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1820,138,0
20	5903848	.	C	G	5903.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.8050;MQ=59.01;MQ0=0;QD=32.08;VQSLOD=8.4666;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:184:99:5903,451,0
20	5904040	.	G	A	1906.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=164;DS;Dels=0.00;FS=8.147;HRun=0;HaplotypeScore=6.6203;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.929;VQSLOD=4.4982;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,70:164:99:1937,0,2641
20	6065729	.	C	T	4571.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=1.4450;MQ=58.89;MQ0=0;QD=32.42;VQSLOD=9.4971;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4571,355,0
20	6759115	.	A	T	1198.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.108;DP=78;Dels=0.00;FS=2.037;HRun=0;HaplotypeScore=2.7396;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.231;VQSLOD=5.3491;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,48:78:99:1229,0,678
20	7964476	.	T	C	469.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.194;DP=65;Dels=0.00;FS=2.217;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.936;VQSLOD=5.3744;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,22:65:99:499,0,1074
20	9288522	.	G	A	763.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.34;VQSLOD=8.0225;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:63.19:797,63,0
20	9496716	.	C	G	472.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.844;DP=38;Dels=0.00;FS=1.282;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.838;VQSLOD=5.7528;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:502,0,518
20	9543622	.	C	T	2570.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.710;DP=247;DS;Dels=0.00;FS=0.999;HRun=1;HaplotypeScore=3.8515;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.212;VQSLOD=4.6894;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,104:247:99:2601,0,4142
20	10030188	.	T	A	1672.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.575;DP=106;Dels=0.00;FS=3.713;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.373;VQSLOD=5.6348;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,61:106:99:1702,0,1175
20	10030452	.	G	A	1052.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=92;Dels=0.00;FS=1.757;HRun=1;HaplotypeScore=1.8533;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.806;VQSLOD=6.7347;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,39:92:99:1082,0,1384
20	10386013	.	C	A	1221.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.000;DP=123;Dels=0.00;FS=0.745;HRun=0;HaplotypeScore=2.8867;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.345;VQSLOD=6.5202;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,53:123:99:1252,0,2043
20	10386059	.	G	A	1611.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.146;DP=160;Dels=0.00;FS=2.877;HRun=0;HaplotypeScore=3.5204;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.774;VQSLOD=5.6489;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,64:160:99:1642,0,2462
20	13053018	.	T	G	4143.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.276;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=7.895;HRun=0;HaplotypeScore=4.9066;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.245;VQSLOD=4.4808;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,133:248:99:3565,0,2899
20	13140720	.	G	A	1788.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=176;Dels=0.00;FS=4.526;HRun=0;HaplotypeScore=2.3001;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.280;VQSLOD=5.1622;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,73:176:99:1818,0,2614
20	13747441	.	A	G	3133.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=32.65;ReadPosRankSum=1.588;VQSLOD=8.6884;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,95:96:99:3167,219,0
20	13912309	.	G	A	879.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.82;VQSLOD=13.2700;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:75.22:912,75,0
20	15967390	.	C	T	371.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.083;DP=35;Dels=0.00;FS=1.301;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.017;VQSLOD=4.2069;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:401,0,510
20	16359567	.	A	G	1989.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=185;Dels=0.00;FS=5.231;HRun=0;HaplotypeScore=5.5868;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.376;VQSLOD=4.6505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,85:185:99:2020,0,2864
20	17600357	.	G	A	823.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.043;DP=73;Dels=0.00;FS=4.832;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.164;VQSLOD=5.6820;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,32:73:99:853,0,1014
20	17605240	.	A	T	606.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.56;MQ0=0;QD=30.33;VQSLOD=6.9324;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:54.16:640,54,0
20	17705677	.	A	G	7236.92	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.95;VQSLOD=8.8814;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7235,605,0
20	17956347	.	C	T	1283.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.516;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.059;VQSLOD=3.8322;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,52:92:99:1314,0,1036
20	18143117	.	T	G	1892.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.95;MQ0=0;QD=32.63;VQSLOD=8.8517;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1926,150,0
20	18296072	.	T	A	5513.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3075;MQ=59.80;MQ0=0;QD=29.80;VQSLOD=6.2884;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,185:185:99:5512,454,0
20	18297336	.	G	A	1709.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=143;Dels=0.00;FS=8.064;HRun=0;HaplotypeScore=8.9460;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.777;VQSLOD=2.3877;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,71:143:99:1739,0,1760
20	18395988	.	C	T	919.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.151;DP=81;Dels=0.00;FS=3.049;HRun=0;HaplotypeScore=1.9765;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.052;VQSLOD=6.2677;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,36:81:99:949,0,1137
20	18513372	.	C	T	1312.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.786;DP=109;Dels=0.00;FS=1.701;HRun=0;HaplotypeScore=8.7378;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.597;VQSLOD=4.2276;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,50:109:99:1342,0,1294
20	19261623	.	G	A	887.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.915;DP=72;Dels=0.00;FS=3.562;HRun=0;HaplotypeScore=2.5275;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.176;VQSLOD=5.1962;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,32:72:99:918,0,1045
20	19654276	.	C	G	1892.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=146;Dels=0.00;FS=3.979;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.583;VQSLOD=4.7781;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,73:146:99:1922,0,1770
20	20032998	.	T	C	2704.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8928;MQ=59.73;MQ0=0;QD=31.81;VQSLOD=9.3982;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2737,217,0
20	20033137	.	T	A	3965.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8660;MQ=59.02;MQ0=0;QD=31.47;VQSLOD=8.7811;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:3965,316,0
20	20033319	.	A	G	1643.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.4533;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61;VQSLOD=8.7478;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1677,135,0
20	20033367	.	C	G	1236.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;QD=31.70;VQSLOD=8.5200;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1269,102,0
20	20079360	.	A	G	6643.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7232;MQ=57.07;MQ0=0;QD=28.76;VQSLOD=5.7320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,231:231:99:6642,548,0
20	20144772	.	G	A	4478.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=59.56;MQ0=0;QD=32.45;VQSLOD=8.9601;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4478,364,0
20	21142523	.	C	G	856.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=87;Dels=0.00;FS=1.963;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.228;VQSLOD=6.1774;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,37:87:99:886,0,1177
20	21142813	.	T	C	2905.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7910;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.308;VQSLOD=6.3360;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,109:202:99:2935,0,2437
20	21186161	.	A	AG	779.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=41.5802;MQ=61.13;MQ0=0;QD=41.02;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57.19:821,57,0
20	21494184	.	C	T	748.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=60;Dels=0.00;FS=6.483;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.860;VQSLOD=4.2911;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,28:60:99:779,0,892
20	23028724	.	G	A	465.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.272;DP=37;Dels=0.00;FS=8.806;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.752;VQSLOD=4.4989;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,20:37:99:496,0,432
20	23065209	.	G	A	1201.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=80;Dels=0.00;FS=3.005;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.789;VQSLOD=6.2949;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,41:80:99:1231,0,1170
20	23375624	.	T	C	1242.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.607;DP=112;Dels=0.00;FS=2.700;HRun=0;HaplotypeScore=3.3212;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.191;VQSLOD=5.3786;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,48:112:99:1273,0,1706
20	23586360	.	G	A	4237.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=10.520;HRun=1;HaplotypeScore=3.9544;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.758;VQSLOD=4.0052;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3566,0,3582
20	23731494	.	A	G	1235.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.26;MQ0=0;QD=35.30;VQSLOD=9.3864;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1268,99,0
20	24964558	.	T	C	2296.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.426;DP=194;Dels=0.00;FS=4.197;HRun=0;HaplotypeScore=6.6779;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.059;VQSLOD=4.8098;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,87:194:99:2326,0,2544
20	25059442	.	C	T	2770.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.704;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5659;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.773;VQSLOD=5.8771;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,108:231:99:2800,0,2981
20	25187213	.	G	A	1088.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.753;DP=99;Dels=0.00;FS=3.714;HRun=1;HaplotypeScore=1.9853;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.596;VQSLOD=5.9018;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,46:99:99:1118,0,1291
20	25195509	.	A	G	4013.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3108;MQ=59.12;MQ0=0;QD=30.40;VQSLOD=7.9320;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:4013,307,0
20	25398790	.	G	A	2851.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.074;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=8.523;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.145;VQSLOD=4.6652;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,114:229:99:2881,0,2892
20	25434139	.	C	T	908.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.791;DP=99;Dels=0.00;FS=0.777;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.312;VQSLOD=6.5226;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,39:99:99:938,0,1534
20	30064331	.	A	G	1308.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.037;DP=131;Dels=0.00;FS=4.612;HRun=0;HaplotypeScore=4.6002;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.068;VQSLOD=4.8180;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,52:131:99:1339,0,2007
20	30818850	.	C	T	2241.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.042;DP=153;Dels=0.00;FS=5.186;HRun=1;HaplotypeScore=2.5073;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.966;VQSLOD=5.2452;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,85:153:99:2272,0,1853
20	31022959	.	T	C	7225.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8154;MQ=59.69;MQ0=0;QD=34.74;VQSLOD=9.5479;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:208:99:7225,590,0
20	31607551	.	G	C	376.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.884;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.200;VQSLOD=6.5559;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:407,0,713
20	31619500	.	C	T	603.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.938;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.869;VQSLOD=6.6560;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,27:45:99:634,0,440
20	31622083	.	G	A	7032.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=32.11;VQSLOD=9.8119;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:219:99:7031,572,0
20	31627291	.	A	G	2153.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.785;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.5633;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.887;VQSLOD=5.1129;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,85:179:99:2184,0,2504
20	31652292	.	G	A	1190.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.647;DP=104;Dels=0.00;FS=1.650;HRun=0;HaplotypeScore=5.2146;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.120;VQSLOD=4.7961;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,49:104:99:1221,0,1331
20	31652596	.	C	T	1524.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.649;DP=132;Dels=0.00;FS=1.449;HRun=0;HaplotypeScore=2.8395;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.641;VQSLOD=6.2583;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,57:132:99:1555,0,1872
20	31656632	.	C	G	1098.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.334;DP=101;Dels=0.00;FS=2.899;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.097;VQSLOD=6.3802;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,44:101:99:1128,0,1644
20	31660543	.	C	T	999.84	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;DP=93;Dels=0.00;FS=5.354;HRun=2;HaplotypeScore=7.7159;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.702;VQSLOD=4.0224;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,40:93:99:1030,0,1345
20	31671619	.	G	T	544.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;DP=66;Dels=0.00;FS=3.469;HRun=0;HaplotypeScore=3.5088;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.996;VQSLOD=3.7635;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,25:66:99:575,0,1127
20	31673846	.	A	G	2352.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=215;DS;Dels=0.00;FS=6.088;HRun=0;HaplotypeScore=5.2903;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.075;VQSLOD=4.6463;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,91:215:99:2383,0,3361
20	31676804	.	A	C	2490.82	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.279;DP=238;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.022;VQSLOD=6.8447;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,98:238:99:2521,0,3515
20	31688241	.	T	C	2166.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.178;DP=203;Dels=0.00;FS=1.745;HRun=0;HaplotypeScore=6.7887;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.282;VQSLOD=4.4865;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:113,88:203:99:2197,0,3009
20	31688260	.	C	T	2361.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.853;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7396;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.316;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.197;VQSLOD=3.6704;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,97:203:99:2391,0,3001
20	31812923	.	G	A	2216	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.886;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4552;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.815;VQSLOD=6.3787;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,84:175:99:2246,0,2217
20	31897554	.	G	C	1022.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;DP=86;Dels=0.00;FS=0.816;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.171;VQSLOD=6.0436;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,42:86:99:1052,0,1075
20	32295541	.	C	T	2522.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;DP=158;Dels=0.00;FS=3.998;HRun=0;HaplotypeScore=5.5661;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.136;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.464;VQSLOD=3.1855;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,91:158:99:2553,0,1604
20	33583331	.	A	G	2180.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.7406;MQ=58.20;MQ0=0;QD=32.07;VQSLOD=8.0664;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2214,181,0
20	33872215	.	C	A	3180.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.011;HRun=1;HaplotypeScore=9.0385;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=4.3459;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,122:250:99:3210,0,3647
20	33874720	.	C	T	1632.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.233;DP=103;Dels=0.00;FS=3.798;HRun=0;HaplotypeScore=5.3450;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.781;VQSLOD=4.7043;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,55:103:99:1662,0,1111
20	33971914	.	C	T	761.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.344;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6040;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.722;VQSLOD=5.7168;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,32:80:99:791,0,1173
20	34022387	.	A	C	360.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.674;DP=33;Dels=0.00;FS=1.508;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.111;VQSLOD=5.8009;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:390,0,532
20	35509130	.	T	G	1822.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=142;Dels=0.00;FS=0.628;HRun=0;HaplotypeScore=3.7415;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.379;VQSLOD=6.0379;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,79:142:99:1853,0,1643
20	35731181	.	G	C	4170.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.164;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.9875;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.447;VQSLOD=3.2941;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,123:250:99:3522,0,3400
20	35749423	.	T	C	384.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.835;DP=40;Dels=0.00;FS=7.525;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.525;VQSLOD=4.3226;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,14:40:99:415,0,647
20	35769592	.	T	C	451.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.178;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.190;VQSLOD=6.1027;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:481,0,495
20	36841914	.	G	A	405.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.469;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.294;VQSLOD=10.8905;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:435,0,347
20	36842049	.	G	A	470.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.215;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.110;VQSLOD=10.5945;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:500,0,329
20	36845738	.	C	T	267.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;DP=26;Dels=0.00;FS=1.718;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.439;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.311;VQSLOD=3.4570;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:297,0,417
20	36869516	.	C	A	4154.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.146;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=4.298;HRun=0;HaplotypeScore=2.8857;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.347;VQSLOD=5.0933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,126:249:99:3498,0,3413
20	36946848	.	G	A	3851.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.873;DP=228;DS;Dels=0.00;FS=6.723;HRun=1;HaplotypeScore=3.6604;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=16.89;ReadPosRankSum=-2.156;VQSLOD=3.3861;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,126:228:99:3288,0,2734
20	36952342	.	C	T	1304.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.646;DP=117;Dels=0.00;FS=0.709;HRun=0;HaplotypeScore=3.8817;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.840;VQSLOD=6.2547;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,51:117:99:1335,0,1719
20	36974945	.	C	T	1314.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.243;DP=95;Dels=0.00;FS=10.414;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.481;VQSLOD=4.1002;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,51:95:99:1345,0,1142
20	39797465	.	T	C	1196.13	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.365;DP=80;Dels=0.00;FS=5.878;HRun=1;HaplotypeScore=1.8410;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.184;VQSLOD=5.3207;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,45:80:99:1226,0,903
20	40045902	.	C	T	2307.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=145;Dels=0.00;FS=1.384;HRun=1;HaplotypeScore=2.3696;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.399;VQSLOD=4.1349;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,89:145:99:2338,0,1403
20	41420095	.	T	C	317.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=22;Dels=0.00;FS=2.199;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.668;VQSLOD=6.0891;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:347,0,206
20	42826350	.	A	C	1149.14	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.706;DP=78;Dels=0.00;FS=3.697;HRun=1;HaplotypeScore=5.6819;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.494;VQSLOD=5.0373;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,41:78:99:1179,0,882
20	43378770	.	A	G	403.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=44;Dels=0.00;FS=5.103;HRun=1;HaplotypeScore=2.4258;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.313;VQSLOD=4.8689;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,17:44:99:434,0,676
20	43379264	.	A	C	188.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.636;DP=30;Dels=0.00;FS=2.764;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.432;VQSLOD=4.2318;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:218,0,520
20	43723573	.	C	T	2523.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.832;DP=195;Dels=0.00;FS=7.356;HRun=0;HaplotypeScore=7.4651;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.290;VQSLOD=2.8688;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,95:195:99:2554,0,2633
20	43723627	.	T	C	7840.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7771;MQ=59.53;MQ0=0;QD=31.36;VQSLOD=8.6024;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7839,635,0
20	43926573	.	C	T	997.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=87;Dels=0.00;FS=5.510;HRun=1;HaplotypeScore=2.2633;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.759;VQSLOD=4.9076;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,40:87:99:1027,0,1236
20	43933021	.	G	T	380.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;DP=33;Dels=0.00;FS=1.945;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.199;VQSLOD=6.2954;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:410,0,550
20	43976991	.	A	G	304.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=49.50;MQ0=0;QD=25.38;VQSLOD=7.0360;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:27.08:338,27,0
20	44184375	.	T	C	3711.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.22;MQ0=0;QD=32.28;VQSLOD=9.7717;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:115:99:3667,283,0
20	44417675	.	G	C	6068.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4106;MQ=58.99;MQ0=0;QD=29.60;VQSLOD=6.1599;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,205:205:99:6067,505,0
20	44469290	.	G	A	2854.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=237;Dels=0.00;FS=5.423;HRun=0;HaplotypeScore=7.6353;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.202;VQSLOD=4.3774;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,116:237:99:2884,0,2723
20	44505973	.	T	C	2018.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.122;DP=148;Dels=0.00;FS=4.164;HRun=1;HaplotypeScore=2.9391;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.105;VQSLOD=6.0998;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,78:148:99:2049,0,1826
20	44596207	.	C	G	3826.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8455;MQ=59.51;MQ0=0;QD=31.11;VQSLOD=8.0222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:3826,301,0
20	44642406	.	G	C	518.81	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;VQSLOD=13.3553;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:42.13:552,42,0
20	45315769	.	T	C	3107.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.341;DP=242;Dels=0.00;FS=3.639;HRun=0;HaplotypeScore=6.4369;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.555;VQSLOD=4.8771;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,119:242:99:3137,0,3095
20	47253150	.	T	C	788.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.49;MQ0=0;QD=29.21;VQSLOD=7.7285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.18:822,72,0
20	47865509	.	G	A	2391.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.749;DP=194;Dels=0.00;FS=0.536;HRun=0;HaplotypeScore=9.0123;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.380;VQSLOD=4.3575;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,97:194:99:2422,0,2725
20	47872377	.	C	G	1402.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=134;Dels=0.00;FS=0.682;HRun=1;HaplotypeScore=3.3618;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.612;VQSLOD=5.5012;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,54:134:99:1432,0,2133
20	47989527	.	C	T	366.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=32;Dels=0.00;FS=4.959;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.076;VQSLOD=5.8735;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:397,0,525
20	47990250	.	G	C	637.47	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;DP=56;Dels=0.00;FS=3.715;HRun=0;HaplotypeScore=2.9114;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.414;VQSLOD=5.3018;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,25:56:99:667,0,866
20	49214156	.	A	G	36.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.179;DP=21;Dels=0.00;FS=2.754;HRun=3;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.454;VQSLOD=2.3616;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:66.21:66,0,427
20	51870336	.	G	C	1422.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.925;DP=97;Dels=0.00;FS=7.051;HRun=1;HaplotypeScore=1.4538;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=14.67;ReadPosRankSum=2.283;VQSLOD=3.7933;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,51:97:99:1453,0,1289
20	52573971	.	T	G	948.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.703;DP=75;Dels=0.00;FS=1.057;HRun=0;HaplotypeScore=4.8865;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.182;VQSLOD=3.5873;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,39:75:99:979,0,958
20	52612549	.	C	T	878.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.499;VQSLOD=6.4164;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:77:99:908,0,1143
20	54961463	.	T	C	6123.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.8209;MQ=58.13;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=4.7512;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6121,523,0
20	55088404	.	A	G	224.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=32;Dels=0.00;FS=1.708;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.952;VQSLOD=3.4748;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,11:32:99:254,0,506
20	55108617	.	C	A	5827.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.7471;MQ=47.62;MQ0=16;MQRankSum=0.944;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.708;VQSLOD=3.0687;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:14,198:212:99:5782,428,0
20	56098733	.	T	C	4793.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3856;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=32.17;ReadPosRankSum=0.726;VQSLOD=8.5747;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,148:149:99:4793,370,0
20	56099114	.	C	G	8706.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.4476;MQ=59.48;MQ0=0;QD=34.83;VQSLOD=8.9888;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8706,674,0
20	56137895	.	G	C	2693.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2952;MQ=59.74;MQ0=0;QD=30.26;VQSLOD=7.2825;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:2726,211,0
20	56138621	.	A	G	486.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.386;DP=44;Dels=0.00;FS=1.400;HRun=1;HaplotypeScore=1.6120;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.769;VQSLOD=6.2619;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,21:44:99:516,0,615
20	56186884	.	T	C	860.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75;VQSLOD=13.1583;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:69.21:893,69,0
20	57290347	.	C	G	824.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44;VQSLOD=8.3047;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:69.19:857,69,0
20	57829301	.	T	C	1105.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.296;DP=58;Dels=0.00;FS=7.664;HRun=1;HaplotypeScore=2.6147;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.120;VQSLOD=3.9694;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,36:58:99:1136,0,596
20	60503350	.	A	G	8165.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7666;MQ=59.30;MQ0=0;QD=32.66;VQSLOD=9.4788;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:8165,635,0
20	60768615	.	G	A	542.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.108;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8607;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.635;VQSLOD=5.7145;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,20:47:99:572,0,809
20	60887581	.	G	A	1210.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;QD=31.04;VQSLOD=8.4161;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1243,102,0
20	60897104	.	C	T	829.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;DP=69;Dels=0.00;FS=1.162;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.012;VQSLOD=5.0869;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,34:69:99:859,0,1032
20	60899206	.	C	T	1466.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=13.7330;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1499,120,0
20	60900481	.	A	G	892.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=33.06;VQSLOD=9.9842;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:75.22:926,75,0
20	60904853	.	T	C	954.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=58.09;MQ0=0;QD=29.84;VQSLOD=8.4328;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:87.21:988,87,0
20	60908969	.	T	C	1092.16	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5257;MQ=57.72;MQ0=0;QD=29.52;VQSLOD=6.1190;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:93.23:1125,93,0
20	60921643	.	T	C	525.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=30.92;ReadPosRankSum=-1.531;VQSLOD=13.1967;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:26.45:559,26,0
20	60966318	.	G	T	4691.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8653;MQ=59.54;MQ0=0;QD=36.08;VQSLOD=9.3613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:4691,367,0
20	60987737	.	C	T	2045.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;DP=137;Dels=0.00;FS=3.148;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.236;VQSLOD=5.8947;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,73:137:99:2076,0,1760
20	60989185	.	C	T	86.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.674;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.429;VQSLOD=5.2422;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:116,0,279
20	61288038	.	G	A	319.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.097;VQSLOD=5.7563;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:350,0,559
20	61491494	.	T	C	2779.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.107;DP=209;Dels=0.00;FS=1.717;HRun=0;HaplotypeScore=2.8605;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.676;VQSLOD=5.5630;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,108:209:99:2809,0,2404
20	61512606	.	T	C	1538.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5741;MQ=59.07;MQ0=0;QD=34.19;VQSLOD=9.0471;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1572,129,0
20	61528271	.	C	T	669.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=53;Dels=0.00;FS=1.067;HRun=0;HaplotypeScore=1.9903;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.934;VQSLOD=6.0074;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,26:53:99:699,0,787
20	61528306	.	A	G	586.97	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.677;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7855;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.173;VQSLOD=5.6469;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,25:54:99:617,0,720
20	61594679	.	A	G	1661.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;QD=29.66;VQSLOD=8.1670;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1694,129,0
20	61598731	.	C	T	4126.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.870;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=0.998;HRun=0;HaplotypeScore=11.6984;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.809;VQSLOD=3.1269;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,135:245:99:3518,0,2784
20	61870727	.	G	C	1027.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=56;Dels=0.00;FS=4.243;HRun=2;HaplotypeScore=2.2337;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.125;VQSLOD=4.3288;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,33:56:99:1058,0,527
20	61880169	.	T	G	752.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.120;DP=58;Dels=0.00;FS=1.124;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.889;VQSLOD=6.0255;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,31:58:99:782,0,735
20	62038277	.	T	G	518.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80;VQSLOD=12.9420;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:48.11:551,48,0
20	62196253	.	C	A	1595.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.51;VQSLOD=8.2418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:1629,132,0
20	62196807	.	T	C	1297.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=30.18;VQSLOD=8.0098;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1331,111,0
20	62198348	.	C	T	4726.30	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.45;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=9.3364;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,151:151:99:4726,385,0
20	62340115	.	C	G	3100.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.2633;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.98;VQSLOD=8.9824;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:3133,250,0
20	62373707	.	G	T	274.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6208;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.395;VQSLOD=4.8066;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:304,0,461
20	62378405	.	C	T	506.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.822;DP=62;Dels=0.00;FS=1.053;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.816;VQSLOD=4.1789;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,23:62:99:537,0,1016
20	62737568	.	T	C	992.99	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;DP=71;Dels=0.00;FS=6.456;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.020;VQSLOD=5.4819;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,38:71:99:1023,0,859
21	10920098	.	T	C	3744.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.68;MQ0=0;QD=31.73;VQSLOD=8.5406;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3744,292,0
21	10942923	.	G	A	854.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.569;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5065;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.108;VQSLOD=3.8780;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,38:130:99:885,0,2402
21	15481365	.	G	T	1735.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=146;Dels=0.00;FS=3.963;HRun=1;HaplotypeScore=1.9662;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.325;VQSLOD=5.9260;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,71:146:99:1766,0,1732
21	15516948	.	C	T	997.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=69;Dels=0.00;FS=2.860;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.760;VQSLOD=5.5649;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,36:69:99:1028,0,1004
21	15516976	.	T	A	3017.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.73;MQ0=0;QD=28.47;VQSLOD=7.2378;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3050,238,0
21	15524921	.	C	T	671.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;DP=42;Dels=0.00;FS=2.913;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.181;VQSLOD=5.5220;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,27:42:99:702,0,322
21	15596772	.	T	G	435.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;QD=31.10;VQSLOD=9.3636;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.11:468,36,0
21	15873026	.	T	C	1772.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.728;DP=163;Dels=0.00;FS=6.847;HRun=0;HaplotypeScore=2.1790;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.005;VQSLOD=4.3456;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,74:163:99:1802,0,2333
21	16339172	.	G	C	1748.26	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.984;DP=126;Dels=0.00;FS=3.457;HRun=1;HaplotypeScore=1.9290;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.541;VQSLOD=5.0260;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,65:126:99:1778,0,1559
21	19169155	.	G	C	4541.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9601;MQ=59.10;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=9.2265;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:4541,346,0
21	19670118	.	G	A	822.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.271;DP=75;Dels=0.00;FS=3.299;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.569;VQSLOD=4.7290;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,34:75:99:852,0,1106
21	19756040	.	C	G	526.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.436;DP=39;Dels=0.00;FS=1.302;HRun=0;HaplotypeScore=5.4774;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.239;VQSLOD=4.4739;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:556,0,556
21	22746187	.	T	C	737.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;DP=73;Dels=0.00;FS=6.902;HRun=2;HaplotypeScore=1.5253;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.461;VQSLOD=4.3134;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,32:73:99:768,0,1033
21	26978950	.	A	G	1594.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=58.19;MQ0=0;QD=27.98;VQSLOD=7.6912;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1628,123,0
21	28216595	.	C	G	354.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;DP=33;Dels=0.00;FS=3.436;HRun=1;HaplotypeScore=1.8499;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.133;VQSLOD=5.2829;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:384,0,540
21	28302355	.	A	G	3075.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.700;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.492;HRun=1;HaplotypeScore=3.7835;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.610;VQSLOD=6.2594;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,115:249:99:3105,0,3849
21	30250555	.	T	C	2628.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.80;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=8.8980;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2662,208,0
21	30250615	.	T	C	3929.90	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=58.55;MQ0=0;QD=30.46;VQSLOD=8.1090;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:3929,298,0
21	30257568	.	T	C	6524.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=9.8228;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:6524,518,0
21	30339120	.	C	A	508.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=56;Dels=0.00;FS=1.118;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.932;VQSLOD=5.2400;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,23:56:99:538,0,852
21	30339234	.	T	C	820.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=71;Dels=0.00;FS=7.355;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.150;VQSLOD=4.7657;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,28:71:99:850,0,1229
21	30341891	.	A	G	894.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.914;DP=74;Dels=0.00;FS=2.385;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.446;VQSLOD=6.2815;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,33:74:99:924,0,1181
21	31538692	.	C	T	1733.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.519;DP=147;Dels=0.00;FS=1.313;HRun=0;HaplotypeScore=3.2867;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.706;VQSLOD=5.9707;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,70:147:99:1763,0,2200
21	31587793	.	A	G	1132.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.435;DP=83;Dels=0.00;FS=4.154;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=6.1181;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,40:83:99:1162,0,1260
21	31709691	.	G	A	2976.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.699;DP=214;DS;Dels=0.00;FS=5.822;HRun=0;HaplotypeScore=5.7586;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.866;VQSLOD=3.9337;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,116:214:99:3006,0,2489
21	31744127	.	A	T	1918.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.142;DP=129;Dels=0.00;FS=1.412;HRun=0;HaplotypeScore=3.2363;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.912;VQSLOD=5.0984;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,68:129:99:1949,0,1578
21	31744310	.	G	C	1690.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.554;DP=122;Dels=0.00;FS=0.700;HRun=1;HaplotypeScore=5.4034;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.174;VQSLOD=3.7864;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,65:122:99:1721,0,1559
21	31802768	.	G	A	1856.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;DP=141;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=0;HaplotypeScore=7.8757;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.374;VQSLOD=4.2611;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,75:141:99:1886,0,1762
21	31812772	.	C	A	1170.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.966;DP=97;Dels=0.00;FS=5.132;HRun=2;HaplotypeScore=3.2580;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.033;VQSLOD=5.2159;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,43:97:99:1200,0,1567
21	31913981	.	AG	A	3418.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=12.243;DP=247;DS;FS=3.341;HRun=1;HaplotypeScore=862.6989;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.407;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,101:247:99:3419,0,6064
21	31973516	.	T	A	7851.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5702;MQ=58.07;MQ0=0;QD=31.41;VQSLOD=8.0218;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:7823,632,0
21	31973525	.	A	G	3024.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.093;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3567;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.472;VQSLOD=4.9320;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,114:248:99:3055,0,3362
21	32253629	.	C	T	3839.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.06;MQ0=0;QD=32.54;VQSLOD=9.3320;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3839,301,0
21	33951068	.	T	C	7033.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6279;MQ=59.60;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=8.6149;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,229:229:99:7032,590,0
21	34059352	.	T	C	1553.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=119;Dels=0.00;FS=2.383;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.633;VQSLOD=6.5452;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,65:119:99:1584,0,1333
21	34166190	.	A	T	3739.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.23;VQSLOD=9.1224;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,116:116:99:3739,301,0
21	34860749	.	CAATTA	C	1744.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=93;FS=3.353;HRun=0;HaplotypeScore=480.0224;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-5.308;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.075;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,36:93:99:1783,0,2824
21	34883618	.	T	C	3004.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.796;DP=239;DS;Dels=0.00;FS=4.436;HRun=3;HaplotypeScore=10.5023;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.693;VQSLOD=3.6737;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,106:239:99:3035,0,3582
21	34897113	.	C	T	2025.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=148;Dels=0.00;FS=2.117;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.949;VQSLOD=5.7185;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,79:148:99:2056,0,1605
21	34925142	.	C	T	7917.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7445;MQ=59.55;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=8.8039;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7917,629,0
21	34926260	.	C	T	1345.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;DP=129;Dels=0.00;FS=3.256;HRun=0;HaplotypeScore=3.3109;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.558;VQSLOD=6.0136;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,54:129:99:1375,0,1924
21	34948684	.	G	GA	2789.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=391.1160;MQ=34.14;MQ0=0;QD=36.70;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:18,58:67:99:2831,193,0
21	34948696	.	GA	G	2286.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=349.7398;MQ=33.27;MQ0=0;QD=34.64;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,56:58:99:2329,175,0
21	35467645	.	A	G	3870.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2455;MQ=59.31;MQ0=0;QD=31.99;VQSLOD=8.4954;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3870,295,0
21	35469193	.	C	A	4679.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=4.9015;MQ=59.11;MQ0=0;QD=31.62;VQSLOD=7.9915;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,148:148:99:4679,367,0
21	37518706	.	G	A	4494.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.317;DP=142;Dels=0.00;FS=3.475;HRun=0;HaplotypeScore=5.5315;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.390;VQSLOD=3.9822;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,141:142:99:4463,339,0
21	37617630	.	T	G	4271.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.1342;MQ=59.28;MQ0=0;QD=29.46;VQSLOD=6.5913;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:4271,343,0
21	38444863	.	C	T	6695.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7408;MQ=59.04;MQ0=0;QD=30.57;VQSLOD=8.5858;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,218:219:99:6694,551,0
21	38444881	.	G	A	5476.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.92;MQ0=0;QD=29.93;VQSLOD=8.4719;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:5475,466,0
21	38525356	.	T	C	2152.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=59.45;MQ0=0;QD=28.33;VQSLOD=7.6023;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:2186,172,0
21	38568009	.	G	C	8848.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=6.6575;MQ=59.05;MQ0=0;QD=35.40;VQSLOD=6.5681;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:250:99:8810,686,0
21	39671476	.	G	A	2865.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.706;DP=206;Dels=0.00;FS=0.521;HRun=0;HaplotypeScore=3.7971;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.394;VQSLOD=6.2633;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,112:206:99:2896,0,2447
21	40571246	.	A	G	4178.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.350;DP=128;Dels=0.00;FS=4.226;HRun=1;HaplotypeScore=7.4097;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=32.64;ReadPosRankSum=-0.014;VQSLOD=3.6076;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,126:128:99:4143,287,0
21	40720494	.	C	T	336.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.635;VQSLOD=5.2226;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:366,0,359
21	40800371	.	C	T	2786.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=29.33;VQSLOD=8.7198;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:2820,214,0
21	40823902	.	C	G	3198.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5449;MQ=59.75;MQ0=0;QD=34.76;VQSLOD=9.3769;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3231,259,0
21	40871810	.	T	C	1828.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=157;Dels=0.00;FS=2.014;HRun=0;HaplotypeScore=2.5395;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=3.089;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.162;VQSLOD=4.1403;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,82:157:99:1859,0,1947
21	41032740	.	T	C	768.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.148;VQSLOD=6.1326;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,31:68:99:798,0,1018
21	41137507	.	G	C	2485.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.70;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=9.0519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2518,193,0
21	41455898	.	T	C	1019.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.626;DP=102;Dels=0.00;FS=2.669;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.277;VQSLOD=4.4078;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,44:102:99:1049,0,1328
21	42817930	.	G	A	3602.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.9874;MQ=58.58;MQ0=0;QD=29.77;VQSLOD=8.8212;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:3602,274,0
21	43161252	.	G	A	2443.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=168;Dels=0.00;FS=5.694;HRun=0;HaplotypeScore=5.5961;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.431;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.602;VQSLOD=3.3254;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,94:168:99:2474,0,1914
21	43161357	.	T	C	4085.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.1357;MQ=59.82;MQ0=0;QD=31.92;VQSLOD=8.9454;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:4085,349,0
21	43221483	.	A	G	3657.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=3.3269;MQ=59.77;MQ0=0;QD=36.95;VQSLOD=8.1203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:3657,292,0
21	43413553	.	T	G	1765.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.453;DP=125;Dels=0.00;FS=3.629;HRun=0;HaplotypeScore=1.9565;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.428;VQSLOD=6.5001;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,66:125:99:1796,0,1723
21	43413651	.	T	C	3986.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.965;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=2.827;HRun=0;HaplotypeScore=5.2255;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.530;VQSLOD=5.0171;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,124:250:99:3383,0,3195
21	43531008	.	T	C	71.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.468;VQSLOD=4.7751;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:102,0,222
21	43531403	.	C	G	174.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.337;VQSLOD=5.2457;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:204,0,278
21	43531553	.	A	C	1447.73	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.442;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.810;VQSLOD=6.4068;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,56:102:99:1478,0,1204
21	43531632	.	T	C	1221.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.7317;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.701;VQSLOD=4.7058;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,45:96:99:1252,0,1318
21	43531808	.	A	C	935.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=83;Dels=0.00;FS=19.028;HRun=5;HaplotypeScore=1.6671;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.395;VQSLOD=3.2613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,42:83:99:965,0,854
21	43857602	.	C	G	667.60	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.449;DP=64;Dels=0.00;FS=6.220;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.148;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.173;VQSLOD=4.5152;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,25:64:99:698,0,1045
21	43896143	.	C	T	1123.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.210;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8055;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.715;VQSLOD=6.3435;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,44:83:99:1154,0,1003
21	43985955	.	G	A	1401.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=143;Dels=0.00;FS=4.017;HRun=0;HaplotypeScore=4.1441;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.010;VQSLOD=5.4434;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,59:143:99:1431,0,2139
21	44293744	.	C	G	2427.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;DP=182;DS;Dels=0.00;FS=3.664;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.477;VQSLOD=5.6552;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,88:182:99:2457,0,2641
21	44323720	.	C	T	1463.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.187;DP=126;Dels=0.00;FS=2.315;HRun=0;HaplotypeScore=4.1778;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.642;VQSLOD=5.4517;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,53:126:99:1493,0,1910
21	44324365	.	G	A	287.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.356;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.958;VQSLOD=6.6056;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:317,0,434
21	44837555	.	G	A	227.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9399;MQ=57.87;MQ0=0;QD=20.68;VQSLOD=2.9506;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:11:24.05:260,24,0
21	44846016	.	C	T	310.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;DP=18;Dels=0.00;FS=2.112;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.690;VQSLOD=5.6188;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:341,0,111
21	45107562	.	T	C	1040.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7987;MQ=58.71;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=8.1162;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:36:90.20:1074,90,0
21	45217936	.	C	T	962.92	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.903;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.606;VQSLOD=5.2037;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,33:57:99:993,0,573
21	45220483	.	A	G	1128.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=93;Dels=0.00;FS=1.877;HRun=0;HaplotypeScore=2.5730;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.843;VQSLOD=6.5133;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,44:93:99:1158,0,1195
21	45391272	.	C	T	3129.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-10.804;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.507;HRun=0;HaplotypeScore=4.1274;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.238;VQSLOD=5.4852;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,125:250:99:3159,0,3519
21	45503121	.	G	A	1973.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.570;DP=170;Dels=0.00;FS=1.969;HRun=0;HaplotypeScore=3.8539;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.176;VQSLOD=5.7410;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,75:170:99:2004,0,2267
21	45528919	.	G	A	612.88	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.861;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.770;VQSLOD=5.9003;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,29:76:99:643,0,1183
21	45553596	.	T	C	209.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=18;Dels=0.00;FS=11.830;HRun=2;HaplotypeScore=0.9867;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.377;VQSLOD=4.1689;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:239,0,212
21	45709906	.	C	G	212.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=13;Dels=0.00;FS=6.892;HRun=1;HaplotypeScore=1.6006;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.294;VQSLOD=3.9729;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:80.75:243,0,81
21	45725746	.	C	T	367.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.564;DP=43;Dels=0.00;FS=5.002;HRun=0;HaplotypeScore=2.6822;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.143;VQSLOD=4.8962;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,14:43:99:397,0,761
21	45733867	.	A	T	184.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;DP=19;Dels=0.00;FS=1.957;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.265;VQSLOD=5.6154;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:19:99:215,0,220
21	45750145	.	T	C	262.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=28;Dels=0.00;FS=1.657;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.415;VQSLOD=5.5250;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:292,0,465
21	45844751	.	A	G	350.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.28;MQ0=0;QD=25.01;VQSLOD=7.9456;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:33.07:383,33,0
21	45978499	.	T	G	2991.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.3302;MQ=49.52;MQ0=1;QD=29.62;VQSLOD=3.1935;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,100:101:99:3024,238,0
21	46011468	.	G	A	7537.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6617;MQ=52.90;MQ0=4;QD=30.15;VQSLOD=3.3365;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,247:250:99:7536,650,0
21	46032094	.	A	G	6856.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.5998;MQ=59.68;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=8.4254;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:221:99:6855,572,0
21	46047633	.	A	G	4501.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.222;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.539;HRun=0;HaplotypeScore=4.4217;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.557;VQSLOD=4.0790;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,124:250:99:3769,0,3501
21	46057548	.	A	C	4217.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.497;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.156;HRun=4;HaplotypeScore=3.6090;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.146;VQSLOD=4.1065;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,125:249:99:3554,0,3318
21	46057711	.	G	C	3070.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.586;HRun=1;HaplotypeScore=8.6462;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.260;VQSLOD=2.3190;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,110:249:99:3101,0,4298
21	46057720	.	A	C	2932.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.572;HRun=1;HaplotypeScore=4.0213;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.353;VQSLOD=4.4495;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,110:250:99:2963,0,4295
21	46057806	.	G	A	2995.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=11.462;HRun=0;HaplotypeScore=3.8090;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.660;VQSLOD=3.9902;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,112:250:99:3025,0,4219
21	46067180	.	C	T	2139.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.816;DP=185;Dels=0.00;FS=1.323;HRun=0;HaplotypeScore=1.8245;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.516;VQSLOD=5.0318;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,84:185:99:2169,0,2586
21	46077946	.	A	G	2295.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.117;DP=206;Dels=0.00;FS=1.810;HRun=0;HaplotypeScore=6.4120;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.207;VQSLOD=4.1058;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,95:206:99:2325,0,3159
21	46086407	.	C	T	1591.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.033;DP=125;Dels=0.00;FS=8.506;HRun=0;HaplotypeScore=5.0686;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.758;VQSLOD=3.1774;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,64:125:99:1621,0,1570
21	46086457	.	G	A	1613.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.766;DP=136;Dels=0.00;FS=4.363;HRun=0;HaplotypeScore=4.4645;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.083;VQSLOD=4.9607;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,67:136:99:1644,0,1733
21	46086757	.	G	A	761.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;DP=66;Dels=0.00;FS=1.233;HRun=0;HaplotypeScore=3.7467;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.652;VQSLOD=4.5932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,30:66:99:791,0,981
21	46086758	.	C	T	815	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.736;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.7467;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.791;VQSLOD=4.5457;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,31:65:99:845,0,800
21	46101939	.	C	T	2438.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.046;DP=168;Dels=0.00;FS=0.588;HRun=0;HaplotypeScore=5.7432;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.639;VQSLOD=4.5382;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,85:168:99:2468,0,2045
21	46314907	.	T	A	3453	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.61;MQ0=0;QD=30.56;VQSLOD=8.4907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3452,277,0
21	47423389	.	G	A	1659.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.19;MQ0=0;QD=31.91;VQSLOD=9.2267;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:1692,141,0
21	47538960	.	G	A	1437.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.69;MQ0=0;QD=29.95;VQSLOD=9.1039;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1471,114,0
21	47545768	.	G	A	952.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.855;DP=96;Dels=0.00;FS=0.787;HRun=0;HaplotypeScore=2.6204;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.828;VQSLOD=6.1661;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,42:96:99:982,0,1334
21	47556882	.	G	A	340.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.838;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.734;VQSLOD=6.0780;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:371,0,479
21	47558552	.	G	A	309.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=22;Dels=0.00;FS=1.808;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.058;VQSLOD=5.4862;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:339,0,193
21	47614469	.	A	C	2065.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9900;MQ=58.69;MQ0=0;QD=32.27;VQSLOD=8.9649;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2098,163,0
21	47704896	.	G	A	1936.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23;VQSLOD=13.6722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:1969,156,0
21	47777063	.	G	A	3715.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48;VQSLOD=14.0284;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3715,292,0
21	47787002	.	T	C	3045.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46;VQSLOD=8.9642;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:3079,268,0
21	47836653	.	C	T	754.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;DP=46;Dels=0.00;FS=18.609;HRun=0;HaplotypeScore=2.4551;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.071;VQSLOD=2.5775;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,27:46:99:784,0,530
21	47850484	.	G	C	562.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=29.59;VQSLOD=8.8763;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:48.15:595,48,0
21	47851753	.	A	G	1285.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=14.0221;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1319,111,0
21	47852085	.	G	A	704.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=50;Dels=0.00;FS=1.357;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.909;VQSLOD=6.2220;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,28:50:99:734,0,659
21	47863757	.	A	C	1730.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.560;DP=115;Dels=0.00;FS=2.485;HRun=0;HaplotypeScore=8.3164;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.655;VQSLOD=3.7267;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,63:115:99:1761,0,1288
22	17280822	.	G	A	2103.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=0.540;HRun=0;HaplotypeScore=5.7155;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.710;VQSLOD=5.3057;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,85:195:99:2134,0,3003
22	17469049	.	C	A	554.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=27.73;ReadPosRankSum=1.561;VQSLOD=7.1812;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:32.46:588,32,0
22	17669306	.	T	C	1559.90	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=114;Dels=0.00;FS=0.712;HRun=0;HaplotypeScore=4.9761;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.658;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.054;VQSLOD=4.7972;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,64:114:99:1590,0,1222
22	18301693	.	T	C	167.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.068;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.299;VQSLOD=10.3114;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:197,0,191
22	18901004	.	C	T	458.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.99;VQSLOD=7.7567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:36.12:492,36,0
22	18912677	.	C	T	1881.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.775;DP=119;Dels=0.00;FS=5.833;HRun=0;HaplotypeScore=3.7167;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.171;VQSLOD=4.0614;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,72:119:99:1912,0,1178
22	18912678	.	A	G	3699.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7167;MQ=59.80;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=8.4016;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3699,292,0
22	19026613	.	A	G	779.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;DP=84;Dels=0.00;FS=7.517;HRun=0;HaplotypeScore=3.6476;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.094;VQSLOD=4.4975;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,37:84:99:809,0,1169
22	19119751	.	C	T	1317.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.5810;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.875;VQSLOD=6.3706;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,53:121:99:1348,0,1912
22	19189003	.	A	AC	7430.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=344.4284;MQ=60.51;MQ0=0;QD=44.49;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,166:167:99:7430,500,0
22	19766782	.	C	T	1853.72	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.594;DP=150;Dels=0.00;FS=2.056;HRun=0;HaplotypeScore=2.6421;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.041;VQSLOD=6.3809;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,75:150:99:1884,0,1871
22	19808769	.	C	T	2646.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4319;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.219;VQSLOD=7.7777;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,87:90:99:2680,229,0
22	19868218	.	A	G	1559.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42;VQSLOD=14.0265;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1592,123,0
22	19951271	.	G	A	1747.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=59.59;MQ0=0;QD=31.20;VQSLOD=9.3183;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1780,144,0
22	19959473	.	C	T	2543.25	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8773;MQ=59.12;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=8.4655;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:2576,199,0
22	19968971	.	G	A	157.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.191;VQSLOD=5.9784;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:188,0,190
22	19969106	.	A	G	456.16	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=58;Dels=0.00;FS=1.147;HRun=0;HaplotypeScore=4.9239;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.606;VQSLOD=4.3806;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:58:99:486,0,883
22	20043504	.	G	A	749.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=90;Dels=0.00;FS=0.821;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.268;VQSLOD=4.6492;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,33:90:99:780,0,1517
22	20779768	.	G	C	62.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.457;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.588;VQSLOD=4.5187;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:92.53:93,0,243
22	21327589	.	C	T	117.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.859;VQSLOD=3.7065;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:147,0,273
22	21354970	.	C	G	3186.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.762;DP=233;Dels=0.00;FS=1.690;HRun=4;HaplotypeScore=4.2335;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.200;VQSLOD=5.1751;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,122:233:99:3216,0,2893
22	21384578	.	C	T	741.42	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.280;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5088;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.190;VQSLOD=5.0390;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,30:59:99:771,0,690
22	21386019	.	G	A	782.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6475;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.152;VQSLOD=6.2095;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,30:57:99:813,0,730
22	21988599	.	G	A	1816.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=133;Dels=0.00;FS=2.422;HRun=0;HaplotypeScore=8.4606;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.182;VQSLOD=4.7503;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,66:133:99:1846,0,1929
22	22842957	.	T	G	3459.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.314;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.282;VQSLOD=9.5475;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,107:109:99:3459,268,0
22	22869123	.	T	C	2946.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=230;DS;Dels=0.00;FS=2.943;HRun=0;HaplotypeScore=12.6522;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.659;VQSLOD=2.6682;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,116:230:99:2977,0,3198
22	22869209	.	C	G	3983.09	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;DP=241;DS;Dels=0.00;FS=0.476;HRun=2;HaplotypeScore=7.2838;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.781;VQSLOD=3.4396;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,122:241:99:3389,0,3177
22	22869218	.	T	C	4184.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.145;DP=244;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.5471;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.494;VQSLOD=3.5940;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,128:244:99:3566,0,2989
22	22869742	.	C	A	1702.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.270;DP=159;Dels=0.00;FS=0.623;HRun=1;HaplotypeScore=2.7447;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.565;VQSLOD=5.0791;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,69:159:99:1732,0,2527
22	22893394	.	A	T	1839.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=140;Dels=0.00;FS=0.658;HRun=0;HaplotypeScore=4.4452;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.477;VQSLOD=5.3120;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,67:140:99:1869,0,1981
22	22899234	.	A	G	2449.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.230;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=0.492;HRun=0;HaplotypeScore=3.6555;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.217;VQSLOD=5.4902;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,96:243:99:2480,0,3906
22	22989256	.	A	G	7589.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4809;MQ=43.52;MQ0=9;QD=30.36;VQSLOD=2.4226;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7587,640,0
22	23482483	.	G	A	926.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.869;DP=79;Dels=0.00;FS=1.883;HRun=0;HaplotypeScore=1.8835;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.437;VQSLOD=6.1482;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,38:79:99:957,0,1112
22	23503170	.	A	G	1335.38	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;DP=105;Dels=0.00;FS=6.514;HRun=0;HaplotypeScore=1.8401;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.715;VQSLOD=5.3055;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,53:105:99:1365,0,1321
22	23627369	.	A	G	608.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.653;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.599;VQSLOD=6.6177;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,24:43:99:638,0,517
22	24034288	.	A	G	1381.32	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.408;DP=121;Dels=0.00;FS=2.353;HRun=3;HaplotypeScore=8.5122;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.180;VQSLOD=4.4285;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,56:121:99:1411,0,1712
22	24035970	.	C	T	3518.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9858;MQ=59.37;MQ0=0;QD=33.20;VQSLOD=9.8358;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3519,268,0
22	24038847	.	T	C	1200.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8332;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;VQSLOD=7.1029;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:93.28:1233,93,0
22	24121378	.	C	T	236.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.5281;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.415;VQSLOD=6.4478;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:267,0,402
22	24179922	.	G	C	287.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.441;DP=44;Dels=0.00;FS=5.195;HRun=0;HaplotypeScore=2.7470;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.013;VQSLOD=3.7826;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,14:44:99:318,0,863
22	24226890	.	G	A	2228.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.455;DP=222;DS;Dels=0.00;FS=2.532;HRun=0;HaplotypeScore=6.8047;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.143;VQSLOD=4.3245;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,92:222:99:2258,0,3554
22	24487739	.	G	A	2016.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.062;DP=129;Dels=0.00;FS=2.315;HRun=0;HaplotypeScore=5.6891;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.532;VQSLOD=4.0566;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,78:129:99:2047,0,1315
22	24717850	.	A	G	6494.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.4108;MQ=59.31;MQ0=0;QD=33.31;VQSLOD=9.0667;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:195:99:6494,506,0
22	24761467	.	G	A	4120.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=5.0130;MQ=57.97;MQ0=0;QD=34.34;VQSLOD=5.9778;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:4120,337,0
22	25144912	.	C	T	761.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;DP=85;Dels=0.00;FS=2.955;HRun=1;HaplotypeScore=4.7463;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.286;VQSLOD=4.9013;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,32:85:99:791,0,1378
22	25145453	.	C	T	2841.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=34.24;VQSLOD=9.9090;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2875,244,0
22	25145471	.	A	G	966.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.111;DP=61;Dels=0.00;FS=2.586;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.385;VQSLOD=5.8474;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,34:61:99:996,0,714
22	25601196	.	C	G	3192.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.59;MQ0=0;QD=30.12;VQSLOD=8.6822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3226,247,0
22	26159289	.	G	A	1477.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=1;QD=29.55;VQSLOD=9.2578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1510,117,0
22	26164413	.	C	T	166.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.362;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=3.6383;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.634;VQSLOD=2.9187;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:196,0,312
22	26166900	.	G	C	441.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44;VQSLOD=8.6632;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:36.12:475,36,0
22	26173661	.	T	C	1445.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.04;MQ0=0;QD=28.91;VQSLOD=8.7999;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1478,123,0
22	26239850	.	C	A	623.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;DP=57;Dels=0.00;FS=5.574;HRun=1;HaplotypeScore=1.9085;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.174;VQSLOD=5.6937;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,24:57:99:654,0,949
22	26422980	.	A	G	1452.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.054;DP=166;Dels=0.00;FS=3.943;HRun=0;HaplotypeScore=5.4303;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-1.594;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.055;VQSLOD=3.8089;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,67:166:99:1482,0,2693
22	26695077	.	G	T	313	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.2762;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.035;VQSLOD=5.4676;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:343,0,594
22	26853905	.	C	A	1387.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.10;MQ0=0;QD=27.20;VQSLOD=7.8887;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1420,111,0
22	26854441	.	G	A	4762.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6671;MQ=59.62;MQ0=0;QD=29.95;VQSLOD=8.6784;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,159:159:99:4762,382,0
22	26859942	.	C	T	1595.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7480;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.725;VQSLOD=5.7649;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,62:126:99:1625,0,1801
22	26862212	.	T	C	1262.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.173;DP=134;Dels=0.00;FS=2.482;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.853;VQSLOD=6.4281;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:84,50:134:99:1293,0,2266
22	26884039	.	G	A	325.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;DP=24;Dels=0.00;FS=4.129;HRun=0;HaplotypeScore=2.6939;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.521;VQSLOD=6.0754;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:355,0,301
22	29533572	.	C	G	2900.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.44;MQ0=0;QD=34.95;VQSLOD=8.7634;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2934,232,0
22	29707827	.	G	A	306.52	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=14;Dels=0.00;FS=2.688;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.296;VQSLOD=3.1973;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:33.24:337,0,33
22	29727886	.	T	C	1396.27	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71;VQSLOD=13.3515;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1429,126,0
22	29837537	.	T	C	4975.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=150;Dels=0.00;FS=4.929;HRun=0;HaplotypeScore=1.8188;MQ=54.51;MQ0=1;MQRankSum=1.839;QD=33.17;ReadPosRankSum=-0.784;VQSLOD=3.5238;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,147:150:99:4913,344,0
22	30688659	.	C	T	1145.33	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=83;Dels=0.00;FS=8.032;HRun=0;HaplotypeScore=1.7878;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=13.80;ReadPosRankSum=2.290;VQSLOD=3.9338;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,43:83:99:1175,0,810
22	30762140	.	G	A	4208.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=8.164;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.001;HRun=1;HaplotypeScore=4.5375;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.170;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.558;VQSLOD=3.8331;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,129:250:99:3581,0,2908
22	30771554	.	T	G	3230.05	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.8518;MQ=59.30;MQ0=0;QD=31.67;VQSLOD=7.7028;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:102:99:3264,250,0
22	30776095	.	C	T	1586.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=129;Dels=0.00;FS=2.349;HRun=0;HaplotypeScore=1.8650;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.852;VQSLOD=6.4155;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,69:129:99:1616,0,1541
22	30888494	.	C	T	1178.25	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.478;DP=119;Dels=0.00;FS=3.319;HRun=1;HaplotypeScore=2.9713;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.125;VQSLOD=5.4115;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,51:119:99:1208,0,1944
22	30888527	.	C	T	1342.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.222;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6596;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=11.88;ReadPosRankSum=2.429;VQSLOD=4.6358;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,54:113:99:1373,0,1481
22	30891294	.	G	C	1313.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.725;DP=97;Dels=0.00;FS=0.978;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.993;VQSLOD=5.8801;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,51:97:99:1344,0,1292
22	30901592	.	T	C	193.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=16;Dels=0.00;FS=4.467;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.741;VQSLOD=6.1795;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:224,0,213
22	30953295	.	C	T	1298.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=134;Dels=0.00;FS=8.121;HRun=0;HaplotypeScore=3.9831;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.882;VQSLOD=4.5599;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,57:134:99:1329,0,2009
22	31011610	.	G	C	3082.08	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=34.25;VQSLOD=9.0604;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:3115,241,0
22	31013419	.	C	T	1965.62	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;DP=129;Dels=0.00;FS=1.412;HRun=1;HaplotypeScore=5.0572;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.174;VQSLOD=5.3985;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,68:129:99:1996,0,1627
22	31491295	.	G	C	3109.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.7292;MQ=58.55;MQ0=0;QD=30.79;VQSLOD=8.4370;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,101:101:99:3143,238,0
22	31533796	.	G	C	2945.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;DP=226;Dels=0.00;FS=2.979;HRun=1;HaplotypeScore=10.2178;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.643;VQSLOD=3.4559;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,106:226:99:2976,0,3354
22	31535872	.	G	C	1100.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.213;DP=69;Dels=0.00;FS=0.974;HRun=0;HaplotypeScore=2.3782;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.261;VQSLOD=5.8215;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,40:69:99:1130,0,713
22	31536133	.	A	C	3934.67	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.80;MQ0=0;QD=33.63;VQSLOD=9.3262;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:3934,304,0
22	31679110	.	G	C	411.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.391;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.049;VQSLOD=5.5494;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:28:99:442,0,284
22	31971258	.	T	C	3313.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=57.76;MQ0=0;QD=32.17;VQSLOD=8.5112;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,102:103:99:3280,253,0
22	31998612	.	G	A	2068.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.347;DP=193;Dels=0.00;FS=2.545;HRun=1;HaplotypeScore=2.9426;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.636;VQSLOD=6.0769;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,81:193:99:2099,0,2909
22	32334021	.	T	A	3147.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.003;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=4.9335;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.505;VQSLOD=5.7039;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,114:250:99:3177,0,3750
22	32554985	.	A	G	2395.59	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.431;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=3.661;HRun=1;HaplotypeScore=2.5367;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.367;VQSLOD=5.7340;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,102:250:99:2426,0,4134
22	32589023	.	C	T	2523.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.078;DP=185;Dels=0.00;FS=4.382;HRun=0;HaplotypeScore=7.4842;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.375;VQSLOD=4.2094;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,96:185:99:2554,0,2590
22	32590449	.	G	A	83.29	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.051;VQSLOD=4.3151;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:113,0,361
22	32811952	.	A	G	607.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=56;Dels=0.00;FS=1.038;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.654;VQSLOD=3.5919;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,24:56:99:637,0,780
22	32871383	.	T	G	196.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;DP=23;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=0;HaplotypeScore=3.5124;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.067;VQSLOD=5.6493;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:226,0,320
22	32875190	.	G	A	2414.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.336;DP=139;Dels=0.00;FS=0.706;HRun=0;HaplotypeScore=7.8156;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.117;VQSLOD=3.8779;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,89:139:99:2444,0,1405
22	35463162	.	A	G	569.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.457;DP=44;Dels=0.00;FS=11.766;HRun=1;HaplotypeScore=5.7518;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.141;VQSLOD=4.1746;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,21:44:99:600,0,552
22	35463249	.	C	T	84.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.3471;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.429;VQSLOD=3.7756;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:16:99:115,0,309
22	35660875	.	G	T	1081.02	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.257;DP=103;Dels=0.00;FS=3.753;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.132;VQSLOD=6.0932;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,45:103:99:1111,0,1589
22	36123083	.	C	T	698.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.702;DP=51;Dels=0.00;FS=2.838;HRun=0;HaplotypeScore=3.2285;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.289;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.933;VQSLOD=4.2086;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,25:51:99:729,0,696
22	36556823	.	G	T	5007.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=58.77;MQ0=0;QD=30.17;VQSLOD=8.8499;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,166:166:99:5007,409,0
22	36587202	.	G	A	406.98	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.904;VQSLOD=6.3013;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:37:99:437,0,516
22	36587223	.	G	T	381.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.498;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.324;VQSLOD=4.8301;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:412,0,539
22	36587279	.	A	G	542.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.013;DP=48;Dels=0.00;FS=4.231;HRun=0;HaplotypeScore=1.9889;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.457;VQSLOD=5.6163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,21:48:99:572,0,708
22	36587486	.	A	G	1373.51	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;DP=102;Dels=0.00;FS=5.061;HRun=1;HaplotypeScore=6.4969;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.234;VQSLOD=4.6519;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,50:102:99:1404,0,1546
22	36587511	.	C	T	1318.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.429;DP=102;Dels=0.00;FS=1.621;HRun=0;HaplotypeScore=1.9947;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.171;VQSLOD=6.2222;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,46:102:99:1349,0,1612
22	36587704	.	T	C	1274.06	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.164;DP=77;Dels=0.00;FS=2.024;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.283;VQSLOD=6.0120;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,44:77:99:1304,0,906
22	36587845	.	A	ACT	3431.30	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-8.555;DP=133;FS=4.327;HRun=0;HaplotypeScore=349.7192;MQ=60.39;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.424;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,68:133:99:3431,0,2137
22	36587952	.	C	T	1499.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6807;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.294;VQSLOD=6.3476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,58:115:99:1529,0,1520
22	36591380	.	A	G	1343.70	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=121;Dels=0.00;FS=0.688;HRun=0;HaplotypeScore=2.7972;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.181;VQSLOD=6.2819;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,59:121:99:1374,0,1756
22	36598049	.	C	G	1202.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.363;DP=93;Dels=0.00;FS=0.818;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.434;VQSLOD=5.0339;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,48:93:99:1233,0,1172
22	36598058	.	T	C	1266.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=104;Dels=0.00;FS=0.747;HRun=0;HaplotypeScore=1.7287;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.602;VQSLOD=6.2348;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,54:104:99:1296,0,1307
22	36598081	.	A	T	1368.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.778;DP=122;Dels=0.00;FS=5.632;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.379;VQSLOD=5.1376;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,59:122:99:1399,0,1546
22	36623731	.	T	C	7612.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=8.0305;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=33.98;ReadPosRankSum=1.233;VQSLOD=5.0080;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,221:224:99:7528,590,0
22	36661330	.	G	A	1828.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.509;DP=155;Dels=0.00;FS=2.192;HRun=1;HaplotypeScore=3.1137;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.353;VQSLOD=6.3192;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,72:155:99:1858,0,2385
22	36661566	.	G	A	2457.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;DP=162;Dels=0.00;FS=3.281;HRun=0;HaplotypeScore=3.7994;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.17;ReadPosRankSum=-2.398;VQSLOD=4.7170;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,84:162:99:2487,0,2363
22	36661646	.	G	A	1861.96	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7480;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.890;VQSLOD=6.0778;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,61:110:99:1892,0,1389
22	36684354	.	T	C	1835.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;DP=198;Dels=0.00;FS=0.547;HRun=0;HaplotypeScore=5.4476;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.653;VQSLOD=5.1753;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,80:198:99:1865,0,3114
22	36900271	.	T	C	4340.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.3867;MQ=59.83;MQ0=0;QD=31.45;VQSLOD=8.3348;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4340,331,0
22	36900806	.	A	G	1781.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;QD=31.26;VQSLOD=9.5674;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1815,141,0
22	37271882	.	T	C	5283.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6266;MQ=59.46;MQ0=0;QD=31.08;VQSLOD=8.1196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,170:170:99:5282,454,0
22	37462936	.	A	G	1101.63	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.290;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.8650;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.270;VQSLOD=6.1311;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,39:76:99:1132,0,1009
22	37485724	.	T	C	224.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;DP=22;Dels=0.00;FS=1.848;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.692;VQSLOD=6.5346;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:255,0,332
22	37524619	.	G	T	1186.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;DP=69;Dels=0.00;FS=2.202;HRun=1;HaplotypeScore=2.6274;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.071;VQSLOD=6.0482;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,41:69:99:1216,0,641
22	37581422	.	G	C	1165.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50;VQSLOD=14.2371;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1199,99,0
22	37581485	.	C	A	766.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;VQSLOD=13.2064;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:63.18:799,63,0
22	38051999	.	C	T	305.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.170;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.217;VQSLOD=6.3334;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:335,0,365
22	38119213	.	G	A	396.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7329;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.097;VQSLOD=5.8542;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,16:40:99:427,0,671
22	38121152	.	C	A	2608.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.859;DP=233;Dels=0.00;FS=1.095;HRun=2;HaplotypeScore=6.4166;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.122;VQSLOD=4.5167;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,100:233:99:2639,0,3668
22	38122122	.	T	C	1507.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;DP=130;Dels=0.00;FS=3.147;HRun=1;HaplotypeScore=4.1086;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.162;VQSLOD=5.1193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,58:130:99:1537,0,2045
22	38122462	.	A	G	441.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54;VQSLOD=13.6352;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.10:475,39,0
22	38130459	.	G	T	250.43	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.494;DP=40;Dels=0.00;FS=1.326;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.982;VQSLOD=3.7005;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,13:40:99:280,0,682
22	38130472	.	T	C	812.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.40;VQSLOD=7.9677;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:66.19:846,66,0
22	38205989	.	T	C	328.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8110;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.670;VQSLOD=6.6566;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:359,0,470
22	38323507	.	G	T	1010.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.693;VQSLOD=11.8251;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,35:71:99:1040,0,865
22	38474696	.	A	G	1058.19	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.126;DP=86;Dels=0.00;FS=15.305;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.965;VQSLOD=3.7885;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,40:86:99:1088,0,1218
22	39381826	.	A	G	4062.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=47.88;MQ0=0;QD=30.55;VQSLOD=6.5366;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:4062,367,0
22	39382079	.	C	A	4222.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.2494;MQ=46.94;MQ0=3;QD=33.25;VQSLOD=3.2667;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:4222,334,0
22	39440149	.	C	T	503.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;VQSLOD=6.2869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:42.13:536,42,0
22	39445554	.	G	A	5957.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.4835;MQ=58.71;MQ0=0;QD=29.20;VQSLOD=6.3230;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,204:204:99:5957,469,0
22	40283427	.	A	G	2090.20	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=149;Dels=0.00;FS=0.632;HRun=0;HaplotypeScore=1.8914;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=14.03;ReadPosRankSum=-1.708;VQSLOD=6.2137;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,78:149:99:2120,0,1804
22	41548008	.	A	G	2448.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.567;DP=185;DS;Dels=0.00;FS=2.338;HRun=0;HaplotypeScore=5.8353;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.359;VQSLOD=5.2491;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,91:185:99:2479,0,2471
22	42416056	.	A	G	4825.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.1938;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=30.16;ReadPosRankSum=-1.491;VQSLOD=7.3266;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,158:160:99:4825,370,0
22	42423110	.	G	C	5931.98	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.4308;MQ=59.38;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=8.4285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:5931,502,0
22	42522613	.	G	C	1311.35	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.44;MQ0=0;QD=31.22;VQSLOD=7.6509;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1344,102,0
22	42523943	.	A	G	4222.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.11;MQ0=1;QD=29.94;VQSLOD=7.3106;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:4221,337,0
22	42538029	.	A	G	2594.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9973;MQ=45.58;MQ0=3;QD=27.60;VQSLOD=2.8578;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:2628,217,0
22	42912097	.	C	T	588.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.353;DP=41;Dels=0.00;FS=6.909;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.301;VQSLOD=4.9164;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,22:41:99:618,0,518
22	43089849	.	T	C	255.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.356;DP=25;Dels=0.00;FS=3.909;HRun=0;HaplotypeScore=1.5741;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.082;VQSLOD=4.4296;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:285,0,396
22	43206950	.	A	C	1263.94	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=93;Dels=0.00;FS=1.089;HRun=1;HaplotypeScore=13.2055;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.573;VQSLOD=3.2265;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,45:93:99:1294,0,1358
22	43529314	.	G	C	1942.24	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=7.5626;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.985;VQSLOD=4.2276;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,75:155:99:1972,0,2319
22	43558926	.	A	G	408.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=29.15;VQSLOD=8.8595;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.11:441,36,0
22	43568512	.	C	T	1131.66	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.052;DP=115;Dels=0.00;FS=8.113;HRun=0;HaplotypeScore=3.6942;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.743;VQSLOD=3.7069;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,42:115:99:1162,0,1729
22	43579049	.	T	C	2109.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.864;DP=164;Dels=0.00;FS=3.956;HRun=0;HaplotypeScore=5.4257;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.580;VQSLOD=4.1593;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,75:164:99:2140,0,2335
22	43610207	.	A	G	835.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.130;DP=81;Dels=0.00;FS=3.160;HRun=1;HaplotypeScore=1.6498;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.198;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.406;VQSLOD=4.8670;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,32:81:99:865,0,1238
22	43623395	.	C	G	899.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=9.1939;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:81.22:932,81,0
22	43976396	.	G	A	8387.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.7139;MQ=59.25;MQ0=0;QD=33.82;VQSLOD=8.4490;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,248:248:99:8387,674,0
22	44079680	.	G	A	2828.95	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=243;DS;Dels=0.00;FS=1.559;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.909;VQSLOD=6.6438;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,115:243:99:2859,0,3748
22	44282276	.	A	G	1509.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;DP=107;Dels=0.00;FS=13.327;HRun=1;HaplotypeScore=5.9446;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.501;VQSLOD=3.7487;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,59:107:99:1539,0,1312
22	44286950	.	G	A	327.50	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;DP=25;Dels=0.00;FS=1.935;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.680;VQSLOD=6.3579;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:357,0,326
22	44322922	.	T	G	1298.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.836;DP=101;Dels=0.00;FS=0.750;HRun=1;HaplotypeScore=1.9150;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.691;VQSLOD=6.3726;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,47:101:99:1328,0,1379
22	44322970	.	G	T	1257.17	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.693;DP=95;Dels=0.00;FS=5.146;HRun=0;HaplotypeScore=1.9466;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.269;VQSLOD=5.6883;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,47:95:99:1287,0,1335
22	44342116	.	A	G	7297.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;DP=229;DS;Dels=0.00;FS=4.058;HRun=0;HaplotypeScore=8.0361;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.169;VQSLOD=3.3632;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,227:229:99:7258,572,0
22	44379838	.	A	G	7001.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.8440;MQ=58.93;MQ0=0;QD=28.93;VQSLOD=8.0211;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,242:242:99:7000,578,0
22	44489868	.	T	C	4458.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.235;DP=155;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=28.77;ReadPosRankSum=-0.302;VQSLOD=8.8804;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,154:155:99:4425,350,0
22	45255637	.	G	C	983.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=71;Dels=0.00;FS=0.925;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.300;VQSLOD=4.3051;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,39:71:99:1014,0,842
22	45683304	.	G	C	404.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=13.5231;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.09:437,36,0
22	45723807	.	G	C	958.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;DP=69;Dels=0.00;FS=1.014;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.978;VQSLOD=4.8558;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,34:69:99:988,0,1002
22	45728370	.	G	A	1748.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.467;DP=176;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=7.1955;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.251;VQSLOD=4.7558;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,70:176:99:1779,0,2951
22	45749983	.	G	T	2071.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.604;DP=186;Dels=0.00;FS=4.311;HRun=1;HaplotypeScore=5.5685;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.287;VQSLOD=5.0536;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:104,82:186:99:2102,0,2749
22	45767421	.	C	T	1595.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9652;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.054;VQSLOD=5.7985;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,59:110:99:1626,0,1477
22	45789642	.	A	C	1978.87	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.81;MQ0=0;QD=31.41;VQSLOD=9.3285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2012,156,0
22	45821887	.	G	A	983.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;DP=87;Dels=0.00;FS=7.101;HRun=0;HaplotypeScore=3.4308;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.431;VQSLOD=4.7706;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,44:87:99:1014,0,1132
22	45821956	.	C	G	617.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.887;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.824;VQSLOD=6.3531;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:648,0,256
22	45826880	.	G	A	212.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.092;VQSLOD=11.4505;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:243,0,146
22	45923827	.	A	G	2722.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.05;MQ0=0;QD=29.59;VQSLOD=8.4452;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:2756,220,0
22	46644168	.	A	G	1060.36	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.134;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.3003;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.356;VQSLOD=4.2258;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,41:85:99:1090,0,1123
22	46655779	.	G	C	4144.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=10.091;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=1.569;HRun=2;HaplotypeScore=2.5757;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.316;VQSLOD=4.7708;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,130:249:99:3527,0,2964
22	46655948	.	T	C	1231.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.805;DP=74;Dels=0.00;FS=6.029;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.588;VQSLOD=5.0069;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,41:74:99:1261,0,928
22	46656246	.	T	G	2914.91	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=187;DS;Dels=0.00;FS=16.833;HRun=1;HaplotypeScore=3.5696;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.571;VQSLOD=3.1966;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,101:187:99:2945,0,2424
22	46656479	.	A	G	2647.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.708;DP=193;Dels=0.00;FS=2.726;HRun=2;HaplotypeScore=1.8315;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.184;VQSLOD=6.8070;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,93:193:99:2677,0,2992
22	46677607	.	T	C	5328.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=33.10;ReadPosRankSum=1.558;VQSLOD=8.8866;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,160:161:99:5328,418,0
22	46682976	.	C	T	639.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;DP=47;Dels=0.00;FS=7.226;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.734;VQSLOD=4.0951;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,24:47:99:670,0,651
22	46704676	.	A	G	853.04	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;DP=77;Dels=0.00;FS=0.856;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.736;VQSLOD=5.6057;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,33:77:99:883,0,1233
22	46709881	.	G	A	1680.31	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6665;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.109;VQSLOD=5.6728;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,68:137:99:1710,0,1763
22	46719100	.	C	G	2775.81	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;DP=228;Dels=0.00;FS=3.730;HRun=0;HaplotypeScore=4.7576;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.175;VQSLOD=4.8025;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,114:228:99:2806,0,3114
22	46722400	.	T	C	2004.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.3670;MQ=59.31;MQ0=0;QD=29.92;VQSLOD=9.0201;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,66:67:99:2037,177,0
22	46760481	.	C	G	753.11	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.581;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.788;VQSLOD=6.3574;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:783,0,870
22	46780521	.	T	C	869.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=70;Dels=0.00;FS=3.658;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.195;VQSLOD=6.1907;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,36:70:99:899,0,835
22	46782382	.	C	T	234.58	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=19;Dels=0.00;FS=2.003;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.619;VQSLOD=5.7512;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:265,0,196
22	46787694	.	A	G	89.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=2.688;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.919;VQSLOD=4.9324;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:120,0,273
22	46787697	.	A	G	51.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.919;VQSLOD=7.9890;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:81.09:81,0,313
22	46805772	.	C	T	2336.01	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.293;DP=162;DS;Dels=0.00;FS=5.971;HRun=0;HaplotypeScore=1.9452;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.215;VQSLOD=4.7663;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,87:162:99:2366,0,1828
22	46860063	.	C	T	1127.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.282;VQSLOD=6.9187;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,41:94:99:1157,0,1288
22	46929692	.	A	G	5981.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=9.2780;MQ=59.32;MQ0=0;QD=29.91;VQSLOD=4.0637;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:5980,532,0
22	46931077	.	G	C	1171.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8561;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65;VQSLOD=8.3955;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:96.29:1204,96,0
22	47189678	.	C	G	205.28	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=16;Dels=0.00;FS=2.447;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.683;VQSLOD=5.1513;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:235,0,259
22	50278568	.	A	G	4285.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=59.43;MQ0=0;QD=30.61;VQSLOD=9.5833;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4285,358,0
22	50356693	.	T	C	981.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73;VQSLOD=13.7122;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:33:81.24:1014,81,0
22	50435480	.	A	G	124.41	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.4167;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.470;VQSLOD=4.6273;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:154,0,164
22	50439194	.	C	T	331.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;DP=32;Dels=0.00;FS=8.139;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.695;VQSLOD=4.5542;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:32:99:361,0,476
22	50468907	.	C	T	296.23	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9976;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.312;VQSLOD=3.8509;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:326,0,355
22	50468933	.	G	T	290.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=21;Dels=0.00;FS=1.719;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.249;VQSLOD=5.1179;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:321,0,213
22	50470516	.	C	T	872.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.051;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.015;VQSLOD=6.8836;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,35:78:99:902,0,991
22	50480108	.	C	T	1787.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30;VQSLOD=8.8692;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1821,141,0
22	50488547	.	G	A	363.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.694;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=19.14;ReadPosRankSum=-1.065;VQSLOD=12.5304;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:77.01:394,0,77
22	50530501	.	A	T	4248.18	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=234;DS;Dels=0.00;FS=3.268;HRun=1;HaplotypeScore=7.9648;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.345;VQSLOD=2.9468;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,129:234:99:3642,0,2659
22	50546666	.	C	T	331.37	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=30;Dels=0.00;FS=4.499;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.670;VQSLOD=6.0277;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:361,0,442
22	50555686	.	A	C	1094.46	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.216;DP=76;Dels=0.00;FS=10.808;HRun=0;HaplotypeScore=2.7198;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.895;VQSLOD=4.3284;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,38:76:99:1124,0,1006
22	50572473	.	G	A	1398.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.272;DP=93;Dels=0.00;FS=0.801;HRun=0;HaplotypeScore=2.8552;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.575;VQSLOD=6.5233;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,54:93:99:1429,0,865
22	50582626	.	A	G	1858.35	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.345;DP=170;DS;Dels=0.00;FS=0.848;HRun=1;HaplotypeScore=8.6129;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.203;VQSLOD=4.0849;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,69:170:99:1888,0,3125
22	50599466	.	C	A	2282.80	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.580;DP=201;DS;Dels=0.00;FS=1.164;HRun=1;HaplotypeScore=6.4108;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.027;VQSLOD=4.3614;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,85:201:99:2313,0,3266
22	50656428	.	G	A	292.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.318;VQSLOD=10.4977;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:322,0,546
22	50657010	.	C	G	2320.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.78;MQ0=0;QD=31.35;VQSLOD=8.4286;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:2353,181,0
22	50658424	.	T	C	464.55	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;DP=42;Dels=0.00;FS=4.777;HRun=0;HaplotypeScore=2.7291;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.679;VQSLOD=5.5205;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,21:42:99:495,0,541
22	50660137	.	G	A	736.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;DP=57;Dels=0.00;FS=5.667;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.228;VQSLOD=5.4666;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,30:57:99:767,0,602
22	50664612	.	A	G	4188.76	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-7.081;DP=234;DS;Dels=0.00;FS=2.399;HRun=0;HaplotypeScore=2.3149;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.894;VQSLOD=5.1016;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,132:234:99:3547,0,2975
22	50722134	.	T	C	909.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.065;VQSLOD=6.0617;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,35:62:99:940,0,662
22	50728062	.	T	C	575.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;DP=55;Dels=0.00;FS=7.438;HRun=0;HaplotypeScore=1.3302;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.716;VQSLOD=4.6789;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,26:55:99:605,0,832
22	50878196	.	G	A	601.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;DP=52;Dels=0.00;FS=4.459;HRun=1;HaplotypeScore=2.6548;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.028;VQSLOD=4.9345;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,24:52:99:631,0,803
22	50885800	.	G	A	2025.07	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.879;DP=172;Dels=0.00;FS=2.729;HRun=0;HaplotypeScore=8.1830;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.612;VQSLOD=2.6444;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,78:172:99:2055,0,2147
22	50962782	.	C	G	1580.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.70;MQ0=0;QD=28.74;VQSLOD=7.9706;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1614,129,0
22	50988193	.	A	G	521.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.05;MQ0=0;QD=32.59;VQSLOD=8.8578;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:45.13:554,45,0
22	51009953	.	C	T	8301.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.35;MQ0=0;QD=33.34;VQSLOD=9.4568;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,249:249:99:8301,650,0
22	51043278	.	G	A	285.67	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.869;VQSLOD=11.8222;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:316,0,285
22	51045190	.	C	T	273.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.898;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.5204;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.429;VQSLOD=2.6882;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:304,0,99
22	51064039	.	G	C	4416.37	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.13;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=8.8288;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4416,337,0
22	51117580	.	T	C	221.89	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.931;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.566;VQSLOD=13.1536;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:54.65:252,0,55
X	229542	.	G	A	941.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.8857;MQ=50.95;MQ0=0;QD=30.37;VQSLOD=2.2270;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:81.21:974,81,0
X	1428421	.	G	T	4188.48	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.033;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=1.551;HRun=0;HaplotypeScore=6.1804;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.046;VQSLOD=4.3859;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,119:250:99:3513,0,3550
X	1471062	.	G	C	1311.65	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;DP=74;Dels=0.00;FS=5.300;HRun=1;HaplotypeScore=1.5774;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.941;VQSLOD=3.1431;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,45:74:99:1342,0,794
X	1531648	.	C	T	4375.77	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=237;DS;Dels=0.00;FS=4.833;HRun=1;HaplotypeScore=8.5143;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.201;VQSLOD=3.1231;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,133:237:99:3749,0,2881
X	1537881	.	C	T	251.49	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.738;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.839;VQSLOD=8.6335;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:281,0,311
X	2161129	.	C	G	4442.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5134;MQ=59.72;MQ0=0;QD=32.91;VQSLOD=6.7461;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,135:135:99:4442,346,0
X	2777985	.	C	T	539.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69;VQSLOD=13.6675;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48.14:572,48,0
X	2779570	.	A	G	440.75	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.55;VQSLOD=7.5215;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:39.10:474,39,0
X	2832742	.	G	C	6038.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.7317;MQ=55.51;MQ0=0;QD=31.95;VQSLOD=4.1241;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,189:189:99:6037,487,0
X	2835863	.	G	T	743.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.564;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.285;VQSLOD=4.0749;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,31:63:99:774,0,921
X	2836184	.	C	T	139.93	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.936;VQSLOD=3.0502;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:170,0,170
X	8138080	.	G	C	2060.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=42.05;MQ0=2;QD=25.44;VQSLOD=2.8126;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:2094,168,0
X	11157535	.	G	C	608.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97;VQSLOD=13.1048;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:51.16:641,51,0
X	12924826	.	A	G	1121.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.04;MQ0=0;QD=28.76;VQSLOD=8.3759;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:93.26:1155,93,0
X	13681115	.	C	T	2968.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.5784;MQ=59.42;MQ0=0;QD=30.92;VQSLOD=9.0418;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,96:96:99:3002,232,0
X	17819377	.	T	C	1970.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.64;MQ0=0;QD=30.80;VQSLOD=9.2555;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2004,156,0
X	19379640	.	G	C	3354.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5581;MQ=58.71;MQ0=0;QD=29.17;VQSLOD=7.5285;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:115:99:3354,250,0
X	19482476	.	C	T	946.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=58.55;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=8.0622;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:78.24:980,78,0
X	20071046	.	T	C	3426.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.4514;MQ=58.12;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=7.3075;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,109:110:99:3427,262,0
X	23723711	.	C	G	2903.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=59.73;MQ0=0;QD=33.77;VQSLOD=9.0944;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2937,229,0
X	23928489	.	C	T	1612.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.63;MQ0=0;QD=31.62;VQSLOD=9.1380;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:1646,126,0
X	26157220	.	C	T	1741.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=59.65;MQ0=0;QD=32.25;VQSLOD=9.3077;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1775,144,0
X	30254361	.	G	A	681.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65;VQSLOD=13.8109;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:57.18:715,57,0
X	30254376	.	T	C	890.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99;VQSLOD=13.6031;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.21:924,72,0
X	30872602	.	A	G	4814.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=29.90;VQSLOD=8.8723;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:4814,391,0
X	31496350	.	C	T	1046.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=58.45;MQ0=0;QD=34.88;VQSLOD=9.0131;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:84.27:1079,84,0
X	34149267	.	C	A	2986.12	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.9933;MQ=59.08;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=7.6534;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:98:99:3019,238,0
X	35820425	.	C	T	1213.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.38;MQ0=0;QD=32.81;VQSLOD=9.1703;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1247,99,0
X	35820696	.	G	A	1769.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6997;MQ=59.67;MQ0=0;QD=31.05;VQSLOD=8.0140;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1803,147,0
X	35820795	.	A	G	2891.19	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.77;MQ0=0;QD=29.20;VQSLOD=8.3138;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2924,235,0
X	35821055	.	A	G	1940.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8216;MQ=59.60;MQ0=0;QD=34.04;VQSLOD=9.4010;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:1973,156,0
X	35821056	.	T	A	1833.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8216;MQ=59.58;MQ0=0;QD=33.34;VQSLOD=8.6902;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:1867,153,0
X	35821127	.	C	T	1715.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.64;VQSLOD=8.5121;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:1749,135,0
X	38144822	.	C	T	2112.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.30;MQ0=0;QD=35.21;VQSLOD=9.4870;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2146,178,0
X	45051111	.	C	T	2448.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1.8332;MQ=59.49;MQ0=0;QD=33.55;VQSLOD=9.6021;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2482,196,0
X	48054740	.	C	G	7177.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.36;MQ0=0;QD=31.62;VQSLOD=9.7414;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,227:227:99:7177,545,0
X	48317386	.	A	G	513.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.68;VQSLOD=7.5359;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:42.13:547,42,0
X	48418126	.	A	G	1501.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.91;VQSLOD=14.5375;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1534,120,0
X	48418659	.	G	A	905.94	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.33;MQ0=0;QD=32.35;VQSLOD=8.3973;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:78.22:939,78,0
X	48460314	.	A	G	1595	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=30.67;ReadPosRankSum=0.000;VQSLOD=8.1102;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,51:52:99:1628,138,0
X	48920046	.	C	T	668.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.68;MQ0=0;QD=33.44;VQSLOD=7.3066;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:57.17:702,57,0
X	49021256	.	A	G	6726.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=59.39;MQ0=0;QD=30.71;VQSLOD=8.4680;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,219:219:99:6725,539,0
X	50121146	.	A	AG	1457.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=76.7914;MQ=60.60;MQ0=0;QD=42.87;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,33:34:99:1500,102,0
X	55116466	.	C	G	1130.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.99;MQ0=0;QD=30.56;VQSLOD=7.9957;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:87.28:1164,87,0
X	55289774	.	T	C	513.60	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10;VQSLOD=13.9766;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:42.14:547,42,0
X	55651001	.	T	C	2255.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.8614;MQ=56.90;MQ0=0;QD=31.76;VQSLOD=5.6478;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2288,181,0
X	65824986	.	C	T	925.38	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.17;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=9.6083;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:78.24:958,78,0
X	71379702	.	T	C	1408.48	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=58.20;MQ0=0;QD=29.97;VQSLOD=8.7046;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1441,114,0
X	71401607	.	G	A	417.34	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.04;MQ0=0;QD=34.78;VQSLOD=8.6643;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36.11:450,36,0
X	71401614	.	C	A	450.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=56.35;MQ0=0;QD=34.62;VQSLOD=6.2170;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.12:483,39,0
X	71521867	.	G	C	448.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.54;MQ0=0;QD=32.02;VQSLOD=8.6388;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39.12:481,39,0
X	77298857	.	G	A	3707.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.01;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=8.8402;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:3707,289,0
X	77913569	.	G	A	379.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=58.33;MQ0=0;QD=27.13;VQSLOD=7.5195;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:36.10:413,36,0
X	79698593	.	C	G	587.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.80;MQ0=0;QD=34.55;VQSLOD=8.5809;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51.14:620,51,0
X	79943569	.	T	C	1395.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.92;VQSLOD=8.3613;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1429,105,0
X	82764042	.	G	C	2451.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.6106;MQ=59.06;MQ0=0;QD=31.03;VQSLOD=8.1730;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:79:99:2485,193,0
X	84563135	.	T	A	782.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.05;MQ0=0;QD=32.60;VQSLOD=8.0249;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:66.20:815,66,0
X	88008423	.	A	C	337.31	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95;VQSLOD=12.9608;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:27.09:370,27,0
X	89177673	.	G	A	1005.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=55.43;MQ0=0;QD=31.42;VQSLOD=8.5265;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:84.25:1038,84,0
X	99941705	.	T	C	1329.51	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.87;MQ0=0;QD=32.43;VQSLOD=9.4385;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1363,105,0
X	100490933	.	G	C	5835.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=6.1162;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=31.71;ReadPosRankSum=0.274;VQSLOD=7.0188;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,182:184:99:5798,426,0
X	100532621	.	T	C	5463.22	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.3493;MQ=58.69;MQ0=0;QD=28.45;VQSLOD=7.7121;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,192:192:99:5462,433,0
X	100547933	.	A	G	7909.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=5.7933;MQ=59.39;MQ0=0;QD=31.64;VQSLOD=7.9453;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,250:250:99:7909,611,0
X	101138792	.	T	C	1935.72	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.31;MQ0=0;QD=28.89;VQSLOD=8.8369;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:1969,162,0
X	102979486	.	T	C	1562.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.19;MQ0=0;QD=28.94;VQSLOD=8.4251;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:1596,126,0
X	103267865	.	C	T	1152.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;DP=39;Dels=0.00;FS=3.493;HRun=0;HaplotypeScore=1.8315;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=29.55;ReadPosRankSum=1.277;VQSLOD=3.4878;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,37:39:68.33:1185,68,0
X	104464276	.	CA	C	1146.53	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=197.6542;MQ=31.83;MQ0=0;QD=35.83;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,28:32:93.29:1189,93,0
X	106016268	.	A	T	2558.76	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=94;Dels=0.00;FS=3.664;HRun=0;HaplotypeScore=1.7608;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.437;VQSLOD=3.1283;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,93:94:99:2592,175,0
X	106200202	.	G	A	3293.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.49;MQ0=0;QD=28.89;VQSLOD=8.0827;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3293,253,0
X	106221389	.	T	C	2087.17	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3639;MQ=59.12;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=8.0665;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2120,163,0
X	106396402	.	A	G	6352.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.75;VQSLOD=8.8722;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:221:99:6351,511,0
X	107433688	.	A	G	2097.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.7621;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96;VQSLOD=8.1297;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2130,160,0
X	108708516	.	C	T	3514.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=3.6879;MQ=58.66;MQ0=0;QD=33.79;VQSLOD=7.6981;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:3514,277,0
X	108708552	.	A	G	3971.26	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=2.6511;MQ=59.45;MQ0=0;QD=31.77;VQSLOD=8.8920;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,125:125:99:3970,337,0
X	118281538	.	C	A	1098.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9159;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.044;VQSLOD=8.1765;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,38:39:90.28:1131,90,0
X	118587003	.	C	T	1793.46	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.42;MQ0=0;QD=32.03;VQSLOD=9.5826;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:56:99:1826,144,0
X	129147079	.	T	C	1056.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02;VQSLOD=12.8044;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:87.27:1090,87,0
X	129150143	.	T	C	132.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.093;VQSLOD=4.0111;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:162,0,135
X	132437337	.	G	A	2102.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.33;MQ0=0;QD=30.47;VQSLOD=8.3282;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2136,181,0
X	132438872	.	C	A	2307.28	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.8501;MQ=57.56;MQ0=0;QD=29.58;VQSLOD=6.2017;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2340,184,0
X	134185997	.	T	A	4242.66	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7234;MQ=51.33;MQ0=2;QD=30.30;VQSLOD=3.3635;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:4242,349,0
X	135310785	.	T	C	908.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.96;VQSLOD=7.3119;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:69.22:942,69,0
X	135313034	.	T	G	2229.45	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.31;VQSLOD=9.5969;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2262,169,0
X	135960146	.	G	GAA	595.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=59;FS=4.616;HRun=1;HaplotypeScore=203.7148;MQ=49.12;MQ0=3;MQRankSum=-4.196;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.292;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,16:59:99:634,0,1854
X	136113464	.	C	A	909.36	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.371;DP=28;Dels=0.00;FS=3.680;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=32.48;ReadPosRankSum=1.609;VQSLOD=3.7974;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:44.27:942,44,0
X	138897130	.	A	C	1213.11	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.3204;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.81;VQSLOD=6.7580;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:90.29:1246,90,0
X	140983064	.	G	A	4023.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6828;MQ=58.69;MQ0=0;QD=30.25;VQSLOD=8.8111;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:4023,316,0
X	140983127	.	G	A	5336.01	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=2.5165;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.081;VQSLOD=8.7152;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,171:173:99:5335,433,0
X	140994280	.	A	G	2977.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.803;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.9366;MQ=48.97;MQ0=6;MQRankSum=2.325;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.510;VQSLOD=2.8483;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,103:105:99:3011,224,0
X	142967468	.	T	G	2944.44	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8100;MQ=59.42;MQ0=0;QD=33.46;VQSLOD=9.4304;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:2977,235,0
X	147088249	.	C	T	3607.24	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=59.36;MQ0=0;QD=29.09;VQSLOD=8.0350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,124:124:99:3607,289,0
X	150349871	.	A	G	5821.43	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.6594;MQ=59.52;MQ0=0;QD=31.30;VQSLOD=8.6207;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:5821,445,0
X	150817094	.	C	G	5420.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;DP=175;Dels=0.00;FS=4.412;HRun=0;HaplotypeScore=4.7390;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.049;VQSLOD=4.2903;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,174:175:99:5381,373,0
X	150869267	.	A	G	1489.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=58.44;MQ0=0;QD=32.38;VQSLOD=8.7359;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1523,123,0
X	151138179	.	A	C	2296.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=58.47;MQ0=0;QD=27.34;VQSLOD=7.9196;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2330,181,0
X	151303393	.	C	T	2619.58	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=58.55;MQ0=0;QD=31.19;VQSLOD=9.0690;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:2653,208,0
X	151303596	.	C	T	2694.39	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.72;MQ0=0;QD=32.46;VQSLOD=8.3822;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2727,214,0
X	151821277	.	T	A	4951.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.2120;MQ=59.32;MQ0=0;QD=28.96;VQSLOD=6.9476;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,169:171:99:4951,394,0
X	151909156	.	A	G	2958.18	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=56.33;MQ0=0;QD=29.88;VQSLOD=6.7247;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:2991,229,0
X	152226542	.	T	C	1484.03	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73;VQSLOD=9.2004;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1517,126,0
X	152482796	.	C	T	3671.84	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.6318;MQ=58.90;MQ0=0;QD=32.78;VQSLOD=9.6440;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3671,292,0
X	152482917	.	T	C	2746.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.542;VQSLOD=7.6326;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,91:92:99:2780,209,0
X	153035798	.	G	A	623.10	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15;VQSLOD=13.2869;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:54.16:656,54,0
X	153039502	.	G	C	353.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=57.23;MQ0=0;QD=20.81;VQSLOD=6.2330;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:39.03:387,39,0
X	153174934	.	T	G	801.56	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.49;MQ0=0;QD=29.69;VQSLOD=7.0300;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:72.19:835,72,0
X	153278829	.	G	A	988.13	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.5784;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94;VQSLOD=8.3825;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:84.25:1021,84,0
X	153284192	.	A	G	1432.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.8401;MQ=58.89;MQ0=0;QD=34.10;VQSLOD=9.4545;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1465,120,0
X	153689893	.	G	A	6646.49	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=5.1520;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.95;VQSLOD=7.5568;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,208:208:99:6646,518,0
X	153881525	.	G	C	1125.20	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.44;VQSLOD=7.4489;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:84.28:1158,84,0
X	154456747	.	A	G	4440.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2.3294;MQ=59.08;MQ0=0;QD=30.42;VQSLOD=9.2192;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:4440,340,0
1	5935162	.	A	T	629.22	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.246;VQSLOD=6.1419;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,24:34:99:659,0,264
1	17718671	.	AG	A	478.57	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=39.4073;MQ=58.75;MQ0=0;QD=34.18;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42.13:521,42,0
1	100316589	.	A	G	4175.63	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.12;MQ0=0;QD=32.88;VQSLOD=9.4193;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:4175,316,0
1	156354347	.	TC	T	2067.10	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=11.302;DP=212;FS=1.763;HRun=8;HaplotypeScore=949.4889;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.164;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,94:212:99:2106,0,2973
1	179858444	.	G	A	1558.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.292;DP=133;Dels=0.00;FS=3.595;HRun=1;HaplotypeScore=7.7077;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.003;VQSLOD=4.2940;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,63:133:99:1589,0,1915
2	71062833	.	G	GC	1350.62	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=73.2776;MQ=59.81;MQ0=0;QD=39.72;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,31:34:93.32:1393,93,0
2	152424933	.	T	TA	305.44	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;DP=45;FS=4.224;HRun=13;HaplotypeScore=168.9163;MQ=60.99;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.416;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,21:45:99:344,0,103
2	162904013	.	T	C	740.83	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.028;DP=52;Dels=0.00;FS=3.055;HRun=1;HaplotypeScore=2.7873;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.429;VQSLOD=3.2567;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,31:52:99:771,0,546
2	201778717	.	T	TA	56.74	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;HRun=15;HaplotypeScore=47.0299;MQ=62.82;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.361;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:15:33.19:96,0,33
3	50251833	.	A	AG	735.91	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=49.9160;MQ=59.32;MQ0=0;QD=40.88;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54.18:778,54,0
3	53910109	.	T	TG	524.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=4.809;DP=62;FS=1.661;HRun=8;HaplotypeScore=220.3176;MQ=60.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.092;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,20:62:99:564,0,612
3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	31444.52	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;DS;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=2051.4486;MQ=34.19;MQ0=0;QD=223.01;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:114,17:140:99:31445,394,0
3	108634973	.	C	A	1167.79	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-3.825;DP=102;Dels=0.00;FS=2.705;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.405;VQSLOD=6.1364;culprit=ReadPosRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,48:102:99:1198,0,1335
4	69687987	.	C	A	5416.86	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.7323;MQ=53.02;MQ0=7;QD=29.44;VQSLOD=3.3222;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:184:99:5416,424,0
4	71339723	.	G	A	728.53	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=2.5432;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.304;VQSLOD=4.3077;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,34:88:99:759,0,1393
4	139100372	.	C	T	2538.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=58.94;MQ0=0;QD=30.58;VQSLOD=9.3350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:2571,193,0
5	111500816	.	C	CTAAAA	402.15	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.064;DP=54;FS=3.704;HRun=0;HaplotypeScore=227.5483;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.133;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.448;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,7:54:99:441,0,1617
6	32303236	.	T	TA	90.54	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;DP=29;FS=0.000;HRun=10;HaplotypeScore=76.4073;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.350;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,6:29:99:130,0,288
6	33648228	.	C	T	3473	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.6809;MQ=59.17;MQ0=0;QD=31.01;VQSLOD=8.2374;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3472,277,0
6	89913209	.	C	T	3710.68	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=28.99;VQSLOD=7.7768;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:3710,292,0
7	28997497	.	GC	G	3734.54	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=278.7362;MQ=60.40;MQ0=0;QD=35.57;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,101:105:99:3735,292,0
7	149476666	.	G	GC	833.88	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=45.1334;MQ=61.46;MQ0=0;QD=37.90;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66.20:876,66,0
7	149515188	.	TA	T	501.82	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=42.0947;MQ=60.72;MQ0=0;QD=33.45;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:42.14:544,42,0
8	6673377	.	CA	C	1160.15	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=78.9279;MQ=59.08;MQ0=0;QD=40.01;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87.28:1202,87,0
8	62550924	.	T	TA	302.34	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=60;FS=3.093;HRun=13;HaplotypeScore=268.8992;MQ=56.37;MQ0=1;MQRankSum=0.777;QD=4.96;ReadPosRankSum=-2.621;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,5:60:99:341,0,169
8	96047806	.	T	TA	243.21	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=26;FS=0.000;HRun=13;HaplotypeScore=84.6964;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.290;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:10,16:26:15.45:285,15,0
8	99205612	.	C	T	2229.78	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-9.312;DP=245;DS;Dels=0.00;FS=1.590;HRun=0;HaplotypeScore=10.4040;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.697;VQSLOD=3.4348;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,99:245:99:2260,0,3722
8	124154697	.	G	T	619.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;DP=55;Dels=0.00;FS=2.712;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.683;VQSLOD=6.7768;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,26:55:99:650,0,759
8	142505038	.	T	C	1470.32	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=56.31;MQ0=0;QD=30.01;VQSLOD=7.7516;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1503,117,0
8	143746087	.	CCA	C	606.99	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=123.3556;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,15:17:48.16:649,48,0
8	145106938	.	GCC	G	677.97	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=91.5871;MQ=60.15;MQ0=0;QD=33.90;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:54.18:720,54,0
8	145738767	.	CG	C	709.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=68.5903;MQ=59.01;MQ0=0;QD=32.26;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:60.18:752,60,0
9	35683240	.	T	TG	442.80	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;HRun=8;HaplotypeScore=31.0264;MQ=57.54;MQ0=0;QD=24.60;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,14:18:42.12:485,42,0
9	73458045	.	T	TA	177.12	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;DP=31;FS=1.885;HRun=10;HaplotypeScore=74.0345;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=0.217;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.465;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:216,0,236
9	74300311	.	T	TAA	64.57	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=28;FS=0.000;HRun=18;HaplotypeScore=134.1945;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.000;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:28:27.91:104,0,28
9	82187750	.	A	G	1751.07	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.78;MQ0=0;QD=35.02;VQSLOD=9.1203;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:50:99:1784,141,0
9	95237024	.	CTCA	C	848.03	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.409;DP=72;FS=1.264;HRun=0;HaplotypeScore=337.9932;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.241;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,26:72:99:887,0,443
9	96259883	.	T	TA	419.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;DP=59;FS=0.000;HRun=11;HaplotypeScore=158.0539;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.268;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:59:99:458,0,339
9	107556793	.	T	TAA	381.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;HRun=18;HaplotypeScore=241.3172;MQ=56.40;MQ0=0;QD=13.63;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:16,11:27:46.17:424,46,0
9	116191244	.	G	A	747.64	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;DP=61;Dels=0.03;FS=0.970;HRun=5;HaplotypeScore=4.9204;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.065;VQSLOD=4.2237;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,32:61:99:778,0,794
9	131235321	.	A	G	1972.79	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.21;MQ0=0;QD=32.34;VQSLOD=10.0140;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2006,162,0
9	140139757	.	G	A	2368.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.68;MQ0=0;QD=30.75;VQSLOD=7.8826;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:2401,202,0
10	7605077	.	TC	T	9093.95	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;DS;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=1986.4673;MQ=59.29;MQ0=0;QD=38.05;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,237:239:99:9094,707,0
10	46965887	.	T	TG	69.87	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;DP=28;FS=8.846;HRun=7;HaplotypeScore=72.0129;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.284;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:109,0,478
10	69785435	.	T	TA	1582.68	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-5.847;DP=117;FS=0.812;HRun=7;HaplotypeScore=270.2187;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.228;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,54:117:99:1622,0,1101
11	46342259	.	A	AG	519.93	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=25.1329;MQ=62.45;MQ0=0;QD=39.99;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39.13:562,39,0
11	61165731	.	C	CA	1732.64	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=176.3582;MQ=57.21;MQ0=0;QD=43.32;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,39:40:99:1775,111,0
11	76751584	.	CT	C	543.14	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=89.7760;MQ=29.00;MQ0=0;QD=38.80;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42.14:585,42,0
11	76751603	.	CT	C	425.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=82.0723;MQ=32.45;MQ0=0;QD=32.74;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:36.12:468,36,0
11	89420607	.	G	A	745.86	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-4.336;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=44.92;MQ0=4;MQRankSum=0.569;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.891;VQSLOD=3.3492;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,31:59:99:776,0,538
11	117965530	.	A	G	514.39	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.942;DP=31;Dels=0.00;FS=17.794;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.460;VQSLOD=2.8350;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:544,0,255
11	118898435	.	AC	A	1399.41	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=94.2625;MQ=58.35;MQ0=0;QD=35.88;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1441,111,0
12	7080212	.	T	C	624.42	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=61.13;MQ0=0;QD=32.86;VQSLOD=7.7121;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:51.16:657,51,0
12	48888763	.	A	G	3922.70	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=1.6281;MQ=59.80;MQ0=0;QD=34.41;VQSLOD=9.2821;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,114:114:99:3922,313,0
12	113357193	.	G	A	5874.78	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.62;MQ0=0;QD=32.28;VQSLOD=9.4384;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,182:182:99:5874,451,0
13	21729952	.	T	TAA	727.45	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;DP=82;FS=5.778;HRun=12;HaplotypeScore=376.9101;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=8.87;ReadPosRankSum=-2.608;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,25:82:99:766,0,346
13	31531009	.	G	A	1146.56	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=79;Dels=0.00;FS=0.939;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.185;VQSLOD=6.0793;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,42:79:99:1177,0,940
14	57948380	.	T	C	3711.40	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=3.5938;MQ=58.27;MQ0=0;QD=32.84;VQSLOD=8.2219;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,113:113:99:3711,286,0
15	40856989	.	C	T	2197.69	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.47;VQSLOD=8.3522;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2231,178,0
15	57918090	.	A	G	1834.55	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.39;MQ0=0;QD=31.09;VQSLOD=8.2547;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:1868,144,0
15	72105928	.	AC	A	2703.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=213.8604;MQ=58.91;MQ0=0;QD=31.44;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,84:86:99:2746,244,0
16	3602227	.	AG	A	3712.85	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=267.4904;MQ=59.89;MQ0=0;QD=35.36;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,103:105:99:3713,304,0
16	24564879	.	GTA	G	1592.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=227.4274;MQ=58.61;MQ0=0;QD=23.42;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:20,44:68:99:1635,141,0
17	7470285	.	CA	C	583.33	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=42.1583;MQ=60.63;MQ0=0;QD=34.31;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51.16:625,51,0
17	15343524	.	C	CCTT	6938.74	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=339.8256;MQ=57.69;MQ0=0;QD=55.07;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:21,104:126:99:6939,325,0
17	42254011	.	C	G	2511.69	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;DP=177;Dels=0.00;FS=1.350;HRun=1;HaplotypeScore=6.8903;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.013;VQSLOD=3.9994;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,91:177:99:2542,0,2379
17	42979026	.	T	C	1162.71	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;DP=78;Dels=0.00;FS=1.126;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.184;VQSLOD=5.7443;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,48:78:99:1193,0,746
17	45669428	.	T	TA	875.59	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;DP=40;FS=0.000;HRun=9;HaplotypeScore=112.4796;MQ=41.00;MQ0=6;MQRankSum=0.727;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.509;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:17,28:40:66.91:918,67,0
17	61660889	.	CG	C	1547.96	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=135.2918;MQ=61.01;MQ0=0;QD=29.77;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,50:52:99:1590,150,0
17	79614932	.	TTAAC	T	1115.65	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=113.4720;MQ=56.92;MQ0=0;QD=50.71;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:63.22:1158,63,0
18	28611139	.	A	C	678.06	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=57.66;MQ0=0;QD=33.90;VQSLOD=8.2163;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:57.18:711,57,0
18	74090957	.	CG	C	2356.47	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=267.8510;MQ=59.61;MQ0=1;QD=23.56;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:18,82:99:99:2399,237,0
19	16268207	.	TA	T	1686.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=159.5491;MQ=60.70;MQ0=0;QD=29.59;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,54:57:99:1729,162,0
19	17648350	.	T	C	2092.89	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=59.28;MQ0=0;QD=36.08;VQSLOD=9.8608;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2126,169,0
19	36214632	.	A	AG	794.50	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=40.3808;MQ=61.07;MQ0=0;QD=39.73;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:57.18:837,57,0
19	36243813	.	G	A	497.71	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=58.45;MQ0=0;QD=33.18;VQSLOD=8.9316;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:42.13:531,42,0
19	42092815	.	T	A	1832.61	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.272;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.517;VQSLOD=5.2539;culprit=MQRankSum;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,70:138:99:1863,0,1816
19	45016990	.	CT	C	1046.04	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=82.8899;MQ=60.11;MQ0=0;QD=37.36;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84.27:1088,84,0
19	47823038	.	G	A	3404.77	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40;VQSLOD=8.0965;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3404,271,0
19	51535130	.	A	G	6840.83	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=4.7966;MQ=59.11;MQ0=0;QD=33.05;VQSLOD=8.5276;culprit=HaplotypeScore;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:6840,524,0
19	58003580	.	A	G	1443.08	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=5.611;DP=126;Dels=0.00;FS=2.400;HRun=1;HaplotypeScore=1.8662;MQ=49.95;MQ0=1;MQRankSum=-0.568;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.164;VQSLOD=2.2891;culprit=MQ;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,60:126:99:1473,0,1759
21	11029596	.	AC	A	520.75	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.255;DP=76;FS=2.547;HRun=2;HaplotypeScore=350.9240;MQ=50.71;MQ0=1;MQRankSum=2.881;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.395;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,21:76:99:560,0,2242
21	46020655	.	CCTGCTGCGCCCCCAG	C	2249.21	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.254;DP=41;FS=3.665;HRun=0;HaplotypeScore=623.9041;MQ=17.05;MQ0=99;MQRankSum=2.154;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.351;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,28:41:99:2288,0,362
22	36597744	.	A	C	181.40	Mask	AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.329;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.847;VQSLOD=4.7258;culprit=QD;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:211,0,219
22	39497509	.	A	G	2644.61	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=58.90;MQ0=0;QD=29.71;VQSLOD=8.3096;culprit=FS;set=variant	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:89:99:2678,202,0
X	104464281	.	TC	T	964.29	Mask	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=215.1267;MQ=32.03;MQ0=0;QD=29.22;set=variant2	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,29:33:84.25:1006,84,0